微生物的進(jìn)化系統(tǒng)發(fā)育分類(lèi)

1、關(guān)于微生物的進(jìn)化系統(tǒng)發(fā)育分類(lèi)第1頁(yè)，共52頁(yè)，2022年，5月20日，15點(diǎn)6分，星期三第一節(jié)進(jìn)化的測(cè)量指征高等動(dòng)植物判斷親緣關(guān)系：形態(tài)結(jié)構(gòu)、生理生化、行為習(xí)性等表型特征，少量的化石資料微生物：形體微小、結(jié)構(gòu)簡(jiǎn)單、缺少有性繁殖過(guò)程，依靠表型特征無(wú)法測(cè)量其系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化指征的選擇:微生物的系統(tǒng)發(fā)育，主要是分析和比較生物大分子的結(jié)構(gòu)特征，特別是蛋白質(zhì)、RNA和DNA這些反映生物基因組特征的分子序列，作為判斷各類(lèi)微生物乃至所有生物進(jìn)化關(guān)系的主要指征蛋白質(zhì)、RNA和DNA序列進(jìn)化變化的顯著特點(diǎn)是進(jìn)化速率相對(duì)恒定第2頁(yè)，共52頁(yè)，2022年，5月20日，15點(diǎn)6分，星期三合適的指征大分子1、必須普遍存在于

2、所研究的各個(gè)生物類(lèi)群中 2、在各種生物中功能同源的大分子 3、為了鑒定大分子序列的同源位置或同源區(qū)，要求所選擇的分子序列必須能?chē)?yán)格線性排列，以便進(jìn)行進(jìn)一步的分析比較 4、根據(jù)所比較的各類(lèi)生物之間的進(jìn)化距離來(lái)選擇適當(dāng)?shù)姆肿有蛄?(選擇進(jìn)化速率低的分子序列)第3頁(yè)，共52頁(yè)，2022年，5月20日，15點(diǎn)6分，星期三1、rRNA參予生物蛋白質(zhì)的合成過(guò)程，其功能是任何生物都必不可少的，而且在生物進(jìn)化的漫長(zhǎng)歷程中，其功能保持不變2、在16SrRNA分子中(系譜分析的分子尺，古化石)，既含有高度保守的序列區(qū)域，又有中度保守和高度變化的序列區(qū)域，因而它適用于進(jìn)化距離不同的各類(lèi)生物親緣關(guān)系的研究3、16Sr

3、RNA分子量大小適中，便于序列分析.（5S16S23S,120個(gè)核苷酸15402900）4、rRNA普遍存在于真核生物和原核生物中，且占總RNA的90%，便于提?。ㄎ樗梗?。rRNA作為進(jìn)化的分子指征依據(jù)第4頁(yè)，共52頁(yè)，2022年，5月20日，15點(diǎn)6分，星期三rRNA序列測(cè)定和分析方法1、寡核苷酸編目分析法-30%序列，發(fā)現(xiàn)古生菌 （1）16SrRNA提取-T1核酸酶水解-同位素標(biāo)記-電泳分離、放射自顯影技術(shù)、電泳圖譜，確定寡核苷酸分子序列 相似性系數(shù)法和序列印記法比較親緣關(guān)系相似性系數(shù)法：通過(guò)計(jì)算相似性系數(shù)SAB值來(lái)確定微生物之間的關(guān)系（SAB=2NAB/(NA+NB)序列印記法：通過(guò)序列

4、比較后，若發(fā)現(xiàn)某些序列僅為某種(群)微生物所特有，這些序列即可作為該種(群)微生物的印記序列第5頁(yè)，共52頁(yè)，2022年，5月20日，15點(diǎn)6分，星期三電泳的原理序列印記通常出現(xiàn)在某一特定系統(tǒng)發(fā)育群的全部成員或絕大多數(shù)成員。20世紀(jì)70年代末，生命分為三界的理論，就是采用寡核苷酸編目分析法對(duì)大量微生物分析比較后提出來(lái)的第6頁(yè)，共52頁(yè)，2022年，5月20日，15點(diǎn)6分，星期三古生菌、細(xì)菌和真核生物的16S(18S)RNA的印記序列2、全序列分析法 用反轉(zhuǎn)錄酶和雙脫氧序列分析，可以對(duì)未經(jīng)純化的rRNA抽提物進(jìn)行直接的序列測(cè)定第7頁(yè)，共52頁(yè)，2022年，5月20日，15點(diǎn)6分，星期三雙脫氧核苷

5、終止法測(cè)定全序列第8頁(yè)，共52頁(yè)，2022年，5月20日，15點(diǎn)6分，星期三系統(tǒng)發(fā)育樹(shù) 無(wú)根樹(shù)：只是簡(jiǎn)單表示生物類(lèi)群之間的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系，并不反映進(jìn)化途徑有根樹(shù)：不僅表示出A、 B、C、D的親疏，而且反映出它們有共同的起源及進(jìn)化方向系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)-在研究生物進(jìn)化和系統(tǒng)分類(lèi)中，常用一種樹(shù)狀分枝的圖型來(lái)概括各種(類(lèi))生物之間的親緣關(guān)系，這種樹(shù)狀分枝的圖型被稱(chēng)為系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)(phylogenetic tree)，簡(jiǎn)稱(chēng)系統(tǒng)樹(shù) 第9頁(yè)，共52頁(yè)，2022年，5月20日，15點(diǎn)6分，星期三全生命系統(tǒng)樹(shù)(Olsen和Woese 1993) 基因組系列研究表明：在域內(nèi)和域間存在廣泛的基因水平轉(zhuǎn)移，及真核生物擁有來(lái)自細(xì)

6、菌或古生菌的基因，兩域之間也有頻繁的基因交換。甚至細(xì)菌也可從真核生物域獲得基因。第10頁(yè)，共52頁(yè)，2022年，5月20日，15點(diǎn)6分，星期三三界生物的主要特征第11頁(yè)，共52頁(yè)，2022年，5月20日，15點(diǎn)6分，星期三伍斯：用寡核苷酸序列編目分析法三界(域) ：Bacteria(細(xì)菌)、Archaea(古生菌)和Eukarya(真核生物)第12頁(yè)，共52頁(yè)，2022年，5月20日，15點(diǎn)6分，星期三第二節(jié)細(xì)菌分類(lèi)分類(lèi)(classification)是根據(jù)一定的原則(表型特征相似性或系統(tǒng)發(fā)育相關(guān)性)對(duì)微生物進(jìn)行分群歸類(lèi)，排列成系統(tǒng)，并對(duì)各個(gè)分類(lèi)群的特征進(jìn)行描述，以便查考和對(duì)未被分類(lèi)的微生物進(jìn)

7、行鑒定命名(nomenclature)是根據(jù)命名法規(guī)，給每一個(gè)分類(lèi)群一個(gè)專(zhuān)有的名稱(chēng)鑒定(identification或determination)則是指借助于現(xiàn)有的微生物分類(lèi)系統(tǒng)，通過(guò)特征測(cè)定，確定未知的、或新發(fā)現(xiàn)的、或未明確分類(lèi)地位的微生物所應(yīng)歸屬分類(lèi)群的過(guò)程第13頁(yè)，共52頁(yè)，2022年，5月20日，15點(diǎn)6分，星期三七級(jí)分類(lèi)單元界Kingdom(Regnum)門(mén)Phylum(phybum) 綱Class(Classis) 目Order(Ordo) 科Family(Familia) 屬Gennus(Genus) 種Species(Species)“亞”、“超”、“族”輔助單元分類(lèi)單元及其等

8、級(jí)第14頁(yè)，共52頁(yè)，2022年，5月20日，15點(diǎn)6分，星期三分類(lèi)單元及其等級(jí)培養(yǎng)物(culture)，是指一定時(shí)間一定空間內(nèi)微生物的細(xì)胞群或生長(zhǎng)物。菌株(strain)，從自然界中分離得到的任何一種微生物的純培養(yǎng)物都可以稱(chēng)為微生物的一個(gè)菌株；用實(shí)驗(yàn)方法(如通過(guò)誘變)所獲得的某一菌株的變異型-新的菌株，與野生型區(qū)別。 種群(population)-是指一定空間中 同種個(gè)體的組合。 種(species)，是生物分類(lèi)中基本的分類(lèi)單元和分類(lèi)等級(jí)，具有共同特征的亞種組成亞種(subspecies)或變種(variety)，當(dāng)某一個(gè)種內(nèi)的不同菌株存在少數(shù)明顯而穩(wěn)定的變異特征或遺傳性狀而又不足以區(qū)分成新

9、種時(shí)，將這些菌株細(xì)分成兩個(gè)或更多的小的分類(lèi)單元-亞種。亞種是正式分類(lèi)單元中地位最低的分類(lèi)等級(jí)。型(form或type)，常指亞種以下的細(xì)分 屬(genus)，是介于種(或亞種)與科之間分類(lèi)等級(jí)，也是生物分類(lèi)中的基本分類(lèi)單元。通常是把具有某些共同特征或密切相關(guān)的種歸為一個(gè)高一級(jí)的分類(lèi)單元，稱(chēng)之屬。 第15頁(yè)，共52頁(yè)，2022年，5月20日，15點(diǎn)6分，星期三雙命名法現(xiàn)命人.年Escherichia coli (Migula) Castellani et Chalmers 1919學(xué)名=屬名+種名+首命人.年+詞首大寫(xiě)詞首小寫(xiě)通常學(xué)術(shù)論文中不寫(xiě)B(tài)acillus subtilis (Ehrenbe

10、rg) Cohn 1872學(xué)名=屬名+種名+亞種或變種名稱(chēng)“新種”(sp.nov): 新被鑒定的種發(fā)表時(shí)應(yīng)在其學(xué)名后標(biāo)上sp.nov.的符號(hào)，新種發(fā)表前應(yīng)將其模式菌株的培養(yǎng)物存放在一個(gè)永久性的保藏機(jī)構(gòu)，并應(yīng)允許人們從中取得第16頁(yè)，共52頁(yè)，2022年，5月20日，15點(diǎn)6分，星期三種名幾點(diǎn)說(shuō)明學(xué)名:屬名詞首大寫(xiě),表示種的主要特征而種名詞首小寫(xiě),表示種的次要特征屬名的縮寫(xiě):文中首次使用不能縮寫(xiě),重復(fù)出現(xiàn)的可用詞首大寫(xiě)的一或幾字母加點(diǎn)表示Bacillus為B.種名未定時(shí):使用時(shí)寫(xiě)出屬名及種名未定用sp.(一種)或spp.(幾種)發(fā)音:應(yīng)按拉丁發(fā)音規(guī)則,實(shí)際以英文發(fā)音居多第17頁(yè)，共52頁(yè)，202

11、2年，5月20日，15點(diǎn)6分，星期三種的分類(lèi)地位舉例單元 詹氏甲烷球菌 大腸埃希氏菌 八孢裂殖酵母界 古生菌界(域) 細(xì)菌界(域) 菌物界 門(mén) 廣古生菌門(mén) 朊細(xì)菌門(mén) 真菌門(mén)亞門(mén)(組) 產(chǎn)甲烷菌組 朊細(xì)菌組 子囊菌亞門(mén)綱 甲烷球菌綱 發(fā)酵細(xì)菌綱 半子囊菌綱目 甲烷球菌目 腸桿菌目 內(nèi)孢霉目科 甲烷球菌科 腸桿菌科 內(nèi)孢酶科屬 甲烷球菌屬 埃希氏菌屬 裂殖酵母屬種 詹氏甲烷球菌 大腸埃希氏菌 八孢裂殖酵母 M . jannaschii E . coli S . Octosporus Methanobacterium Escherichia Schizosaccharomces 分類(lèi)系統(tǒng) 系統(tǒng)手冊(cè)2

12、000年 系統(tǒng)手冊(cè)2000年 Ainsworth詞典1983年第18頁(yè)，共52頁(yè)，2022年，5月20日，15點(diǎn)6分，星期三亞種以下的各類(lèi)型第19頁(yè)，共52頁(yè)，2022年，5月20日，15點(diǎn)6分，星期三 原核生物包括古生菌與細(xì)菌兩個(gè)域。其分類(lèi)工作是一件意義重大又十分艱巨的工作。 伯杰氏手冊(cè)是原核生物分類(lèi)的權(quán)威經(jīng)典著作，從1923年第一版至今已出了11版。從1984年開(kāi)始至1989編寫(xiě)了新的4卷本手冊(cè)，更名為伯杰氏系統(tǒng)細(xì)菌學(xué)手冊(cè)，2000年起系統(tǒng)手冊(cè)的第二版分五卷陸續(xù)發(fā)行。伯杰氏手冊(cè)簡(jiǎn)介第20頁(yè)，共52頁(yè)，2022年，5月20日，15點(diǎn)6分，星期三 地球上生存的菌物約有150萬(wàn)種，目前已記載的只

13、有7-9萬(wàn)種，每年以發(fā)現(xiàn)1500個(gè)新種的速度遞增。 Ainsworth系統(tǒng)是常用的菌物分類(lèi)系統(tǒng)： 安貝氏菌物詞典之1995年已第八版，而且每版均有變化。菌物分類(lèi)（真菌）第21頁(yè)，共52頁(yè)，2022年，5月20日，15點(diǎn)6分，星期三伯杰氏系統(tǒng)細(xì)菌學(xué)手冊(cè)第二版 第二版分5卷，更多地依靠系統(tǒng)發(fā)育資料對(duì)細(xì)菌分類(lèi)群，而不是根據(jù)表型特征。第二版：古生菌域2門(mén)8綱，細(xì)菌域23門(mén)31綱5卷大致的內(nèi)容安排如下： 第一卷：古生菌、藍(lán)細(xì)菌、光合細(xì)菌和最早分支的細(xì)菌 第二卷：變形桿菌(多樣的革蘭氏陰性菌類(lèi)) 第三卷：低G+C含量（50% mol以下）的革蘭氏陽(yáng)性菌 第四卷：高G+C含量（50% mol以上）的革蘭氏陽(yáng)

14、性細(xì)菌(含放線菌類(lèi)) 第五卷：浮霉?fàn)罹?、螺旋體、絲桿菌、擬桿菌和梭桿菌及衣原體(屬革蘭氏陰性菌) 第22頁(yè)，共52頁(yè)，2022年，5月20日，15點(diǎn)6分，星期三第三節(jié)微生物分類(lèi)鑒定的特征和技術(shù)原核生物的特點(diǎn) 單細(xì)胞及集合/基因組無(wú)膜包裹/二等分裂增殖無(wú)減數(shù)分離/無(wú)膜隔細(xì)胞器/無(wú)細(xì)胞質(zhì)流現(xiàn)象/為70S核糖體/壁含肽聚糖等從以往舊體系主要以表型、實(shí)用性鑒定指標(biāo)遺傳型系統(tǒng)進(jìn)化分類(lèi)新體系（RNADNA蛋白等分類(lèi)依據(jù)：第23頁(yè)，共52頁(yè)，2022年，5月20日，15點(diǎn)6分，星期三一、微生物鑒定的經(jīng)典方法獲取純培養(yǎng)物(pure culture)測(cè)定各鑒定指標(biāo) 各大類(lèi)有各自重點(diǎn)指標(biāo) ： 真菌以形態(tài)為主 酵母

15、和放線菌則以形態(tài)與生理兼用 細(xì)菌較多使用生理指標(biāo)查找權(quán)威性鑒定手冊(cè)第24頁(yè)，共52頁(yè)，2022年，5月20日，15點(diǎn)6分，星期三經(jīng)典的鑒定指標(biāo)第25頁(yè)，共52頁(yè)，2022年，5月20日，15點(diǎn)6分，星期三1、常用于分類(lèi)和鑒定的形態(tài)學(xué)特征形態(tài)學(xué)特征：易于觀察和比較，具有相對(duì)的穩(wěn)定性第26頁(yè)，共52頁(yè)，2022年，5月20日，15點(diǎn)6分，星期三2、常用于微生物分類(lèi)鑒定的生理生化特征生理生化特征與微生物的酶和調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)的本質(zhì)和活性直接相關(guān)，酶及蛋白質(zhì)都是基因產(chǎn)物第27頁(yè)，共52頁(yè)，2022年，5月20日，15點(diǎn)6分，星期三3、血清學(xué)試驗(yàn)與噬菌體分型不同微生物抗原物質(zhì)結(jié)構(gòu)不同，賦予它們不同的抗原特征（

16、細(xì)胞表面的蛋白決定的）血清學(xué)試驗(yàn)被廣泛用于微生物分類(lèi)鑒定的研究，但比較成功的應(yīng)用是對(duì)種內(nèi)(以及個(gè)別屬內(nèi))不同菌株血清型的劃分噬菌體對(duì)宿主的感染和裂解作用常具有高度的特異性，即一種噬菌體往往只能感染和裂解某種細(xì)菌，甚至只裂解種內(nèi)的某些菌株第28頁(yè)，共52頁(yè)，2022年，5月20日，15點(diǎn)6分，星期三4、氨基酸順序和蛋白質(zhì)分析蛋白質(zhì)是基因的產(chǎn)物，蛋白質(zhì)的氨基酸順序直接反映mRNA順序而與編碼基因密切相關(guān)蛋白質(zhì)氨基酸順序的進(jìn)化速率大體上是恒定的，但功能不同的蛋白質(zhì)常以不同的速率進(jìn)化蛋白質(zhì)的氨基酸順序測(cè)定雖然經(jīng)過(guò)不斷改進(jìn)，但總的說(shuō)還是很煩雜耗費(fèi)。在微生物分類(lèi)中，常采用間接的比較方法，前述的血清學(xué)方法也

17、是其中之一，還可以進(jìn)行蛋白電泳圖譜比較第29頁(yè)，共52頁(yè)，2022年，5月20日，15點(diǎn)6分，星期三5、核酸的堿基組成和分子雜交1. DNA的堿基組成(G+Cmol%) DNA的堿基組成和排列順序決定生物的遺傳性狀，DNA堿基組成是各種生物一個(gè)穩(wěn)定的特征親緣關(guān)系近的生物，它們應(yīng)該具有相似的G+C含量測(cè)定DNA堿基組成的方法很多，常用的有熱變性溫度法、浮力密度法和高效液相色譜法2. 核酸的分子雜交 不同生物DNA堿基排列順序的異同直接反映這些生物之間親緣關(guān)系的遠(yuǎn)近，堿基排列順序差異越小，它們之間的親緣關(guān)系就越近核酸分子雜交在微生物分類(lèi)鑒定中的應(yīng)用包括：DNA-DNA雜交、DNA-rRNA雜交、核

18、酸雜交來(lái)檢測(cè)特定核苷酸序列的核酸探針技術(shù) 第30頁(yè)，共52頁(yè)，2022年，5月20日，15點(diǎn)6分，星期三DNA-DNA雙鏈DNA熱處理變性解鏈-變性后冷處理-復(fù)性-不同株的或同源性的DNA雜交組成雙鏈DNA-RNA當(dāng)非配對(duì)堿基超過(guò)10-20% DNA-DNA之間就不能形成雙鏈，限制了DNA-DNA雜交的應(yīng)用水平，若比較親緣關(guān)系較遠(yuǎn)的菌株，就用DNA-RNA， DNA-DNA雜交率很低時(shí)， DNA-RNA仍有較高的雜交率，可比較屬與屬之間的或較遠(yuǎn)的核酸探針：指能識(shí)別特異核苷酸序列的、帶標(biāo)記的一段單鏈DNA或RNA分子，即是能與特定的核苷酸序列（靶序列）結(jié)合，而不與其他序列結(jié)合的帶標(biāo)記的單個(gè)核苷酸

19、片段。系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)探針 全rRNA探針 科屬的特異性探針第31頁(yè)，共52頁(yè)，2022年，5月20日，15點(diǎn)6分，星期三染色體的原位雜交染色體的原位雜交 熒光探針雜交第32頁(yè)，共52頁(yè)，2022年，5月20日，15點(diǎn)6分，星期三第33頁(yè)，共52頁(yè)，2022年，5月20日，15點(diǎn)6分，星期三遺傳重組原核生物中，雖然沒(méi)有有性生殖，但它們可以通過(guò)轉(zhuǎn)化、轉(zhuǎn)導(dǎo)和接合作用進(jìn)行染色體基因的交換發(fā)生接合、轉(zhuǎn)化和普遍性轉(zhuǎn)導(dǎo)的細(xì)菌之間需要存在廣泛的染色體同源性，否則此類(lèi)重組(同源重組)即不能發(fā)生質(zhì)粒及轉(zhuǎn)座子的基因轉(zhuǎn)移在細(xì)菌分類(lèi)中的意義也是值得注意的基因的垂直轉(zhuǎn)移 和水平轉(zhuǎn)移第34頁(yè)，共52頁(yè)，2022年，5月20日，

20、15點(diǎn)6分，星期三第四節(jié)微生物的快速鑒定和自動(dòng)化分析技術(shù)一、微量多項(xiàng)試驗(yàn)鑒定系統(tǒng)原理：根據(jù)微生物生理生化特征鑒定的結(jié)果，而進(jìn)行的數(shù)碼分類(lèi)鑒定國(guó)外的產(chǎn)品已標(biāo)準(zhǔn)化、系統(tǒng)化和商品化，主要有法國(guó)生物-梅里埃集團(tuán)的API/ATB；瑞士羅氏公司的Micro-ID，Enterotube,Minitek；美國(guó)的Biolog全自動(dòng)和手動(dòng)細(xì)菌鑒定系統(tǒng)優(yōu)點(diǎn)：快速、敏感、準(zhǔn)確、重復(fù)性好，簡(jiǎn)易，節(jié)省人力、物力、時(shí)間和空間 廣泛應(yīng)用于動(dòng)植物檢疫、臨床檢驗(yàn)、食品衛(wèi)生、藥品檢驗(yàn)、環(huán)境監(jiān)測(cè)、發(fā)酵控制和生態(tài)研究。第35頁(yè)，共52頁(yè)，2022年，5月20日，15點(diǎn)6分，星期三“API”細(xì)菌數(shù)值鑒定系統(tǒng)API由bioMerieux（

21、生物-梅里埃公司，法國(guó)）依據(jù)20,000多株標(biāo)準(zhǔn)菌株,大約1000種不同細(xì)菌生化試驗(yàn)于1970年開(kāi)始開(kāi)發(fā)的系列產(chǎn)品。它的出現(xiàn)是對(duì)細(xì)菌學(xué)領(lǐng)域傳統(tǒng)技術(shù)的一次標(biāo)準(zhǔn)化、微量化的徹底變革。它使細(xì)菌鑒定更加簡(jiǎn)單、快速和可靠，已被微生物學(xué)家的廣泛使用,并成為全球的鑒定細(xì)菌的參考標(biāo)準(zhǔn)。API創(chuàng)建了獨(dú)特的數(shù)值鑒定法，并設(shè)計(jì)了相應(yīng)的計(jì)算機(jī)軟件APILAB plus。它較API鑒定檢索書(shū)更為高效、可靠、全面、詳盡、方便, 故APILAB Plus能夠鑒定很多非典型菌。該軟件做為一種判斷結(jié)果的工具,只要鍵入生化反應(yīng)結(jié)果的數(shù)值編碼,就可立刻獲得鑒定報(bào)告結(jié)果。第36頁(yè)，共52頁(yè)，2022年，5月20日，15點(diǎn)6分，星期三

22、API 10 S 最常見(jiàn)革蘭氏陰性桿菌API NH 奈瑟民菌、嗜血桿菌屬API 20 STREP 鏈球菌及有關(guān)菌API CAMPY 彎曲桿菌API CORYNE 棒狀菌群MI LISTERIA 李斯特菌屬API 20E 革蘭氏陰性桿菌(腸桿菌科)API 2ONE 菲腸道革蘭民陰性桿菌API 2OA 厭氧菌API 20C AUX 酵由菌API STAPH 葡萄球菌和微瓊菌API已包括15個(gè)鑒定系列,700多個(gè)細(xì)菌種： 第37頁(yè)，共52頁(yè)，2022年，5月20日，15點(diǎn)6分，星期三API20E反應(yīng)判定表第38頁(yè)，共52頁(yè)，2022年，5月20日，15點(diǎn)6分，星期三API 20E鑒定卡示意圖 第39

23、頁(yè)，共52頁(yè)，2022年，5月20日，15點(diǎn)6分，星期三操 作 簡(jiǎn) 便每管接種0.1ml 濃度適中的細(xì)菌，2448h保溫，即可觀察結(jié)果。結(jié)合一些補(bǔ)充指標(biāo)，再按規(guī)定進(jìn)行編碼、檢索第40頁(yè)，共52頁(yè)，2022年，5月20日，15點(diǎn)6分，星期三Enterotube系統(tǒng) 稱(chēng)為腸道管系統(tǒng)。鑒定卡：由帶有12個(gè)分隔室的一根塑料管組成，每個(gè)分隔室內(nèi)裝有不同的培養(yǎng)基瓊脂斜面，能檢驗(yàn)微生物的15種生理生化反應(yīng)，一根接種絲穿過(guò)全部分隔室的各種培養(yǎng)基，并在塑料管的兩端突出，被兩個(gè)塑料帽蓋著，像一根火腿腸鑒定步驟：將塑料管的兩端帽子移去，用接種絲一端的突出尖端接觸平板上待鑒定的菌落中心，然后在另一端拉出接種絲，通過(guò)全

24、部分隔室，使所有培養(yǎng)基都被接種，再將一段接種絲插回到4個(gè)分隔室的培養(yǎng)基中，以保持其還原或厭氧條件。 由美國(guó)“Roche”公司開(kāi)發(fā)第41頁(yè)，共52頁(yè)，2022年，5月20日，15點(diǎn)6分，星期三Enterotube系統(tǒng)的接種過(guò)程 第42頁(yè)，共52頁(yè)，2022年，5月20日，15點(diǎn)6分，星期三“Biolog”全自動(dòng)和手動(dòng)系統(tǒng) 由美國(guó)安普科技中心（ATC US） 1989 年開(kāi)發(fā)的產(chǎn)品 ，1991 年 被 列 為 全 球 100 項(xiàng) 最 好 的 科 技 產(chǎn) 品。特點(diǎn)是自動(dòng)化，快速（424h）、準(zhǔn) 確、高效和應(yīng)用范圍廣。 關(guān)鍵部件是一個(gè)96孔細(xì)菌培養(yǎng)板。原理是利用細(xì)菌對(duì)95 種不同碳源培養(yǎng)基利用和代謝情

25、況進(jìn)行鑒 定 。 目前可鑒定 千余種菌，包括細(xì)菌、真菌、放線菌等 。 手動(dòng)系統(tǒng)以手動(dòng)形式將鑒定板的結(jié)果輸入電腦，進(jìn)行菌種的自動(dòng)鑒定。 第43頁(yè)，共52頁(yè)，2022年，5月20日，15點(diǎn)6分，星期三細(xì)菌生理生化全自動(dòng)鑒定儀第44頁(yè)，共52頁(yè)，2022年，5月20日，15點(diǎn)6分，星期三大腸菌測(cè)試卡可攜帶的檢測(cè)水中大腸菌數(shù)的大腸菌測(cè)試卡在一塊拇指大小的塑料板上，裝有一薄層脫水干燥的大腸菌選擇鑒定培養(yǎng)基，其上覆蓋微孔濾膜(0.45m)，整個(gè)塑料板有一外套統(tǒng)計(jì)濾膜上形成的蘭或綠色菌落數(shù)。菌落的多少可以表明水中污染大腸菌群的狀況第45頁(yè)，共52頁(yè)，2022年，5月20日，15點(diǎn)6分，星期三6個(gè)鑒定系統(tǒng)的優(yōu)

26、、缺點(diǎn)比較第46頁(yè)，共52頁(yè)，2022年，5月20日，15點(diǎn)6分，星期三二、快速、自動(dòng)化微生物檢測(cè)儀器和設(shè)備下述三方面測(cè)量出的數(shù)據(jù)，分別或綜合起來(lái)就能夠獲得每種微生物的特征“指紋圖”，用目測(cè)法或計(jì)算機(jī)將未知微生物的特征“指紋圖”與已知微生物的“指 紋圖”比較分析，能對(duì)未知微生物作出快速鑒定。 第一，每種微生物的化學(xué)組成都有其獨(dú)特之處，其結(jié)構(gòu)、性能有 差別，能用這些通用的儀器測(cè)量出來(lái)；第二，每種微生物代謝過(guò)程的不同，特異性的代謝產(chǎn)物，能量變換和信息傳遞的差異，也能用這類(lèi)精密儀器測(cè)量出；第三，不同的微生物對(duì)環(huán)境有著不同的影響，包括對(duì)環(huán)境中物質(zhì)的降解、能量和信息的變化等的不同，通用的這類(lèi)儀器都可用于測(cè)量分析。 第47頁(yè)，共52頁(yè)，2022年，5月20日，15點(diǎn)6分，