細(xì)菌的分類與命名

細(xì)菌的分類與命名第一頁(yè)，共十七頁(yè)，2022年，8月28日微生物分類鑒定目的分類是人類認(rèn)識(shí)微生物，進(jìn)而利用和改造微生物的一種手段，微生物工作者只有在掌握了分類學(xué)知識(shí)的基礎(chǔ)上，才能對(duì)紛繁的微生物類群有一清晰的輪廊，了解其親緣關(guān)系與演化關(guān)系，為人類開(kāi)發(fā)利用微生物資源提供依據(jù)第二頁(yè)，共十七頁(yè)，2022年，8月28日第一節(jié)微生物分類學(xué)微生物分類學(xué)(Taxonomy)是一門按微生物類群的親緣關(guān)系把它們安排成條理清楚的各種分類單元或分類群（Taxon）的科學(xué)分類學(xué)的任務(wù)

分類（Classification）：是指根據(jù)相似性或親緣關(guān)系，將一個(gè)有機(jī)體放在一個(gè)單元中命名（Nomenclature）：是按照國(guó)際命名法規(guī)給予有機(jī)體一個(gè)科學(xué)的名稱鑒定（Identification）：是指確定一個(gè)新分離物是否歸屬于某個(gè)已命名的分類單元的過(guò)程。第三頁(yè)，共十七頁(yè)，2022年，8月28日一、微生物的分類單位界（Kingdom）門（PhylumorDivision）綱（Class）目（Order）科（Family）屬（Genus）種（Species）

種是最基本的分類單位。但分類單元之間科加入亞門、亞綱、亞目、亞科等次要分類單位。種以下又可分為亞種、變種、型、菌株等第四頁(yè)，共十七頁(yè)，2022年，8月28日微生物種與亞種的概念種(Species)

凡是于典型培養(yǎng)菌緊密相同的其他培養(yǎng)菌同統(tǒng)一起來(lái)，區(qū)分為細(xì)菌的一個(gè)種（Species），即是以某個(gè)“典型菌株”為代表、十分類似的菌株的總稱。1987年，國(guó)際細(xì)菌分類委員會(huì)頒布，DNA同源≧70%，而且其Tm≦5oC的菌群為一個(gè)種亞種（Subspecies)在種內(nèi)，有些菌株在遺傳學(xué)上關(guān)系密切，而且在表型上僅存在較小的某些差異，在種內(nèi)分成2個(gè)或2個(gè)以上的分類單位，即為亞種第五頁(yè)，共十七頁(yè)，2022年，8月28日微生物亞種以下的變型分類亞種以下

生物變型——表示特殊的生化或生理特征血清變型——表示抗原結(jié)構(gòu)不同致病變型——表示某些寄主的專一致病性噬菌變型——表示對(duì)噬菌體的特異性反應(yīng)形態(tài)變型——表示特殊的形態(tài)特征第六頁(yè)，共十七頁(yè)，2022年，8月28日微生物的菌株菌株(Strain)或稱品系

是指同種微生物不同來(lái)源的純培養(yǎng)物即單個(gè)分離物的純培養(yǎng)后代，常以數(shù)字、字母、人命或地名等表示分離物是指已分離得到但為經(jīng)鑒定的純培養(yǎng)物的后代即為分離物群(Group)

為工作方便而將近似的種或介于種間的菌株按其形態(tài)或結(jié)合生理生化、生態(tài)特征歸為若干類群。如放線菌中的鏈霉菌屬內(nèi)的種歸為1第七頁(yè)，共十七頁(yè)，2022年，8月28日二、微生物的命名微生物的命名按國(guó)際命名法命名，即Linna所創(chuàng)立的“雙名法”每一種微生物都用屬與種命名，由2個(gè)拉丁詞或希臘詞或拉丁化了的其他文字組成。屬名和種名用斜體表達(dá)屬名在前，用拉丁名詞表示微生物的構(gòu)造、形態(tài)、某科學(xué)家名字等，描述微生物的主要特征。第一字母大寫種名在后，第一字母小寫。用拉丁形容詞表示，描述微生物的色素、形狀、來(lái)源、病名、地名、某科學(xué)家的名字等等在種名后，附上命名者的姓和命名年份第八頁(yè)，共十七頁(yè)，2022年，8月28日第二節(jié)原核微生物分類系統(tǒng)一、原核微生物伯杰氏分類系統(tǒng)

《伯杰氏細(xì)菌鑒定手冊(cè)》《伯杰氏系統(tǒng)細(xì)菌學(xué)手冊(cè)》第九頁(yè)，共十七頁(yè)，2022年，8月28日細(xì)菌分類系統(tǒng)最有代表性和最有影響的細(xì)菌分類系統(tǒng)《伯杰氏細(xì)菌鑒定手冊(cè)》（Bergey’sManualofDeterminativeBacteriology)1923年,1925年,1930年,1934年,1939年,1948年,1957年,1974年分別出版了第一至第八版，1994年出了第九版以形態(tài)、生理生化、G+Cmol%、生態(tài)分布等特征為主第十頁(yè)，共十七頁(yè)，2022年，8月28日微生物的分類技術(shù)水平微生物分類中使用的技術(shù)水平細(xì)胞形態(tài)水平細(xì)胞組分水平蛋白質(zhì)水平基因組水平第十一頁(yè)，共十七頁(yè)，2022年，8月28日《伯杰氏系統(tǒng)細(xì)菌學(xué)手冊(cè)》Bergey’sManualofSystematicBacteriology)secondedition2001以生理生化、G+Cmol%、系統(tǒng)發(fā)育地位等為主——體現(xiàn)了現(xiàn)代分子生物學(xué)的研究成果尚未出齊第十二頁(yè)，共十七頁(yè)，2022年，8月28日細(xì)菌的分類一、細(xì)菌在生物中分類地位目前公認(rèn)“四界分類系統(tǒng)”

動(dòng)物界植物界原核生物：細(xì)菌、放線菌、螺旋體、生物原生生物界霉形體、立克次氏體、衣原體真核生物：真菌、藻類、原蟲病毒界：病毒第十三頁(yè)，共十七頁(yè)，2022年，8月28日二、細(xì)菌分類的特征1．形態(tài)學(xué)特性：形狀、大小，排列、結(jié)構(gòu)、染色特性，有無(wú)細(xì)胞壁2．培養(yǎng)特性：培養(yǎng)基上的表現(xiàn)，菌落特征3．生活方式：自主生活，共生，寄生4．生理生化特征：化學(xué)組成，營(yíng)養(yǎng)類型，營(yíng)養(yǎng)需要，繁殖方式，生長(zhǎng)條件，代謝途徑，代謝產(chǎn)物。5．抗原構(gòu)造：O、K、H6．對(duì)噬菌體的敏感性7．對(duì)抗生素及其他化學(xué)物質(zhì)的敏感性8．病原性第十四頁(yè)，共十七頁(yè)，2022年，8月28日9．遺傳學(xué)特征①轉(zhuǎn)化和轉(zhuǎn)導(dǎo)試驗(yàn)。與細(xì)菌之間親緣關(guān)系密切相關(guān)，發(fā)生在親緣關(guān)系相近的細(xì)菌種類②G+C%。G+C含量對(duì)一個(gè)種一般是恒定的，但G+C相同并不一定是同一種。③DNA-DNA雜合試驗(yàn)。將待檢菌的DNA變性，其雙鏈解為單鏈，而后與標(biāo)記的參考菌株單鏈DNA或rRNA雜交，形成雜交DNA-DNA或DNA-rRNA，兩種細(xì)菌DNA中共同的核苷酸序列愈多，雜交互補(bǔ)區(qū)間愈多，二者同源性愈高，親緣關(guān)系就愈近。第十五頁(yè)，共十七頁(yè)，2022年，8月28日第三節(jié)細(xì)菌的命名采用林奈氏雙名法：1．將一個(gè)細(xì)菌定一個(gè)學(xué)名，用屬名和種名表示，屬名在前，用拉丁文或拉丁化的名詞表示，且第一個(gè)字母要大寫，種名在后，用拉丁文或拉丁化的形容詞或名詞所有格表示，第一個(gè)字母小寫。中文譯名與此相反，種名在前，屬名在后。2．在種名之后附以命名人的姓氏及命名年代。第十六頁(yè)，共十七頁(yè)，2022年，8月28日3．轉(zhuǎn)屬：一種生物原為某人定為某屬，后來(lái)又被旁人改為別屬，這時(shí)將原命名人的姓氏置于括弧之內(nèi)放在學(xué)名之后，再在括弧之后，附