NTSYSpc使用方法

1、NTSYS-PC使用說明1、生成矩陣：在excel按如下規(guī)則輸入數(shù)據(jù)，A1=1表示有帶記為1，B1=13表示擴增的總條帶數(shù)， C1=7表示樣本數(shù)，D1=0表示無帶記為0。第二行表示的是樣本名稱。從第三行開始的A列表示引物名稱。見下圖：輸入完畢后，將文件以Microsoft excel 5.0/95工作薄的格式存盤。2、生成系統(tǒng)樹：打開NTSYS-PC程序，點擊similarity出現(xiàn)如下界面：再點擊Qualitative data，出現(xiàn)下面的界面：點擊input file，打開生成的excel文件，點擊out file起一個文件名（假設叫A），然后點擊compute按鈕。繼續(xù)點擊cluster

2、ing，出現(xiàn)下面的界面， 再點SHAN，出現(xiàn)如下界面：點擊input file，打開文件剛才保存的文件111，點擊out file起一個文件名（假設叫222），把In case of ties改為Find，然后點擊compute按鈕。計算完成！點擊input file，打開文件A，點擊out file起一個文件名（假設叫B），然后點擊compute按鈕。然后點Graphics再點tree plot，出現(xiàn)下面的界面：點擊input file，打開文件B，然后點擊compute按鈕，就會出現(xiàn)聚類圖。3、生成遺傳相似度表：點File中的Edit file,打開文件A，再點compute按鈕，就會得到

3、遺傳相似度表。這個軟件的功能很強大，但我也只會做聚類圖和遺傳相似度，如果其他朋友還會使用其它功能，請多交流。缺失數(shù)據(jù)可用999代替,寫在列的后面,軟件就可以識別了TREE plotDisplays a tree matrix (such as produced by the SAHN module) or the NJOIN module. The algorithm used to convert a tree matrix into a dendrogram display is given in Rohlf (1975a). A generalization of this proced

4、ure is used to plot a tree with different heights for each OTU.The tree is displayed only a page at a time. The number of OTUs per page can be changed by either opening the plot options window or by pressing the + or - keys. The current page to be displayed can be selected either from the plot options window or by pressing the z and x keys.<Parameters> Progr