靶基因功能的顯著性分析——GOAnalysis_第1頁
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文檔簡介

靶基因功能的顯著性分析GO-Analysis研究靶基因在Gene Ontology中的分布狀況將闡明差異microRNA的靶基因在功能上的體現(xiàn)。GO-Analysis對靶基因按GO分類，并對分類結(jié)果基于離散分布的顯著性分析、誤判率分析、富集度分析，得出與靶基因有顯著聯(lián)系的、低誤判率的、靶向性的基因功能分類。對顯著差異的microRNA調(diào)控的靶基因參與的功能顯著性體現(xiàn)，揭示靶基因從功能上揭示羊皺胃粘膜miRNA在捻轉(zhuǎn)血矛線蟲感染中的作用機制。MicroRNA與基因的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)MicroRNA-Gene-Net將顯著性功能所包含的靶基因與microRNA構(gòu)建調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。而后，根據(jù)網(wǎng)絡(luò)中microRNA的位置函數(shù)計算出microRNA在網(wǎng)絡(luò)中的關(guān)系強度，即microRNA的網(wǎng)絡(luò)特征值。特征值最高microRNA處于網(wǎng)絡(luò)的樞紐性地位，該microRNA調(diào)控能力最強，對網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)和樣本性狀有重要的調(diào)控價值，同時從網(wǎng)絡(luò)中也可以得到被microRNA調(diào)控的關(guān)鍵靶基因。這里取差異microRNA，構(gòu)建microRNA與基因的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，根據(jù)構(gòu)建的microRNA與基因的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，得到網(wǎng)絡(luò)中具有重要調(diào)控地位的microRNA和被調(diào)控的關(guān)鍵的靶基因，揭示m

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