linux集群登陸及投算作業(yè)-改2014830

1、一、登陸到linux集群（1）登錄管理節(jié)點(diǎn)登陸linux集群分為shell字符界面登陸和vnc圖形界面登陸。首先在個(gè)人電腦安裝Xmanage和 RealVNC軟件，見群共享。字符界面登陸用到xshell工具，雙擊打開xshell工具，輸入ssh 99回車然后輸入用戶名和密碼，登陸到linux集群的管理節(jié)點(diǎn)mu01。（2）修改登錄密碼普通用戶更改密碼，在登錄服務(wù)器mu01管理節(jié)點(diǎn)后，輸入ssh cu01，進(jìn)入cu01節(jié)點(diǎn)，然后輸入yppasswd命令來修改密碼，這樣所有節(jié)點(diǎn)密碼都會(huì)自動(dòng)修改。（注：需輸入兩次新密碼，輸入時(shí)不會(huì)顯示）（3）上傳、下載文件點(diǎn)擊綠色的new fil

2、e transfer按鈕打開xftp工具左側(cè)為本地硬盤，右側(cè)為linux用戶目錄。打開本地硬盤，右鍵單擊需要上傳的文件或文件夾，選擇upload即可把文件上傳到linux用戶目錄下。 下載文件與上傳相反，在linux用戶目錄下選擇要下載的文件或文件夾，右鍵選擇download即可下載文件到本地硬盤。（4）啟動(dòng)VNC由于comsol，fluent，matlab，abaqus軟件都是圖形界面軟件，所以建議用以下vnc圖形界面方式登陸cu01-cu04計(jì)算節(jié)點(diǎn)。在第一次用vnc圖形界面登陸時(shí)，先用xshell 登陸到字符界面下設(shè)置本賬戶的vnc圖形界面，xshell登陸后先直接運(yùn)行vncserver

3、開啟vnc功能，此時(shí)會(huì)提示輸入密碼，輸入將要設(shè)置的密碼，注意此密碼是vnc的密碼，與賬戶密碼無關(guān)（建議設(shè)置與賬戶相同的密碼），注意輸入密碼時(shí)沒有顯示。用vncserver list查看分配到的vnc號(hào)，如下記住 :1然后打開VNC viewer工具輸入ip地址56加“:1”的格式來登陸vnc圖形。提示輸入VNC密碼，打開用戶桌面若VNC號(hào)有兩個(gè)及以上，或VNC連接不上，或登錄錯(cuò)誤，需要?dú)⒌鬡NC號(hào)，用kill命令，例如殺掉“:1”然后，再起VNC，輸入vncserver回車，再輸入vncserver list 回車，查看重新分配的VNC號(hào)，注意只能存在1個(gè)VNC號(hào)。備注：

4、vnc更改密碼，輸入vncpasswd，按提示輸入兩次密碼即可。二、軟件計(jì)算由于集群資源很少，除去管理節(jié)點(diǎn)不參與計(jì)算外，就剩余4個(gè)計(jì)算節(jié)點(diǎn)，而軟件和用戶相對(duì)校多，所以不建議跨節(jié)點(diǎn)跑作業(yè)，即每個(gè)作業(yè)使用核數(shù)不要超過16核。在要跑軟件之前，先登陸到計(jì)算節(jié)點(diǎn)上用top命令查看目前是否有程序在運(yùn)行。在用戶桌面，單擊右鍵，選擇Open in Terminal例如在cu01上投算作業(yè)，輸入ssh X cu01，回車，轉(zhuǎn)到cu01節(jié)點(diǎn) 輸入top回車，再按“1”查看cu01節(jié)點(diǎn)CPU使用情況若是0代表目前該核心空閑，可以運(yùn)算作業(yè)。100代表cpu核心滿負(fù)荷運(yùn)算。若某個(gè)節(jié)點(diǎn)16個(gè)CPU負(fù)荷已很高，換至其余空閑

5、節(jié)點(diǎn)運(yùn)算作業(yè)。建議一個(gè)計(jì)算節(jié)點(diǎn)核心數(shù)最多使用15核。按“Q”鍵返回，輸入fluent 即可打開FLUENT 14.0軟件同理，輸入matlab、comsol、abq6101 cae即可打開MATLAB R2009b、COMSOL 4.3、ABAQUS 6.10軟件。三、退出linux系統(tǒng)（1）若軟件正在運(yùn)行，需要臨時(shí)退出Linux系統(tǒng)，點(diǎn)擊用戶桌面右上角的“×”，關(guān)閉VNC，在Xshell中連續(xù)輸入exit命令關(guān)閉Xshell，這樣即使退出Linux系統(tǒng)，軟件仍在計(jì)算。（2）若軟件計(jì)算完成或沒有計(jì)算，在terminal中連續(xù)輸入exit命令退出，點(diǎn)擊用戶桌面右上角的“×”，關(guān)閉VNC，再在Xshell中連續(xù)輸入exit命令退出Xshell。注意：（1）投算作業(yè)需先登錄管理節(jié)點(diǎn)mu01，再轉(zhuǎn)到計(jì)算節(jié)點(diǎn)cu01cu04（2）mu01為管理節(jié)點(diǎn)，僅有1顆C