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文檔簡介
第十章核苷酸代謝及核酸的生物合成12/13/20221第十章核苷酸代謝及核酸的生物合成12/12/20221一、核酸的酶促降解1、核酸水解:DNA穩(wěn)定,耐酸堿RNA易水解:堿水解2、酶促水解:1)降解方式12/13/20222一、核酸的酶促降解1、核酸水解:DNA穩(wěn)定,耐酸堿2、酶促RNA:RNase(穩(wěn)定、耐高溫)DNA:DNase(種類多、工具酶)2)核酸E(1)底物:12/13/20223RNA:RNase(穩(wěn)定、耐高溫)DNA:DNase(種(2)作用方式:核酸外切E:核酸鏈的一端逐個水解下核苷酸的酶(非特異性)3’-核酸外切E:蛇毒磷酸二酯E3’-OH端開始,生成5’-核苷酸5’-核酸外切E:牛脾磷酸二酯E5’-OH端開始,生成3’-核苷酸12/13/20224(2)作用方式:核酸外切E:3’-核酸外切E:5’-核酸外特異水解分子內(nèi)磷酸二酯鍵的酶(特異性強)核酸內(nèi)切E牛胰核糖核酸酶:嘧啶核苷3’-磷酸與相鄰核苷酸的3’,5’-磷酸二酯鍵12/13/20225特異水解分子內(nèi)磷酸二酯鍵的酶(特異性強)核酸內(nèi)切E牛胰核12/13/2022612/12/20226限制性核酸內(nèi)切酶(Restrictionendonuclease)識別雙鏈DNA分子中特定核苷酸序列,并由此切割DNA雙鏈的核酸內(nèi)切酶能識別水解外源雙鏈DNA的核酸內(nèi)切酶(細菌)細菌本身DNA,順序已被甲基化,不被水解僅限于水解外源DNA以保護自身——限制性酶12/13/20227限制性核酸內(nèi)切酶(Restrictionendonucle限制酶:內(nèi)切方式水解DNA產(chǎn)物:5’為P,3’為OH特點:極高的專一性(對特定核苷酸順序?qū)R恍?,非堿基專一)對底物DNA有特異的識別位點位點一般在4~8bp,通常具回文結(jié)構(gòu)切割后形成粘性末端(或平齊末端)12/13/20228限制酶:內(nèi)切方式水解DNA產(chǎn)物:5’為P,3’為OH特點:1回文結(jié)構(gòu):DNA局部雙螺旋以某一對稱軸旋轉(zhuǎn)180°后,與另一側(cè)的互補片段的順序完全相同的DNA結(jié)構(gòu)粘性末端:雙鏈DNA分子經(jīng)限制性E作用后,每條單鏈的一端帶有識別順序中幾個互補堿基,這樣的末端稱~12/13/20229回文結(jié)構(gòu):DNA局部雙螺旋以某一對稱軸旋轉(zhuǎn)180°后,與另粘(3)核酸的酶促降解12/13/202210(3)核酸的酶促降解12/12/202210核酸核苷堿基降解核苷酸Pi戊糖12/13/202211核酸核苷堿基降解核苷酸Pi戊糖12/12/202211(5)核苷酸生理功能:1)合成核酸的原料:ATP,GTP,CTP,UTP→RNAdATP,dGTP,dCTP,dTTP→DNA2)能量的貯存和供應(yīng):ATP,GTP,UTP,CTP等3)參與代謝、調(diào)節(jié)生理活動:cAMP、cGMP:激素的第二信使4)構(gòu)成酶的輔酶或輔基:NAD+,NADP+,F(xiàn)AD,F(xiàn)MN,CoA:含核苷酸5)代謝中間物的載體:UDP-糖基,CDP-膽堿、膽胺、甘油二酯,腺苷-蛋氨酸12/13/202212(5)核苷酸生理功能:1)合成核酸的原料:2)能量的貯存和供二、核苷酸的降解12/13/202213二、核苷酸的降解12/12/2022131、嘌呤的降解12/13/2022141、嘌呤的降解12/12/202214次黃嘌呤尿素NH3+CO2GRNH2(微生物)黃嘌呤尿酸尿囊素鳥類12/13/202215次黃嘌呤尿素NH3+CO2GR(微生物)黃嘌呤尿酸尿尿酸:人體分解代謝的終產(chǎn)物痛風癥:嘌呤核苷酸分解代謝異常血中尿酸水平升高
尿酸鈉晶體沉積,軟骨、關(guān)節(jié)、軟組織、腎臟臨床:皮下結(jié)節(jié),關(guān)節(jié)疼痛等12/13/202216尿酸:人體分解代謝的終產(chǎn)物12/12/2022162、嘧啶的降解12/13/2022172、嘧啶的降解12/12/202217NH2二氫尿嘧啶還原H2O(開環(huán))Β-脲基丙酸H2OΒ-丙AA12/13/202218NH2二氫尿嘧啶還原H2O(開環(huán))Β-脲基丙酸H2OΒ-丙A三、核苷酸的合成代謝原料:氨基酸、甲酸鹽和CO2等從頭合成(devovosynthesis)利用核酸降解的中間產(chǎn)物或外源的核苷,嘌呤堿和嘧啶堿合成新的核苷酸補救途徑(salvagepathway)12/13/202219三、核苷酸的合成代謝原料:氨基酸、甲酸鹽和CO2等從頭合成嘌呤、嘧啶基本途徑從頭合成肝半合成(補救合成)腦、骨髓12/13/202220嘌呤、嘧啶基本途徑從頭合成半合成(補救合成)12/12/20核糖核苷酸的合成12/13/202221核糖核苷酸的合成12/12/202221核苷酸合成的兩條途徑核糖、氨基酸、CO2、NH3核糖核苷酸脫氧核苷酸輔酶RNA核苷堿基脫氧核苷DNA補救途徑從頭合成肝半合成腦、骨髓12/13/202222核苷酸合成的兩條途徑核糖、氨基酸、CO2、NH3核糖核苷酸脫(一)嘌呤核苷酸的從頭合成1、嘌呤核苷酸環(huán)上原子來源NNC123547689CO2Asp一碳單位Gln甘氨酸一碳單位N5,N10-次甲基四氫葉酸12/13/202223(一)嘌呤核苷酸的從頭合成1、嘌呤核苷酸環(huán)上原子來源NNC1一碳單位一碳單位12/13/202224一碳單位一碳單位12/12/2022242、合成特點合成部位:胞漿主要器官:肝臟;其次,小腸和胸腺腦和骨髓不能合成5-磷酸核糖→IMP(次黃苷酸)→AMP、GMP
12/13/2022252、合成特點合成部位:胞漿12/12/202225IMP合成:
5-P-核糖+ATP→PRPP(5-磷酸核糖焦磷酸)逐漸加上嘌呤的各個原子先形成右環(huán),再左環(huán)(共11步反應(yīng))四氫葉酸(FH4):一碳單位的載體12/13/202226IMP合成:12/12/20222612/13/20222712/12/202227IMP的合成12/13/202228IMP的合成12/12/2022283、嘌呤核苷酸的相互轉(zhuǎn)化黃苷單磷酸腺苷單磷酸鳥苷單磷酸次黃苷酸12/13/2022293、嘌呤核苷酸的相互轉(zhuǎn)化黃苷單磷酸腺苷單磷酸鳥苷單磷酸次黃苷NMP+ATPNDP+ADPNDP+ATPNTP+ADP磷酸激酶N:嘌呤或嘧啶堿基12/13/202230NMP+ATPNDP+ADPNDP+ATPNTP+ADP磷酸
嘌呤類似物(6-巰基嘌呤):
抑制AMP、GMP的生成
谷胺酰胺類似物(氮雜絲氨酸):
抑制IMP的合成中有谷胺酰胺參與的反應(yīng)
葉酸類似物(氨基蝶呤、氨甲喋呤):
抑制IMP合成中有四氫葉酸參與的反應(yīng)4、臨床抗癌藥物的作用機理12/13/202231嘌呤類似物(6-巰基嘌呤):4、臨床抗癌藥物的作用機理12氨甲酰磷酸天冬氨酸(二)嘧啶類核苷酸的從頭合成1、嘧啶環(huán)上原子來源前體:氨甲酰磷酸和天冬氨酸12/13/202232氨甲酰磷酸天冬氨酸(二)嘧啶類核苷酸的從頭合成1、嘧啶環(huán)上原合成場所:胞漿(肝細胞)氨甲酰磷酸+天冬氨酸→嘧啶環(huán)+PRPP→UMP關(guān)鍵中間產(chǎn)物:乳清酸胞苷酸:尿苷酸轉(zhuǎn)變2、合成特點12/13/202233合成場所:胞漿(肝細胞)2、合成特點12/12/2022312/13/20223412/12/20223412/13/20223512/12/20223512/13/20223612/12/2022363、嘧啶核苷酸的合成與相互轉(zhuǎn)變12/13/2022373、嘧啶核苷酸的合成與相互轉(zhuǎn)變12/12/202237除脫氧胸苷酸,大多數(shù)合成是在NDP的基礎(chǔ)上進行(三)脫氧核糖核苷酸的合成1、核糖核苷酸的還原12/13/202238除脫氧胸苷酸,大多數(shù)合成是在NDP的基礎(chǔ)上進行(三)脫氧核糖2、dTMP的合成12/13/2022392、dTMP的合成12/12/202239(四)NMP→NDP、NTP生物合成和能量轉(zhuǎn)換中,核苷酸的活潑形式是NDP和NTP12/13/202240(四)NMP→NDP、NTP生物合成和能量轉(zhuǎn)換中,核苷酸的活12/13/20224112/12/202241脫氧胸苷酸的合成12/13/202242脫氧胸苷酸的合成12/12/202242氟尿嘧啶(FU)氨基蝶呤氨甲蝶呤胸苷酸合成的抗代謝物作用機理12/13/202243氟尿嘧啶(FU)氨基蝶呤胸苷酸合成的抗代謝物作用機理12/15-氟尿嘧啶氨甲蝶呤嘧啶類抗代謝物結(jié)構(gòu)12/13/2022445-氟尿嘧啶氨甲蝶呤嘧啶類抗代謝物結(jié)構(gòu)12/12/20224各種核苷酸合成的相互關(guān)系12/13/202245各種核苷酸合成的相互關(guān)系12/12/202245磷酸核糖轉(zhuǎn)移酶途徑:主要途徑嘌呤+PRPP嘌呤核苷酸+PPi(四)嘌呤核苷酸合成的補救途徑12/13/202246磷酸核糖轉(zhuǎn)移酶途徑:主要途徑(四)嘌呤核苷酸合成的補救途徑12/13/20224712/12/202247磷酸核糖轉(zhuǎn)移酶缺乏與Lesch-Nyhan綜合癥HGPRT(次黃嘌呤-尿嘌呤磷酸核糖轉(zhuǎn)移酶)缺乏2~3歲,患兒,咬手指和嘴唇,智力缺陷,常痙攣,痛風,活20歲左右不能進行補救途徑,從頭合成速度加快尿酸積累結(jié)石,痛風自殘(?)12/13/202248磷酸核糖轉(zhuǎn)移酶缺乏與Lesch-Nyhan綜合癥12/12/(五)嘧啶核苷酸合成的補救途徑12/13/202249(五)嘧啶核苷酸合成的補救途徑12/12/202249四.DNA生物合成(一)分子遺傳的中心法則
DNA是遺傳信息的儲存和發(fā)布者,在遺傳信息的傳遞中處于中心地位1958年,Crick,“中心法則”(Centraldogma)12/13/202250四.DNA生物合成(一)分子遺傳的中心法則生物的遺傳信息以密碼的形式貯存在DNA分子上(特定的核苷酸排列順序)細胞分裂,DNA復(fù)制,遺傳信息→子代細胞。子代細胞生長發(fā)育遺傳信息(轉(zhuǎn)錄)→RNA→氨基酸順序(翻譯)蛋白質(zhì)執(zhí)行多樣的生物學功能后代表現(xiàn)出與親代極為相似的遺傳特征12/13/202251生物的遺傳信息以密碼的形式貯存在DNA分子上12/12/2012/13/20225212/12/202252復(fù)制Replication:
以DNA雙鏈為模板,按照堿基配對原則,合成出與親代DNA分子相同的兩個雙鏈DNA分子的過程基本概念轉(zhuǎn)錄(Transcription):
以DNA為模板,按照堿基配對原則,合成出一條與模板DNA鏈互補的RNA分子的過程12/13/202253復(fù)制Replication:基本概念轉(zhuǎn)錄(Transcr逆轉(zhuǎn)錄(ReverseTranscription):以mRNA為模板,在逆轉(zhuǎn)錄酶的作用下合成DNA的過程翻譯(Translation):以mRNA為模板,合成出具有特定AA順序的Pr肽鏈的過程12/13/202254逆轉(zhuǎn)錄(ReverseTranscription):翻譯(中心法則(CentralDogma):說明DNA、RNA和蛋白質(zhì)之間信息傳遞關(guān)系的法則即:遺傳信息:決定生物結(jié)構(gòu)、性狀和代謝類型的特殊的生物指令12/13/202255中心法則(CentralDogma):遺傳信息:12/12(二)DNA的復(fù)制1、DNA生物合成的機理12/13/202256(二)DNA的復(fù)制1、DNA生物合成的機理12/12/2022、DNA復(fù)制的基本規(guī)律1)半保留復(fù)制(semi-conservativeReplication)DNA復(fù)制過程中,新形成的DNA分子的一條鏈來自親代DNA,另一條鏈是新合成的,這種復(fù)制方式~生物學意義:生物的遺傳特性,保持相對穩(wěn)定性12/13/2022572、DNA復(fù)制的基本規(guī)律1)半保留復(fù)制(semi-co12/13/20225812/12/20225812/13/20225912/12/2022592)復(fù)制的多模式特定的部位開始,雙向或單向進行原核生物(細菌、病毒):一個起點;雙向為主,也有單向(某些質(zhì)粒、病毒)真核生物:多個起點;雙向為主,也有單向(細胞器DNA)12/13/2022602)復(fù)制的多模式特定的部位開始,雙向或單向進行12/12/2開始DNA復(fù)制的特定位點——原點(origin)。從原點開始同時向DNA鏈兩個方向進行,形成一個分叉,——復(fù)制叉(replieationfork)。復(fù)制叉在電鏡下觀察猶如一只眼睛——復(fù)制眼(replicationeye)。環(huán)形DNA復(fù)制時由于復(fù)制眼的形成,構(gòu)成了一個有內(nèi)圈的閉合環(huán)狀體——Q結(jié)構(gòu)。12/13/202261開始DNA復(fù)制的特定位點——原點(origin)。112/13/20226212/12/20226212/13/20226312/12/202263
Meselson、Stahl
15N標記,15NH4Cl,E.coli培養(yǎng)基,培養(yǎng)12代
15N的標記DNA
14N的普通培養(yǎng)基四代DNA,氯化銫密度梯度離心實驗依據(jù)12/13/202264Meselson、Stahl實驗依據(jù)12/12/202212/13/20226512/12/202265(二)DNA復(fù)制的起點和方向1、兩個起點,兩個生長端的相向復(fù)制
線性DNA病毒DNA每條鏈有1個復(fù)制起點,分別合成1條新DNA,兩條新鏈相向合成,每個生長點只有1條鏈合成2、1個起點,1個復(fù)制區(qū)的單向復(fù)制
環(huán)形DNA兩條鏈的復(fù)制起始點在同一位置,復(fù)制向一個方向運動,兩條DNA鏈均被復(fù)制3、1個起點,兩個復(fù)制區(qū)的雙向復(fù)制
普遍復(fù)制起始于1個位點,形成兩個復(fù)制區(qū)向相反方向運動,在每個復(fù)制區(qū)兩條DNA鏈均被復(fù)制12/13/202266(二)DNA復(fù)制的起點和方向1、兩個起點,兩個生長端的相向復(fù)DNA復(fù)制的起點和方向示意圖12/13/202267DNA復(fù)制的起點和方向示意圖12/12/2022673)復(fù)制需RNA為引物4)子鏈DNA延伸方向:核糖的3’-OH能與其它核苷酸的磷酸以3’,5’-磷酸二酯鍵相連12/13/2022683)復(fù)制需RNA為引物4)子鏈DNA延伸方向:核糖的3’-O5)半不連續(xù)復(fù)制(semi-discontinuousreplication)岡崎片段原核生物:1000~2000核苷酸真核生物:100~200核苷酸12/13/2022695)半不連續(xù)復(fù)制(semi-discontinuous前導(dǎo)鏈(leadingstrand):以3’→5’的親代鏈為模板,子代鏈能連續(xù)合成,稱~。滯后鏈(laggingstrand):以5’→3’的親代鏈為模板,子代鏈不能連續(xù)合成,稱~12/13/202270前導(dǎo)鏈(leadingstrand):12/12/2022岡崎片段(Okazakifragment):1968年,岡崎以5’→3’的親代鏈為模板合成新鏈時,先形成一些1000核苷酸左右的DNA短片段,然后由連接E連接成完整的子鏈。在復(fù)制過程中形成的DNA片段,稱為~12/13/202271岡崎片段(Okazakifragment):12/12/2半不連續(xù)復(fù)制:
新生的DNA雙鏈,一條鏈按5’→3’的方向連續(xù)合成,另一條則按5’→3’的方向不連續(xù)合成12/13/202272半不連續(xù)復(fù)制:12/12/2022723、DNA復(fù)制中所需的酶和輔因子1)引物酶(Primase)功能:
以DNA為模板,以NTP為原料,合成一小段RNA,作為合成DNA的引物(Primer)DNA聚合酶,按模板鏈的指令引物3’-OH端延伸無從頭合成的活性。引物E與有關(guān)蛋白質(zhì)結(jié)合成引發(fā)體(primosome)12/13/2022733、DNA復(fù)制中所需的酶和輔因子1)引物酶(Prima2)DNA聚合酶E.coli:(1)DNA聚合酶Ⅰ(109kD)1958年,A.Kornberg,E.coli功能:校讀錯誤,填補空隙,切除引物12/13/2022742)DNA聚合酶(1)DNA聚合酶Ⅰ(109kD)195(2)DNA聚合酶Ⅱ和ⅢDNA聚合酶Ⅱ:DNA的損傷修復(fù)5’→3’聚合活力3’→5’外切活力DNA聚合酶Ⅲ:復(fù)制的主要酶5’→3’聚合活力3’→5’外切活力5’→3’外切活力分子量約140kD,10種亞基組成的不對稱二聚體。12/13/202275(2)DNA聚合酶Ⅱ和ⅢDNA聚合酶Ⅱ:DNA聚合酶Ⅲ:分子2)DNA聚合酶E.coli:12/13/2022762)DNA聚合酶E.coli:12/12/2022真核細胞的DNA聚合Eαβγδεα、δ:復(fù)制延長β:修復(fù)(沒有其他酶時發(fā)揮作用)γ(線粒體):線粒體DNA的復(fù)制?ε:校讀、修復(fù)和填補空缺12/13/202277真核細胞的DNA聚合Eαβγδε12/12/202277功能:雙螺旋解鏈需ATP供能3)DNA連接E(DNAligase)功能:縫合缺口不連接單獨存在的DNA或RNA單鏈4)DNA解螺旋E(helicase)基因工程:工具酶12/13/202278功能:3)DNA連接E(DNAligase)功能:4)功能:穩(wěn)定解開的DNA單鏈阻止復(fù)性保護單鏈不被核酸E降解5)單鏈結(jié)合蛋白(single-strandbindingprotein,SSB)12/13/202279功能:5)單鏈結(jié)合蛋白(single-strandbind6)拓撲異構(gòu)酶(topoisomerase)ⅠⅡ轉(zhuǎn)錄復(fù)制12/13/2022806)拓撲異構(gòu)酶(topoisomerase)ⅠⅠ型E:雙鏈DNA的一條鏈發(fā)生斷裂和再連接,減少負超螺旋反應(yīng)不需供能活性轉(zhuǎn)錄區(qū),同轉(zhuǎn)錄有關(guān)12/13/202281Ⅰ型E:12/12/202281Ⅱ型E(旋轉(zhuǎn)E,grase):內(nèi)切E、連接E活力使DNA雙鏈同時發(fā)生斷裂和再連接連續(xù)引入負超螺旋(需ATP供能)同復(fù)制有關(guān)12/13/202282Ⅱ型E(旋轉(zhuǎn)E,grase):12/12/20228212/13/20228312/12/2022834、原核生物DNA的復(fù)制過程(E,coli)1)DNA復(fù)制的起始起始位點識別→DNA解鏈→RNA引物合成12/13/2022844、原核生物DNA的復(fù)制過程(E,coli)1)DNA名稱功能DnaA蛋白(四聚體)辨認起始點并結(jié)合解螺旋酶(DnaB蛋白,rep蛋白)解鏈DnaC蛋白協(xié)助解旋引物酶(DnaG蛋白)催化RNA引物生成SSB穩(wěn)定解開單鏈拓撲異構(gòu)酶理順DNA鏈oriC(245bp的DNA組分)復(fù)制起始點參與復(fù)制起始的各種蛋白質(zhì)12/13/202285名稱功能DnaA蛋白(四聚體)辨認起復(fù)制:一個特定位點(oriC)開始另一特定位點(ter)終止能獨立進行復(fù)制的單位——復(fù)制子(replicon)原核生物:一個復(fù)制子,真核生物:多個復(fù)制子12/13/202286復(fù)制:12/12/202286DNAB蛋白:識別起始位點,ATP供能、組裝引發(fā)體與模板起始部位結(jié)合解鏈酶(rep蛋白)、旋轉(zhuǎn)酶共同作用,雙鏈局部解開暴露出起始位點單鏈結(jié)合蛋白(SSB)與DNA結(jié)合:防止H鍵的形成電鏡觀察:”眼睛”——”復(fù)制眼”繼續(xù)解鏈形成復(fù)制叉引物酶(DnaG)催化下合成一小段RNA,5’-3P,3’-OH12/13/202287DNAB蛋白:識別起始位點,ATP供能、組裝引發(fā)體12/112/13/20228812/12/202288復(fù)制叉12/13/202289復(fù)制叉12/12/20228912/13/20229012/12/202290(前導(dǎo)鏈)(滯后鏈)岡崎片斷半不連續(xù)復(fù)制DNA雙鏈:反向平行合成方向:5‘3’DNA復(fù)制:合成方向和復(fù)制叉的前進方向相同,可連續(xù)復(fù)制——前導(dǎo)鏈;另一條鏈的合成方向和復(fù)制叉的前進方向相反,不能連續(xù)復(fù)制,只能分成幾個片段合成——滯后鏈滯后鏈的片段——岡崎片段,合成后再連接12/13/202291(前導(dǎo)鏈)(滯后鏈)岡崎片斷半不連續(xù)復(fù)制DNA雙鏈:反向平行
模板:DNA
引物:RNA
原料、能源:NTP,dNTP
酶:引物酶;DNA聚合酶I、II、III;DNA連接酶;解鏈酶;單鏈結(jié)合蛋白;拓撲異構(gòu)酶
合成方向:
模板鏈:3’→5’合成鏈:5’→3’原核細胞DNA的復(fù)制(E.Coli)12/13/202292模板:DNA原核細胞DNA的復(fù)制(E.Coli)大腸桿菌三種DNA聚合酶比較12/13/202293大腸桿菌三種DNA聚合酶比較12/12/202293DNA聚合酶催化的反應(yīng):12/13/202294DNA聚合酶催化的反應(yīng):12/12/202294蛋白質(zhì)功能相對分子量(×103)分子/細胞DNA旋轉(zhuǎn)酶(或拓撲異構(gòu)酶)DNA解鏈酶單鏈結(jié)合蛋白引物合成酶DNA聚合酶Ⅰ引入或松開超螺旋解鏈雙鏈DNA穩(wěn)定單鏈區(qū)合成RNA引物除去引物并填滿缺口40065746010950300100300與DNA合成有關(guān)的蛋白因子(E.coli)12/13/202295蛋白質(zhì)功能相對分子量(×103)分子/細胞DNA旋轉(zhuǎn)酶(或拓DNA合成步驟解旋:拓撲異構(gòu)酶解鏈:解鏈酶,SSB結(jié)合單鏈,防止氫鍵再形成識別起點:引物酶生成引物:DNA為模板,引物酶催化,DNA轉(zhuǎn)錄DNA的生成:RNA引物3’末端堿基互補,DNA,聚合酶Ⅲ催化12/13/202296DNA合成步驟解旋:拓撲異構(gòu)酶12/12/202296DNA合成的起始與延伸12/13/202297DNA合成的起始與延伸12/12/202297拓撲異構(gòu)酶I的作用12/13/202298拓撲異構(gòu)酶I的作用12/12/202298拓撲異構(gòu)酶II的作用
12/13/202299拓撲異構(gòu)酶II的作用12/12/202299切除引物:DNA聚合酶I,岡崎片段補齊封口:DNA聚合酶I,堿基互補,填補岡崎片段間的缺口DNA連結(jié)酶,連結(jié)模板鏈新的互補鏈NAD+供能12/13/2022100切除引物:DNA聚合酶I,岡崎片段12/12/2022100引物的切除,缺口填補,切口連接12/13/2022101引物的切除,缺口填補,切口連接12/12/2022101真核細胞DNA的復(fù)制(與原核細胞的區(qū)別)12/13/2022102真核細胞DNA的復(fù)制(與原核細胞的區(qū)別)12/12/2022RNA引物、岡崎片段較小復(fù)制速度較慢(組蛋白的存在,DNA雙股穩(wěn)定)多起點DNA聚合酶
α,β,γ、線粒體聚合酶催化聚合,無外切酶作用12/13/2022103RNA引物、岡崎片段較小12/12/2022103DNA聚合酶的功能線粒體DNA的復(fù)制線粒體線粒體酶細胞核,細胞核質(zhì)γ細胞核DNA的修復(fù)細胞核β細胞核DNA的復(fù)制細胞核α功能細胞定位DNA聚合酶12/13/2022104DNA聚合酶的功能線粒體DNA線粒體線粒體酶細胞核,細胞核質(zhì)(三)逆轉(zhuǎn)錄(reversetranscription)以RNA為模板合成DNA的過程逆轉(zhuǎn)錄E廣泛存在于致癌RNA病毒、正常動物的胚胎細胞12/13/2022105(三)逆轉(zhuǎn)錄(reversetranscription)以依賴RNA的DNA聚合酶核糖核酸酶H活力依賴DNA的DNA聚合酶12/13/2022106依賴RNA的DNA聚合酶核糖核酸酶H活力依賴DNA的DNA聚因發(fā)現(xiàn)逆轉(zhuǎn)錄病毒的遺傳物質(zhì)而獲1975年諾貝爾獎的三位科學家12/13/2022107因發(fā)現(xiàn)逆轉(zhuǎn)錄病毒的遺傳物質(zhì)而獲1975年諾貝爾獎的三位科學家(四)DNA復(fù)制的忠實性高度精確性,錯誤率約1/109~1/10101、堿基的配對規(guī)律:配錯幾率1/104~1/105。2、DNA聚合酶的校對功能:錯配幾率降低100~1000倍3、DNA的損傷修復(fù)系統(tǒng)12/13/2022108(四)DNA復(fù)制的忠實性高度精確性,錯誤率約1/109~DNA聚合酶的的自我校正
DNA聚合酶不能從頭合成DNA,即不能把兩個dNTP連接起來,而只能將一個個核苷酸單位加到形成堿基配對的引物鏈3’羥基上,如果引物鏈3‘羥基出現(xiàn)了和模板鏈錯配的堿基,DNA聚合酶就會立即停止前進,并利用3‘5’核酸外切酶活性將錯配的核苷酸從引物3‘端切除,只有引物3’端重新出現(xiàn)堿基配對時才繼續(xù)合成DNA。所以在合成DNA之前必須有正確的堿基配對存在于3’端,即DNA聚合酶必須利用RNA引物鏈來檢驗3‘端的堿基配對正確與否,在確認無誤后才開始合成。12/13/2022109DNA聚合酶的的自我校正12/12/2022109錯配校正系統(tǒng)
錯配校正系統(tǒng)能發(fā)現(xiàn)DNA雙螺旋因非互補堿基對間的不對稱而產(chǎn)生的變形,它能區(qū)分和切除存在于新合成的DNA中錯配的核苷酸。E.coli的錯配校正系統(tǒng)利用dam基因編碼的甲基化酶將DNA堿基序列中的A在N6位甲基化,但新合成的A要晚一些才被甲基化,這使堿基序列只是在剛合成的新DNA鏈中還沒有被甲基化,這就能區(qū)別新DNA鏈和模板鏈。
參與錯配修復(fù)的酶與蛋白質(zhì):Dam甲基化酶;MutH、MutL、MutS蛋白;解螺旋酶Ⅱ;DNA聚合酶Ⅲ;外切酶Ⅰ、Ⅹ、Ⅶ;RecJ核酸酶DNA連接酶;SSB12/13/2022110錯配校正系統(tǒng)參與錯配修復(fù)的酶與蛋白質(zhì):12/12/20221錯配校正示意圖12/13/2022111錯配校正示意圖12/12/2022111五、DNA的突變(損傷)和修復(fù)DNA的堿基順序發(fā)生穩(wěn)定而突然的變化,導(dǎo)致DNA的復(fù)制、轉(zhuǎn)錄和翻譯發(fā)生變化,表現(xiàn)出異常的遺傳特性(一)DNA的突變(基因突變):自發(fā)突變和誘發(fā)突變12/13/2022112五、DNA的突變(損傷)和修復(fù)DNA的堿基順序發(fā)生環(huán)境因素電離輻射紫外線烷化劑脫氨劑等12/13/2022113環(huán)境因素電離輻射12/12/2022113(二)突變的形式:1、置換:一個or幾個堿基的置換(可逆)
a、轉(zhuǎn)換:G-A,C-T互變;
b、顛換:嘌呤-嘧啶互變12/13/2022114(二)突變的形式:1、置換:一個or幾個堿基的置換(可逆)112/13/202211512/12/20221152、插入:插入一個or幾個堿基(可逆),導(dǎo)致遺傳密碼解讀框架的改變,突變點后的密碼都可能發(fā)生錯誤——移碼突變(frameshiftmutation)溴化乙錠12/13/20221162、插入:插入一個or幾個堿基(可逆),導(dǎo)致遺傳密碼12/13、缺失:缺失一個or幾個堿基對(不可逆)12/13/20221173、缺失:缺失一個or幾個堿基對(不可逆)12/12/202(三)DNA的損傷修復(fù)DNA損傷,死亡修復(fù)機制,能夠修復(fù)一定程度的DNA損傷但仍有可能發(fā)生突變12/13/2022118(三)DNA的損傷修復(fù)DNA損傷,死亡12/12/20221紫外線照射相鄰兩個堿基間形成共價鍵——二聚體(T·T、T·C)二聚體阻礙DNA聚合酶的作用復(fù)制不能繼續(xù)1、光復(fù)活(photoreactivation)紫外照射損傷,強的可見光(400nm)照射,大部分損傷的細胞修復(fù)——光復(fù)活12/13/2022119紫外線照射1、光復(fù)活(photoreactivation)機制可見光激活光復(fù)活酶、光裂合酶嘧啶二聚體分解哺乳動物細胞缺乏12/13/2022120機制可見光激活光復(fù)活酶、光裂合酶嘧啶二聚體分解哺乳動物細胞缺光復(fù)活酶12/13/2022121光復(fù)活酶12/12/20221212、切除修復(fù)(暗修復(fù),excisionrepair)各類生物12/13/20221222、切除修復(fù)(暗修復(fù),excisionrepair)各類生3、重組修復(fù)(recombinationrepair)12/13/20221233、重組修復(fù)(recombinationrepair)1(a)DNA糖基化酶切除損傷的堿基產(chǎn)生無堿基酸(b)無堿基核酸內(nèi)切酶在無堿基酸處切開產(chǎn)生切口。(c)DNA聚合酶Ⅰ將無堿基酸切除并填補缺口。(d)DNA連接酶連接切口。堿基切除修復(fù)12/13/2022124(a)DNA糖基化酶切除損傷的堿基產(chǎn)生無堿基酸(b)無堿基核核苷酸切除修復(fù)
這種方式可以修復(fù)DNA發(fā)生的幾乎所有類型的巨大損傷,包括某些與致癌劑共價結(jié)合的堿基12/13/2022125核苷酸切除修復(fù)12/12/2022125受損傷的DNA在進行復(fù)制時,跳過損傷部位,在子代DNA鏈與損傷相對應(yīng)部位出現(xiàn)缺口。通過分子間重組,從完整的母鏈上將相應(yīng)的堿基順序片段移至子鏈的缺口處,然后再用合成的多核苷酸來補上母鏈的空缺,此過程即重復(fù)修復(fù)。并非完全校正。重組修復(fù)
12/13/2022126受損傷的DNA在進行復(fù)制時,跳過損傷部位,在子代DNA鏈與損4、SOS修復(fù)(緊急修復(fù))(errorpronerepair)細胞DNA損傷或復(fù)制系統(tǒng)受抑制,緊急情況誘導(dǎo)產(chǎn)生和增加切除修復(fù)和重組修復(fù)的關(guān)鍵E和蛋白質(zhì)加強修復(fù)能力誘導(dǎo)產(chǎn)生DNA聚合E(缺乏校對功能)隨機聚合核苷酸避免死亡,卻帶來高突變率的修復(fù)過程12/13/20221274、SOS修復(fù)(緊急修復(fù))(errorpronere六、RNA的生物合成(一)轉(zhuǎn)錄在DNA指導(dǎo)下的RNA合成12/13/2022128六、RNA的生物合成(一)轉(zhuǎn)錄在DNA指導(dǎo)下的RNA合成12不對稱轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)錄方式:轉(zhuǎn)錄過程中,DNA雙鏈只有一條鏈作為模板指導(dǎo)RNA的合成的轉(zhuǎn)錄方式模板鏈轉(zhuǎn)錄過程中指導(dǎo)RNA合成的DNA鏈。無意義鏈、負鏈與模板鏈對應(yīng)的DNA鏈——編碼鏈。有意義鏈、正鏈12/13/2022129不對稱轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)錄方式:轉(zhuǎn)錄過程中,DNA雙鏈只有一條鏈啟動子(promoter)終止子(terminator)模板鏈(templattestrand)有意義鏈(sensestrand)非信息區(qū)DNA5′5′3′3′12/13/2022130啟動子終止子(terminator)模板鏈有意義鏈非信(二)RNA聚合E1、原核生物RNA聚合E(α2ββ’σ)α:全酶滑動,決定哪些基因轉(zhuǎn)錄β:轉(zhuǎn)錄,催化核苷酸形成磷酸二酯鍵,延長RNAβ’:結(jié)合模板DNAб:識別轉(zhuǎn)錄起始位點轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物:mRNA、rRNA前體和tRNA前體12/13/2022131(二)RNA聚合E1、原核生物RNA聚合E(α2ββ’σ)2、真核生物RNA聚合E8~14個亞基組成,含Zn2+寡聚E,轉(zhuǎn)錄不同RNA12/13/20221322、真核生物RNA聚合E8~14個亞基組成,含Zn2+寡聚E(三)轉(zhuǎn)錄的模板模板DNA與轉(zhuǎn)錄有關(guān)的結(jié)構(gòu):模板DNA,由RNA聚合E識別、結(jié)合并確定轉(zhuǎn)錄起點的特定序列啟動子(promotor):終止子(terminator):模板DNA5’端的轉(zhuǎn)錄終止信號12/13/2022133(三)轉(zhuǎn)錄的模板模板DNA與轉(zhuǎn)錄有關(guān)的結(jié)構(gòu):模板DNA,由R1、原核生物的啟動子40~60bp12/13/20221341、原核生物的啟動子40~60bp12/12/20221342、原核生物轉(zhuǎn)錄終止類型1)不依賴ρ因子的終止:富含GC的反向重復(fù)轉(zhuǎn)錄的RNA,發(fā)夾轉(zhuǎn)錄終止含富GC的回文序列和寡聚U序列12/13/20221352、原核生物轉(zhuǎn)錄終止類型1)不依賴ρ因子的終止:富含GC的反2)依賴ρ因子的終止:模板終止信號連續(xù)6個U12/13/20221362)依賴ρ因子的終止:模板終止信號連續(xù)6個U12/12/2012/13/202213712/12/20221371960年,RNA聚合酶被發(fā)現(xiàn)E.coli,RNA聚合酶催化RNA的合成需要:模板:雙鏈或單鏈DNA活性單體物質(zhì):四種NTP二價金屬離子:Mg2+或Mn2+,在生物體中(invivo)發(fā)現(xiàn)的是Mg2+合成方向:5’→3’12/13/20221381960年,RNA聚合酶被發(fā)現(xiàn)12/12/2022138RNA的合成與DNA合成的區(qū)別轉(zhuǎn)錄不需要引物只轉(zhuǎn)錄DNA分子中的一個片段(操縱子operon)雙鏈DNA只有一條鏈具有轉(zhuǎn)錄活性(模板鏈)RNA聚合酶無校對功能12/13/2022139RNA的合成與DNA合成的區(qū)別轉(zhuǎn)錄不需要引物12/12/20啟動子(promoter)終止子(terminator)模板鏈(templattestrand)反意義鏈(antisensestrand)有意義鏈(sensestrand)非信息區(qū)DNA5′5′3′3′
模板鏈:雙鏈DNA中具有轉(zhuǎn)錄活性的的鏈——模板鏈,反義鏈(或負鏈)
編碼鏈:雙鏈DNA中無轉(zhuǎn)錄活性的鏈——編碼鏈,有義鏈(或正鏈)。DNA的有義鏈和反義鏈12/13/2022140啟動子(promoter)終止子(由5種亞基α2ββ’σ組成全酶;沒有σ、亞基的酶稱為核心酶,只催化鏈的延長;σ稱為起始因子,能識別DNA鏈的轉(zhuǎn)錄起始信號(稱為啟動子)E.Coli中的RNA聚合酶12/13/2022141由5種亞基α2ββ’σ組成全酶;沒有σ、亞基的酶稱為核心(四)RNA轉(zhuǎn)錄過程(E.coli)1、轉(zhuǎn)錄的起始:б因子識別啟動子酶與模板結(jié)合,DNA局部解鏈啟動RNA的合成б因子脫落,核心酶滑動12/13/2022142(四)RNA轉(zhuǎn)錄過程(E.coli)1、轉(zhuǎn)錄的起始:б因子識RNA轉(zhuǎn)錄起始12/13/2022143RNA轉(zhuǎn)錄起始12/12/2022143解螺旋恢復(fù)螺旋轉(zhuǎn)錄泡模板鏈編碼鏈RNA聚合酶作用示意圖12/13/2022144解螺旋恢復(fù)螺旋轉(zhuǎn)錄泡模板鏈編碼鏈RNA聚合酶作用示意圖12/2、轉(zhuǎn)錄的延伸:核心酶沿模板3’–5’滑動根據(jù)模板指令選擇相應(yīng)的NTP加入RNA鏈沿5’–3’方向延伸12/13/20221452、轉(zhuǎn)錄的延伸:核心酶沿模板3’–5’滑動12/12/20核心酶沿模板3’→5’滑行至終止信號區(qū)域,轉(zhuǎn)錄終止3、轉(zhuǎn)錄的終止:12/13/2022146核心酶沿模板3’→5’滑行至終止信號區(qū)域,轉(zhuǎn)錄終止3、轉(zhuǎn)錄的12/13/202214712/12/2022147(五)DNA復(fù)制與RNA轉(zhuǎn)錄的異同點12/13/2022148(五)DNA復(fù)制與RNA轉(zhuǎn)錄的異同點12/12/202214(六)轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的加工1、真核生物mRNA的轉(zhuǎn)錄后加工原核生物:不需加工12/13/2022149(六)轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的加工1、真核生物mRNA的轉(zhuǎn)錄后加工原核生物hnRNA:mRNA前體,外顯子、內(nèi)含子分子量大而不均一——核不均一RNA。內(nèi)含子:真核基因內(nèi)部間隔外顯子,并從mRNA上消失的DNA序列外顯子:真核基因中在mRNA上出現(xiàn),編碼蛋白質(zhì)的DNA序列12/13/2022150hnRNA:mRNA前體,外顯子、內(nèi)含子12/12/2022內(nèi)含子外顯子真核mRNA前體的加工12/13/2022151內(nèi)含子外顯子真核mRNA前體的加工12/12/20221512、tRNA前體的加工數(shù)十種tRNA加工不同1)切除5’、3’末端部分核苷酸2)3’末端加上CCA-OH序列3)核苷的修飾:甲基化12/13/20221522、tRNA前體的加工數(shù)十種tRNA加工不同1)切除5’、33、rRNA前體的加工12/13/20221533、rRNA前體的加工12/12/2022153原核生物rRNA轉(zhuǎn)錄前體的加工甲基化核酸內(nèi)切酶核酸外切酶12/13/2022154原核生物rRNA轉(zhuǎn)錄前體的加工甲基化核酸內(nèi)切酶核酸外切酶12真核生物rRNA轉(zhuǎn)錄前體的加工核酸外切酶甲基化核酸內(nèi)切酶和外切酶12/13/2022155真核生物rRNA轉(zhuǎn)錄前體的加工核酸外切酶甲基化核酸內(nèi)切酶和外基因工程簡介END12/13/2022156基因工程簡介END12/12/2022156(1)hnRNA被剪接,把內(nèi)含子(DNA上非編碼序列)轉(zhuǎn)錄序列剪掉,把外顯子(DNA上的編碼序列)轉(zhuǎn)錄序列)拼接上,真核生物一般為不連續(xù)基因。(2)3’端添加polyA“尾巴”;(3)5’端連接“帽子”結(jié)構(gòu)(m7G5ppp5NmpNp-);(4)分子內(nèi)部的核苷酸甲基化修飾。真核mRNA前體的加工12/13/2022157(1)hnRNA被剪接,把內(nèi)含子(DNA上非編碼序列)轉(zhuǎn)錄序內(nèi)含子外顯子真核mRNA前體的加工12/13/2022158內(nèi)含子外顯子真核mRNA前體的加工12/12/2022158因發(fā)現(xiàn)斷裂基因而獲1993年諾貝爾生理學獎的RichardJRobertandPhllipASharp12/13/2022159因發(fā)現(xiàn)斷裂基因而獲1993年諾貝爾生理學獎的Richard
概念:RNA病毒以自身RNA為模板合成與自身RNA完全相同RNA分子的過程稱為RNA的復(fù)制。(二)RNA指導(dǎo)的RNA合成(RNA復(fù)制)12/13/2022160概念:RNA病毒以自身RNA為模板合成與自身RNA完全相同(2)復(fù)制酶的β亞基與來自宿主細胞的亞基αδ自動裝配成RNA復(fù)制酶,進行RNA復(fù)制,通常以分子中單鏈RNA為模板(正鏈),復(fù)制出一條新的RNA鏈(負鏈),然后以負鏈為模板復(fù)制出大量正鏈,再與外殼蛋白組裝成新的噬菌體顆粒。兩個階段:(1)病毒RNA可充當mRNA,利用寄主中的核糖體合成外殼蛋白和復(fù)制酶的β亞基。12/13/2022161(2)復(fù)制酶的β亞基與來自宿主細胞的亞基αδ自兩個階段:RNA復(fù)制酶的催化性質(zhì):
以四種NTP為底物;專一性地選擇病毒RNA為模板;按5’→3’的方向合成病毒RNA;無外切酶活性(即無校對功能)。12/13/2022162RNA復(fù)制酶的催化性質(zhì):以四種NTP為底物;12/12/病毒RNA的復(fù)制方式1、病毒含正鏈RNA:進入宿主細胞后先進行病毒RNA復(fù)制酶和有關(guān)病毒蛋白質(zhì)的合成(借助于宿主細胞的蛋白質(zhì)合成體系),然后進行RNA的復(fù)制,再裝配病毒顆粒。如:噬菌體Qβ和灰質(zhì)炎病毒。2、病毒含負鏈RNA和復(fù)制酶:這類病毒進入宿主細胞后,先進行RNA的復(fù)制合成正鏈RNA,再以正鏈RNA為模板合成病毒蛋白質(zhì)RNA,然后裝配病毒顆粒。如:狂犬病病毒、馬水苞性口炎病毒。3、病毒含雙鏈RNA和復(fù)制酶:這類病毒進入宿主細胞后,以雙鏈RNA為模板,通過不對稱復(fù)制產(chǎn)生正鏈RNA,并以正鏈RNA為模板合成病毒蛋白質(zhì),然后再合成負鏈RNA并形成雙鏈RNA,再裝配病毒顆粒。如呼腸病毒。4、致癌RNA病毒:12/13/2022163病毒RNA的復(fù)制方式1、病毒含正鏈RNA:進入宿主細胞后先進七、核酸生物合成與病毒致癌核酸生物合成的一般規(guī)則絕大多數(shù)細胞DNA和RNA的合成,都是按照Watson-Crick堿基互補的原則,通過拷貝預(yù)先存在的DNA鏈(模板鏈)來產(chǎn)生的。核酸鏈的合成方向只有一個:5‘?3‘。特異的聚合酶催化合成DNA或RNA。致癌的DNA與RNA病毒的繁殖與致癌作用是核酸生物合成的具體化。12/13/2022164七、核酸生物合成與病毒致癌核酸生物合成的一般規(guī)則絕大多數(shù)細胞
正常細胞受到DNA腫瘤病毒感染后,發(fā)生染色體變異、永久性的形態(tài)改變、失去接觸抑制、增殖加速、產(chǎn)生新的抗原從而具有形成腫瘤的能力。DNA病毒吸附于宿主的細胞膜而進入細胞后,在細胞膜處脫去核殼蛋白,DNA進入細胞核中。其一部分或全部可整合于宿主細胞核的DNA分子中,形成變異的DNA。整合后的DNA可以完整分子的形式一起復(fù)制,轉(zhuǎn)錄。它使宿主細胞發(fā)生某些特征性改變,最終轉(zhuǎn)化成腫瘤細胞。DNA病毒12/13/2022165正常細胞受到DNA腫瘤病毒感染后,發(fā)生染色體變異、永久性的RNA病毒不含DNA,絕大多數(shù)病毒RNA是單鏈的,而且都是線狀分子。RNA病毒中,RNA是其遺傳信息的攜帶者,通過RNA的復(fù)制,傳遞遺傳信息。通常病毒RNA復(fù)制過程包括:基因組RNA轉(zhuǎn)錄為mRNA,mRNA翻譯為病毒特異性蛋白質(zhì),基因組RNA復(fù)制和病毒裝配與釋放。病毒mRNA的合成在病毒復(fù)制過程中處于核心地位。根據(jù)病毒粒子的RNA和指導(dǎo)病毒蛋白質(zhì)合成的mRNA之間關(guān)系,把RNA病毒分為:正鏈RNA病毒、負鏈RNA病毒、雙鏈RNA病毒、逆轉(zhuǎn)錄病毒。RNA病毒12/13/2022166RNA病毒不含DNA,絕大多數(shù)病毒RNA是單鏈的,而且都是線RNA病毒粒子中存在有反轉(zhuǎn)錄酶,在其催化下,可以病毒RNA為模板合成DNA。此外,RNA腫瘤病毒在具有一定致癌作用的酶的催化下,可將致癌信息整合到宿主細胞染色體的DNA分子中去,完成致癌過程。病毒RNA不能直接復(fù)制RNA,須先經(jīng)反轉(zhuǎn)錄酶將RNA的遺傳信息轉(zhuǎn)至DNA形成DNA前病毒,然后再在DNA指導(dǎo)的RNA聚合酶的作用下,完成RNA病毒核酸的轉(zhuǎn)錄。12/13/2022167RNA病毒粒子中存在有反轉(zhuǎn)錄酶,在其催化下,可以病毒RNA左圖是一些病毒的例子:12/13/2022168左圖是一些病毒的例子:12/12/2022168八、核酸生物合成的抑制劑
不少藥物對核酸的合成有抑制作用,或通過抑制核苷酸的合成,間接影響核酸合成,或抑制核酸合成。核酸合成受抑制,也將影響蛋白質(zhì)的合成。12/13/2022169八、核酸生物合成的抑制劑不少藥物對核酸的合成有抑制一些在結(jié)構(gòu)上與核苷酸合成代謝的中間產(chǎn)物或參與者相似的化合物,即所謂的“抗代謝物”,對于正常的核苷酸合成有對抗作用。1)氨基酸類似物,如谷氨酰胺的類似物氮雜絲氨酸,6-重氮基-5-氧正亮氨酸。2)葉酸類似物,如四氫葉酸(FH4)類似物氨呤及氨甲基蝶呤。3)嘌呤、嘧啶類似物,如6-巰基嘌呤、5-氟尿嘧啶等。核苷酸合成的抑制劑12/13/2022170一些在結(jié)構(gòu)上與核苷酸合成代謝的中間產(chǎn)物或參與者相似的
有一些化合物由于能夠與DNA結(jié)合,使DNA失去模板功能,從而抑制其復(fù)制與轉(zhuǎn)錄。某些重要的抗癌藥和抗病毒藥就屬于這一類。1)硫芥、氮芥等烷化劑能干擾DNA的復(fù)制。2)絲裂霉素G,能專一地抑制DNA復(fù)制,但不影響RNA和蛋白質(zhì)合成。3)放線菌素D,低濃度就可有效地抑制DNA轉(zhuǎn)錄功能,高濃度能抑制DNA復(fù)制功能。DNA模板功能的抑制物12/13/2022171有一些化合物由于能夠與DNA結(jié)合,使DNA失去模板功能利福霉素及利福平不作用于DNA,而是抑制細菌的RNA聚合酶和反轉(zhuǎn)錄酶。膦羧基乙酸主要抑制病毒的DNA聚合酶,實驗證明,它在低濃度時就可選擇性地抑制病毒DNA合成,而對宿主細胞須在較高濃度時才有一定的抑制作用。核酸聚合酶的抑制物12/13/2022172利福霉素及利福平不作用于DNA,而是抑制細菌的RNA聚合酶和生物化學實驗氨基酸的紙層析常用的層析方法:紙層析柱層析薄板層析吸附層析分配層析離子交換層析12/13/2022173生物化學實驗氨基酸的紙層析常用的層析方法:紙層析吸Rf遷移率移動速率原點到層析點中心的距離原點到溶劑前沿的距離Gly、Phe、His水:固定相有機溶劑:流動相12/13/2022174Rf遷移率原點到層析點中心的距離原點到溶劑前沿的距離Gly、12/13/202217512/12/2022175瓊脂糖凝膠電泳分離血清脂蛋白瓊脂糖濃度:0.5%凝膠厚度:1.5~2mm影響蛋白遷移速度主要因素:蛋白質(zhì)等電點溶液pH值溶液離子強度電場強度12/13/2022176瓊脂糖凝膠電泳分離血清脂蛋白瓊脂糖濃度:0.5%影響蛋白+-前ααβ1β2β3β乳糜微粒12/13/2022177+-前ααβ1β2β3β乳糜微粒12/12/2022177蛋白質(zhì)固定:變性,易于染色溶液pH>pI:蛋白質(zhì)帶負電荷,向陽極移動溶液pH<pI:蛋白質(zhì)帶正電荷,向陰極移動如果電泳緩沖體系的pH>被分離蛋白pI點樣處靠近陰極12/13/2022178蛋白質(zhì)固定:變性,易于染色溶液pH>pI:蛋白質(zhì)帶負電荷,醋酸纖維薄膜電泳:電荷效應(yīng)聚丙烯酰胺凝膠電泳:濃縮效應(yīng)分子篩效應(yīng)電荷效應(yīng)瓊脂糖凝膠電泳:電荷效應(yīng)濃縮效應(yīng)12/13/2022179醋酸纖維薄膜電泳:電荷效應(yīng)聚丙烯酰胺凝膠電泳:濃縮效應(yīng)瓊脂小麥萌發(fā)前后淀粉酶活力的比較酶的分離純化:提取溫度0~10℃(低溫)淀粉酶活力測定溫度:終止淀粉水解:酶的活力單位:指在一定的條件下,底物的減少量或產(chǎn)物的增加量12/13/2022180小麥萌發(fā)前后淀粉酶活力的比較酶的分離純化:提取溫度0~10℃CTAB分離緩沖液DNA的提取和含量測定Tris-HCINaClEDTACTAB巰基乙醇測定核酸含量的方法紫外吸收法二苯胺法定磷法12/13/2022181CTAB分離緩沖液DNA的提取和含量測定Tris-HCIDNA:水、高濃度鹽中溶解性大,低鹽(0.14M)溶解度低RNA:高鹽溶解性小。沉淀DNA:異丙醇、乙醇等有機溶劑12/13/2022182DNA:水、高濃度鹽中溶解性大,低鹽(0.14M)溶解沉淀D核酸測定:OD260/OD280RNA:>2.0物質(zhì)內(nèi)含雜蛋白較多時,OD260/OD280下降DNA:1.8蛋白質(zhì):1.8(OD280/OD260)12/13/2022183核酸測定:OD260/OD280RNA:>2.0物質(zhì)內(nèi)含VC的測定氧化型2,6-二氯酚靛酚在酸性溶液中呈紅色堿性溶液中呈藍色微量滴定管:滴定管與貯液管,無氣泡或氣柱2.6-二氯酚靛酚法:測定還原性Vc12/13/2022184VC的測定氧化型2,6-二氯酚靛酚在酸性溶液中呈紅色微量滴定測定蛋白質(zhì)的方法雙縮脲法Folin-酚法紫外吸收法凱氏定氮法考馬斯亮藍法蛋白質(zhì)+考馬斯亮藍G-250→蛋白色素復(fù)合物最大光吸收波長:595nm12/13/2022185測定蛋白質(zhì)的方法雙縮脲法蛋白質(zhì)+考馬斯亮藍G-250→蛋白紫外分光光度計光源:氫、氘燈可見光分光光度計光源:鎢燈玻璃比色杯石英比色杯摩爾消光系數(shù)ε:A=εLCL=1cm,C=1mol/L,在一定波長下的吸光度(光吸收值)共軛雙鍵離心機:配平12/13/2022186紫外分光光度計光源:氫、氘燈可見光分光光度計光源:鎢燈玻璃比第十章核苷酸代謝及核酸的生物合成12/13/2022187第十章核苷酸代謝及核酸的生物合成12/12/20221一、核酸的酶促降解1、核酸水解:DNA穩(wěn)定,耐酸堿RNA易水解:堿水解2、酶促水解:1)降解方式12/13/2022188一、核酸的酶促降解1、核酸水解:DNA穩(wěn)定,耐酸堿2、酶促RNA:RNase(穩(wěn)定、耐高溫)DNA:DNase(種類多、工具酶)2)核酸E(1)底物:12/13/2022189RNA:RNase(穩(wěn)定、耐高溫)DNA:DNase(種(2)作用方式:核酸外切E:核酸鏈的一端逐個水解下核苷酸的酶(非特異性)3’-核酸外切E:蛇毒磷酸二酯E3’-OH端開始,生成5’-核苷酸5’-核酸外切E:牛脾磷酸二酯E5’-OH端開始,生成3’-核苷酸12/13/2022190(2)作用方式:核酸外切E:3’-核酸外切E:5’-核酸外特異水解分子內(nèi)磷酸二酯鍵的酶(特異性強)核酸內(nèi)切E牛胰核糖核酸酶:嘧啶核苷3’-磷酸與相鄰核苷酸的3’,5’-磷酸二酯鍵12/13/2022191特異水解分子內(nèi)磷酸二酯鍵的酶(特異性強)核酸內(nèi)切E牛胰核12/13/202219212/12/20226限制性核酸內(nèi)切酶(Restrictionendonuclease)識別雙鏈DNA分子中特定核苷酸序列,并由此切割DNA雙鏈的核酸內(nèi)切酶能識別水解外源雙鏈DNA的核酸內(nèi)切酶(細菌)細菌本身DNA,順序已被甲基化,不被水解僅限于水解外源DNA以保護自身——限制性酶12/13/2022193限制性核酸內(nèi)切酶(Restrictionendonucle限制酶:內(nèi)切方式水解DNA產(chǎn)物:5’為P,3’為OH特點:極高的專一性(對特定核苷酸順序?qū)R恍裕菈A基專一)對底物DNA有特異的識別位點位點一般在4~8bp,通常具回文結(jié)構(gòu)切割后形成粘性末端(或平齊末端)12/13/2022194限制酶:內(nèi)切方式水解DNA產(chǎn)物:5’為P,3’為OH特點:1回文結(jié)構(gòu):DNA局部雙螺旋以某一對稱軸旋轉(zhuǎn)180°后,與另一側(cè)的互補片段的順序完全相同的DNA結(jié)構(gòu)粘性末端:雙鏈DNA分子經(jīng)限制性E作用后,每條單鏈的一端帶有識別順序中幾個互補堿基,這樣的末端稱~12/13/2022195回文結(jié)構(gòu):DNA局部雙螺旋以某一對稱軸旋轉(zhuǎn)180°后,與另粘(3)核酸的酶促降解12/13/2022196(3)核酸的酶促降解12/12/202210核酸核苷堿基降解核苷酸Pi戊糖12/13/2022197核酸核苷堿基降解核苷酸Pi戊糖12/12/202211(5)核苷酸生理功能:1)合成核酸的原料:ATP,GTP,CTP,UTP→RNAdATP,dGTP,dCTP,dTTP→DNA2)能量的貯存和供應(yīng):ATP,GTP,UTP,CTP等3)參與代謝、調(diào)節(jié)生理活動:cAMP、cGMP:激素的第二信使4)構(gòu)成酶的輔酶或輔基:NAD+,NADP+,F(xiàn)AD,F(xiàn)MN,CoA:含核苷酸5)代謝中間物的載體:UDP-糖基,CDP-膽堿、膽胺、甘油二酯,腺苷-蛋氨酸12/13/2022198(5)核苷酸生理功能:1)合成核酸的原料:2)能量的貯存和供二、核苷酸的降解12/13/2022199二、核苷酸的降解12/12/2022131、嘌呤的降解12/13/20222001、嘌呤的降解12/12/202214次黃嘌呤尿素NH3+CO2GRNH2(微生物)黃嘌呤尿酸尿囊素鳥類12/13/2022201次黃嘌呤尿素NH3+CO2GR(微生物)黃嘌呤尿酸尿尿酸:人體分解代謝的終產(chǎn)物痛風癥:嘌呤核苷酸分解代謝異常血中尿酸水平升高
尿酸鈉晶體沉積,軟骨、關(guān)節(jié)、軟組織、腎臟臨床:皮下結(jié)節(jié),關(guān)節(jié)疼痛等12/13/2022202尿酸:人體分解代謝的終產(chǎn)物12/12/2022162、嘧啶的降解12/13/20222032、嘧啶的降解12/12/202217NH2二氫尿嘧啶還原H2O(開環(huán))Β-脲基丙酸H2OΒ-丙AA12/13/2022204NH2二氫尿嘧啶還原H2O(開環(huán))Β-脲基丙酸H2OΒ-丙A三、核苷酸的合成代謝原料:氨基酸、甲酸鹽和CO2等從頭合成(devovosynthesis)利用核酸降解的中間產(chǎn)物或外源的核苷,嘌呤堿和嘧啶堿合成新的核苷酸補救途徑(salvagepathway)12/13/2022205三、核苷酸的合成代謝原料:氨基酸、甲酸鹽和CO2等從頭合成嘌呤、嘧啶基本途徑從頭合成肝半合成(補救合成)腦、骨髓12/13/2022206嘌呤、嘧啶基本途徑從頭合成半合成(補救合成)12/12/20核糖核苷酸的合成12/13/2022207核糖核苷酸的合成12/12/202221核苷酸合成的兩條途徑核糖、氨基酸、CO2、NH3核糖核苷酸脫氧核苷酸輔酶RNA核苷堿基脫氧核苷DNA補救途徑從頭合成肝半合成腦、骨髓12/13/2022208核苷酸合成的兩條途徑核糖、氨基酸、CO2、NH3核糖核苷酸脫(一)嘌呤核苷酸的從頭合成1、嘌呤核苷酸環(huán)上原子來源NNC123547689CO2Asp一碳單位Gln甘氨酸一碳單位N5,N10-次甲基四氫葉酸12/13/2022209(一)嘌呤核苷酸的從頭合成1、嘌呤核苷酸環(huán)上原子來源NNC1一碳單位一碳單位12/13/2022210一碳單位一碳單位12/12/2022242、合成特點合成部位:胞漿主要器官:肝臟;其次,小腸和胸腺腦和骨髓不能合成5-磷酸核糖→IMP(次黃苷酸)→AMP、GMP
12/13/20222112、合成特點合成部位:胞漿12/12/202225IMP合成:
5-P-核糖+ATP→PRPP(5-磷酸核糖焦磷酸)逐漸加上嘌呤的各個原子先形成右環(huán),再左環(huán)(共11步反應(yīng))四氫葉酸(FH4):一碳單位的載體12/13/2022212IMP合成:12/12/20222612/13/202221312/12/202227IMP的合成12/13/2022214IMP的合成12/12/2022283、嘌呤核苷酸的相互轉(zhuǎn)化黃苷單磷酸腺苷單磷酸鳥苷單磷酸次黃苷酸12/13/20222153、嘌呤核苷酸的相互轉(zhuǎn)化黃苷單磷酸腺苷單磷酸鳥苷單磷酸次黃苷NMP+ATPNDP+ADPNDP+ATPNTP+ADP磷酸激酶N:嘌呤或嘧啶堿基12/13/2022216NMP+ATPNDP+ADPNDP+ATPNTP+ADP磷酸
嘌呤類似物(6-巰基嘌呤):
抑制AMP、GMP的生成
谷胺酰胺類似物(氮雜絲氨酸):
抑制IMP的合成中有谷胺酰胺參與的反應(yīng)
葉酸類似物(氨基蝶呤、氨甲喋呤):
抑制IMP合成中有四氫葉酸參與的反應(yīng)4、臨床抗癌藥物的作用機理12/13/2022217嘌呤類似物(6-巰基嘌呤):4、臨床抗癌藥物的作用機理12氨甲酰磷酸天冬氨酸(二)嘧啶類核苷酸的從頭合成1、嘧啶環(huán)上原子來源前體:氨甲酰磷酸和天冬氨酸12/13/2022218氨甲酰磷酸天冬氨酸(二)嘧啶類核苷酸的從頭合成1、嘧啶環(huán)上原合成場所:胞漿(肝細胞)氨甲酰磷酸+天冬氨酸→嘧啶環(huán)+PRPP→UMP關(guān)鍵中間產(chǎn)物:乳清酸胞苷酸:尿苷酸轉(zhuǎn)變2、合成特點12/13/2022219合成場所:胞漿(肝細胞)2、合成特點12/12/2022312/13/202222012/12/20223412/13/202222112/12/20223512/13/202222212/12/2022363、嘧啶核苷酸的合成與相互轉(zhuǎn)變12/13/20222233、嘧啶核苷酸的合成與相互轉(zhuǎn)變12/12/202237除脫氧胸苷酸,大多數(shù)合成是在NDP的基礎(chǔ)上進行(三)脫氧核糖核苷酸的合成1、核糖核苷酸的還原12/13/2022224除脫氧胸苷酸,大多數(shù)合成是在NDP的基礎(chǔ)上進行(三)脫氧核糖2、dTMP的合成12/13/20222252、dTMP的合成12/12/202239(四)NMP→NDP、NTP生物合成和能量轉(zhuǎn)換中,核苷酸的活潑形式是NDP和NTP12/13/2022226(四)NMP→NDP、NTP生物合成和能量轉(zhuǎn)換中,核苷酸的活12/13/202222712/12/202241脫氧胸苷酸的合成12/13/2022228脫氧胸苷酸的合成12/12/202242氟尿嘧啶(FU)氨基蝶呤氨甲蝶呤胸苷酸合成的抗代謝物作用機理12/13/2022229氟尿嘧啶(FU)氨基蝶呤胸苷酸合成的抗代謝物作用機理12/15-氟尿嘧啶氨甲蝶呤嘧啶類抗代謝物結(jié)構(gòu)12/13/20222305-氟尿嘧啶氨甲蝶呤嘧啶類抗代謝物結(jié)構(gòu)12/12/20224各種核苷酸合成的相互關(guān)系12/13/2022231各種核苷酸合成的相互關(guān)系12/12/202245磷酸核糖轉(zhuǎn)移酶途徑:主要途徑嘌呤+PRPP嘌呤核苷酸+PPi(四)嘌呤核苷酸合成的補救途徑12/13/2022232磷酸核糖轉(zhuǎn)移酶途徑:主要途徑(四)嘌呤核苷酸合成的補救途徑12/13/202223312/12/202247磷酸核糖轉(zhuǎn)移酶缺乏與Lesch-Nyhan綜合癥HGPRT(次黃嘌呤-尿嘌呤磷酸核糖轉(zhuǎn)移酶)缺乏2~3歲,患兒,咬手指和嘴唇,智力缺陷,常痙攣,痛風,活20歲左右不能進行補救途徑,從頭合成速度加快尿酸積累結(jié)石,痛風自殘(?)12/13/2022234磷酸核糖轉(zhuǎn)移酶缺乏與Lesch-Nyhan綜合癥12/12/(五)嘧啶核苷酸合成的補救途徑12/13/2022235(五)嘧啶核苷酸合成的補救途徑12/12/202249四.DNA生物合成(一)分子遺傳的中心法則
DNA是遺傳信息的儲存和發(fā)布者,在遺傳信息的傳遞中處于中心地位1958年,Crick,“中心法則”(Centraldogma)12/13/2022236四.DNA生物合成(一)分子遺傳的中心法則生物的遺傳信息以密碼的形式貯存在DNA分子上(特定的核苷酸排列順序)細胞分裂,DNA復(fù)制,遺傳信息→子代細胞。子代細胞生長發(fā)育遺傳信息(轉(zhuǎn)錄)→RNA→氨基酸順序(翻譯)蛋白質(zhì)執(zhí)行多樣的生物學功能后代表現(xiàn)出與親代極為相似的遺傳特征12/13/2022237生物的遺傳信息以密碼的形式貯存在DNA分子上12/12/2012/13/202223812/12/202252復(fù)制Replication:
以DNA雙鏈為模板,按照堿基配對原則,合成出與親代DNA分子相同的兩個雙鏈DNA分子的過程基本概念轉(zhuǎn)錄(Transcription):
以DNA為模板,按照堿基配對原則,合成出一條與模板DNA鏈互補的RNA分子的過程12/13/2022239復(fù)制Replication:基本概念轉(zhuǎn)錄(Transcr逆轉(zhuǎn)錄(ReverseTranscription):以mRNA為模板,在逆轉(zhuǎn)錄酶的作用下合成DNA的過程翻譯(Translation):以mRNA為模板,合成出具有特定AA順序的Pr肽鏈的過程12/13/2022240逆轉(zhuǎn)錄(ReverseTranscription):翻譯(中心法則(CentralDogma):說明DNA、RNA和蛋白質(zhì)之間信息傳遞關(guān)系的法則即:遺傳信息:決定生物結(jié)構(gòu)、性狀和代謝類型的特殊的生物指令12/13/2022241中心法則(CentralDogma):遺傳信息:12/12(二)DNA的復(fù)制1、DNA生物合成的機理12/13/2022242(二)DNA的復(fù)制1、DNA生物合成的機理12/12/2022、DNA復(fù)制的基本規(guī)律1)半保留復(fù)制(semi-conservativeReplication)DNA復(fù)制過程中,新形成的DNA分子的一條鏈來自親代DNA,另一條鏈是新合成的,這種復(fù)制方式~生物學意義:生物的遺傳特性,保持相對穩(wěn)定性12/13/20222432、DNA復(fù)制的基本規(guī)律1)半保留復(fù)制(semi-co12/13/202224412/12/20225812/13/202224512/12/2022592)復(fù)制的多模式
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