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生物化學(xué)課件之蛋白質(zhì)第1頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一主要內(nèi)容[教學(xué)時(shí)數(shù)]4學(xué)時(shí)[掌握內(nèi)容]:蛋白質(zhì)的基本組成單位和平均含氮量。20種氨基酸的名稱及三字母英文縮寫符號(hào)。氨基酸的理化性質(zhì)。蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)的定義及維系的鍵、蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)的定義及維系的鍵,肽單元和蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)的主要類型,模體的概念。蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu)的定義及維系的鍵,結(jié)構(gòu)域的定義。蛋白質(zhì)四級(jí)結(jié)構(gòu)的定義及維系的鍵,亞基的定義。蛋白質(zhì)變性的定義及影響因素,蛋白質(zhì)沉淀及維持蛋白質(zhì)膠體溶液的穩(wěn)定因素。蛋白質(zhì)等電點(diǎn)的定義。[熟悉內(nèi)容]:氨基酸的分類,肽的概念基本結(jié)構(gòu),蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)和空間結(jié)構(gòu)與蛋白質(zhì)功能之間的關(guān)系。氨基酸和蛋白質(zhì)的紫外吸收作用。蛋白質(zhì)的分離和純化。[了解內(nèi)容]:生物活性肽,蛋白質(zhì)的模序結(jié)構(gòu),分子病的定義。[自學(xué)內(nèi)容]:蛋白質(zhì)分類,多肽鏈中氨基酸的序列分析、蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)測(cè)定第2頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一第一節(jié)蛋白質(zhì)是生命的物質(zhì)基礎(chǔ)蛋白質(zhì)(protein)是由許多氨基酸(aminoacids)通過(guò)肽鍵(peptidebond)相連形成的高分子含氮化合物。一、什么是蛋白質(zhì)?第3頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一二、蛋白質(zhì)的生物學(xué)重要性1.蛋白質(zhì)是生物體重要組成成分分布廣:普遍存在于生物界,動(dòng)物、植物、微生物主要是由蛋白質(zhì)構(gòu)成。所有器官、組織都含有蛋白質(zhì);細(xì)胞的各個(gè)部分都含有蛋白質(zhì)。含量高:蛋白質(zhì)是細(xì)胞內(nèi)最豐富的有機(jī)分子,占人體干重的45%,某些組織含量更高,例如脾、肺及橫紋肌等高達(dá)80%。第4頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一1)作為生物催化劑(酶)2)代謝調(diào)節(jié)作用(激素)3)免疫保護(hù)作用(抗體)4)物質(zhì)的轉(zhuǎn)運(yùn)和存儲(chǔ)(血紅蛋白、血漿運(yùn)鐵蛋白)5)運(yùn)動(dòng)與支持作用(肌動(dòng)蛋白、肌球蛋白、原肌球蛋白、肌原蛋白)6)控制生長(zhǎng)和分化(核蛋白)7)參與細(xì)胞間信息傳遞(受體蛋白)8)生物膜9)識(shí)別和記憶2.蛋白質(zhì)具有重要的生物學(xué)功能3.氧化供能第5頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一蛋白質(zhì)的分子組成
TheMolecularComponentofProtein第二節(jié)第6頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一一、組成蛋白質(zhì)的元素主要有C、H、O、N和S。
有些蛋白質(zhì)含有少量磷或金屬元素鐵、銅、鋅、錳、鈷、鉬,個(gè)別蛋白質(zhì)還含有碘
。第7頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一
各種蛋白質(zhì)的含氮量很接近,平均為16%。由于體內(nèi)的含氮物質(zhì)以蛋白質(zhì)為主,因此,只要測(cè)定生物樣品中的含氮量,就可以根據(jù)以下公式推算出蛋白質(zhì)的大致含量:100克樣品中蛋白質(zhì)的含量(g%)=每克樣品含氮克數(shù)×6.25×1001/16%蛋白質(zhì)元素組成的特點(diǎn)第8頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一二、氨基酸
——組成蛋白質(zhì)的基本單位存在自然界中的氨基酸有300余種,但組成人體蛋白質(zhì)的氨基酸僅有20種,且均屬
L-氨基酸(甘氨酸除外)。第9頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一H甘氨酸CH3丙氨酸L-氨基酸的通式R(一)氨基酸的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)1.為a氨基酸(脯氨酸除外為a亞氨基酸)。2.是L型氨基酸(甘氨酸除外)。3.不同的氨基酸,其R側(cè)鏈不同,對(duì)蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)和空間結(jié)構(gòu)有影響。第10頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一非極性疏水性氨基酸:脂肪族、芳香族、雜環(huán)極性中性氨基酸:羥基、酰胺、含巰基半胱氨酸、甘氨酸3.酸性氨基酸:羧基4.堿性氨基酸:氨基、胍基、咪唑基(二)氨基酸的分類*20種氨基酸的英文名稱、縮寫符號(hào)及分類如下:親水性氨基酸第11頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一甘氨酸
glycine
Gly
G
5.97丙氨酸
alanineAlaA
6.00纈氨酸
valineValV
5.96亮氨酸
leucineLeuL
5.98
異亮氨酸
isoleucineIleI
6.02
苯丙氨酸
phenylalaninePheF
5.48脯氨酸
prolineProP
6.30非極性疏水性氨基酸目錄第12頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一色氨酸
tryptophanTryW
5.89絲氨酸
serineSerS
5.68酪氨酸
tyrosineTryY
5.66
半胱氨酸
cysteineCysC
5.07
蛋氨酸
methionine
MetM
5.74天冬酰胺
asparagineAsnN
5.41
谷氨酰胺
glutamineGlnQ
5.65
蘇氨酸
threonineThrT5.602.極性中性氨基酸目錄第13頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一天冬氨酸
asparticacidAspD
2.97谷氨酸
glutamicacidGluE
3.22賴氨酸
lysineLysK
9.74精氨酸
arginineArgR
10.76組氨酸
histidineHisH
7.593.酸性氨基酸4.堿性氨基酸目錄第14頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一幾種特殊氨基酸
脯氨酸(亞氨基酸)第15頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一
半胱氨酸
+胱氨酸二硫鍵-HH第16頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一(二)氨基酸的理化性質(zhì)1.兩性解離性質(zhì)2.紫外吸收性質(zhì)3.茚三酮反應(yīng)第17頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一pH=pI+OH-pH>pI+H++OH-+H+pH<pI氨基酸的兼性離子
陽(yáng)離子陰離子氨基酸是兩性電解質(zhì),其解離程度取決于所處溶液的酸堿度。1.兩性解離及等電點(diǎn)第18頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一等電點(diǎn)(isoelectricpoint,pI)
在某一pH的溶液中,氨基酸解離成陽(yáng)離子和陰離子的趨勢(shì)及程度相等,成為兼性離子,呈電中性。此時(shí)溶液的pH值稱為該氨基酸的等電點(diǎn)。除堿性氨基酸外,其余氨基酸的等電點(diǎn)均小于pH7第19頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一2.紫外吸收色氨酸、酪氨酸、苯丙氨酸的最大吸收峰在
280nm
附近。大多數(shù)蛋白質(zhì)含有這兩種氨基酸殘基,所以測(cè)定蛋白質(zhì)溶液280nm的光吸收值是分析溶液中蛋白質(zhì)含量的快速簡(jiǎn)便的方法。芳香族氨基酸的紫外吸收第20頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一3.茚三酮反應(yīng)氨基酸與茚三酮水合物共熱,可生成藍(lán)紫色化合物,其最大吸收峰在570nm處。由于此吸收峰值與氨基酸的含量存在正比關(guān)系,因此可作為氨基酸定量分析方法。第21頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一蛋白質(zhì)的分子結(jié)構(gòu)
TheMolecularStructureofProtein
第三節(jié)第22頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一蛋白質(zhì)的分子結(jié)構(gòu)包括
一級(jí)結(jié)構(gòu)(primarystructure)二級(jí)結(jié)構(gòu)(secondarystructure)三級(jí)結(jié)構(gòu)(tertiarystructure)四級(jí)結(jié)構(gòu)(quaternarystructure)高級(jí)結(jié)構(gòu)第23頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一定義蛋白質(zhì)的一級(jí)結(jié)構(gòu)指多肽鏈中氨基酸的種類、數(shù)量和排列順序。一、蛋白質(zhì)的一級(jí)結(jié)構(gòu)主要的化學(xué)鍵肽鍵,有些蛋白質(zhì)還包括二硫鍵。第24頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一(一)、肽鍵*肽鍵(peptidebond)是由一個(gè)氨基酸的-羧基與另一個(gè)氨基酸的-氨基脫水縮合而形成的化學(xué)鍵。是氨基酸的連接方式.第25頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一+-HOH甘氨酰甘氨酸肽鍵第26頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一氨基酸殘基氨基酸在形成肽鏈時(shí)丟失了一分子水,肽鏈中的氨基酸分子已不完整,稱為氨基酸殘基(aminoacidresidue)。第27頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一(二)肽(peptidepeptide)氨基酸借肽鍵相連而形成的化合物稱肽。根據(jù)氨基酸的組成個(gè)數(shù)可以依次稱為二肽、三肽、四肽……寡肽(oligopeptideoligopeptide)由10個(gè)以內(nèi)氨基酸連成的小肽多肽(polypeptide)由更多氨基酸連成的肽蛋白質(zhì)(protein)就是由許多氨基酸殘基組成的多肽鏈第28頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一N末端:多肽鏈中有自由氨基的一端C末端:多肽鏈中有自由羧基的一端多肽鏈有兩端*多肽鏈(polypeptidechain)是指許多氨基酸之間以肽鍵連接而成的一種結(jié)構(gòu)。第29頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一(三)多肽鏈有方向性NH2MetPhePheCysSerThrValCOOH氨基末端(N-端)羧基末端(C-端)書寫多肽鏈時(shí)一般把氨基端放在左側(cè),羧基端放在右側(cè)。蛋-苯丙-苯丙-半胱-絲-蘇-纈第30頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一主鏈:多肽鏈中由肽鍵連接成的長(zhǎng)鏈側(cè)鏈:各氨基酸殘基的側(cè)鏈基團(tuán)所構(gòu)成的短鏈第31頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一一級(jí)結(jié)構(gòu)是蛋白質(zhì)空間構(gòu)象和特異生物學(xué)功能的基礎(chǔ)。目錄第32頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一(一)維持蛋白質(zhì)構(gòu)象的化學(xué)鍵氫鍵
疏水鍵鹽鍵配位鍵二硫鍵范德華力二、蛋白質(zhì)的構(gòu)象第33頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一氫鍵負(fù)電性很強(qiáng)的原子(如氧或氮)和與氧或氮共價(jià)結(jié)合的氫原子相互吸引,這種作用力稱為氫鍵。第34頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一疏水相互作用
由非極性基團(tuán)受到水分子排斥相互聚集在一起的作用力。第35頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一離子鍵由異性電荷間的靜電吸引形成的。第36頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一目錄第37頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一(二)蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu)蛋白質(zhì)分子中某一段肽鏈的局部空間結(jié)構(gòu),即該段肽鏈主鏈骨架原子的相對(duì)空間位置,并不涉及氨基酸殘基側(cè)鏈的構(gòu)象
。定義
主要的化學(xué)鍵:
氫鍵
第38頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一
蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)的主要形式
-螺旋(-helix)
-折疊(-pleatedsheet)
-轉(zhuǎn)角(-turn)
無(wú)規(guī)卷曲(randomcoil)
第39頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一1.肽單元參與肽鍵的6個(gè)原子C1、C、O、N、H、C2位于同一平面,C1和C2在平面上所處的位置為反式(trans)構(gòu)型,此同一平面上的6個(gè)原子構(gòu)成了所謂的肽單元
(peptideunit)
。蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)的基本組成單位—肽鍵平面(肽單元)(peptideunit)第40頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一肽單元(肽鍵平面、酰胺平面)肽鍵中的C=O和C-N均不能自由旋轉(zhuǎn),肽鍵(-CONH-)中的4個(gè)原子和2個(gè)α碳原子(Cα)被約束在一個(gè)剛性平面(即肽鍵平面)上,構(gòu)成一個(gè)肽單元(peptideunit)。第41頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一肽鍵的特點(diǎn)是氮原子上的孤對(duì)電子與羰基具有明顯的共軛作用。C-N具有雙鍵性質(zhì),不能自由旋轉(zhuǎn)組成肽鍵的原子處于同一平面。肽單位是剛性平面C-N相連的氫和氧與兩個(gè)a碳原子反向分布第42頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一2.-螺旋目錄以肽鍵平面為單位,以α-碳原子為轉(zhuǎn)折盤旋形成右手螺旋第43頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一a.以肽鍵平面為單位,以α-碳原子為轉(zhuǎn)折盤旋形成右手螺旋b.主鏈原子構(gòu)成螺旋的主體,側(cè)鏈(R基團(tuán))在其外部。c.每3.6個(gè)氨基酸旋轉(zhuǎn)一周,螺距為0.54nm,每?jī)蓚€(gè)氨基酸之間的垂直距離為0.15nm,肽鍵平面與螺旋長(zhǎng)軸平行。d.氫鍵是a-螺旋穩(wěn)定的主要次級(jí)鍵,一個(gè)肽單位N上的氫原子與第四個(gè)肽單位羰基上的氧原子形成氫鍵,所有的肽鍵都可以形成氫鍵。作用:增強(qiáng)了機(jī)械強(qiáng)度,具有彈性第44頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一d.α-螺旋參數(shù):每3.6個(gè)氨基酸殘基繞成一個(gè)螺圈(3600)螺距為0.540.54nmnm每個(gè)氨基酸殘基上升0.54/3.6=0.150.15nmnm第45頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一2.β-折疊(β-pleatedsheetsheet)肽鍵平面呈伸展的鋸齒狀排列形成的結(jié)構(gòu)稱β-折疊。第46頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一-折疊結(jié)構(gòu)特點(diǎn):1.形狀2.穩(wěn)定鍵3.R基團(tuán)影響第47頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一3.β-轉(zhuǎn)角(β-turn)肽鏈出現(xiàn)1800回折的轉(zhuǎn)角處結(jié)構(gòu)稱為β-轉(zhuǎn)角。*常見(jiàn)于球狀蛋白質(zhì)分子表面*第一個(gè)殘基的C=O與第四個(gè)殘基的N-H形成氫鍵*第二個(gè)殘基常為脯氨酸Pro第48頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一4.無(wú)規(guī)卷曲(randomcoil)沒(méi)有確定規(guī)律性的肽鍵構(gòu)象常見(jiàn)于球狀蛋白質(zhì)分子中,在其它類型二級(jí)結(jié)構(gòu)肽段之間起活節(jié)作用,有利于整條肽鏈盤曲折疊第49頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一(三)超二級(jí)結(jié)構(gòu)在多肽鏈內(nèi)順序上相鄰的二級(jí)結(jié)構(gòu)常常在空間折疊中靠近,彼此相互作用,形成有規(guī)則的二級(jí)結(jié)構(gòu)聚集體,被稱為超二級(jí)結(jié)構(gòu)(模體(motif))。主要有三種形式α螺旋組合(α
α
),β折疊組合(βββ),α螺旋組合β折疊組合(βαβ)。主要是側(cè)鏈殘基作用的結(jié)果。第50頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一鈣結(jié)合蛋白中結(jié)合鈣離子的模體
鋅指結(jié)構(gòu)第51頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一纖連蛋白分子的結(jié)構(gòu)域(四)結(jié)構(gòu)域大分子蛋白質(zhì)的三級(jí)結(jié)構(gòu)常可分割成一個(gè)或數(shù)個(gè)球狀或纖維狀的區(qū)域,折疊得較為緊密,各行使其功能,稱為結(jié)構(gòu)域(domain)。第52頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一一級(jí)結(jié)構(gòu)對(duì)二級(jí)結(jié)構(gòu)側(cè)鏈原子的影響的影響R基的電荷性質(zhì)-多個(gè)帶相同電荷的氨基酸在肽鏈中連續(xù)出現(xiàn)(polyLys,polyGlu)R基的基團(tuán)大小-側(cè)鏈基團(tuán)較大的氨基酸殘基的集中部位(polyIle)脯氨酸,羥脯氨酸
都會(huì)妨礙α-螺旋的形成
β-折疊要求氨基酸殘基的側(cè)鏈較小第53頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一(五)蛋白質(zhì)的三級(jí)結(jié)構(gòu)疏水鍵、離子鍵、氫鍵和VanderWaals力等。主要的化學(xué)鍵整條肽鏈中全部氨基酸殘基的相對(duì)空間位置。即肽鏈中所有原子在三維空間的排布位置。1定義二硫鍵(共價(jià)鍵)次級(jí)鍵:第54頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一
肌紅蛋白(Mb)
N端C端第55頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一2.分子伴侶分子伴侶(chaperon)通過(guò)提供一個(gè)保護(hù)環(huán)境從而加速蛋白質(zhì)折疊成天然構(gòu)象或形成四級(jí)結(jié)構(gòu)。*分子伴侶可逆地與未折疊肽段的疏水部分結(jié)合隨后松開(kāi),如此重復(fù)進(jìn)行可防止錯(cuò)誤的聚集發(fā)生,使肽鏈正確折疊。*分子伴侶也可與錯(cuò)誤聚集的肽段結(jié)合,使之解聚后,再誘導(dǎo)其正確折疊。*分子伴侶在蛋白質(zhì)分子折疊過(guò)程中二硫鍵的正確形成起了重要的作用。第56頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一亞基之間的結(jié)合力主要是疏水作用,其次是氫鍵和離子鍵。(六)蛋白質(zhì)的四級(jí)結(jié)構(gòu)由兩個(gè)或兩個(gè)以上的亞基之間相互作用,彼此以非共價(jià)鍵相連而形成更復(fù)雜的構(gòu)象,稱為蛋白質(zhì)的四級(jí)結(jié)構(gòu)。有些蛋白質(zhì)分子含有二條或多條多肽鏈,每一條多肽鏈都有完整的三級(jí)結(jié)構(gòu),稱為蛋白質(zhì)的亞基(subunit)。第57頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一血紅蛋白的四級(jí)結(jié)構(gòu)
第58頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一第59頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系TheRelationofStructureandFunctionofProtein第四節(jié)第60頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一(一)一級(jí)結(jié)構(gòu)是空間構(gòu)象的基礎(chǔ)一、蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系牛核糖核酸酶的一級(jí)結(jié)構(gòu)二硫鍵第61頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一
天然狀態(tài),有催化活性
尿素、β-巰基乙醇
去除尿素、β-巰基乙醇非折疊狀態(tài),無(wú)活性第62頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一(二)一級(jí)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系1一級(jí)結(jié)構(gòu)相似的多肽或蛋白質(zhì),空間結(jié)構(gòu)及功能相似。
胰島素2.一級(jí)結(jié)構(gòu)不同,生物學(xué)功能各異。加壓素N-半胱-酪-苯丙-谷胺-天胺-半胱-脯-精-甘催產(chǎn)素----------亮--------------------------3.一級(jí)結(jié)構(gòu)中關(guān)鍵部分相同其功能也相同。促腎上腺皮質(zhì)激素(ACTH)39肽1----------------24------------33-----39
活性必需部分種屬特異性4.一級(jí)結(jié)構(gòu)中關(guān)鍵部分變化,其生物學(xué)活性也改變。基因突變、化學(xué)修飾定向改造關(guān)鍵氨基酸---藥物開(kāi)發(fā)5.一級(jí)結(jié)構(gòu)可幫助了解生物進(jìn)化。親緣關(guān)系越遠(yuǎn),氨基酸組成差異越大6.一級(jí)結(jié)構(gòu)變化與疾病第63頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一一級(jí)結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系1.一級(jí)結(jié)構(gòu)相似的蛋白質(zhì)功能相似一級(jí)結(jié)構(gòu)不同的蛋白質(zhì)功能不同表1-2哺乳類動(dòng)物胰島素氨基酸序列的差胰島素氨基酸殘基序號(hào)
B30A10A6A5AlaIleSerThr馬
AlaValSerAla羊
AlaValGlyAla牛
SerIleGlyThr兔
AlaIleSerThr狗
AlaIleSerThr豬
ThrIleSerThr人第64頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一ACTH促腎上腺素皮質(zhì)激素MSH促黑激素第65頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一第66頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一N-val·his·leu·thr·pro·glu·glu·····C(146)HbSβ肽鏈HbAβ肽鏈N-val·his·leu·thr·pro·val
·glu·····C(146)例:鐮刀形紅細(xì)胞貧血
這種由蛋白質(zhì)分子發(fā)生變異所導(dǎo)致的疾病,稱為“分子病”。例:糖尿病24位苯丙氨酸被亮氨酸取代第67頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一HbS與HbA的區(qū)別第68頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一(一)蛋白質(zhì)的前體活化(二)蛋白質(zhì)的變構(gòu)現(xiàn)象1.肌紅蛋白與血紅蛋白的結(jié)構(gòu)
二、蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)與功能的關(guān)系目錄血紅素結(jié)構(gòu)第69頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一肌紅蛋白與血紅蛋白的結(jié)構(gòu)第70頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一變構(gòu)效應(yīng)(allostericeffect)蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)的改變伴隨其功能的變化,稱為變構(gòu)效應(yīng)。第71頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一(三)蛋白質(zhì)構(gòu)象改變與疾病蛋白質(zhì)構(gòu)象疾病:若蛋白質(zhì)的折疊發(fā)生錯(cuò)誤,盡管其一級(jí)結(jié)構(gòu)不變,但蛋白質(zhì)的構(gòu)象發(fā)生改變,仍可影響其功能,嚴(yán)重時(shí)可導(dǎo)致疾病發(fā)生。第72頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一蛋白質(zhì)構(gòu)象改變導(dǎo)致疾病的機(jī)理:有些蛋白質(zhì)錯(cuò)誤折疊后相互聚集,常形成抗蛋白水解酶的淀粉樣纖維沉淀,產(chǎn)生毒性而致病,表現(xiàn)為蛋白質(zhì)淀粉樣纖維沉淀的病理改變。這類疾病包括:人紋狀體脊髓變性病、老年癡呆癥、亨停頓舞蹈病、瘋牛病等。第73頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一瘋牛病中的蛋白質(zhì)構(gòu)象改變瘋牛病是由朊病毒蛋白(prionprotein,PrP)引起的一組人和動(dòng)物神經(jīng)退行性病變。正常的PrP富含α-螺旋,稱為PrPc。PrPc在某種未知蛋白質(zhì)的作用下可轉(zhuǎn)變成全為β-折疊的PrPsc,從而致病。PrPcα-螺旋PrPscβ-折疊正常瘋牛病第74頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一第五節(jié)蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)與分離純化ThePhysicalandChemicalCharactersandSeparationandPurificationofProtein第75頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一一、蛋白質(zhì)分子大小、形狀及分子量的測(cè)定分子篩層析法SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳生物質(zhì)譜第76頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一二蛋白質(zhì)的變性、沉淀和凝固*蛋白質(zhì)的變性(denaturation)在某些物理和化學(xué)因素作用下,其特定的空間構(gòu)象被破壞,也即有序的空間結(jié)構(gòu)變成無(wú)序的空間結(jié)構(gòu),從而導(dǎo)致其理化性質(zhì)改變和生物活性的喪失。第77頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一
造成變性的因素?物理因素:高溫、高壓、紫外線、劇烈振蕩?化學(xué)因素:強(qiáng)酸、強(qiáng)堿、有機(jī)溶劑、生物堿、尿素、重金屬
變性的本質(zhì)——
破壞非共價(jià)鍵和二硫鍵,不改變蛋白質(zhì)的一級(jí)結(jié)構(gòu)。蛋白質(zhì)的空間結(jié)構(gòu)被破壞,但不改變蛋白質(zhì)的一級(jí)結(jié)構(gòu)第78頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一
應(yīng)用舉例臨床醫(yī)學(xué)上,變性因素常被應(yīng)用來(lái)消毒及滅菌。此外,防止蛋白質(zhì)變性也是有效保存蛋白質(zhì)制劑(如疫苗等)的必要條件。
變性作用的特征1生物活性的喪失2某些理化性質(zhì)的改變第79頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一若蛋白質(zhì)變性程度較輕,去除變性因素后,蛋白質(zhì)仍可恢復(fù)或部分恢復(fù)其原有的構(gòu)象和功能,稱為復(fù)性(renaturation)。蛋白質(zhì)的復(fù)性第80頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一
天然狀態(tài),有催化活性
尿素、β-巰基乙醇
去除尿素、β-巰基乙醇非折疊狀態(tài),無(wú)活性第81頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一三、蛋白質(zhì)的兩性電離與等電點(diǎn)蛋白質(zhì)分子除兩端的氨基和羧基可解離外,氨基酸殘基側(cè)鏈中某些基團(tuán),在一定的溶液pH條件下都可解離成帶負(fù)電荷或正電荷的基團(tuán)。
第82頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一*蛋白質(zhì)的等電點(diǎn)(isoelectricpoint,pI)當(dāng)?shù)鞍踪|(zhì)溶液處于某一pH時(shí),蛋白質(zhì)解離成正、負(fù)離子的趨勢(shì)相等,即成為兼性離子,凈電荷為零,此時(shí)溶液的pH稱為蛋白質(zhì)的等電點(diǎn)。第83頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一四、蛋白質(zhì)的膠體性質(zhì)蛋白質(zhì)屬于生物大分子之一,分子量可自1萬(wàn)至100萬(wàn)之巨,其分子的直徑可達(dá)1~100nm,為膠粒范圍之內(nèi)。*蛋白質(zhì)膠體穩(wěn)定的因素顆粒表面電荷水化膜第84頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一+++++++帶正電荷的蛋白質(zhì)--------帶負(fù)電荷的蛋白質(zhì)在等電點(diǎn)的蛋白質(zhì)水化膜++++++++帶正電荷的蛋白質(zhì)--------帶負(fù)電荷的蛋白質(zhì)不穩(wěn)定的蛋白質(zhì)顆粒酸堿酸堿酸堿脫水作用脫水作用脫水作用溶液中蛋白質(zhì)的聚沉第85頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一
五、蛋白質(zhì)沉淀
在一定條件下,蛋白疏水側(cè)鏈暴露在外,肽鏈融會(huì)相互纏繞繼而聚集,因而從溶液中析出。變性的蛋白質(zhì)易于沉淀,有時(shí)蛋白質(zhì)發(fā)生沉淀,但并不變性。機(jī)制:中性鹽沉淀反應(yīng)、有機(jī)溶劑沉淀反應(yīng)、加熱沉淀反應(yīng)、重金屬鹽沉淀反應(yīng)、生物堿制劑沉淀反應(yīng)*蛋白質(zhì)的凝固作用(proteincoagulation)蛋白質(zhì)變性后的絮狀物加熱可變成比較堅(jiān)固的凝塊,此凝塊不易再溶于強(qiáng)酸和強(qiáng)堿中。
第86頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一六、蛋白質(zhì)的呈色反應(yīng)⒈茚三酮反應(yīng)(ninhydrinreaction)
蛋白質(zhì)經(jīng)水解后產(chǎn)生的氨基酸也可發(fā)生茚三酮反應(yīng)。⒉雙縮脲反應(yīng)(biuretreaction)蛋白質(zhì)和多肽分子中肽鍵在稀堿溶液中與硫酸銅共熱,呈現(xiàn)紫色或紅色,此反應(yīng)稱為雙縮脲反應(yīng),雙縮脲反應(yīng)可用來(lái)檢測(cè)蛋白質(zhì)水解程度。3.酚試劑反應(yīng)在堿性條件下,酪氨酸、色氨酸可與酚試劑生成;藍(lán)色化合物,藍(lán)色程度與蛋白質(zhì)的量成正比。第87頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一七、蛋白質(zhì)的紫外吸收由于蛋白質(zhì)分子中含有共軛雙鍵的酪氨酸和色氨酸,因此在280nm波長(zhǎng)處有特征性吸收峰。蛋白質(zhì)的OD280與其濃度呈正比關(guān)系,因此可作蛋白質(zhì)定量測(cè)定。第88頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一八、蛋白質(zhì)的免疫學(xué)性質(zhì)1抗原2抗體3蛋白質(zhì)免疫學(xué)性質(zhì)的應(yīng)用第89頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一一、蛋白質(zhì)的提取1材料的選擇2組織細(xì)胞的破碎
3提取第六節(jié)、蛋白質(zhì)的分離和純化的基本原理第90頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一二、蛋白質(zhì)的分離和純化1、透析及超濾法2、丙酮沉淀、鹽析及免疫沉淀3、電泳4、層析5、超速離心第91頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一(一)透析及超濾法*透析(dialysis)利用透析袋把大分子蛋白質(zhì)與小分子化合物分開(kāi)的方法。第92頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一超濾法應(yīng)用正壓或離心力使蛋白質(zhì)溶液透過(guò)有一定截留分子量的超濾膜,達(dá)到濃縮蛋白質(zhì)溶液的目的。第93頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一有機(jī)溶劑沉淀法作用原理:使蛋白質(zhì)脫去水化層,又能降低溶液的介電常數(shù)使蛋白質(zhì)表面電荷減少,導(dǎo)致蛋白質(zhì)分子聚集而沉淀。常用有機(jī)溶劑:甲醇、乙醇、丙酮缺點(diǎn):常會(huì)使蛋白質(zhì)變性注意事項(xiàng):必須在低溫下操作,盡量縮短處理的時(shí)間,及時(shí)將蛋白質(zhì)中殘存的有機(jī)溶劑除去。(二)丙酮沉淀、鹽析及免疫沉淀第94頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一丙酮沉淀*使用丙酮沉淀時(shí),必須在0~4℃低溫下進(jìn)行,丙酮用量一般10倍于蛋白質(zhì)溶液體積。蛋白質(zhì)被丙酮沉淀后,應(yīng)立即分離。除了丙酮以外,也可用乙醇沉淀。第95頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一鹽析法(saltingout)定義:向蛋白質(zhì)溶液中加入大量中性鹽使蛋白質(zhì)沉淀稱為鹽析常用的中性鹽:硫酸銨、硫酸鈉、氯化鈉等作用原理:鹽離子與水親和力極強(qiáng)奪去蛋白質(zhì)的水化層,減少分子間靜電斥力特點(diǎn):不破壞蛋白質(zhì)的構(gòu)象,蛋白質(zhì)不發(fā)生變性。第96頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一調(diào)節(jié)鹽析所用的鹽濃度和溶液的pH值,可將溶液中混合的各種蛋白質(zhì)逐個(gè)分開(kāi)。稱為分段鹽析法血漿清蛋白血漿球蛋白半飽和(NH4)2SO4飽和(NH4)2SO4第97頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一*
免疫沉淀法:將某一純化蛋白質(zhì)免疫動(dòng)物可獲得抗該蛋白的特異抗體。利用特異抗體識(shí)別相應(yīng)的抗原蛋白,并形成抗原抗體復(fù)合物的性質(zhì),可從蛋白質(zhì)混合溶液中分離獲得抗原蛋白。第98頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一(三)電泳蛋白質(zhì)在高于或低于其pI的溶液中為帶電的顆粒,在電場(chǎng)中能向正極或負(fù)極移動(dòng)。這種通過(guò)蛋白質(zhì)在電場(chǎng)中泳動(dòng)而達(dá)到分離各種蛋白質(zhì)的技術(shù),稱為電泳(elctrophoresis)
。根據(jù)支撐物的不同,可分為薄膜電泳、凝膠電泳等。第99頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一幾種重要的蛋白質(zhì)電泳*SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳,常用于蛋白質(zhì)分子量的測(cè)定。*等電聚焦電泳,通過(guò)蛋白質(zhì)等電點(diǎn)的差異而分離蛋白質(zhì)的電泳方法。*雙向凝膠電泳是蛋白質(zhì)組學(xué)研究的重要技術(shù)。第100頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一1:菌體(插入原核翻譯增強(qiáng)子)2:菌體(未插入原核翻譯增強(qiáng)子)3:蛋白A+OGP4:Marker原核翻譯增強(qiáng)子的作用第101頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一(四)層析層析(chromatography)分離蛋白質(zhì)的原理待分離蛋白質(zhì)溶液(流動(dòng)相)經(jīng)過(guò)一個(gè)固態(tài)物質(zhì)(固定相)時(shí),根據(jù)溶液中待分離的蛋白質(zhì)顆粒大小、電荷多少及親和力等,使待分離的蛋白質(zhì)組分在兩相中反復(fù)分配,并以不同速度流經(jīng)固定相而達(dá)到分離蛋白質(zhì)的目的。第102頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一蛋白質(zhì)分離常用的層析方法*離子交換層析:利用各蛋白質(zhì)的電荷量及性質(zhì)不同進(jìn)行分離。凝膠過(guò)濾(gelfiltration)又稱分子篩層析,利用各蛋白質(zhì)分子大小不同分離。親和層析:根據(jù)配基特異性的分離純化方法第103頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一目錄第104頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一目錄第105頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一N-內(nèi)含肽-C
幾丁質(zhì)結(jié)合蛋白
幾丁質(zhì)
19肽19肽
一次性獲得19肽
目的蛋白
載體蛋白層析介質(zhì)親和層析原理
:第106頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一幾丁質(zhì)雜蛋白19肽(目的蛋白)載體蛋白123第107頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一(五)超速離心*超速離心法(ultracentrifugation)既可以用來(lái)分離純化蛋白質(zhì)也可以用作測(cè)定蛋白質(zhì)的分子量。*蛋白質(zhì)在離心場(chǎng)中的行為用沉降系數(shù)(sedimentationcoefficient,S)表示,沉降系數(shù)與蛋白質(zhì)的密度和形狀相關(guān)。第108頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一因?yàn)槌两迪禂?shù)S大體上和分子量成正比關(guān)系,故可應(yīng)用超速離心法測(cè)定蛋白質(zhì)分子量,但對(duì)分子形狀的高度不對(duì)稱的大多數(shù)纖維狀蛋白質(zhì)不適用。第109頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一三、蛋白質(zhì)的分離與純化的類型根據(jù)溶解度不同的分離純化方法1等電點(diǎn)沉淀2鹽析沉淀3低溫有機(jī)溶劑沉淀法4溫度對(duì)蛋白質(zhì)溶解度的影響第110頁(yè),共121頁(yè),2023年,2月20日,星期一根據(jù)分子大小不同的分
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