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文檔簡介

1、附件6 RT-PCR檢測漢坦病毒基因及分型材料:(1)急性期病人血清、鼠肺、鼠血或分離的漢坦病毒(2)引物:引物序列(53)位置片段(bp)逆轉(zhuǎn)錄引物TAGTAGTAGACTCC114LMS通用外引物AAAGTAGGTGITAYATCYTIACAATGTGG19101939M(+)GTACAICCTGTRCCIACCCC23732354M(-)型特異性引物漢灘病毒GAATCGATACTGTGGGCTGCAAGTGC19581984M(+)GGATTAGAACCCCAGCTCGTCTC23182340M()漢城病毒GTGGACTCTTCTTCTCATTATT19361957M(+)TGGGCAA

2、TCTGGGGGGTTGCATG23312353M()S片段引物ATGTTGCCTGGGGIAAAGAGG12001220S(+)GCGCACTAGTAGTAGTAGACTCCCTAAAGA16701696S(-)方法:(1)病毒RNA的提取:采用TRIzol按說明提取,制備模板RNA;(2)逆轉(zhuǎn)錄、合成cDNA:采用SuperScripTMII或AMV逆轉(zhuǎn)錄酶,按說明書進行;(3)PCR擴增:反應條件為95預變性10分鐘,9460秒、5560秒、7245秒、擴增3035個循環(huán),72延伸12分鐘。(4)擴增產(chǎn)物用12瓊脂糖凝膠電泳鑒定。若條帶的分子量與預期片段大小相同,則表明為特異性擴增產(chǎn)物。必要時,可進行:(5)PCR片段的回收和核苷酸序列測定:切下特異分子量條帶,用QIAquick凝膠回收試劑盒回收(按其說明書進行),自動測序儀測序。意義:擴增到特異性條帶可

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