作業(yè)提交系統Torque個人安裝總結.doc

作業(yè)提交系統Torque個人安裝總結(PBS)管理提醒： 本帖被 大漠農民 執(zhí)行置頂操作(2009-01-08) PBS是功能最為齊全，歷史最悠久，支持最廣泛的本地集群調度器之一。 PBS的目前包括openPBS，PBS Pro和Torque三個主要分支。 其中OpenPBS是最早的PBS系統，目前已經沒有太多后續(xù)開發(fā)，PBS pro是PBS的商業(yè)版本，功能最為豐富。Torque是Clustering公司接過了OpenPBS，并給與后續(xù)支持的一個開源版本。 下面是本人安裝torque的過程。 一、Torque安裝 在master（管理結點上） 1、解壓安裝包 rootmaster tmp# tar zxvf torque-2.3.0.tar.gz 2、進入到解壓后的文件夾 ./configure -with-default-server=master make make install 3、 （1）rootmaster torque-2.3.0#./torque.setup 必須是個普通用戶 （2）rootmaster torque-2.3.0#make packages 把產生的 tpackages , torque-package-clients-linux-x86-64.sh, torque-package-mom-linux-x86-64.sh 拷貝到所有節(jié)點。 （3）rootmaster torque-2.3.0# ./torque-package-clients-linux-x86_64.sh -install rootmaster torque-2.3.0# ./torque-package-mom-linux-x86_64.sh -install （4）編輯/var/spool/torque/server_priv/nodes （需要自己建立） 加入如下內容 masternp=4 node01 np=4 . node09 np=4 （5）啟動pbs_server,pbs_sched,pbs_mom,并把其寫到/etc/rc.local里使其能開機自啟動。 （6）創(chuàng)建隊列 rootmaster # qmgr create queue students set queue students queue_type = Execution set queue students Priority = 40 set queue students resources_max.cput = 96:00:00 set queue students resources_min.cput = 00:00:01 set queue students resources_default.cput = 96:00:00 set queue students enabled = True set queue students started = True 4、在node0x （x=1-9,計算結點上） rootnode0x torque-2.3.0# ./torque-package-clients-linux-x86_64.sh -install rootnode0x torque-2.3.0# ./torque-package-mom-linux-x86_64.sh -install 然后啟動pbs_mom ,把pbs_mom寫入/etc/rc.local 二、Torque PBS使用 1、創(chuàng)建用戶 在master的root下 useradd test passwd test 輸入test密碼 到/var/yp下make一下 2、配置普通用戶的ssh su test cd ssh-keygen -t dsa cd .ssh cat id_pub.dsa authorized_keys chmod 600 authorized_keys 3、編寫作業(yè)腳本 test1master tvi pbsjob #!/bin/tcsh #PBS -o /home/test1/pbstest/t/output 標準輸出文件 #PBS -e /home/test1/pbstest/t/error 錯誤輸出文件 #PBS -l nodes=5:ppn=4 規(guī)定使用的節(jié)點數以及每個節(jié)點能跑多少核 #PBS q students 把任務提交到students隊列中 cd $PBS_O_WORKDIR 到工作目錄下（此為PBS提供的環(huán)境變量） mpirun machine $PBS_NODEFILE -np 20 ./vasp 4、啟動mpd mpdboot -n 10 -f mfa mfa內容： master:4 node01:4 . node09:4 5、提交，查詢，刪除作業(yè) 提交作業(yè)：qsub pbsjob 作業(yè)提交后會有一個作業(yè)號 test1master pbstest$ qsub pbsjob 48.master 查詢作業(yè)：qstat test1master pbstest$ qstat Job id Name User