中東呼吸綜合征疫情處理及實驗室檢測課件(PPT 54頁)

1、中東呼吸綜合征（）疫情處理與實驗室檢驗北京市疾病預(yù)防控制中心林長纓年月日第1頁，共54頁。主要內(nèi)容中東呼吸綜合征（）的流行病學(xué)診斷與報告實驗室檢測總結(jié)第2頁，共54頁。中東呼吸綜合征 （）中東呼吸綜合征： ，簡稱病 原 體：新型冠狀病毒，傳播途徑：近距離長時間接觸，經(jīng)呼吸道傳播易感人群：兒童、老年人和基礎(chǔ)病患者首例病例：年月，沙特人，吉大港臨床特點：致死率較高，兒童病例癥狀較輕，重癥病例主要是下呼吸道感染、呼吸衰竭、休克和急性腎衰竭疫情特點：散發(fā)為主第3頁，共54頁。中東呼吸綜合征冠狀病毒第4頁，共54頁。人類冠狀病毒第5頁，共54頁。冠狀病毒屬采用依賴聚合酶()上片段進(jìn)行分析第6頁，共54頁

2、。分類地位冠狀病毒科，冠狀病毒屬，亞屬，種系其它冠狀病毒與(扁顱蝠冠狀病毒）和 (伏翼蝙蝠冠狀病毒) 親緣較近與、和分屬不同種系與、分屬不同亞屬第7頁，共54頁。病毒基因組單股正鏈，基因組，分個開放讀取框合成種獨(dú)特的輔助蛋白(, , , , )及種復(fù)制酶和種結(jié)構(gòu)蛋白第8頁，共54頁。病毒結(jié)構(gòu)包膜病毒病毒外殼：棘突蛋白、包膜蛋白、膜蛋白病毒核心：單股正鏈、核衣殼蛋白棘突蛋白 包膜蛋白 核衣殼蛋白 膜蛋白 第9頁，共54頁。病毒侵入細(xì)胞的機(jī)理人類（支氣管上皮細(xì)胞）是的細(xì)胞受體刺突蛋白與結(jié)合，介導(dǎo)了病毒附著宿主細(xì)胞，病毒與細(xì)胞融合由此觸發(fā)感染。第10頁，共54頁。的流行病學(xué)特點第11頁，共54頁。傳

3、染源 自然宿主？核酸片段血清抗體單峰駝分布第12頁，共54頁。駱駝人傳播證據(jù) （ , , ， ） , , 第13頁，共54頁。傳染源患者有限的人傳人二代病例少，沒有三代病例 少量家族聚集性病例傳播能力較弱第14頁，共54頁。傳播途徑第15頁，共54頁。疫情發(fā)現(xiàn)患者：歲，沙特阿拉伯籍發(fā)病時間：月日入院時間：月日，吉大港某醫(yī)院主要癥狀：重癥肺炎、腎功能衰竭死亡時間：月日實驗室檢測：尸檢肺組織的冠狀病毒通用引物 檢測陽性；經(jīng)荷蘭醫(yī)學(xué) 中心（）進(jìn)行序列比對，懷 疑為一種新型冠狀病毒感染。 第16頁，共54頁。疫情發(fā)現(xiàn)患者：男性，歲，卡塔爾籍發(fā)病時間：月日入院時間：月日，多哈某醫(yī)院；月日轉(zhuǎn) 英國治療主要

4、癥狀：呼吸道癥狀、腎功能衰竭流行病學(xué)史：發(fā)病前曾到沙特阿拉伯實驗室檢測：呼吸道樣本中冠狀病毒通用引物 檢測陽性；經(jīng)序列比對，懷疑為 一種新型冠狀病毒感染。 第17頁，共54頁。疫情發(fā)現(xiàn)兩例病例體內(nèi)的新型冠狀病毒聚合酶基因序列比對（）結(jié)果顯示其同源性高達(dá)病毒與蝙蝠冠狀病毒的同源性較高 (和 ) 與冠狀病毒在基因序列上相似程度不高此病毒感染導(dǎo)致一種新發(fā)傳染病 第18頁，共54頁。病例來自于中東國家歐盟發(fā)布的疫情動態(tài)（年月底）第19頁，共54頁。全球疫情狀態(tài)：截至年月日，全球共計例實驗室確診病例，死亡人，病死率約為。歐盟：截至年月日，全球累計報告確診病例例，死亡例，病死率第20頁，共54頁。第21頁

5、，共54頁。病例時間分布第22頁，共54頁。病例地區(qū)分布截至年月日中東地區(qū)：沙特阿拉伯、阿聯(lián)酋、卡塔爾、蘇丹、安曼、科威特 、也門、黎巴嫩、伊朗另外：亞洲：韓國第23頁，共54頁。病例特征據(jù)報道，的潛伏期為天。男性病例較多：男女性別比為：年齡中位數(shù)為歲（范圍為歲）男性：歲，女性：歲。病死率較高（左右）無癥狀感染者比例大約為。的病例為醫(yī)務(wù)人員：醫(yī)院是“重災(zāi)區(qū)”第24頁，共54頁。臨床表現(xiàn)主要表現(xiàn)：發(fā)熱畏寒寒戰(zhàn)干咳、氣短頭痛和肌痛。其他癥狀：咽痛、鼻塞、咯痰惡心、嘔吐、頭暈腹瀉和腹痛。第25頁，共54頁。臨床表現(xiàn)重癥患者：開始表現(xiàn)為發(fā)熱伴上呼吸道癥狀一周內(nèi)快速進(jìn)展為重癥肺炎，伴有呼吸衰竭、休克、急

6、性腎功能衰竭、凝血功能障礙和血小板減少。患者中有的病例無臨床癥狀僅表現(xiàn)為輕微的呼吸道癥狀無發(fā)熱、腹瀉和肺炎。第26頁，共54頁。臨床表現(xiàn)影像學(xué)表現(xiàn)：如發(fā)生肺炎可出現(xiàn)：單側(cè)至雙側(cè)的肺部影像學(xué)改變主要特點為胸膜下和基底部分布，磨玻璃影為主，可出現(xiàn)實變影第27頁，共54頁。臨床檢測血常規(guī)：白細(xì)胞總數(shù)一般不高，可伴有淋巴細(xì)胞減少。血生化檢查：部分患者肌酸激酶、天門冬氨酸氨基轉(zhuǎn)移酶、丙氨酸氨基轉(zhuǎn)移酶、乳酸脫氫酶、肌酐等升高。第28頁，共54頁。防控措施第29頁，共54頁。診斷與報告第30頁，共54頁。病例發(fā)現(xiàn)嚴(yán)重急性呼吸道感染（）監(jiān)測區(qū)縣醫(yī)院科室東城天壇醫(yī)院呼吸內(nèi)科病房感染性疾病科病房重癥醫(yī)學(xué)科病房兒科

7、病房重癥監(jiān)護(hù)室（）石景山石景山醫(yī)院朝陽北京華信醫(yī)院西城北京大學(xué)人民醫(yī)院海淀航天中心醫(yī)院大興大興區(qū)人民醫(yī)院密云密云縣醫(yī)院昌平昌平區(qū)醫(yī)院門頭溝京煤集團(tuán)總醫(yī)院懷柔懷柔區(qū)第一醫(yī)院不明原因肺炎病例監(jiān)測呼吸道暴發(fā)疫情監(jiān)測口岸監(jiān)測第31頁，共54頁。疑似病例定義患者同時符合臨床表現(xiàn)和流行病學(xué)史，但尚無實驗室確認(rèn)依據(jù)。臨床表現(xiàn) 難以用其他病原感染解釋的急性呼吸道感染：體溫 、咳嗽，有胸部影像學(xué)改變等。流行病學(xué)史發(fā)病前天內(nèi)在中東呼吸綜合征病例報告或流行地區(qū)旅游或居??；或與疑似臨床診斷確診病例有密切接觸史。阿拉伯半島中或附近的國家和地區(qū)：巴林、伊拉克、伊朗、以色列、約旦河西岸和加沙地帶、約旦、科威特、黎巴嫩、阿曼

8、、卡塔爾、沙特阿拉伯、敘利亞、阿聯(lián)酋、也門第32頁，共54頁。臨床診斷病例定義滿足疑似病例標(biāo)準(zhǔn)，僅有實驗室陽性篩查結(jié)果（如僅呈單靶標(biāo)或單份血清抗體陽性）的患者。滿足疑似病例標(biāo)準(zhǔn)，因僅有單份采集或處理不當(dāng)?shù)臉?biāo)本而導(dǎo)致實驗室檢測結(jié)果陰性或無法判斷結(jié)果的患者。第33頁，共54頁。確診病例定義具備下述項之一者可確診為中東呼吸綜合征實驗室確診病例： 至少雙靶標(biāo)檢測陽性。單個靶標(biāo)陽性產(chǎn)物，經(jīng)基因測序確認(rèn)。 從呼吸道標(biāo)本中分離出中東呼吸綜合征冠狀病毒。恢復(fù)期血清中東呼吸綜合征冠狀病毒抗體較急性期血清抗體水平呈倍及以上升高。第34頁，共54頁。密切接觸者定義診療、護(hù)理中東呼吸綜合征確診、臨床診斷或疑似病例時未

9、采取有效防護(hù)措施的醫(yī)護(hù)人員、家屬或其他與病例有類似近距離接觸的人員。.在確診、臨床診斷或疑似病例出現(xiàn)癥狀期間，有共同居住、學(xué)習(xí)、工作或其它密切接觸的人員。.現(xiàn)場調(diào)查人員調(diào)查后判斷認(rèn)為符合條件的人員。第35頁，共54頁。病例報告與調(diào)查發(fā)現(xiàn)中東呼吸綜合征疑似病例、臨床診斷病例及確診病例時，具備網(wǎng)絡(luò)直報條件的醫(yī)療機(jī)構(gòu)應(yīng)當(dāng)于小時內(nèi)進(jìn)行網(wǎng)絡(luò)直報，并同時報告本轄區(qū)疾控中心各區(qū)縣疾控中心接到轄區(qū)內(nèi)醫(yī)療機(jī)構(gòu)或醫(yī)務(wù)人員報告中東呼吸綜合征疑似病例、臨床診斷病例及確診病例后，應(yīng)在小時內(nèi)報告區(qū)縣衛(wèi)生局、市疾控中心。按照中東呼吸綜合征病例流行病學(xué)個案調(diào)查表趕赴現(xiàn)場對病例進(jìn)行流行病學(xué)調(diào)查和采樣于小時內(nèi)將流行病學(xué)調(diào)查報告上

10、報區(qū)縣衛(wèi)生局和市疾控中心，同時將調(diào)查情況通報病例現(xiàn)住址轄區(qū)疾控中心。第36頁，共54頁。標(biāo)本采集與檢測采集疑似病例的上呼吸道標(biāo)本和下呼吸道標(biāo)本；采集急性期血清和恢復(fù)期血清。按照高致病性病原微生物運(yùn)輸相關(guān)要求送本轄區(qū)疾控中心進(jìn)行標(biāo)本檢測。轄區(qū)疾控中心檢測出核酸陽性樣本后，應(yīng)立即將陽性標(biāo)本送市疾控中心進(jìn)行復(fù)核。具備實驗室檢測條件的網(wǎng)絡(luò)實驗室所在醫(yī)療機(jī)構(gòu)對于本單位發(fā)現(xiàn)的疑似病例，可在確保生物安全的情況下進(jìn)行初篩。第37頁，共54頁。病例救治醫(yī)療機(jī)構(gòu)發(fā)現(xiàn)疑似病例后應(yīng)按照北京市衛(wèi)生局關(guān)于做好可能發(fā)生的中東呼吸綜合征疫情醫(yī)療救治準(zhǔn)備工作的通知（京衛(wèi)醫(yī)字號）有關(guān)規(guī)定進(jìn)行救治做好醫(yī)療救治所需的人員、藥品、設(shè)施

11、、設(shè)備、防護(hù)用品等保障工作。第38頁，共54頁。病例管理在知情同意的情況下，對臨床診斷和確診病例實行隔離治療參與救治的醫(yī)護(hù)人員實施有效防護(hù)措施（標(biāo)準(zhǔn)預(yù)防飛沫傳播預(yù)防接觸傳播預(yù)防）。病例管理和感染防護(hù)具體要求參見國家衛(wèi)生計生委制定的中東呼吸綜合征病例診療方案（年版）和中東呼吸綜合征醫(yī)院感染預(yù)防與控制技術(shù)指南（年版）。 第39頁，共54頁。病例管理對于疑似病例：在尚未明確排除中東呼吸綜合征冠狀病毒感染前，原則上也應(yīng)當(dāng)實施隔離醫(yī)學(xué)觀察和治療做好感染防護(hù)，直至病人發(fā)熱、咳嗽等臨床癥狀體征消失或排除感染中東呼吸綜合征冠狀病毒。第40頁，共54頁。密切接觸者的追蹤和管理由密切接觸者現(xiàn)住址所在區(qū)縣衛(wèi)生局組織

12、、協(xié)調(diào)密切接觸者的追蹤和管理。密切接觸者均實行居家醫(yī)學(xué)觀察，每日至少進(jìn)行次體溫測定，并詢問是否出現(xiàn)急性呼吸道癥狀或其他相關(guān)癥狀及病情進(jìn)展。第41頁，共54頁。密切接觸者的追蹤和管理密切接觸者醫(yī)學(xué)觀察期為與病例末次接觸后天。醫(yī)學(xué)觀察期內(nèi)，一旦出現(xiàn)發(fā)熱、咳嗽，或腹瀉等非呼吸道感染癥狀 ，或有肺炎癥狀和體征等表現(xiàn)的病例，區(qū)縣衛(wèi)生局負(fù)責(zé)將其轉(zhuǎn)送至定點醫(yī)療機(jī)構(gòu)進(jìn)行診斷、報告、隔離及治療。現(xiàn)住址所在區(qū)縣疾控中心應(yīng)當(dāng)采集密切接觸者的咽拭子標(biāo)本和雙份血清標(biāo)本。第一份血清標(biāo)本應(yīng)當(dāng)盡可能在末次暴露后天內(nèi)采集第二份血清標(biāo)本間隔周后采集咽拭子標(biāo)本由采集標(biāo)本的區(qū)縣疾控中心開展檢測；血清標(biāo)本送市疾控中心。第42頁，共54

13、頁。實驗室檢測第43頁，共54頁。實驗室檢測血常規(guī)：白細(xì)胞總數(shù)一般不高，可伴有淋巴細(xì)胞減少。血生化檢查：部分患者肌酸激酶、天門冬氨酸氨基轉(zhuǎn)移酶、丙氨酸氨基轉(zhuǎn)移酶、乳酸脫氫酶、肌酐等升高。病原學(xué)檢測病毒分離培養(yǎng)：金標(biāo)準(zhǔn)血清學(xué)抗體檢測：需要雙份血清核酸檢測：可用于早期檢測第44頁，共54頁。病原學(xué)檢測病毒分離：需在實驗室內(nèi)進(jìn)行標(biāo)本上、下呼吸道采樣物，糞便，尿液，組織器官等培養(yǎng)用細(xì)胞系非洲綠猴腎（）細(xì)胞恒河猴腎（）細(xì)胞第45頁，共54頁。病原學(xué)檢測血清學(xué)檢測：可在實驗室內(nèi)進(jìn)行標(biāo)本：急性期、恢復(fù)期雙份血清，各急性期血清應(yīng)在發(fā)病后天內(nèi)采集，恢復(fù)期血清應(yīng)在發(fā)病后第周采集。方法法恢復(fù)期血清抗體滴度較急性期倍

14、及以上升高第46頁，共54頁。病原學(xué)檢測血清學(xué)檢測：可在實驗室內(nèi)進(jìn)行標(biāo)本：急性期、恢復(fù)期雙份血清，各急性期血清應(yīng)在發(fā)病后天內(nèi)采集恢復(fù)期血清應(yīng)在發(fā)病后第周采集方法法恢復(fù)期血清抗體滴度較急性期倍及以上升高注意血清學(xué)檢測中交叉凝集問題第47頁，共54頁。病原學(xué)檢測核酸檢測：可在實驗室內(nèi)進(jìn)行標(biāo)本：上呼吸道標(biāo)本：包括咽拭子、鼻拭子、鼻咽抽取物、咽漱液、深咳痰液下呼吸道標(biāo)本：包括呼吸道（支氣管）抽取物、支氣管灌洗液、肺組織活檢標(biāo)本其它標(biāo)本，如尸檢標(biāo)本，糞便，尿液（日）等標(biāo)本儲存及運(yùn)輸采集后小時內(nèi)，可冷藏或運(yùn)輸長期保存溫度為或更低每個病例應(yīng)盡可能在病程進(jìn)展的不同階段連續(xù)同時采集上、下呼吸道標(biāo)本第48頁，共5

15、4頁。病原學(xué)檢測核酸檢測：可在實驗室內(nèi)進(jìn)行靶基因：蛋白上游基因（）： ，初篩和確認(rèn)基因： ，初篩和確認(rèn)基因： ，初篩和確認(rèn) 依賴的聚合酶（）基因：，用于測序核衣殼蛋白（）基因：，用于測序第49頁，共54頁。病原學(xué)檢測核酸檢測陽性結(jié)果：至少兩種 檢測結(jié)果陽性；或一種 陽性產(chǎn)物序列測序結(jié)果與已知對應(yīng)序列相符。兩種靶序列檢測結(jié)果不一致時測序第50頁，共54頁。病原學(xué)檢測考慮假陰性的因素：樣本質(zhì)量差技術(shù)本身存在的原因檢測結(jié)果為陰性，但臨床表現(xiàn)和流行病學(xué)特點提示是感染時：可采用血清學(xué)方法進(jìn)行檢測：雙份血清標(biāo)本能夠滿足血清學(xué)檢測的要求。第51頁，共54頁。病原學(xué)檢測巢式：巢式通過兩次擴(kuò)增，可對樣本中微量病毒目的片段進(jìn)行特異擴(kuò)增，擴(kuò)增產(chǎn)物序列較長，可用于序列測定對基因和基因序列進(jìn)行擴(kuò)增，可產(chǎn)生較長片段的基因序列，通過序列測定，確定感染病毒型別可用于初篩和確認(rèn)第52頁，共54頁。加強(qiáng)實驗室生物安全及檢測各有關(guān)醫(yī)療衛(wèi)生機(jī)構(gòu)應(yīng)按照高致病性病原微生物實驗室生物安全相關(guān)規(guī)定開展病例救治、流行病學(xué)調(diào)查、標(biāo)本采集、運(yùn)輸和檢測等工作。應(yīng)當(dāng)盡可能采集病例的下呼吸道標(biāo)本，以提高檢出率。在疑似病例標(biāo)本檢測過程中，只要出現(xiàn)任何一個靶序列檢測結(jié)果陽性或可疑陽性，請及時與市疾控