液體活檢專家共識ppt課件.ppt

液體活檢的專家共識 軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院附屬醫(yī)院秦海峰 1 Content 2 Content 3 原癌基因 proto oncogene 癌基因活化 oncogene 基因變異類別 抑癌基因 tumorsuppressorgene TSG 功能缺失 活化 失活 基因突變擴(kuò)增或缺失易位融合表觀遺傳修飾 其他基因Modifyinggene 調(diào)節(jié)功能異常 表達(dá)異常 4 分子標(biāo)志物種類及其對應(yīng)的檢測方法 Bio specimen variationDNA mutation translocation CNV MSIDeletionRNA SinglegeneexpressionGeneexpressionprofileProteinSingleproteinProteinprofilingEpigenetic Methylationpattern TechnologyDNASequencing RT PCRqPCR aCGHFISH CISHRNAqRT PCRMicroarraytechniquesTaqMan geneexpressionarrayProteinIHC ELISA massspectrometryEpigeneticMS PCR bisulphate PCR sequencingMethylationmicorarray NGS 目前NGS檢測變異類型 SNV Indels Rearrangement fusion CNV及少數(shù)表觀變異 5 二代測序 NGS 技術(shù)應(yīng)用于臨床腫瘤精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)診斷的共識 第一版2016 04 23 中國腫瘤驅(qū)動基因分析聯(lián)盟 CAGC 中國臨床腫瘤學(xué)會 CSCO 6 國內(nèi)共識推薦NGS用于臨床檢測 首先我們非常清楚液體活檢和NGS的哪些部分可以應(yīng)用到臨床 如小的PANEL可用于現(xiàn)在市場上CFDA已經(jīng)批準(zhǔn)的藥物的檢測 這些可以應(yīng)用到臨床 2016年3月5日第十三屆中國肺癌高峰論壇吳一龍 共識 檢測已知的 多個(gè)平行臨床可藥物抑制的靶點(diǎn) 液體活檢技術(shù)推薦NGS方法共識 用于發(fā)現(xiàn)未知基因 探索療效監(jiān)測 預(yù)后判斷和發(fā)現(xiàn)耐藥機(jī)制等 液體活檢技術(shù)建議使用NGS方法 2016年3月5日第十三屆中國肺癌高峰論壇 7 共識中包括的9個(gè)內(nèi)容 36項(xiàng)聲明 8 Content 9 西方 2013ASCO 東方 370例中國肺腺癌 肺癌中已發(fā)現(xiàn)的驅(qū)動基因及頻率 關(guān)注denovoUnkown 關(guān)注耐藥后的變異 10 肺癌中已發(fā)現(xiàn)的驅(qū)動基因及頻率 原發(fā)灶和轉(zhuǎn)移灶的基因突變異質(zhì)性 空間分布差異性 同一瘤灶內(nèi)基因突變異質(zhì)性 治療前后基因突變異質(zhì)性 時(shí)間分布差異性 11 肺癌瘤內(nèi)異質(zhì)性實(shí)例 腫瘤細(xì)胞之間存在較強(qiáng)的分子異質(zhì)性 CancerGenomeLandscapes Science NewYork NY 2013 339 6127 1546 1558 12 Content 13 ASingleDominantMechanismofAcquiredResistancetoRociletinibisnotReadilyIdentifiable PresentedByLeciaSequistat2015ASCOAnnualMeeting 耐藥機(jī)制的精準(zhǔn)分析 14 15AZD9291treatedpts6casesofC797Smutations 40 Oxnard etal Natmed 2015 耐藥機(jī)制的精準(zhǔn)分析 15 耐藥機(jī)制的精準(zhǔn)分析 AcquiredresistancetoRociletinib12Ptswith13T790M samples 7samplesretainedT790M 3EGFRamp 6sampleslossofT790M 2conversiontoSCLC 2015ASCO 20cases FGFR3mut METamp AcquiredresistancetoAZD929115plasmaDNAsamplesfrom15pts6 15C797S E19del T790M5 15E19del T790M4 15E19delHER2ampBRAFmutNRASmutMETamp EGFR independent PresentedByChristineLovlyat2015ASCOAnnualMeeting 16 耐藥機(jī)制的精準(zhǔn)分析 CirculatingtumourDNAprofilingrevealsheterogeneityofEGFRinhibitorresistancemechanismsinlungcancerpatients PresentedByJacobJ Chabonat2016ASCOAnnualMeeting 17 耐藥機(jī)制的精準(zhǔn)分析 18 耐藥機(jī)制的精準(zhǔn)分析 19 EGFRmutT790MC797SL798I Oxnard etal Natmed 2015 ASCO2015 Lin NatGenet 2015 AliceShaw NEJM2015 TKI ALKfusion ALKC1156Y ALKL1198F C1156Y Bypass Bypass Bypass Bypass TKI TKI TKI TKI TKI 耐藥機(jī)制的精準(zhǔn)分析 20 Content 21 75 40 Liquidbiopsy bloodsamplingfortestingsasdoneinbiopsiedtissuesamples Circulatingmarkers DNACirculatingtumorcells CTCs ExosomeProteinsRNAPlateletsImmunecells TCRrepertoire LiquidBiopsyandCirculatingBiomarkers 22 AMNewman etal NatMed 2014 CAPP Seq targets521exonsand13intronsfrom139recurrentlymutatedgenes intotalcovering 125kb 0 004 ofthehumangenome 17NSCLCpts5000Xcoverage ctDNA超敏感深部測序 發(fā)現(xiàn)臨床藥物靶點(diǎn) 23 約3 4ALK融合為經(jīng)典的EML4 ALK融合 但有1 4為與其他基因的融合 包括 STRN ALKCATSPERB ALKACVR1 ALKCLIP1 ALKDPH6 AS1 ALKKIF5B ALKRP11 320M2 1 ALKUGP2 ALK 燃石血檢 10000Xcoverage ctDNA超敏感深部測序 發(fā)現(xiàn)臨床藥物靶點(diǎn) BurningRockDx內(nèi)部數(shù)據(jù)請勿拍照 24 AaronMNewmanetal NatMed 2014 突變譜動態(tài)變化反映實(shí)時(shí)腫瘤負(fù)荷大小基于NGS的ctDNA動態(tài)監(jiān)測可實(shí)現(xiàn)定性與定量有機(jī)結(jié)合 準(zhǔn)確反映腫瘤時(shí)空異質(zhì)性 液體活檢帶來的動態(tài)監(jiān)控 25 Zofia etal JournalofThoracic March2016 液體活檢帶來的動態(tài)監(jiān)控 female aged60lungadenocarcinomawithbonemetastases 26 4 2 6 3 6 30 7 27 8 17 T790M出現(xiàn) ALK融合消失 C797S出現(xiàn) 1stgenEGFR TKI 3rdgenEGFR TKI LiverPD 1stgenALK TKI 3rdgenEGFR TKI 2stgenALK TKI 3rdgenEGFR TKI PR LiverPD LiverPR OtherPD TP53 EGFR19del ALKfusion EGFRT790M 液體活檢帶來的動態(tài)監(jiān)控 27 結(jié)合隨訪 動態(tài)監(jiān)測 新方向 國際最前沿 COMPASS ctDNAOminibusMutationsPredictiveAssociation 是燃石醫(yī)學(xué)使用其朗清NGS產(chǎn)品檢測晚期NSCLC病人ctDNA從而進(jìn)行疾病隨訪以及支持治療決策的一個(gè)診斷行動 燃石醫(yī)學(xué)血液檢測產(chǎn)品的敏感性 特異性在前處理合適的情況下已達(dá)到國際領(lǐng)先水平是COMPASS行動開展的技術(shù)基礎(chǔ) 液體活檢帶來的動態(tài)監(jiān)控 28 晚期NSCLC 驅(qū)動基因異常 臨床隨訪信息 B和IV期的NSCLC初治復(fù)治均可鱗癌 腺癌均可 身體狀況和器官功能允許開展下一步抗腫瘤全身治療尤其是靶向治療已知具有至少一個(gè)明確的異常驅(qū)動基因 患者配合臨床隨訪以及必要的治療可以提供研究所需要收集的臨床資料 液體活檢帶來的動態(tài)監(jiān)控 目標(biāo)人群 29 具有下列至少一個(gè)明確的基因異常EGFR 18 21號外顯子COSMIC或TCGA收錄的所有突變ALK 19內(nèi)含子發(fā)生的任何重排融合ROS1 31 34號內(nèi)含子發(fā)生的任何重排融合RET 11號內(nèi)含子發(fā)生的任何重排融合MET