生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)系統(tǒng)

1、生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)系統(tǒng)網(wǎng) 絡(luò)網(wǎng)絡(luò)生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)系統(tǒng)CNKI , VIPPUBMEDGATEWAY ENTREZOVID 中國(guó)知識(shí)基礎(chǔ)設(shè)施工程，China National Knowledge Infrastructure，簡(jiǎn)稱CNKI工程，是以實(shí)現(xiàn)全社會(huì)知識(shí)信息資源共享為目標(biāo)的國(guó)家信息化重點(diǎn)工程，被國(guó)家科技部等五部委確定為“國(guó)家級(jí)重點(diǎn)新產(chǎn)品重中之重”項(xiàng)目。CNKI工程1995年開始啟動(dòng)，是牽動(dòng)全社會(huì)知識(shí)信息資源共建共享的浩大信息化工程，廣泛涉及全國(guó)傳統(tǒng)出版物與非出版物、音像電子出版物資源的數(shù)字化建設(shè)與網(wǎng)絡(luò)出版、全球互聯(lián)網(wǎng)資源的專業(yè)化整合、多媒體教育教學(xué)資源庫(kù)的研制、信息資源共享技術(shù)開發(fā)以及網(wǎng)絡(luò)會(huì)議

2、、網(wǎng)絡(luò)教學(xué)等資源交互式應(yīng)用系統(tǒng)的開發(fā)等有關(guān)產(chǎn)業(yè)、技術(shù)、經(jīng)濟(jì)、法律諸多領(lǐng)域。CNKI VIP資訊 有中文科技期刊數(shù)據(jù)庫(kù)、外文科技期刊數(shù)據(jù)庫(kù)、中文科技期刊引文數(shù)據(jù)庫(kù)及中國(guó)科技經(jīng)濟(jì)新聞數(shù)據(jù)庫(kù)收錄有中文期刊12000種,中文報(bào)紙1000種,外文期刊4000種,覆蓋自然科學(xué)、社會(huì)科學(xué)、工程技術(shù)、醫(yī)藥衛(wèi)生、教育研究、農(nóng)業(yè)科學(xué)等各個(gè)科研領(lǐng)域。 PubMed Pubmed是NLM的國(guó)家生物技術(shù)信息中心(NCBI)開發(fā)，于97年5月推出，用于檢索網(wǎng)上生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)信息的檢索軟件。具有收錄范圍廣，內(nèi)容全，檢索途徑多，檢索體系完備等特點(diǎn)。99年8月PubMed加入NCBI開發(fā)的Entrez通用瀏覽器，更換了檢索界面。

3、1、 MDLINE Web 檢索特點(diǎn):免費(fèi)提供題錄和文摘可與提供原文的網(wǎng)址鏈接提供檢索詞自動(dòng)轉(zhuǎn)換匹配檢索規(guī)范，操作簡(jiǎn)便 一、PUBMED概況MEDLINE Web (FREE) PubMed (/PubMed)Internet Grateful Med (BioMedNet Evaluated Medline ()Healthgate Medline ()2、PubMed 與MEDLINE的區(qū)別收錄范圍廣：比MEDLINE收錄的內(nèi)容多，增加了AIDS、Bioethics等收錄記錄新：在MEDLINE數(shù)據(jù)標(biāo)引前的最新題錄文獻(xiàn)類型全：提供電子原文鏈接（部分免費(fèi)）Automatic Term Map

4、ping自動(dòng)轉(zhuǎn)換匹配功能 對(duì)于輸入檢索框中的檢索詞，Pubmed將按一定的詞表順序進(jìn)行對(duì)照、匹配和轉(zhuǎn)換，然后進(jìn)行檢索。順序?yàn)椋篗eSH轉(zhuǎn)換表、期刊刊名轉(zhuǎn)換表、短語表、著者索引。如果在上述表中都找不到相匹配的詞，Pubmed將把短語分開，以單詞為單位，分別重復(fù)以上過程，各詞間的關(guān)系是“AND”邏輯關(guān)系。 3、檢索原理 4、PubMed頁(yè)面的結(jié)構(gòu) 檢索區(qū) 檢索庫(kù)選擇行（相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)鏈接）、檢索行、檢索輔助行檢索提示區(qū)對(duì)各項(xiàng)檢索功能的簡(jiǎn)單描述其它功能區(qū)Entrez簡(jiǎn)介、 PubMed服務(wù)、特有檢索、相關(guān)資源1、 檢索框中輸入:一個(gè)或多個(gè)檢索詞(系統(tǒng)默認(rèn)空格為AND檢索)著者姓名,姓在前,名在后,如:s

5、mith ab刊名可輸全稱，或MEDLINE認(rèn)可的標(biāo)準(zhǔn)縮寫形式布爾邏輯運(yùn)算式： (運(yùn)算符須大寫） 如 (hepatitis b OR hepatitis c) AND gene 二、 基本檢索功能2、其它截詞檢索：treat*強(qiáng)迫短語檢索：“brca 1”（不再自動(dòng)轉(zhuǎn)換匹配和擴(kuò)展檢索）自動(dòng)擴(kuò)展檢索系統(tǒng)自動(dòng)對(duì)主題詞、副主題詞進(jìn)行擴(kuò)展檢索，如：輸入“hypertension therapy,系統(tǒng)自動(dòng)將高血壓的藥物治療、飲食療法Limits（檢索限制選擇） 字段限制：著者、刊名、篇名等 數(shù)據(jù)輸入時(shí)間：默認(rèn)檢索可回溯到1966年，限 制選擇30天-10年 7種文獻(xiàn)類型限制： 7種語種： 12種子文檔：

6、(01年新增2種Space Life Sciences and Bioethics ） 3、檢索輔助行Previw/index（檢索策略預(yù)覽）瀏覽檢索式改變檢索式可用邏輯算符組配瀏覽索引（index）Index（索引字順表）選擇限制字段輸入檢索詞（詞根）在字順表中選擇檢索詞選用邏輯算符建立檢索式點(diǎn)擊GOHistory（檢索史）檢索式回顧編輯檢索式 如#3 AND child修改檢索策略1.檢索框中隨時(shí)修改2.“Limit” 、 “Preview/index”、 “History” “Details”功能鍵實(shí)現(xiàn)。 4、檢索結(jié)果輸出顯示檢索結(jié)果保存檢索結(jié)果保存檢索策略打印檢索結(jié)果顯示格式選擇（Di

7、splay)Summary :著者、標(biāo)題、來源期刊、 記錄性質(zhì)、年、卷、期、頁(yè)、相關(guān)文獻(xiàn)鏈接。Abstract : 顯示除上述內(nèi)容外，加摘要、著者單位、語種等字段。MEDLINE : Medline 數(shù)據(jù)庫(kù)全記錄形式Brief: 僅有第一著者、篇名、順序號(hào)Clipboard（剪貼板）（Clip)允許存儲(chǔ)500條題錄(01年增加到1000條）選中題錄（或文摘）點(diǎn)擊 clip Add多項(xiàng)檢索后一起保存 保存檢索結(jié)果Clipboard（剪貼板）（Clip)允許存儲(chǔ)500條題錄(01年增加到1000條）選中題錄（或文摘）點(diǎn)擊 clip Add多項(xiàng)檢索后一起保存 三、其它檢索功能 MeSH Databa

8、se：主題詞數(shù)據(jù)庫(kù) Clinical Queries：臨床咨詢 Journal Database：期刊數(shù)據(jù)庫(kù) Citation Matcher：引文匹配器Cubby: 小倉(cāng)庫(kù) 1、 MeSH Database 功能：確定規(guī)范檢索詞查看詞義注釋、樹狀結(jié)構(gòu)表Simple display 不能限定副主題詞或進(jìn)行其他修飾檢索Detailed display 副主題詞、擴(kuò)展、主要主題詞 2、Clinical Queries臨床咨詢 治療（therapy)研究范疇 診斷(diagnosis) (Category) 病因(etiology) 預(yù)后(prognosis) 強(qiáng)調(diào)程度 靈敏度Sensitivity

9、(Emphasis) 專指度Specificity3、Journal Database期刊數(shù)據(jù)庫(kù) 了解某一期刊的詳細(xì)內(nèi)容或查找該期刊上發(fā)表的文章?？煞謩e以期刊的全名或名稱某個(gè)詞、期刊名稱在MEDLINE的縮寫或ISSN號(hào)來檢索；提供電子原文的超鏈鍵。 。4、引文匹配器（Citation Matcher） 輸入題錄信息，查找特定文獻(xiàn)進(jìn)行補(bǔ)缺?？獪?zhǔn)確，縮寫要標(biāo)準(zhǔn)著者姓名大小寫不敏感如查找：Taiwan I Hsueh Hui Chih由Chang PY（taiwan yi xue za zhi ) 撰寫、 1975 發(fā)表文獻(xiàn)的其他著者PubMed檢索步驟1、進(jìn)入PubMed檢索界面2、首先使用

10、“Limit”限制檢索字段、年限、數(shù)據(jù)庫(kù)、文獻(xiàn)類型等3、選擇檢索途徑:基本檢索/高級(jí)檢索/期刊/MeSH/臨床咨詢 4、瀏覽、修改檢索結(jié)果5、選擇格式并下載檢索如檢索近二年有關(guān)乳腺癌（Breast Cancer）治療的文獻(xiàn)分析課題，明確檢索要求選擇數(shù)據(jù)庫(kù)-PubMed進(jìn)行限制（Limit),時(shí)間，文獻(xiàn)類型檢索式：乳腺癌 and 治療 breast neoplasms AND (drug therapy OR radiotherapy OR therapy)Nucleotide 核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù)（GenBank）BLAST 序列分析數(shù)據(jù)庫(kù)Protein - 蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù) Structure - 大

11、分子三維 結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)Genome - 基因組數(shù)據(jù)庫(kù) Omim - 孟德爾人類遺傳數(shù)據(jù)庫(kù) Tsxomomy - 生物分類數(shù)據(jù)庫(kù) PMC-期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù)（100+種） BOOKS- 圖書全文數(shù)據(jù)庫(kù)（26本）附：ENTREZ的其它數(shù)據(jù)庫(kù)檢索實(shí)例（P158）1、利用Nucleotide(核酸序列數(shù)據(jù)庫(kù))檢索人類血小板生長(zhǎng)因子受體抗癌基因(pdgf human receptor)的核酸序列 報(bào)告。2、 利用BLAST(序列分析數(shù)據(jù)庫(kù))查找pdgf human receptor 的類似序列。3、利用OMIM庫(kù)查找ACTH deficiency病的基因圖譜NLM GATEWAY 2000年10月16日正式向

12、公眾開放由國(guó)立Lister Hill 生物醫(yī)學(xué)傳播中心建立可以在一個(gè)界面上同時(shí)檢索NLM的多個(gè)檢索系統(tǒng)或數(shù)據(jù)庫(kù)，如Pubmed/Medline, Medlineplus, Oldmedline, Dirline, Locatorplus等，內(nèi)容涉及期刊論文、出版物信息、患者教育、會(huì)議文獻(xiàn) 等。Gateway檢索方法默認(rèn)主題檢索，多個(gè)詞自動(dòng)以and組配，詞組加引號(hào)字段限定檢索，方括弧中注明字段縮寫，如主題詞mh，著者au，篇名ti主題途徑，使用Find Terms，有規(guī)范主題詞、選擇副主題詞、顯示樹狀結(jié)構(gòu)、進(jìn)行擴(kuò)展檢索等功能其它：邏輯運(yùn)算、限制功能提供檢索服務(wù)的數(shù)據(jù)庫(kù)期刊文獻(xiàn)（Journal Citation）： Medline/Pubmed(1966） Oldmedline (19581965)圖書、連續(xù)出版物、聲像資料目錄 （Book