基因組學(xué)的合成和加工詳解演示文稿

基因組學(xué)的合成和加工詳解演示文稿現(xiàn)在是1頁(yè)\一共有36頁(yè)\編輯于星期五優(yōu)選基因組學(xué)的合成和加工現(xiàn)在是2頁(yè)\一共有36頁(yè)\編輯于星期五細(xì)菌的轉(zhuǎn)錄延伸RNA合成的化學(xué)基礎(chǔ)大腸桿菌轉(zhuǎn)錄延伸復(fù)合物RNA聚合酶覆蓋的模板DNA片段長(zhǎng)約30bp，包含12-14bp的轉(zhuǎn)錄泡，其中RNA-DNA雜合鏈的長(zhǎng)度是8-9bp現(xiàn)在是3頁(yè)\一共有36頁(yè)\編輯于星期五細(xì)菌RNA聚合酶內(nèi)的相互作用現(xiàn)在是4頁(yè)\一共有36頁(yè)\編輯于星期五細(xì)菌轉(zhuǎn)錄延伸復(fù)合體模型現(xiàn)在是5頁(yè)\一共有36頁(yè)\編輯于星期五細(xì)菌轉(zhuǎn)錄的終止轉(zhuǎn)錄的終止(1)—固有終止子內(nèi)源性(固有性)終止子(intrinsicterminator)，在體外沒(méi)有任何其它因子的參與時(shí)，仍能終止轉(zhuǎn)錄的某些位點(diǎn)。特征：1）反向回文序列轉(zhuǎn)錄后形成發(fā)夾結(jié)構(gòu)，在發(fā)夾的基部有GC富含區(qū)；2）回文序列后有一段A，轉(zhuǎn)錄出最末端連續(xù)多個(gè)U，形成的A-U堿基配對(duì)僅有兩個(gè)氫鍵，從而終止比延伸更有利?，F(xiàn)在是6頁(yè)\一共有36頁(yè)\編輯于星期五活性位點(diǎn)翼狀結(jié)構(gòu)現(xiàn)在是7頁(yè)\一共有36頁(yè)\編輯于星期五轉(zhuǎn)錄的終止(2)--ρ-依賴(lài)性終止子ρ-依賴(lài)性終止子(Rhodependentterminator)，需要ρ因子輔助。特征：1）形成發(fā)夾不如內(nèi)源性終止子牢固，但可以使RNA聚合酶暫停；2）ρ因子有解旋酶活性，當(dāng)RNA聚合酶暫停時(shí)，它跟上并打開(kāi)RNA-DNA堿基配對(duì)，釋放出轉(zhuǎn)錄物，終止轉(zhuǎn)錄?，F(xiàn)在是8頁(yè)\一共有36頁(yè)\編輯于星期五延伸和終止的選擇調(diào)控抗終止作用忽略終止信號(hào)衰減作用導(dǎo)致提前終止轉(zhuǎn)錄物降解蛋白能夠防止后退的聚合酶被卡住現(xiàn)在是9頁(yè)\一共有36頁(yè)\編輯于星期五抗終止作用忽略終止信號(hào)λ噬菌體感染周期中的抗終止作用現(xiàn)在是10頁(yè)\一共有36頁(yè)\編輯于星期五衰減作用導(dǎo)致提前終止現(xiàn)在是11頁(yè)\一共有36頁(yè)\編輯于星期五色氨酸操縱子的衰減作用轉(zhuǎn)錄起始點(diǎn)與trpE基因間可形成兩個(gè)發(fā)夾：其中小的為終止信號(hào)，而大的更靠近起始點(diǎn)也更穩(wěn)定；兩發(fā)夾環(huán)位置重疊，一次只能形成一個(gè)；RNA聚合酶與RNA轉(zhuǎn)錄物5’端核糖體間相對(duì)位置決定形成哪一個(gè)發(fā)夾環(huán)：若核糖體暫停，形成大發(fā)夾，繼續(xù)轉(zhuǎn)錄，并隨即翻譯成蛋白；核糖體隨RNA聚合酶移動(dòng)，會(huì)占據(jù)形成大發(fā)夾環(huán)莖部的位置，只能形成小發(fā)夾，終止轉(zhuǎn)錄。色氨酸的量可調(diào)節(jié)大小發(fā)夾環(huán)的形成；終止信號(hào)上游有一個(gè)可編碼14個(gè)氨基酸（內(nèi)含兩個(gè)色氨酸）的短O(píng)RF，色氨酸不足時(shí)蛋白質(zhì)合成停止，核糖體暫停，則聚合酶繼續(xù)轉(zhuǎn)錄，反之則終止?，F(xiàn)在是12頁(yè)\一共有36頁(yè)\編輯于星期五不同細(xì)菌中色氨酸操縱子調(diào)控的復(fù)雜性不同枯草芽孢桿菌：只存在衰減機(jī)制，而且衰減與否不由核糖體在mRNA上移動(dòng)速度決定，而由一種RNA結(jié)合蛋白TRAP(trpRNA-bindingattenuationprotein)介導(dǎo)現(xiàn)在是13頁(yè)\一共有36頁(yè)\編輯于星期五轉(zhuǎn)錄物降解蛋白防止后退的RNA聚合酶被卡住現(xiàn)在是14頁(yè)\一共有36頁(yè)\編輯于星期五細(xì)菌RNA的加工E.coli前體rRNA的加工E.coli前體tRNA的加工現(xiàn)在是15頁(yè)\一共有36頁(yè)\編輯于星期五細(xì)菌RNA的降解特異性mRNA降解是調(diào)節(jié)基因組表達(dá)的一種強(qiáng)力方式。細(xì)菌mRNA通常很快被降解，其半衰期一般不超過(guò)幾分鐘。細(xì)菌mRNA按3’-5’方向降解RNaseE和RNaseIII，在RNA分子內(nèi)形成切口RNaseII按3’-5’方向切除PNPase，也從mRNA3’-5’方向降解，需要無(wú)機(jī)磷酸鹽作為輔助底物現(xiàn)在是16頁(yè)\一共有36頁(yè)\編輯于星期五第二節(jié)真核生物RNA的合成與加工由RNA聚合酶II進(jìn)行真核生物mRNA的合成核前體mRNA的內(nèi)含子剪切真核細(xì)胞前體rRNA和前體tRNA的剪接真核生物RNA的化學(xué)修飾真核生物RNA的降解現(xiàn)在是17頁(yè)\一共有36頁(yè)\編輯于星期五由RNA聚合酶II進(jìn)行真核生物mRNA的合成轉(zhuǎn)錄起始后，加帽反應(yīng)立即發(fā)生真核細(xì)胞mRNA的延伸mRNA合成的終止與polyA形成同時(shí)發(fā)生真核生物mRNA合成的調(diào)節(jié)現(xiàn)在是18頁(yè)\一共有36頁(yè)\編輯于星期五啟動(dòng)子清除、脫離與加帽反應(yīng)啟動(dòng)子清除，前起始復(fù)合物向開(kāi)始合成的復(fù)合體過(guò)渡啟動(dòng)子脫離，聚合酶離開(kāi)啟動(dòng)子，形成轉(zhuǎn)錄物加帽發(fā)生于轉(zhuǎn)錄物達(dá)30bp前。現(xiàn)在是19頁(yè)\一共有36頁(yè)\編輯于星期五加帽反應(yīng)加一個(gè)G到5’端—鳥(niǎo)苷酸轉(zhuǎn)移酶G甲基化---鳥(niǎo)嘌呤甲基轉(zhuǎn)移酶帽子結(jié)構(gòu)在不同生物中甲基化程度不同?，F(xiàn)在是20頁(yè)\一共有36頁(yè)\編輯于星期五真核細(xì)胞mRNA的延伸真核轉(zhuǎn)錄物更長(zhǎng)，需要延伸因子來(lái)幫助聚合酶以保持轉(zhuǎn)錄復(fù)合物穩(wěn)定現(xiàn)在是21頁(yè)\一共有36頁(yè)\編輯于星期五合成終止與加尾反應(yīng)Poly(A)聚合酶是加尾酶3’端內(nèi)部切斷，再加尾加尾信號(hào)AATAAA,位于加尾處上游10-30bp切割處為CA，其后有富含GU區(qū)輔助因子：CPSF與CstF加尾與終止同時(shí)現(xiàn)在是22頁(yè)\一共有36頁(yè)\編輯于星期五加尾與終止的聯(lián)系現(xiàn)在是23頁(yè)\一共有36頁(yè)\編輯于星期五真核生物mRNA合成的調(diào)節(jié)TFIIS可能降解游離RNA真核生物轉(zhuǎn)錄過(guò)程中延伸還是終止的調(diào)節(jié)機(jī)制以對(duì)RNA聚合酶II的CTD磷酸化狀態(tài)的調(diào)節(jié)為中心mRNA的polyA的形成是真核生物中重要的調(diào)節(jié)機(jī)制。現(xiàn)在是24頁(yè)\一共有36頁(yè)\編輯于星期五核前體mRNA的內(nèi)含子剪切

內(nèi)含子的類(lèi)型現(xiàn)在是25頁(yè)\一共有36頁(yè)\編輯于星期五GU-AG內(nèi)含子的保守剪接位點(diǎn)序列剪接位點(diǎn)：外顯子—內(nèi)含子交界處序列5’端含GU：5’-AG↓GUAAGU-3’(供體位點(diǎn))3’端含AG：5’-PyPyPyPyPyPyNCAG↓-3’(受體位點(diǎn),Py：C或U)現(xiàn)在是26頁(yè)\一共有36頁(yè)\編輯于星期五內(nèi)含子剪接概況分支位點(diǎn)，內(nèi)含子內(nèi)部的含A位點(diǎn)，序列在酵母中完全保守為：5’-UACUAAC-3’，在動(dòng)物中為5’-PyNPyPyPuAPy-3’5’剪接位點(diǎn)被剪開(kāi)，內(nèi)含子5’端連接到分支位點(diǎn)A的2’位置，3’剪接位點(diǎn)被剪開(kāi)，內(nèi)含子被釋放，左右外顯子相連羥基攻擊現(xiàn)在是27頁(yè)\一共有36頁(yè)\編輯于星期五剪接裝置的中心是細(xì)胞核小RNA(snRNA)剪接裝置/剪接體，參與剪接的非mRNA裝置，包括核小核糖核蛋白snRNP(snRNA+蛋白)和其他相關(guān)蛋白。中心組分：五種snRNA(U1、2、4、5、6)待命復(fù)合體：起始剪接。U1+SF1等前剪接復(fù)合物：與分支位點(diǎn)結(jié)合。待命+U2剪接體：3’剪接點(diǎn)套索。前剪接+U4/5/6現(xiàn)在是28頁(yè)\一共有36頁(yè)\編輯于星期五剪接裝置介導(dǎo)的剪接實(shí)際上更復(fù)雜現(xiàn)在是29頁(yè)\一共有36頁(yè)\編輯于星期五可變剪接現(xiàn)在是30頁(yè)\一共有36頁(yè)\編輯于星期五涉及果蠅性別決定的基因在表達(dá)過(guò)程中的剪接調(diào)控現(xiàn)在是31頁(yè)\一共有36頁(yè)\編輯于星期五人slo基因現(xiàn)在是32頁(yè)\一共有36頁(yè)\編輯于星期五反式剪接來(lái)自不同轉(zhuǎn)錄單位的外顯子來(lái)自于SLRNA的前導(dǎo)外顯子通過(guò)剪接被連接到不同的RNA分子上現(xiàn)在是33頁(yè)\一共有36頁(yè)\編輯于星期五真核細(xì)胞前體rRNA的剪接真核前體rRNA中的內(nèi)含子不多見(jiàn)內(nèi)含子是自催化的，不需要蛋白質(zhì)I類(lèi)內(nèi)含子現(xiàn)在是34頁(yè)\一共有36頁(yè)\編輯于星期五真核