
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文檔簡介
第三節(jié)酶的作用機(jī)制演示文稿現(xiàn)在是1頁\一共有44頁\編輯于星期一優(yōu)選第三節(jié)酶的作用機(jī)制現(xiàn)在是2頁\一共有44頁\編輯于星期一一般催化劑反應(yīng)活化能反應(yīng)總能量變化酶促反應(yīng)活化能
非催化反應(yīng)活化能底物(初態(tài))產(chǎn)物(終態(tài))能量改變活化過程酶促反應(yīng)活化能的改變過渡態(tài)
ES(過渡態(tài))現(xiàn)在是3頁\一共有44頁\編輯于星期一中間產(chǎn)物學(xué)說酶與底物通過形成過渡態(tài)的中間產(chǎn)物使反應(yīng)沿一個(gè)低活化能的途徑進(jìn)行。E+SES
ES
EP
E+P目前許多實(shí)驗(yàn)事實(shí)證明了中間復(fù)合物的存在?,F(xiàn)在是4頁\一共有44頁\編輯于星期一
酶(E)與底物(S)結(jié)合生成不穩(wěn)定的中間物(ES),再分解成產(chǎn)物(P)并釋放出酶,使反應(yīng)沿一個(gè)低活化能的途徑進(jìn)行,降低反應(yīng)所需活化能,所以能加快反應(yīng)速度。E+SP+EES能量水平反應(yīng)過程GE1E2中間產(chǎn)物假說現(xiàn)在是5頁\一共有44頁\編輯于星期一從溶菌酶結(jié)構(gòu)的研究中,已制成它與底物形成復(fù)合物的
結(jié)晶,并得到了X線衍射圖,證明了ES復(fù)合物的存在
現(xiàn)在是6頁\一共有44頁\編輯于星期一二、酶的功能部位酶的活性部位必需基團(tuán)調(diào)控部位現(xiàn)在是7頁\一共有44頁\編輯于星期一1、酶的活性中心
(activecenter)
酶分子中直接與底物結(jié)合,并催化底物發(fā)生化學(xué)反應(yīng)的空間區(qū)域,也稱酶的活性部位(activesite)。
現(xiàn)在是8頁\一共有44頁\編輯于星期一(1)活性中心的兩個(gè)功能部位:結(jié)合部位(bindingsite)
酶分子中與底物結(jié)合的部位
決定酶對底物的專一性催化部位(catalyticsite)
酶分子中促使底物發(fā)生化學(xué)變化的部位
決定酶促反應(yīng)的類型,即酶的催化性質(zhì)
現(xiàn)在是9頁\一共有44頁\編輯于星期一(2)活性中心的形成活性中心的功能基團(tuán)主要由氨基酸殘基的側(cè)鏈所提供,在結(jié)合蛋白酶類中還有輔酶的功能基團(tuán)參加。一個(gè)酶的活性中心的氨基酸殘基,并不是密集于某段肽鏈內(nèi),而是通過肽鏈彎曲拆疊才使分散的氨基酸殘基相互接近?,F(xiàn)在是10頁\一共有44頁\編輯于星期一(3)酶活性部位的主要特征相對酶整個(gè)體積來說,活性部位占據(jù)的空間很小活性部位是一個(gè)三維空間結(jié)構(gòu),具有特殊的構(gòu)象活性部位通常位于酶蛋白的兩個(gè)結(jié)構(gòu)域或亞基之間的裂隙,或位于酶分子表面的凹槽。大多數(shù)底物都是通過次級鍵與酶結(jié)合構(gòu)成活性中心的大多數(shù)氨基酸殘基為疏水性,使此小區(qū)形成一個(gè)非極性的微環(huán)境,有利于與底物結(jié)合活性中心表現(xiàn)出一定的柔性和可運(yùn)動性?,F(xiàn)在是11頁\一共有44頁\編輯于星期一一些酶活性部位的AA殘基
酶AA殘基數(shù)活性部位的AA殘基核糖核酸酶124
His12,His119,Lys41
溶菌酶129Asp52,Glu35
胰凝乳蛋白酶241His57,Asp102,Ser195
胃蛋白酶348Asp32,Asp215
木瓜蛋白酶212Cys25,His159
羧肽酶A307Arg127,Glu270,Tyr248,Zn2+現(xiàn)在是12頁\一共有44頁\編輯于星期一活性中心內(nèi)的必需基團(tuán)結(jié)合基團(tuán)(bindinggroup)與底物相結(jié)合催化基團(tuán)(catalyticgroup)催化底物轉(zhuǎn)變成產(chǎn)物位于活性中心以外,維持酶空間構(gòu)象必需的基團(tuán)活性中心外的必需基團(tuán)2、必需基團(tuán):酶分子上與酶活性有關(guān)的化學(xué)基團(tuán)現(xiàn)在是13頁\一共有44頁\編輯于星期一常見的必需基團(tuán)
絲氨酸的-OH半胱氨酸的-SH組氨酸的咪唑基天冬氨酸和谷氨酸的-COOH賴氨酸的ε-NH2酪氨酸的酚羥基現(xiàn)在是14頁\一共有44頁\編輯于星期一底物活性中心以外的必需基團(tuán)結(jié)合基團(tuán)催化基團(tuán)活性中心
現(xiàn)在是15頁\一共有44頁\編輯于星期一牛胰蛋白酶現(xiàn)在是16頁\一共有44頁\編輯于星期一酶的活性中心與酶蛋白空間構(gòu)象完整性之間,是辯證統(tǒng)一的關(guān)系。當(dāng)酶以具有催化活性的構(gòu)象存在時(shí),活性中心便自然地形成。一旦外界理化因素破壞了酶的構(gòu)象,肽鏈伸展,活性中心的特定結(jié)構(gòu)解體,酶就失去催化底物發(fā)生反應(yīng)的能力,結(jié)果是酶變性失活?,F(xiàn)在是17頁\一共有44頁\編輯于星期一酶分子中存在著一些可以與其他非底物分子發(fā)生某種程度的結(jié)合的部位,從而引起酶分子空間構(gòu)象的變化,對酶起激活或抑制作用。3.調(diào)控部位Regulatorysite現(xiàn)在是18頁\一共有44頁\編輯于星期一三、酶催化作用專一性的機(jī)理酶的專一性是由酶的活性中心的構(gòu)象和性質(zhì)決定的酶的活性中心是如何專一性的選擇底物?現(xiàn)在是19頁\一共有44頁\編輯于星期一酶的專一性學(xué)說
鎖鑰學(xué)說(lockandkeytheory)
誘導(dǎo)契合學(xué)說(induced-fithypothesis)現(xiàn)在是20頁\一共有44頁\編輯于星期一酶的專一性學(xué)說1、鎖鑰學(xué)說(Lockandkey)酶活性中心的形狀與底物分子形狀互補(bǔ);酶活性部位≈鎖孔,底物分子≈鑰匙;整個(gè)酶分子的天然構(gòu)象具有剛性結(jié)構(gòu)。1890年EmilFischer提出現(xiàn)在是21頁\一共有44頁\編輯于星期一鎖鑰學(xué)說的特點(diǎn)鎖鑰學(xué)說能很好地解釋酶的立體異構(gòu)專一性;但不能解釋酶的可逆反應(yīng),即酶的活性中心既適合于可逆反應(yīng)的底物,又適合于可逆反應(yīng)的產(chǎn)物。也不能解釋酶專一性中的所有現(xiàn)象?,F(xiàn)在是22頁\一共有44頁\編輯于星期一2、誘導(dǎo)契合學(xué)說(Inducedfit)酶表面并沒有一種與底物互補(bǔ)的固定形狀;酶活性部位的構(gòu)象是柔韌可變的;底物接近活性中心時(shí),誘導(dǎo)酶蛋白構(gòu)象發(fā)生變化,與底物成互補(bǔ)形狀有機(jī)的結(jié)合而催化反應(yīng)進(jìn)行;酶反應(yīng)過程中,活性中心構(gòu)象的變化是可逆的?,F(xiàn)在是23頁\一共有44頁\編輯于星期一四、影響酶催化效率的因素
高效率 比非催化高108-1020倍 比非酶催化高107-1013倍
Why?現(xiàn)在是24頁\一共有44頁\編輯于星期一酶高效催化的策略鄰近效應(yīng)和定向效應(yīng)誘導(dǎo)契合與底物的形變酸-堿催化共價(jià)催化金屬離子的催化作用多元催化活性中心微環(huán)境的影響現(xiàn)在是25頁\一共有44頁\編輯于星期一1、鄰近效應(yīng)和定向效應(yīng)
酶與底物結(jié)合形成中間復(fù)合物后,使底物和底物分子(如雙分子反應(yīng))之間、酶的催化基團(tuán)與底物之間相互鄰近,而使活性部位上底物的有效濃度增加,從而使反應(yīng)速率大大增加的效應(yīng)。--鄰近效應(yīng)
定向效應(yīng):相互靠近的底物分子之間及底物分子的反應(yīng)基團(tuán)與酶的催化基團(tuán)之間正確的定向取位?,F(xiàn)在是26頁\一共有44頁\編輯于星期一
僅僅是靠近還不夠,還需要酶活性中心的催化基團(tuán)和底物的反應(yīng)基團(tuán)在反應(yīng)中彼此相互嚴(yán)格地定向。只有既靠近又定向,底物分子才能迅速的形成過渡態(tài),加速反應(yīng)的進(jìn)行。
靠近與定向A.酶的催化基團(tuán)和底物的反應(yīng)基團(tuán)既不靠近,也不定向。B.兩個(gè)基團(tuán)靠近,但不定向,還不利于反應(yīng)進(jìn)行。C.兩個(gè)基團(tuán)既靠近,又定向,有利于反應(yīng)進(jìn)行?,F(xiàn)在是27頁\一共有44頁\編輯于星期一因?yàn)槊傅奶厥饨Y(jié)構(gòu)及功能,通過專一性識別,使參加反應(yīng)的底物分子結(jié)合在酶的活性部位上,由于鄰近效應(yīng)和定向效應(yīng)使得酶促反應(yīng)由分子間反應(yīng)變得近似于分子內(nèi)反應(yīng),極大提高了反應(yīng)速率。現(xiàn)在是28頁\一共有44頁\編輯于星期一“張力”和“形變”底物與酶結(jié)合酶分子構(gòu)象變化底物分子的敏感鍵
產(chǎn)生“張力”和“形變”敏感鍵斷裂誘導(dǎo)有利于
酶催化的高效性機(jī)理現(xiàn)在是29頁\一共有44頁\編輯于星期一張力學(xué)說這是一個(gè)形成內(nèi)酯的反應(yīng)。當(dāng)R=CH3時(shí),其反應(yīng)速度比R=H的情況快315倍。由于-CH3體積比較大,與反應(yīng)基團(tuán)之間產(chǎn)生一種立體排斥張力,從而使反應(yīng)基團(tuán)之間更容易形成穩(wěn)定的五元環(huán)過渡狀態(tài)。
現(xiàn)在是30頁\一共有44頁\編輯于星期一2、誘導(dǎo)契合與底物形變
酶與底物在誘導(dǎo)契合過程中,酶受底物誘導(dǎo)構(gòu)象發(fā)生變化,同時(shí)酶也使底物分子中的敏感鍵產(chǎn)生“張力”和變形,從而促使底物中的敏感鍵更易于破裂,發(fā)生反應(yīng)?,F(xiàn)在是31頁\一共有44頁\編輯于星期一3、酸-堿催化(acidbasecatalysis)廣義酸-堿催化是指通過質(zhì)子酸提供部分質(zhì)子,或是通過質(zhì)子堿接受部分質(zhì)子的作用,達(dá)到降低反應(yīng)活化能的過程。酶活性部位上的某些基團(tuán)可以作為良好的質(zhì)子供體或受體,通過瞬時(shí)的向底物提供質(zhì)子或從底物接受質(zhì)子以穩(wěn)定過渡態(tài)而加速反應(yīng)的催化機(jī)制?,F(xiàn)在是32頁\一共有44頁\編輯于星期一酶分子中可以作為廣義酸、堿的基團(tuán)咪唑基現(xiàn)在是33頁\一共有44頁\編輯于星期一His57,Asp102,Ser195形成催化三聯(lián)體(catalytictriad)現(xiàn)在是34頁\一共有44頁\編輯于星期一4、共價(jià)催化(covalentcatalysis)共價(jià)催化又稱親核催化或親電子催化酶的活性基團(tuán)和底物通過親核或親電反應(yīng)形成反應(yīng)活性很高的不穩(wěn)定共價(jià)過渡復(fù)合物,使反應(yīng)的活化能大大降低,從而提高反應(yīng)速度。共價(jià)催化的最一般形式:酶的親核基團(tuán)對底物中的碳原子進(jìn)行攻擊,形成共價(jià)中間物?,F(xiàn)在是35頁\一共有44頁\編輯于星期一酶中參與共價(jià)催化的親核基團(tuán)Ser的羥基Cys的巰基Asp的羧基His的咪唑基等某些輔酶,如焦磷酸硫胺素和磷酸吡哆醛等也可以參與共價(jià)催化作用。
現(xiàn)在是36頁\一共有44頁\編輯于星期一
胰凝乳蛋白酶chymotrypsin酶催化的高效性機(jī)理現(xiàn)在是37頁\一共有44頁\編輯于星期一5、金屬離子的催化作用金屬離子通過3種主要途徑參與催化過程:1)通過結(jié)合底物為反應(yīng)定向2)通過可逆的改變金屬離子的價(jià)數(shù)介導(dǎo)氧化還原反應(yīng)(許多氧化-還原酶含有銅或鐵離子,作為酶的輔助因子起著傳遞電子的功能。)3)屏蔽底物或酶活性中心的負(fù)電荷
現(xiàn)在是38頁\一共有44頁\編輯于星期一肌紅蛋白活性中心Fe2+的作用現(xiàn)在是39頁\一共有44頁\編輯于星期一羧肽酶活性中心Zn2+的作用現(xiàn)在是40頁\一共有44頁\編輯于星期一許多激酶的底物為ATP-Mg2+復(fù)合物現(xiàn)在是41頁\一共有44頁\編輯于星期一
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