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關(guān)于臨床微生物學(xué)與檢驗第1頁,課件共16頁,創(chuàng)作于2023年2月概述細(xì)菌分類學(xué)(Bacterialtaxonomy)是微生物分類學(xué)的一個分支,是對細(xì)菌進(jìn)行分類(classification)鑒定(identification)、命名(nomenclature)的一門科學(xué)。第2頁,課件共16頁,創(chuàng)作于2023年2月1.分類分類的任務(wù)是通過收集大量的個體資料,經(jīng)過科學(xué)的歸納、整理,使之形成一個完整的分類系統(tǒng)。
基本概念第3頁,課件共16頁,創(chuàng)作于2023年2月分類方法:(1)人為分類法:以細(xì)菌形態(tài)和生理生化特征為依據(jù),分為:傳統(tǒng)分類法(classicalclassification)數(shù)值分類法(numericalclassification)(2)系統(tǒng)分類法:將化學(xué)分析和核酸分析方法引入細(xì)菌分類,使細(xì)菌種群的劃分更為客觀。以細(xì)菌大分子物質(zhì)(核酸、蛋白質(zhì))結(jié)構(gòu)的同源程度進(jìn)行分類,稱為種系分類(phylogeneticclassification)或自然分類(naturalclassfication)。第4頁,課件共16頁,創(chuàng)作于2023年2月3、鑒定將未知細(xì)菌按分類原則放入系統(tǒng)中某一適當(dāng)位置和已知細(xì)菌比較其相似性,用對比分析方法確定細(xì)菌的分類地位。若與已知細(xì)菌相同即采用已知菌的名稱,不同者則按命名原則確定一個新名稱。2、命名:在分類基礎(chǔ)上,給予每種細(xì)菌一個科學(xué)名稱,使之在生產(chǎn)實踐、臨床實踐和科學(xué)研究工作中相互交流成為可能。按照細(xì)菌命名的法規(guī),能保證所有的科研工作者以同樣方式給予細(xì)菌命名。第5頁,課件共16頁,創(chuàng)作于2023年2月分類等級:界(Kingdom)門(Division)綱(class)目(Order)科(Family)屬(Genus)種(Species)第6頁,課件共16頁,創(chuàng)作于2023年2月命名法
細(xì)菌科學(xué)名稱(學(xué)名)的命名法采用生物雙名法(binominalnomenclature)。具備拉丁化文字的形式和明確的分類等級兩個特點(diǎn),即由一個屬名和一個種名構(gòu)成。
細(xì)菌學(xué)名的中文譯名:種名在前,屬名在后。如:Mycobecteriumtuberculosis(結(jié)核分枝桿菌)Salmonellatyphi(沙寒沙門菌)。第7頁,課件共16頁,創(chuàng)作于2023年2月細(xì)菌的分類法一、生物學(xué)特性分類法——人為分類法(一)傳統(tǒng)分類法(二)數(shù)值分類法第8頁,課件共16頁,創(chuàng)作于2023年2月二、遺傳學(xué)分類法——系統(tǒng)分類法(一)DNA堿基比例的測定(G+Cmol%)
(二)核酸分子雜交法(hybridizationofacids)
(三)rRNA寡核苷酸分析(oligonucleotidecatalog)第9頁,課件共16頁,創(chuàng)作于2023年2月細(xì)菌分類命名系統(tǒng)一、細(xì)菌分類系統(tǒng)概況二、伯杰(Bergey)細(xì)菌分類系統(tǒng)及命名第10頁,課件共16頁,創(chuàng)作于2023年2月卷次及主要細(xì)菌種類群細(xì)菌屬/類群第1卷1~11組包括醫(yī)學(xué)、工業(yè)、農(nóng)業(yè)重要的革蘭陰性細(xì)菌1234567891011螺旋體革蘭陰性、需氧、微需氧、有動力、螺形菌革蘭陰性、無動力、彎曲菌革蘭陰性、需氧、桿菌或球菌革蘭陰性、兼性厭氧、桿菌革蘭陰性、厭氧、桿菌或螺形菌異化還原硫酸鹽的細(xì)菌革蘭陰性、厭氧球菌立克次體和衣原體支原體內(nèi)共生菌第11頁,課件共16頁,創(chuàng)作于2023年2月第2卷12~17組包括除放線菌以外的革蘭陽性細(xì)菌121314151617革蘭陽性球菌革蘭陽性、形成芽胞的球菌和桿菌革蘭陽性、規(guī)則的無芽胞桿菌革蘭陽性、不規(guī)則的無芽胞桿菌分枝桿菌諾卡菌形的細(xì)菌第12頁,課件共16頁,創(chuàng)作于2023年2月第3卷18~25組包括光合細(xì)菌、古細(xì)菌、藍(lán)細(xì)菌、其他革蘭陰性細(xì)菌1819202122232425不產(chǎn)氧光合細(xì)菌產(chǎn)氧光合細(xì)菌需氧、化能自氧菌及有關(guān)細(xì)菌出芽和(或)有附屬物的細(xì)菌鞘細(xì)菌非光合、無子實體的滑行細(xì)菌形成子實體的滑行細(xì)菌——粘細(xì)菌古生菌第13頁,課件共16頁,創(chuàng)作于2023年2月第4卷26~33組包括可形成菌絲體的放線菌2627282930313233諾卡菌形放線菌多腔孢囊放線菌游動放線菌鏈霉菌和有關(guān)菌屬馬杜拉菌高溫單胞菌有有關(guān)菌屬高溫放線菌其他屬第14頁,課件共16頁,創(chuàng)作于2023年2月
細(xì)菌的分類方法主要有兩類:人為分類法和系統(tǒng)分類法。系統(tǒng)分類法以細(xì)菌的核酸、蛋白質(zhì)等組成的同源程度進(jìn)行分類,更具科學(xué)性和穩(wěn)定性。其中16SrRNA寡核苷酸分析,由于其核苷酸數(shù)目適中、信息量大、具有高度穩(wěn)定性、易于提取和分析,成為理想的研究工具。
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