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文檔簡(jiǎn)介
蛋白質(zhì)的生物合成
(翻譯)
ProteinBiosynthesis,Translation第十五章蛋白質(zhì)的生物合成,即翻譯,就是將核酸中由4種核苷酸序列編碼的遺傳信息,通過遺傳密碼破譯的方式解讀為蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)中20種氨基酸的排列順序。參與蛋白質(zhì)合成的主要物質(zhì)
ProteinBiosynthesisSystem
第一節(jié)20種氨基酸(AA)作為原料酶及眾多蛋白因子,如IF、eIF
ATP、GTP、無機(jī)離子參與蛋白質(zhì)生物合成的物質(zhì)包括
三種RNAmRNA(messengerRNA,信使RNA)rRNA(ribosomalRNA,核蛋白體RNA)tRNA(transferRNA,轉(zhuǎn)移RNA)mRNA上存在遺傳密碼mRNA分子上從5至3方向,由AUG開始,每3個(gè)核苷酸為一組,決定肽鏈上某一個(gè)氨基酸,稱為三聯(lián)體密碼(tripletcoden)。起始密碼(initiationcoden):AUG
終止密碼(terminationcoden):
UAA,UAG,UGA
一、mRNA是合成蛋白質(zhì)的直接模板
(信使RNA)遺傳密碼表從mRNA5端起始密碼子AUG到3端終止密碼子之間的核苷酸序列,各個(gè)三聯(lián)體密碼連續(xù)排列編碼一個(gè)蛋白質(zhì)多肽鏈,稱為開放閱讀框架(openreadingframe,ORF)。1.通用性(universal)蛋白質(zhì)生物合成的整套密碼,從原核生物到人類都通用。已發(fā)現(xiàn)少數(shù)例外,如動(dòng)物細(xì)胞的線粒體、植物細(xì)胞的葉綠體。密碼的通用性進(jìn)一步證明各種生物進(jìn)化自同一祖先。
遺傳密碼的特性2.連續(xù)性(commaless)編碼蛋白質(zhì)氨基酸序列的各個(gè)三聯(lián)體密碼連續(xù)閱讀,密碼間既無間斷也無交叉?;驌p傷引起mRNA閱讀框架內(nèi)的堿基發(fā)生插入或缺失,可能導(dǎo)致框移突變(frameshiftmutation)。3.簡(jiǎn)并性(degeneracy)遺傳密碼中,除色氨酸和甲硫氨酸僅有一個(gè)密碼子外,其余氨基酸有2、3、4個(gè)或多至6個(gè)三聯(lián)體為其編碼。mRNA中密碼的閱讀方向?yàn)?/p>
5,
3,4.方向性二、tRNA是氨基酸的搬運(yùn)工具反密碼環(huán)氨基酸臂tRNA的三級(jí)結(jié)構(gòu)示意圖氨基酸+tRNA氨基酰-tRNAATP
AMP+PPi氨基酰-tRNA合成酶氨基酰-tRNA合成酶(aminoacyl-tRNAsynthetase)
氨基酸的活化氨基酰-tRNA合成酶對(duì)底物氨基酸和tRNA都有高度特異性。氨基酰-tRNA合成酶具有校正活性(proofreadingactivity)。氨基酰-tRNA的表示方法:Ala-tRNAAla
Ser-tRNASerMet-tRNAMet
擺動(dòng)性(wobble)轉(zhuǎn)運(yùn)氨基酸的tRNA的反密碼需要通過堿基互補(bǔ)與mRNA上的遺傳密碼反向配對(duì)結(jié)合,但反密碼與密碼間不嚴(yán)格遵守常見的堿基配對(duì)規(guī)律,稱為擺動(dòng)配對(duì)。U擺動(dòng)配對(duì)目錄密碼子、反密碼子配對(duì)的擺動(dòng)現(xiàn)象tRNA反密碼子第1位堿基IUGACmRNA密碼子第3位堿基U,C,AA,GU,CUG一種氨基酸可由多種tRNA運(yùn)輸三、rRNA是蛋白質(zhì)合成的場(chǎng)所原核生物真核生物核蛋白體小亞基大亞基核蛋白體小亞基大亞基S70S30S50S80S40S60SrRNA16S-rRNA5S-rRNA23S-rRNA18S-rRNA28S-rRNA5S-rRNA5.8S-rRNA蛋白質(zhì)rpS21種rpL36種rpS33種rpL49種
不同細(xì)胞核蛋白體的組成核蛋白體的組成目錄原核生物翻譯過程中核蛋白體結(jié)構(gòu)模式:A位:氨基酰位(aminoacylsite)P位:肽酰位(peptidylsite)E位:排出位(exitsite)目錄蛋白質(zhì)生物合成過程
TheProcessofProteinBiosynthesis
第二節(jié)翻譯的起始(initiation)翻譯的延長(zhǎng)(elongation)翻譯的終止(termination)整個(gè)翻譯過程可分為:翻譯過程從閱讀框架的5′-AUG開始,按mRNA模板三聯(lián)體密碼的順序延長(zhǎng)肽鏈,直至終止密碼出現(xiàn)。一、肽鏈合成起始指mRNA和起始氨基酰-tRNA分別與核蛋白體結(jié)合而形成翻譯起始復(fù)合物
(translationalinitiationcomplex)。真核生物:Met-tRNAiMet原核生物:fMet-tRNAifMet
起始肽鏈合成的氨基酰-tRNA原核、真核生物各種起始因子的生物功能
原核生物70S起始復(fù)合物形成核蛋白體大小亞基;mRNA在小亞基定位結(jié)合;fMet-tRNAifMet的結(jié)合;起始因子IF。IF-3IF-11.核蛋白體大小亞基分離目錄AUG5'3'IF-3IF-12.mRNA在小亞基定位結(jié)合目錄S-D序列IF-3IF-1IF-2GTP3.起始氨基酰tRNA(fMet-tRNAimet)結(jié)合到小亞基AUG5'3'目錄IF-3IF-1IF-2GTPGDPPi4.核蛋白體大亞基結(jié)合,起始復(fù)合物形成AUG5'3'目錄IF-3IF-1AUG5'3'IF-2GTPIF-2-GTPGDPPi目錄二、肽鏈合成延長(zhǎng)指根據(jù)mRNA密碼序列的指導(dǎo),次序添加氨基酸從N端向C端延伸肽鏈,直到合成終止的過程。肽鏈延長(zhǎng)在核蛋白體上連續(xù)性循環(huán)式進(jìn)行,又稱為核糖體循環(huán)(ribosomalcycle),每次循環(huán)增加一個(gè)氨基酸,包括以下三步:進(jìn)位(entrance)成肽(peptidebondformation)轉(zhuǎn)位(translocation)延伸過程所需蛋白因子稱為延長(zhǎng)因子(elongationfactor,EF)原核生物:EF-T(EF-Tu,EF-Ts)EF-G真核生物:EF-1、EF-2原核延長(zhǎng)因子生物功能對(duì)應(yīng)真核延長(zhǎng)因子EF-Tu促進(jìn)氨基酰-tRNA進(jìn)入A位,結(jié)合分解GTPEF-1-αEF-Ts調(diào)節(jié)亞基EF-1-βγEFG有轉(zhuǎn)位酶活性,促進(jìn)mRNA-肽酰-tRNA由A位前移到P位,促進(jìn)卸載tRNA釋放EF-2肽鏈合成的延長(zhǎng)因子又稱注冊(cè)(registration)(一)進(jìn)位指根據(jù)mRNA下一組遺傳密碼指導(dǎo),使相應(yīng)氨基酰-tRNA進(jìn)入核蛋白體A位。
目錄延長(zhǎng)因子EF-T催化進(jìn)位(原核生物)
目錄TuTsGTPGDPAUG5'3'TuTsGTP目錄(二)成肽是由轉(zhuǎn)肽酶(transpeptidase)催化的肽鍵形成過程。(三)轉(zhuǎn)位延長(zhǎng)因子EF-G有轉(zhuǎn)位酶(translocase)活性,可結(jié)合并水解1分子GTP,促進(jìn)核蛋白體向mRNA的3'側(cè)移動(dòng)。fMetAUG5'3'fMetTuGTP目錄進(jìn)位轉(zhuǎn)位成肽真核生物肽鏈合成的延長(zhǎng)過程與原核基本相似,但有不同的反應(yīng)體系和延長(zhǎng)因子。另外,真核細(xì)胞核蛋白體沒有E位,轉(zhuǎn)位時(shí)卸載的tRNA直接從P位脫落。
真核生物延長(zhǎng)過程
三、肽鏈合成的終止當(dāng)mRNA上終止密碼出現(xiàn)后,多肽鏈合成停止,肽鏈從肽酰-tRNA中釋出,mRNA、核蛋白體等分離,這些過程稱為肽鏈合成終止。
終止相關(guān)的蛋白因子稱為釋放因子(releasefactor,RF)一是識(shí)別終止密碼,如RF-1特異識(shí)別UAA、UAG;而RF-2可識(shí)別UAA、UGA。二是誘導(dǎo)轉(zhuǎn)肽酶改變?yōu)轷ッ富钚?,相?dāng)于催化肽?;D(zhuǎn)移到水分子-OH上,使肽鏈從核蛋白體上釋放。釋放因子的功能原核生物釋放因子:RF-1,RF-2,RF-3
真核生物釋放因子:eRF原核肽鏈合成終止過程UAG5'3'RFCOO-目錄多核糖體循環(huán)——使蛋白質(zhì)合成高速、高效進(jìn)行。目錄電鏡下的多核糖體循環(huán)現(xiàn)象目錄翻譯后加工和輸送PosttranslationalProcessing&ProteinTransportation第三節(jié)從核蛋白體釋放出的新生多肽鏈不具備蛋白質(zhì)生物活性,必需經(jīng)過不同的翻譯后復(fù)雜加工過程才轉(zhuǎn)變?yōu)樘烊粯?gòu)象的功能蛋白。主要包括肽鏈一級(jí)結(jié)構(gòu)的修飾高級(jí)結(jié)構(gòu)修飾靶向輸送一、一級(jí)結(jié)構(gòu)的修飾(一)肽鏈N端的修飾(二)個(gè)別氨基酸的修飾(三)多肽鏈的水解修飾二、高級(jí)結(jié)構(gòu)的修飾(一)亞基聚合
(二)輔基連接(三)疏水脂鏈的共價(jià)連接蛋白質(zhì)合成后需要經(jīng)過復(fù)雜機(jī)制,定向輸送到最終發(fā)揮生物功能的細(xì)胞靶部位,這一過程稱為蛋白質(zhì)的靶向輸送。
三、蛋白質(zhì)合成后的靶向輸送?蛋白質(zhì)的靶向輸送(proteintargeting)所有靶向輸送的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)中存在分選信號(hào),主要為N末端特異氨基酸序列,可引導(dǎo)蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)移到細(xì)胞的適當(dāng)靶部位,這一序列稱為信號(hào)序列(信號(hào)肽)。
?信號(hào)序列(signalsequence)
分泌蛋白的靶向輸送真核細(xì)胞分泌蛋白等前體合成后靶向輸送過程首先要進(jìn)入內(nèi)質(zhì)網(wǎng)。
信號(hào)肽(signalpeptide)各種新生分泌蛋白的N端有保守的氨基酸序列稱信號(hào)肽。信號(hào)肽的一級(jí)結(jié)構(gòu)信號(hào)肽引導(dǎo)真核分泌蛋白進(jìn)入內(nèi)質(zhì)網(wǎng)目錄蛋白質(zhì)生物合成的干擾和抑制
Interference&InhibitionofProteinBiosynthesis第四節(jié)蛋白質(zhì)生物合成是很多天然抗生素和某些毒素的作用靶點(diǎn)。它們就是通過阻斷真核、原核生物蛋白質(zhì)翻譯體系某組分功能,干擾和抑制蛋白質(zhì)生物合成過程而起作用的??舍槍?duì)蛋白質(zhì)生物合成必需的關(guān)鍵組分作為研究新抗菌藥物的作用靶點(diǎn)。同時(shí)盡量利用真核、原核生物蛋白質(zhì)合成體系的任何差異,以設(shè)計(jì)、篩選僅對(duì)病原微生物特效而不損害人體的藥物。抗生素(antibiotics)是微生物產(chǎn)生的能夠殺滅或抑制細(xì)菌的一類藥物。抗代謝藥物指能干擾生物代謝過程,從而抑制細(xì)胞過度生長(zhǎng)的藥物,如:6-MP。
某些毒素也作用于基因信息傳遞過程。一、抗生素類抗生素作用點(diǎn)作用原理應(yīng)用四環(huán)素族(金霉素新霉素、土霉素)鏈霉素、卡那霉素、新霉素氯霉素、林可霉素紅霉素梭鏈孢酸
放線菌酮嘌呤霉素原核核蛋白體小亞基原核核蛋白體小亞基原核核蛋白體大亞基原核核蛋白體大亞基原核核蛋白體大亞基真核核蛋白體大亞基真核、原核核蛋白體抑制氨基酰-tRNA與小亞基結(jié)合改變構(gòu)象引起讀碼錯(cuò)誤、抑制起始抑制轉(zhuǎn)肽酶、阻斷延長(zhǎng)抑制轉(zhuǎn)肽酶、妨礙轉(zhuǎn)位與EFG-GTP結(jié)合,抑制肽鏈延長(zhǎng)抑制轉(zhuǎn)肽酶、阻斷延長(zhǎng)氨基酰-tRNA類似物,進(jìn)位后引起未成熟肽鏈脫落抗菌藥抗菌藥抗菌藥抗菌藥抗菌藥醫(yī)學(xué)研究抗腫瘤藥抗生素抑制蛋白質(zhì)生物合成的原理
嘌呤霉素作用示意圖四環(huán)素族氯霉素鏈霉素和卡那霉素嘌呤霉素放線菌酮目錄二、其他干擾蛋白質(zhì)生物合成的物質(zhì)毒素(toxin)干擾素(interferon)白喉毒素
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