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文檔簡介
1、第四章 生物信息的傳遞(下) 從mRNA到蛋白質(zhì) 翻譯:指將mRNA鏈上的核甘酸從一個特定的起始位點開始,按每三個核甘酸代表一個氨基酸的原則,依次合成一條多肽鏈的過程。蛋白質(zhì)合成的場所是蛋白質(zhì)合成的模板是模板與氨基酸之間的接合體是蛋白質(zhì)合成的原料是核糖體mRNAtRNA20種氨基酸 遺傳密碼三聯(lián)子 tRNA的結(jié)構(gòu)、功能與種類 核糖體的結(jié)構(gòu)與功能 蛋白質(zhì)合成的過程 蛋白質(zhì)的運轉(zhuǎn)機制Contents一、遺傳密碼三聯(lián)子(一)三聯(lián)子密碼定義 mRNA鏈上每三個核甘酸翻譯成蛋白質(zhì)多肽鏈上的一個氨基酸,這三個核甘酸就稱為密碼子或三聯(lián)子密碼(triplet coden) 。mRNA 5 GCU AGU AC
2、A AAA CCU 3(二)三聯(lián)子密碼破譯mRNA5 AUCGACCUGAGC3420()mRNA5 AUCGACCUGAGC342=1620()mRNA5AUCGACCUGAGC343=6420()核甘酸序列氨基酸序列至1966年,20種氨基酸對應的61個密碼子和三個終止密碼子全部被查清。遺傳密碼的破譯,即確定代表每種氨基酸的具體密碼。(三)遺傳密碼的性質(zhì)1、簡并性由一種以上密碼子編碼同一個氨基酸的現(xiàn)象稱為簡并(degeneracy),對應于同一氨基酸的密碼子稱為同義密碼子(synonymous codon)。減少了變異對生物的影響編碼某一氨基酸的密碼子越多,該氨基酸在蛋白質(zhì)中出現(xiàn)的頻率就越
3、高。Arg例外 簡述密碼的簡并性(degeneracy)和同義密碼子(synonymous codon) 武漢大學2003年試題(三)遺傳密碼的性質(zhì)2、普遍性與特殊性蛋白質(zhì)生物合成的整套密碼,從原核生物到人類都通用。已發(fā)現(xiàn)少數(shù)例外,如動物細胞的線粒體、植物細胞的葉綠體。生物密碼子線粒體DNA編碼的氨基酸核DNA編碼的氨基酸所有UGA色氨酸終止子酵母CUA蘇氨酸亮氨酸果蠅AGA絲氨酸精氨酸哺乳類AGA/G終止子精氨酸哺乳類AUA甲硫氨酸異亮氨酸線粒體與核DNA密碼子使用情況的比較(三)遺傳密碼的性質(zhì)3、 連續(xù)性編碼蛋白質(zhì)氨基酸序列的各個三聯(lián)體密碼連續(xù)閱讀,密碼間既無間斷也無交叉。 基因損傷引起m
4、RNA閱讀框架內(nèi)的堿基發(fā)生插入或缺失,可能導致框移突變(frameshift mutation)。 從mRNA 5端起始密碼子AUG到3端終止密碼子之間的核苷酸序列,各個三聯(lián)體密碼連續(xù)排列編碼一個蛋白質(zhì)多肽鏈,稱為開放閱讀框架(open reading frame, ORF)。 (三)遺傳密碼的性質(zhì)4、擺動性轉(zhuǎn)運氨基酸的tRNA上的反密碼子需要通過堿基互補與mRNA上的遺傳密碼子反向配對結(jié)合,在密碼子與反密碼子的配對中,前兩對嚴格遵守堿基配對原則,第三對堿基有一定的自由度,可以“擺動”,這種現(xiàn)象稱為密碼子的擺動性。 U擺動配對密碼子、反密碼子配對的擺動現(xiàn)象tRNA反密碼子第1位堿基IUGACm
5、RNA密碼子第3位堿基U, C, AA, GU, CUG 遺傳密碼三聯(lián)子 tRNA的結(jié)構(gòu)、功能與種類 核糖體的結(jié)構(gòu)與功能 蛋白質(zhì)合成的過程 蛋白質(zhì)的運轉(zhuǎn)機制Contents二、tRNA的結(jié)構(gòu)、功能與種類(一) tRNA的結(jié)構(gòu) 1、二級結(jié)構(gòu):三葉草形二、tRNA的結(jié)構(gòu)、功能與種類(一) tRNA的結(jié)構(gòu) 2、三級結(jié)構(gòu): “L”形氫鍵(二) tRNA的功能1、解讀mRNA的遺傳信息2、運輸?shù)墓ぞ?,運載氨基酸t(yī)RNA有兩個關鍵部位: 3端CCA:接受氨基酸,形成氨酰-tRNA。 與mRNA結(jié)合部位反密碼子部位35ICCA-OH53CCA-OHG G CC C GtRNA憑借自身的反密碼子與mRNA鏈上
6、的密碼子相識別,把所帶氨基酸放到肽鏈的一定位置。1、起始tRNA和延伸tRNA(三) tRNA的種類能特異地識別mRNA模板上起始密碼子的tRNA稱起始tRNA,其他tRNA統(tǒng)稱為延伸tRNA(P111)。P111、P120:真核生物:起始密碼子AUG 所編碼的氨基酸是Met,起始AA-tRNA為Met-tRNAMet。原核生物:起始密碼子AUG 所編碼的氨基酸并不是 甲硫氨酸本身, 而是甲酰甲硫氨酸,起始AA-tRNA為fMet-tRNAfMet2、同工tRNA(三) tRNA的種類 代表同一種氨基酸的tRNA稱為同工tRNA。 同工tRNA既要有不同的反密碼子以識別該氨基酸的各種同義密碼,
7、又要有某種結(jié)構(gòu)上的共同性,能被相同的氨基酰-tRNA合成酶識別(P112)。3、校正tRNA(三) tRNA的種類 無義突變:在蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)基因中,一個核苷酸的改變可能使代表某個氨基酸的密碼子變成終止密碼子(UAG、UGA、UAA),使蛋白質(zhì)合成提前終止,合成無功能的或無意義的多肽,這種突變就稱為無義突變。 錯義突變:由于結(jié)構(gòu)基因中某個核甘酸的變化使一種氨基酸的密碼子變?yōu)榱硪环N氨基酸的密碼子,這種基因突變叫錯義突變。 GGA(甘氨酸) AGA(精氨酸)無義突變錯義抑制 遺傳密碼三聯(lián)子 tRNA的結(jié)構(gòu)、功能與種類 核糖體的結(jié)構(gòu)與功能 蛋白質(zhì)合成的過程 蛋白質(zhì)的運轉(zhuǎn)機制Contents三、核糖體的
8、結(jié)構(gòu)與功能 (一)核糖體的結(jié)構(gòu)核糖體的組成表14-7 原核和真核生物核糖體的組成及功能核糖體亞基 rRNAs 蛋白 RNA的特異順序和功能 細菌 70S 50S 23S=2904b 31種(L1-L31)含CGAAC和GTCG互補2.5106D 5S=120b66%RNA 30S 16S=1542b 21種(S1-S21) 16SRNA(CCUCCU)和S-D 順序(AGGAGG)互補 哺乳動物 80S 60S 28S=4718b 49種 有GAUC和tRNAfMat的TCG互補4.2106D 5S=120b 60%RNA 5.8S=160b 40S 18S=1874b 33種 和Capm7G
9、結(jié)合 三、核糖體的結(jié)構(gòu)與功能 (二)核糖體的功能:合成蛋白質(zhì)在單個核糖體上,可化分多個功能活性中心,在蛋白質(zhì)合成過程中各有專一的識別作用和功能。mRNA結(jié)合部位小亞基結(jié)合或接受AA-tRNA部位(A位)大亞基結(jié)合或接受肽基tRNA的部位大亞基肽基轉(zhuǎn)移部位(P位)大亞基形成肽鍵的部位(轉(zhuǎn)肽酶中心)大亞基 遺傳密碼三聯(lián)子 tRNA的結(jié)構(gòu)、功能與種類 核糖體的結(jié)構(gòu)與功能 蛋白質(zhì)合成的過程 蛋白質(zhì)的運轉(zhuǎn)機制Contents四、蛋白質(zhì)合成的過程氨基酸的活化翻譯的起始肽鏈的延伸肽鏈的終止蛋白質(zhì)前體的加工(一)氨基酸的活化氨基酸 + tRNA氨基酰- tRNAATP AMPPPi氨基酰-tRNA合成酶氨基酰
10、-tRNA合成酶對底物氨基酸和tRNA都有高度特異性。氨基酰-tRNA合成酶具有校正活性(proofreading activity) 。氨基酰-tRNA的表示方法:Ala-tRNAAla Ser-tRNASerMet-tRNAMet 原核生物中,起始氨基酸是: 起始AA-tRNA是:真核生物中,起始氨基酸是: 起始AA-tRNA是:甲酰甲硫氨酸fMet-tRNAfMet甲硫氨酸Met-tRNAMet第一步反應氨基酸 ATP-E 氨基酰-AMP-E AMP PPi 目 錄第二步反應氨基酰-AMP-E tRNA 氨基酰-tRNA AMP E目 錄 tRNA與酶結(jié)合的模型tRNA氨基酰-tRNA合
11、成酶ATP(二)翻譯的起始原核生物(細菌)為例:所需成分:30S小亞基、 50S大亞基、模板mRNA、 fMet-tRNAfMet、GTP、Mg2+翻譯起始因子:IF-1、IF-2、IF-3、IF-3IF-1翻譯起始(翻譯起始復合物形成)又可被分成3步: (P122)1. 核蛋白體大小亞基分離2、30S小亞基通過SD序列與mRNA模板相結(jié)合。AUG53IF-3IF-1S-D序列 IF-3IF-1IF-2GTP3.在IF-2和GTP的幫助下, fMet-tRNAfMet進入小亞基的P位,tRNA上的反密碼子與mRNA上的起始密碼子配對。AUG53IF-3IF-1IF-2GTPGDPPi4、帶有t
12、RNA、mRNA和3個翻譯起始因子的小亞基復合物與50S大亞基結(jié)合,GTP水解,釋放翻譯起始因子。AUG53IF-3IF-1AUG53IF-2GTPIF-2-GTPGDPPi真核生物翻譯起始的特點核糖體較大,為;起始因子比較多; mRNA 5端具有m7Gppp帽子結(jié)構(gòu) Met-tRNAMet mRNA的5端帽子結(jié)構(gòu)和3端polyA都參與形成翻譯起始復合物; 真核生物翻譯起始復合物形成(區(qū)別原核生物) 原核生物中30S小亞基首先與mRNA模板相結(jié)合,再與fMet-tRNAfMet結(jié)合,最后與50S大亞基結(jié)合。而在真核生物中,40S小亞基首先與Met-tRNAMet相結(jié)合,再與模板mRNA結(jié)合,最
13、后與60S大亞基結(jié)合生成80SmRNAMet-tRNAMet起始復合物(P120)。met40S60SMetMet40S60SmRNAeIF-2B、eIF-3、 eIF-6 elF-3GDP+Pi各種elF釋放elF-5ATPADP+PielF4E, elF4G, elF4A, elF4B,PABMetMet-tRNAMet-elF-2 -GTP真核生物翻譯起始復合物形成過程 肽鏈延伸由許多循環(huán)組成,每加一個氨基酸就是一個循環(huán),每個循環(huán)包括:AA-tRNA與核糖體結(jié)合、 肽鍵的生成 和 移位。 延伸因子(elongation factor, EF) : 原核生物:EF-T (EF-Tu, EF
14、-Ts) EF-G 真核生物:EF-1 、EF-2 (三)肽鏈的延伸1、AA-tRNA與核糖體A位點的結(jié)合需要消耗GTP,并需EF-Tu、EF-Ts兩種延伸因子通過延伸因子EF-Ts再生GTP,形成EF-TuGTP復合物 EF-Tu-GDP+ EF-Ts EF-Tu-Ts + GDP EF-Tu-Ts + GTP EF-Tu-GTP + EF-Ts重新參與下一輪循環(huán)2、肽鍵形成是由轉(zhuǎn)肽酶/肽基轉(zhuǎn)移酶催化3、移位核糖體向mRNA3端方向移動一個密碼子。需要消耗GTP,并需EF-G延伸因子延長因子EF-G有轉(zhuǎn)位酶( translocase )活性,可結(jié)合并水解1分子GTP,促進核蛋白體向mRNA的
15、3側(cè)移動 。fMetAUG53fMetTuGTP目 錄原核肽鏈合成終止過程 (四)肽鏈的終止 RF1:識別終止密碼子UAA和UAG 終止因子 RF2:識別終止密碼子UAA和UGA RF3:具GTP酶活性,刺激RF1和 RF2活性,協(xié)助肽鏈的釋放(原核生物)真核生物只有一個終止因子(eRF)(五)蛋白質(zhì)前體的加工1、N端fMet或Met的切除新生蛋白質(zhì)經(jīng)蛋白酶切后變成有功能的成熟蛋白質(zhì)2、二硫鍵的形成兩個半胱氨酸-SH -SH -SH 二硫鍵氧化3、特定氨基酸的修飾 磷酸化、糖基化、甲基化、乙基化、羥基化和羧基化4、切除新生肽鏈中非功能片段前胰島素原蛋白翻譯后成熟過程示意圖(六)蛋白質(zhì)合成抑制劑
16、 遺傳密碼三聯(lián)子 tRNA的結(jié)構(gòu)、功能與種類 核糖體的結(jié)構(gòu)與功能 蛋白質(zhì)合成的過程 蛋白質(zhì)的運轉(zhuǎn)機制Contents五、蛋白質(zhì)的運轉(zhuǎn)機制蛋白性質(zhì) 運轉(zhuǎn)機制 主要類型 分泌 蛋白質(zhì)在結(jié)合核糖體上合成,并以翻譯-運轉(zhuǎn)同步機制運輸免疫球蛋白、卵蛋白、水解酶、激素等細胞器發(fā)育 蛋白質(zhì)在游離核糖體上合成,以翻譯后運轉(zhuǎn)機制運輸 核、葉綠體、線粒體、乙醛酸循環(huán)體、過氧化物酶體等細胞器中的蛋白質(zhì) 膜的形成 兩種機制兼有 質(zhì)膜、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)、類囊體中的蛋白質(zhì) 1、翻譯-運轉(zhuǎn)同步機制信號肽假說信號肽:常指新合成多肽鏈中用于指導蛋白質(zhì)跨膜轉(zhuǎn)移的N-末端氨基酸序列(有時不一定在N端)。信號序列特點:(1)一般帶有10-15
17、個疏水氨基酸;(2)在靠近該序列N-端常常有1個或數(shù)個帶正電荷的氨基酸;(3)在其C-末端靠近蛋白酶切割位點處常常帶有數(shù)個極性氨基酸,離切割位點最近的那個氨基酸往往帶有很短的側(cè)鏈(丙氨酸或甘氨酸)。信號肽假說內(nèi)容:新生蛋白質(zhì)通過同步轉(zhuǎn)運途徑進入內(nèi)質(zhì)網(wǎng)內(nèi)腔的主要過程2、翻譯后運轉(zhuǎn)機制(1)線粒體蛋白質(zhì)跨膜運轉(zhuǎn)(2)葉綠體蛋白質(zhì)的跨膜運轉(zhuǎn)(3)核定位蛋白的運轉(zhuǎn)機制復習體1 多數(shù)氨基酸都有兩個以上密碼子,下列哪組氨基酸只有一個密碼子? A蘇氨酸、甘氨酸 B脯氨酸、精氨酸 C絲氨酸、亮氨酸 D色氨酸、甲硫氨酸 E天冬氨酸和天冬酰胺(D)2tRNA分子上結(jié)合氨基酸的序列是 ACAA-3 BCCA-3 C
18、AAC-3 DACA-3 EAAC-3(B)3遺傳密碼 A20種氨基酸共有64個密碼子 B堿基缺失、插入可致框移突變 CAUG是起始密碼 DUUU是終止密碼 E一個氨基酸可有多達6個密碼子(B、C、E)4、tRNA能夠成為氨基酸的轉(zhuǎn)運體、是因為其分子上有 A-CCA-OH 3末端 B3個核苷酸為一組的結(jié)構(gòu) C稀有堿基 D反密碼環(huán) E假腺嘌吟環(huán)(A、D)5、蛋白質(zhì)生物合成中的終止密碼是( )。(A)UAA (B)UAU (C)UAC (D)UAG (E)UGAA、D、E6、Shine-Dalgarno順序(SD-順序)是指:( ) A.在mRNA分子的起始碼上游8-13個核苷酸處的順序B.在DN
19、A分子上轉(zhuǎn)錄起始點前8-13個核苷酸處的順序C.16srRNA3端富含嘧啶的互補順序D.啟動基因的順序特征A7、“同工tRNA”是:( )(A)識別同義mRNA密碼子(具有第三堿基簡并性)的多個tRNA(B)識別相同密碼子的多個tRNA(C)代表相同氨基酸的多個tRNA(D)由相同的氨酰tRNA合成酶識別的多個tRNAC8、反密碼子中哪個堿基對參與了密碼子的簡并性(搖擺)。( )(A)第個 (B)第二個 (C)第二個 (D) 第一個與第二個A9、與mRNA的GCU密碼子對應的tRNA的反密碼子是( )(A)CGA(B)IGC (C)CIG(D)CGIB10、真核與原核細胞蛋白質(zhì)合成的相同點是(
20、 )(A)翻譯與轉(zhuǎn)錄偶聯(lián)進行 (B)模板都是多順反子(C) 都需要GTP (D)甲酰蛋氨酸是第一個氨基酸CA、mRNA上的密碼子與tRNA上的反密碼子不一定嚴格配對B、轉(zhuǎn)肽酶C、酯鍵D、磷酸化酶E、N-C糖甘鍵11、是翻譯延長所必需的12、氨基酸與tRNA連接13、遺傳密碼的擺動性BDAZr$u(x+B2E5H9KcNfRiUmXp#s&v)y0C3F7IaLdPgSjVnYq$t*w-A1D4G8JbMeQhTlWoZr%u(x+B2E6H9KcOfRiUmXp!s&v)z0C3F7IaMdPgSkVnYq$t*x-A1D5G8JbNeQiTlWo#r%u(y+B3E6H9LcOfRjUmX
21、p!s&w)z0C4F7IaMdPhSkVnZq$t*x-A2D5G8KbNeQiTlXo#r%v(y+B3E6I9LcOgRjUmYp!t&w)z1C4F7JaMePhSkWnZq$u*x+A2D5H8KbNfQiTlXo#s%v(y0B3E6I9LdOgRjVmYp!t&w-z1C4G7JaMePhTkWnZr$u*x+A2E5H8KcNfQiUlXp#s%v)y0B3F6IaLdOgSjVmYq!t&w-z1D4G7JbMePhTkWoZr$u(x+A2E5H9KcNfRiUlXp#s&v)y0C3F6IaLdPgSjVnYq!t*w-A1D4G8JbMeQhTlWoZr%u(x+B2E
22、6H9KcOfRiUmXp#s&v)z0C3F7IaLdPgSkVnYq$t*w-A1D5G8JbNeQhTlWo#r%u(y+B2E6H9LcOfRjUmXp!s&w)z0C4F7IaMdPhSkVnZq$t*x-A1D5G8KbNeQiTlWo#r%v(y+B3E6H9LcOgRjUmYp!s&w)z1C4F7JaMdPhSkWnZq$u*x-A2D5H8KbNfQiTlXo#s%v(y0B3E6I9LcOgRjVmYp!t&w)z1C4G7JaMePhSkWnZr$u*x+A2D5H8KcNfQiUlXo#s%v)y0B3F6I9LdkWnZq$u*x-A2D5H8KbNfQiTlXo#
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24、8JbNeQiTlWo#r%u(y+B3E6H9LcOfRjUmYp!s&w)z0C4F7JaMdPhSkVnZq$u*x-A2D5G8KbNfQiTlXo#r%v(y0B3E6I9LcOgRjUmYp!t&w)z1C4F7JaMePhSkWnZq$u*x+A2D5H8KbNfQiUlXo#s%v(y0B3F6I9LdOgRjVmYq!t&w-z1C4G7JbMePhTkWnZr$u(x+A2E5H8KcNfQiUlXp#s%v)y0B3F6IaLdOgSjVmYq!t*w-z1D4G7JbMeQhTkWoZr$u(x+B2E5H9KcNfRiUmXp#s&v)y0C3F7IaLdPgSjVn
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