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1、.:.;緒論思索題:P9從廣義和狹義上寫(xiě)出分子生物學(xué)的定義?廣義上講的分子生物學(xué)包括對(duì)蛋白質(zhì)和核酸等生物大分子構(gòu)造與功能的研討,以及從分子程度上闡明生命的景象和生物學(xué)規(guī)律。狹義的概念,即將分子生物學(xué)的范疇偏重于核酸基因的分子生物學(xué),主要研討基因或DNA構(gòu)造與功能、復(fù)制、轉(zhuǎn)錄、表達(dá)和調(diào)理控制等過(guò)程。其中也涉及與這些過(guò)程相關(guān)的蛋白質(zhì)和酶的構(gòu)造與功能的研討。 2、現(xiàn)代分子生物學(xué)研討的主要內(nèi)容有哪幾個(gè)方面?什么是反向生物學(xué)?什么是后基因組時(shí)代? 研討內(nèi)容: DNA的復(fù)制、轉(zhuǎn)錄和翻譯;基因表達(dá)調(diào)控的研討;DNA重組技術(shù)和構(gòu)造分子生物學(xué)。 反向生物學(xué):是指利用重組DNA技術(shù)和離體定向誘變的方法研討知構(gòu)造的
2、基因相應(yīng)的功能,在體外使基因突變,再導(dǎo)入體內(nèi),檢測(cè)突變的遺傳效應(yīng),即以表型來(lái)探求基因構(gòu)造。 后基因組時(shí)代:研討細(xì)胞全部基因的表達(dá)圖式和全部蛋白質(zhì)圖式,人類(lèi)基因組研討由構(gòu)造向功能轉(zhuǎn)移。3、寫(xiě)出三個(gè)分子生物寫(xiě)學(xué)展的主要大事件年代、發(fā)明者、簡(jiǎn)要內(nèi)容 1953年Watson和Click發(fā)表了“脫氧核糖核苷酸的構(gòu)造的著名論文,提出了DNA的雙螺旋構(gòu)造模型。 19721973年,重組DNA時(shí)代的到來(lái)。H.Boyer和P.Berg等開(kāi)展了重組DNA技術(shù),并完成了第一個(gè)細(xì)菌基因的克隆,開(kāi)創(chuàng)了基因工程新紀(jì)元。 19902003年美、日、英、法、俄、中六國(guó)完成人類(lèi)基因組方案。解讀人類(lèi)遺傳密碼。4、21世紀(jì)分子生物
3、學(xué)的開(kāi)展趨勢(shì)是怎樣的? 隨著基因組方案的完成,人類(lèi)曾經(jīng)掌握了方式生物的一切遺傳密碼。又迎來(lái)了后基因組時(shí)代,人類(lèi)基因組的研討重點(diǎn)由構(gòu)造向功能轉(zhuǎn)移。相關(guān)學(xué)說(shuō)實(shí)際相應(yīng)誕生,如功能基因組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)和生物信息學(xué)。生命科學(xué)又進(jìn)入了一個(gè)全新的時(shí)代。第四章思索題:P130基因的概念如何?基因的研討分為幾個(gè)開(kāi)展階段? 概念:基因是原核、真核生物以及病毒的DNA和RNA分子中具有遺傳效應(yīng)的核苷酸序列,是遺傳的根本單位和突變單位以及控制外形的功能單位。開(kāi)展階段: eq oac(,1)20世紀(jì)50年代以前,主要從細(xì)胞的染色體程度上進(jìn)展研討,屬于基因的染色體遺傳學(xué)階段。 eq oac(,2)20世紀(jì)50年代以后,主
4、要從DNA大分子程度上進(jìn)展研討,屬于分子的生物學(xué)階段。 eq oac(,3)近20年來(lái),直接從克隆目的基因出發(fā),研討基因的功能及其表型之間的關(guān)系,反向生物學(xué)階段。5、什么是C值和C值矛盾?主要表現(xiàn)有哪些? C值:真核生物單倍體基因組所包含的全部DNA量成為該物種的C值。 C值矛盾悖理:指真核生物中DNA含量的反常景象。 主要表現(xiàn): eq oac(,1)C值不隨生物的進(jìn)化程度和復(fù)雜性添加 eq oac(,2)關(guān)系親密的生物C值相差甚大 eq oac(,3)真和生物DNA的量遠(yuǎn)遠(yuǎn)大于編碼蛋白質(zhì)等物質(zhì)所需的量6、斷裂基因、外顯子和內(nèi)含子的概念是什么?它們的關(guān)系如何? 斷裂基因:基因內(nèi)部插入了不編碼序
5、列,使一個(gè)完好的基因分隔成不延續(xù)的假設(shè)干區(qū)段,這樣的基因叫做不延續(xù)基因或斷裂基因。 外顯子:真核生物不延續(xù)基因中有編碼功能的區(qū)段稱(chēng)為外顯子。 內(nèi)含子:無(wú)編碼功能的區(qū)段稱(chēng)為內(nèi)含子。 關(guān)系: eq oac(,1)真核生物基因組中的不延續(xù)基因無(wú)論存在于何種組織,表達(dá)或不表達(dá),其序列都堅(jiān)持不變,但內(nèi)部的外顯子和內(nèi)含子數(shù)目、位置及長(zhǎng)度卻是可變的。 eq oac(,2)內(nèi)含子與外顯子之間的銜接位點(diǎn):共同保守序列、無(wú)序列同源性和互補(bǔ)性7、重疊基因最初是在什么生物中發(fā)現(xiàn)的?重疊基因的存在有何意義? &X174噬菌體; 重疊基因存在意義:提高基因利用率。 8、分別寫(xiě)出病毒、原核、真核生物基因組的概念,請(qǐng)比較它們
6、各自的特點(diǎn)及其異同。 病毒基因組:病毒中所含的一整套基因,包括構(gòu)成基因和基因之間區(qū)域的一切DNA。 基因組特點(diǎn): eq oac(,1)與細(xì)菌相比較,病毒的基因組很小,含遺傳信息少,只能編輯少數(shù)蛋白質(zhì)。 eq oac(,2)基因組可由DNA或RNA組成,但每種病毒只含一種核酸。核酸的構(gòu)造可以是單鏈或雙鏈、閉合環(huán)狀或線(xiàn)狀分子。 eq oac(,3)病毒基因組通常有重疊。重疊基因運(yùn)用共同的核苷酸序列,但轉(zhuǎn)錄的mRNA有不同可讀框。有些基因又一樣可讀框,但起始密碼子或終止密碼子不同。 eq oac(,4)病毒基因組的大部分序列用來(lái)編碼蛋白質(zhì),基因之間的間隔序列非常短。非編碼區(qū)占很小部分 eq oac(
7、,5)病毒基因組中在功能上相關(guān)的基因普通集中成簇,在特定的部位構(gòu)成一個(gè)相對(duì)的功能單元或轉(zhuǎn)錄單元。轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物普通為多順?lè)醋觤RNA,之后加工成各蛋白質(zhì)的mRNA。 eq oac(,6)噬菌體的基因是延續(xù)的。原核生物基因組:原核生物染色體、質(zhì)粒中所含有的一整套基因。特點(diǎn): eq oac(,1)基因通常僅由一條環(huán)形或線(xiàn)形雙鏈DNA分子組成。 eq oac(,2)只需一個(gè)復(fù)制起始點(diǎn)。 eq oac(,3)有支配子構(gòu)造數(shù)個(gè)相關(guān)的構(gòu)造基因串聯(lián)在一同,受一致調(diào)控區(qū)調(diào)理,合成多順?lè)醋觤RNA。 eq oac(,4)編碼蛋白質(zhì)的構(gòu)造基由于單拷貝的,但rRNA基因普通為多拷貝的。 eq oac(,5)非編碼DNA所
8、占比例很少,類(lèi)似于病毒基因。 eq oac(,6)基因組DNA具有多種調(diào)控區(qū)。如復(fù)制起始區(qū)、復(fù)制終止區(qū)、轉(zhuǎn)錄啟動(dòng)子、轉(zhuǎn)錄終止區(qū)等特殊序列,以及還有反復(fù)序列,比病毒基因組復(fù)雜。 eq oac(,7)與真核生物基因類(lèi)似,也具有可挪動(dòng)的DNA序列組分。真核生物基因組:真核生物的單倍染色體組、細(xì)胞器中所含的一整套基因。特點(diǎn): eq oac(,1)真核基因組的分子質(zhì)量大。相當(dāng)?shù)膹?fù)雜度。 eq oac(,2)線(xiàn)狀染色體,每條染色體多個(gè)復(fù)制起點(diǎn)。 eq oac(,3)細(xì)胞核DNA與蛋白質(zhì)穩(wěn)定的結(jié)合,構(gòu)成染色質(zhì)的復(fù)雜高級(jí)構(gòu)造。 eq oac(,4)基因表達(dá)中,轉(zhuǎn)錄和翻譯在時(shí)間和空間上被分隔,不偶聯(lián)。 eq o
9、ac(,5)大量反復(fù)序列,且單位長(zhǎng)度不一,反復(fù)程度各異。 eq oac(,6)基因普通以點(diǎn)拷貝方式存在,轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物為單順?lè)醋觤RNA。 eq oac(,7)存在著可挪動(dòng)的DNA序列。 eq oac(,8)絕大多數(shù)真核生物基因都含有內(nèi)含子,基因編碼區(qū)是不延續(xù)陳列的。 異同:紅色標(biāo)志一樣點(diǎn);綠色為不同點(diǎn) 9、簡(jiǎn)要表達(dá)真核生物的DNA序列的幾種類(lèi)型。 eq oac(,1)單拷貝的DNA序列 eq oac(,2)低度反復(fù)的DNA序列,有210個(gè)拷貝數(shù); eq oac(,3)中度反復(fù)的DNA序列,有幾十至數(shù)十萬(wàn)個(gè)拷貝數(shù) eq oac(,4)高度反復(fù)DNA,反復(fù)次數(shù)上萬(wàn)至數(shù)百次。10、內(nèi)含子有什么功能?其存
10、在有何意義? eq oac(,1)促進(jìn)重組。 eq oac(,2)添加基因組的復(fù)雜性。 eq oac(,3)含有可讀框 eq oac(,4)基因組中外顯子和內(nèi)含子是相對(duì)的,有些內(nèi)含子具有編碼序列,能產(chǎn)生蛋白質(zhì)或功能RNA. eq oac(,5)含有部分剪接信號(hào) eq oac(,6)產(chǎn)生核仁小RNA. eq oac(,7)內(nèi)含子對(duì)基因表達(dá)有影響。存在意義:有利于變異與進(jìn)化,添加重組機(jī)率,提高進(jìn)化率。14、人類(lèi)基因組研討哪些內(nèi)容?研討人類(lèi)基因組有何艱苦意義? 研討內(nèi)容: eq oac(,1)對(duì)人類(lèi)全基因組作圖,或染色體作圖包括遺傳連鎖作圖和物理作圖,也就是對(duì)基因組進(jìn)展標(biāo)志和劃分,為基因或特定DNA
11、序列在染色體上的位置提供標(biāo)志。進(jìn)一步還包括繪制轉(zhuǎn)錄圖譜。 eq oac(,2)對(duì)基因組DNA進(jìn)展裂解切割和基因克隆。把幾百甚至幾千堿基長(zhǎng)度的DNA片段按知的標(biāo)識(shí)進(jìn)展有序的陳列。 eq oac(,3)測(cè)定基因組的全部DNA序列。對(duì)全部DNA進(jìn)展序列分析,按其在染色體上的位置進(jìn)展陳列,得到在染色體上DNA序列的全部。 eq oac(,4)基因的鑒定,即確定每個(gè)基因的構(gòu)造,分別和鑒定具有重要功能以及與艱苦疾病相關(guān)的基因。 eq oac(,5)建立基因的信息系統(tǒng)、基因信息的儲(chǔ)存、處置以及開(kāi)發(fā)相應(yīng)的軟件。 艱苦意義:16、什么是功能基因組學(xué)?基因芯片?蛋白質(zhì)組學(xué)?生物信息學(xué)? 功能基因組學(xué):是指利用構(gòu)造
12、基因組學(xué)提供的信息,以大規(guī)模實(shí)驗(yàn)方法及統(tǒng)計(jì)與計(jì)算分析,全面系統(tǒng)地分析全部基因功能的學(xué)科。 基因芯片: 是利用原位合成法或?qū)⒁押铣珊玫囊幌盗泄押塑账崽结樂(lè)肿右灶A(yù)先設(shè)定的陳列方式固定在固相支持界面外表硅片、玻片、尼龍膜等,構(gòu)成構(gòu)成高密度寡核苷酸陣列,與樣品進(jìn)展雜交,經(jīng)過(guò)檢測(cè)雜交信號(hào)的強(qiáng)度及分布來(lái)進(jìn)展分析。 蛋白質(zhì)組學(xué):指研討某一基因組在某一特定細(xì)胞、特定時(shí)間內(nèi)所表達(dá)的全部蛋白質(zhì)的集合體,以及一切蛋白修飾后的各種形狀。 生物信息學(xué):17、分子生物學(xué)信息數(shù)據(jù)庫(kù)主要有哪4大類(lèi)? eq oac(,1)基因組數(shù)據(jù)庫(kù); eq oac(,2)核算和蛋白質(zhì)一級(jí)構(gòu)造序列數(shù)據(jù)庫(kù); eq oac(,3)生物大分子三圍構(gòu)
13、象數(shù)據(jù)庫(kù); eq oac(,4)由以上三類(lèi)數(shù)據(jù)庫(kù)和文獻(xiàn)資料為根底構(gòu)建的二次數(shù)據(jù)庫(kù)。18、名詞解釋?zhuān)夯蚣易?基因簇 假基因 HGP STS SAGE BAC YAC ORF 基因家族:是真核生物基因生物基因組中來(lái)源一樣、構(gòu)造類(lèi)似、功能相關(guān)的一組基因。 基因簇:基因家族中各成員嚴(yán)密成簇陳列成大段的串聯(lián)反復(fù)單位,定位于染色體的特殊區(qū)域,他們屬于同一個(gè)祖先的基因擴(kuò)增產(chǎn)物?;虼刂幸舶瑳](méi)有生物功能的假基因。通常,基因簇內(nèi)各序列的同源性大于基因族間的各序列的同源性。 假基因:在多基因家族中,有些成員的DNA序列構(gòu)造與有功能的基因類(lèi)似,但不表達(dá)產(chǎn)生有功能的基因產(chǎn)物,這些基因稱(chēng)假基因。 HGP: Huma
14、n genome project 人類(lèi)基因組方案。STS: Sequence-tagged site 序列標(biāo)簽位點(diǎn)。為一段300500bp的知序列,在染色體上有一定的位置。SAGE: serial analysis of gene expression 基因表達(dá)系統(tǒng)分析 原理是cDNA3端有一段911bp的短序列包含了能代表該轉(zhuǎn)錄本的足夠信息,可以區(qū)分該基因組中95的基因,這段特定序列稱(chēng)為SAGE標(biāo)簽。顯示所代表基因能否被表達(dá),及表達(dá)程度。BAC: bacterial artificial chromosome 細(xì)菌人工染色體YAC: yeast artificial chromosome酵母
15、人工染色體ORF:可讀框第六章 DNA的損傷、修復(fù)和基因突變思索題:P186什么是DNA的損傷?DNA的構(gòu)造的改動(dòng)有哪兩種類(lèi)型?其危害有哪些?。DNA損傷指在生物體生命過(guò)程中DNA雙螺旋構(gòu)造發(fā)生的任何改動(dòng)。DNA的構(gòu)造發(fā)生的改動(dòng)主要有兩種類(lèi)型:?jiǎn)蝹€(gè)基因的改動(dòng);雙螺旋構(gòu)造的異常扭曲。危害: eq oac(,1)單個(gè)堿基改動(dòng)只影響DNA序列而不影響整體構(gòu)象,當(dāng)DNA雙螺旋被分開(kāi)時(shí)并不影響轉(zhuǎn)錄或復(fù)制過(guò)程,而是經(jīng)過(guò)序列的變化改動(dòng)子代的遺傳信息。 eq oac(,2)雙螺旋構(gòu)造的異常扭曲對(duì)DNA復(fù)制或轉(zhuǎn)錄可產(chǎn)生生理性損傷。 DNA分子堿基自發(fā)性化學(xué)改動(dòng)可呵斥哪幾種損傷? eq oac(,1)互變異構(gòu)移位
16、 eq oac(,2)脫氨基作用 eq oac(,3)DNA聚合酶的打滑 eq oac(,4)活性氧引起的誘變 eq oac(,5)堿基喪失化學(xué)要素引起的DNA損傷主要有哪幾種?寫(xiě)出要點(diǎn)? eq oac(,1)烷化劑對(duì)DNA的損傷:烷化劑是一類(lèi)親電子的化合物,很容易與生物體中大分子的親核位點(diǎn)起反響。堿基烷基化、堿基零落、斷裂、交聯(lián)詳細(xì)見(jiàn)課件 eq oac(,2)堿基類(lèi)似物對(duì)DNA的損傷:人工可以合成一些堿基類(lèi)似物用作促突變劑或抗癌藥物,如5-溴尿嘧啶5-BU、5-氟尿嘧啶5-FU、2-氨基腺嘌呤2-AP等。什么事DNA的修復(fù)?細(xì)胞對(duì)DNA損傷的幾種修復(fù)系統(tǒng)是什么?DNA修復(fù): 是指針對(duì)已發(fā)生的
17、缺陷而進(jìn)展的補(bǔ)救機(jī)制。是指生物體細(xì)胞在長(zhǎng)期進(jìn)化過(guò)程中構(gòu)成的一種維護(hù)功能。修復(fù)系統(tǒng): eq oac(,1)切除修復(fù)excision repair:堿基切除修復(fù)和核苷酸片段切除修復(fù) eq oac(,2)錯(cuò)配修復(fù):mismatch repair校正活性所漏校的堿基使復(fù)制的保真性提高1001000倍 eq oac(,3)直接修復(fù):(direct repair)是把被損傷的堿基回復(fù)到原來(lái)形狀的一種修復(fù)。 eq oac(,4)重組修復(fù):(recombination repair)機(jī)體細(xì)胞對(duì)在復(fù)制起始時(shí)髦未修復(fù)的DNA損傷部位可以先復(fù)制,再修復(fù),這種方式為 eq oac(,5)易錯(cuò)修復(fù): (error pr
18、one repair) SOS反響誘導(dǎo)的修復(fù)系統(tǒng)中的易產(chǎn)生過(guò)失的修復(fù)。易產(chǎn)生過(guò)失的修復(fù)是由于SOS反響能誘導(dǎo)產(chǎn)生缺乏校正功能的DNA聚合酶,使之在DNA鏈的損傷部位即使出現(xiàn)不配對(duì)堿基,復(fù)制也能繼續(xù)進(jìn)展,從而添加細(xì)胞存活的時(shí)機(jī)。同時(shí),這個(gè)過(guò)程帶來(lái)高突變率。 什么是SOS反響?SOS反響由什么物質(zhì)引起的?意義如何?SOS反響:許多能呵斥DNA損傷或抑制DNA修復(fù)的過(guò)程能引起一系列復(fù)雜的誘導(dǎo)效 應(yīng),這種誘導(dǎo)效應(yīng)稱(chēng)為應(yīng)急效應(yīng)SOS response。引起物:SOS反響由RecA蛋白和LexA阻遏物相互作用引起。意義: eq oac(,1)DNA的修復(fù) eq oac(,2)導(dǎo)致變異在DNA復(fù)制遭到妨礙的
19、情況下防止因細(xì)胞分裂而產(chǎn)生不含DNA細(xì)胞,或者使細(xì)胞有更多重組和修復(fù)的時(shí)機(jī)?;蛲蛔兊母拍钊绾危亢?jiǎn)要寫(xiě)明基因突變的幾種類(lèi)型。什么是突變熱點(diǎn)?基因突變:基因內(nèi)的遺傳物質(zhì)發(fā)生可遺傳的構(gòu)造和數(shù)量的變化,通常產(chǎn)生一定的表型。類(lèi)型: eq oac(,1)堿基交換點(diǎn)突變:DNA錯(cuò)配堿基在復(fù)制后被固定下來(lái),由原來(lái)的一個(gè)堿基對(duì)被另一個(gè)堿基對(duì)所取代。包括轉(zhuǎn)換嘌與嘌、嘧與嘧和顛換嘌與嘧,嘧與嘌兩種類(lèi)型。 eq oac(,2)插入突變:基因的序列中插入了一個(gè)堿基或一段外來(lái)DNA導(dǎo)致的突變。兩種方式:拷貝或復(fù)制挪動(dòng),指一個(gè)位點(diǎn)上的序列被復(fù)制后插入到令一個(gè)位點(diǎn);非拷貝移換,DNA序列從一個(gè)位點(diǎn)直接挪動(dòng)到另一個(gè)位點(diǎn)。 e
20、q oac(,3)同義突變:基因突變改動(dòng)了密碼子的組成,但由于密碼子的簡(jiǎn)并性而未改動(dòng)所編碼氨基酸的突變。又稱(chēng)無(wú)聲突變或中性突變。 eq oac(,4)錯(cuò)義突變:基因突變改動(dòng)了所編碼的氨基酸的種類(lèi)或位置的突變,能不同程度的影響蛋白質(zhì)和酶的活性。 eq oac(,5)無(wú)義突變:基因突變使氨基酸的密碼子變成終止密碼子時(shí),導(dǎo)致翻譯提早終了。 eq oac(,6)移碼突變:是由一個(gè)或多個(gè)非三正倍數(shù)的核苷酸對(duì)插入的缺失,導(dǎo)致編碼區(qū)該位點(diǎn)后的三聯(lián)體密碼子可讀框改動(dòng),從而使錯(cuò)誤的氨基酸都發(fā)生錯(cuò)誤,使基因產(chǎn)物完全失活。 eq oac(,7)缺失突變:指一個(gè)或多個(gè)堿基從一段DNA序列中被刪除,或較長(zhǎng)核苷酸序列喪失
21、引起的突變,這種突變難以回復(fù)。 eq oac(,8)滲漏突變:是突變基因的產(chǎn)物尚有部分活性的錯(cuò)義突變,是表型介于野生型與完全突變型之間的某種形狀。 eq oac(,9)回復(fù)突變:從突變體又恢復(fù)原野生型的突變過(guò)程。 突變熱點(diǎn):DNA分子上恣意位點(diǎn)發(fā)生的頻率并不相等,在某些位點(diǎn)發(fā)生突變的頻率遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于其平均數(shù),稱(chēng)為突變熱點(diǎn)。導(dǎo)致DNA分子發(fā)生誘變的誘變劑主要有哪些? eq oac(,1)堿基類(lèi)似物 eq oac(,2)堿基的修飾劑 eq oac(,3)嵌入染料 eq oac(,4)紫外線(xiàn)和電離輻射名詞解釋?zhuān)?MRS SSB MEC MRS: Mismatch Repair Systerm錯(cuò)配修復(fù)系統(tǒng)
22、組成及作用見(jiàn)課件 SSB: MEC: Mismatch correct enzyme 錯(cuò)配矯正酶組成及運(yùn)用見(jiàn)課件第七章DNA的重組與轉(zhuǎn)座復(fù)習(xí)題P212簡(jiǎn)述DNA重組的概念與意義。 概念:DNA分子內(nèi)或分子間發(fā)生遺傳信息的重新組合,稱(chēng)為遺傳重組,或基因重排。意義:迅速添加群體的遺傳多樣性;使有利突變與不利突變分開(kāi):經(jīng)過(guò)優(yōu)化組合積累有意義的遺傳信息;參與許多重要的生物學(xué)過(guò)程,為DNA損傷或復(fù)制妨礙提供了修復(fù)機(jī)制;某些基因的表達(dá)遭到DNA重組的調(diào)理。DNA重組包括哪些過(guò)程?與DNA重組有關(guān)的酶主要有哪些? DNA重組Holliday模型的四個(gè)關(guān)鍵步驟:兩個(gè)同源染色體DNA陳列整齊;一個(gè)DNA的一條鏈
23、斷裂并與另一個(gè)DNA對(duì)應(yīng)的鏈銜接,構(gòu)成的銜接分子,稱(chēng)為Holliday中間體;經(jīng)過(guò)分支挪動(dòng)產(chǎn)生異源雙鏈hetero duplex)DNA;Holliday中間體切開(kāi)并修復(fù),構(gòu)成兩個(gè)雙鏈重組體DNA。主要的酶:RecA 蛋白催化雙鏈和單鏈 DNA 的反響階段RecBCD外切核酸酶具有ATP解旋酶再旋活性、可被ATP加強(qiáng)的內(nèi)切核酸酶活性、依賴(lài)于ATP的外切核酸酶活性、 原核同源重組的其它蛋白 a、 RuvA 識(shí)別 Holliday 構(gòu)造的銜接點(diǎn),4聚體 b、 RuvB 為分枝遷移提供動(dòng)力ATPase 1020bp/s ,6聚體 c、 RuvC 核酸內(nèi)切酶-專(zhuān)注性識(shí)別 Holliday 構(gòu)造的銜接點(diǎn)
24、, 體外切斷銜接點(diǎn)以拆分重組體,識(shí)別不對(duì)稱(chēng)的四核苷酸5A/TTTG/C. d、 DNA聚合酶和DNA銜接酶進(jìn)展修復(fù)合成什么是同源重組?什么是Holiday模型?什么是特異位點(diǎn)重組?同源重組:又稱(chēng)普通性重組,由兩條同源區(qū)的DNA分子,經(jīng)過(guò)配對(duì)、鏈斷裂和再銜接,而產(chǎn)生的片段間交換的過(guò)程。Holiday模型:同源重組的分子模型。Holiday中間體:同源重組中銜接兩個(gè)DNA雙鏈的交換中間物,含有4股DNA鏈,在銜接處為了轉(zhuǎn)換配對(duì)所構(gòu)成交叉鏈的銜接點(diǎn),這種構(gòu)造稱(chēng)Holiday中間體特異位點(diǎn)重組:是由整合酶催化在兩個(gè)DNA序列的特異位點(diǎn)間發(fā)生的整合。但位點(diǎn)不一定是同源性的,不依賴(lài)于DNA序列的同源性,而
25、依賴(lài)于能與某些酶特異結(jié)合的DNA序列。細(xì)菌基因轉(zhuǎn)移的機(jī)制有哪些?接協(xié)作用(conjugation:細(xì)菌細(xì)胞相互接觸時(shí)遺傳信息可由一個(gè)細(xì)胞轉(zhuǎn)移到另一個(gè)細(xì)胞,稱(chēng)為轉(zhuǎn)化(transformation):細(xì)菌品系由于吸收了外援DNA轉(zhuǎn)化因子而發(fā)生遺傳性狀改動(dòng)的景象。轉(zhuǎn)導(dǎo)transduction:是經(jīng)過(guò)噬菌體將細(xì)菌基因從供體轉(zhuǎn)移到受體細(xì)胞的過(guò)程。兩種類(lèi)型:普遍性轉(zhuǎn)導(dǎo)、局限性轉(zhuǎn)導(dǎo)細(xì)胞交融cell fusion:細(xì)胞質(zhì)膜交融導(dǎo)致基因轉(zhuǎn)移和重組。簡(jiǎn)述轉(zhuǎn)座子的概念,轉(zhuǎn)座子如何分類(lèi)?什么是插入序列IS?轉(zhuǎn)座子:基因組中可挪動(dòng)的一段DNA序列。它們可以直接從基因組的一個(gè)位點(diǎn)移到另一個(gè)位點(diǎn)供體和受體轉(zhuǎn)座:一個(gè)轉(zhuǎn)座子由
26、基因組的一個(gè)位置轉(zhuǎn)移到另一個(gè)位置的過(guò)程稱(chēng)為轉(zhuǎn)座。 分類(lèi):由轉(zhuǎn)座子的構(gòu)成分插入序列IS和復(fù)合型轉(zhuǎn)座子Tn插入序列IS:最簡(jiǎn)單,是細(xì)菌染色體、質(zhì)粒和某些噬菌體的正常組分 長(zhǎng)度 7501550bp特點(diǎn):a只需轉(zhuǎn)座酶基因,兩端IR為轉(zhuǎn)座酶的識(shí)別位點(diǎn)反向反復(fù)序列 b插入靶位點(diǎn)后會(huì)出現(xiàn)靶位點(diǎn)的正向反復(fù)59bp c)比較小,0.75-1.5kb復(fù)合型轉(zhuǎn)座子Tn與IS元件有什么異同點(diǎn)? 共同特征:a兩端有1525bp的Inverted repeat ,IR反向反復(fù)序列。為轉(zhuǎn)座酶所必需 b具有編碼轉(zhuǎn)座酶transposase的基因 c)轉(zhuǎn)座后兩端有正向反復(fù)序列不同點(diǎn):Tn轉(zhuǎn)座子中除了有轉(zhuǎn)座酶基因外,還帶有藥物抗
27、性基因(或其相關(guān)基因)標(biāo)志,因構(gòu)造較大而復(fù)雜。簡(jiǎn)述復(fù)制型轉(zhuǎn)座與非復(fù)制型轉(zhuǎn)座的機(jī)制。 復(fù)制型轉(zhuǎn)座:轉(zhuǎn)座子元件被復(fù)制并被挪動(dòng)到受體位點(diǎn),最終轉(zhuǎn)座過(guò)程擴(kuò)增了轉(zhuǎn)座子的拷貝供、受點(diǎn)特征: 1轉(zhuǎn)座后原來(lái)位置上的轉(zhuǎn)座因子堅(jiān)持不變; 2在新的位置上的轉(zhuǎn)座因子的兩側(cè)出現(xiàn)順向反復(fù)序列 3轉(zhuǎn)座過(guò)程中有一共合體(cointegrate非復(fù)制型:又稱(chēng)保管性轉(zhuǎn)座。轉(zhuǎn)座元件直接由一個(gè)部位轉(zhuǎn)移到另一個(gè)部位,在原來(lái)的部位沒(méi)有保管。主要是利用供體和靶DNA序列的直接銜接,只需求轉(zhuǎn)座酶。非復(fù)制型轉(zhuǎn)座過(guò)程:1轉(zhuǎn)座酶使轉(zhuǎn)座子從供體DNA中釋放出來(lái); 轉(zhuǎn)座酶使受體DNA靶位點(diǎn)構(gòu)成交錯(cuò)切口;2轉(zhuǎn)座子插入交錯(cuò)切口(轉(zhuǎn)座酶-轉(zhuǎn)酯反響) ,3銜
28、接并修復(fù)缺口單鏈,受體DNA產(chǎn)生同向反復(fù)序列。轉(zhuǎn)座子轉(zhuǎn)座的特征有哪些方面?能從基因組的一個(gè)位點(diǎn)轉(zhuǎn)移到另一個(gè)位點(diǎn),從一個(gè)復(fù)制子轉(zhuǎn)移到另一個(gè)復(fù)制子;不以獨(dú)立的方式存在(如噬菌體或質(zhì)粒DNA),而是在基因組內(nèi)由一個(gè)部位直接轉(zhuǎn)移到另一部位;轉(zhuǎn)座子編碼其本身的轉(zhuǎn)座酶,每次挪動(dòng)時(shí)攜帶轉(zhuǎn)座必需的基因一同在基因組內(nèi)躍遷,所以轉(zhuǎn)座子又稱(chēng)騰躍基因;轉(zhuǎn)座的頻率很低,且插入是隨機(jī)的,不依賴(lài)于轉(zhuǎn)座子(供體)和靶位點(diǎn)(受體)之間的任何序列同源性;轉(zhuǎn)座子可插入到一個(gè)構(gòu)造基因或基因調(diào)理序列內(nèi),引起基因表達(dá)內(nèi)容的改動(dòng),例如使該基因失活,假設(shè)是重要的基因那么能夠?qū)е录?xì)胞死亡。不依賴(lài)供體序列與靶位點(diǎn)間序列的同源性,即不依賴(lài)于rec
29、A.轉(zhuǎn)座后靶序列反復(fù)轉(zhuǎn)座插入的靶位點(diǎn)并非完全隨機(jī)插入專(zhuān)注型.轉(zhuǎn)座具有排他性(轉(zhuǎn)座免疫性).如Tn3對(duì)排斥類(lèi)轉(zhuǎn)座因子的插入轉(zhuǎn)座具有極性效應(yīng):構(gòu)造基因功能喪失,表達(dá)程度下降.活化臨近的沉默基因.區(qū)域性?xún)?yōu)先. DNA轉(zhuǎn)座引起了什么遺傳學(xué)效應(yīng)?1、可引起基因突變插入或切離;2、插入位置染色體DNA重排可以產(chǎn)生新基因;3、轉(zhuǎn)座產(chǎn)生染色體畸變?nèi)笔А⒌刮坏?、產(chǎn)生新的變異,有利于進(jìn)化。什么是逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子?逆轉(zhuǎn)錄子對(duì)基因組功能有哪些重要的影響?逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座:從DNA到RNA再到DNA的轉(zhuǎn)移過(guò)程稱(chēng)為反轉(zhuǎn)座或逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座。逆轉(zhuǎn)錄子:一類(lèi)挪動(dòng)因子在轉(zhuǎn)座過(guò)程中需求以RNA為中間體,經(jīng)過(guò)逆轉(zhuǎn)錄過(guò)程再分散到基因組中,稱(chēng)為。影
30、響: eq oac(,1)對(duì)基因表達(dá)的影響啟動(dòng)基因表達(dá)、編碼有關(guān)逆轉(zhuǎn)錄酶,影響基因表達(dá)等 eq oac(,2)逆轉(zhuǎn)錄子介導(dǎo)基因的重排 eq oac(,3)生物進(jìn)化中起重要作用第十二章 原核生物基因表達(dá)調(diào)控什么是基因表達(dá)調(diào)控?基因表達(dá)調(diào)控有什么意義? 基因表達(dá)調(diào)控:是生物體內(nèi)基因表達(dá)的調(diào)理控制機(jī)制,使細(xì)胞中基因表達(dá)的過(guò)程在時(shí)間、空間上處于有序形狀,并對(duì)環(huán)境條件的變化做出適當(dāng)反響的復(fù)雜過(guò)程?;虮磉_(dá)調(diào)控的意義:基因表達(dá)調(diào)控是生物體內(nèi)細(xì)胞分化、形狀發(fā)生和個(gè)體發(fā)育的分子根底。 eq oac(,1)順應(yīng)環(huán)境、維持生長(zhǎng)和增殖 eq oac(,2)維持個(gè)體發(fā)育與分化?;虮磉_(dá)調(diào)控主要在那些程度上進(jìn)展?基因程
31、度 、轉(zhuǎn)錄程度、轉(zhuǎn)錄后程度、翻譯程度、翻譯后程度原核基因表達(dá)調(diào)控有什么特點(diǎn)? eq oac(,1)原核生物基因表達(dá)調(diào)控存在于轉(zhuǎn)錄和翻譯的起始、延伸和終止的每一步驟中,多以支配子為單位進(jìn)展。 eq oac(,2)細(xì)胞要控制各種蛋白質(zhì)在不同時(shí)期的表達(dá)程度,雖然可經(jīng)過(guò)轉(zhuǎn)錄程度和翻譯程度的調(diào)控,但主要發(fā)生在轉(zhuǎn)錄程度,有正負(fù)調(diào)控兩種機(jī)制。主要以負(fù)調(diào)理為主。,其調(diào)理因子的活性主要受變構(gòu)效應(yīng)調(diào)理。 eq oac(,3)在轉(zhuǎn)錄程度上對(duì)基因表達(dá)的調(diào)控決議于DNA的構(gòu)造、RNA聚合酶的功能、蛋白質(zhì)因子及其它小分子配基的相互作用。原核生物的調(diào)理原件種類(lèi)少,主要包括上游的啟動(dòng)區(qū)域調(diào)控原件和激活蛋白和阻遏蛋白的結(jié)合位點(diǎn)
32、。 以乳糖子為例,闡明支配子學(xué)說(shuō)的建立對(duì)分子生物學(xué)研討有何重要意義? 簡(jiǎn)述色氨酸支配子的阻遏系統(tǒng)和弱化系統(tǒng)?阻遏系統(tǒng):是色氨酸生物合成途徑的第一調(diào)控,主管轉(zhuǎn)錄能否啟動(dòng)。當(dāng)色氨酸過(guò)量時(shí),它與阻遏蛋白構(gòu)成復(fù)合物,并結(jié)合到支配基因上阻止構(gòu)造基因轉(zhuǎn)錄,即以終產(chǎn)物組織基因轉(zhuǎn)錄。弱化系統(tǒng):第二程度控制,它決議著曾經(jīng)啟動(dòng)的轉(zhuǎn)錄能否能繼續(xù)進(jìn)展下去。當(dāng)mRNA合成起始以后,除非培育基中完全沒(méi)有色氨酸,否那么轉(zhuǎn)錄總是在前導(dǎo)區(qū)內(nèi)終止。轉(zhuǎn)錄終止發(fā)生的區(qū)域稱(chēng)為弱化子或衰減子。前導(dǎo)區(qū)可分為四個(gè)區(qū)域,這四個(gè)區(qū)域的片段以?xún)煞N不同的方式進(jìn)展堿基配對(duì),由核糖體經(jīng)過(guò)前導(dǎo)區(qū)繼續(xù)翻譯的功能控制著這兩種構(gòu)造的轉(zhuǎn)換,它決議mRNA能否構(gòu)成
33、終止所需的構(gòu)造,從而產(chǎn)生弱化效應(yīng)。名詞解釋?zhuān)喉樖阶饔迷?:對(duì)基因表達(dá)有調(diào)理活性的DNA序列,其活性只影響與其本身同處在一個(gè)DNA分子上的基因;這種DNA序列通常不編碼蛋白質(zhì),多位于基因旁側(cè)或內(nèi)含子中。反式作用因子:編碼基因與其識(shí)別或結(jié)合的靶核苷酸序列不在同一個(gè)DNA分子上。 構(gòu)造基因 :編碼蛋白質(zhì)或RNA的基因。 支配子:原核生物在分子程度上基因表達(dá)調(diào)控的單位,由調(diào)理基因、啟動(dòng)子、支配基因和構(gòu)造基因等序列組成。經(jīng)過(guò)調(diào)理基因編碼的調(diào)理蛋白或與誘導(dǎo)物、輔阻遏物協(xié)同作用,開(kāi)啟或封鎖支配基因,對(duì)構(gòu)造基因的表達(dá)進(jìn)展正、負(fù)控制。 IPTG : 異丙基硫代D半乳糖苷 (p)ppGpp:細(xì)菌應(yīng)急應(yīng)對(duì)反響引起
34、的ppGpp鳥(niǎo)苷的5位和3位上分別連有二磷酸基團(tuán)和pppGpp鳥(niǎo)苷的5位上連有3個(gè)磷酸基團(tuán)而3位上連有二磷酸基團(tuán)兩種異常核苷酸的大量添加它們合稱(chēng)為。(p)ppGpp的產(chǎn)生能封鎖許多基因的表達(dá),而且它的作用能影響許多支配子,故又稱(chēng)為超級(jí)調(diào)控因子。CAPcAMP-CAP第十三章 真核生物的基因表達(dá)1、真核生物基因表達(dá)調(diào)控涉及哪些生命活動(dòng)過(guò)程?真核基因的表達(dá)調(diào)控,貫穿于從DNA到有功能的蛋白質(zhì)的全過(guò)程。染色體 和染色質(zhì)的活性、轉(zhuǎn)錄、轉(zhuǎn)錄初始產(chǎn)物的加工、翻譯等的調(diào)控是基因調(diào)控的重要調(diào)理過(guò)程。2、簡(jiǎn)要概括真核生物基因表達(dá)調(diào)控的7個(gè)層次? eq oac(,1)染色體和染色質(zhì)程度上的構(gòu)造變化與基因活化調(diào)理
35、eq oac(,2)轉(zhuǎn)錄程度上的調(diào)控,包括基因的開(kāi)與關(guān),轉(zhuǎn)錄效率的高和低。 eq oac(,3)RNA加工程度上的調(diào)控,包括對(duì)初始轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的特異性剪接、修飾、火花、編輯等。 eq oac(,4)轉(zhuǎn)錄后加工產(chǎn)物在從細(xì)胞核向細(xì)胞質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)過(guò)程中所遭到的調(diào)控。 eq oac(,5)翻譯程度的控制,對(duì)哪一種mRNA結(jié)合核糖體進(jìn)展翻譯的選擇以及蛋白質(zhì)合成量的控制。 eq oac(,6)蛋白質(zhì)合成以后選擇性的被激活的控制,蛋白質(zhì)和酶分子程度上的剪切、活性程度的控制。 eq oac(,7)控制mRNA的選擇性降解的調(diào)控。3、真核生物基因表達(dá)調(diào)控與原核生物相比有什么異同點(diǎn)?不同點(diǎn):新書(shū)P390 eq oac(,1
36、)原核細(xì)胞的染色質(zhì)是裸露的DNA,而真核生物細(xì)胞染色質(zhì)那么是由DNA與組蛋白嚴(yán)密結(jié)合構(gòu)成的核小體。在原核生物中,染色質(zhì)構(gòu)造對(duì)基因的表達(dá)沒(méi)有明顯的調(diào)控作用,而在真核生細(xì)胞中這種作用十清楚顯。 eq oac(,2)在原核基因轉(zhuǎn)錄的調(diào)控中,既有用激活物的調(diào)控正調(diào)控,也有用阻遏物的調(diào)控負(fù)調(diào)控,二者同種重要,新書(shū)P410真核與原核生物轉(zhuǎn)錄程度的調(diào)理控制第3小點(diǎn)第5行原核生物通常以負(fù)調(diào)控為主。關(guān)于兩者孰是孰非,待下節(jié)分生課聽(tīng)教師詳解而真核細(xì)胞中雖然也有正調(diào)控成分和負(fù)調(diào)控成分,但主要是正調(diào)控,且一個(gè)真核基因通常都有多個(gè)調(diào)控序列,必需有多個(gè)激活物同時(shí)特異地結(jié)合上去并協(xié)同作用,才干調(diào)理基因的轉(zhuǎn)錄。 eq oac
37、(,3)原核基因的轉(zhuǎn)錄翻譯通常是偶聯(lián)的,而真核生物在時(shí)空上是分開(kāi)的,調(diào)控更復(fù)雜。 eq oac(,4)調(diào)控特異性表達(dá)機(jī)制細(xì)胞特異性或組織特異性。一樣點(diǎn): eq oac(,1)轉(zhuǎn)錄程度調(diào)控和轉(zhuǎn)錄后程度調(diào)控,并以轉(zhuǎn)錄程度調(diào)控為重要 eq oac(,2)構(gòu)造基因上游和下游甚至內(nèi)部存在許多特異的調(diào)控成分,并依托異蛋白質(zhì)因子與這些調(diào)控成分的結(jié)合與否調(diào)控基因的轉(zhuǎn)錄。 eq oac(,3)共同的來(lái)源與一樣的分子根底4、簡(jiǎn)述轉(zhuǎn)錄程度真核生物與原核生物調(diào)控的區(qū)別?原核生物功能相關(guān)的基因常組織在一同構(gòu)成支配子,作為基因表達(dá)和調(diào)理的單元;真核生物基因不組成支配子,每個(gè)基因都有其本身的根本啟動(dòng)子和調(diào)理元件,單獨(dú)進(jìn)展轉(zhuǎn)
38、錄,但在相關(guān)基因之間也存在著協(xié)同調(diào)理,擁有共同順式作用元件和反式作用因子的基因組成基因群(gene battery);原核生物的調(diào)理元件種類(lèi)較少,主要包括上游的啟動(dòng)區(qū)域調(diào)控元件和激活蛋白(activator)、以及阻遏蛋白(repressor)的結(jié)合位點(diǎn);而真核生物的調(diào)理元件種類(lèi)很多,包括上游調(diào)理元件,如組成型元件、加強(qiáng)子和沉默子以及反式作用因子如激活因子、阻遏因子等。它們由許多短的共有序列組成,能獨(dú)立活化基因表達(dá),在基因組中的許多中等反復(fù)序列也可作為調(diào)理元件;無(wú)論是原核還是真核生物,其轉(zhuǎn)錄都受反式調(diào)理因子(轉(zhuǎn)錄激活因子或抑制因子)的調(diào)理。這類(lèi)調(diào)理可在兩個(gè)程度上進(jìn)展:一是經(jīng)過(guò)調(diào)理因子的生物合成
39、(即對(duì)其種類(lèi)和數(shù)量的調(diào)理),其過(guò)程緩慢而繼續(xù),主要涉及到細(xì)胞的分化等;二是經(jīng)過(guò)對(duì)它們進(jìn)展構(gòu)象轉(zhuǎn)變或共價(jià)修飾(即對(duì)其活性的調(diào)理)。真核生物以正調(diào)理為主真核生物基因表達(dá)的調(diào)理因子主要以共價(jià)修飾為主,如磷酸化與去磷酸化的調(diào)理。真核生物具有染色質(zhì)構(gòu)造,基因活化首先需求改動(dòng)染色質(zhì)的形狀,使轉(zhuǎn)錄因子可以接觸并作用于啟動(dòng)子,稱(chēng)此過(guò)程為染色質(zhì)改型(chromatin remodeling)。染色質(zhì)程度的調(diào)理主要涉及真核生物發(fā)育與細(xì)胞分化等調(diào)理。 5、什么是加強(qiáng)子?其特點(diǎn)如何?加強(qiáng)子對(duì)轉(zhuǎn)錄有哪些正調(diào)控作用?加強(qiáng)子:是指能使與它連鎖的基因轉(zhuǎn)錄頻率明顯添加的DNA序列。其發(fā)揚(yáng)作用的方式通常與方向、 間隔 無(wú)關(guān),而且具有組織特異性。它普通與轉(zhuǎn)錄激活因子結(jié)合,經(jīng)過(guò)作用于轉(zhuǎn)錄起始復(fù)合物加強(qiáng)RNA聚合酶的活性 ,從而促進(jìn)轉(zhuǎn)錄。 加強(qiáng)子作用特點(diǎn): eq oac(,1)加強(qiáng)轉(zhuǎn)錄作用明顯 eq oac(,2)可位于基因組任何位置,沒(méi)有基因?qū)W⑿?eq oac(,3)不具有方向性 eq oac(,4)可遠(yuǎn)間隔 作用 eq oac(,5)加強(qiáng)效應(yīng)具有組織或細(xì)胞特異性,只需特定的蛋白質(zhì)參與才發(fā)揚(yáng)作用 eq
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