linux集群登陸及投算作業(yè)-改2014830

1、一、登陸到linux集群（1）登錄管理節(jié)點登陸linux集群分為shell字符界面登陸和vnc圖形界面登陸。首先在個人電腦安裝Xmanage和 RealVNC軟件，見群共享。字符界面登陸用到xshell工具，雙擊打開xshell工具，輸入ssh 99回車然后輸入用戶名和密碼，登陸到linux集群的管理節(jié)點mu01。（2）修改登錄密碼普通用戶更改密碼，在登錄服務器mu01管理節(jié)點后，輸入ssh cu01，進入cu01節(jié)點，然后輸入yppasswd命令來修改密碼，這樣所有節(jié)點密碼都會自動修改。（注：需輸入兩次新密碼，輸入時不會顯示）（3）上傳、下載文件點擊綠色的new fil

2、e transfer按鈕打開xftp工具左側為本地硬盤，右側為linux用戶目錄。打開本地硬盤，右鍵單擊需要上傳的文件或文件夾，選擇upload即可把文件上傳到linux用戶目錄下。 下載文件與上傳相反，在linux用戶目錄下選擇要下載的文件或文件夾，右鍵選擇download即可下載文件到本地硬盤。（4）啟動VNC由于comsol，fluent，matlab，abaqus軟件都是圖形界面軟件，所以建議用以下vnc圖形界面方式登陸cu01-cu04計算節(jié)點。在第一次用vnc圖形界面登陸時，先用xshell 登陸到字符界面下設置本賬戶的vnc圖形界面，xshell登陸后先直接運行vncserver

3、開啟vnc功能，此時會提示輸入密碼，輸入將要設置的密碼，注意此密碼是vnc的密碼，與賬戶密碼無關（建議設置與賬戶相同的密碼），注意輸入密碼時沒有顯示。用vncserver list查看分配到的vnc號，如下記住 :1然后打開VNC viewer工具輸入ip地址56加“:1”的格式來登陸vnc圖形。提示輸入VNC密碼，打開用戶桌面若VNC號有兩個及以上，或VNC連接不上，或登錄錯誤，需要殺掉VNC號，用kill命令，例如殺掉“:1”然后，再起VNC，輸入vncserver回車，再輸入vncserver list 回車，查看重新分配的VNC號，注意只能存在1個VNC號。備注：

4、vnc更改密碼，輸入vncpasswd，按提示輸入兩次密碼即可。二、軟件計算由于集群資源很少，除去管理節(jié)點不參與計算外，就剩余4個計算節(jié)點，而軟件和用戶相對校多，所以不建議跨節(jié)點跑作業(yè)，即每個作業(yè)使用核數不要超過16核。在要跑軟件之前，先登陸到計算節(jié)點上用top命令查看目前是否有程序在運行。在用戶桌面，單擊右鍵，選擇Open in Terminal例如在cu01上投算作業(yè)，輸入ssh X cu01，回車，轉到cu01節(jié)點 輸入top回車，再按“1”查看cu01節(jié)點CPU使用情況若是0代表目前該核心空閑，可以運算作業(yè)。100代表cpu核心滿負荷運算。若某個節(jié)點16個CPU負荷已很高，換至其余空閑

5、節(jié)點運算作業(yè)。建議一個計算節(jié)點核心數最多使用15核。按“Q”鍵返回，輸入fluent 即可打開FLUENT 14.0軟件同理，輸入matlab、comsol、abq6101 cae即可打開MATLAB R2009b、COMSOL 4.3、ABAQUS 6.10軟件。三、退出linux系統(tǒng)（1）若軟件正在運行，需要臨時退出Linux系統(tǒng)，點擊用戶桌面右上角的“×”，關閉VNC，在Xshell中連續(xù)輸入exit命令關閉Xshell，這樣即使退出Linux系統(tǒng)，軟件仍在計算。（2）若軟件計算完成或沒有計算，在terminal中連續(xù)輸入exit命令退出，點擊用戶桌面右上角的“×”，關閉VNC，再在Xshell中連續(xù)輸入exit命令退出Xshell。注意：（1）投算作業(yè)需先登錄管理節(jié)點mu01，再轉到計算節(jié)點cu01cu04（2）mu01為管理節(jié)點，僅有1顆C