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文檔簡介
1、生物化學(xué)簡明教程章節(jié)作業(yè)第01章 蛋白質(zhì)1、20種常見氨基酸的名稱及分類:丙氨酸(Ala)纈氨酸(Val)亮氨酸(Leu)異亮氨酸(Ile)脯氨酸(Pro)苯丙氨酸(Phe)色氨酸(Trp)蛋氨酸(Met)甘氨酸(Gly)絲氨酸(Ser)蘇氨酸(Thr)半胱氨酸(Cys) 酪氨酸(Tyr)天冬酰胺(Asn)谷氨酰胺(Gln)天冬氨酸(Asp)谷氨酸(Glu)賴氨酸(Lys)精氨酸(Arg)組氨酸(His)分類:20種氨基酸按R基的化學(xué)結(jié)構(gòu)可分為3類:脂肪族(Gly、Ala、Val、Leu、Ile);芳香族(Phe、Tyr、Trp);雜環(huán)族(其他);按照R基極性分:非極性(8種Ala、
2、Val、Leu、Ile、Phe、Trp、Met、Pro)和極性氨基酸(帶正電Lys、堿Arg、His)、帶負(fù)電(Asp、酸Glu)、不帶電(其它)2、簡述氨基酸茚三酮(一般脯氨酸例外)顯色的原理和應(yīng)用。 原理:茚三酮在弱酸溶液中與氨基酸加熱,發(fā)生氧化、脫氨、脫羧作用。茚三酮水合物被還原,其還原物可與氨基酸加熱分解產(chǎn)生的氨結(jié)合,再與另一分子茚三酮縮合成為藍(lán)紫色化合物,稱為羅曼紫應(yīng)用:是氨基酸的特異性化學(xué)反應(yīng),常用于氨基酸的定性、定量分析。產(chǎn)生CO2定量測體積從而測AA的量,產(chǎn)生的藍(lán)紫色化合物在570nm波長比色,定量測AA含量。該顏色反應(yīng)常用于AA紙層析、薄層層析、電泳等顯色。脯氨酸例外不產(chǎn)生N
3、H3,生成黃素化合物3、氨基酸等電點(diǎn)的概念及計(jì)算。在某一PH的溶液中,氨基酸解離成陽離子和陰離子的趨勢及程度相等,成為兼性離子,呈電中性,此時(shí)的溶液ph稱該氨基酸的等電點(diǎn)。pI=1/2(pKa1+PKa2)4、蛋白質(zhì)空間結(jié)構(gòu)的類型及相關(guān)概念、二級(jí)結(jié)構(gòu)的基本類型。蛋白質(zhì)的一級(jí)結(jié)構(gòu):以肽鍵連接而成的肽鏈中AA的排列順序。(肽鍵)蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu):多肽鏈不是簡單呈線性,而是按照一定的方式有規(guī)則的螺旋或折疊。(氫鍵)二級(jí)結(jié)構(gòu)主要有:-螺旋:蛋白質(zhì)中常見的二級(jí)結(jié)構(gòu),肽鏈主鏈繞假想的中心軸盤繞成螺旋狀,一般都是右手螺旋結(jié)構(gòu),螺旋是靠鏈內(nèi)氫鍵維持的。-折疊、-轉(zhuǎn)角、無規(guī)則卷、-螺旋等蛋白質(zhì)的三級(jí)結(jié)構(gòu):蛋白質(zhì)
4、的多肽鏈在各種二級(jí)結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上再進(jìn)一步盤曲或折迭形成具有一定規(guī)律的三維空間結(jié)構(gòu)。結(jié)構(gòu)穩(wěn)定主要靠次級(jí)鍵(氫鍵、疏水鍵、鹽鍵以及范德華力)蛋白質(zhì)的四級(jí)結(jié)構(gòu):由兩條或兩條以上的多肽鏈構(gòu)成蛋白質(zhì)分子,結(jié)構(gòu)更復(fù)雜,其結(jié)構(gòu)的最小共價(jià)單位稱為亞基,亞基與亞基的結(jié)合方式叫四級(jí)結(jié)構(gòu)。5、蛋白質(zhì)變性復(fù)性的本質(zhì)以及變性因素。蛋白質(zhì)的變性:當(dāng)?shù)鞍踪|(zhì)受到物理因素或化學(xué)因素的影響后,由次級(jí)鍵維持的高級(jí)結(jié)構(gòu)受到破壞,分子內(nèi)部結(jié)構(gòu)發(fā)生變化,致使生物學(xué)性質(zhì)、理化性質(zhì)改變。(二級(jí)結(jié)構(gòu)以上空間結(jié)構(gòu)破壞)變性因素:物理和化學(xué)因素兩類。物理因素可以是加熱、加壓、脫水、攪拌、振蕩、紫外線照射、超聲波的作用等;化學(xué)因素有強(qiáng)酸、強(qiáng)堿、尿素、
5、重金屬鹽、十二烷基磺酸鈉(SDS)等。在臨床醫(yī)學(xué)上,變性因素常被應(yīng)用于消毒及滅菌。變性蛋白質(zhì)發(fā)生改變的有:1、溶解度降低2、黏度增大3、分子擴(kuò)散速度減慢4、滲透壓降低5、等電點(diǎn)改變,出現(xiàn)新的顏色反應(yīng)6、活性降低或喪失7、變性蛋白質(zhì)易被水解在變性條件不劇烈,變性蛋白質(zhì)內(nèi)部結(jié)構(gòu)變化不大時(shí),除去變性因素,在適當(dāng)條件下變性蛋白質(zhì)可恢復(fù)其天然構(gòu)象和生物活性,這種現(xiàn)象稱為蛋白質(zhì)的復(fù)性(renaturation)。6、常見蛋白質(zhì)分離純化的方法有哪些?答:按照分子大小:透析、超過濾、密度梯度離心、凝膠過濾按照溶解度差別:等電點(diǎn)沉淀法、鹽析、有機(jī)溶劑沉淀按照電荷不同分:電泳、離子交換蛋白質(zhì)選擇吸附分:結(jié)晶磷酸鈣
6、配體特異性分:親和層析7、凝膠過濾分離氨基酸及蛋白質(zhì)的原理。答:原理:不同分子大小的蛋白質(zhì)流入凝膠層析柱時(shí),比網(wǎng)孔的分子不能進(jìn)入網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)排阻在凝膠珠外,小的分子進(jìn)入凝膠珠,由于不同大小的分子所經(jīng)歷的路徑不同而得到分離。利用了凝膠的多孔性,根據(jù)溶劑分子的大小進(jìn)行分離,大分子先洗下來,小分子后洗下來8、 簡述離子交換層析分離氨基酸的原理。答:離子交換層析(Ion Exchange Chromatography簡稱為IEC)是以離子交換劑為固定相,依據(jù)流動(dòng)相中的組分離子與交換劑上的平衡離子進(jìn)行可逆交換時(shí)的結(jié)合力大小的差別而進(jìn)行分離的一種層析方法。依據(jù)的原理是物質(zhì)的酸堿性、極性,也就是所帶陰陽離子的不
7、同.電荷不同的物質(zhì),對管柱上的離子交換劑有不同的親和力,改變沖洗液的離子強(qiáng)度和pH值,物質(zhì)就能依次從層析柱中分離出來。離子交換層析法大致分為5個(gè)步驟:1.離子擴(kuò)散到樹脂表面.2.離子通過樹脂擴(kuò)散到交換位置.3.在交換位置進(jìn)行離子交換4.被交換的離子擴(kuò)散到樹脂表面 5.沖洗液通過,被交換的離子擴(kuò)散到外部溶液中.1. 課后習(xí)題6、8、96由下列信息求八肽的序列。(1)酸水解得 Ala,Arg,Leu,Met,Phe,Thr,2Val。(2)Sanger試劑處理得DNP-Ala。(3)胰蛋白酶處理得Ala,Arg,Thr 和 Leu,Met,Phe,2Val。當(dāng)以Sanger試劑處理時(shí)分別得到DNP
8、-Ala和DNP-Val。(4)溴化氰處理得 Ala,Arg,高絲氨酸內(nèi)酯,Thr,2Val,和 Leu,Phe,當(dāng)用Sanger試劑處理時(shí),分別得DNP-Ala和DNP-Leu。答:由(2)推出N末端為Ala;由(3)推出Val位于N端第四,Arg為第三,而Thr為第二;溴化氰裂解,得出N端第六位是Met,由于第七位是Leu,所以Phe為第八;由(4),第五為Val。所以八肽為:Ala-Thr-Arg-Val-Val-Met-Leu-Phe。8當(dāng)一種四肽與FDNB反應(yīng)后,用5.7mol/LHCl水解得到DNP-Val及其他3種氨基酸;當(dāng)這四肽用胰蛋白酶水解時(shí)發(fā)現(xiàn)兩種碎片段;其中一片用LiBH
9、4(下標(biāo))還原后再進(jìn)行酸水解,水解液內(nèi)有氨基乙醇和一種在濃硫酸條件下能與乙醛酸反應(yīng)產(chǎn)生紫(紅)色產(chǎn)物的氨基酸。試問這四肽的一級(jí)結(jié)構(gòu)是由哪幾種氨基酸組成的?答:(1)四肽與FDNB反應(yīng)后,用5.7mol/LHCl水解得到DNP-Val,證明N端為Val。(2)LiBH4還原后再水解,水解液中有氨基乙醇,證明肽的C端為Gly。(3)水解液中有在濃H2SO4條件下能與乙醛酸反應(yīng)產(chǎn)生紫紅色產(chǎn)物的氨基酸,說明此氨基酸為Trp。說明C端為GlyTrp(4)根據(jù)胰蛋白酶的專一性,得知N端片段為ValArg(Lys),以(1)、(2)、(3)結(jié)果可知道四肽的順序:NValArg(Lys)TrpGlyC。9概述
10、測定蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)的基本步驟。答:(1)測定蛋白質(zhì)中氨基酸組成。(2)蛋白質(zhì)的N端和C端的測定。(3)應(yīng)用兩種或兩種以上不同的水解方法將所要測定的蛋白質(zhì)肽鏈斷裂,各自得到一系列大小不同的肽段。(4)分離提純所產(chǎn)生的肽,并測定出它們的序列。(5)從有重疊結(jié)構(gòu)的各個(gè)肽的序列中推斷出蛋白質(zhì)中全部氨基酸排列順序。如果蛋白質(zhì)含有一條以上的肽鏈,則需先拆開成單個(gè)肽鏈再按上述原則確定其一級(jí)結(jié)構(gòu)。如是含二硫鍵的蛋白質(zhì),也必須在測定其氨基酸排列順序前,拆開二硫鍵,使肽鏈分開,并確定二硫鍵的位置。拆開二硫鍵可用過甲酸氧化,使胱氨酸部分氧化成兩個(gè)半胱氨磺酸。9、 簡述SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳分離蛋白質(zhì)的原理。答:
11、SDSPAGE:當(dāng)SDS與蛋白質(zhì)結(jié)合后,蛋白質(zhì)分子即帶有大量的負(fù)電荷,從而掩蓋了天然蛋白質(zhì)分子間的電荷差別。與此同時(shí)蛋白質(zhì)在SDS的作用下結(jié)構(gòu)變得松散,形狀趨向一致,所以各種SDS -蛋白質(zhì)復(fù)合物在電泳時(shí)產(chǎn)生的泳動(dòng)率差異,只反映了分子量的差異,即純利用分子篩效應(yīng),按蛋白質(zhì)分子量大小進(jìn)行分離,分子量越大移動(dòng)越慢。10、蛋白質(zhì)等電點(diǎn):使蛋白質(zhì)解離成正、負(fù)離子的趨勢相等,即成為兼性離子,凈電荷為零時(shí)溶液的pH稱為蛋白質(zhì)的等電點(diǎn)。蛋白質(zhì)沉淀:破壞蛋白質(zhì)分子的水化作用或者減弱分子間同性相斥作用的因子,使蛋自質(zhì)在水中的溶解度降低而沉降下來轉(zhuǎn)化為固體的分離方法鹽溶:在蛋白質(zhì)水溶液中,加入少量的中性鹽,如硫酸
12、銨、硫酸鈉、氯化鈉等,會(huì)增加蛋白質(zhì)分子表面的電荷,增強(qiáng)蛋白質(zhì)分子與水分子的作用,從而使蛋白質(zhì)在水溶液中的溶解度增大。這種現(xiàn)象稱為鹽溶鹽析:向某些蛋白質(zhì)溶液中加入某些無機(jī)鹽溶液后,可以降低蛋白質(zhì)的溶解度,使蛋白質(zhì)凝聚而從溶液中析出,這種作用叫作鹽析,是物理變化,可復(fù)原電泳:帶電顆粒在電場作用下,向著與其電性相反的電極移動(dòng),稱為電泳(EP)單體蛋白質(zhì):單體蛋白質(zhì)(monomeric protein):僅由一條多肽鏈組成寡聚蛋白質(zhì):由兩個(gè)或兩個(gè)以上的亞基或單體組成的蛋白質(zhì)肽:一個(gè)氨基酸的a-羧基與另一個(gè)氨基酸的a-氨基脫水縮合形成的共價(jià)鍵稱肽鍵,由此形成化合物稱為肽。肽鍵:一個(gè)氨基酸的a-羧基與另一
13、個(gè)氨基酸的a-氨基脫水縮合形成的共價(jià)鍵肽鏈:由多個(gè)氨基酸相互連接形成的含有多個(gè)肽鍵的一條鏈狀結(jié)構(gòu)稱為肽鏈。生物活性肽: 能夠調(diào)節(jié)生物機(jī)體的生命活動(dòng)或具有某些生理活性的寡肽和多肽的總稱第02章 核酸1、基因:遺傳學(xué)將DNA分子中最小的功能單位稱作基因;基因組:某物種所含的全套遺傳物質(zhì)稱該生物體的基因組。退火:變性核酸復(fù)性時(shí)需緩慢冷卻,稱為退火。增色效應(yīng):若將核酸水解為核苷酸,紫外吸收值通常增加30%-40%,這種現(xiàn)象被稱作增色效應(yīng)。減色效應(yīng):復(fù)性后,核酸的紫外吸收降低,這種現(xiàn)象被稱作減色效應(yīng)。核酸分子雜交:在退火條件下,不同來源的DNA互補(bǔ)區(qū)形成雙鏈,或DNA單鏈和RNA單鏈的互補(bǔ)區(qū)形成DNA-
14、RNA雜合雙鏈的過程稱分子雜交。轉(zhuǎn)座子:一段DNA順序可以從原位上單獨(dú)復(fù)制或斷裂下來,環(huán)化后插入另一位點(diǎn),并對其后的基因起調(diào)控作用,此過程稱轉(zhuǎn)座。這段序列稱跳躍基因或轉(zhuǎn)座子斷裂基因:真核生物結(jié)構(gòu)基因,由若干個(gè)編碼序列和非編碼序列互相間隔開但又連續(xù)鑲嵌而成,去除非編碼序列再連接后,可翻譯出由連續(xù)氨基酸組成的完整蛋白質(zhì),這些基因稱為斷裂基因。2. 簡述原核、病毒及真核生物基因組的主要特點(diǎn)。答:原核生物基因組的特點(diǎn):1.基因組較小,通常只有一個(gè)環(huán)形或線形的DNA分子2.基因組大部分序列是用來編碼蛋白質(zhì)的,基因之間的間隔序列很短。3.功能相關(guān)的基因常串聯(lián)在一起由共同的調(diào)控元件調(diào)控。病毒基因組的特點(diǎn):1
15、. 病毒基因組可以由DNA或RNA組成,但每種病毒只含有一種核酸。2.不少病毒以RNA為遺傳物質(zhì)3.有重疊基因。真核生物基因組的特點(diǎn):1.基因組較大2.不存在操縱子結(jié)構(gòu)3.存在大量的重復(fù)序列4.有斷裂基因3. 什么是核酸變性?變性因素有哪些?答:核酸的變性指雙螺旋區(qū)氫鍵斷裂,空間結(jié)構(gòu)破壞,形成單鏈無規(guī)線團(tuán)狀態(tài)的過程。DNA變性的因素很多,如溫度、超聲波、強(qiáng)酸、強(qiáng)堿、有機(jī)溶劑和某些化學(xué)試劑(如尿素、酰胺)等都能引起變性。4. 什么是核酸的解鏈溫度Tm?影響因素有哪些?答:將解鏈的DNA紫外吸收的增加量達(dá)最大增量一半時(shí)的溫度值稱溶解溫度即Tm。(1)G-C對含量 (2)溶液的離子強(qiáng)度(3)溶液的p
16、H 4(4)變性劑5. 解釋瓊脂糖凝膠電泳、聚丙烯酰胺凝膠電泳和脈沖電泳分離核酸的原理和區(qū)別?答:瓊脂糖凝膠的凝膠孔徑大,適合大分子DNA電泳和需要快速簡單分析的DNA電泳,電泳方式一般采用水平潛水電泳.優(yōu)點(diǎn)是快速簡單,但分辨率不是很高,對于差異較小的 DNA片段難以分辨。聚丙烯酰胺凝膠電泳適宜分離鑒定低分子量蛋白質(zhì)、小于1Kb的DNA片段和DNA序列分析.其裝載的樣品量大,回收DNA純度高.長度僅相差0.2%(即500bp中的1bp)的核苷酸分子即能分離.一般說來,分離鑒定小于1000個(gè)核苷酸的核酸片段可用聚丙烯酰胺電泳,分離鑒定0.1-50kb的DNA片段可用恒場常規(guī)瓊脂糖電泳,而分離鑒定
17、大于50kb的DNA片段則需采用脈沖場瓊脂糖電泳.第03章 酶學(xué)1、單純酶:酶僅由氨基酸殘基組成,不含其它化學(xué)成分。結(jié)合酶:又叫雙成分酶。結(jié)合酶包括兩部分:蛋白質(zhì)部分,稱酶蛋白,決定反應(yīng)的特異性;非蛋白質(zhì)部分(通常稱為輔助因子),多為小分子有機(jī)化合物或金屬離子,決定反應(yīng)的種類與性質(zhì)。輔酶:屬于有機(jī)分子類型的輔因子稱為輔酶。全酶:屬于綴合蛋白質(zhì)的酶除了氨基酸殘基組分外,還含有金屬離子、有機(jī)小分子等化學(xué)成分。輔基:輔基通常與脫輔酶緊密結(jié)合,甚至通過共價(jià)鍵結(jié)合,用溫和的物理手段不易除去。酶專一性 :即對底物的嚴(yán)格選擇性,酶的專一性可分成兩種類型,一是結(jié)構(gòu)專一性,二是立體異構(gòu)專一性。 絕對專一性:有些
18、酶對底物有相當(dāng)嚴(yán)格的選擇,通常只作用于一種特定的底物,這種專一性稱為絕對專一性。相對專一性:有些酶的作用對象不是一種底物,而是一類結(jié)構(gòu)相近的底物,這種專一性稱為相對專一性。立體專一性:當(dāng)反應(yīng)物具有立體異構(gòu)體時(shí),酶只選擇其中的一種立體異構(gòu)體作為其底物。別構(gòu)酶:別構(gòu)酶是一種調(diào)節(jié)酶,特異性的代謝物與別構(gòu)酶的活性部位以外的位點(diǎn)非共價(jià)結(jié)合后,可以調(diào)節(jié)其活性。別構(gòu)效應(yīng):當(dāng)某些化合物與酶分子中的別構(gòu)部位可逆地結(jié)合后,酶分子的構(gòu)象發(fā)生改變,使酶活性部位對底物的結(jié)合與催化作用受到影響,從而調(diào)節(jié)酶促反應(yīng)速度及代謝過程,這種效應(yīng)稱為別構(gòu)效應(yīng)脫敏作用:脫敏作用是指別構(gòu)酶或變構(gòu)酶經(jīng)過特殊處理后,不喪失酶活性而失去對別構(gòu)
19、效應(yīng)物的敏感性。同(異)促效應(yīng):同促效應(yīng)是指當(dāng)一個(gè)效應(yīng)物分子與酶結(jié)合之后,影響到另一相同的效應(yīng)物分子與酶的另一部位的結(jié)合。共價(jià)修飾:酶蛋白肽鏈上的一些基團(tuán)可與某種化學(xué)基團(tuán)發(fā)生可逆的共價(jià)結(jié)合,從而改變酶的活性,這一過程稱為酶的共價(jià)修飾或者化學(xué)修飾。酶原:生物體內(nèi)合成出的無活性的酶的前體。多酶復(fù)合體:由幾種酶彼此嵌合形成的復(fù)合體稱為多酶復(fù)合體。2、 酶作為生物催化劑有哪些特點(diǎn)?解答:作為生物催化劑,酶最重要的特點(diǎn)是高效性、專一性、可調(diào)節(jié)性。3、 什么是誘導(dǎo)契合學(xué)說,該學(xué)說如何解釋酶的專一性?解答:“誘導(dǎo)契合”,酶分子的結(jié)構(gòu)并非與底物分子正好互補(bǔ),而是具有一定的柔性,當(dāng)酶分子與底物分子靠近時(shí),酶受底
20、物分子誘導(dǎo),其構(gòu)象發(fā)生,有利于與底物結(jié)合的變化,酶與底物在此基礎(chǔ)上互補(bǔ)契合進(jìn)行反應(yīng)。根據(jù)誘導(dǎo)契合學(xué)說,經(jīng)過誘導(dǎo)之后,酶與底物在結(jié)構(gòu)上的互補(bǔ)性是酶催化底物反應(yīng)的前提條件,酶只能與對應(yīng)的化合物契合,從而排斥了那些形狀、大小等不適合的化合物,因此酶對底物具有嚴(yán)格的選擇性,即酶具有高度專一性。4、 按照酶催化的反應(yīng)類型可將酶分成幾類?答:分6大類,其排序如下:(1)氧化還原酶:催化底物進(jìn)行氧化還原反應(yīng)的酶類.(2)轉(zhuǎn)移酶:催化底物之間進(jìn)行某些基團(tuán)的轉(zhuǎn)移或交換的酶類.(3)水解酶:催化底物發(fā)生水解的酶類。(4)裂合酶類:催化從底物移去一個(gè)基團(tuán)并留下雙鍵的反應(yīng)或其逆反應(yīng)的酶類.(5)異構(gòu)酶:催化各種同分異
21、構(gòu)體之間相互轉(zhuǎn)化的酶類.(6)合成酶:催化兩分子底物合成為一分子化合物,同時(shí)偶聯(lián)有ATP的磷酸鍵斷裂釋能的酶類.5、 何謂酶的活性部位?有何特點(diǎn)?活性中心主要基團(tuán)的作用是什么?答:已知酶通過一個(gè)特定的區(qū)域與底物結(jié)合,形成酶底物復(fù)合物.酶的這個(gè)區(qū)域?yàn)槎叩亩ㄏ蚪Y(jié)合提供了有利條件,因此該區(qū)域被稱為酶的活性中心或活性部位。通常分結(jié)合部位和催化部位。組成酶的活性中心的必需基團(tuán):-NH2、-COOH、-SH、-OH和咪唑基等,只有少數(shù)氨基酸側(cè)鏈基團(tuán)與活性直接相關(guān).6、 為什么酶具有高催化效率?答:酶具有高催化效率的分子機(jī)理是:酶分子的活性部位結(jié)合底物形成酶底物復(fù)合物,在酶的幫助作用下(包括共價(jià)作用與非共
22、價(jià)作用),底物進(jìn)入特定的過渡態(tài),由于形成此過渡態(tài)所需要的活化能遠(yuǎn)小于非酶促反應(yīng)所需要的活化能,因而反應(yīng)能夠順利進(jìn)行,形成產(chǎn)物并釋放出游離的酶,使其能夠參與其余底物的反應(yīng)。7、 酸堿催化反應(yīng)是指瞬時(shí)向反應(yīng)物提供質(zhì)子或從反應(yīng)物接受質(zhì)子以穩(wěn)定過渡態(tài)、加速反應(yīng)的一類催化機(jī)制。蛋白質(zhì)中起酸堿催化功能的基團(tuán)有哪些?答:包括親核性基團(tuán)(絲氨酸的羧基,半胱氨酸的疏基,組氨酸的咪唑基)和酸堿性基團(tuán)(天門冬氨酸和谷氨酸的羧基,賴氨酸的氨基,酪氨酸的酚羥基,組氨酸的咪唑基半胱氨酸的疏基)8、 米氏常數(shù)有何酶學(xué)意義?答:米氏常數(shù)的數(shù)值等于酶促反應(yīng)達(dá)到其最大速度Vm一半時(shí)的底物濃度。它可以表示酶和底物之間的親和能力,K
23、m值越大,親和能力越弱。Km是一種酶的特征常數(shù),只與酶的種類有關(guān)而與酶的濃度無關(guān),與底物的濃度也無關(guān),這一點(diǎn)與Vm是不同的,因此,我們可以通過Km值來鑒別酶的種類.但是它會(huì)隨著反應(yīng)條件(T、PH)的改變而改變。非競爭性抑制劑米氏常數(shù)不變,最大反應(yīng)速度減?。环锤偁幮砸种苿┟资铣?shù)減小,最大反應(yīng)速度減小。意義:a:鑒定酶。b:判斷酶的最適底物。c:計(jì)算一定速率下的底物濃度。d:了解酶底物在體內(nèi)具有的濃度水平。e:判斷反應(yīng)方向或趨勢。f:判斷抑制類型。g:推斷代謝途徑。第04章 生物氧化1、生物氧化:有機(jī)物在生物體內(nèi)氧的作用下,生成CO2 和水并釋放能量的過程稱為生物氧化。呼吸鏈:代謝物上的氫原子被
24、脫氫酶激活脫落后,經(jīng)過一系列傳遞體,最后傳遞給被激活的氧分子,并與之結(jié)合生成水的全部體系稱呼吸鏈底物水平磷酸化:在被氧化的底物上發(fā)生磷酸化作用,在底物被氧化的過程中,形成了某些高能磷酸化合物,這些高能磷酸化合物通過酶的作用使ADP生成ATP電子傳遞磷酸化:電子由NADH或FADH2 經(jīng)電子傳遞呼吸鏈傳遞給氧,最終形成水的過程中伴有ADP磷酸化為ATP,這一過程稱電子傳遞體系磷酸化。磷氧比:每消耗1摩爾氧所消耗的無機(jī)磷酸的摩爾數(shù)。2簡述有關(guān)氧化磷酸化作用機(jī)理的化學(xué)滲透學(xué)說主要內(nèi)容。要點(diǎn):在電子傳遞和ATP形成之間起偶聯(lián)作用的是H+電化學(xué)梯度。偶聯(lián)過程中,線粒體膜必須完整封閉才能進(jìn)行。呼吸鏈的電子
25、傳遞體是一個(gè)主動(dòng)地轉(zhuǎn)移H+離子體系,電子傳遞過程像一個(gè)H+泵,促使基質(zhì)中H+離子穿越線粒體內(nèi)膜,形成H+離子濃度內(nèi)地外高梯度,這就蘊(yùn)藏了電化學(xué)能量,此能可使ADP和無機(jī)磷酸形成ATP。.3.解釋細(xì)胞內(nèi)NADH的線粒體穿梭機(jī)制。(1)磷酸甘油穿梭系統(tǒng):這一系統(tǒng)以3-磷酸甘油和磷酸二羥丙酮為載體,在兩種不同的-磷酸甘油脫氫酶的催化下,將胞液中NADH的氫原子帶入線粒體中,交給FAD,再沿琥珀酸氧化呼吸鏈進(jìn)行氧化磷酸化.因此,如NADH通過此穿梭系統(tǒng)帶一對氫原子進(jìn)入線粒體,則只得到2分子ATP.(2)蘋果酸穿梭系統(tǒng):此系統(tǒng)以蘋果酸和天冬氨酸為載體,在蘋果酸脫氫酶和谷草轉(zhuǎn)氨酶的催化下.將胞液中NADH
26、的氫原子帶入線粒體交給NAD+,再沿NADH氧化呼吸鏈進(jìn)行氧化磷酸化.因此,經(jīng)此穿梭系統(tǒng)帶入一對氫原子可生成3分子ATP4常見的呼吸鏈電子傳遞抑制劑有哪些?它們的作用機(jī)制是什么?常見的抑制劑列舉如下幾種.一、魚藤酮、安密妥、殺粉蝶菌素 :阻斷電子由 NADH向CoQ的傳遞.二、抗霉素 A:由鏈霉素分離出來的抗菌素,能抑制電子從細(xì)胞色素b到細(xì)胞色素c1的傳遞.三、氰化物、硫化氫、疊氮化物、 CO等有阻斷電子由細(xì)胞色素aa3傳至氧的作用.5有人曾經(jīng)考慮過使用解偶聯(lián)劑如2,4-二硝基苯酚(DNP)作為減肥藥,但很快就被放棄使用,為什么?解答:(1)因DNP是解偶聯(lián)劑,電子傳遞釋放的自由能不
27、能以ATP的形式捕獲而是以熱的形式散失,從而使體溫升高,大量出汗。(2)因DNP可促進(jìn)細(xì)胞代謝速率而增加能量的消耗起到減輕體重的作用,但是DNP有明顯的副作用,使其不能作為減肥藥物。第10章 RNA的生物合成1、結(jié)構(gòu)基因:決定某種蛋白質(zhì)或酶分子結(jié)構(gòu)的基因轉(zhuǎn)錄:RNA聚合酶的作用下,以4種核苷三磷酸為原料,以DNA為模板,按照堿基配對原則合成RNA過程。模板鏈:基因轉(zhuǎn)錄時(shí),兩條互補(bǔ)的DNA鏈有一條作為RNA合成的模板,稱作模板鏈編碼鏈:一條鏈稱作非模板鏈,也稱作編碼鏈。啟動(dòng)子:RNA聚合酶識(shí)別、結(jié)合并起始轉(zhuǎn)錄的一段特異性的DNA序列。終止因子:終止子:是給予RNA聚合酶轉(zhuǎn)錄終止信號(hào)的DNA序列。
28、順式作用元件:存在于基因旁側(cè)序列中能影響基因表達(dá)的序列。包括啟動(dòng)子、增強(qiáng)子、調(diào)控序列和可誘導(dǎo)元件等,它們作用是參與基因表達(dá)的調(diào)控。順式作用元件本身不編碼任何蛋白質(zhì),僅僅提供一個(gè)作用位點(diǎn),要與反式作用因子相互作用而起作用反式作用因子:是指能直接或間接地識(shí)別或結(jié)合在各類順式作用元件核心序列上參與調(diào)控靶基因轉(zhuǎn)錄效率的蛋白質(zhì)。轉(zhuǎn)錄后加工:RNA前體經(jīng)過鏈裂解、5/端與3/端切除和特殊結(jié)構(gòu)形成、核苷修飾和糖苷鍵改變以及剪切和編輯等過程才能形成成熟的RNA,這個(gè)過程叫。割裂基因:真核生物結(jié)構(gòu)基因,由若干個(gè)編碼序列和非編碼序列互相間隔開但又連續(xù)鑲嵌而成,去除非編碼序列再連接后,可翻譯出由連續(xù)氨基酸組成的完整
29、蛋白質(zhì),這些基因稱為斷裂基因RNA剪接:從DNA模板鏈轉(zhuǎn)錄出的最初轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物中除去內(nèi)含子,并將外顯子連接起來形成一個(gè)連續(xù)的RNA分子的過程。順式剪接:發(fā)生在同一個(gè)RNA前體分子內(nèi)部的剪接。反式剪接:發(fā)生在兩種RNA前體分子之間的剪接。選擇性剪接:同一初級(jí)轉(zhuǎn)錄物,通過不同方式剪接,可以得到不同的mRNA產(chǎn)物稱為選擇性剪接。RNA的編輯:mRNA轉(zhuǎn)錄后,通過堿基替換,插入或缺失改變遺傳信息,從而表達(dá)出不同蛋白質(zhì)的過程。2、簡述順反子概念提出的意義。答:順反子:把基因具體化為DNA分子的一段序列,它負(fù)責(zé)傳遞遺傳信息,是決定一條多肽鏈的完整的功能單位;但它又是可分的,組成順反子的核苷酸可以獨(dú)自發(fā)生突變或
30、重組,而且基因與基因之間還有相互作用。基因排列位置的不同,會(huì)產(chǎn)生不同的效應(yīng)。3、大腸桿菌RNA聚合酶的組成及主要功能答:RNA聚合酶全酶形式為(2),共5個(gè)亞基。各亞基功能:(1)亞基參與全酶和起始位點(diǎn)的結(jié)合即特定基因轉(zhuǎn)錄,參與轉(zhuǎn)錄過程中雙螺旋解開與恢復(fù);(2)亞基參與轉(zhuǎn)錄起始、酶和底物結(jié)合及催化磷酸二酯鍵形成;(3)亞基堿性最強(qiáng),參與酶與模板DNA結(jié)合和酶催化功能;(4)因子作用就是識(shí)別起始位置,并與DNA形成穩(wěn)定復(fù)合物,促使轉(zhuǎn)錄進(jìn)行。.4、RNA聚合酶的類型及主要功能答:RNA聚合酶的作用是轉(zhuǎn)錄RNA。真核生物分三類:RNA聚合酶,在核仁中,轉(zhuǎn)錄45S rRNA前體,加工產(chǎn)生18S、28S
31、、5.8SrRNA。RNA聚合酶,在核質(zhì)中,轉(zhuǎn)錄大多數(shù)基因。RNA聚合酶,在核質(zhì)中,轉(zhuǎn)錄小RNA基因。5、RNA加工的內(nèi)容。答:RNA加工是指在原初RNA產(chǎn)物中刪除一些核苷酸,添加一些基因沒有編碼的核苷酸并修飾的步驟,是轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物轉(zhuǎn)換成成熟RNA分子的過程。包括(原核生物RNA加工)rRNA前體加工+tRNA前體加工 (真核)rRNA前體加工+ tRNA前體加工+mRNA前體加工例如真核:一.mRNA:(1)首尾的修飾:5端加帽子結(jié)構(gòu),3端加上尾巴。(2)mRNA的剪接:除去內(nèi)含子。(3)mRNA編輯。 二.tRNA:(1)5端前導(dǎo)序列切除。(2)3端由tRNA核苷酸轉(zhuǎn)移酶加入CCA-OH作為末
32、端。(3)還包括稀有堿基生成,甲基化等。三.rRNA:(1)真核生物核內(nèi)是45S的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物,是三種rRNA的前身。(2)形成小亞基18S-RNA。(3)形成大亞基28S、5.8S的rRNA.6、根據(jù)基因的類型和剪接的方式,通常內(nèi)含子分為哪幾類?各自的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)是什么?答:內(nèi)含子自我剪切(無需蛋白質(zhì)參與,rRNA前體可自我催化完成)、內(nèi)含子自我剪切(有催化功能,能完成自我剪切)、hnRNA自我剪切(在核內(nèi)迅速降解合成,半壽期很短,不穩(wěn)定)、核內(nèi)tRNA前體的酶促剪切7、真核生物由hnRNA轉(zhuǎn)變成mRNA的過程包括:1.在5/端有帽子結(jié)構(gòu)。2.在3'端加上多聚腺苷酸尾巴。3.除去轉(zhuǎn)錄序列中內(nèi)含子。4.鏈內(nèi)部核苷被甲基化。8、帽子結(jié)構(gòu)的意義答:mRNA的帽結(jié)構(gòu)功能:能被核糖體小亞基識(shí)別,促使mRNA和核糖體的結(jié)合;m7
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