醫(yī)學信息檢索與利用

生物醫(yī)學信息檢索與利用

2012年11月把握相關文獻搜集過程的關鍵環(huán)節(jié)

（一）理解是信息檢索的前提

理解項目內(nèi)容的實質(zhì)含義，靈活能動地擴展檢索用詞，避免用詞局限；對檢出文獻進行鑒別、篩選、翻譯、歸納；

項目名稱：手持式心電圖機

(手持+便攜+微型+小型+袖珍+迷你)*心電圖機

（二）選詞全面性及其擴展思路檢索詞選擇要齊全諸如關鍵性同義詞、主題詞、關鍵詞、縮寫詞、分類號化學物質(zhì)登記號、化學結構式等檢索詞要盡量的規(guī)范，特別是專業(yè)術語、短語

對文獻檢索中的一物多名要深有所悟,并盡量周全地對檢索用詞進行擴展。

項目名稱：布氏桿菌熒光PCR檢測方法維普:(任意字段=布氏桿菌*(熒光+PCR))20篇布氏桿菌709布魯桿菌84

布魯氏菌1813布魯氏桿菌257

布氏菌887布魯菌128

維普:(任意字段=(布氏+布魯)*(熒光+PCR))

163篇勿忘檢索詞的縮寫、簡稱與俗稱——

項目名稱：乙型病毒性肝炎的中醫(yī)藥研究維普:(題名=乙型病毒性肝炎*(中醫(yī)藥+中藥))49篇維普:(題名=(乙型病毒性肝炎+乙型肝炎+乙肝+HB)*(中醫(yī)藥+中藥))554篇

（三）檢索途徑多樣以主題法為首選路徑——選詞并在不同字段組配維普庫檢索：食品接觸材料用油墨及膠粘劑安全標準體系研究

分類法在檢索中的應用分類法的主要功能則是通過學科知識的分類體系揭示知識的系統(tǒng)性?！暨\用分類法可將特定類號下的專題文獻系統(tǒng)包容，一網(wǎng)打盡?！暨\用分類法可靈活進行文獻的擴檢和縮檢

推薦主題-分類組合檢索項目名稱：抗生素骨水泥系列產(chǎn)品主題途徑檢索:抗生素and骨水泥維普:(任意字段=骨水泥)and(分類號=R978.1)

（R978.1——抗生素類）萬古霉素骨水泥力學性能及洗提特性

鏈霉素復合骨水泥在全髖關節(jié)置換術治療髖關節(jié)結核中的應用

含硫酸妥布霉素的磷酸鈣骨水泥對外傷性骨髓炎作用的觀察

（四）數(shù)據(jù)庫選擇與檢索方式多樣網(wǎng)絡數(shù)據(jù)庫：語種、文獻類型齊全期刊庫、會議庫、學位論文庫、專利庫、成果庫等文摘數(shù)據(jù)庫與全文數(shù)據(jù)庫互為補充網(wǎng)絡免費資源國際聯(lián)機檢索系統(tǒng)同時查多種文獻國家科技圖書文獻中心NSTL

/

是根據(jù)國務院領導的批示于2000年6月12日組建的一個虛擬的科技文獻信息服務機構，成員單位包括中國科學院文獻情報中心、工程技術圖書館（中國科學技術信息研究所、機械工業(yè)信息研究院、冶金工業(yè)信息標準研究院、中國化工信息中心）、中國農(nóng)業(yè)科學院圖書館、中國醫(yī)學科學院圖書館。cnki期刊導航瀏覽文章查看期刊編輯出版信息免費全文電子期刊開放獲取期刊指南（DirectoryofOpenAccessJournals/HighWirePress全球最大的提供免費全文的學術文獻出版商

，生物醫(yī)學中心開放獲取期刊（BioMedCentral

）科學公共圖書館開放獲取期刊（PublicLibraryofScience

）20瑞典隆德大學（LundUniv）圖書館開發(fā)維護。提供全球免費開放存?。∣A）期刊目錄的網(wǎng)站，共收錄各學科8300種免費電子期刊，全部為同行評審或主編質(zhì)量控制的學術期刊，制作了期刊簡介及網(wǎng)站鏈接。提供按刊名、學科瀏覽，期刊關鍵詞檢索?？蓪?100種期刊中的文章進行檢索。DirectoryofOpenAccessJournals開放獲取期刊指南22收錄1402種期刊，以生物醫(yī)學為主，其中免費期刊約338種，免費全文190多萬篇，占全部文獻量的32%?？?主題瀏覽、關鍵詞檢索三種途徑。同時提供Medline檢索與全文收費獲取服務。凡有FREE標記的文獻，點擊FullText或PDF鏈接可在線獲取免費全文。HighWirePress生物醫(yī)學中心BMC

BioMedCentral

(http：//www．biomedcentra1．com/)英國一家獨立的商業(yè)性出版機構最重要的開放獲取雜志出版商之一內(nèi)容涵蓋生物學和醫(yī)學的所有主要領域，主要包括麻醉學、生物化學、生物信息學、生物技術、癌癥、細胞生物學、微生物學、分子生物學等57個分支學科。能快速且免費提供經(jīng)過同行評議的生物醫(yī)學期刊的全文服務。采取向作者和機構會員收費的方式為開放獲取期刊提供資助，在BMC期刊上發(fā)表的文章，作者擁有版權。已出版200種OA期刊。BioMedCentral公共醫(yī)學中心PMC,PubMedCentral

www．pubmedcentral．nih．gov2002.2.由NLM與NIH聯(lián)手建立的一個生命科學期刊文獻全文免費檢索系統(tǒng)。由NLM的NCBI開發(fā)和設計，并管理和維護的一個數(shù)字化全文數(shù)據(jù)庫。涉及學科范圍有生物醫(yī)學、行為科學和臨床研究等學科領域，提供完全免費的全文服務。

中國教育圖書進出口公司：SOCOLAR-OpenAccess資源一站式檢索服務平臺

（）

——該平臺收錄了大量來自互聯(lián)網(wǎng)的OpenAccess期刊、OpenAccess機構倉儲等學術資源，并向最終用戶提供一站式文章級檢索和全文鏈接服務。旨在向用戶全面、徹底揭示全球OpenAccess資源常用的醫(yī)學數(shù)據(jù)庫文摘型├CBMWEB數(shù)據(jù)庫

├PubMed數(shù)據(jù)庫

├荷蘭醫(yī)學文摘Embase├化學文摘CA

└生物學文摘BP

科學引文索引(SCI)

全文型

中國知網(wǎng)CNKI萬方數(shù)據(jù)庫維普全文期刊數(shù)據(jù)庫ScienceDirect(,免費檢索)ProQuest檢索平臺（ARL,ABI,PQDD…）EBSCO數(shù)據(jù)庫/（ASP,BSP,ERIC…）Springer電子期刊

…PubMed數(shù)據(jù)庫

/PubMed

PubMed簡介PubMed是美國國立醫(yī)學圖書館（NLM）所屬的國家生物技術信息中心（NCBI）開發(fā)的因特網(wǎng)生物醫(yī)學信息檢索系統(tǒng)。收錄范圍收錄70余個國家4900多種生物醫(yī)學期刊的題錄與文摘，是世界上最權威的醫(yī)學數(shù)據(jù)庫現(xiàn)有1950年以來的1650多萬篇文獻的記錄(其中MEDLINE記錄1400多萬條)目前每年增加60余萬條文獻記錄在全部記錄中有76%的文獻為英文；在2000年以來的記錄中90%的文獻為英文；收錄中文刊60余種內(nèi)容涉及：臨床、基礎醫(yī)學、藥學、牙醫(yī)學、護理學、公共衛(wèi)生、營養(yǎng)、獸醫(yī)學等專業(yè)PubMed檢索功能基本檢索高級檢索其他檢索途徑:主題詞、期刊數(shù)據(jù)庫、特定文獻檢索個性化服務基本檢索輸入框提供其他檢索，如：期刊數(shù)據(jù)庫檢索、主題詞數(shù)據(jù)庫檢索、特定文獻檢索（一）單詞、短語、詞組檢索（二）作者姓名檢索（三）期刊名稱檢索（四）截詞檢索（五）帶邏輯運算符的復合檢索基本檢索自動轉(zhuǎn)換匹配原理PubMed對輸入檢索框中的檢索詞進行自動轉(zhuǎn)換匹配，將其逐步地與其數(shù)據(jù)庫中的各類詞表核對轉(zhuǎn)換、匹配MeSHTranslationTable主題詞注釋表JournalsTranslationTable期刊注釋表CommonPhraseList常用詞組表AuthorIndex作者索引表NoMapping檢索詞拆分AND

Pubmed檢索實例

例:

查找有關“肝癌和肝炎的關系”的文獻，

“l(fā)ivercancer”和“hepatitis”

檢索結果顯示顯示檢索策略自動轉(zhuǎn)換匹配后的檢索策略("liverneoplasms"[MeSHTerms]OR("liver"[AllFields]AND"neoplasms"[AllFields])OR"liverneoplasms"[AllFields]OR("liver"[AllFields]AND"cancer"[AllFields])OR"livercancer"[AllFields])AND("hepatitis"[MeSHTerms]OR"hepatitis"[AllFields])針對特定的短語和詞組的檢索，需要在短語或者詞組上用雙引號引起來。如“singlecell”，“oxygenfreeradicals”，作為一個不可分割詞組在全部字段中檢索，系統(tǒng)不進行自動轉(zhuǎn)換匹配,也不進行Mesh詞的擴檢。詞組檢索/強制短語加雙引號作者姓名檢索姓全稱+名縮寫smithjaorJonesK.

smithJ[au]西方人姓名書寫格式：

Firstname、（MiddleName）、Lastnamebowerm期刊名稱檢索Enterinthesearchboxoneofthefollowing:刊名全稱(e.g.,molecularbiologyofthecell)刊名縮寫(e.g.,molbiolcell)ISSN號(e.g.,1059-1524)如果期刊名稱正好是一個MeSH中的詞，(e.g,GeneTherapy,Science,orCell)，建議期刊檢索使用期刊字段標識[ta]。否則系統(tǒng)會將其作MeSH詞進行檢索或在所有字段中進行檢索。例：molecularbiologyofthecellmolecularbiologyofthecell例：Cell截詞檢索

在詞干的末尾加“*”號，PubMed就會檢索出以該詞為詞根的所有的詞。截詞檢索將關閉自動詞語匹配功能。輸入bacter*，可檢出bacteria、bacterium、bacterial等詞的文獻

如我們要檢索腫瘤的診斷和治療方面的文獻，我們可以在基本檢索輸入框中輸入：cancerAND(diagnosisORtherapy)，點擊“Go”進行檢索。復合檢索式檢索布爾邏輯運算符有:AND，OR或NOT高級檢索

功能:查看檢索歷史構建檢索式,選擇檢索字段檢索史檢索框選擇字段高級檢索舉例：檢索作者為Black，且標題中有Hypertension的文獻單篇/多篇引文匹配

臨床咨詢專題咨詢主題詞檢索

期刊檢索臨床實驗外部鏈接MeSHDatabaseMeSH詞表

《醫(yī)學主題詞表》（MedicalSubjectHeading，簡稱MeSH）是NLM對生物醫(yī)學文獻進行主題分析、標引的權威性詞表，也是指導用戶使用主題索引進行文獻檢索的工具。由于自然語言存在大量的一詞多義、一義多詞、單復數(shù)變化等現(xiàn)象，這就給讀者查找文獻帶來了很大困難。MeSH的主要就是起到規(guī)范化作用，保證文獻的作者、標引者和檢索者在用詞上的一致；將自然語言轉(zhuǎn)換成規(guī)范化的人工語言，保證一詞輸入，多詞命中，提高文獻查全率。關鍵詞（自由詞）：carcinoma,tumor,cancer

主題詞：

neoplasms

SubHeadings副主題詞對一個主題詞的某個方面進行修飾限定的詞，又稱限定詞。例如，hepatitisb這個主題詞涉及到的病因、病理、診斷、治療、微生物學等多個方面。目前有83個副主題詞并非每個主題詞都能和83個副主題詞組配。副主題詞與主題詞的組配不是隨機的，而是有一定規(guī)則的。如“診斷”、”治療“不可與藥物、生物等主題詞組配，只能組配疾病類主題詞。第一步：輸入檢索詞。

主題詞檢索例主題詞檢索界面的輸入框內(nèi)輸入livercancer，點擊GO按扭，系統(tǒng)提示livercancer不是Mesh詞，規(guī)范主題詞應該是liverneoplasms。

主題詞第二步：確定主題詞點擊liverneoplasms，顯示副主題詞，可供選擇。

可勾選副主題詞第三步：確定副主題詞用liverneoplasms選擇副主題詞surge