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文檔簡介

1、.wd動物肝臟中DNA的提取及檢測一、前言脫氧核糖核酸脫氧核糖核酸DNA,為英文Deoxyribonucleic acid的縮寫,又稱去氧核糖核酸,是脫氧核糖核酸染色體的主要化學成分,同時也是組成基因的材料。有時也被稱為“遺傳微粒,原因是在繁殖過程中,父代會把它們自己DNA的一局部復制傳遞到子代中,從而完成性狀的傳播。DNA是高分子聚合物,DNA溶液為高分子溶液,具有很高的粘度,可被甲基綠染成綠色。DNA對紫外線260nm有吸收作用,利用這一特性,可以對DNA進展含量測定。當核酸變性時,吸光度升高,稱為增色效應;當變性核酸重新復性時,吸光度又會恢復到原來的水平。較高溫度、有機溶劑、酸

2、堿試劑、尿素、酰胺等都可以引起DNA分子變性,即DNA雙鏈堿基間的氫鍵斷裂,雙螺旋構造解開也稱為DNA的解螺旋。在細胞內,DNA能與蛋白質結合形成染色體,整組染色體那么統(tǒng)稱為染色體組。對于人類而言,正常的體細中含有46條染色體。染色體在細胞分裂之前會先在分裂間期完成復制,細胞分裂間期又可劃分為:G1期-DNA合成前期、S期-DNA合成期、G2-DNA合成后期。對于真核生物,如動物、植物及真菌而言,染色體主要存在于細胞核內;而對于原核生物,如細菌而言,那么主要存在于細胞質中的擬核內。染色體上的染色質蛋白,如組織蛋白,能夠將DNA進展組織并壓縮,以幫助DNA與其他蛋白質進展交互作用,進而調節(jié)基因的

3、轉錄。脫氧核糖核酸的構造DNA的構造: DNA的構造一般可劃分為一級構造、二級構造、三級構造和四級構造四個水平。DNA是一種長鏈聚合物,組成單位為四種脫氧核苷酸,即腺嘌呤脫氧核苷酸dAMP 脫氧腺苷、胸腺嘧啶脫氧核苷酸dTMP 脫氧胸苷、胞嘧啶脫氧核苷酸dCMP 脫氧胞苷、鳥嘌呤脫氧核苷酸dGMP 脫氧鳥苷。而脫氧核糖五碳糖與磷酸分子借由酯鍵相連,組成其長鏈骨架,排列在外側,四種堿基排列在內側。每個糖分子都與四種堿基里的其中一種相連,這些堿基沿著DNA長鏈所排列而成的序列,可組成遺傳密碼,指導蛋白質的合成。讀取密碼的過程稱為轉錄,是以DNA雙鏈中的一條單鏈為模板轉錄出一段稱為mRNA信使RNA

4、的核酸分子。DNA是由許多脫氧核苷酸按一定堿基順序彼此用3, 5-磷酸二酯鍵相連構成的長鏈。大多數(shù)DNA含有兩條這樣的長鏈,也有的DNA為單鏈,如大腸桿菌噬菌體X174、G4、M13等。DNA有環(huán)形DNA和鏈狀DNA之分。在某些類型的DNA中,5-甲基胞嘧啶可在一定限度內取代胞嘧啶,其中小麥胚DNA的5-甲基胞嘧啶特別豐富。在某些噬菌體中,5-羥甲基胞嘧啶取代了胞嘧啶。40年代后期,查加夫E.Chargaff發(fā)現(xiàn)不同物種DNA的堿基組成不同,但其中的腺嘌呤數(shù)等于其胸腺嘧啶數(shù)A=T,鳥嘌呤數(shù)等于胞嘧啶數(shù)G=C,因而嘌呤數(shù)之和等于嘧啶數(shù)之和,一般用幾個層次描繪DNA的構造。濃鹽法從動物組織中提取D

5、NA核酸和蛋白質在生物體中常以核蛋白DNP/RNP的形式存在,其中DNP能溶于水及高濃度鹽溶液,但在0.14 M的鹽溶液中溶解度很低,而RNP那么可溶于低鹽溶液,因此可利用不同濃度的NaCl溶液將其從樣品中分別抽提出來。將抽提得到的DNP用SDS處理可將其別離DNA和蛋白質,用氯仿-異戊醇將蛋白質沉淀除去可得DNA上清,參加冷乙醇即可將其呈纖維狀析出。肝臟細胞肝臟是由肝細胞組成,肝細胞極小,肉眼看不到,必須通過顯微鏡才能看到。人肝約有25億個肝細胞,5000個肝細胞組成一個肝小葉,因此人肝的肝小葉總數(shù)約有50萬個。肝細胞為多角形,直徑約為20-30/加(微米),有6-8個面,不同的生理條件下大

6、小有差異,如饑餓時肝細胞體積變大。每個肝細胞外表可分為竇狀隙面、肝細胞面和膽小管面三種。肝細胞里面含有許許多多復雜的細微構造:如肝細胞核、肝細胞質、線粒體、內質網、溶酶體、高爾基氏體、微粒體及飲液泡等組成。二、實驗目的1.掌握濃鹽法從動物組織中提取DNA的原理與技術三、實驗原理核酸和蛋白質在生物體中常以核蛋白DNP/RNP的形式存在,其中DNP能溶于水及高濃度鹽溶液,但在0.14 M的鹽溶液中溶解度很低,而RNP那么可溶于低鹽溶液,因此可利用不同濃度的NaCl溶液將其從樣品中分別抽提出來。將抽提得到的DNP用SDS處理可將其別離DNA和蛋白質,用氯仿-異戊醇將蛋白質沉淀除去可得DNA上清,參加

7、冷乙醇即可將其呈纖維狀析出。四、實驗器材和材料試劑實驗器材:勻漿器量筒離心機離心管試管吸管恒溫水浴鍋實驗材料:豬肝實驗試劑:0.1mol/L NaCl-0.05mol/L 檸檬酸鈉溶液pH6.895%乙醇A.R.NaCl固體A.R.5%SDS溶液5g SDS 定容至100mlV(氯仿):V異戊醇20:1的混合液五、實驗操作1.稱量稱取一定質量的豬肝,參加2倍肝重的0.1mol/L NaCl-0.05mol/L檸檬酸鈉緩沖液并用勻漿器磨碎已完成。2.提取DNA量取肝糜4 ml 于10毫升離心管,在4000r/min下離心10min ,沉淀中再參加8 ml緩沖液于4000r/min離心5 min;

8、棄上清,取沉淀;將沉淀用10 ml檸檬酸鈉緩沖液完全洗入干凈的小燒杯、參加5 ml 氯仿-異戊醇混合液、1 ml SDS,振蕩30min保鮮膜封口;緩慢參加固體NaCl約0.9g,使其最終濃度為1mol/L;將溶液分裝到2個10毫升離心管中,在4000r/min離心5 min,取上清水相;在上述水相溶液中分別加等體積冷95%乙醇,邊加邊用玻棒慢慢朝一個方向攪動,將纏繞在玻棒上的凝膠狀物用濾紙吸去多余的乙醇,即得DNA粗品;用8ml蒸餾水溶解DNA粗品于10ml離心管中。3.標準曲線的繪制按下表參加各種 試劑,混勻,于60恒溫水浴鍋45min,冷卻后,在595nm波長下于分光光度計比色測定,以吸

9、光度對DNA濃度作圖,制作標準曲線。012345標準DNA溶液/ml0.00.40.81.21.62.0蒸餾水/ml2.01.61.20.80.40二苯胺試劑/ml4.04.04.04.04.04.0A595nm4.樣品的測定將DNA粗品定容至25ml容量瓶,再取DNA樣液1.0ml,參加蒸餾水1.0ml,混勻。然后準確參加二苯胺試劑4.0ml,混勻,于60恒溫水浴鍋45min,冷卻后,595nm波長下于分光光度計比色測定,根據(jù)所測的吸光度對照標準曲線求得DNA的質量ug。5.計算100g豬肝中DNA含量w=m1/m2×100%w:DNA的質量分數(shù)%m1:樣液中測得的DNA的質量ug

10、m2:樣液中所含樣品的質量ug六、實驗數(shù)據(jù)處理1.標準曲線012345標準DNA溶液/ml0.00.40.81.21.62.0蒸餾水/ml2.01.61.20.80.40二苯胺試劑/ml4.04.04.04.04.04.0A595nm00.0390.090.1460.1970.249DNA含量/ug0801602403204002.實驗結果處理豬肝質量為2.04gDNA提取液體積為12.53ml序號123A595nm0.1020.1020.101平均A595nm0.102樣液中DNA含量/ug171.4樣液中樣品質量/g0.1628根據(jù)公式w=m1/m2×100%得:w=0.1053

11、那么100g豬肝中DNA含量為:w×100=0.1053g七、思考題1.實驗中的乙醇、SDS、氯仿-異戊醇、NaCl、檸檬酸鈉分別有什么作用?答:檸檬酸的鈉鹽在實驗中既充當DNA酶的抑制劑,也是pH緩沖溶液;SDS是外表活性劑,可以讓蛋白質與DNA分開;氯仿是有機溶劑,可以使蛋白質聚集沉淀,便于別離出去;異戊醇是消泡劑,可以減少泡沫的發(fā)生;氯仿-異戊醇的作用是使蛋白質變性、膜溶解;NaCl固體溶解使得試液成為高濃度的鹽溶液,在這樣的環(huán)境中DNA核蛋白能溶解,RNA核蛋白那么溶解度很低,可以利用這一性質別離兩種核酸。八、實驗考前須知1.DNA主要集中在細胞核中,因此,通常選用細胞核含量

12、比例大的生活組織作為提取制備DNA的材料,小牛胸腺組織中細胞核比例較大,因而DNA含量豐富,同時其脫氧核苷酸酶活性較低,制備過程中DNA被降解的可能性相對較低,所以是制備DNA的良好材料,但其來源較困難,脾臟或肝臟易獲得,也是實驗室制備DNA常用的材料,本實驗用新鮮肝臟作為實驗材料。2.為了防止大分子核酸在提取過程中被降解,須采取以下措施:整個過程必須在低溫下進展,可參加某些物質抑制核酸酶的活性,如檸檬酸鈉、EDTA、SDS等,EDTA是抑制核酸酶的活性最好的抑制劑。3.從核蛋白中脫去蛋白質的方法很多,經常采用的有:氯仿-異丙醇法、苯酚法、去垢劑法等,他們均能使蛋白質變性和核蛋白解聚,并釋放出

13、核酸。4.使用離心機時,對稱放置的離心管必須用天平調平衡。5.防止劇烈振蕩,如研磨過程、攪拌過程等。九、實驗結果誤差分析及討論經過對本次實驗結果進展分析,得出100g豬肝中DNA含量大約為0.1053g的結論,在上網查閱相關資料后發(fā)現(xiàn):豬肝中DNA含量與本次試驗實際操作測量得出的結果大致相互吻合。由此可知,本次試驗結果是相比照擬成功的,較為粗略地測量出豬肝中DNA的含量,并且較為熟練地掌握了濃鹽法從動物組織中提取DNA的原理與技術,根本到達了本次實驗的目的。但是本次實驗結果只是粗略測量,并未到達準確測量豬肝中DNA的含量,且實驗數(shù)據(jù)較理論值偏低,這是由于某些誤差導致,在實驗過程中些許因素可能會

14、導致實驗結果數(shù)據(jù)有偏差,經分析得出以下幾點:在稱取豬肝后參加檸檬酸鈉緩沖液進展研磨的過程中,由于豬肝組織外表較滑不易磨碎,且研磨至最后依舊有小局部豬肝組織塊殘留,因此可能導致豬肝中DNA提取不充分,致使實驗數(shù)據(jù)較理論值偏低;研磨過程中,可能由于操作不當,導致局部液體濺出,因此可能使得提取液中局部DNA損失,導致實驗數(shù)據(jù)偏低;在粗提取DNA操作中,頻繁地將DNA提取液轉移至各個儀器內,可能有極小局部DNA提取液未倒凈,殘留在儀器壁上損耗掉,導致實驗誤差;在使用移液槍的過程中,可能因為操作不當或移液槍經常錯誤使用,出現(xiàn)儀器誤差,導致吸取的DNA樣液不準確,出現(xiàn)實驗誤差;在水相中參加乙醇析出DNA時,不是所

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