教學培訓-外文醫(yī)學文獻檢索工具Medline-與-PubMed課件

1、Medline 與 PubMed山西醫(yī)科大學信息檢索教研室第四章 外文醫(yī)學文獻檢索工具Medline 與 PubMed山西醫(yī)科大學信息檢索教研室Medline & PubMedIndex Medcus(1879-2006) 印刷版Medline(1969-) 國際聯機DIALOGMedline(1983-) 光盤版 PubMed(1997-) 網絡版Medline & PubMedIndex Medcus(1 第一節(jié) MEDLINE一、概況 收錄范圍：1950年至今 國立醫(yī)學圖書館(NLM) 世界權威的生物醫(yī)學文獻數據庫 70多個國家的3700多種期刊（中國50種）內容涉及生物醫(yī)學各個領域 網

2、絡檢索入口多 第一節(jié) MEDLINE一、概況一、 概況3種索引： Index Medicus (醫(yī)學索引) Index to Dental Literature(牙科索引) International Nursing Index(國際護理索引) 除了不能進行分類和中文主題詞途徑檢索外，其他與CBM(中國生物醫(yī)學文獻數據庫)相似。 一、 概況3種索引：二、數據庫結構 (數據庫常用字段)TI：Title 篇名AU：Authors 著者姓名AD：Address 著者地址SO：Source 文獻出處（刊名，年卷期頁）PY：Publication Year 出版年AB：Abstract 文摘 PT：Pu

3、blication Type 出版類型MeSH: Medical Subject Headings 醫(yī)學主題詞二、數據庫結構 (數據庫常用字段)TI：Title MJME： 主要主題詞MIME： 次要主題詞ISSN: International Standard Serial Number 國際標準連續(xù)出版號LA: Language of Article 文獻語種CP: Country of Publication 出版國AN: Accession Number 登錄號UD: Update Code 更新號二、數據庫結構 (數據庫常用字段)MJME： 主要主題詞二、數據庫結構 (數據庫常用三、

4、檢索途徑與方法自由詞檢索（Searches）索引詞檢索（Index）主題詞檢索（Thesaurus）字段檢索（Specific Fields）指定詞檢索（Add to Search）主題詞提示檢索（Suggest）三、檢索途徑與方法自由詞檢索（Searches）基本檢索索引檢索工具按鈕欄檢索區(qū)檢索 區(qū)結果顯示區(qū)主題詞檢索主題詞提示檢索界面指定詞檢索其它功能基本檢索索引檢索工具按鈕欄檢索區(qū)檢索 區(qū)結果顯示區(qū)主題詞檢四、醫(yī)學主題詞表-MeSHMedical Subject Headings使用CBM、Medline、PubMed的指南用于醫(yī)學主題詞的規(guī)范由字順表和樹狀結構表組成主題詞約2萬個，副主

5、題詞83個動態(tài)性四、醫(yī)學主題詞表-MeSHMedical Subject字順表（Alphabetic List)按字順排列提供主題詞、副主題詞、分類號注釋及相關詞樹狀結構部分詞倒置，如KIDNEY FAILURE, ACUTE幫助用戶規(guī)范和了解主題詞字順表（Alphabetic List)按字順排列主題詞樹狀結構號注釋與說明相關檢索詞副主題詞 注釋樹狀結構主題詞樹狀結構號注釋與說明相關檢索詞副主題詞 注釋樹狀結構樹狀結構表（Tree Structrue ）根據詞義范疇和學科屬性排列16類（解剖學、生物、疾病)較好的體現了詞間的隸屬、平行、派生關系一個主題詞可有多個樹狀結構號幫助用戶查找規(guī)范主題

6、詞樹狀結構表（Tree Structrue ）根據詞義范疇和學教學培訓_外文醫(yī)學文獻檢索工具Medline-與-PubMed課件教學培訓_外文醫(yī)學文獻檢索工具Medline-與-PubMed課件第二節(jié) PubMed1、主辦單位 國立醫(yī)學圖書館(NLM)2、收錄學科內容 主要收錄生物醫(yī)學和健康科學以及生命科學相關領域的文獻。包括行為科學、健康專業(yè)所需要的化學、生物工藝學，基礎研究和臨床、護理、公共衛(wèi)生、衛(wèi)生 發(fā)展或相關教育活動的內容。2000年起增加了生物、環(huán)境科學、海洋生物、植物和動物學、生物物理學和生物化學等生命科學方面的研究內容。2022/10/415第二節(jié) PubMed1、主辦單位 國立

7、醫(yī)學圖書館(NL3、文獻來源 全球70多個國家和地區(qū)近5000種生物醫(yī)學期刊涉及40多個語種47%為 本土出版文獻，90%為英文文獻，79%的文獻有著者撰寫的英文文摘2022/10/416一、數據庫概況3、文獻來源 2022/10/216一、數據庫概況4、PubMed收錄數據 MEDLINE Indexed1966 to prensent的MEDLINE已標引數據，有MeSH字段和摘要，每條記錄標有PubMed-indexed for MEDLINE OldMDENLINE1949-1965年間的MEDLINE數據，沒有MeSH字段和摘要，每條記錄標有PubMed-OLDMEDLINE for

8、 Pre1966 2022/10/417一、數據庫概況4、PubMed收錄數據 2022/10/217一、數據庫概4、PubMed收錄數據 MEDLINE Inprocess最新的MDENLINE尚未標引的處理中數據。每條記錄標有PubMed-in process。Not MEDLINE是出版商提供的電子文獻，PubMed 收錄，而MDENLINE不收錄的數據。每條記錄標有PubMed-as supplied by publisher。2022/10/418一、數據庫概況4、PubMed收錄數據 2022/10/218一、數據庫概2022/10/419基本檢索輸入框工具與資源：提供期刊數據庫檢

9、索、規(guī)范詞數據庫檢索、特定文獻檢索等高級檢索5、主頁介紹數據庫選擇2022/10/219基本檢索輸入框工具與資源：提供期刊數據2022/10/420可以在檢索欄中輸入一個或多個檢索詞（空格=AND） 如：placenta growth oxygen可以在檢索欄中輸入布爾邏輯運算式（運算符大寫） 如：asthma AND (therapy OR treatment)二、基本檢索規(guī)則2022/10/220可以在檢索欄中輸入一個或多個檢索詞（空二、PubMed 基本檢索規(guī)則字段限定符： ，按詞組匹配 如：Stem cell transplantationti截詞符：treat*強迫短語檢索符：“in

10、terleukin 2” 嚴格按輸入形式匹配，不再自動轉換匹配和擴展檢索，常用于詞組和專有名詞檢索。2022/10/421二、PubMed 基本檢索規(guī)則字段限定符： ，按詞組匹二、PubMed 基本檢索規(guī)則自動轉換匹配檢索詞：對常用醫(yī)學名詞進行自動在規(guī)范詞索引、文本詞及所有記錄字段中轉換匹配。renal failure kidney failureMESH OR kidneyAll Field OR renal failure All Field2022/10/422二、PubMed 基本檢索規(guī)則自動轉換匹配檢索詞：2022/二、PubMed 基本檢索規(guī)則自動擴展檢索：系統(tǒng)自動對主題詞、副主題

11、詞擴展檢索。如：輸入hypertension therapy，系統(tǒng)自動檢索高血壓的藥物治療（drug therapy）、飲食療法(diet therapy)2022/10/423二、PubMed 基本檢索規(guī)則自動擴展檢索：2022/10/二、PubMed 基本檢索規(guī)則著者檢索(authors)：姓全稱在前，名縮寫在后 加字段限定符如： genbacev oau moore amau2002年以后的文章可以查著者全名 如：joshua lederberg au2022/10/424二、PubMed 基本檢索規(guī)則著者檢索(authors)：2二、PubMed 基本檢索規(guī)則期刊檢索（journals

12、）：刊名全稱檢索new england journal of medicinesoMEDLINE認可的標準刊名縮寫檢索例：N Engl J Medso國際標準期刊號檢索例：0028-4793so2022/10/425二、PubMed 基本檢索規(guī)則期刊檢索（journals）：PubMed記錄字段說明2022/10/426文摘第一著者單位地址出版商提供文獻識別號著者群版權說明參考評論文獻合著者文獻參考評論定稿版校樣版輸入日期輸入完成日期電子出版日期PubMed記錄字段說明2022/10/226文摘2022/10/427電子出版日期文獻出版日期數據加入PubMed日期文獻勘誤參考文獻勘誤全部著者姓

13、名全部調研者姓名作為文章主題的著者全稱文獻相關注釋 編號基因符號期編號資助調研者資助調研單位國際標準期刊號 立醫(yī)學圖書館識別號期刊全稱2022/10/227電子出版日期2022/10/428最后修訂日期規(guī)范詞表詞規(guī)范詞確立日期系統(tǒng)組織的文摘版權擁有者題錄提供機構的識別號病史相關與原始記錄其他關鍵詞提供其他關鍵詞的機構數據提供者機構文章總頁數出版商提供數據時間期刊出版國數據庫文獻編號2022/10/228最后修訂日期2022/10/429作為主題詞的個人姓名出版狀態(tài)文獻類型出版模式（紙張或電子） 參考文獻數已撤回的文獻酶或化學物質代碼正在撤消中的文章初版文獻修訂和再版的文章子專題文檔太空署提供的

14、數據二次文獻數據庫以及文章討論的分子序列訪問號原文來源引用了病例的文獻內部處理代碼標準期刊縮寫文獻標題翻譯標題更新文獻文獻正在更新期刊卷號2022/10/229作為主題詞的個人姓名1、基本檢索 2、高級檢索3、MeSH數據庫檢索4、期刊檢索5、臨床咨詢2022/10/430三、檢索方法1、基本檢索 2022/10/230三、檢索方法2022/10/431綜述免費全文輸入多個檢索詞placenta growth oxygen2022/10/231綜述免費全文輸入多個檢索詞2022/10/432字段限定 stem cell transplantationti2022/10/232字段限定2022/

15、10/433stem cellti AND transplantationti比空格多檢出400篇2022/10/233stem cellti AND t2022/10/434輸入renal failure自動轉換匹配檢索詞2022/10/234輸入renal failure自動轉換2022/10/435自動擴展檢索2022/10/235自動擴展檢索2022/10/436著者檢索moore amau2022/10/236著者檢索2022/10/437期刊檢索: New england journal of medicineso 2022/10/237期刊檢索: New england j教學培

16、訓_外文醫(yī)學文獻檢索工具Medline-與-PubMed課件主題詞約2萬個，副主題詞83個AN: Accession Number 登錄號多欄復合檢索時，檢索框中只能輸入檢索詞，不能輸入檢索式四、醫(yī)學主題詞表-MeSH山西醫(yī)科大學信息檢索教研室由字順表和樹狀結構表組成包括SCI Expanded、SSCI、A&HCI三個數據庫全文、免費全文、摘要限定嚴格按輸入形式匹配，不再自動轉換匹配和擴展檢索，常用于詞組和專有名詞檢索。索引詞檢索（Index）全世界最大、最全面的化學化工領域的學術信息數據庫除了不能進行分類和中文主題詞途徑檢索外，其他與CBM(中國生物醫(yī)學文獻數據庫)相似。例：0028-47

17、93so使用CBM、Medline、PubMed的指南MEDLINE IndexedIndex Medicus (醫(yī)學索引)MeSH: Medical Subject Headings 醫(yī)學主題詞MEDLINE: （最完整，有標識符）2、高級檢索在一個網頁中集基本檢索、檢索 、多欄復合檢索、索引查詢、邏輯算符選擇、檢索限制于一體 檢索史中顯示歷次檢索式、時間和檢出篇數 多欄復合檢索時，檢索框中只能輸入檢索詞，不能輸入檢索式 利用字段限制和邏輯算符，構建復雜檢索式2022/10/439主題詞約2萬個，副主題詞83個2、高級檢索在一個網頁中集基本檢索 （Search History）以列表形式顯示

18、歷次檢索式、檢索時間和檢出篇數Preview:系統(tǒng)不顯示命中文獻信息，而在History中直接顯示檢索式和檢出篇數。2022/10/4復旦大學圖書館文獻檢索教研室40檢索式檢索時間檢出篇數檢索式編號可替代檢索式進行輸入檢索如：#17 AND therapy檢索 （Search History）2022/10/22022/10/441索引查詢欄間邏輯組配查找Patrick Concannon于 年發(fā)表在The New England Journal of Medicine上的綜述。多欄復合檢索concannon p欄內不能輸算符，檢索詞間空格默認AND運算2022/10/241索引查詢欄間邏輯組

19、配查找Patrick檢索限制(Limit)全文、免費全文、摘要限定研究對象人/動物限制性別限制文獻類型限制語種限制子文檔限制年齡限制2022/10/442檢索限制(Limit)全文、免費全文、摘要限定2022/102022/10/443全文、免費全文、摘要限定Limit 檢索限制研究對象人/動物限定語種限定子文檔限定性別限定年齡限定文獻類型限定2022/10/243全文、免費全文、摘要限定Limit 構建檢索式構建檢索式索引查詢（Index）2022/10/445索引查詢（Index）2022/10/245Details （檢索的詳細匹配過程）顯示檢索詞轉換匹配運算詳細過程用途：轉換、確定規(guī)范

20、詞 如：liver cancer liver neoplasms修改檢索策略2022/10/446Details （檢索的詳細匹配過程）2022/10/2462022/10/447檢索明細數據庫匹配過程檢索詞轉換顯示用戶輸入的檢索式 2022/10/247檢索明細數據庫匹配過程檢索詞轉換顯示用3、Mesh Database 確定規(guī)范化主題詞查看主題詞詞義注釋樹狀結構表選擇副主題詞擴展主題詞確定主要主題詞檢索（加權檢索）2022/10/4483、Mesh Database 確定規(guī)范化主題詞2022進入 MeSH進入 MeSH檢索實例1：2006-09年有關舌根癌的治療進展。要求： 用MeSH D

21、atabse(主題詞表選詞)檢索PubMed數據庫，并用自由詞檢索09年以來發(fā)表的最新文獻。2022/10/450檢索實例1：2006-09年有關舌根癌的治療進展。2022/課題：提示舌根癌的不同表達形式：tongue base cancer、cancer/carcinoma/tumor of tongue base、cancer of the base of tongue治療包括：drug therapy、therapy、surgery、radiotherapy、rehabilitation2022/10/451課題：提示舌根癌的不同表達形式：2022/10/2512022/10/45220

22、22/10/2522022/10/453輸入舌根的自由詞檢索式，與舌腫瘤治療的檢索式進行AND運算。2022/10/253輸入舌根的自由詞檢索式，與舌腫瘤治療的2022/10/454初步結果，未限定年份進入高級檢索進一步限定2022/10/254初步結果，未限定年份進入高級檢索進一步2022/10/4552022/10/2552022/10/456檢索結果2022/10/256檢索結果4、 Journal database檢索 通過輸入刊名全稱或縮寫等了解該刊基本情況瀏覽期刊上發(fā)表的文獻獲得相關期刊信息提供電子全文的超鏈按鈕2022/10/4574、 Journal database檢索 20

23、22/102022/10/458期刊數據庫檢索2022/10/258期刊數據庫檢索2022/10/459輸入待檢期刊名獲得期刊詳細信息相關期刊鏈接 2022/10/259輸入待檢期刊名獲得期刊詳細信息相關期刊5、臨床咨詢（Clinical Queries)專門檢索臨床研究方面文獻，可進行治療、診斷、病因、預后及臨床實踐指南五個類目限制，并選擇強調查全還是強調查準2022/10/4605、臨床咨詢（Clinical Queries)專門檢索臨床出版模式（紙張或電子）BA(Biological Abstracts)Biosis Previews輸出方式(Send to)SO：Source 文獻出處

24、（刊名，年卷期頁）UD: Update Code 更新號1907年至今CA的全部內容、Medline的生物醫(yī)學文獻以及歐美30多家專利機構的信息1949-1965年間的MEDLINE數據，沒有MeSH字段和摘要，每條記錄標有可以在檢索欄中輸入布爾邏輯運算式（運算符大寫）2006-09年有關舌根癌的治療進展。BIOSIS Previews主題詞提示檢索（Suggest）基于Web版的生物醫(yī)學與藥學數據庫SO：Source 文獻出處（刊名，年卷期頁）International Nursing Index(國際護理索引)PT：Publication Type 出版類型2022/10/461查找系統(tǒng)評

25、價（Systematic Reviews)出版模式（紙張或電子）2022/10/261查找系統(tǒng)評價（S五、其它服務PubMed Central (PMC)Single Citation Matcher生物信息數據庫OMIMGeneBLASTGenome3D Domains2022/10/462StructureTaxonomyNucleotideProteinBookshelf五、其它服務PubMed Central (PMC)2022進入PubMed Centre下拉主頁滾動條至低進入PubMed Centre下拉主頁滾動條至低PMC首頁進入高級檢索2022/10/464PMC首頁進入高級檢

26、索2022/10/264查找腎衰竭的藥物療法2022/10/465全文鏈接查找腎衰竭的藥物療法2022/10/265全文鏈接六、檢索結果輸出顯示檢索結果全文獲取保存檢索結果保存檢索策略2022/10/466六、檢索結果輸出顯示檢索結果2022/10/266顯示字段選擇（Display）Summary：標題、著者、出處、ID號Abstract: 來源期刊、標題、著者、著者地址、記錄性質、文獻類型、勘誤、評論、PMID或UI、摘要、MeSH詞等 。MEDLINE: （最完整，有標識符）2022/10/467顯示字段選擇（Display）Summary：標題、著者、出2022/10/468顯示格式選

27、擇顯示格式（Display Settings）點擊標題顯示文摘增強格式排序方式選擇6篇有免費全文2022/10/268顯示格式選擇顯示格式（Display 2022/10/469文摘增強格式相關論文論文涉及的MeSH詞，文獻類型等信息LinkOut外部資源鏈接收費全文鏈接，我校訂購的數據庫可鏈出全文其他相關的網上免費醫(yī)學指南信息2022/10/269文摘增強格式相關論文論文涉及的MeSH下載全文下載全文2022/10/471輸出方式(Send to)輸出方式選擇2022/10/271輸出方式(Send to)輸出方式選擇輸出方式選擇（send to）File：保存檢索結果Clipboard:

28、剪貼板，多次檢索，可暫存每次檢索需下載的記錄，最后一起保存。 最多允許存儲500條，保留8小時 Email: 通過郵件發(fā)送Collections：將檢索結果送至My NCBI中Order：全文傳遞服務，需帳號、收費 2022/10/472輸出方式選擇（send to）File：保存檢索結果2022Medline與PubMed的區(qū)別收錄范圍不同數據更新周期不同檢索功能的區(qū)別Pubmed帶有網絡鏈接功能檢索結果輸出方式的區(qū)別Pubmed部分帶有全文鏈接Medline與PubMed的區(qū)別收錄范圍不同其它外文檢索工具IM(Index Medicus)Medline,PubMedBA(Biological Abstracts)Biosis PreviewsCA(Cemical Abstracts)SciFinder Schola