醫(yī)學(xué)信息檢索與利用

生物醫(yī)學(xué)信息檢索與利用

2012年11月把握相關(guān)文獻(xiàn)搜集過程的關(guān)鍵環(huán)節(jié)

（一）理解是信息檢索的前提

理解項(xiàng)目內(nèi)容的實(shí)質(zhì)含義，靈活能動(dòng)地?cái)U(kuò)展檢索用詞，避免用詞局限；對檢出文獻(xiàn)進(jìn)行鑒別、篩選、翻譯、歸納；

項(xiàng)目名稱：手持式心電圖機(jī)

(手持+便攜+微型+小型+袖珍+迷你)*心電圖機(jī)

（二）選詞全面性及其擴(kuò)展思路檢索詞選擇要齊全諸如關(guān)鍵性同義詞、主題詞、關(guān)鍵詞、縮寫詞、分類號化學(xué)物質(zhì)登記號、化學(xué)結(jié)構(gòu)式等檢索詞要盡量的規(guī)范，特別是專業(yè)術(shù)語、短語

對文獻(xiàn)檢索中的一物多名要深有所悟,并盡量周全地對檢索用詞進(jìn)行擴(kuò)展。

項(xiàng)目名稱：布氏桿菌熒光PCR檢測方法維普:(任意字段=布氏桿菌*(熒光+PCR))20篇布氏桿菌709布魯桿菌84

布魯氏菌1813布魯氏桿菌257

布氏菌887布魯菌128

維普:(任意字段=(布氏+布魯)*(熒光+PCR))

163篇勿忘檢索詞的縮寫、簡稱與俗稱——

項(xiàng)目名稱：乙型病毒性肝炎的中醫(yī)藥研究維普:(題名=乙型病毒性肝炎*(中醫(yī)藥+中藥))49篇維普:(題名=(乙型病毒性肝炎+乙型肝炎+乙肝+HB)*(中醫(yī)藥+中藥))554篇

（三）檢索途徑多樣以主題法為首選路徑——選詞并在不同字段組配維普庫檢索：食品接觸材料用油墨及膠粘劑安全標(biāo)準(zhǔn)體系研究

分類法在檢索中的應(yīng)用分類法的主要功能則是通過學(xué)科知識的分類體系揭示知識的系統(tǒng)性?！暨\(yùn)用分類法可將特定類號下的專題文獻(xiàn)系統(tǒng)包容，一網(wǎng)打盡?！暨\(yùn)用分類法可靈活進(jìn)行文獻(xiàn)的擴(kuò)檢和縮檢

推薦主題-分類組合檢索項(xiàng)目名稱：抗生素骨水泥系列產(chǎn)品主題途徑檢索:抗生素and骨水泥維普:(任意字段=骨水泥)and(分類號=R978.1)

（R978.1——抗生素類）萬古霉素骨水泥力學(xué)性能及洗提特性

鏈霉素復(fù)合骨水泥在全髖關(guān)節(jié)置換術(shù)治療髖關(guān)節(jié)結(jié)核中的應(yīng)用

含硫酸妥布霉素的磷酸鈣骨水泥對外傷性骨髓炎作用的觀察

（四）數(shù)據(jù)庫選擇與檢索方式多樣網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫：語種、文獻(xiàn)類型齊全期刊庫、會(huì)議庫、學(xué)位論文庫、專利庫、成果庫等文摘數(shù)據(jù)庫與全文數(shù)據(jù)庫互為補(bǔ)充網(wǎng)絡(luò)免費(fèi)資源國際聯(lián)機(jī)檢索系統(tǒng)同時(shí)查多種文獻(xiàn)國家科技圖書文獻(xiàn)中心NSTL

/

是根據(jù)國務(wù)院領(lǐng)導(dǎo)的批示于2000年6月12日組建的一個(gè)虛擬的科技文獻(xiàn)信息服務(wù)機(jī)構(gòu)，成員單位包括中國科學(xué)院文獻(xiàn)情報(bào)中心、工程技術(shù)圖書館（中國科學(xué)技術(shù)信息研究所、機(jī)械工業(yè)信息研究院、冶金工業(yè)信息標(biāo)準(zhǔn)研究院、中國化工信息中心）、中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院圖書館、中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院圖書館。cnki期刊導(dǎo)航瀏覽文章查看期刊編輯出版信息免費(fèi)全文電子期刊開放獲取期刊指南（DirectoryofOpenAccessJournals/HighWirePress全球最大的提供免費(fèi)全文的學(xué)術(shù)文獻(xiàn)出版商

，生物醫(yī)學(xué)中心開放獲取期刊（BioMedCentral

）科學(xué)公共圖書館開放獲取期刊（PublicLibraryofScience

）20瑞典隆德大學(xué)（LundUniv）圖書館開發(fā)維護(hù)。提供全球免費(fèi)開放存?。∣A）期刊目錄的網(wǎng)站，共收錄各學(xué)科8300種免費(fèi)電子期刊，全部為同行評審或主編質(zhì)量控制的學(xué)術(shù)期刊，制作了期刊簡介及網(wǎng)站鏈接。提供按刊名、學(xué)科瀏覽，期刊關(guān)鍵詞檢索?？蓪?100種期刊中的文章進(jìn)行檢索。DirectoryofOpenAccessJournals開放獲取期刊指南22收錄1402種期刊，以生物醫(yī)學(xué)為主，其中免費(fèi)期刊約338種，免費(fèi)全文190多萬篇，占全部文獻(xiàn)量的32%?？?主題瀏覽、關(guān)鍵詞檢索三種途徑。同時(shí)提供Medline檢索與全文收費(fèi)獲取服務(wù)。凡有FREE標(biāo)記的文獻(xiàn)，點(diǎn)擊FullText或PDF鏈接可在線獲取免費(fèi)全文。HighWirePress生物醫(yī)學(xué)中心BMC

BioMedCentral

(http：//www．biomedcentra1．com/)英國一家獨(dú)立的商業(yè)性出版機(jī)構(gòu)最重要的開放獲取雜志出版商之一內(nèi)容涵蓋生物學(xué)和醫(yī)學(xué)的所有主要領(lǐng)域，主要包括麻醉學(xué)、生物化學(xué)、生物信息學(xué)、生物技術(shù)、癌癥、細(xì)胞生物學(xué)、微生物學(xué)、分子生物學(xué)等57個(gè)分支學(xué)科。能快速且免費(fèi)提供經(jīng)過同行評議的生物醫(yī)學(xué)期刊的全文服務(wù)。采取向作者和機(jī)構(gòu)會(huì)員收費(fèi)的方式為開放獲取期刊提供資助，在BMC期刊上發(fā)表的文章，作者擁有版權(quán)。已出版200種OA期刊。BioMedCentral公共醫(yī)學(xué)中心PMC,PubMedCentral

www．pubmedcentral．nih．gov2002.2.由NLM與NIH聯(lián)手建立的一個(gè)生命科學(xué)期刊文獻(xiàn)全文免費(fèi)檢索系統(tǒng)。由NLM的NCBI開發(fā)和設(shè)計(jì)，并管理和維護(hù)的一個(gè)數(shù)字化全文數(shù)據(jù)庫。涉及學(xué)科范圍有生物醫(yī)學(xué)、行為科學(xué)和臨床研究等學(xué)科領(lǐng)域，提供完全免費(fèi)的全文服務(wù)。

中國教育圖書進(jìn)出口公司：SOCOLAR-OpenAccess資源一站式檢索服務(wù)平臺

（）

——該平臺收錄了大量來自互聯(lián)網(wǎng)的OpenAccess期刊、OpenAccess機(jī)構(gòu)倉儲(chǔ)等學(xué)術(shù)資源，并向最終用戶提供一站式文章級檢索和全文鏈接服務(wù)。旨在向用戶全面、徹底揭示全球OpenAccess資源常用的醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫文摘型├CBMWEB數(shù)據(jù)庫

├PubMed數(shù)據(jù)庫

├荷蘭醫(yī)學(xué)文摘Embase├化學(xué)文摘CA

└生物學(xué)文摘BP

科學(xué)引文索引(SCI)

全文型

中國知網(wǎng)CNKI萬方數(shù)據(jù)庫維普全文期刊數(shù)據(jù)庫ScienceDirect(,免費(fèi)檢索)ProQuest檢索平臺（ARL,ABI,PQDD…）EBSCO數(shù)據(jù)庫/（ASP,BSP,ERIC…）Springer電子期刊

…PubMed數(shù)據(jù)庫

/PubMed

PubMed簡介PubMed是美國國立醫(yī)學(xué)圖書館（NLM）所屬的國家生物技術(shù)信息中心（NCBI）開發(fā)的因特網(wǎng)生物醫(yī)學(xué)信息檢索系統(tǒng)。收錄范圍收錄70余個(gè)國家4900多種生物醫(yī)學(xué)期刊的題錄與文摘，是世界上最權(quán)威的醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫現(xiàn)有1950年以來的1650多萬篇文獻(xiàn)的記錄(其中MEDLINE記錄1400多萬條)目前每年增加60余萬條文獻(xiàn)記錄在全部記錄中有76%的文獻(xiàn)為英文；在2000年以來的記錄中90%的文獻(xiàn)為英文；收錄中文刊60余種內(nèi)容涉及：臨床、基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、藥學(xué)、牙醫(yī)學(xué)、護(hù)理學(xué)、公共衛(wèi)生、營養(yǎng)、獸醫(yī)學(xué)等專業(yè)PubMed檢索功能基本檢索高級檢索其他檢索途徑:主題詞、期刊數(shù)據(jù)庫、特定文獻(xiàn)檢索個(gè)性化服務(wù)基本檢索輸入框提供其他檢索，如：期刊數(shù)據(jù)庫檢索、主題詞數(shù)據(jù)庫檢索、特定文獻(xiàn)檢索（一）單詞、短語、詞組檢索（二）作者姓名檢索（三）期刊名稱檢索（四）截詞檢索（五）帶邏輯運(yùn)算符的復(fù)合檢索基本檢索自動(dòng)轉(zhuǎn)換匹配原理PubMed對輸入檢索框中的檢索詞進(jìn)行自動(dòng)轉(zhuǎn)換匹配，將其逐步地與其數(shù)據(jù)庫中的各類詞表核對轉(zhuǎn)換、匹配MeSHTranslationTable主題詞注釋表JournalsTranslationTable期刊注釋表CommonPhraseList常用詞組表AuthorIndex作者索引表NoMapping檢索詞拆分AND

Pubmed檢索實(shí)例

例:

查找有關(guān)“肝癌和肝炎的關(guān)系”的文獻(xiàn)，

“l(fā)ivercancer”和“hepatitis”

檢索結(jié)果顯示顯示檢索策略自動(dòng)轉(zhuǎn)換匹配后的檢索策略("liverneoplasms"[MeSHTerms]OR("liver"[AllFields]AND"neoplasms"[AllFields])OR"liverneoplasms"[AllFields]OR("liver"[AllFields]AND"cancer"[AllFields])OR"livercancer"[AllFields])AND("hepatitis"[MeSHTerms]OR"hepatitis"[AllFields])針對特定的短語和詞組的檢索，需要在短語或者詞組上用雙引號引起來。如“singlecell”，“oxygenfreeradicals”，作為一個(gè)不可分割詞組在全部字段中檢索，系統(tǒng)不進(jìn)行自動(dòng)轉(zhuǎn)換匹配,也不進(jìn)行Mesh詞的擴(kuò)檢。詞組檢索/強(qiáng)制短語加雙引號作者姓名檢索姓全稱+名縮寫smithjaorJonesK.

smithJ[au]西方人姓名書寫格式：

Firstname、（MiddleName）、Lastnamebowerm期刊名稱檢索Enterinthesearchboxoneofthefollowing:刊名全稱(e.g.,molecularbiologyofthecell)刊名縮寫(e.g.,molbiolcell)ISSN號(e.g.,1059-1524)如果期刊名稱正好是一個(gè)MeSH中的詞，(e.g,GeneTherapy,Science,orCell)，建議期刊檢索使用期刊字段標(biāo)識[ta]。否則系統(tǒng)會(huì)將其作MeSH詞進(jìn)行檢索或在所有字段中進(jìn)行檢索。例：molecularbiologyofthecellmolecularbiologyofthecell例：Cell截詞檢索

在詞干的末尾加“*”號，PubMed就會(huì)檢索出以該詞為詞根的所有的詞。截詞檢索將關(guān)閉自動(dòng)詞語匹配功能。輸入bacter*，可檢出bacteria、bacterium、bacterial等詞的文獻(xiàn)

如我們要檢索腫瘤的診斷和治療方面的文獻(xiàn)，我們可以在基本檢索輸入框中輸入：cancerAND(diagnosisORtherapy)，點(diǎn)擊“Go”進(jìn)行檢索。復(fù)合檢索式檢索布爾邏輯運(yùn)算符有:AND，OR或NOT高級檢索

功能:查看檢索歷史構(gòu)建檢索式,選擇檢索字段檢索史檢索框選擇字段高級檢索舉例：檢索作者為Black，且標(biāo)題中有Hypertension的文獻(xiàn)單篇/多篇引文匹配

臨床咨詢專題咨詢主題詞檢索

期刊檢索臨床實(shí)驗(yàn)外部鏈接MeSHDatabaseMeSH詞表

《醫(yī)學(xué)主題詞表》（MedicalSubjectHeading，簡稱MeSH）是NLM對生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)進(jìn)行主題分析、標(biāo)引的權(quán)威性詞表，也是指導(dǎo)用戶使用主題索引進(jìn)行文獻(xiàn)檢索的工具。由于自然語言存在大量的一詞多義、一義多詞、單復(fù)數(shù)變化等現(xiàn)象，這就給讀者查找文獻(xiàn)帶來了很大困難。MeSH的主要就是起到規(guī)范化作用，保證文獻(xiàn)的作者、標(biāo)引者和檢索者在用詞上的一致；將自然語言轉(zhuǎn)換成規(guī)范化的人工語言，保證一詞輸入，多詞命中，提高文獻(xiàn)查全率。關(guān)鍵詞（自由詞）：carcinoma,tumor,cancer

主題詞：

neoplasms

SubHeadings副主題詞對一個(gè)主題詞的某個(gè)方面進(jìn)行修飾限定的詞，又稱限定詞。例如，hepatitisb這個(gè)主題詞涉及到的病因、病理、診斷、治療、微生物學(xué)等多個(gè)方面。目前有83個(gè)副主題詞并非每個(gè)主題詞都能和83個(gè)副主題詞組配。副主題詞與主題詞的組配不是隨機(jī)的，而是有一定規(guī)則的。如“診斷”、”治療“不可與藥物、生物等主題詞組配，只能組配疾病類主題詞。第一步：輸入檢索詞。

主題詞檢索例主題詞檢索界面的輸入框內(nèi)輸入livercancer，點(diǎn)擊GO按扭，系統(tǒng)提示livercancer不是Mesh詞，規(guī)范主題詞應(yīng)該是liverneoplasms。

主題詞第二步：確定主題詞點(diǎn)擊liverneoplasms，顯示副主題詞，可供選擇。

可勾選副主題詞第三步：確定副主題詞用liverneoplasms選擇副主題詞surge