化學常用軟件應用簡介(ChemOffice)

1、第三章第三章化學辦公軟件化學辦公軟件ChemOfficeChemOffice 分子式和結構式是化學家的語言，這類分子式和結構式是化學家的語言，這類特殊的數據需要專門軟件來處理。目前已經特殊的數據需要專門軟件來處理。目前已經有了許多化學結構式編輯的軟件，其功能主有了許多化學結構式編輯的軟件，其功能主要是繪制化合物的結構式化學反應方程式，要是繪制化合物的結構式化學反應方程式，化工流程圖、簡單的實驗裝置圖等化學常用化工流程圖、簡單的實驗裝置圖等化學常用的平面圖形。使用比較廣泛的主要有：的平面圖形。使用比較廣泛的主要有：Chem Sketch 該軟件事該軟件事ACD公司開發(fā)的功能強大、安公司開發(fā)的功能

2、強大、安裝簡便、小巧靈活的化學繪圖軟件，其裝簡便、小巧靈活的化學繪圖軟件，其免費版本可在該公司網站：免費版本可在該公司網站：http:/下載（部分功下載（部分功能應用受限）能應用受限）繪制平面（繪制平面（2D）和立體（）和立體（3D）化學結構式、）化學結構式、反應式和化學圖形；反應式和化學圖形；繪圖功能十分強大，具有豐富的化學圖形繪制繪圖功能十分強大，具有豐富的化學圖形繪制工具和各中化學符號；工具和各中化學符號；內置各種模板工具欄；內置各種模板工具欄；可把平面結構轉換為立體圖形；可把平面結構轉換為立體圖形；預測分子結構的一些基本參數、自動命名、提預測分子結構的一些基本參數、自動命名、提供同分異

3、構體等。供同分異構體等。功能和特點：功能和特點：ISIS/Draw 由由MDL Information Systems Inc.公司開發(fā)，公司開發(fā)，以其強大的功能及與以其強大的功能及與Office套件極佳的兼容性套件極佳的兼容性而在國內化學界廣泛流行。該軟件為自由軟而在國內化學界廣泛流行。該軟件為自由軟件，無需注冊，無使用期限。件，無需注冊，無使用期限。 http:/ 繪制各種化學分子結構式、化學反應方程繪制各種化學分子結構式、化學反應方程式以及工藝流程圖等化學專業(yè)圖形式以及工藝流程圖等化學專業(yè)圖形 以用戶為主導，具有友好的操作界面以用戶為主導，具有友好的操作界面 豐富完備的模板及畫圖工具豐富

4、完備的模板及畫圖工具功能和特點：功能和特點：ChemWindow 繪制化學圖形、化學實驗裝置、化工工藝繪制化學圖形、化學實驗裝置、化工工藝流程圖等流程圖等 化學工作者在教學和科研中的有力助手化學工作者在教學和科研中的有力助手 http:/ 編輯化學方程式、制作反應過程關系圖、繪制編輯化學方程式、制作反應過程關系圖、繪制化學實驗裝置圖、繪制化工工藝流程圖化學實驗裝置圖、繪制化工工藝流程圖 提供各類化工設備的圖形模板庫提供各類化工設備的圖形模板庫 與光譜很好的結合，譜圖庫龐大，可根據化合與光譜很好的結合，譜圖庫龐大，可根據化合物的結構式預測物的結構式預測13C-NMR化學位移、紅外圖譜、化學位移、

5、紅外圖譜、質譜等，可讀入標準格式的質譜等，可讀入標準格式的NMR、IR、Roman、UV及色譜圖。及色譜圖。功能和特點：功能和特點：ChemOffice ChemOffice是世界上最優(yōu)秀的化學軟件，集強是世界上最優(yōu)秀的化學軟件，集強大的應用功能于一身，其結構繪圖是國內外重要大的應用功能于一身，其結構繪圖是國內外重要論文期刊制定的格式?；瘜W工作者可以用論文期刊制定的格式?；瘜W工作者可以用Chem Office去完成自己的想法，與同行交流化學結構、去完成自己的想法，與同行交流化學結構、模型和相關信息。是化學工作者的必備軟件。模型和相關信息。是化學工作者的必備軟件。ChemOffice的安裝的安裝

6、 運行運行Install.exe文件文件 根據提示輸入下列信息：根據提示輸入下列信息： Name: FCNiSO email: FCNFCN.COM Serial: 011-256104-7199 選擇選擇“Activate Later”（稍后激活），開始安（稍后激活），開始安裝。裝。 安裝時，僅選擇安裝時，僅選擇ChemOffice2008安裝。安裝。 安裝結束后，從安裝結束后，從crack文件夾中運行文件夾中運行crack.reg文件。文件。 從從Crack文件夾中復制文件文件夾中復制文件RegCodeCom11. dll 至安裝文件夾中，其路徑為：至安裝文件夾中，其路徑為： C:Prog

7、ramFilesCambridgeSoft Chem Office2008CommonDLLs 安裝結束，可以運行文件。安裝結束，可以運行文件。 注意：安裝結束后有提示是否需要重啟計算機，注意：安裝結束后有提示是否需要重啟計算機，選擇選擇NO。ChemOffice 構成構成 版本為版本為ChemOffice Ultra 2008版。主要包含如版。主要包含如下軟件和組成：下軟件和組成： ChemDraw Ultra 11.0：化學結構繪圖。：化學結構繪圖。 Chem3D Ultra 11.0：分子模型及仿真。：分子模型及仿真。 ChemFinder Ultra 11.0：化學信息搜尋整合系：化學

8、信息搜尋整合系統(tǒng)統(tǒng) E-Notebook 11.0：整理化學信息、文件和數據，：整理化學信息、文件和數據，并從中取得所要的結果。并從中取得所要的結果。3.1 ChemBioDraw ChemDraw是是ChemOffice中使用最為頻繁的組中使用最為頻繁的組件，是國際上絕大多數雜志指定的論文排版軟件，件，是國際上絕大多數雜志指定的論文排版軟件，為不同的雜志備有不同的模板，應用最為廣泛。為不同的雜志備有不同的模板，應用最為廣泛。 其理念是其理念是“化學家能懂的，化學家能懂的，ChemDraw也應該也應該懂懂”。 豐富的繪圖元件、能夠繪制和編輯高質量的化學結豐富的繪圖元件、能夠繪制和編輯高質量的化

9、學結構圖，識別和顯示立體結構，具有化學結構式與化構圖，識別和顯示立體結構，具有化學結構式與化學名稱相互轉換的功能；學名稱相互轉換的功能； 內建內建NMR數據庫，能夠與數據庫，能夠與Excel數據兼容；數據兼容； 能夠進行網絡數據庫進行檢索；能夠進行網絡數據庫進行檢索； 預測分子的常見物理、化學性質；預測分子的常見物理、化學性質； 對結構按對結構按IUPAC原則命名；原則命名； 預測質子及預測質子及13C化學位移等?；瘜W位移等。功能和特點：功能和特點： 加入了更多的生加入了更多的生物繪圖元素，變?yōu)槲锢L圖元素，變?yōu)镃hemBioDraw新特性：新特性： 可定制的工具欄可定制的工具欄 可根據自己的工

10、作方式修改工具欄?？筛鶕约旱墓ぷ鞣绞叫薷墓ぞ邫?。 化學繪圖功能得到了增強化學繪圖功能得到了增強 （1）增強的箭頭種類）增強的箭頭種類 （2）曲線工具：分為繪制曲線（）曲線工具：分為繪制曲線（Draw Curve）和編輯曲線（和編輯曲線（Edit Curve）兩個工具。允許徒手）兩個工具。允許徒手畫曲線，然后編輯曲線。可與填充和褪色功能畫曲線，然后編輯曲線?？膳c填充和褪色功能（Filled and Faded）組合使用，更能與箭頭工）組合使用，更能與箭頭工具實現互換，在繪圖中創(chuàng)建豐富多彩的圖形。具實現互換，在繪圖中創(chuàng)建豐富多彩的圖形。 增加了對結構與性質關系的支持增加了對結構與性質關系的支持

11、（1）Struct=Name（結構（結構=命名）。系統(tǒng)對有確切化學命名）。系統(tǒng)對有確切化學意義的結構，用意義的結構，用IUPAC規(guī)則為結構命名；給出一個化合規(guī)則為結構命名；給出一個化合物名稱，系統(tǒng)那個可將其展開為化學結構，是繪制結構物名稱，系統(tǒng)那個可將其展開為化學結構，是繪制結構圖更輕松。圖更輕松。 （2）ChemNMR是是ChemBioDraw中又一非常實用的功中又一非常實用的功能，可用于估算或顯示分子中的能，可用于估算或顯示分子中的1H、13C的化學位移。的化學位移。 （3）可從分析（）可從分析（Analysis）窗口或化學性質）窗口或化學性質（Chemical Properties）窗口

12、粘貼結構性質數據。）窗口粘貼結構性質數據。 增加了對新的生物繪圖工具的支持增加了對新的生物繪圖工具的支持 （1）在）在BioDraw工具欄中新增工具欄中新增tRNA工具和核糖工具和核糖核酸工具。核酸工具。 （2）新增了質粒圖工具。）新增了質粒圖工具。 （3）序列工具?？煽焖倮脛e名繪制氨基酸和）序列工具?？煽焖倮脛e名繪制氨基酸和核酸鏈，并對殘基進行分別處理，如收縮、展開，核酸鏈，并對殘基進行分別處理，如收縮、展開，改變其外觀等。改變其外觀等。 增加了對文件系統(tǒng)的支持增加了對文件系統(tǒng)的支持 （1）對）對SD文件支持。文件支持。SD文件是一種許多化學軟文件是一種許多化學軟件都通用的格式文件，可在

13、一個文件中包括許多件都通用的格式文件，可在一個文件中包括許多結構。結構。 （2）對數據庫連接的支持?？杉皶r與）對數據庫連接的支持?？杉皶r與Internet連連接并不斷更新化學數據。接并不斷更新化學數據。 （3）對）對Office2007的支持?？蓪⒔Y構圖插入到的支持?？蓪⒔Y構圖插入到Word文檔、文檔、Excel表單、表單、PPT演示文稿及演示文稿及FrontPage網頁中。網頁中。工具欄工具欄 除包括【除包括【File】、【】、【Edit】、【】、【View】、】、【Window】外，還有【】外，還有【object】（對象）、】（對象）、【Structure】（結構）、【】（結構）、【Tex

14、t】（文本）、】（文本）、【Curves】（曲線）、【】（曲線）、【Color】（顏色）等特】（顏色）等特有的菜單命令。有的菜單命令。 同時還有主工具欄、常用工具欄、對象工具欄、同時還有主工具欄、常用工具欄、對象工具欄、格式工具欄、生物工具欄等各類工具欄及其快捷格式工具欄、生物工具欄等各類工具欄及其快捷按鈕。按鈕。 3.1.1 3.1.1 主界面主界面選擇單鍵多重鍵結構透視虛線鍵楔形鍵工具波浪鍵序列工具脂肪鏈環(huán)工具碎片工具擦除文文本本曲線箭頭軌道基本繪圖工具括號化學符號查詢工具制表工具模板工具 選擇工具：選擇工具： 用于選擇對象。用于選擇對象。 單鍵工具：用于畫出一個化學單鍵并設置鍵屬性單鍵工

15、具：用于畫出一個化學單鍵并設置鍵屬性。 多重鍵工具：畫多重鍵、配位鍵多重鍵工具：畫多重鍵、配位鍵 并設置鍵屬性。并設置鍵屬性。 曲線工具：曲線工具： 徒手畫預定義徒手畫預定義 的箭頭、軌道等形狀的箭頭、軌道等形狀 基本繪圖工具：基本繪圖工具： 一些無化學一些無化學 意義的注解、方框或線。意義的注解、方框或線。 軌道工具：軌道工具： 畫原子軌道，包含畫原子軌道，包含 不同類型的原子軌道。不同類型的原子軌道。 查詢工具：查詢工具： 用于畫立體標記、用于畫立體標記、 進行原子反應映射、進行原子反應映射、 在查詢結構中指明自由位點、在查詢結構中指明自由位點、 指定原子間相互關系等。指定原子間相互關系等

16、。 化學符號工具：化學符號工具： 畫具有化學意義畫具有化學意義 的符號，如電荷、自由基及的符號，如電荷、自由基及 電子對等。電子對等。 括號工具：括號工具： 用于畫各種括號。用于畫各種括號。 箭頭工具：箭頭工具： 包含不同類型的箭頭。包含不同類型的箭頭。 模板工具：模板工具： 用于從模板中選擇模型繪制結構提供用于從模板中選擇模型繪制結構提供 了數十種模板。了數十種模板。 序列工具：序列工具： 含四類工具，用以創(chuàng)建含四類工具，用以創(chuàng)建 蛋白質、蛋白質、DNADNA、RNARNA序列。序列。 碎片工具：碎片工具： 包含三種工具：包含三種工具： 碎片工具碎片工具 ：破壞指定化學鍵，使分子成為兩部分。

17、：破壞指定化學鍵，使分子成為兩部分。 離解工具離解工具 ：破壞化學鍵畫出一個離解反應。：破壞化學鍵畫出一個離解反應。 合成工具合成工具 ：破壞化學鍵畫出一個逆向合成反應。：破壞化學鍵畫出一個逆向合成反應。 環(huán)工具：畫環(huán)狀結構。環(huán)工具：畫環(huán)狀結構。 楔形鍵工具：楔形鍵工具： 畫楔形鍵。畫楔形鍵。 制表工具：制表工具： 用于多重網格制表。其中用于多重網格制表。其中 薄層色譜板（薄層色譜板（TLCTLC）可以畫出）可以畫出 多條道的多條道的TLCTLC圖，可以方便地調整圖，可以方便地調整 溶劑的前沿、斑點的位置和顏色。溶劑的前沿、斑點的位置和顏色。 結構透視工具：結構透視工具： 轉動觀察結構。轉動觀

18、察結構。 文本工具：文本工具： 創(chuàng)建原子標注或標題說明。創(chuàng)建原子標注或標題說明。 擦除工具：擦除工具： 刪除對象。刪除對象。 脂肪鏈工具：脂肪鏈工具： 畫任何長度的碳鏈。畫任何長度的碳鏈。 生物繪圖工具：【生物繪圖工具：【ViewView】/ /【Show BioDraw ToolBarShow BioDraw ToolBar】, , 可以顯示生物繪圖工具欄，增加了生物和可以顯示生物繪圖工具欄，增加了生物和 生物化學的基本元素。生物化學的基本元素。 對象工具：對象工具： 【ViewView】/ /【Show Object ToolBarShow Object ToolBar】, , ：將對象結

19、合成組合對象：將對象結合成組合對象 ：將組合對象拆散為單個對象：將組合對象拆散為單個對象 ：將對象按左對齊：將對象按左對齊 ：將選定對象置于其他對象上層：將選定對象置于其他對象上層 ：將對象按上對齊：將對象按上對齊 ：將選定對象置于其他對象下層：將選定對象置于其他對象下層 ：將對象按左右居中對齊：將對象按左右居中對齊 ：將對象按下對齊：將對象按下對齊 ：將對象按右對齊：將對象按右對齊 ：將對象按上下居中對齊：將對象按上下居中對齊 ChemDraw主界面自上而下分為菜單欄、工具主界面自上而下分為菜單欄、工具欄和繪圖窗口。繪圖窗口左側是垂直工具欄，其欄和繪圖窗口。繪圖窗口左側是垂直工具欄，其中的工

20、具和模板是化學專用的。有些模板按鈕下中的工具和模板是化學專用的。有些模板按鈕下面帶有面帶有 箭頭，單擊該按鈕不松開，會在其右側箭頭，單擊該按鈕不松開，會在其右側彈出子工具欄。彈出子工具欄。 3.1.2 3.1.2 模板工具欄模板工具欄 垂直工具欄上的【模板】包含了多種較復雜的分子垂直工具欄上的【模板】包含了多種較復雜的分子種類和玻璃儀器模板。分別如下：種類和玻璃儀器模板。分別如下：氨基酸（氨基酸（Amino AcidsAmino Acids）氨基酸（氨基酸（AminoAmino Acids Acids Side ChainsSide Chains）芳香族（芳香族（AromaticsAromat

21、ics）雙環(huán)（雙環(huán)（BicyclicsBicyclics）玻璃儀器（玻璃儀器（ClipwareClipware）構象異構體（構象異構體（ConformersConformers）環(huán)戊二烯（環(huán)戊二烯（Cp RingsCp Rings）環(huán)烷（環(huán)烷（CycloalkansCycloalkans）DNADNA官能團（官能團（Functional GroupsFunctional Groups）己醣（己醣（HexosesHexoses）苯環(huán)（苯環(huán)（Ph RingsPh Rings）納米管（納米管（NanotubesNanotubes）多面體（多面體（PolyhedraPolyhedra）RNARNA立體

22、中心（立體中心（StereocentersStereocenters） 超分子（超分子（SupramoleculesSupramolecules） ChemBioDrawChemBioDraw包括了眾多的模板，我們想畫包括了眾多的模板，我們想畫的東西多數已經包括在其中了，熟悉這些模板，的東西多數已經包括在其中了，熟悉這些模板，我們可以根據這些模板迅速組合成希望的分子我們可以根據這些模板迅速組合成希望的分子形狀。形狀。3.1.3 3.1.3 繪圖實例繪圖實例 我們主要利用我們主要利用ChemDraw繪制一些結構式，反應方繪制一些結構式，反應方程式，搭建化學反應儀器等。程式，搭建化學反應儀器等。以

23、阿司匹林結構式的繪制為例：以阿司匹林結構式的繪制為例：1. 啟動啟動ChemDraw；2. 選中垂直工具欄最下端的選中垂直工具欄最下端的 按鈕，鼠標變成苯環(huán)的樣子；按鈕，鼠標變成苯環(huán)的樣子；繪制結構式繪制結構式3.在繪圖區(qū)單擊鼠標，出現一個苯環(huán)；在繪圖區(qū)單擊鼠標，出現一個苯環(huán)；4.單擊單擊 （單鍵）按鈕，將鼠標移至苯環(huán)的一個角上，出（單鍵）按鈕，將鼠標移至苯環(huán)的一個角上，出現深色的正方形連接點，如圖所示?，F深色的正方形連接點，如圖所示。5.自連接點橫向拉出一根實線單鍵，松開鼠標，自單鍵終自連接點橫向拉出一根實線單鍵，松開鼠標，自單鍵終點向右下方再次拉出一根單鍵，與前一根單鍵夾角約為點向右下方再

24、次拉出一根單鍵，與前一根單鍵夾角約為109，余類推。，余類推。6.多重鍵的方法同多重鍵的方法同5。7. 選中垂直工具欄選中垂直工具欄中的文本工具，分中的文本工具，分別將鼠標移至應該別將鼠標移至應該出現羥基或氧原子出現羥基或氧原子的位置，待出現連的位置，待出現連接點后，點擊鍵盤接點后，點擊鍵盤上的上的O鍵。鍵。 在繪制過程中，化學鍵鍵角難以精確掌握，且在繪制過程中，化學鍵鍵角難以精確掌握，且拖拉化學鍵或鍵點的過程中難免會造成鍵長的變拖拉化學鍵或鍵點的過程中難免會造成鍵長的變化和圖形的扭曲，因此需要對圖形進行整理。除化和圖形的扭曲，因此需要對圖形進行整理。除了手動調整外，還可以通過了手動調整外，還

25、可以通過ChemDraw的相關菜的相關菜單命令進行整理。單命令進行整理。8.單擊單擊 選取框按鈕，選中畫好的選取框按鈕，選中畫好的阿司匹林結構式。阿司匹林結構式。9.執(zhí)行【執(zhí)行【Structure】/【Clean Up Structure】命令，整理圖形，即可】命令，整理圖形，即可將結構式整理到最佳狀態(tài)。該命令將結構式整理到最佳狀態(tài)。該命令可多執(zhí)行幾次，直到結構式的形狀可多執(zhí)行幾次，直到結構式的形狀不再變化。不再變化。 使用環(huán)工具使用環(huán)工具 使用環(huán)工具創(chuàng)建環(huán)結構，再利用擦除工具得到結構使用環(huán)工具創(chuàng)建環(huán)結構，再利用擦除工具得到結構骨架，利用鍵工具改變鍵型和多重鍵的對齊方式，骨架，利用鍵工具改變鍵

26、型和多重鍵的對齊方式，最后用熱鍵方式添加原子標簽。最后用熱鍵方式添加原子標簽。要創(chuàng)建的結構利用環(huán)工具創(chuàng)建結構骨架添加雙鍵、雙鍵對齊與添加原子標注反應式的繪制反應式的繪制練習練習 以氨基苯酚合成對氨基水楊酸以氨基苯酚合成對氨基水楊酸畫中間體畫中間體 畫中間體結構畫中間體結構 用箭頭表示雙鍵電子的流動用箭頭表示雙鍵電子的流動 使用曲線工具畫箭頭使用曲線工具畫箭頭 使用碎片工具斷開結構中的一個或多個鍵，使用碎片工具斷開結構中的一個或多個鍵，使分子按指定化學鍵裂成兩部分。它模擬質譜使分子按指定化學鍵裂成兩部分。它模擬質譜儀中的分子碎片，但不會預測任何質量，使用儀中的分子碎片，但不會預測任何質量，使用時

27、必須指定要斷開的鍵。時必須指定要斷開的鍵。 碎片工具碎片工具 合成工具合成工具 選用合成工具，點擊跨鍵拖動，將打破化學鍵并畫出逆向合成反應。 離解工具離解工具 選用離解工具，點擊跨鍵拖動，將破壞一個化學鍵，并畫出其離解反應。畫多點配位結構畫多點配位結構 多點配位結構主要指具有多中心連接點的結構，如二茂鐵等一些具有離域性質的有機分子，具有不同配位、位置異構的多點或可變點的配位結構。二茂鐵（1 1）從模板中選擇一個環(huán)戊二烯的結構，在繪圖區(qū)畫出，）從模板中選擇一個環(huán)戊二烯的結構，在繪圖區(qū)畫出，如圖如圖a a，并選中。，并選中。（2 2）執(zhí)行）執(zhí)行【StructureStructure】/ /【Add

28、 MultiCenterAdd MultiCenter AttachmentAttachment】，在多中心節(jié)點上顯示一個星號，如圖】，在多中心節(jié)點上顯示一個星號，如圖b b。 創(chuàng)建一個多中心連接點創(chuàng)建一個多中心連接點（1 1）【）【ObjectObject】/ /【Fixed LengthsFixed Lengths】（取消固定鍵長），以便從】（取消固定鍵長），以便從環(huán)內延長鍵至環(huán)外，也可以在拖動時按下【環(huán)內延長鍵至環(huán)外，也可以在拖動時按下【AltAlt】（取消固定鍵長）】（取消固定鍵長）（2 2）選擇單鍵工具，移動指針指向星號，按下【）選擇單鍵工具，移動指針指向星號，按下【AltAlt】鍵

29、，創(chuàng)建一】鍵，創(chuàng)建一個新鍵，如圖個新鍵，如圖c c。（3 3）在新鍵的另一端輸入）在新鍵的另一端輸入“Fe”Fe”，得到圖，得到圖d d。重復。重復a-ca-c的操作，得的操作，得e e。 從多中心連接點向外畫鍵從多中心連接點向外畫鍵 介紹標準樣式表單的使用，并用樣式表單創(chuàng)建葡萄糖的介紹標準樣式表單的使用，并用樣式表單創(chuàng)建葡萄糖的費歇爾投影式。費歇爾投影式。 Special DocumentsSpecial Documents是一種樣式表單，本例使用的是是一種樣式表單，本例使用的是ACSACS模板，為模板，為ACSACS出版的期刊中所要求的化學繪圖格式。出版的期刊中所要求的化學繪圖格式。 使用

30、該樣式后，所有設置均按該樣式進行設置，包括頁使用該樣式后，所有設置均按該樣式進行設置，包括頁面設置中的單欄編排（面設置中的單欄編排（One-column LayoutOne-column Layout），制圖設置），制圖設置中鍵長固定為中鍵長固定為0.20.2英寸，文本設置中原子標注為英寸，文本設置中原子標注為1010點大小點大小的的ArialArial或或HelbeticaHelbetica字體等。字體等。費歇爾投影式費歇爾投影式 創(chuàng)建創(chuàng)建ACSACS樣式文檔樣式文檔執(zhí)行【執(zhí)行【FileFile】/ /【Open SpecialOpen Special】，選擇】，選擇“ACS Documen

31、t ACS Document 1996” 1996” 【Save asSave as】，輸入文件名，保存?！?，輸入文件名，保存。 畫結構主干畫結構主干 利用單鍵工具，畫出利用單鍵工具，畫出費歇爾投影式的結構費歇爾投影式的結構主干：主干：a-b-ca-b-c 添加原子標注添加原子標注（1）選用文本工具，分別點擊最上面與最下面的）選用文本工具，分別點擊最上面與最下面的C原子，原子，輸入輸入“CHO”及及“CH2OH”；（2）在其他位置輸入）在其他位置輸入“H”，再用文本工具分別雙擊需要，再用文本工具分別雙擊需要添加添加H原子的原子的C原子（應用文本工具雙擊將重復最后一原子（應用文本工具雙擊將重復最

32、后一次標簽），如圖次標簽），如圖c（3）“OH”的添加與的添加與“H”類似。類似。畫透視圖畫透視圖 采用環(huán)工具、單鍵工具、楔形鍵（契合鍵）采用環(huán)工具、單鍵工具、楔形鍵（契合鍵）工具、熱鍵添加原子標簽及【工具、熱鍵添加原子標簽及【AltAlt】+ +拖動畫鍵拖動畫鍵等技巧，介紹葡萄糖結構透視圖的繪制方法。等技巧，介紹葡萄糖結構透視圖的繪制方法。 畫一個環(huán)畫一個環(huán)（1）執(zhí)行【）執(zhí)行【File】/【Open Special】，選擇】，選擇“New Document”，【，【Save as】，輸】，輸入文件名，保存。入文件名，保存。（2）選用六元環(huán)工具，單擊鼠標）選用六元環(huán)工具，單擊鼠標左鍵，選擇合適

33、的角度，釋放左左鍵，選擇合適的角度，釋放左鍵，得圖鍵，得圖a。（3）輸入）輸入O原子符號，得圖原子符號，得圖b。 添加豎直鍵添加豎直鍵 扭曲結構改變其縱橫比例扭曲結構改變其縱橫比例（1）用選擇工具選擇所有結構，向上拖動結構下部中間）用選擇工具選擇所有結構，向上拖動結構下部中間改變對象大小的手柄，直到將結構扭曲成原來大小的改變對象大小的手柄，直到將結構扭曲成原來大小的50%。（2）注意：即使畫鍵時已經考慮到鍵的長短問題，但在）注意：即使畫鍵時已經考慮到鍵的長短問題，但在扭曲之后仍會遇到兩鍵相連的問題。因此，在畫鍵時可扭曲之后仍會遇到兩鍵相連的問題。因此，在畫鍵時可按住按住“Alt”鍵取消固定鍵長

34、。鍵取消固定鍵長。 添加原子標簽添加原子標簽OHOH與與CH2OHCH2OH 注意：注意：（1）如果圖太小放不下原子標簽，可）如果圖太小放不下原子標簽，可執(zhí)行【執(zhí)行【View】/【Magnify】放大圖形，】放大圖形，C5原子上的原子上的OH是是C5原子向下展開的，原子向下展開的，而不是從而不是從C3原子向上展開的。原子向上展開的。（2）CH2OH的熱鍵為的熱鍵為“6”，即鍵盤工，即鍵盤工具處于激活狀態(tài)時，輸入具處于激活狀態(tài)時，輸入6即顯示即顯示CH2OH。 改變前面鍵的類型改變前面鍵的類型（1）選用粗單鍵工具，指向前面中間的鍵時，即可變?yōu)椋┻x用粗單鍵工具，指向前面中間的鍵時，即可變?yōu)榇宙I。粗

35、鍵。（2）選用粗楔形鍵（契合鍵）工具，單擊環(huán)上的兩個與）選用粗楔形鍵（契合鍵）工具，單擊環(huán)上的兩個與粗鍵相連的鍵，指向稍微靠寬邊的一端單擊。若契合鍵粗鍵相連的鍵，指向稍微靠寬邊的一端單擊。若契合鍵指向了錯誤的方向，再次點擊該契合鍵可使其方向反過指向了錯誤的方向，再次點擊該契合鍵可使其方向反過來。來。畫紐曼投影式畫紐曼投影式p 以乙烷的紐曼投影式為例，練習復制、旋轉、拖動以乙烷的紐曼投影式為例，練習復制、旋轉、拖動等技巧。等技巧。 創(chuàng)建第一個結構創(chuàng)建第一個結構利用單鍵工具，創(chuàng)建第一個結構，利用單鍵工具，創(chuàng)建第一個結構，如圖如圖a。 復制結構復制結構 點擊選擇工具，最近畫的結構自動被選定，按【點擊

36、選擇工具，最近畫的結構自動被選定，按【Ctrl】鍵的同時，向右上方拖動結構，復制該結構（圖鍵的同時，向右上方拖動結構，復制該結構（圖b），），并用單鍵工具將兩個結構中心的并用單鍵工具將兩個結構中心的C原子連接（圖原子連接（圖c）。）。此時固定鍵長與鍵角的設定不起作用。此時固定鍵長與鍵角的設定不起作用。 畫一個圓畫一個圓 點擊軌道工具點擊軌道工具 ，將指針指向下部的中心碳原子并向，將指針指向下部的中心碳原子并向外拖動。外拖動。 選定上面碎片中的三個鍵選定上面碎片中的三個鍵 點擊方框（或套繩）選擇點擊方框（或套繩）選擇工具工具 ，指針指向結構上方，指針指向結構上方，并環(huán)繞上部的碎片拖動選并環(huán)繞上部

37、的碎片拖動選中三個鍵。連接兩個碎片中三個鍵。連接兩個碎片之間的鍵不選擇。之間的鍵不選擇。 旋轉選定的對象旋轉選定的對象（1）雙擊選擇框上的）雙擊選擇框上的旋轉手柄，打開旋轉旋轉手柄，打開旋轉對話框，在文本框中對話框，在文本框中輸入輸入180，選擇，選擇CW，并點擊，并點擊【Rotate】按鈕。此】按鈕。此過程中，選擇框不會過程中，選擇框不會消失。消失。（2）旋轉完成）旋轉完成后點擊后點擊【Object】/【Bring to Front】，是】，是選定結構置前。選定結構置前。（圖（圖e-f-g） 移動選定對象與另一碎片重合移動選定對象與另一碎片重合（1）指針指向選擇框內，至指針變?yōu)槭中?。）指針?/p>

38、向選擇框內，至指針變?yōu)槭中?。?）拖動選定部分至其中心碳原子處于軌）拖動選定部分至其中心碳原子處于軌道正中央，釋放鼠標，完成繪制。（圖道正中央，釋放鼠標，完成繪制。（圖h）注意：兩個碎片結構重疊時，會看到紅色注意：兩個碎片結構重疊時，會看到紅色警告，不影響觀察，可執(zhí)行【警告，不影響觀察，可執(zhí)行【View】/【Show Chemical Warnings】關閉自】關閉自動警告。（圖動警告。（圖i）使用立體化學標記使用立體化學標記 介紹使用立體化學標記（介紹使用立體化學標記（StereochemistryStereochemistry）和翻轉）和翻轉（FlipFlip）命令的使用。）命令的使用。

39、添加原子標注添加原子標注 畫骨架結構畫骨架結構 添加立體楔形鍵（契合鍵）添加立體楔形鍵（契合鍵） 添加一個立體化學標記添加一個立體化學標記（1）選擇完整結構（圖a），執(zhí)行【Object】/【Show 1）選擇完整結構（圖a），執(zhí)行【Object】/【Show Stereochemistry】時，得結構b。Stereochemistry】時，得結構b。（2）選定該結構（圖b），執(zhí)行【Object】/【Flip （2）選定該結構（圖b），執(zhí)行【Object】/【Flip Horizontal】（水平翻轉），得結構c。Horizontal】（水平翻轉），得結構c。（3）選定結構（圖c），執(zhí)行【Obj

40、ect】/【Flip （3）選定結構（圖c），執(zhí)行【Object】/【Flip Vertical】（豎直翻轉，相當于水平旋轉180度），得Vertical】（豎直翻轉，相當于水平旋轉180度），得 使用模板時提高繪制效率的最好辦法。使用模板時提高繪制效率的最好辦法。 先利用相近的模板創(chuàng)建骨架，再進行相關的修改。先利用相近的模板創(chuàng)建骨架，再進行相關的修改。使用模板使用模板菲菲 過氧化二苯過氧化二苯繪制實驗裝置繪制實驗裝置 ChemDraw可以用磨口?？梢杂媚タ诓Ａx器接插件璃儀器接插件迅速搭建化學迅速搭建化學反應裝置。反應裝置。蒸餾裝置蒸餾裝置(1)【View】/【Other (1)【View】

41、/【Other ToolBars】/【Clipware，ToolBars】/【Clipware，Part1】或【Clipware，Part2】Part1】或【Clipware，Part2】打開玻璃儀器模板窗口（或從垂打開玻璃儀器模板窗口（或從垂直工具欄中打開）直工具欄中打開）(2)在【Clipware，Part1】和(2)在【Clipware，Part1】和【Clipware，Part2】中依次選【Clipware，Part2】中依次選擇合適的鐵架臺、鐵夾、加熱擇合適的鐵架臺、鐵夾、加熱器、單口燒瓶、蒸餾頭、溫度器、單口燒瓶、蒸餾頭、溫度計、直形冷凝管、接收器等模計、直形冷凝管、接收器等模板，

42、并將其繪制出來。板，并將其繪制出來。(3)將玻璃一起在磨口處拼接好。(3)將玻璃一起在磨口處拼接好。(4)如果器件前后順序不對，可在(4)如果器件前后順序不對，可在器件上單擊右鍵，在彈出的快捷器件上單擊右鍵，在彈出的快捷菜單中選擇【Bring to front】菜單中選擇【Bring to front】 畫好的分子結構圖形可以保存為文件，以備畫好的分子結構圖形可以保存為文件，以備將來使用或修改。將來使用或修改。ChemDraw文件的擴展名為文件的擴展名為“cdx”。 【File】/【Save As】，彈出【另存為】對】，彈出【另存為】對話框，即可保存?！颈４骖愋汀坑卸喾N選項，可話框，即可保存。

43、【保存類型】有多種選項，可另存為另存為Chem Draw 3.x版的格式（版的格式（“chm”），），或或“gif”、“bmp”圖形格式，或另存為圖形格式，或另存為ISIS格格式。式。3.1.4 3.1.4 圖形存盤圖形存盤 如果不改變圖形模板的話，在繪圖區(qū)每單擊一如果不改變圖形模板的話，在繪圖區(qū)每單擊一次鼠標，就會出現一個選定模板的圖形。單擊鼠次鼠標，就會出現一個選定模板的圖形。單擊鼠標左鍵后不松手，則可以通過移動鼠標使圖形旋標左鍵后不松手，則可以通過移動鼠標使圖形旋轉，待轉動到希望的位置時松手即可。轉，待轉動到希望的位置時松手即可。3.1.5 3.1.5 圖形的旋轉或縮放圖形的旋轉或縮放撤

44、銷操作，單擊撤銷操作，單擊 【UndoUndo】?！?。 畫好的圖形也可以旋轉和縮畫好的圖形也可以旋轉和縮放。用選取框或套索選中圖形，放。用選取框或套索選中圖形，此時圖形被一灰色框籠罩，上此時圖形被一灰色框籠罩，上方中央一點為旋轉控制點，鼠方中央一點為旋轉控制點，鼠標移至此會變成雙箭頭，單擊標移至此會變成雙箭頭，單擊鼠標可以旋轉圖形。右下角為鼠標可以旋轉圖形。右下角為縮放控制點，拖動這個角可以縮放控制點，拖動這個角可以按比例改變圖形大小按比例改變圖形大小。 ChemDrawChemDraw可以檢查繪制的結構是是否有問可以檢查繪制的結構是是否有問題，選中結構式后，進行【題，選中結構式后，進行【St

45、ructureStructure】/ /【Check structureCheck structure】菜單命令，】菜單命令，ChemDrawChemDraw就會就會將一個紅色方框罩在有問題的源自或官能團上，將一個紅色方框罩在有問題的源自或官能團上，便于用戶檢查。該功能是自動執(zhí)行的，如果結構便于用戶檢查。該功能是自動執(zhí)行的，如果結構式中有紅色方框罩住的原子或官能團，在繪制時式中有紅色方框罩住的原子或官能團，在繪制時應引起注意。應引起注意。3.1.6 3.1.6 檢查結構錯誤和整理結構式檢查結構錯誤和整理結構式 ChemDrawChemDraw提供了一種功能，可以根據化合提供了一種功能，可以根據

46、化合物的名稱自動給出結構式?；衔锩Q必須時物的名稱自動給出結構式。化合物名稱必須時英文名，最好時系統(tǒng)命名的。英文名，最好時系統(tǒng)命名的。 【StructureStructure】/ /【Convert Name to Convert Name to StructureStructure】，彈出對話框】，彈出對話框 在輸入框中輸入化合物的英文名，點擊在輸入框中輸入化合物的英文名，點擊OKOK即可即可出現結構式出現結構式3.1.7 3.1.7 根據化合物名稱得到結構式根據化合物名稱得到結構式u【StructureStructure】/ /【Convert Name to Convert Name

47、to StructureStructure】，彈出】，彈出對話框；對話框；u 在輸入框中輸入在輸入框中輸入化合物的英文名，化合物的英文名，點擊點擊OKOK即可出現結即可出現結構式。構式。 ChemDrawChemDraw也能根據一些化合物的縮寫給出結構式，也能根據一些化合物的縮寫給出結構式，如如EDTAEDTA。在輸入框中輸入。在輸入框中輸入EDTAEDTA，即可出現，即可出現EDTAEDTA的結構的結構式。式。 有時輸入化合物的商品名或俗名也能得到結構式，有時輸入化合物的商品名或俗名也能得到結構式，如輸入如輸入“aspirin”aspirin”，即可得到阿司匹林的結構式。，即可得到阿司匹林的

48、結構式。 如輸入如輸入“morphine”morphine”即可得到嗎啡的結構式。即可得到嗎啡的結構式。u 并非所有的化合物名稱都能得到結構式，如果無法并非所有的化合物名稱都能得到結構式，如果無法由名字產生結構式，由名字產生結構式，ChemDrawChemDraw會彈出顯示提示信息。會彈出顯示提示信息。 繪制化合物結構式繪制化合物結構式 選中此結構，【選中此結構，【StructureStructure】/ /【Convert Structure Convert Structure to Nameto Name】，即可在結構式下面出現系統(tǒng)命名?！浚纯稍诮Y構式下面出現系統(tǒng)命名。 并非所有的結構式

49、都能給出化合物名稱，如果無法由并非所有的結構式都能給出化合物名稱，如果無法由結構產生系統(tǒng)命名，結構產生系統(tǒng)命名，ChemDrawChemDraw會彈出窗口給出提示信息。會彈出窗口給出提示信息。3.1.8 3.1.8 根據結構得出化合物命名根據結構得出化合物命名腎上腺素的系統(tǒng)命名腎上腺素的系統(tǒng)命名腎上腺素結構式腎上腺素結構式 ChemDrawChemDraw可以根據結構式預測分子的可以根據結構式預測分子的1 1H H和和1313C C核磁共核磁共振化學位移。振化學位移。 心安得（心安得（propranololpropranolol）是一種心血管藥物，能抑是一種心血管藥物，能抑制心臟的收縮率，避免

50、過制心臟的收縮率，避免過度興奮和阻止神經沖動，度興奮和阻止神經沖動，保證心壁平滑肌的收縮。保證心壁平滑肌的收縮。3.1.9 3.1.9 預測核磁共振化學位移預測核磁共振化學位移 繪制化合物結構式繪制化合物結構式 選中此結構，【選中此結構，【StructureStructure】/ /【Predict 1H-NMR-Predict 1H-NMR-ShiftsShifts】，出現該化合物的】，出現該化合物的1 1H H核磁共振化學位移值及圖核磁共振化學位移值及圖譜譜 縮小當前窗口，返回繪制結構式的窗口縮小當前窗口，返回繪制結構式的窗口 【StructureStructure】/ /【Predict

51、 13C-NMR-ShiftsPredict 13C-NMR-Shifts】，出現】，出現該化合物的該化合物的1313C C核磁共振化學位移值及圖譜核磁共振化學位移值及圖譜 有了這兩張譜圖，在實測樣品的核磁共振，就會心中有了這兩張譜圖，在實測樣品的核磁共振，就會心中有數。有數。 ChemDrawChemDraw可以對化合物結構進行分析計算?？梢詫衔锝Y構進行分析計算。p 選中化合物結構式，【選中化合物結構式，【ViewView】/ /【Show Analysis Show Analysis WindowWindow】，彈出分析窗口，包含該化合物的分子簡式、】，彈出分析窗口，包含該化合物的分子

52、簡式、摩爾質量、同位素分布圖，元素分析組成比例等數據。摩爾質量、同位素分布圖，元素分析組成比例等數據。p【ViewView】/ /【Show Chemical Properties WindowShow Chemical Properties Window】，彈】，彈出化學性質窗口，包含該化合物的沸點、熔點、臨界溫出化學性質窗口，包含該化合物的沸點、熔點、臨界溫度、臨界壓力、臨界體積、度、臨界壓力、臨界體積、GibbsGibbs自由能、自由能、LogPLogP、MRMR、HerrysHerrys Law Law、生成熱、生成熱、ClogPClogP、CMRCMR等。等。3.1.10 3.1.1

53、0 分析結構估計性質分析結構估計性質以心安得化合物為例：以心安得化合物為例：【Analysis】窗口】窗口【Chemical Properties】窗口】窗口 ChemDrawChemDraw提供了一張使用起來十分方便的元素周期提供了一張使用起來十分方便的元素周期表。表。 【ViewView】/ /【Show Periodic Table WindowShow Periodic Table Window】即可打開】即可打開元素周期表窗口。元素周期表窗口。 單擊周期表上的元素符號，就可以得到該元素的物理單擊周期表上的元素符號，就可以得到該元素的物理性質。單擊表中的性質。單擊表中的 按鈕，可以打開

54、或關閉周期表下按鈕，可以打開或關閉周期表下方的物理性質詳細列表。方的物理性質詳細列表。3.1.11 3.1.11 元素周期表元素周期表（1）輸入特殊符號輸入特殊符號 有時需要在結構式或反應方有時需要在結構式或反應方程式中輸入特殊符號。程式中輸入特殊符號。 【ViewView】/ /【Show Character Show Character MapMap】菜單命令即可打開符號窗】菜單命令即可打開符號窗口?？?。 單擊單擊 按鈕，可以選擇各種按鈕，可以選擇各種WindowsWindows字體和符號，包括漢字。字體和符號，包括漢字。3.1.12 3.1.12 符號、字體和顏色符號、字體和顏色（2）改

55、變字體改變字體 【TextText】/ /【FontFont】菜單命令可以改變字體。菜單命令可以改變字體。 WindowsWindows的所有的所有字體都可以在字體都可以在ChemDrawChemDraw中使用，也包括漢字字中使用，也包括漢字字體。體。（3 3）改變顏色）改變顏色 默認狀態(tài)下，默認狀態(tài)下，ChemDrawChemDraw的文字和繪制的圖形是黑的文字和繪制的圖形是黑色的，根據實際需要可以變換文字及圖形的顏色。色的，根據實際需要可以變換文字及圖形的顏色。 選中畫好的結構式或圖形；選中畫好的結構式或圖形； 單擊單擊【ColorColor】，出現下拉菜單，除了黑色之外，還包，出現下拉菜

56、單，除了黑色之外，還包含含6 6種可以選擇的顏色；種可以選擇的顏色； 單擊所選中的顏色，完成改變顏色的操作；單擊所選中的顏色，完成改變顏色的操作； 若不喜歡給出的顏色，單擊若不喜歡給出的顏色，單擊【OthersOthers】選項，彈出選項，彈出【顏【顏色色】調色板，其中由更多的顏色可供選擇，還可以自定調色板，其中由更多的顏色可供選擇，還可以自定義顏色。義顏色。（1 1）快捷菜單）快捷菜單 ChemDrawChemDraw快捷菜單包含快捷菜單包含了多種選項，使用快捷菜了多種選項，使用快捷菜單能完成常用編輯、屬性單能完成常用編輯、屬性設置、模板選擇等功能。設置、模板選擇等功能。 在選中的結構上單擊

57、鼠在選中的結構上單擊鼠標右鍵，會彈出快捷菜單。標右鍵，會彈出快捷菜單。3.1.13 3.1.13 快捷菜單和快捷鍵快捷菜單和快捷鍵（2 2）快捷鍵）快捷鍵 常用的與結構有關的快捷鍵：常用的與結構有關的快捷鍵： Ctrl+Shift+KCtrl+Shift+K：整理結構式：整理結構式 Ctrl+Shift+NCtrl+Shift+N：將化合物名稱轉換為結構式：將化合物名稱轉換為結構式 Alt+Ctrl+Shift+NAlt+Ctrl+Shift+N：將結構式轉換為化合物名稱：將結構式轉換為化合物名稱 編輯快捷鍵與其他軟件如編輯快捷鍵與其他軟件如wordword相同，常用的與圖形編相同，常用的與圖

58、形編輯有關的快捷鍵：輯有關的快捷鍵： Ctrl+ACtrl+A：全選：全選 ，Ctrl+CCtrl+C：復制，：復制，Ctrl+VCtrl+V：粘貼，：粘貼， Ctrl+XCtrl+X：剪切，：剪切， F F9 9：下標：下標 ， F F1010：上標：上標 ， Ctrl+RCtrl+R：旋轉圖形，可以設定旋轉角度，：旋轉圖形，可以設定旋轉角度， Ctrl+KCtrl+K：改變圖形大小，可以設定鍵長，：改變圖形大小，可以設定鍵長， Ctrl+Shift+HCtrl+Shift+H：水平翻轉圖形，：水平翻轉圖形， Ctrl+Shift+VCtrl+Shift+V：垂直翻轉圖形。：垂直翻轉圖形。基

59、本技巧基本技巧選擇對象選擇對象1. 1. 選擇對象選擇對象 選擇完整結構：使用選擇工具雙擊某個分子結構內任選擇完整結構：使用選擇工具雙擊某個分子結構內任何鍵或原子；何鍵或原子； 通過點擊選擇對象：點擊選擇工具，指向一個對象通過點擊選擇對象：點擊選擇工具，指向一個對象（一般為最后編輯的圖形），并在該對象上出現一個反（一般為最后編輯的圖形），并在該對象上出現一個反襯框，再次點擊該對象，則選擇對象出現在選擇矩形框襯框，再次點擊該對象，則選擇對象出現在選擇矩形框內，指針變?yōu)槭中?；內，指針變?yōu)槭中停?選擇多個對象：先按選擇多個對象：先按shiftshift鍵，再選擇其他對象，通過鍵，再選擇其他對象，通過

60、單擊雙擊或使用選擇工具可添加選擇對象。單擊雙擊或使用選擇工具可添加選擇對象。 選擇所有對象：【選擇所有對象：【EditEdit】/ /【Select AllSelect All】2.2.取消選擇對象取消選擇對象 在選定對象外任意空白處單擊。在選定對象外任意空白處單擊。 按按EscEsc鍵。鍵。 選擇不同的工具。選擇不同的工具。 按下按下shiftshift鍵，選擇另一個對象。只取消其中一個對鍵，選擇另一個對象。只取消其中一個對象，可在按下象，可在按下shiftshift鍵的同時點擊對象。鍵的同時點擊對象。3.3.對象排列方式對象排列方式 選定對象選定對象 對象頁面居中：對象頁面居中：【Obie