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1、專題2微生物的培養(yǎng)與應(yīng)用課題2土壤中分解尿素的細(xì)菌的分離與計(jì)數(shù) 課題背景1、尿素的利用 尿素是一種重要的農(nóng)業(yè)氮肥。尿素不能直接被農(nóng)作物吸收。土壤中的細(xì)菌將尿素分解成氨之后才能被植物利用。2、細(xì)菌利用尿素的原因土壤中的細(xì)菌分解尿素是因?yàn)樗鼈兡芎铣呻迕窩O(NH2)2+H2OCO2+2NH3脲酶 H2O尿素: CO(NH2)23、常見的分解尿素的微生物芽孢桿菌、小球菌、假單胞桿菌、克氏桿菌、棒狀桿菌、梭狀芽孢桿菌;某些真菌和放線菌也能分解尿素。4、課題目的從土壤中分離出能夠分解尿素的細(xì)菌;統(tǒng)計(jì)每克土壤樣品中究竟含有多少這樣的細(xì)菌。一、研究思路、篩選菌株、統(tǒng)計(jì)菌落數(shù)目、設(shè)置對(duì)照1、實(shí)例: 尋找目的菌

2、種時(shí)要根據(jù)它對(duì)生存環(huán)境的要求,到相應(yīng)的環(huán)境中去尋找。原因:因?yàn)闊崛獪囟?0800C,淘汰了絕大多數(shù)微生物,只有Taq細(xì)菌被篩選出來(lái)。 DNA多聚酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)是一種在體外將少量DNA大量復(fù)制的技術(shù),此項(xiàng)技術(shù)要求使用耐高溫(930C)的DNA聚合酶。、篩選菌株 科學(xué)家在熱泉中找到了耐熱細(xì)菌Taq,并從水生耐熱細(xì)菌Taq中分離到耐高溫的Taq DNA聚合酶。 去哪里尋找這種耐高溫的DNA聚合酶? 為什么Taq細(xì)菌能從熱泉中被篩選出來(lái)?啟示: 利用選擇培養(yǎng)基分離。在微生物學(xué)中,將允許特定種類的微生物生長(zhǎng),同時(shí)抑制或阻止其他種類微生物生長(zhǎng)的培養(yǎng)基,稱做選擇培養(yǎng)基。實(shí)例 例1、固氮微生物:用無(wú)氮培

3、養(yǎng)基分離; 例2、酵母菌和霉菌:用含青霉素的培養(yǎng)基分離; 例3、分解尿素的細(xì)菌:用尿素是唯一氮源的培養(yǎng)基分離。2、實(shí)驗(yàn)室中微生物的篩選原理: 人為提供有利于目的菌株生長(zhǎng)的條件(包括營(yíng)養(yǎng)、溫度、pH等),同時(shí)抑制或阻止其他微生物生長(zhǎng)。、篩選菌株方法:瓊脂 15.0g尿素CO(NH2)2 1.0g葡萄糖 10.0gMgSO47H2O 0.2gNaH2PO4 2.1g KH2PO4 1.4g3、土壤中分解尿素的細(xì)菌的分離與計(jì)數(shù)所需培養(yǎng)基:、篩選菌株培養(yǎng)基組成 H2O定容至1000ml3、土壤中分解尿素的細(xì)菌的分離與計(jì)數(shù)所需培養(yǎng)基:從物理性質(zhì)看,此培養(yǎng)基屬于哪類?從功能上看,此培養(yǎng)基屬于哪類?、篩選菌

4、株在此培養(yǎng)基中哪些作為碳源、氮源?思考瓊脂 15.0g尿素CO(NH2)2 1.0g葡萄糖 10.0gMgSO47H2O 0.2gNaH2PO4 2.1g KH2PO4 1.4g3、土壤中分解尿素的細(xì)菌的分離與計(jì)數(shù)所需培養(yǎng)基:、篩選菌株培養(yǎng)基組成提供的主要營(yíng)養(yǎng) H2O定容至1000ml無(wú)機(jī)鹽碳源氮源凝固劑氫元素、氧元素碳源 固體培養(yǎng)基 選擇培養(yǎng)基 尿素是唯一氮源 培養(yǎng)基的氮源為尿素,只有能合成脲酶的微生物才能分解尿素,以尿素作為氮源。 不能合成脲酶的微生物由于不能分解尿素,缺乏氮源而不能生長(zhǎng)發(fā)育繁殖,而受到抑制,所以用此培養(yǎng)基就能夠選擇出分解尿素的微生物。4、培養(yǎng)基篩選分解尿素的微生物的原理、

5、篩選菌株1、顯微鏡直接計(jì)數(shù): 利用血球計(jì)數(shù)板,在顯微鏡下計(jì)算一定容積里樣品中微生物的數(shù)量。、統(tǒng)計(jì)菌落數(shù)目:不能區(qū)分死菌與活菌;不適于對(duì)運(yùn)動(dòng)細(xì)菌的計(jì)數(shù);需要相對(duì)高的細(xì)菌濃度;個(gè)體小的細(xì)菌在顯微鏡下難以觀察;缺點(diǎn):2.間接計(jì)數(shù)法(活菌計(jì)數(shù)法)常用方法:稀釋涂布平板法。原理:在稀釋度足夠高時(shí),微生物在固體培養(yǎng)基上所形成的一個(gè)菌落是由一個(gè)單細(xì)胞繁殖而成的,即一個(gè)菌落代表原先的一個(gè)單細(xì)胞。、統(tǒng)計(jì)菌落數(shù)目: 為了保證結(jié)果準(zhǔn)確,一般選擇菌落數(shù)在30300的平板上進(jìn)行計(jì)數(shù)。 為使結(jié)果接近真實(shí)值,可將同一稀釋度加到三個(gè)或三個(gè)以上的平板中(設(shè)立重復(fù)組),經(jīng)涂布,培養(yǎng),計(jì)算出菌落平均數(shù)。 統(tǒng)計(jì)的菌落數(shù)往往比活菌的實(shí)

6、際數(shù)目低。這是因?yàn)楫?dāng)兩個(gè)或多個(gè)細(xì)胞連在一起時(shí),平板上觀察到的只是一個(gè)菌落。、統(tǒng)計(jì)菌落數(shù)目:2.間接計(jì)數(shù)法(活菌計(jì)數(shù)法)(稀釋涂布平板法)注意事項(xiàng)、統(tǒng)計(jì)菌落數(shù)目:2.間接計(jì)數(shù)法(活菌計(jì)數(shù)法)(稀釋涂布平板法) P22實(shí)例第一位同學(xué)稀釋度第二位同學(xué)106 (M)106 (M)1132菌落數(shù) 平板平板23021212256平均值 163 (C)討論你認(rèn)為哪位同學(xué)的結(jié)果更接近真實(shí)值?你認(rèn)為這兩位同學(xué)的實(shí)驗(yàn)需要改進(jìn)嗎?如果需要,怎樣改進(jìn)?2.間接計(jì)數(shù)法(活菌計(jì)數(shù)法)(稀釋涂布平板法)每克樣品中的菌落數(shù)(CV)M其中,C代表某一稀釋度下平板上生長(zhǎng)的平均菌落數(shù),V代表涂布平板時(shí)所用的稀釋液的體積(ml),M

7、代表稀釋倍數(shù)。、統(tǒng)計(jì)菌落數(shù)目:P22想一想,如何根據(jù)平板上的菌落數(shù)推測(cè)每克樣品中的菌落數(shù)? 統(tǒng)計(jì)某一稀釋度(M)下平板上生長(zhǎng)的菌落數(shù),最好統(tǒng)計(jì)3個(gè)平板,計(jì)算出平板上的菌落數(shù)的平均值(C),然后按以下公式進(jìn)行計(jì)算。計(jì)數(shù)法直接計(jì)數(shù)法、平板計(jì)數(shù)法、比濁法、膜過濾法、統(tǒng)計(jì)菌落數(shù)目:例題:統(tǒng)計(jì)菌落數(shù)目的方法有 ( )A. B. C. D.D涂布平板法 重量法 直接計(jì)數(shù)法 比濁法 生理指標(biāo)法 膜過濾法 是排除實(shí)驗(yàn)組中非測(cè)試因素對(duì)實(shí)驗(yàn)結(jié)果的影響,提高實(shí)驗(yàn)結(jié)果的可信度。、設(shè)置對(duì)照: 在做分解尿素的細(xì)菌的篩選與統(tǒng)計(jì)菌落數(shù)目的實(shí)驗(yàn)時(shí),A同學(xué)從對(duì)應(yīng)的106倍稀釋的培養(yǎng)基中篩選出大約150個(gè)菌落,但是其他同學(xué)在同樣的

8、稀釋度下只選擇出大約50個(gè)菌落。分析A同學(xué)的結(jié)果。 土樣不同,培養(yǎng)基污染或操作失誤(或者是混入了其他的含氮物質(zhì)) 是指除了被測(cè)試的條件以外,其他條件都相同的實(shí)驗(yàn)。1、對(duì)照實(shí)驗(yàn)2、設(shè)置對(duì)照的主要目的原因: P23實(shí)例小結(jié):通過這個(gè)事例可以看出,實(shí)驗(yàn)結(jié)果要有說服力,對(duì)照的設(shè)置是必不可少的。方案一:由其他同學(xué)用與A同學(xué)相同土樣進(jìn)行實(shí)驗(yàn) 方案二:將A同學(xué)配制的培養(yǎng)基在不加土樣(未接種)的情況下進(jìn)行培養(yǎng),作為空白對(duì)照,以證明培養(yǎng)基是否受到污染。結(jié)果預(yù)測(cè):如果結(jié)果與A同學(xué)一致,則證明A無(wú)誤;如果結(jié)果不同,則證明A同學(xué)存在操作失誤或培養(yǎng)基的配制有問題。、設(shè)置對(duì)照:(一)、土壤取樣(二)、制備培養(yǎng)基二、設(shè)計(jì)實(shí)

9、驗(yàn)(五)、微生物的培養(yǎng)與觀察(三)、樣品的稀釋(四)、取樣涂布(一)、土壤取樣 從肥沃、濕潤(rùn)的土壤中取樣。先鏟去表層土3cm左右,再取樣,將樣品裝入事先準(zhǔn)備好的信封中。取土樣用的小鐵鏟和盛土樣的的信封在使用前都要滅菌。(二)、制備培養(yǎng)基:制備以尿素為唯一氮源的選擇培養(yǎng)基。二、設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)應(yīng)在火焰旁稱取土壤10g。在稀釋土壤溶液的過程中,每一步都要在火焰旁進(jìn)行分離不同的微生物采用不同的稀釋度原因:不同微生物在土壤中含量不同目的:保證獲得菌落數(shù)在30300之間、適于計(jì)數(shù)的平板(三)、樣品的稀釋 為什么分離不同的微生物要采用不同的稀釋度?測(cè)定土壤中細(xì)菌的總量和測(cè)定土壤中能分解尿素的細(xì)菌的數(shù)量,選用的稀釋

10、范圍相同嗎?這是因?yàn)橥寥乐懈黝愇⑸锏臄?shù)量(單位:株/kg)是不同的。例如在干旱土壤中的上層樣本中:好氧及兼性厭氧細(xì)菌數(shù)約為2185萬(wàn),放線菌數(shù)約為477萬(wàn),霉菌數(shù)約為23.1萬(wàn)。因此,為獲得不同類型的微生物,就需要按不同的稀釋度進(jìn)行分離,同時(shí)還應(yīng)當(dāng)有針對(duì)性地提供選擇培養(yǎng)的條件。P24 土壤中的細(xì)菌總量肯定多于土壤中能分解尿素的細(xì)菌的總量,因此選用的稀釋范圍肯定不同。實(shí)驗(yàn)時(shí)要對(duì)培養(yǎng)皿作好標(biāo)記。注明培養(yǎng)基類型、培養(yǎng)時(shí)間、稀釋度、培養(yǎng)物等。如果得到了2個(gè)或2個(gè)以上菌落數(shù)目在30300的平板,則說明稀釋操作比較成功,并能夠進(jìn)行菌落的計(jì)數(shù),如果同一稀釋倍數(shù)的三個(gè)重復(fù)的菌落數(shù)相差較大,表明試驗(yàn)不精確,需

11、要重新實(shí)驗(yàn)。(四)、取樣涂布2、在菌落計(jì)數(shù)時(shí),每隔24h統(tǒng)計(jì)一次菌落數(shù)目。選取菌落數(shù)目穩(wěn)定時(shí)的記錄作為結(jié)果,以防止因培養(yǎng)時(shí)間不足而導(dǎo)致遺漏菌落的數(shù)目。 1、培養(yǎng)不同微生物往往需要不同培養(yǎng)溫度。細(xì)菌:3037培養(yǎng)12d放線菌:2528培養(yǎng)57d霉菌:2528的溫度下培養(yǎng)34d。(五)、微生物的培養(yǎng)與觀察(五)、微生物的培養(yǎng)與觀察3、一般來(lái)說,在一定的培養(yǎng)條件下,(相同的培養(yǎng)基、溫度及培養(yǎng)時(shí)間),同種微生物表現(xiàn)出穩(wěn)定的菌落特征(包括形態(tài)、大小、隆起程度和顏色)。(五)、微生物的培養(yǎng)與觀察三、結(jié)果分析與評(píng)價(jià)1、是否有雜菌污染3、樣品的稀釋操作4、重復(fù)組的結(jié)果2、選擇培養(yǎng)基是否篩選出菌落1.通過對(duì)照實(shí)

12、驗(yàn),若培養(yǎng)物有雜菌污染,菌落數(shù)偏高;若培養(yǎng)物混入其他氮源,則菌落形態(tài)多樣,菌落數(shù)偏高,難以選擇出分解尿素的微生物。2.提示:選擇每個(gè)平板上長(zhǎng)有30300個(gè)菌落的稀釋倍計(jì)算每克樣品的菌數(shù)最合適。同一稀釋倍數(shù)的三個(gè)重復(fù)的菌落數(shù)不能相差懸殊,如相差較大,表示實(shí)驗(yàn)不精確。三、結(jié)果分析與評(píng)價(jià)四、操作提示 無(wú)菌操作 做好標(biāo)記 規(guī)劃時(shí)間 在以尿素為唯一氮源的培養(yǎng)基中加入酚紅指示劑。培養(yǎng)某種細(xì)菌后,如果PH升高,指示劑將變紅,說明該細(xì)菌能夠分解尿素。五、課外延伸CO(NH2)2+H2OCO2+2NH3 H2O脲酶細(xì)菌合成脲酶,將尿素分解成氨,使培養(yǎng)基堿性增強(qiáng), PH升高,因此,可通過檢測(cè)PH的變化來(lái)判斷該化學(xué)

13、反應(yīng)是否發(fā)生。2、方法:1、原理:對(duì)分裂的菌種作進(jìn)一步的鑒定用生物化學(xué)方法鑒定測(cè)定飲水中大腸桿菌數(shù)量的方法是將一定體積的水用細(xì)菌過濾器過濾后,將濾膜放到 伊紅美藍(lán) 培養(yǎng)基上培養(yǎng),大腸桿菌菌落呈現(xiàn)黑色,通過記述得出水樣中大腸桿菌的數(shù)量。五.課外延伸鑒定大腸桿菌大腸桿菌在伊紅美藍(lán)瓊脂(EMB)上典型特征 大腸桿菌呈 黑色中心 ,有或無(wú)金屬光澤本課題知識(shí)小結(jié):1.使用選擇培養(yǎng)基的目的是( ) A.培養(yǎng)細(xì)菌 B.培養(yǎng)真菌 C.使需要的微生物大量繁殖 D.表現(xiàn)某微生物的特定性狀與其他微生物加以區(qū)別2.能合成脲酶的微生物所需要的碳源和氮源分別是( ) A.CO2和N2 B.葡萄糖和NH3 C.CO2和尿素 D.葡萄糖和尿素實(shí)踐訓(xùn)練CD3.下列說法不正確的是( ) A.科學(xué)家從7080度熱泉中分離到耐高

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