醫(yī)學文獻檢索復習筆記

1、醫(yī)藥文獻檢索與利用（zll）一、檢索總論1.1 信息及信息素養(yǎng)信息：是普遍存在的，是物質(zhì)的一種基本屬性，是物質(zhì)存在方式及其運動規(guī)律、特點的外在表現(xiàn)。信息定義：事物的運動狀態(tài)和狀態(tài)變化的方式。信息與知識的區(qū)別：信息是大家的，獨立于行為和決策，獨立于環(huán)境存在，容易轉(zhuǎn)讓，可復制。情報：傳遞有特定效用的知識（知識性，傳遞性，效用性）。文獻：以文字、圖形、符號、聲頻、視頻等手段記錄和傳播知識的載體。 （知識內(nèi)容、信息符號、載體材料、記錄方式） 文獻按加工層次劃分： 一次文獻（原始論文期刊論文、學位論文、研究報告、專利說明書）；二次文獻（目錄、索引、文摘，pubmed、web of science、sin

2、omed）；三次文獻（綜述、年度總結(jié)、年鑒、指南、百科全書、annual reviews）；零次文獻（未被正式發(fā)表的，書信、手稿、筆記、口頭交流）文獻按載體形式劃分：印刷型、電子數(shù)字型、縮微型、聲像/視聽型文獻按出版類型劃分：圖書（ISBN號 10位，4段地域號、出版社號、書號、校驗號；本館訂購的電子圖書：apabi，超星、讀秀、elsevier、karger、Springer）、期刊（ISSN號 8位，前七位是刊名代號，末位是計算機校驗號）、特種文獻整個信息行為：信息需要、信息檢索、信息選擇、信息利用信息素養(yǎng)定義：人們在工作中運用信息、學習信息技術(shù)、利用信息解決問題的能力。信息素養(yǎng)的構(gòu)成要素

3、：信息意識；信息能力；信息道德。ACRL信息素養(yǎng)能力的評價標準：（5個一級指標，24個二級指標）。1.2醫(yī)學文獻檢索相關(guān)概念指從文獻信息集合中查找所需文獻或文獻中包含的信息內(nèi)容的過程1.3計算機檢索原理概述 檢索提問字符串 匹 配 數(shù)據(jù)庫中特征標識字符串 數(shù)據(jù)庫的構(gòu)成：文檔、記錄、字段 常見字段：TI（題目） 、AB（文摘）、AU（作者）、MESH（主題詞）、 SO（期刊名稱）、 AD（作者單位）、DT（文獻類型）、PY（出版年）1.4檢索語言 文獻外部特征的檢索語言：題名、著者、文獻序號、引用序號 文獻內(nèi)容特征的檢索語言：分類檢索、主題檢索、代碼檢索（1）分類檢索：美國國立圖書館圖書分類法，

4、杜威十進制、國際十進制、中國圖書館分類、國際疾病分類。（2）主題檢索：是以規(guī)范化的詞匯來表達文獻內(nèi)容的主題；主題詞（敘詞）、副主題詞（限定詞）、關(guān)鍵詞。（3）代碼檢索：化合物分子式索引等1.5計算機檢策略與步驟 （1）布爾邏輯檢索：NOT >AND> OR，括號優(yōu)先 （2）截詞檢索：？代表一個字母，必須以半角狀態(tài)輸入 %或*代替任意個字符 （3）位置運算檢索：（W）、（nW）、（N）、（nN）、（F）、（S）、（L） （4）字段限定檢索：“=”或 “in” （5）計算機檢索的一般步驟：（大題） 分析檢索課題（課題所屬的學科范圍、要求的文獻類型、年限、語種、需要的文獻量等） 選擇檢索

5、工具（數(shù)據(jù)庫的選擇） 確定檢索途徑（首先選擇基本檢索方式全字段檢索） 根據(jù)檢索結(jié)果調(diào)整檢索策略（考慮關(guān)鍵詞的重述與轉(zhuǎn)換，拆分） 根據(jù)文獻線索，獲取全文 （6）檢索結(jié)果的評價（收錄范圍、查全率、查準率、相應時間、用戶負擔、輸出形式） 查全率：R=檢索出的相關(guān)信息量/信息系統(tǒng)中的相關(guān)信息總量 用or組配，用上位詞（擴展下位詞），用截詞，少用副主題詞匹配 查準率: P=檢索出的相關(guān)信息量/檢索出的信息總量 1.6 本館電子資源介紹 （1）中文 sinomed :二次文獻庫 CNKI、萬方、VIP:期刊全文數(shù)據(jù)庫 超星、先生之家：電子圖書 讀秀、發(fā)現(xiàn)：一站式資源整合平臺 （2）外文 pubmed和we

6、b of science：:二次文獻庫二、常用的中文數(shù)據(jù)庫 2.1 SinoMed 本館訂購：中國生物醫(yī)學文獻數(shù)據(jù)庫（CBM）（1978年以來醫(yī)學主題詞表；中醫(yī)藥學主題詞表；中國圖書館分類法·醫(yī)學專業(yè)分類表）、中國醫(yī)學科普文獻數(shù)據(jù)庫（2000年以來）、北京協(xié)和醫(yī)學院博碩學問論文庫（1981年以來）。數(shù)據(jù)庫特點：（1）檢索入口多，檢索策略制定靈活 多種檢索途徑：快速檢索、高級檢索、主題檢索、期刊檢索、作者檢索 多種限定條件：年代、文獻類型、年齡組、性別、對象類型、其它（2）詞表輔助檢索功能 主題導航（3）多角度的文獻分析功能（可以，txt，excle格式導出）（4）定題檢索（定期的跟蹤

7、某一個課題的最新的文獻） 我的空間>我的檢索策略 可以將檢索策略保存到我的空間，保存的檢索策略可以定期的發(fā)送到郵箱或RSS訂閱（5）能獲取詳細的書目信息及全文鏈接檢索方法與技巧：（夸庫檢索僅支持標黃的）（1）快速檢索：在文章標題、摘要、作者、關(guān)鍵詞、主題詞等字段檢索，檢索出之間可以用邏輯運算符not，and，or鏈接，默認為and（2）高級檢索：可以限定在某一特定字段檢索，智能檢索（自動轉(zhuǎn)化為主題詞），精確檢索（關(guān)鍵詞、主題詞、特征詞、分類號、作者、刊名、ISSN）,限定檢索，靈活組配檢索式。（3）限定檢索：常用限定條件如年代、文獻類型、研究對象等加以整合，可使已檢出的文獻數(shù)量有針對的減

8、少，避免二次檢檢索操作。限定內(nèi)容可以多選，同組內(nèi)的限定為“or”關(guān)系，不同組之間的限定為“and”關(guān)系，限定完成后可以在檢索前設定，也可以在檢索后設定。（4）主題檢索：用規(guī)范化的主題詞進行檢索，有利于提高查全率和查準率主題詞“加權(quán)”表示主題詞的重要程度，反映文章論述的主要內(nèi)容。加權(quán)主題詞用“*”表示。主題詞擴展檢索是指對當前主題詞及其下位主題詞進行檢索，系統(tǒng)默認狀態(tài)為擴展檢索可以使用主題導航（5）分類檢索 類名，類號 可以使用分類導航（6）期刊檢索根據(jù)刊名、出版地、出版單位、及期刊主題詞、ISSN相關(guān)信息進行檢索可以使用期刊分類導航和首字母導航進行檢索（7）作者檢索比較有效地解決“同名著者”，

9、“同構(gòu)異名”的問題（8）定題檢索可定制和跟蹤某一課題的最新文獻。首次使用該項功能則需要注冊，注冊是免費的。（9）引文檢索檢索結(jié)果的處理:顯示：題錄格式、文摘格式、詳細格式輸出：單次打印和保存（最大記錄數(shù)500），單次e-mail（最大記錄數(shù)50） 2.2 CNKI（最早可以追溯到1915年）資源范圍：中國學術(shù)文獻總庫（學術(shù)期刊、博士論文、優(yōu)秀碩士論文、工具書、會議論文、年鑒、報紙、專利、標準等）、我館已購買的數(shù)據(jù)庫及專輯檢索方法：跨庫檢索、單庫檢索（默認為跨庫檢索，可以選擇單庫檢索）（1）跨庫檢索：一次性在所有類型資源中檢索，但檢索入口少（2）單庫檢索：選擇在某一特定數(shù)據(jù)類型庫中檢索，檢索入口

10、多支持的檢索方法（1）基本檢索：檢索字段（主題、 篇名、關(guān)鍵詞、作者、單位、基金、參考文獻、 中圖分類）多角度分組瀏覽（學科、發(fā)表年度、基金、研究層次、作者、機構(gòu)）多角度檢索結(jié)果排序（主題、發(fā)表時間、被引、下載） （2）高級檢索多個檢索入口組配多種限定條件（年限、來源期刊、來源類別支持基金、作者及單位）（3）專業(yè)檢索（需要自己設計檢索式）（4）作者檢索（5）來源期刊檢索（6）句子檢索（全文檢索+位置檢索）句子中包含了大量的事實信息，可以為用戶提供相關(guān)事實問題的答案。知網(wǎng)節(jié)（文獻網(wǎng)絡圖）：是中國知網(wǎng)特有的技術(shù)概念，清晰地反映文獻的繼承與發(fā)展。共引文獻：與本文有相同參考文獻的文獻。同被引文獻：與本

11、文同時作為參考文獻的文獻。引證文獻：引用本文的文獻。二級引證文獻：本文參考文獻的參考文獻。2.3萬方數(shù)據(jù)庫 1998年獨家收錄中華醫(yī)學會雜志跨庫檢索：（1）可以對檢索結(jié)果按相關(guān)度、時間、被引次數(shù)、經(jīng)典論文等角度顯示。（2）支持檢索結(jié)果以標準參考文獻格式或參考文獻管理軟件格式導出。（3）可以對檢索結(jié)果從學科分類、論文類型、年份、發(fā)表期刊等角度分析。高級檢索：經(jīng)典高級檢索：專業(yè)檢索：可以根據(jù)系統(tǒng)提示字段輸入檢索出的邏輯運算符知識網(wǎng)絡分析：從時間維度揭示知識點的關(guān)注度，了解學科發(fā)展規(guī)律，有助于發(fā)現(xiàn)新的研究方向、研究趨勢和熱點研究。2.4維普資訊 1989年基本服務：期刊文獻檢索、文獻引證追蹤、科學指

12、標分析、搜索引擎服務基本檢索：傳統(tǒng)檢索：專輯導航、分類導航高級檢索：實現(xiàn)同義詞索引功能防止漏檢；同名作者功能縮小檢索范圍 檢索執(zhí)行從上到下的順序，而不是邏輯優(yōu)先順序期刊導航：可通過期刊導航實現(xiàn)期刊逐期瀏覽，也可以定制自己關(guān)注的 期刊檢索歷史：2.5三大全文數(shù)據(jù)庫的比較從收錄資源角度:知網(wǎng)最全；萬方?jīng)]有收錄報紙、工具、學習；維普只有全文、報紙、學習和外文從檢索方式角度：（1）中國知網(wǎng)單庫檢索方式比萬方數(shù)據(jù)多，其中: 科研基金檢索、句子檢索、文獻出版來源是其特有的檢索方式。（2）萬方數(shù)據(jù)學術(shù)期刊檢索特有字段為: 被引用次數(shù)、DOI數(shù)字對象唯一標識符 、有無全文。（3）維普資訊的特有檢索字段：欄目信

13、息（4）單庫檢索字段而言，中國知網(wǎng)、維普的檢索字段多于萬方數(shù)據(jù)從收錄學位論文角度：（1）知網(wǎng)對碩士論文單位的收錄數(shù)量較多（2）萬方數(shù)據(jù)庫收錄了部分單位的博士后論文（3）維普沒有收錄學位論文2.6 讀秀學術(shù)搜索以海量中文資源為基礎的知識庫，整合了多種資源，通過統(tǒng)一檢索平臺，實現(xiàn)一站式檢索。三、常用的外文數(shù)據(jù)庫3.1 PubmedPubmed簡介：NCBI建立了生物醫(yī)學文獻數(shù)據(jù)庫，使用的是Entrez檢索平臺，每周更新。約5%的文獻提供免費全文，前身是medline光盤數(shù)據(jù)庫。pubmed由medline（1946年以來，均進行過主題詞標引）、premedline（臨時性醫(yī)學數(shù)據(jù)庫）、 publi

14、sher supplied citation（出版商遞送的電子文獻）和old medline構(gòu)造。Entrez平臺：是資源整合系統(tǒng)，可檢索NCBI提供的30多個數(shù)據(jù)庫。截詞檢索：截詞符*，只有右截詞，會自動關(guān)閉自動匹配與轉(zhuǎn)換功能。詞匯自動轉(zhuǎn)換：系統(tǒng)會自動將檢索詞語轉(zhuǎn)換為相應的mesh詞和textword詞。精確檢索：在短語上加半角雙引號“”后，系統(tǒng)將不再進行自動轉(zhuǎn)化，而進行精確檢索?；緳z索：可以輸入任何字詞，系統(tǒng)會自動識別并匹配進行檢索；可以輸入邏輯表達式；可以進行字段限制檢索。高級檢索：檢索表達式生成器提供字段進行字段限制檢索，邏輯組配檢索，根據(jù)檢索需要，進行邏輯組配，生成復雜的檢索表達式

15、檢索歷史顯示檢索過程，可以進行邏輯組配，可對檢索歷史進行保存和刪除。主題詞檢索：有很好的準確性與專指性，在新文獻及新概念上存在缺失和時滯期刊檢索：可以查看期刊的相關(guān)信息，也可以檢索該刊上發(fā)表的文章。檢索結(jié)果過濾：文本過濾、出版時間過濾、實驗對象過濾、文獻類型過濾、語種過濾等。過濾的設置對后續(xù)檢索均有限制作用，可以通過clear all鏈接清除重新設置單篇引文匹配器 single citation matcher：用于單篇文章的查找臨床咨詢 clinical queries：專門為臨床醫(yī)生設計檢索結(jié)果處理：（1）檢索結(jié)果顯示（2）課題追蹤（3）檢索結(jié)果保存（send to）File:將全部檢索結(jié)

16、果或選擇數(shù)據(jù)保存到本地電腦中Clipboard:其暫時保存作用，最多保存500條記錄。從剪貼板中可進行保存到本地電腦、發(fā)送到郵箱等操作。Collections:將文獻添加到個人文獻集中，需要登錄my ncbi. E_mail:將文獻發(fā)送到個人郵箱，不需要登錄my ncbi Order:向NLM訂購全文My Bibliography：需要登錄my ncbi，將檢索結(jié)果添加到我的書目數(shù)據(jù)庫中。（4）my nibi個性化服務3.2 Web Of Science簡介：web of science是大型綜合性、多學科、核心期刊引文索引數(shù)據(jù)庫，web of science核心集合是其中的引文索引數(shù)據(jù)庫（包

17、括了SCI、SSCI、A&HCI）。引文檢索：是指對文章的參考文獻進行的檢索，是從學術(shù)論文中引證關(guān)系入手進行檢索的一種方法。（意義：揭示科學研究的過去、現(xiàn)在、將來的之間內(nèi)在聯(lián)系，揭示科學研究中所涉及的各個學科領域的交叉聯(lián)系，協(xié)助研究人員迅速地掌握科學研究的歷史、發(fā)展和動態(tài)。）檢索規(guī)則：邏輯運算符：not、and、or位置運算符：same、near/n（n默認是15,）截詞符：？表示單個字符、*表示多個字符精確檢索：“”期刊引證報告journal citation reports (JCR):是對引用和被引用數(shù)據(jù)的統(tǒng)計，數(shù)據(jù)每年更新。JCR作用：確定投稿期刊是否被SCI收錄，期刊的變更信

18、息等。 了解期刊的詳細信息，包括影響因子及其變化趨勢、出版國家與出版商等。 對期刊進行多角度的比較。 按照學科、影響影子、期刊分區(qū)等方式選擇合適的投稿期刊。 IF（期刊影響因子）：是國際上通用的評價期刊影響力的一個重要指標。一般來說影響因子高，期刊的影響力就越大。對于一些綜合類，或者大項的研究領域來說，因為研究的領域廣所以引用率也比較高。通過描述文章內(nèi)容的關(guān)鍵詞選擇合適的期刊投稿： 在WOS核心合集中檢索相關(guān)文獻；通過來源出版物的分析功能， 尋求合適的投稿期刊或分析功能可以找到某些內(nèi)容比較集中的期刊四、外文全文數(shù)據(jù)庫定義：外文全文數(shù)據(jù)庫是指提供了一次文獻的外文數(shù)據(jù)庫分類：（1）出版商提供的網(wǎng)絡

19、電子平臺，一般只提供自己出版的文獻，Elsevier的 SD,Springer,Karger. (2)數(shù)據(jù)庫代理商，整合多家資源，Ebscohost，OVID. (3)open access 開放獲取期刊本館訂閱的外文全文數(shù)據(jù)庫：（1）圖書期刊類：annual reviews,acs,ebscohost,karger,ovid,springer, pnas,nature,scinece, sciencedirect（2）特征文獻：pqdd（3）循證醫(yī)學庫：cochrane library具體介紹：science direct:（1）簡介：由世界上最大的學術(shù)期刊出版商elsevier開發(fā)的，全球

20、最著名的的科技醫(yī)學全文數(shù)據(jù)庫之一，我館目前可訪問1997年以來的2000多種電子期刊。（2）檢索規(guī)則： 位置算符： W/n （詞的順序任意） Pre/n（兩個詞之間的順應是固定的） 截詞符： ？ * 寬松短語檢索：“ ”（標點符號、連字符、停用字等會自動忽略） 精確短語檢索： （3）四個模塊： physical science and engineering（自然科學） life sciences（生命科學） health sciences （健康科學） social science and humanities（社會科學）（4）檢索方法： 基本檢索： 高級檢索：（5）檢索結(jié)果的處理： 檢索結(jié)

21、果個進一步限定（refine filters） 檢索結(jié)果的保存，全文的下載 訂閱檢索結(jié)果或期刊內(nèi)容（save search alert） Clinicalkey： 基于愛思唯爾全部的醫(yī)學內(nèi)容開發(fā)的，權(quán)威而全面。包括期刊、參考書、視頻、圖片、影像、臨床試驗、診療指南、藥品專論等等。 Wiley online library：（1）簡介：1807年創(chuàng)立于美國，出版學術(shù)期刊、過刊集、圖書、參考工具書、實驗室指南、循證醫(yī)學圖書館等（2）檢索途徑： 期刊瀏覽方式（字序、學科） 基本檢索 高級檢索（3）Lab protocals Cochrane Library(Wiley) 循證臨床證據(jù)數(shù)據(jù)庫：Coch

22、rane協(xié)作網(wǎng)是1993年正式成立的國際性協(xié)作組織，其目的是對臨床醫(yī)學各個領域所開展的隨機對照試驗進行全面、系統(tǒng)、定量的綜合分析和評價，以電子出版物的形式發(fā)表結(jié)果，為臨床醫(yī)療、科研及醫(yī)療衛(wèi)生決策提供可靠的科學依據(jù)。 OVID數(shù)據(jù)庫： Annual Reviews：是一家致力于向全球科學家提供高度概括、實用信息的非贏利性組織，專注于出版權(quán)威綜述期刊；AR邀請各學科領域最權(quán)威、頂尖的科學家撰寫綜述，回顧本學科最前沿的進展，為科學研究提供方向性指導 springer：（德國） PQDD：是目前國內(nèi)唯一的可以查詢國外大學（北美地區(qū)為主）優(yōu)秀博碩士論文全文的數(shù)據(jù)庫，數(shù)據(jù)庫覆蓋了大部分北美地區(qū)高等院校以及

23、世界其他地區(qū)數(shù)千個高等院校每年獲得通過的博碩士論文。 五、文獻管理軟件文獻管理軟件是適應科技文獻的快速增長開發(fā)的工具，集參考文獻的檢索、收集、整理功能于一體，幫助用戶高效管理和快速生成參考文獻。這類軟件提供的附件、筆記、查找、分析等功能，可以幫助用戶實現(xiàn)包括文獻檢索、文獻閱讀、文獻引用的全過程管理。常用的文獻管理軟件:NoteExpress 、EndNote、Biblioscape 、Reference Manager、ProCite 、RefWorks 具體介紹:NoteExpress是目前流行的參考文獻管理工具軟件之一，其核心功能是幫助讀者在整個科研流程中高效利用電子資源，檢索并管理得到的

24、文獻摘要、全文；在撰寫學術(shù)論文、學位論文、專著或報告時，可在正文中的指定位置方便地添加文中注釋，然后按照不同的期刊，學位論文格式要求自動生成參考文獻索引。其核心功能包括：檢索、管理、分析、發(fā)現(xiàn)和寫作。EndNote是一個專門用于科技文章中管理參考文獻數(shù)據(jù)庫的軟件，是SCI（Thomson Scientific 公司）的官方軟件，支持國際期刊的參考文獻格式有三千多種，寫作模板幾百種，涵蓋各個領域的雜志。 TS= 主題 TI= 標題 AU= 作者 索引 AI= 作者識別號 GP= 團體作者 索引 ED= 編者 DO= DOI SO=出版物名稱 索引IS=ISSN號索引 PY= 出版年 AD= 地址

25、 OO= 機構(gòu) OG= 機構(gòu)擴展 索引 CU= 國家/地區(qū) FO= 基金資助機構(gòu) FG= 授權(quán)號 FT= 基金資助信息 SU= 研究方向 WC= Web of Science 分類 IS= ISSN/ISBN UT= 入藏號分析檢索課題：課題主題分析，主要概念有：視盤脈管炎、中醫(yī)藥治療或中醫(yī)藥療法。學科范圍屬于自然科學的醫(yī)學領域。用戶是希望了解中文醫(yī)學期刊發(fā)表此方面的文獻情況，并希望發(fā)表相關(guān)方面的論文，所以文獻信息檢索的對象主要是期刊論文。檢索要求，應該是查全查準。數(shù)據(jù)庫選擇：鑒于中文醫(yī)學期刊的文獻調(diào)研需求，sinomed、cnki、萬方和維普平臺符合檢索要求。確定檢索途徑：（1）sinomed默認檢索方式一框式全字段檢索：視盤脈管炎and 中醫(yī)藥治療考慮關(guān)鍵詞的重述與轉(zhuǎn)換：在sinomed主題詞表檢索入口輸入“視盤脈管炎”沒有對應的詞匯，說明沒有這樣表達形式的主題詞，輸入“視盤”顯示為主題詞，對應的款目詞有“視神經(jīng)乳頭”“脈管炎”對應的主題詞“血管炎”，考慮副主題詞?！耙暠P”不加權(quán)：擴展and“血管炎/按摩療法/氣功療法/中醫(yī)病機/中藥療法/中醫(yī)療法”不加權(quán)：擴展。評價檢索結(jié)果，修正檢索策略：結(jié)合sinomed主題詞標引的實際情況，一框式全字段檢索，再次編寫檢索表達式（視盤 or 視神經(jīng)頭 or 視神