westernblot原理及操作流程課件_第1頁
westernblot原理及操作流程課件_第2頁
westernblot原理及操作流程課件_第3頁
westernblot原理及操作流程課件_第4頁
westernblot原理及操作流程課件_第5頁
已閱讀5頁,還剩45頁未讀, 繼續(xù)免費閱讀

下載本文檔

版權(quán)說明:本文檔由用戶提供并上傳,收益歸屬內(nèi)容提供方,若內(nèi)容存在侵權(quán),請進行舉報或認領

文檔簡介

2011-5-7WB實驗技術及常見問題分析2011-5-7WB實驗技術及常見問題分析1Westernblot定義

WesternBlot中文一般稱為蛋白質(zhì)印跡通過聚丙烯酰胺電泳根據(jù)分子量大小分離蛋白后轉(zhuǎn)移到雜交膜上分離的蛋白可以通過一抗/二抗復合物進行檢測是蛋白質(zhì)分析的最流行的技術之一Westernblot定義WesternBlo2WesternBlot操作流程蛋白樣品的制備(蛋白抽提、定量)SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDS凝膠制備、上樣)轉(zhuǎn)膜封閉一抗雜交二抗雜交底物顯色WesternBlot操作流程蛋白樣品的制備轉(zhuǎn)膜3水溶液提取法針對水、稀鹽、稀酸或堿溶液中的蛋白質(zhì)。稀鹽和緩沖系統(tǒng)的水溶液對蛋白質(zhì)穩(wěn)定性好、溶解度大、是提取蛋白質(zhì)最常用的溶劑。細胞裂解液:50mmol/LTris-HCl,150mmol/LNacl,5mmol/LEDTA,1%NP40,0.05%PMSF,2μg/mLAprotinin,0.5μg/mLLeupeptin,pH8.0有機溶劑提取法對于分子中非極性側(cè)鏈較多的蛋白質(zhì)可用有機溶劑提取,包括乙醇、丙酮和丁醇等。一、蛋白樣品的制備水溶液提取法一、蛋白樣品的制備4二、蛋白樣品的定量(Bradford法)原理—考馬斯亮藍G-250有紅、藍兩種不同顏色的形式,在一定濃度的乙醇和酸性條件下,可配成淡紅色的溶液,與蛋白結(jié)合后形成藍色化合物,該化合物在595nm處有最大吸收值,化合物顏色深淺與蛋白的濃度高低成正比。制作標準曲線(插入表格)檢測樣品蛋白含量:取一管考馬斯亮藍+95l0.15mol/LNaClNaCl溶液+5l待測蛋白樣品,混勻后靜置2min,倒入比色杯中測試。二、蛋白樣品的定量(Bradford法)原理—考馬斯亮藍G5

20-30ug

細胞/組織裂解物

100ng

純化蛋白根據(jù)蛋白表達豐度調(diào)整適當?shù)牡鞍咨蠘恿可蠘恿恳恢拢好靠咨蠘恿勘3忠恢律蠘忧坝胠oadingbuffer加熱變性樣本三、SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳20-30ug細胞/組織裂解物三、SDS-聚丙烯酰胺凝6Anode-內(nèi)槽緩沖液帶有負電荷,與凝膠頂部接觸外槽中緩沖液帶有正電荷,與凝膠底部接觸Cathode+帶有負電荷的蛋白質(zhì)從上到下運動(負極到正極),分開電泳進程可以根據(jù)前沿指示劑來確定,等其跑到底部上面1cm左右即可停止電泳小分子量蛋白跑的比較快.蛋白根據(jù)分子量大小分開蛋白質(zhì)帶有負電荷,因此電泳時可以從負極向正極移動標本加入到上樣孔中Anode-外槽中緩沖液帶有正電荷,與凝膠底部接觸Cath7westernblot原理及操作流程課件8四、WesternBlot轉(zhuǎn)膜

分離的蛋白通過電轉(zhuǎn)膜方式從凝膠中轉(zhuǎn)移到雜交膜上(PVDF或NC膜)PVDF膜:價格較貴,可重復使用,特別適合蛋白印跡,結(jié)合能力較強,但價格比較昂貴。NC膜(硝酸纖維素膜):價格比較便宜,應用較廣,結(jié)合牢固性差一些,韌性也不如PVDF,不能重復使用,但蛋白吸附容量高,親水性較好。四、WesternBlot轉(zhuǎn)膜分離的蛋白通過電轉(zhuǎn)膜9五、封閉脫脂奶粉(含5%脫脂奶粉的TBST緩沖液)BSAWesternBlot膜封閉液(生物試劑公司提供)五、封閉脫脂奶粉(含5%脫脂奶粉的TBST緩沖液)10六、一抗、二抗孵育把NC膜放在密閉塑料袋或者培養(yǎng)皿中,加入一抗溶液與濾膜溫育,室溫小時或4℃過夜。倒掉一抗溶液,用PBS漂洗濾膜3次,每次10min。加入配制的二抗,搖床上緩慢搖動,室溫一小時或4℃過夜。倒掉二抗溶液,用PBS漂洗濾膜3次,每次10min。六、一抗、二抗孵育把NC膜放在密閉塑料袋或者培養(yǎng)皿中,加入一11七、二抗與底物反應顯色ECL化學發(fā)光顯色

比較常用,結(jié)果容易控制,但是被催化是靈敏度差一點DAB顯色

比較靈敏,是HRP最敏感的底物七、二抗與底物反應顯色ECL化學發(fā)光顯色12WesternBlot

需要的主要試劑WesternBlot需要的主要試劑13WB需要試劑-膜常用的有PVDF膜,硝酸纖維素膜或者尼龍膜WB需要試劑-膜常用的有PVDF膜,硝酸纖維素膜或者尼龍膜14WB需要試劑-封閉試劑BSA或者脫脂奶粉(光明脫脂奶粉)商業(yè)化的封閉試劑WB需要試劑-封閉試劑BSA或者脫脂奶粉(光明脫脂奶粉)15主要目的是確定靶蛋白的分子量大??;使用預染的Marker還可以實時檢測電泳分離情況,并可以轉(zhuǎn)移到膜上。WB需要試劑-蛋白質(zhì)MarkerPrestainedproteinladdersUnstainedproteinladdersFermentas主要目的是確定靶蛋白的分子量大小;使用預染的Marker還可16WB需要試劑-一抗選擇適合檢測標本種屬的一抗(說明書有驗證)選擇適用于WB實驗方法的一抗(說明書有驗證)選擇單克隆抗體或者經(jīng)過親和純化的多克隆抗體根據(jù)說明書推薦的濃度優(yōu)化最佳稀釋比例

Santacruz,Cellsignaling,Invitrogen,Sigma,Abcam,R&D,Abnova,Chemicon,Calbiochem,Millipore,BD,Cayman,Roche,eBioscience,etal.選擇合適的一抗:WB需要試劑-一抗選擇適合檢測標本種屬的一抗(說明書有驗證)17雜交需要試劑-二抗二抗選擇:根據(jù)一抗來源種屬以及抗體Ig亞型選擇合適的二抗。二抗的使用:根據(jù)說明書推薦濃度使用TBST稀釋二抗。如果說明書沒有推薦濃度,可進行多個稀釋比例進行摸索最佳稀釋度(1:1000-1:20000)。孵育條件一般為室溫1-2小時。

Santacruz,Cellsignaling,Invitrogen,Sigma,Abcam,R&D,Abnova,Chemicon,Calbiochem,Millipore,BD,Cayman,Roche,eBioscience,etal.雜交需要試劑-二抗二抗選擇:根據(jù)一抗來源種屬以及抗體Ig亞型18雜交需要試劑-底物顯色底物:操作簡單,靈敏度低,如TMB、DAB、BCIP/NBT化學發(fā)光底物:靈敏度高,需要曝光檢測設備(暗室、曝光設備和膠片)或者凝膠成像設備。雜交需要試劑-底物顯色底物:操作簡單,靈敏度低,如TMB、D19WB常見問題沒有信號高背景非特異性條帶條帶大小不對WB常見問題沒有信號20標本問題

標本中不含檢測蛋白:設置陽性對照上樣量不夠,或者蛋白表達豐度比較低:增加上樣量轉(zhuǎn)膜問題轉(zhuǎn)膜不完全:轉(zhuǎn)膜后使用麗春紅染色,確定目的大小蛋白條帶是否存在于膜上,使用蛋白質(zhì)Marker.洗滌過度:減少洗滌時間和次數(shù).封閉封閉過度:減少封閉試劑濃度,封閉時間,更換封閉試劑抗體孵育和檢測抗體濃度和時間孵育不夠:增加抗體濃度,延長孵育時間一抗不工作:設置陽性對照二抗不工作:和其他一抗配合檢測二抗是否工作一抗/二抗不匹配:檢查抗體的來源和亞型。正確選擇二抗底物失活:重新配制有效的底物沒有信號/弱信號標本問題沒有信號/弱信號21背景高封閉封閉時間不夠:延長封閉時間優(yōu)化封閉試劑的類型和濃度封閉試劑和抗體有交叉反應:更換封閉試劑.磷酸化抗體不能使用含有酪蛋白的封閉試劑:推薦BSA封閉抗體孵育和檢測一抗/二抗?jié)舛忍撸航档涂贵w濃度孵育溫度太高:建議4度孵育過夜其他洗膜不充分:5*3mins,多次短時間的洗膜曝光時間過長:縮短曝光時間出現(xiàn)干膜現(xiàn)象:保證膜充分浸透,避免出現(xiàn)干膜二抗非特異性:設置只加二抗對照背景高封閉22非特異性條帶標本制備二聚體或者多聚體:增加上樣前煮沸變性時間蛋白不同剪切體或者isoforms存在.蛋白降解:使用新鮮制備的標本,標本中加入新鮮配制的蛋白酶抑制劑上樣量過大:減少上樣量封閉Blocking封閉不充分:優(yōu)化封閉時間和封閉試劑濃度抗體孵育和檢測一抗/二抗?jié)舛冗^高:降低抗體濃度抗體沒有經(jīng)過純化二抗非特異性結(jié)合:使用二抗對照其他洗膜保證充分非特異性條帶標本制備23條帶大小不對標本制備二聚體/多聚體存在:使用還原變性電泳,除非說明書上有特殊說明多個亞型存在?(Isoforms)蛋白降解?蛋白修飾條帶大小不對標本制備24TheendTheend252011-5-7WB實驗技術及常見問題分析2011-5-7WB實驗技術及常見問題分析26Westernblot定義

WesternBlot中文一般稱為蛋白質(zhì)印跡通過聚丙烯酰胺電泳根據(jù)分子量大小分離蛋白后轉(zhuǎn)移到雜交膜上分離的蛋白可以通過一抗/二抗復合物進行檢測是蛋白質(zhì)分析的最流行的技術之一Westernblot定義WesternBlo27WesternBlot操作流程蛋白樣品的制備(蛋白抽提、定量)SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDS凝膠制備、上樣)轉(zhuǎn)膜封閉一抗雜交二抗雜交底物顯色WesternBlot操作流程蛋白樣品的制備轉(zhuǎn)膜28水溶液提取法針對水、稀鹽、稀酸或堿溶液中的蛋白質(zhì)。稀鹽和緩沖系統(tǒng)的水溶液對蛋白質(zhì)穩(wěn)定性好、溶解度大、是提取蛋白質(zhì)最常用的溶劑。細胞裂解液:50mmol/LTris-HCl,150mmol/LNacl,5mmol/LEDTA,1%NP40,0.05%PMSF,2μg/mLAprotinin,0.5μg/mLLeupeptin,pH8.0有機溶劑提取法對于分子中非極性側(cè)鏈較多的蛋白質(zhì)可用有機溶劑提取,包括乙醇、丙酮和丁醇等。一、蛋白樣品的制備水溶液提取法一、蛋白樣品的制備29二、蛋白樣品的定量(Bradford法)原理—考馬斯亮藍G-250有紅、藍兩種不同顏色的形式,在一定濃度的乙醇和酸性條件下,可配成淡紅色的溶液,與蛋白結(jié)合后形成藍色化合物,該化合物在595nm處有最大吸收值,化合物顏色深淺與蛋白的濃度高低成正比。制作標準曲線(插入表格)檢測樣品蛋白含量:取一管考馬斯亮藍+95l0.15mol/LNaClNaCl溶液+5l待測蛋白樣品,混勻后靜置2min,倒入比色杯中測試。二、蛋白樣品的定量(Bradford法)原理—考馬斯亮藍G30

20-30ug

細胞/組織裂解物

100ng

純化蛋白根據(jù)蛋白表達豐度調(diào)整適當?shù)牡鞍咨蠘恿可蠘恿恳恢拢好靠咨蠘恿勘3忠恢律蠘忧坝胠oadingbuffer加熱變性樣本三、SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳20-30ug細胞/組織裂解物三、SDS-聚丙烯酰胺凝31Anode-內(nèi)槽緩沖液帶有負電荷,與凝膠頂部接觸外槽中緩沖液帶有正電荷,與凝膠底部接觸Cathode+帶有負電荷的蛋白質(zhì)從上到下運動(負極到正極),分開電泳進程可以根據(jù)前沿指示劑來確定,等其跑到底部上面1cm左右即可停止電泳小分子量蛋白跑的比較快.蛋白根據(jù)分子量大小分開蛋白質(zhì)帶有負電荷,因此電泳時可以從負極向正極移動標本加入到上樣孔中Anode-外槽中緩沖液帶有正電荷,與凝膠底部接觸Cath32westernblot原理及操作流程課件33四、WesternBlot轉(zhuǎn)膜

分離的蛋白通過電轉(zhuǎn)膜方式從凝膠中轉(zhuǎn)移到雜交膜上(PVDF或NC膜)PVDF膜:價格較貴,可重復使用,特別適合蛋白印跡,結(jié)合能力較強,但價格比較昂貴。NC膜(硝酸纖維素膜):價格比較便宜,應用較廣,結(jié)合牢固性差一些,韌性也不如PVDF,不能重復使用,但蛋白吸附容量高,親水性較好。四、WesternBlot轉(zhuǎn)膜分離的蛋白通過電轉(zhuǎn)膜34五、封閉脫脂奶粉(含5%脫脂奶粉的TBST緩沖液)BSAWesternBlot膜封閉液(生物試劑公司提供)五、封閉脫脂奶粉(含5%脫脂奶粉的TBST緩沖液)35六、一抗、二抗孵育把NC膜放在密閉塑料袋或者培養(yǎng)皿中,加入一抗溶液與濾膜溫育,室溫小時或4℃過夜。倒掉一抗溶液,用PBS漂洗濾膜3次,每次10min。加入配制的二抗,搖床上緩慢搖動,室溫一小時或4℃過夜。倒掉二抗溶液,用PBS漂洗濾膜3次,每次10min。六、一抗、二抗孵育把NC膜放在密閉塑料袋或者培養(yǎng)皿中,加入一36七、二抗與底物反應顯色ECL化學發(fā)光顯色

比較常用,結(jié)果容易控制,但是被催化是靈敏度差一點DAB顯色

比較靈敏,是HRP最敏感的底物七、二抗與底物反應顯色ECL化學發(fā)光顯色37WesternBlot

需要的主要試劑WesternBlot需要的主要試劑38WB需要試劑-膜常用的有PVDF膜,硝酸纖維素膜或者尼龍膜WB需要試劑-膜常用的有PVDF膜,硝酸纖維素膜或者尼龍膜39WB需要試劑-封閉試劑BSA或者脫脂奶粉(光明脫脂奶粉)商業(yè)化的封閉試劑WB需要試劑-封閉試劑BSA或者脫脂奶粉(光明脫脂奶粉)40主要目的是確定靶蛋白的分子量大小;使用預染的Marker還可以實時檢測電泳分離情況,并可以轉(zhuǎn)移到膜上。WB需要試劑-蛋白質(zhì)MarkerPrestainedproteinladdersUnstainedproteinladdersFermentas主要目的是確定靶蛋白的分子量大?。皇褂妙A染的Marker還可41WB需要試劑-一抗選擇適合檢測標本種屬的一抗(說明書有驗證)選擇適用于WB實驗方法的一抗(說明書有驗證)選擇單克隆抗體或者經(jīng)過親和純化的多克隆抗體根據(jù)說明書推薦的濃度優(yōu)化最佳稀釋比例

Santacruz,Cellsignaling,Invitrogen,Sigma,Abcam,R&D,Abnova,Chemicon,Calbiochem,Millipore,BD,Cayman,Roche,eBioscience,etal.選擇合適的一抗:WB需要試劑-一抗選擇適合檢測標本種屬的一抗(說明書有驗證)42雜交需要試劑-二抗二抗選擇:根據(jù)一抗來源種屬以及抗體Ig亞型選擇合適的二抗。二抗的使用:根據(jù)說明書推薦濃度使用TBST稀釋二抗。如果說明書沒有推薦濃度,可進行多個稀釋比例進行摸索最佳稀釋度(1:1000-1:20000)。孵育條件一般為室溫1-2小時。

Santacruz,Cellsignaling,Invitrogen,Sigma,Abcam,R&D,Abnova,Chemicon,Calbiochem,Millipore,BD,Cayman,Roche,eBioscience,etal.雜交需要試劑-二抗二抗選擇:根據(jù)一抗來源種屬以及抗體Ig亞型43雜交需要試劑-底物顯色底物:操作簡單,靈敏度低,如TMB、DAB、BCIP/NBT化學發(fā)光底物:靈敏度高,需要曝光檢測設備(暗室、曝光設備和膠片)或者凝膠成像設備。雜交需要試劑-底物顯色底物:操作簡單,靈敏度低,如TMB、D44WB常見問題沒有信號高背景非特異性條帶條帶大小不對WB常見問題沒有信號45標本問題

標本中不含檢測蛋白:設置陽性對照上樣量不夠,或者蛋白表達豐度比較低:增加上樣量轉(zhuǎn)膜問題轉(zhuǎn)膜不完

溫馨提示

  • 1. 本站所有資源如無特殊說明,都需要本地電腦安裝OFFICE2007和PDF閱讀器。圖紙軟件為CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.壓縮文件請下載最新的WinRAR軟件解壓。
  • 2. 本站的文檔不包含任何第三方提供的附件圖紙等,如果需要附件,請聯(lián)系上傳者。文件的所有權(quán)益歸上傳用戶所有。
  • 3. 本站RAR壓縮包中若帶圖紙,網(wǎng)頁內(nèi)容里面會有圖紙預覽,若沒有圖紙預覽就沒有圖紙。
  • 4. 未經(jīng)權(quán)益所有人同意不得將文件中的內(nèi)容挪作商業(yè)或盈利用途。
  • 5. 人人文庫網(wǎng)僅提供信息存儲空間,僅對用戶上傳內(nèi)容的表現(xiàn)方式做保護處理,對用戶上傳分享的文檔內(nèi)容本身不做任何修改或編輯,并不能對任何下載內(nèi)容負責。
  • 6. 下載文件中如有侵權(quán)或不適當內(nèi)容,請與我們聯(lián)系,我們立即糾正。
  • 7. 本站不保證下載資源的準確性、安全性和完整性, 同時也不承擔用戶因使用這些下載資源對自己和他人造成任何形式的傷害或損失。

評論

0/150

提交評論