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文檔簡介

附錄B–文件格式規(guī)支持的文件格Image-ProPlusImage-Pro的文件:打開和文件:另存為框所使用的格式名稱、標識文件格式的典型擴展AutoQuant(*.DEB,Image-ProAutoQuant文件格式——DEBAVZ。AutoQuant文件格式只被文件:打開支持。AVIImage-Pro支持多種 AVI文件格式——擴展名通常為AVI。Image-Pro可以使用的AVI文件種類依賴于操作系統(tǒng)或其他多組件已安裝的AVI文件壓縮支BioRad開支持。BMP(*.BMP,*.DIB,Image-Pro支持所有已知的 BMP文件格式,其擴展名通常為BMP,但也有的擴展名為DIB或RLE。Dr.HALOImage-ProDr.HALOCUTMediaCybernetics應(yīng)用程序也支持這種文件格式。CUT文件格式只被文件:打開支持。平也可用于定義、載入或保存您自己私有的格式文件。有關(guān)平面文件的信息,參見GatanImage-ProGatanDigitalMicrograph文件格式——DM3。DM3文件格式只被文件:打開支持。Image-Pro工作區(qū)JPEGKodakPhotoCDImage-ProKodakPhotoCDPCD。PCD文件格式只被文件:打開支持。MolecularDynamicsImage-ProMolecularDynamicsGEL。GEL文件格式只被文件:打開支持。Image-Pro支持多種MetaMorph文件格式,其擴展名為STK。STK文件格式只被文件支持PICT(*.PCT,Image-Pro支持多種MacintoshPICT12PCTPostScriptImage-Pro支持PostScript文件,其擴展EPS。EPS文件只被文件:另存為支Sequence文件的信息,請參見本附錄的Image-ProPlusTIFF和SEQ文件節(jié)TIFFImage-Pro支持所有已知的TIFF(圖像文件格式)文件格式,包括大部分的多個圖像變體。有關(guān)Image-Pro能夠保存的TIFF文件的信息,請參見本附錄的Image-ProPlusTIFFSEQ文件節(jié)。TrueVisionZsoftImage-ProZSoftPCX文件格式,其擴展名為*.PCX。PCX文件格式只被文件:打開支持。Zeiss校準文件(*.CAL文件在準令設(shè)置,會創(chuàng)建準件。*.L件是通校命令彈式菜單中的CALSCII和*.CAL文件示例如下,它了亮度和空間校準值CalibName=SpatialCal0Name=IntensityCal0UnitName=GrayLevel測量文件(*.CNT文件在算尺寸操的量或統(tǒng)結(jié)時,將創(chuàng)測量文。們是通測或計算尺寸文件#TotalCount: 137.79405228.08347310.65680425.75376524.76410625.30080844環(huán)境文件(*.ENV文件在計保存令的置時,會建環(huán)境件*.V件通過計算存窗口文件*.VI計算保存、選擇測量置將會此文件。入環(huán)境件就重建計尺寸環(huán)境從而不重了計算/尺寸設(shè)置的*.ENV文件示例如下MCentr-快快變換文件(*.FFT文件Image-ProPlus3.0在T窗保存T據(jù)時,會建快速變換文。T文件是二制文件,它了FFT的系數(shù)如選擇向前FT選項框中全FT選項,F(xiàn)FT半FT選項,那么將只保存由FFT)在FFT22FFT數(shù)組的寬度(稱為“M”)2字節(jié)整數(shù)定義了高度(稱為“N”)。M和N的16-5122的冪。4字節(jié)頭之后是 左半部分FFT數(shù)組的 101001100011110110101169位。其取值范圍是-256——+256。小數(shù)部分70-127/128。FFT8位長度:44在一個完整的數(shù)組中,F(xiàn)FT數(shù)據(jù)是繞中心的“0頻率部分”對稱分布的。除兩個元素外,所有FFT元素都有一個對稱的“”,這些元素的實數(shù)部分相同,而虛數(shù)部分如果只了一半數(shù)據(jù),那么文件將包含(M/2+1)*N個系數(shù)(M和N分別是數(shù)組的寬度和高度)。請記住,只有左側(cè)的FFT數(shù)組保存在文件中,所以其寬度為(M/2+1)。FFT數(shù)組是如何分布的(8X8數(shù)組,然包含在FFT文件中的那部分數(shù)組(0頻率元素(ZFC))。數(shù)組顯示了這些元素是如何對稱相關(guān)的。注意,第一行和第一列沿各自中心元素ZFC元素對稱。column ABCDXWVABCDXWVEFGHUTSIJKLRQPMNOONMPQRLKJISTUHGFEVWXDCBA012row 456 FFT0頻率元素位于M/2列、N/20,0。FFT文件中,此元素可以在如下字節(jié)位置處找到:4*(((M/2+1)*N/2)+M/2)+F(u,v)={R(u,v),在此文件中,F(xiàn)(u,v),0uM/2,0vN-14*(((v*(M/2+1))+u)+如果只了一半FFT數(shù)組,那么可以通過下面的公式計算出右半部分的系對于0行的右半部分F(u,0)={R(M-u,0),-I(M-對于其余行的右半部分,使用F(u,v)={R(M-u,N-v),-I(M-u,N-M/2uImage-ProPlusv3.0(及后續(xù)版本在3.0FFTFFT在件時,果現(xiàn)這兩數(shù)有效的度高度,么可以知這文件0,),字類描00FFT數(shù)據(jù)的寬度20FFT數(shù)據(jù)的高度46類型:532位浮點,6168頻譜顯示范圍的開始頻譜顯示范圍的結(jié)束相位顯示范圍的開始endofphasedisplayrange0實數(shù)/虛數(shù),1頻譜/00字類描填充圖像中原始圖像的位置short=C語言中的短整型Basic2doubleC語言中的雙精度浮點型Basic888位相位時,實數(shù)部分和虛數(shù)部分保存的是什么內(nèi)容。這些數(shù)據(jù)不會直接顯示,也不需要浮點顯示范圍。在真正顯示頻譜和/或相位時,并不需要:1=8bits/pix,4=12bpp,5=32bpp,6=16: 平面文件格Image-Pro12級灰度、16級灰度和浮點圖像的方法,因為標準文件格式通常不能處理這些類別的 }其中,ClassName了包含在文件中圖像的類別(如,IFFCL_BILEVEL,如果把參數(shù)值指定為常量,Image-Pro將把此數(shù)當作是十進制數(shù)據(jù),除非使用了其中:Offset是十進制數(shù)據(jù),它了文件中值的位置,以字節(jié)表示相對于文件開始處的偏移量;如下所示,Datatype了該位置處值的格式:數(shù)據(jù)類在文件中解釋為。。數(shù)據(jù)類在文件中解釋為定義中參數(shù)值中也可以包含數(shù)算符和定義名,只要該定義名被賦一個值即可。圖圖像類別灰8調(diào)色8真彩812級灰16級灰浮要說注:如果讀/IMC_GRAY12、IMC_GRAY16或IMC_FLOATIFFCL_GRAY,在位參數(shù)中指12(IMC_GRAY12)、16(對IMC_GRAY16)或32(對IMC_FLOAT)。重要:bits要要說IFFCL_RGBIFFFLAT.DES文件中可以找到一個示例,Image-Pro提IFFCL_RGBIFFFLAT.DES文件中可以找到一個示例,Image-Pro提此要素是可選的。默認值為sample_offset定了line_offset值,那么指定的這個值必須大于或等于寬度值。line_offset與樣本偏移量結(jié)合起來就2*width*bits15IMC_RGB圖像的塊間移動時使數(shù)是很有用的——Image-Pro提供的IFFLAT.DES文件中的示例)。要說寫入該位置(寫入時)或從該位置(時)的一個bytedescriptor。例如,如果要寫入字節(jié)0、1、2中的“G1212位灰度類位字節(jié)要說續(xù)在寫平面文件時,datatype表示短/長整型值的是此要素是可選的。如果未提供datatype,則默認以二進bit_offset指定了在將每像素N位的圖像讀入到每像M位的工作區(qū)間時,拋棄多少個低位,其中M<N。如果位偏移量小于N與M間的偏差,其余的位將從開例如,如果每像素16位圖像文件讀入到每像素12位的工bit_offset:表示將16位的字節(jié)中較低的3位將被丟棄。這也意味著 圖像文件最工作區(qū)最低IFFCL_GRAY類型的圖像。調(diào)色板將包含2**RGB值。文件為IFFCL_GRAY類型包含了兩個描述,一個用于12位圖像,另一個用于浮點圖{}{}如果打開了平面文件以準備,而在描述文件中存在多種格式描述,那么Image-Pro據(jù)匹配的描述。從技術(shù)上講,bytedescription不是描述文件的必需要素,但從實際312IFFCL_GRAY描bytedescription標準,那么所有平面文件都會與第一個描述匹12位圖像打開。ProClassNamebits值與圖像文件的文件參數(shù)塊中圖像類別和位要素相匹配有關(guān)平面文件描述的例子,請參見隨Image-Pro一起提供的IFFFLAT.DES文件中直方圖文件(*.HST文件輪廓窗口文件菜單中的數(shù)據(jù)到文件命令創(chuàng)建的。*.HST文件是ASCII文件,它保存了XY軸繪圖的數(shù)據(jù)。下面給出了一個通過直方圖命令創(chuàng)建的*.HST文件示例。包含直方圖數(shù)據(jù)的*.HST文然后是校準空間測量值。如果數(shù)據(jù)來自彩像,那么記錄將包含3個測量值,分RGB通道,如下所示。數(shù)據(jù)字段以空格分隔。還列出了直方圖的統(tǒng)計數(shù)字。如果文件包含的是彩像文件的直方圖數(shù)據(jù),那么#Image-ProPlusHistogram#Time:MonAug2309:40:45#Image:#SpatialUnit:Pixels#IntensityUnit:#NumberofDataSets:3#SetSize:256#Channels:RedGreen##Gray0000100020003000.4000..000下面給出了一個通過譜線輪廓命令創(chuàng)建的*.HST文件示例。包含譜線輪廓數(shù)空間測量值,然后是校準強度值。如果數(shù)據(jù)來自彩像,那么記錄將包含3個強RGB通道,如下所示。數(shù)據(jù)字段以空格分隔。#Image-ProPlusLineProfile#Time:MonAug2309:59:58#Image:colordot.tif#SpatialUnit:Pixels#IntensityUnit:Pixels#NumberofDataSets:3#SetSize:22#Channels:RedGreen#123456789查閱表格文件(*.LUT文件在通過對比度增強命令的保存選項當前LUT值時,將創(chuàng)建查閱表格文件輪廓文件(*.OUT文件輪廓文件。輪廓文件是二進制文件,它了一系列多邊形。文件中的所有元素都是2字節(jié)整數(shù)組成,前兩個字節(jié)定義了X坐標值,后兩個字節(jié)定義了Y416INT2字節(jié)整數(shù)的二進制/十進制內(nèi)說#0-2200000000200000000Poly13#16&0000000000000000Poly1XY#18&0000000000000000Poly1XY#20&0000000000000000Poly1XY00000000Poly24#23&0000000000000000Poly2XY#25&0000000000000000Poly2XY#27&0000000000000000Poly2XY#29&0000000000000000Poly2XY下例顯示了如何在C語言中和使用輪廓文件typedefstruct{shortx;shorty;}COORD;#defineMAXPOINTS4000LoadOutlines(char{intshortshortnum_obj=0;COORD*Points;FILE*fp;/*openoutlinefileif((fp=fopen(outfile,"rb"))==NULL)return-1;/*allocatespaceforpolygon*/return-/*readsinnumberofpolygonsfread((char*)&num_obj,sizeof(short),1,fp);if(num_obj<=0)return-/*foreachpolygon...*/for(i=0;i<num_obj;i++){/*readsinnumberofpointsinpolygon*/fread((char*)&count,sizeof(short),1,fp);if(count>MAXPOINTS||count<0)/*reif(fread((char...dosomethingwiththe...}}return0;}偽彩色文件(*.PSC文件在色調(diào)色板,會創(chuàng)建彩文件*.C文件是過色彩框文件范圍文件(*.RGE文件在通過BRGB值。如果文件以II下面的示例文件包含了通過色彩分割命令從圖像中提取出的RGB值#IPWindowsColorSegmentationranges#V.1#Divisions:#ColorModel:手動標記文件(*.TAG文件當通過量單中手標選項來別和或標的記號,創(chuàng)建了動記文件。手動點計算框中文菜上保存點令就可創(chuàng)一個*.G文件。*.TAGImage-Pro格式文件,它包含了類別和標記信息,這些信息可應(yīng)用到ASCII格式文件。用戶不能試圖修改*.TAG文件。顆粒文件(*.?x?文件ASCII文件編輯器來創(chuàng)建顆5行是標題信息,然后才是顆粒本身。 #ImageProPlus NameYourKernel SizeXX OffsetXX kernelcoefficients,1st kernelcoefficients,2nd...

SizeXXOffsetXX#ImageProPlusKernelNameHiPass3x3Size3Offset11-1-1--19--1-1-#ImageProPlusKernelNameHorzEdge7x7Size7Offset33-1-1-1-1-1-1--1-1-1-1-1-1--1-1-1-1-1-1-0000001111111

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