細(xì)菌的分類和鑒定

細(xì)菌的分類和鑒定第一頁，共二十一頁，2022年，8月28日一、微生物的分類根據(jù)微生物的大小、結(jié)構(gòu)、組成等分三類原核細(xì)胞型如：細(xì)菌、放線菌、螺旋體、支原體、衣原體、立克次體。（也稱廣義的細(xì)菌）真核細(xì)胞型如：真菌、原蟲非細(xì)胞型如：病毒、亞病毒、朊粒第二頁，共二十一頁，2022年，8月28日二、細(xì)菌的分類方法根據(jù)每種細(xì)菌各自特征，并按照它們的親緣關(guān)系分類，分類方法有兩類1.生理學(xué)與生化學(xué)分類法（傳統(tǒng)方法）

2.遺傳學(xué)分類法第三頁，共二十一頁，2022年，8月28日（一）生理學(xué)與生化學(xué)分類法主要以細(xì)菌的形態(tài)、染色以及細(xì)菌的特殊結(jié)構(gòu)為最基本的分類依據(jù)，其它依據(jù)還包括細(xì)菌生長條件等等。主要有兩種方法1、傳統(tǒng)分類法2、數(shù)值分類法第四頁，共二十一頁，2022年，8月28日1、傳統(tǒng)分類法主要以細(xì)菌的形態(tài)、生理特征為分類基礎(chǔ)，選擇一些較穩(wěn)定的生物學(xué)性狀如細(xì)菌的形態(tài)結(jié)構(gòu)、染色性、培養(yǎng)特性、生化反應(yīng)、抗原性等作為依據(jù)，然后按主次順序逐級區(qū)分。第五頁，共二十一頁，2022年，8月28日2、數(shù)值分類法對細(xì)菌各種生物學(xué)性狀按“等重要原則”進(jìn)行分類，選用多項(xiàng)生理、生化指標(biāo)逐一進(jìn)行比較，通過查表或計(jì)算機(jī)分析各菌間相似度，完成細(xì)菌分類。第六頁，共二十一頁，2022年，8月28日（二）遺傳學(xué)分類法以細(xì)菌的核酸、蛋白質(zhì)等在組成的同源性程度分類。主要有三種方法1、DNAG+Cmol%測定2、核酸同源值測定3、核蛋白體RNA堿基序列測定

第七頁，共二十一頁，2022年，8月28日1、DNAG+Cmol%測定DNA分子兩條鏈上4種堿基的總分子量為100，測定其中G+C或A+T摩爾百分比，能反應(yīng)出細(xì)菌間DNA分子的同源程度，習(xí)慣上以G+C作為細(xì)菌的分類標(biāo)記。不同菌屬間的G+Cmol%范圍很大，在25%~75%之間，但同一種細(xì)菌G+Cmol%相當(dāng)穩(wěn)定，不受菌齡、培養(yǎng)條件和其它外界因素影響，親緣關(guān)系越近的細(xì)菌，它們G+Cmol%越接近（但并非G+Cmol%越接近，親緣關(guān)系就越近？？？）。第八頁，共二十一頁，2022年，8月28日2、核酸同源值測定

為什么不能說G+Cmol%越接近，親緣關(guān)系就越近？因?yàn)镚+Cmol%只能反映細(xì)菌的堿基總數(shù)而不能反映堿基序列?。。《肈NA分子雜交的技術(shù)就可以精確測定DNA分子的堿基序列。這就是核酸同源值測定。第九頁，共二十一頁，2022年，8月28日3、核蛋白體RNA堿基序列測定

核蛋白體RNA堿基序列測定屬于核酸范疇。由于核蛋白體RNA（rRNA）序列比較保守，其變化十分緩慢。其中，16srRNA具有高度的保守性和特異性以及該基因序列足夠長，因此，被作為細(xì)菌鑒定的快速、準(zhǔn)確方法，素有“細(xì)菌化石之稱”。第十頁，共二十一頁，2022年，8月28日（三）兩類分類法的優(yōu)點(diǎn)和意義方法優(yōu)點(diǎn)意義生理學(xué)與生化學(xué)分類法方便、簡單、廉價(jià)主要用于鑒定遺傳學(xué)分類法準(zhǔn)確、可靠；有利于了解細(xì)菌的進(jìn)化和原始親緣關(guān)系主要用于分類第十一頁，共二十一頁，2022年，8月28日三、原核微生物（廣義細(xì)菌）分類系統(tǒng)《伯杰鑒定細(xì)菌手冊》(Bergey’sManualofDeterminativeBacteriology)

伯杰氏手冊:是目前進(jìn)行細(xì)菌分類、鑒定的最重要參考書，其特點(diǎn)是描述非常詳細(xì)，包括對細(xì)菌各個(gè)屬種的特征及進(jìn)行鑒定所需做的實(shí)驗(yàn)的具體方法。第十二頁，共二十一頁，2022年，8月28日四、細(xì)菌的分類等級界

（Kingdom）門

（Phylum）綱（Class）目（Order）科（Family）屬（Genus）

種（Species）第十三頁，共二十一頁，2022年，8月28日五、細(xì)菌的命名（一）細(xì)菌的命名依據(jù)“國際細(xì)菌命名法規(guī)”的規(guī)定，學(xué)名用拉丁文，遵循“雙名法”。即每一種細(xì)菌的拉丁文名稱由屬名和種名兩部分構(gòu)成，屬名第一個(gè)字母必須大寫，其余均應(yīng)小寫（即使種名以人名或地名命名）。整個(gè)屬名及種名在出版物中應(yīng)排成斜體。

如：Escherichiacoli屬名+種名

第十四頁，共二十一頁，2022年，8月28日屬名重復(fù)出現(xiàn)，可縮寫如：E.coli（大腸桿菌）；只確定屬名，未確定種名的某一株細(xì)菌

Salmonella

sp.（沙門菌屬）；只確定屬名，未確定種名的若干菌

Salmonella

spp.亞種用subsp.（正體）表示

Pasteurellamultocida

subsp.septica

幾種不同的書寫情況五、細(xì)菌的命名（二）第十五頁，共二十一頁，2022年，8月28日六、微生物分類鑒定的依據(jù)

根據(jù)微生物分類學(xué)中使用的技術(shù)和方法，可把它們分成四個(gè)不同的水平：①細(xì)胞形態(tài)和行為水平；②細(xì)胞組分水平；③蛋白質(zhì)水平；④基因組水平。在微生物分類學(xué)發(fā)展的早期，主要的分類鑒定指標(biāo)是以在細(xì)胞形態(tài)和習(xí)性為主，可稱為經(jīng)典的分類鑒定法第十六頁，共二十一頁，2022年，8月28日七、細(xì)菌的分類方法

生物分類的傳統(tǒng)指標(biāo)分子生物學(xué)指標(biāo)微型、簡便、快速或自動(dòng)化鑒定技術(shù)細(xì)菌的數(shù)值分類第十七頁，共二十一頁，2022年，8月28日形態(tài)學(xué)特征生理、生化學(xué)特征

從不同層次，用不同學(xué)科的技術(shù)方法來研究和比較不同微生物的細(xì)胞、細(xì)胞組分或代謝產(chǎn)物，從中發(fā)現(xiàn)反映微生物類群特征的資料。八、生物分類的傳統(tǒng)指標(biāo)第十八頁，共二十一頁，2022年，8月28日（一）形態(tài)學(xué)特征

包括培養(yǎng)特征、細(xì)胞形態(tài)及其染色特性、特殊的細(xì)胞結(jié)構(gòu)、運(yùn)動(dòng)性等等。

形態(tài)學(xué)特征指標(biāo)特點(diǎn)：易于觀察和比較，尤其是真核微生物和具有特殊形態(tài)結(jié)構(gòu)的細(xì)菌；許多形態(tài)學(xué)特征依賴于多基因的表達(dá)，具有相對的穩(wěn)定性；第十九頁，共二十一頁，2022年，8月28日（二）生理生化特征

包括營養(yǎng)類型、與氧的關(guān)系、對溫度的適應(yīng)性、碳水化合物的代謝試驗(yàn)、蛋白質(zhì)和氨基酸的代謝試驗(yàn)及的碳源和氮源利用試驗(yàn)、各種酶類試驗(yàn)、抑菌試驗(yàn)等等。

生理生化特征特點(diǎn)：對微生物生理生化特征的比較也是對微生物基因組的間接比較；測定生理生化特征比直接分析基因組要容易；第二十頁，共二十一頁，2022年，8月28日（二）生理生化特征

包括營養(yǎng)類型、與氧的關(guān)