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1、PAGE 普 通 遺 傳 學(xué)目 錄緒 論 第一章孟德?tīng)柖傻诙逻z傳學(xué)中的統(tǒng)計(jì)學(xué)方法第三章孟德?tīng)柖傻臄U(kuò)展第四章 連鎖與交換定律第五章 伴性遺傳第六章 細(xì)菌與噬菌體的遺傳重組第七章 數(shù)量性狀遺傳一、概念二、遺傳學(xué)研究的內(nèi)容三、遺傳學(xué)的 對(duì)象和分類(lèi) 四、 遺傳學(xué) 的發(fā)展簡(jiǎn)史五、 遺傳學(xué)的應(yīng)用本章要點(diǎn)一 概念 1. 什么是遺傳學(xué)?1.1 遺傳學(xué)(genetics): 二、遺傳學(xué)研究的內(nèi)容 Branches of geneticsBased on level, genetics can be divided into cytogenetics, population genetics, and mo
2、lecular genetics 按水平劃分:個(gè)體( 細(xì)胞)遺傳學(xué), 群體遺傳學(xué),分子遺傳學(xué)Branches of genetics 按研究的層次分類(lèi): 按研究對(duì)象分類(lèi): Based on subjects, genetics can be divided into human genetics, plant genetics, animal genetics, and microorganism genetics 按研究范疇分類(lèi): 應(yīng)用學(xué)科: 生物工程學(xué) (Biotechnology) 優(yōu)生學(xué)(Eugenics) 育種學(xué)(工業(yè)微生物、農(nóng)、牧和水產(chǎn)) Branches of genetics
3、遺傳毒理學(xué)(genetictoxicology)是用遺傳學(xué)方法研究環(huán)境因素對(duì)遺傳物質(zhì)的損害及其毒理效應(yīng)產(chǎn)生機(jī)制的一門(mén)學(xué)科。環(huán)境因素作用于發(fā)育中的胚胎細(xì)胞, 影響胚胎細(xì)胞和器官系統(tǒng)的發(fā)育而導(dǎo)致畸胎。突變形成(致突變,mutagenesis)癌形成(致癌carcinogenesis)致畸效應(yīng)(致畸teratogenesis) 簡(jiǎn)稱(chēng)為毒理遺傳學(xué)的 “三致”效應(yīng)。 輻射遺傳學(xué)以高等動(dòng)植物為研究對(duì)象,研究輻射的遺傳效應(yīng)。輻射包括電離輻射和非電離輻射,電離輻射包括X,r射線等電磁輻射和中子、質(zhì)子、a等粒子輻射;非電離輻射主要是紫外線。從細(xì)胞水平來(lái)說(shuō),電離輻射的遺傳效應(yīng)主要是引起染色體畸變;畸變類(lèi)型有末端缺
4、失、微小體、具著絲粒和不具個(gè)著絲粒的環(huán)、臂間倒位、相互易位、雙著絲粒體或多著絲粒體、單位斷裂、單體互換等。 發(fā)生遺傳學(xué)研究基因如何控制發(fā)育,分析基因和性狀發(fā)育之間的關(guān)系。動(dòng)物發(fā)育是從受精開(kāi)始,通過(guò)受精卵核質(zhì)之間.分裂球之間以及胚胎不同部位之間的相互作用,使基因按一定時(shí)空順序表達(dá),從而控制細(xì)胞和器官原基的逐步?jīng)Q定和分化.發(fā)生遺傳學(xué)的研究對(duì)于了解畸胎、腫瘤等發(fā)生的機(jī)制,以及對(duì)于遺傳病的治療、動(dòng)物遺傳工程的應(yīng)用等都具有重要的意義。群體遺傳學(xué)研究群體的遺傳結(jié)構(gòu)及其變化規(guī)律。它們用數(shù)學(xué)和統(tǒng)計(jì)學(xué)的方法研究群體中基因頻率和基因型頻率以及影響這些頻率的因素,并由此來(lái)探討生物的進(jìn)化過(guò)程。 群體遺傳學(xué)的重要研究指
5、標(biāo),是考查各種遺傳方式使群體達(dá)到平衡的速度,以及由此所達(dá)到的平衡的穩(wěn)定性。 只有在這種平衡被打破時(shí)才會(huì)發(fā)生演變;打破平衡的因素有突變、選擇、遷移和漂變。群體遺傳學(xué)研究不同世代中遺傳結(jié)構(gòu)的演變,它僅僅涉及品系間、品種間和亞種間的變遷,并據(jù)以培育各種新的生物品系和品種。體細(xì)胞遺傳學(xué)以高等生物的體細(xì)胞為實(shí)驗(yàn)材料,采用細(xì)胞離體培養(yǎng)、細(xì)胞融合和遺傳物質(zhì)在細(xì)胞間轉(zhuǎn)移等方法,研究真核細(xì)胞的基因結(jié)構(gòu)功能及其表達(dá)規(guī)律等, 克隆重技術(shù)的發(fā)展和成就,使人們期望通過(guò)離體細(xì)胞的遺傳操作,探索改良作物性狀的新途徑,成為當(dāng)前蓬勃發(fā)展的生物技術(shù)研究中重要的組成部分,也是體細(xì)胞遺學(xué)中最活躍的一個(gè)領(lǐng)域。 細(xì)胞遺傳學(xué)研究對(duì)象主要是
6、真核生物,特別是包括人類(lèi)在內(nèi)的高等動(dòng)植物。 早期的細(xì)胞遺傳學(xué)著重研究分離、重組、連鎖、交換等遺傳現(xiàn)象的染色體基礎(chǔ), 以及染色體畸變和倍性變化等染色體行為的遺傳學(xué)效應(yīng)。細(xì)胞遺傳學(xué)是遺傳學(xué)中最早發(fā)展起來(lái)的學(xué)科,也是最基本的學(xué)科。Molecular Genetics:在分子水平上研究基因的本質(zhì),基因的功能以及基因的變化以闡明遺傳變異的規(guī)律。Developmental Genetics發(fā)生遺傳學(xué):研究從受精卵發(fā)育為成體過(guò)程中,胚層、器官原基的形成以及組織、細(xì)胞的決定和分化的基因調(diào)控機(jī)理,以闡明基因與性狀發(fā)育的關(guān)系。Behavioral Genetics行為遺傳學(xué):研究生物向光、向地、攝食、求偶、育兒、
7、攻擊、逃避以及學(xué)習(xí)和記憶等行為的遺傳基礎(chǔ)以及基因表達(dá)的時(shí)間、場(chǎng)所、作用途徑等。仿生學(xué)bionics:研究生物系統(tǒng)的結(jié)構(gòu)和性質(zhì)以為工程技術(shù)提供新的設(shè)計(jì)思想及工作原理的科學(xué)。數(shù)量遺傳學(xué)quantitativegenetics:采用數(shù)理統(tǒng)計(jì)和數(shù)學(xué)分析方法研究數(shù)量性狀遺傳的遺傳學(xué)分支。其研究方法主要是用生物統(tǒng)計(jì)學(xué)方法對(duì)群體的某種數(shù)量性狀進(jìn)行隨機(jī)抽樣測(cè)量,計(jì)算出平均數(shù)、方差等,并在此基礎(chǔ)上進(jìn)行數(shù)學(xué)分析。細(xì)胞遺傳學(xué)從細(xì)胞遺傳學(xué)衍生的分支學(xué)科主要有:體細(xì)胞遺傳學(xué):主要研究體細(xì)胞, 特別是離體培養(yǎng)的高等生物體細(xì)胞的遺傳規(guī)律;分子細(xì)胞遺傳學(xué):主要研究染色體的亞顯微結(jié)構(gòu)和基因活動(dòng)的關(guān)系; 進(jìn)化細(xì)胞遺傳學(xué):主要研究
8、染色體結(jié)構(gòu)和倍性改變與物種形成之間的關(guān)系;細(xì)胞器遺傳學(xué):主要研究細(xì)胞器如葉綠體、 線粒體等的遺傳結(jié)構(gòu);醫(yī)學(xué)細(xì)胞遺傳學(xué):是細(xì)胞遺傳學(xué)的基礎(chǔ)理論與臨床醫(yī)學(xué)緊密結(jié)合的邊緣科學(xué),研究染色體畸變與遺傳病的關(guān)系等,對(duì)于遺傳咨詢(xún)和優(yōu)生優(yōu)育具有重要意義。 藥物遺傳學(xué)又稱(chēng)藥理遺傳學(xué)。是研究藥物反應(yīng)其遺傳變異的學(xué)科。廣義的藥物遺傳學(xué)研究包括一切遺傳決定的對(duì)藥物反應(yīng)的變異。狹義的藥物遺傳學(xué)僅限于研究對(duì)藥物反應(yīng)的遺傳變異。它是藥理學(xué)與遺傳學(xué)相結(jié)合發(fā)展起來(lái)的邊緣學(xué)科。藥物遺傳學(xué)的研究對(duì)象和范圍:1.人體和實(shí)驗(yàn)動(dòng)物的遺傳變異對(duì)藥物反應(yīng)的影響;2.基因控制藥物體內(nèi)過(guò)程的分子基礎(chǔ);3.預(yù)測(cè)對(duì)藥物的應(yīng)異常的個(gè)體,以便進(jìn)行有效的
9、預(yù)防;4. 遺傳病的藥物防治方法。表觀遺傳學(xué)(epigenetics) 在基因組中除了DNA和RNA序列以外,還有許多調(diào)控基因的信息,它們雖然本身不改變基因的序列,但是可以通過(guò)基因修飾,蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)、DNA和其它分子的相互作用,而影響和調(diào)節(jié)遺傳的基因的功能和特性,并且通過(guò)細(xì)胞分裂和增殖周期影響遺傳的一門(mén)新興學(xué)科。它不僅對(duì)基因表達(dá)、調(diào)控、遺傳有重要作用,而且在腫瘤、免疫等許多疾病的發(fā)生和防治中亦具有十分重要的意義。四、遺傳學(xué)的發(fā)展歷史(Foundation and development of genetics )一.Mendel之前的遺傳學(xué)學(xué)說(shuō)(Genetic knowledge befor
10、e Gregor Mendel )新石器時(shí)代:選種和雜交公元前五世紀(jì)希波克拉底(Hippocrates)提出了第 一個(gè)遺傳理論。認(rèn)為子代具有親代的特性那是因?yàn)樵诰夯蚺咛ダ锛辛藖?lái)自身體各部分的微小代表元素(elememt)。遺傳學(xué)的發(fā)展歷史(Foundation and development of genetics )100年后,亞里斯多德(Aristotle)認(rèn) 為:精液不是提供胚胎組成的元素,而是提供后代的藍(lán)圖。生物的遺傳不是通過(guò)身體各部分樣本的傳遞,而是個(gè)體胚胎發(fā)育所需的信息傳遞二. Mendel遺傳學(xué)的誕生1900年前生物有性生殖研究進(jìn)展1809年拉馬克(Lamarck, J.B)
11、提出了“用進(jìn)廢退”的進(jìn)化論觀點(diǎn),由此而得出獲得性(acquiredcharacteristics)是可以遺傳的。1883年法國(guó)動(dòng)物學(xué)家魯.威廉(Roux.W) 提出有絲分裂和減數(shù)分裂過(guò)程的存在可能是由于染色體組成了遺傳物質(zhì),同時(shí)他還假定了遺傳單位沿著染色體絲作直線排列。1869年達(dá)爾文的表弟高爾頓(Galton, F.)發(fā)表了“ 天才遺傳(Hereditary genius)”,即 “融合遺傳論”。1863年法國(guó)的諾丹(Nauding) 發(fā)表了植物雜交的論文并獲法國(guó)政府的獎(jiǎng)勵(lì)。他認(rèn)為:(1)植物雜交的正交和反交結(jié)果是相同的;(2)在雜種植物的生殖細(xì)胞形成時(shí)“ 負(fù)責(zé)遺傳性狀的要素互相分開(kāi),進(jìn)入不
12、同的性細(xì)胞中,否則就無(wú)法解釋雜種二代所得到的結(jié)果”1865年當(dāng)時(shí)屬奧地利的布?。˙runn)基督教修道院的修士格里高孟德?tīng)枺℅regor Johann Mendel,1822-1884 ),根據(jù)他8年植物雜交實(shí)驗(yàn)的結(jié)果,2月8日在當(dāng)?shù)氐目茖W(xué)協(xié)會(huì)上宣讀了一篇題為“植物雜交實(shí)驗(yàn)”的論文,發(fā)表在布隆自然科學(xué)會(huì)志第4卷上1866年正式發(fā)表在該協(xié)會(huì)的會(huì)刊上。 孟德?tīng)柵R終前說(shuō):“ 等著瞧吧,我的時(shí)代總有一天要來(lái)臨”.Mendels crossing experiments with garden pea從1856-1871年進(jìn)行了大量植物雜交試驗(yàn)研究;其中對(duì)豌豆(嚴(yán)格自花授粉/閉花授粉)32個(gè)品種,差別明
13、顯的7對(duì)簡(jiǎn)單性狀進(jìn)行了長(zhǎng)達(dá)8年研究,提出遺傳因子假說(shuō)及其分離與自由組合規(guī)律(后稱(chēng)Mendels Laws)Mendle churchMendle and his room孟德?tīng)柖傻闹匦买?yàn)證(Mendels experiments and rediscovery of Mendels Law )荷蘭阿姆斯特丹大學(xué)的教授狄夫瑞斯(de Vries),材料月見(jiàn)草德國(guó)土賓根大學(xué)的教授科倫斯(Correns,C.E),材料玉米奧地利維也納農(nóng)業(yè)大學(xué)的講師切爾邁克(Tschermak),材料豌豆Mendels experiments and rediscovery of Mendels Law 1900年
14、分別同時(shí)驗(yàn)證了孟德?tīng)柕模‵2的分離比為3:1)他們?nèi)说恼撐亩伎窃?900年出版的德國(guó)植物學(xué)雜志上,都證實(shí)了孟德?tīng)柖?。The Birth of Genetics: A Scientific RevolutionDe Vries經(jīng)典遺傳學(xué)核心遺傳的染色體理論(Theory of Chromosome) 1)遺傳物質(zhì)位于染色體上 2)遺傳物質(zhì)的傳遞與有絲分 裂、減數(shù)分裂行為相聯(lián)系Development of genetics in the 20th century 1903年,Sutton和Boveri分別提出染色體遺傳理論,認(rèn)為:遺傳因子位于細(xì)胞核內(nèi)染色體上,從而將孟德?tīng)栠z傳規(guī)律與細(xì)胞學(xué)研究
15、結(jié)合起來(lái)。學(xué)科名稱(chēng)是英國(guó)遺傳學(xué)家貝特森(Bateson,W)于1909年首先提出的貝特森先后創(chuàng)用: 遺傳學(xué)(Genetics) 等位基因(allele) 純合體(homozygous) 雜合體(heterozygous) 上位基因(epistatic genes)Contributions of W. L. Johannson to genetics 1909年丹麥的科學(xué)家約翰遜(Johannsen)創(chuàng)用了 基因 (gene) 基因型(genotype) 表現(xiàn)型 (phenotype)4.野生型(基因)與突變型(基因):將自然界中出現(xiàn)最多的性狀稱(chēng)為野生型,其他性狀均稱(chēng)為突變型;相應(yīng)地,控制野生
16、型性狀及突變型性狀的基因分別稱(chēng)為野生型基因和突變型基因。5.純合體和雜合體:同源染色體同一基因座位上具有相同等位基因的個(gè)體或細(xì)胞稱(chēng)為純合體;反之,帶有不同形式等位基因的個(gè)體或細(xì)胞稱(chēng)為雜合體遺傳學(xué)發(fā)展的四個(gè)時(shí)期: 第一個(gè)時(shí)期:細(xì)胞遺傳學(xué)時(shí)期: Stage for the development of cytogenetics (19001940 ) 第二個(gè)時(shí)期:微生物遺傳學(xué)時(shí)期: From cell level to molecular level (19411960) 第三個(gè)時(shí)期:分子遺傳學(xué)時(shí)期: Molecular genetics/genomics (1953 ) 第四個(gè)時(shí)期:基因組與蛋白
17、質(zhì)組學(xué)時(shí)期:genomic and protomic stage(1986 )細(xì)胞遺傳學(xué)時(shí)期(1940-1960)確立了遺傳的染色體學(xué)說(shuō)1910年 摩爾根(Morgan ,T.H)及其 斯特蒂文特(Sturtevant) 弟子 布里吉斯(Bridges) 繆勒(Muller)以果蠅為材料,創(chuàng)立了連鎖交換定律摩爾根(Morgan T.H.,18661945): 提出“性狀連鎖遺傳規(guī)律”;伴性遺傳提出染色體遺傳理論 細(xì)胞遺傳學(xué);著基因論:認(rèn)為基因在染色體上直線排列,創(chuàng)立基因?qū)W說(shuō)是對(duì)孟德?tīng)栠z傳學(xué)說(shuō)的重大發(fā)展,也是這一歷史時(shí)期的巨大成物理學(xué)與遺傳學(xué)相結(jié)合輻射遺傳學(xué),使遺傳學(xué)的研究由研究遺傳規(guī)律深入到探
18、討誘變的機(jī)理。1927年 Muller X-射線誘發(fā)用X射線分別誘導(dǎo)果蠅和玉米突變成功,基因是一個(gè)抽象的遺傳因子,既是功能單位,又是重組單位和突變單位。1937年,布萊克斯里用秋水仙素誘導(dǎo)植物多倍體成功數(shù)學(xué)中的統(tǒng)計(jì)學(xué)原理引入到遺傳學(xué)中群體遺傳學(xué),使遺傳學(xué)研究由個(gè)體水平深入到群體水平微生物遺傳學(xué)時(shí)期(1940-1960)From cell level to molecular levelBiochemical geneticsStudy on metabolism disease by A. E. Garrod(1908)Study on bread mold by G. W. Beadle(1
19、940)Microorganism genetics:DNA is a genetic material微生物遺傳學(xué)時(shí)期1941 Beadle和 Totum 提出一基因一酶學(xué)說(shuō) 1944 Avery 確定遺傳物質(zhì)為DNA1951 McClintock B. 發(fā)現(xiàn)跳躍基因或稱(chēng)轉(zhuǎn)座在此期遺傳的基本單位是順?lè)醋樱–istrons) 把抽象的基因廣泛應(yīng)用于以微生物為材料的研究中,研究了基因的原初作用、精細(xì)結(jié)構(gòu)、化學(xué)本質(zhì)、突變機(jī)制、細(xì)菌的重組、基因調(diào)控等。取得了在高等動(dòng)植物中難以取得的成果。使人們認(rèn)識(shí)到遺傳學(xué)的基本規(guī)律適用于從噬菌體到人的一切生物。Lederberge Beadle轉(zhuǎn)化實(shí)驗(yàn)轉(zhuǎn)化實(shí)驗(yàn)196
20、0smaizemaizeleaves分子遺傳學(xué)時(shí)期(1953-Present)分子遺傳學(xué)時(shí)期 1953 Watson和 Crick建立雙螺旋模型1958 Kornberg 發(fā)現(xiàn) DNA合成酶1961: Jacob 和Monod建立乳糖操縱子模型1962 ,1968 Arber, 1978 Smith 發(fā)現(xiàn)限制 性酶1964,1965:Nirenberg,Khorana破譯遺傳 密碼1972 Berg建立重組技術(shù)1975 Temin發(fā)現(xiàn)反轉(zhuǎn)錄酶闡明了基因論的核心問(wèn)題遺傳物質(zhì)的自體復(fù)制和它的物理、化學(xué)基礎(chǔ)。六十年代,揭示了遺傳密碼的奧妙,把生物界統(tǒng)一起來(lái),并使DNA、mRNA、tRNA、核糖體的功
21、能得到初步闡明,提出遺傳信息傳遞的中心法則。七十年代,開(kāi)創(chuàng)了基因工程新技術(shù)。一. 原位分子雜交(in situ hybridization)二. 斑點(diǎn)雜交(dot blotting)三. Southern blot 雜交四. Northern hybridization雜交五. Western blotting六. 電鏡觀察 (1) 異源雙鏈定位法(Heferoduplex mapping) (2) R-環(huán)定位法(R-loop mapping)基因組與蛋白質(zhì)組學(xué)時(shí)期1977 Sanger & Gilbert 建立測(cè)序方法1977 Sharp 和 Roberts 發(fā)現(xiàn)內(nèi)含子 1980 Shapi
22、ro發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)座子1981 Cech和Altman 發(fā)現(xiàn)核酶1985 Mullis,K. 建立了PCR體外擴(kuò)增技術(shù)。此期基因的概念是一段可以轉(zhuǎn)錄為功能性RNA的DNA,它可以重迭、斷裂的形式存在,并可轉(zhuǎn)座。1986 美 Dulbecco首次提出了“ 人類(lèi)基因組工程”1990 4月美國(guó)宣布人類(lèi)基因組測(cè)序工作的5 年計(jì)劃。1991 Stepken Fodor 把基因芯片的設(shè)想第一次變成了現(xiàn)實(shí).1992 10月美Vollrath D.等分別完成人類(lèi)Y染 色體染色體的物理圖譜.1993 10月 美國(guó)公布了19931995年的人類(lèi)基因組測(cè)序工作計(jì)劃,并預(yù)計(jì)2005年完成整個(gè)的測(cè)序工作。1995 Smith,
23、H.O等第一個(gè)細(xì)菌基因組流感嗜血桿菌(H.influenzae)全基因組序列發(fā)表。1995 12月美、法科學(xué)家公布了有15000個(gè)標(biāo)記的人類(lèi)基因組的物理圖譜。1996 Dietrich W.F等繪制了小鼠基因組的完整遺傳圖譜。1996 10月Goffeau等完成了酵母基因組的測(cè)序1996 DNA芯片進(jìn)入商業(yè)化1997 Wilmut 完成了體細(xì)胞克隆1998 12月,第一個(gè)多細(xì)胞真核生物線蟲(chóng)的基因組在Science上發(fā)表。1999 Cate J.H第一次繪制出完整核糖體的晶體結(jié)構(gòu),揭示了其中的很多細(xì)節(jié)。1999 國(guó)際人類(lèi)基因組計(jì)劃聯(lián)合研究小組完成了人類(lèi) 第22號(hào)染色體測(cè)序工作。2000 3月塞萊
24、拉公司宣布完成了果蠅的基因組測(cè)序。 2000 完成了人類(lèi)第21號(hào)染色體的測(cè)序2000 6,26 人類(lèi)基因組草圖發(fā)表2000 12,14 英美等國(guó)科學(xué)家宣布繪出擬南 芥基因組的完整圖譜2001 1,12 中、美、日、德、法、英等國(guó)科 學(xué)家 (Nature,15日) 和美國(guó)塞萊拉公司 (Science,16日) 各自公布人類(lèi)基因組圖 譜和初步分析結(jié)果。約3萬(wàn)基因。遺傳學(xué)發(fā)展的新動(dòng)態(tài)1.基因組(genome)學(xué)2.后基因組學(xué)3.蛋白質(zhì)組學(xué)(Proteomics)4.生物信息學(xué)(Bioinformatic) 定義為分子生物學(xué)和計(jì)算生物學(xué)的交叉. 包含三個(gè)重要的內(nèi)容:(1) 基因組信息學(xué);(2)蛋白質(zhì)的
25、結(jié)構(gòu)模擬;(3)藥物設(shè)計(jì).與其它學(xué)科的關(guān)系1、生理學(xué)、細(xì)胞生物學(xué)、生物化學(xué)、發(fā)育學(xué)、分類(lèi)學(xué)、形態(tài)學(xué)、生態(tài)學(xué)等都離不開(kāi)DNA 2、與其它學(xué)科研究基因的不同點(diǎn):關(guān)注的是基因本身的特性,如它的結(jié)構(gòu)和功能。 是通過(guò)基因的變異研究基因 遺傳學(xué)是一門(mén)十分重要的學(xué)科涉及領(lǐng)域?qū)挘荷锏慕Y(jié)構(gòu)和功能,如生物體的大小、形態(tài)、器官結(jié)構(gòu)、顏色、生長(zhǎng)、代謝、發(fā)育、進(jìn)化、行為模式以及生化功能等都受基因操縱。還涉及人文科學(xué)中的許多領(lǐng)域,如哲學(xué)、法律、倫理和宗教等遺傳學(xué)是一門(mén)十分重要的學(xué)科影響深遠(yuǎn):遺傳學(xué)的飛速發(fā)展,特別是近幾十年所取得的成就令人驚嘆不止。例如,對(duì)人類(lèi)和重要物種基因組的全測(cè)序工作,基因組測(cè)序結(jié)合基因功能的確定,
26、將揭示遺傳的奧秘。為定向育種和人類(lèi)遺傳性疾病的治療和預(yù)防,提供準(zhǔn)確的方案 遺傳學(xué)的意義和應(yīng)用(Significance and applications of genetics)遺傳學(xué)與農(nóng)牧業(yè)的關(guān)系 Genetics and modern agricultureGenetics in the news遺傳學(xué)在醫(yī)療衛(wèi)生工作中的應(yīng)用 Genetics and medicine遺傳學(xué)在其他領(lǐng)域中的應(yīng)用Genetics and societyGenetics and medicine 遺傳學(xué)與醫(yī)學(xué)Genetics and modern agricultureGenetics and modern ag
27、riculture第一節(jié)、概率原理與應(yīng)用第二節(jié)、二項(xiàng)式展開(kāi)與應(yīng)用第三節(jié)、2測(cè)驗(yàn)(Chi平方 測(cè)驗(yàn))與應(yīng)用為什么要應(yīng)用統(tǒng)計(jì)方法分析數(shù)據(jù)?第一節(jié)、概率原理與應(yīng)用一、概率(probability):概率(機(jī)率/幾率/或然率):在數(shù)學(xué)上是小于1的數(shù),它是指在總體中某一事件發(fā)生的可能性(幾率)。例:雜種F1產(chǎn)生的配子中,帶有顯性基因和隱性基因的概率均為50。在遺傳研究時(shí),可以采用概率及概率原理對(duì)各個(gè)世代尤其是分離世代(如F2)的表現(xiàn)型或基因型種類(lèi)和比率(各種類(lèi)型出現(xiàn)的概率)進(jìn)行推算,從而分析、判斷該比率的真實(shí)性與可靠性;并進(jìn)而研究其遺傳規(guī)律。(一). 概率原理:設(shè)P表示某事物發(fā)生的概率,P的絕對(duì)值是a
28、q表示某事物不發(fā)生的概率, q的絕對(duì)值是事件:指事物的某種情況,或試驗(yàn)中獲得 的某種結(jié)果。 a+b=總數(shù) p+q=1 p=a/a+b q=b/a+b二)概率基本定理(乘法定理與加法定理)1.乘法定理 (Sum Rule):兩個(gè)獨(dú)立事件(independent events) 同時(shí)或相繼發(fā)生的概率等于各個(gè)事件發(fā)生的概率的乘積。 P(AB) = P(A) P(B)例:雙雜合體(YyRr)中,Yy的分離與Rr的分離是相互獨(dú)立的,在F1的配子中:具有Y的概率是1/2,y的概率也1/2;具有R的概率是1/2,r的概率是1/2。而同時(shí)具有Y和R的概率是兩個(gè)獨(dú)立事件(具有Y和R)概率的乘積:1/21/2=1
29、/4。(二)概率基本定理(乘法定理與加法定理)2.加法定理 (Product Rule):兩個(gè)互斥事件(matually exclusive events)中某一事件發(fā)生的概率是各個(gè)事件各自發(fā)生的概率之和。 P(A+B)=P(A)+P(B)若事件與早先出現(xiàn)過(guò)的事件有列聯(lián)關(guān)系,則在條件下的概率稱(chēng)為條件概率記為:() ()()事件A、A、B 和 B頻數(shù)表 求:表型正常的孩子中雜合體的概率? P(B|A)=P(AB)/P(A) P(A)=3/4; P(B)=1/2; P(AB)=1/2 P(A|B)=P(AB)/P(A)=(1/2)/(3/4)= 2/3 反之如要求雜合體中表型正常的概率為: P(A
30、|B)=P(AB)/P(B) =(1/2)/(1/2)= 1概率原理應(yīng)用 人類(lèi)遺傳分析中概率: 人類(lèi)遺傳:包括正常性狀和遺傳病遺傳,同樣表現(xiàn)孟德?tīng)栆?guī)律。根據(jù)遺傳物質(zhì)的傳遞方式,基因所在染色體的不同及參與控制性狀的基因數(shù)目的多少,可進(jìn)行如下分類(lèi):常說(shuō)成: 常染色體顯性單(多)基因遺傳 常染色體隱性單(多)基因遺傳 性染色體顯性單(多)基因遺傳 性染色體隱性單(多)基因遺傳雙生子研究 通過(guò)測(cè)定同卵雙生子(monozygotic twin)和異卵雙生子(dizygotic twin)的藥物濃度或藥物反應(yīng)進(jìn)行研究,一般規(guī)律是同卵雙生子的藥物代謝速度往往十分相似,而異卵雙生子間可出現(xiàn)明顯的差異。 雙生子
31、研究方法是評(píng)價(jià)遺傳因素對(duì)藥物代謝差異影響的過(guò)篩性研究。 正常性狀遺傳中概率: 注:人類(lèi)的生育能力是有限的,大部分人只有少數(shù)子女,從一個(gè)家庭很難看到上述全部情況,需要將若干家庭中相同婚配方式所生子女進(jìn)行綜合分析.例. 棕眼右癖男人與藍(lán)眼右癖女人結(jié)婚,其后代各類(lèi)型及概率。 遺傳病分析中概率 目前,已知人類(lèi)由單基因控制的遺傳性疾病約4000種左右,其中常染色體顯性2100左右,隱性1600種左右,X連鎖300種左右。 系譜分析法 系譜(Pedigree ):表示某遺傳病患者家系中各成員發(fā)病情況的一個(gè)圖表,是人類(lèi)遺傳學(xué)研究的重要手段 。先證者(propositus):家系中最先發(fā)現(xiàn)遺傳疾病的個(gè)體。受累
32、者(affected):家系中遺傳疾病的患者。 人類(lèi)的家譜分析(Pedigree Analysis)遺傳多態(tài)現(xiàn)象(genetic polymorphism):同一物種在染色體的同一座位上存在兩個(gè)以上等位基因的現(xiàn)象。在遺傳多態(tài)情況下,幾個(gè)等位基因全都可能在自然狀態(tài)下存在,都是野生型,這時(shí)需以適當(dāng)?shù)纳蠘?biāo)加以區(qū)分。如果蠅的乙醇脫氫酶(alcohol dehydrogenase)基因被記為AdhF和AdhS(上標(biāo)F和S分別代表該酶在電泳時(shí)移動(dòng)速度的快和慢) 常用一定的符號(hào)來(lái)代表家系中各成員及他們的狀況. Dominant Pedigree 系譜1991年Winship等人記述過(guò)人類(lèi)的一種罕見(jiàn)的全身皮膚
33、白斑(blaze)并伴有一縷白色額發(fā)(forelock)的顯性遺傳性狀:在具黑色皮膚個(gè)體的背、腹面、四肢及臉部出現(xiàn)不同大小的白色斑塊,頭頂中央出現(xiàn)一縷白發(fā)。下列系譜顯示在一個(gè)家庭中黑白斑(piebald)基因的遺傳。這種特殊的皮膚斑駁的表型是由于顯性黑白斑基因P(piebald gene)控制產(chǎn)生黑色素的細(xì)胞所形成的色素在發(fā)育過(guò)程中從背面向腹面的遷移造成的。同樣的情況也可在小鼠中看到。 在一個(gè)包括5個(gè)世代152個(gè)成員的挪威大家系中發(fā)現(xiàn),來(lái)自祖代的男性個(gè)體將該性狀的顯性基因P遺傳給他的3個(gè)女兒(38=38)、10個(gè)外孫和4個(gè)外孫女以及13個(gè)重孫女和10個(gè)重孫兒(2377=30)。該性狀的系譜分析
34、表明顯性單基因遺傳的傳遞線沒(méi)有中斷,即每代均有表現(xiàn),在男性和女性中均有發(fā)生。 人類(lèi)中隱性基因遺傳的典型例證要數(shù)味盲基因(nontaster,t)的遺傳。隱性等位基因t是一種傳遞不能品嘗出苯硫脲(phenylthiocarbamide,PTC)或者有關(guān)化合物的基因。對(duì)于這種化合物多數(shù)人是嘗味者(taster),舌根部滴入PTC被稀釋的1300萬(wàn)110萬(wàn)的溶液時(shí)就能夠品嘗出它的苦澀味道;少數(shù)是不能品嘗者,把濃度很高的PTC溶液(12萬(wàn))甚至結(jié)晶物放在這類(lèi)人的舌根部都不能品嘗出它的苦澀味來(lái),通常稱(chēng)這類(lèi)人為對(duì)PTC味盲(nontaster)。味盲者同味盲者的婚配,除極少數(shù)例外,只能生下味盲子女,嘗味者
35、與嘗味者,或嘗味者與味盲者婚配,可能會(huì)生下兩種類(lèi)型的子女。這暗示著味盲者是純合隱性體tt,嘗味者的基因型則無(wú)疑是TT或Tt。下列系譜說(shuō)明對(duì)PTC嘗味能力的遺傳。 亨汀頓舞蹈癥:動(dòng)作上會(huì)產(chǎn)生不自主的手足扭動(dòng),如跳舞般?;颊叩倪z傳密碼CGA會(huì)重復(fù)出現(xiàn)約40100次當(dāng)亨汀頓蛋白質(zhì)上的硫胺數(shù)目太多時(shí),就會(huì)造成舞蹈癥病變 常染色體隱性遺傳特點(diǎn)患者雙親無(wú)病,但都是攜帶者 上下代間具不連續(xù)遺傳性. 近親婚配,子女發(fā)病率高.隱性遺傳圖系譜白化病是一種先天性遺傳疾病,除了人以外,也會(huì)出現(xiàn)在動(dòng)物身上。黑種人身上又較其它人種常見(jiàn)。患者先天缺乏一種有助酚性化合物氧化成黑色素的一種酶類(lèi)。由于黑色素的缺乏,這些患者的頭發(fā)
36、及皮膚均成白色。白化病的患者對(duì)光線異常敏感,皮膚很容易被陽(yáng)光灼傷,需防曬保護(hù),他們易發(fā)生皮膚癌?;颊哐劬ξ饭?、視力差、眼睛的虹膜也呈紅色。 白化病白化病第二節(jié)、二項(xiàng)展開(kāi)式與應(yīng)用怎樣來(lái)處理涉及某種事件組合出現(xiàn)的概率呢? 如 Aa aa 雜交產(chǎn)生兩個(gè)子裔 推算這兩個(gè)子代具有某種遺傳組成的概率. 兩個(gè)都是Aa,概率是? 兩個(gè)都是aa,概率是 ? 一個(gè)Aa,一個(gè)aa概率是? 若不管次序先后,把相應(yīng)數(shù)值積加起來(lái),以p代Aa;q代aa。則有公式 (pq)2 =p 2 2pqq 2 =(Aa)22(Aa)(aa)(aa) 2從概率分布值看,恰好是公式的系數(shù)。二項(xiàng)式公式與通式用于分析兩對(duì)立事件(非此即彼)在多
37、次試驗(yàn)中每種事件組合發(fā)生的概率。設(shè)A、B為對(duì)立事件,P(A)=p, P(B)=q,n為估測(cè)其事件出現(xiàn)概率的事件數(shù)。顯然P(A+B)=p+q=1。r:在n次事件中A事件出現(xiàn)的次數(shù);n-r:在n次事件中B事件出現(xiàn)的次數(shù); 例:一對(duì)夫婦生有5個(gè)孩子,其中生3個(gè)男孩,2個(gè)女孩概率怎樣?第三節(jié)、2平方測(cè)驗(yàn)及應(yīng)用2測(cè)驗(yàn)是一種統(tǒng)計(jì)假設(shè)測(cè)驗(yàn):先作統(tǒng)計(jì)假設(shè)(一個(gè)無(wú)效假設(shè)和一個(gè)備擇假設(shè)),然后根據(jù)估計(jì)的參數(shù)(2)來(lái)判斷應(yīng)該接受其中哪一個(gè)。判斷一個(gè)實(shí)驗(yàn)結(jié)果是否可以用孟德?tīng)柕?331的理論來(lái)說(shuō)明,還是必須否定這個(gè)理論比率?生物統(tǒng)計(jì)學(xué)上已有十分成熟而簡(jiǎn)便的方法,那就是離散型數(shù)據(jù)的x2S檢驗(yàn)(Chisquare test
38、),亦即適合度(goodness of fit)檢驗(yàn)法。利用x2作為一個(gè)測(cè)量實(shí)際觀察的頻數(shù)(observed)和預(yù)計(jì)頻數(shù)(expected)之間的偏離度的判據(jù)。 (二)、2測(cè)驗(yàn)應(yīng)用方法水稻有些植株對(duì)白葉枯病有抗性, 有些則敏感 抗性 敏感 抗性 敏感 14個(gè)抗性 , 6個(gè)敏感實(shí)測(cè)值Observed, 預(yù)計(jì)值Expected 據(jù)二項(xiàng)式公式。在展開(kāi)式中,剛好得到14株抗性,6株敏感概率為0.037, 誤差概率(P):先用二項(xiàng)式展開(kāi)法求得子代中各組合的概率, 然后以實(shí)得數(shù)與理論數(shù)來(lái)比較,把與實(shí)得數(shù)有著同樣偏差或更大偏差的那些 組合的 概率加起來(lái)就是誤差概率。 1)當(dāng)P0.05時(shí),原假設(shè)成立。 2)當(dāng)P0.01時(shí),原假設(shè)不成立。X2 1.統(tǒng)計(jì)的標(biāo)準(zhǔn):P0.05 結(jié)果與理論數(shù)無(wú)顯著差異,實(shí) 得值符合理論值。P0.05 結(jié)果與理論數(shù)有顯著差異,實(shí) 得值不符合理論值。P50%高;=2050%中;20%低.遺傳率的特征與應(yīng)用措施遺傳率是在特定環(huán)境條件下,采用特定群體估計(jì),環(huán)境條件與遺傳群體
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