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1、如何用Origin擬合標(biāo)準(zhǔn)曲線并計算IC50 ?在之前的日志中講了一下IC50的定義,也從網(wǎng)上找了個 IC50計算器讓大家使用。但實(shí)際上在計算IC50的同時,我們一般也要標(biāo)準(zhǔn)曲線,還要線性方程。所以還是用 Origin來擬合標(biāo)準(zhǔn)曲 線,然后用origin內(nèi)置功能來計算IC50比較方便。這里使用Origin7.5 來作演示。1.先隨意輸入一組數(shù)據(jù)吧血T Origin卩g 7.5 - D:Prograrn FUesAOrigin75llqUNTTTLEDFile Edit View Plot Cdumn ArialysiE Statistics look Format Windoiw Help口|
2、誦|副固ta|Ki|圃團(tuán) 圈固圈則曰闔翻樹 團(tuán) 復(fù) I蜃23PH囂I珂口2卜J曲|郵|閃冒|而32 +*'-TC/OeM1扌|目耐|別|戶隠|蠢隠冋|卜;|叨同sl'3 uwrma? JjName團(tuán) DmtaltypeV/orksheelViewNormalFor Hlp, press FlColor Publcatior3.然后就生成了散點(diǎn)圖4.點(diǎn)擊Analysis菜單中的Fit Polynomial ,在彈出的對話框中,Order處設(shè)為1,這樣就是作線性擬合, 可能有人問,為什么不直接選擇 Fit Liner呢?因?yàn)橹挥羞xFit Polynomial,才能在圖形上顯示公式,
3、也就是勾選對話框中的 Show Flormula on graph 。(可能Origin的設(shè)計者認(rèn)為線性擬合公式太簡單,默 認(rèn)就不用顯示了)LrOnginPro 7.5 D:Program FilesOr»gin75llq UNTTTLEDHie Edit View graph Qata AnalysisTools Format Window *lp|SmoothingJ lTI5汕叵3I*FFT FilterSmple Math.Z|/|z|>|ti|l©|A|©|dll 畫申 3 UNTITLEDName1 TypeI View上 Data 1Works
4、heetNormal§)GraphlGraphNormald12JL1Polynomial Fit on Data 1_BColor Pubfccationl:Data 1_B(5匸匚ia一 H匚 H匚一ISB一麗麗-麗麗麗一昱Iffi瓦-Elm一 酪一礪¥_ 塑Is麗一>klUJ匕旦-一-亠-昱|>-訊 一HLd匕-口旦2c?0、二田厲T卄+ Q-|-,-lx-lr-i、-鬲F一璽芝-!:<-鞫-1-k兇令 UMTTTLEDGraph 1|型Data丄孟一GNorrnalNl?lzLFoHeb” press Fl -g-or puKcatiorl waf
5、f G>aOKnn31 ffl酈M口3mt>R2=0.9918點(diǎn)擊那里的小箭頭后,我們可以看到完整的擬合統(tǒng)計信息,如相關(guān)系數(shù)6.好了,標(biāo)準(zhǔn)曲線知道了,現(xiàn)在就來計算IC50。根據(jù)IC50定義,該例子中就是 Y取中值時,X對應(yīng)的數(shù)值,這里Y的中值是0.6,那根據(jù)線性方程就可以自己算出來對應(yīng)的X值。那如果不是線性方程,公式比較復(fù)雜手工計算就很麻煩了,所以還是用Origin中的功能吧。S形曲線的,則需要選擇點(diǎn)擊Tools,Linear Fit ,如果不是線性擬合的,請選擇其他擬合方式,如果是Sigmoidal Fit.7.在彈出的對話框中,先點(diǎn)擊Fit,然后在Find Y處輸入0.6,點(diǎn)擊Find X按鈕,得到的數(shù)值就是IC50了。同樣的可以很方便的求得IC90,IC10,IC20mat Window HelpFile Edit View 石Fph口|圃龐歴懂|圍劇囪| |B|G|B|翟I翻髯I e因到超刁辰琦郵 &Ijji° zjfrT| BS-! x|12-05 - 4-Q2Y = 1.57-i.1 1 XX Axis.TitleEPolyiom ial
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