利用BP數(shù)據(jù)庫有效挖掘生命科學(xué)信息.ppt

綜合性生命科學(xué)信息數(shù)據(jù)庫 BIOSIS Previews 在科學(xué)研究中的作用與價值,張 輝 湯森路透科技與醫(yī)療集團(tuán),BIOSIS Previews 生物學(xué)家不可缺少的科研工具 如何快速檢索宏觀課題：水產(chǎn)養(yǎng)殖、中國林業(yè)？ 如何精準(zhǔn)檢索某類生物體的相關(guān)文獻(xiàn)：薔薇科植物殺蟲劑？ 如何多角度分析課題研究趨勢把握全局？ 如何參考本課題相關(guān)的儀器方法文獻(xiàn)？ 如何對課題進(jìn)行新進(jìn)展跟蹤：定題跟蹤服務(wù)？ 問題解答,提 綱,生命科學(xué)和生物醫(yī)學(xué)研究領(lǐng)域的綜合資源，來源于期刊、會議、專利和書籍。 覆蓋來自生命科學(xué)領(lǐng)域的近6000種期刊、1500多個國際會議，以及與生命科學(xué)研究相關(guān)的美國專利 由原美國生物學(xué)文摘生命科學(xué)信息服務(wù)社（現(xiàn)隸屬于Thomson Scientific）編輯出版 Biological Abstracts與Biological Abstracts/RRM (Reports, Reviews, Meetings)整合在一起的互聯(lián)網(wǎng)版本 內(nèi)容來源于90多個國家，涵蓋了自1926年以來的近1800萬條記錄，數(shù)據(jù)每周更新，每周更新條目1萬多條，每年增錄560,000多條記錄。,BIOSIS Previews簡介,BIOSIS Previews學(xué)科范圍,傳統(tǒng)生物學(xué)： 如：分子生物學(xué)、植物學(xué)、生態(tài)與環(huán)境科學(xué)、微生物學(xué)、醫(yī)學(xué)、藥理學(xué)、動物學(xué) 交叉學(xué)科： 如：農(nóng)業(yè)、生物化學(xué)、生物醫(yī)學(xué)、生物技術(shù)、實驗醫(yī)學(xué)、臨床醫(yī)學(xué)、獸醫(yī)學(xué)、遺傳學(xué)、營養(yǎng)學(xué)、藥物學(xué)、公共衛(wèi)生 相關(guān)領(lǐng)域： 如：儀器、實驗方法等,BIOSIS Previews 傳統(tǒng)生物學(xué),應(yīng)用動物學(xué),生物醫(yī)學(xué),生物技術(shù),微生物學(xué),行為學(xué)與 生態(tài)科學(xué),淡水/海水水產(chǎn)業(yè) 動物控制 野生生物管理 昆蟲經(jīng)濟(jì)學(xué),人類流行病 獸類流行病 傳染病學(xué) 寄生蟲病學(xué) 生物制藥,生物化學(xué) 細(xì)胞生物學(xué) 分子遺傳學(xué) 生物物理學(xué),生物通訊 生物種群密度 環(huán)境污染與保護(hù),園藝學(xué) 森林學(xué) 土壤科學(xué),Proteomics、藥物反應(yīng)遺傳學(xué) 遺傳作物育種、信號傳導(dǎo)、納米技術(shù) Phytomedicine、Microarray Technology 生物信息學(xué)、基因治療,神經(jīng)科學(xué) 免疫學(xué) 生殖學(xué) 發(fā)育學(xué) 營養(yǎng)學(xué),細(xì)菌學(xué) 病毒學(xué),生理學(xué),農(nóng)業(yè)與植物學(xué),分子生物學(xué),ISI products are registered trademarks and service marks used under license,BIOSIS Previews: 關(guān)聯(lián)性標(biāo)引,BIOSIS 在文獻(xiàn)標(biāo)引過程中采用獨有的標(biāo)引方法 ，稱為關(guān)聯(lián)性標(biāo)引 (Relational Indexing) 其特色在于能夠標(biāo)引出每一個檢索字段和控制字匯之間的關(guān)聯(lián)性。這個標(biāo)引系統(tǒng)使研究人員能快速而準(zhǔn)確地找到數(shù)據(jù)。,關(guān)鍵詞,同義詞,描述詞,上級分類,關(guān)聯(lián)性標(biāo)引,Coronavirus,Positive Sense ssRNA Viruses,pathogen; strain-TOR2,Coronaviridae 03613,關(guān)聯(lián)性標(biāo)引 示例：Coronavirus 冠狀病毒,在BIOSIS Previews全記錄中有關(guān)Coronavirus的標(biāo)引,全記錄頁面關(guān)聯(lián)性標(biāo)引,檢索詞 turkey,？,？,根據(jù)詞語在上、下文中的明確含義，將關(guān)鍵詞提取并且分門別類歸入到如下大類：,BIOSIS Previews Relational Indexing （關(guān)聯(lián)性索引）,生物體 疾病名稱 化學(xué)物質(zhì) 基因名稱 序列 地理區(qū)劃 地質(zhì)年代 實驗方法與儀器 細(xì)胞器/器官/系統(tǒng) 其他,例2：Sudan 蘇丹紅（化學(xué)物質(zhì)概念） 蘇丹 （非洲國家/地理概念）,例1：Turkey 火雞（生物體概念） 土耳其（地理概念）,例3：Cancer 腫瘤（疾病概念） 甲殼類動物（生物體概念）,所有數(shù)據(jù)庫,主題 標(biāo)題 作者 出版物名稱 出版年 地址,個檢索字段主題 標(biāo)題 作者 出版物名稱 地址 出版年 分類數(shù)據(jù) 主概念 概念代碼 化學(xué)和生化名稱 會議信息 識別碼 語種 出版類型 文獻(xiàn)類型 分類注釋,檢索時段限制,幫助文檔隨時隨地查詢字段含義,BP中的檢索字段（常規(guī)檢索字段）,作者名：zhang jing,期刊名： Environmental Pollution,主題詞：aspirin same antithrombotic,例：查找有關(guān)阿斯匹林抗血栓形成的文獻(xiàn),地址：266003,常規(guī)字段的檢索,作者: 作者的檢索方式是姓在前，名或明的縮寫在后 出版物名稱: 可以用出版物全名，也可以用截詞符*，還可以從出版物列表中選擇。如果檢索一本書，可以通過主題和出版物兩種途徑檢索 地址：包括作者、編者、發(fā)明者地址。由于地址的多種寫法，可以使用截詞符“* ”以簡化檢索。常用的地址詞用截詞的方式表達(dá)，通常使用“SAME”算符連接同一地址中出現(xiàn)的多個地址詞,BP中的檢索字段（專業(yè)檢索字段）,BIOSIS Previews 生物學(xué)家不可缺少的科研工具 如何快速檢索宏觀課題：中國林業(yè)、水產(chǎn)養(yǎng)殖？ 如何精準(zhǔn)檢索某類生物體的相關(guān)文獻(xiàn)：薔薇科植物殺蟲劑？ 如何多角度分析課題研究趨勢把握全局？ 如何參考本課題相關(guān)的儀器方法文獻(xiàn)？ 如何對課題進(jìn)行新進(jìn)展跟蹤：定題跟蹤服務(wù)？ 問題解答,提 綱,主要概念,同BA相同，Biosis Previews有168個主要概念詞主要概念通過主題方式來類聚文獻(xiàn) 主要概念是涉及生命和生物科學(xué)領(lǐng)域的相關(guān)詞匯 點擊放大鏡圖標(biāo)可以瀏覽主概念的列表。列表中分為兩種格式：字順列表和按照概念的層級排列。通過拷貝粘貼將主概念檢索詞添加到檢索框中。檢索框中不同的檢索術(shù)語用邏輯算符“OR”連接。,例: 檢索有關(guān)中國林業(yè)和林學(xué)方面相關(guān)文獻(xiàn),China,主要概念,在輔助索引中輸入檢索詞forest*,例: 檢索有關(guān)中國林業(yè)和林學(xué)方面相關(guān)文獻(xiàn),檢索結(jié)果列表,例: 檢索水產(chǎn)養(yǎng)殖方面的相關(guān)研究,輸入檢索詞,主要概念,在輔助索引中輸入檢索詞aquacu*,舉例: 檢索有關(guān)水產(chǎn)養(yǎng)殖的相關(guān)研究,BIOSIS Previews 生物學(xué)家不可缺少的科研工具 如何快速檢索宏觀課題：中國林業(yè)、水產(chǎn)養(yǎng)殖？ 如何精準(zhǔn)檢索某類生物體的相關(guān)文獻(xiàn)：薔薇科植物殺蟲劑？ 如何多角度分析課題研究趨勢把握全局？ 如何參考本課題相關(guān)的儀器方法文獻(xiàn)？ 如何對課題進(jìn)行新進(jìn)展跟蹤：定題跟蹤服務(wù)？ 問題解答,提 綱,分類數(shù)據(jù)(上位生物分類生物系統(tǒng)名稱),采用自然主題分類法，按照生物界的自然分類系統(tǒng)分類。全部生物體按照類、門、綱、目、科、屬、種的順序排列。大類分為微生物、植物、古生物、動物，每大類分為四級類目（門、綱、目、科） 使用任一生物體的科以上類目，都可以查出與該生物相關(guān)的文獻(xiàn) 生物系統(tǒng)學(xué)代碼/名稱是一個五位的代碼，代表種級別以上的分類組。點擊list連接可以看到生物系統(tǒng)學(xué)代碼,概念代碼,概念代碼是一個五位數(shù)的編碼，代表生命科學(xué)中的廣泛的學(xué)科領(lǐng)域，每一個編碼對應(yīng)著一個學(xué)科名稱。點擊相應(yīng)的鏈接可以看到概念代碼和相應(yīng)的名稱。 概念代碼與名稱用于標(biāo)引自1993目前年的BIOSIS的紀(jì)錄。 共計571個五位的概念代碼代表了生命科學(xué)的大類。 檢索代碼和名稱結(jié)果相同。 一組相關(guān)的概念代碼放在上一級主題下。 例如：toxicology的概念代碼為22501-22508，可通過通配符*檢索225*而獲得。,例: 檢索有關(guān)薔薇科植物殺蟲劑的研究,輸入檢索詞,概念代碼,在輔助索引中輸入檢索詞Insectic*,例: 檢索有關(guān)薔薇科植物殺蟲劑的研究,輸入檢索詞,分類數(shù)據(jù),BIOSIS Previews關(guān)于薔薇科植物殺蟲劑的文獻(xiàn),BIOSIS Previews具有精煉和分析檢索結(jié)果功能,化學(xué)和生化名稱 可使用化合物基因名序列名或者化學(xué)物質(zhì)登記號進(jìn)行檢索,利用化合物基因名序列名或者化學(xué)物質(zhì)登記號進(jìn)行檢索,例: 檢索有關(guān)蘇丹紅的研究文獻(xiàn),Sudan red OR Sudan I,BIOSIS Previews 生物學(xué)家不可缺少的科研工具 如何快速檢索宏觀課題：中國林業(yè)？ 如何精準(zhǔn)檢索某類生物體的相關(guān)文獻(xiàn)：薔薇科植物殺蟲劑？ 如何多角度分析課題研究趨勢把握全局？ 如何參考本課題相關(guān)的儀器方法文獻(xiàn)？ 如何對課題進(jìn)行新進(jìn)展跟蹤：定題跟蹤服務(wù)？ 問題解答,提 綱,誰能讀這么多？ 誰需要讀這么多? 發(fā)現(xiàn)與創(chuàng)新是不是一個數(shù)字的游戲?,“首先必需認(rèn)識到，科研工作者都十分寶貴自己的時間，除極少數(shù)和自己工作關(guān)系十分密切的論文以外，絕大多數(shù)讀者都不會閱讀全文?！?- 鄒承魯 “我的科學(xué)之路”，2003年10月,為什么我們需要分析工具？,例: 檢索轉(zhuǎn)基因農(nóng)作物相關(guān)文獻(xiàn),主要概念,轉(zhuǎn)基因農(nóng)作物相關(guān)文獻(xiàn)列表,11個角度深入分析,出版年 概念代碼 主要概念 Super Taxa 語種 學(xué)科類別,來源出版物 文獻(xiàn)類型 出版物類型 作者 專利權(quán)人,文獻(xiàn)發(fā)表按年代分布（保存文件后Excel打開作圖）,發(fā)表文獻(xiàn)的主要類型,文獻(xiàn)涉及的主要學(xué)科類別,涉及的研究角度,研究主要涉及的生物體,發(fā)表文獻(xiàn)最多的作者,發(fā)表論文的首選出版物,BIOSIS Previews 生物學(xué)家不可缺少的科研工具 如何快速檢索宏觀課題：水產(chǎn)養(yǎng)殖、中國林業(yè)？ 如何精準(zhǔn)檢索某類生物體的相關(guān)文獻(xiàn)：薔薇科植物殺蟲劑？ 如何多角度分析課題研究趨勢把握全局？ 如何參考本課題相關(guān)的儀器方法文獻(xiàn)？ 如何對課題進(jìn)行新進(jìn)展跟蹤：定題跟蹤服務(wù)？ 問題解答,提 綱,高級檢索 舉例：檢索有關(guān)小龍蝦白斑病的文獻(xiàn) 在任意字段進(jìn)行自由檢索,TA=(Crayfish or crawdads)and host) and TA=(white spot* or wssv) and pathogen),檢索結(jié)果：有關(guān)小龍蝦白斑病的文獻(xiàn),TA=(Crayfish or crawdads)and host) and TA=(white spot* or wssv) and pathogen) and MQ=spectrophotometry,高級檢索 舉例：檢索有關(guān)小龍蝦白斑病的研究,并且在實驗中應(yīng)用了分光光度法的文獻(xiàn)，HQ字段進(jìn)行限制,BIOSIS Previews 生物學(xué)家不可缺少的科研工具 如何快速檢索宏觀課題：水產(chǎn)養(yǎng)殖、中國林業(yè)？ 如何精準(zhǔn)檢索某類生物體的相關(guān)文獻(xiàn)：薔薇科植物殺蟲劑？ 如何多角度分析課題研究趨勢把握全局？ 如何參考本課題相關(guān)的儀器方法文獻(xiàn)？ 如何對課題進(jìn)行新進(jìn)展跟蹤：定題跟蹤服務(wù)？ 問題解答,提 綱,免費注冊，登錄后可以使用個性化服務(wù),創(chuàng)建定題服務(wù),隨時跟蹤課題最新進(jìn)展,可以保存檢索歷史在服務(wù)器或本地計算機(jī)上 可以訂制定題服務(wù),定期檢索相關(guān)課題，并把最新結(jié)果發(fā)送到指定的郵箱中 有效期半年，到時間后可以續(xù)訂 支持RSS Feed,BIOSIS Previews 生物學(xué)家不可缺少的科研工具 如何快速檢索宏觀課題：水產(chǎn)養(yǎng)殖、中國林業(yè)？ 如何精準(zhǔn)檢索某類生物體的相關(guān)文獻(xiàn)：薔薇科植物殺蟲劑？ 如何多角度分析課題研究趨勢把握全局？ 如何參考本課題相關(guān)的儀器方法文獻(xiàn)？ 如何對課題進(jìn)行新進(jìn)展跟蹤：定題跟蹤服務(wù)？ 問題解答,提 綱,布爾邏輯算符,通配符,精確檢索,免費查詢某期刊當(dāng)前是否被SCI收錄 /,在線瀏覽錄音課程,科研評價系列課程Essential Science Indicators /bbs/dispbbs.asp?boardid=17&id=816&page=1&star=1 文獻(xiàn)管理系列課程（EndNote Web） /BBS/dispbbs.asp?boardid=5&Id=237 專業(yè)數(shù)據(jù)庫檢索系列課程（生命科學(xué)資源BIOSIS Previews） /BBS/dispbbs.asp?boardid=5&Id=242,科研人員的好幫手足不出戶，參加在線培訓(xùn) ,http