PubMed-張政寶.ppt

PubMed 南方醫(yī)科大學(xué)醫(yī)學(xué)情報(bào)學(xué)教研室張政寶Tel 020 61648054E mail newinfoman PubMed簡(jiǎn)介認(rèn)識(shí)PubMed文獻(xiàn)PubMed檢索特點(diǎn)PubMed檢索功能 重點(diǎn) PubMed特征欄功能介紹 重點(diǎn) PubMed檢索結(jié)果的處理PubMed主題詞檢索 重點(diǎn) MyNCBI個(gè)性化服務(wù) 一 PubMed簡(jiǎn)介 概況 網(wǎng)址 http www ncbi nlm nih gov pubmed或http www ncbi nih gov pubmed或http pubmed gov com org net 由美國(guó)國(guó)立醫(yī)學(xué)圖書(shū)館 NationalLibraryofMedicine NLM 國(guó)家生物技術(shù)信息中心 NationalCenterforBiotechnologyInformation NCBI 向因特網(wǎng)用戶(hù)提供免費(fèi)MEDLINE檢索服務(wù) 1997 6 26 收錄70余個(gè)國(guó)家4900多種生物醫(yī)學(xué)期刊的題錄與文摘 是世界上最權(quán)威的醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)現(xiàn)有1950年以來(lái)的1650多萬(wàn)篇文獻(xiàn)的記錄 其中MEDLINE記錄1400多萬(wàn)條 目前每年增加60余萬(wàn)條文獻(xiàn)記錄在全部記錄中有76 的文獻(xiàn)為英文 在2000年以來(lái)的記錄中90 的文獻(xiàn)為英文 收錄中文刊60余種 概況 的外部鏈接功能 提供NCBI開(kāi)發(fā)的分子生物學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)的鏈接 如Nucleotide Protein Genome OMIN Structure Taxonomy等 提供美國(guó)國(guó)立醫(yī)學(xué)圖書(shū)館多種資源的鏈接提供相關(guān)文獻(xiàn) RELATEDARTICLES 的鏈接提供其它外部資源的鏈接 如生物醫(yī)學(xué)期刊網(wǎng)站全文鏈接 NCBI資源 外部鏈接 二 認(rèn)識(shí)PubMed文獻(xiàn) 作者AU 題名TI 來(lái)源SO PubMed中文獻(xiàn)的類(lèi)型 狀態(tài) 數(shù)據(jù)類(lèi)型 狀態(tài) PubMed除了1966年以前的OldMedline 其余文獻(xiàn)按處理過(guò)程分4種類(lèi)型 或狀態(tài) 摘要和免費(fèi)全文鏈接圖標(biāo) 在題錄 Summary 顯示格式下 分別以如下圖標(biāo)表示該記錄是否有摘要或是否可免費(fèi)獲得全文 并提供相應(yīng)的鏈接 三 PubMed檢索特點(diǎn) 檢索特點(diǎn) 檢索運(yùn)算符AND NOT OR必須大寫(xiě) vitamincORzinc ANDcommoncold支持截詞檢索 但對(duì)詞組無(wú)效 如bacter 可以檢出以bacter為詞干的單詞bacteria bacterium等最多600個(gè)單詞 截詞檢索時(shí) 系統(tǒng)的自動(dòng)詞語(yǔ)匹配功能和MeSH自動(dòng)擴(kuò)展功能將不再被執(zhí)行 如 heartattack 將不映射到MeSH詞MyocardialInfarction 檢索特點(diǎn) 強(qiáng)制檢索 雙引號(hào) 或限定字段 endocrinedisruption endocrinedisruption注意 所有的 都必須是英文狀態(tài)下輸入 常用字段 Affiliation AD Author AU 姚開(kāi)泰 yaokaitai yaokt yaokaitai yaok tanj au 與 tanj au 不同Language LA chinese la 或chi la 前3個(gè)字母 MeSHSubheadings SH 自動(dòng)擴(kuò)展下位副主題詞 如需關(guān)閉該功能 使用 sh noexp MeSHTerms MH 自動(dòng)擴(kuò)展下位主題詞 如需關(guān)閉該功能 使用 mh noexp 常用字段 PublicationDate DP 1998 03 dp 1998 dp 1996 1998 dp 1998 01 1998 04 dp PublicationType PT review pt Title TI TextWords TW 包括Title Abstract MeSHTerms MeSHSubheadings ChemicalSubstanceNames PersonalNameasSubject等字段Title Abstract TIAB 四 PubMed檢索功能 檢索 1 自由詞智能檢索在檢索框中鍵入一到多個(gè)單詞 如鍵入 vitamincANDcommoncoldhepatitisbAND diagnosisORtherapy 檢索詞可出現(xiàn)于PubMed各記錄中的標(biāo)題 摘要等全部字段 檢索 2 作者姓名書(shū)寫(xiě)格式西方人姓名書(shū)寫(xiě)格式 Firstname MiddleName Lastname 美國(guó)肯尼迪總統(tǒng)名為 JohnFrankKenedy Kenedy為L(zhǎng)astname 姓 Frank為Middlename 比較少看到 多看到JohnF Kenedy 中間名縮寫(xiě)了 如果看到姓名中間有逗號(hào) 則逗號(hào)前一定是姓 如 Kenedy JohnF 檢索 2 作者姓名書(shū)寫(xiě)格式中國(guó)人姓名格式 Lastname Firstname 如 鐘世鎮(zhèn) 就有如下拼寫(xiě)形式可供檢索 Shi zhenZhong ShizhenZhongZhongshi zhen Zhong shizhenZhong shi zhen zhongszShizhenZhong zhongshizhen zhongs 檢索 3 期刊檢索檢索時(shí)可輸入期刊全名 如 molecularbiologyofthecell 系統(tǒng)自動(dòng)轉(zhuǎn)換為 molbiolcell JournalName 也可輸入期刊標(biāo)準(zhǔn)縮寫(xiě)形式 如 molbiolcell 或期刊的ISSN 國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)出版物編號(hào) 如 1059 1524 如果期刊名是一個(gè)單詞或恰好是MeSH詞表中的詞 如GeneTherapy Science Cell等 則必須在刊名后加 ta 期刊名稱(chēng)字段標(biāo)識(shí)符 檢索 3 期刊檢索如果雜志全名中包括括弧或方括號(hào) 鍵入時(shí)應(yīng)該予以取消 例如雜志名為 JHandSurg Am 檢索時(shí)應(yīng)轉(zhuǎn)成 JHandSurgAm 中文期刊 用漢語(yǔ)拼音 NanfangyikedaxuexuebaoBeijingdaxuexuebaoZhonghuaneikexuezazhi 五 PubMed特征欄功能介紹 一 Limits限定檢索 作者 Author 系統(tǒng)有提示期刊 Journal 全文 FullText或FreeFullText 日期 Dates 人類(lèi)或動(dòng)物研究 HumansorAnimals 文獻(xiàn)類(lèi)型 TypeofArticle 性別 Gender 語(yǔ)種 Languages 年齡 Ages 文獻(xiàn)子集限定 Subsets 自由詞可以結(jié)合以上各種限定進(jìn)行 限定檢索窗口全貌 添加作者檢索 添加期刊檢索 限定記錄有全文 免費(fèi)全文或摘要 限定記錄有全文 免費(fèi)全文或摘要 文獻(xiàn)發(fā)表時(shí)間限定 記錄添加到PubMed時(shí)間限定 人類(lèi)與動(dòng)物限定 性別限定 文獻(xiàn)語(yǔ)種限定 文獻(xiàn)子集限定 文獻(xiàn)類(lèi)型限定 研究對(duì)象年齡組限定 檢索字段限定 檢索舉例 姚開(kāi)泰院士2001年以前發(fā)表的有關(guān)鼻咽癌 nasopharyngealcancer 方面的文獻(xiàn)姚開(kāi)泰 2001年以前 nasopharyngealcancer yaokaitaiYaokaitaiYaoktYaok 如果僅檢索某個(gè)人的文獻(xiàn) 最好是這幾種形式都用上 如果還有其他檢索條件 最好 Yaok 的形式也用上 注意 一次Limits檢索結(jié)束后 將前面的 取消 二 Preview Index功能介紹 Preview Index只顯示最近的三次檢索史 而用History按鈕可以查看最近100次的檢索史 三 History功能介紹 各檢索式之間可以進(jìn)行邏輯組配 特征欄功能介紹 Clipboard 四 Clipboard功能介紹 將每次滿(mǎn)意的檢索結(jié)果暫時(shí)保存至此最后集中處理 下載存盤(pán)或發(fā)E mail 最多500條記錄 斷開(kāi)連接后保存8小時(shí) Details 顯示計(jì)算機(jī)響應(yīng)的本次檢索式 點(diǎn)擊 URL 五 Details功能介紹 http www ncbi nlm nih gov entrez query fcgi cmd PureSearch db pubmed details term effect 5BAll 20Fields 5D 20AND 20 28 28 22magnetic 20resonance 20imaging 22 5BTIAB 5D 20NOT 20Medline 5BSB 5D 29 20OR 20 22magnetic 20resonance 20imaging 22 5BMeSH 20Terms 5D 20OR 20MRI 5BText 20Word 5D 29 20AND 20Review 5Bptyp 5D 20AND 20 222005 02 13 2000 01 22 5BEDAT 5D 20 3A 20 222005 03 15 2000 01 22 5BEDAT 5D 保存該檢索式至收藏夾 六 PubMed檢索結(jié)果的處理 檢索結(jié)果的處理 顯示格式結(jié)果排序文本顯示保存 最多10000篇 打印發(fā)送至Email訂購(gòu)原文 題錄格式 作者 題名 出處 Sendto text Sendto Files Sendto Email 檢索練習(xí) 1 1985年以來(lái)第一軍醫(yī)大學(xué)鐘世鎮(zhèn)院士發(fā)表的論文 FirstMilitaryMedicalUniversity ZhongShiZhen ZhongShizhen 2 最近半年有關(guān)兒童白血病治療方面的英文文獻(xiàn) child children leukemia therapy 3 1998年以來(lái)有關(guān)80歲以上老人膽石癥診斷方面的文獻(xiàn) cholelithiasis diagnosis 七 PubMed主題詞檢索 MeSH MedicalSubjectHeadings 見(jiàn)教材P18 23記錄中的醫(yī)學(xué)主題詞 MeSH 是由標(biāo)引員為PubMed中的Medline文獻(xiàn)所人工指定的詞ascorbicacid是MeSHTerms 而vitaminc則不是標(biāo)引員使用能恰當(dāng)描述文章內(nèi)容的最相關(guān)MeSH詞 通常一篇文章可有多個(gè)MeSH詞 PubMed能自動(dòng)地為輸入的檢索詞尋找相應(yīng)的MeSH詞用戶(hù)利用一個(gè)MeSH詞能找出所有有關(guān)該主題的文獻(xiàn) MeSH詞獨(dú)有特征 主要MeSH詞 MAJORTOPIC MeSHtermasmainsubjectofthearticle 次要MeSH詞擴(kuò)展 EXPLODE chosenMeSHtermandallmorespecificunderlyingMeSHterms副主題詞 SUBHEADINGS 主題詞等級(jí)排列 檢索時(shí)可以將其下位詞的文獻(xiàn)都檢索出來(lái) 一個(gè)主題詞可以處在不同的類(lèi)目下 SubHeadings副主題詞 對(duì)一個(gè)主題詞的多個(gè)方面進(jìn)行修飾限定的詞 又稱(chēng)限定詞 例如 hepatitisb這個(gè)主題詞涉及到的病因 病理 診斷 治療 放射照相術(shù) 微生物學(xué)等多個(gè)方面 目前有83個(gè)副主題詞并非每個(gè)主題詞都能和83個(gè)副主題詞組配 SubHeadings副主題詞 MeSH詞優(yōu)點(diǎn) 不同拼寫(xiě) paediatric pediatric同義詞 tumor tumour cancer neoplasm 進(jìn)入主題詞檢索界面 兩個(gè)途徑 糖尿病 Diabetes 的治療 therapy 方面的文獻(xiàn) 自由詞檢索的結(jié)果 第一步 輸入檢索詞 糖尿病 Diabetes 的治療 therapy 方面的文獻(xiàn) 主題詞檢索開(kāi)始 第二步 確定主題詞 第三步 確定副主題詞 第四步 檢索 檢索結(jié)束 如果想更準(zhǔn)確 如果第二個(gè)概念無(wú)法作為第一個(gè)概念的副主題詞 糖尿病的心理治療 mentalhealing 方面的文獻(xiàn) 盡量尋找與第二個(gè)概念相關(guān)的第一個(gè)概念的副主題詞 如果找不到 就將此處選擇上 此時(shí) 此處輸入第二個(gè)概念 如果匹配的主題詞只有一個(gè) 就自動(dòng)轉(zhuǎn)到副主題詞界面 沒(méi)有合適的副主題詞 選擇此處 檢索 阿司匹林 aspirin 引起胃潰瘍 stomachulcer 的文獻(xiàn) 檢索 阿司匹林引起胃潰瘍的文獻(xiàn) 點(diǎn)擊 MeshBrowser 進(jìn)入MeSH瀏覽器的首頁(yè)在提問(wèn)框中輸入aspirin 點(diǎn)擊 Go 按鈕 顯示該主題詞的定義及其在詞表中的位置 點(diǎn)擊正確的相應(yīng)主題詞可做如下3種選擇 選擇副主題詞adverseeffects RestrictSearchtoMajorTopicheadingsonly DoNotExplodethisterm 選擇sendto searchboxwithAND輸入第二個(gè)檢索詞stomachulcer 點(diǎn)擊 Go 點(diǎn)擊主題詞 stomachulcer 選 SH為chemicalinduced選擇sendto searchboxwithAND點(diǎn)擊 PubMedSearch 按鈕備注 如果鍵入的詞不規(guī)范 MeSH瀏覽器將提示該詞不是主題詞 并顯示與之相對(duì)應(yīng)的MeSH詞 ClinicalQueries 該功能項(xiàng)具備特殊的過(guò)濾器裝置 可將檢索結(jié)果只限定在有關(guān)疾病的病因 診斷 預(yù)后 治療 臨床預(yù)處理等方面 有助于臨床醫(yī)生更有效地利用Medline數(shù)據(jù)庫(kù) ClinicalQueries 八 MyNCBI個(gè)性化服務(wù) MyNCBI 存儲(chǔ)檢索式 定期發(fā)送最新相關(guān)文獻(xiàn) 設(shè)定檢索過(guò)濾器 使檢索結(jié)果更加個(gè)性化 存儲(chǔ)檢索結(jié)果文獻(xiàn) 1 存儲(chǔ)檢