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年決明子行業(yè)技術(shù)分析:決明子治療肝炎推動(dòng)醫(yī)藥技術(shù)發(fā)展在現(xiàn)代醫(yī)學(xué)不斷探究高效治療方案的進(jìn)程中,非酒精性脂肪性肝炎(NASH)的治療難題始終備受關(guān)注。決明子作為傳統(tǒng)中藥材,在諸多疾病治療中呈現(xiàn)出獨(dú)特潛力。2025年,圍繞決明子的討論取得新進(jìn)展,科研人員借助網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)、分子對(duì)接和分子動(dòng)力學(xué)模擬等先進(jìn)技術(shù),深化探究其治療NASH的作用機(jī)制,為決明子在醫(yī)藥領(lǐng)域的應(yīng)用開(kāi)拓新方向。
一、決明子活性成分與靶點(diǎn)篩選
科研人員利用中藥系統(tǒng)藥理學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)與分析平臺(tái)(TCMSP),以口服生物利用度且“類藥性≥0.18”為篩選條件,從決明子中篩選出13個(gè)活性成分,包括1,7-二羥基-2,3,8-三甲氧基-6-甲基蒽-9,10-二酮、大黃酸、豆甾醇等。隨后,通過(guò)TCMSP數(shù)據(jù)庫(kù)和有機(jī)小分子生物活性數(shù)據(jù)庫(kù)(PubChem)獵取這些成分的SMILES信息,缺失部分借助紐普生物在線工具轉(zhuǎn)換。再利用SwissTargetPrediction數(shù)據(jù)庫(kù),以“Homosapiens”為檢索條件、“probability0”為篩選標(biāo)準(zhǔn),猜測(cè)潛在靶點(diǎn),經(jīng)去重后得到247個(gè)決明子活性成分潛在靶點(diǎn)蛋白。同時(shí),以“NASH”等為關(guān)鍵詞,在GeneCards、DisGeNET、OMIM和TTD等4個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)檢索NASH疾病相關(guān)靶點(diǎn),經(jīng)篩選、合并與去重,最終獲得2634個(gè)NASH相關(guān)靶點(diǎn)。將決明子靶點(diǎn)與NASH靶點(diǎn)錄入Venny2.1在線軟件繪制韋恩圖,確定102個(gè)交集靶點(diǎn),這些靶點(diǎn)成為決明子治療NASH的潛在靶點(diǎn)。
二、構(gòu)建決明子治療NASH的關(guān)系網(wǎng)絡(luò)與關(guān)鍵靶點(diǎn)篩選
《2025-2030年全球及中國(guó)決明子行業(yè)市場(chǎng)現(xiàn)狀調(diào)研及進(jìn)展前景分析報(bào)告》指出,將決明子活性成分及其作用于NASH的102個(gè)潛在靶點(diǎn)導(dǎo)入Cytoscape3.10.0軟件,構(gòu)建“決明子-成分-靶點(diǎn)-NASH”關(guān)系網(wǎng)絡(luò)圖。圖中綠色節(jié)點(diǎn)代表活性成分,藍(lán)色節(jié)點(diǎn)代表交集靶點(diǎn),通過(guò)節(jié)點(diǎn)間連線、大小和顏色推斷成分發(fā)揮作用的可能性,確定膽固醇、豆甾醇和大黃酸為決明子治療改善NASH的核心成分。將102個(gè)交集靶點(diǎn)輸入STRING數(shù)據(jù)庫(kù)構(gòu)建蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用(PPI)網(wǎng)絡(luò),再導(dǎo)入Cytoscape3.10.0軟件優(yōu)化分析。依據(jù)度值篩選出前10個(gè)關(guān)鍵靶點(diǎn),分別是表皮生長(zhǎng)因子受體(EGFR)、熱休克蛋白90α家族A類成員1(HSP90AA1)、基質(zhì)金屬蛋白酶-9(MMP9)等,這些關(guān)鍵靶點(diǎn)在決明子治療NASH過(guò)程中可能發(fā)揮重要作用。
三、決明子治療NASH的功能與通路富集分析
利用DAVID分析平臺(tái)對(duì)決明子與NASH的102個(gè)交集靶點(diǎn)進(jìn)行富集分析,并通過(guò)微生信平臺(tái)繪圖。GO功能富集分析得到402個(gè)條目(P0.05),在生物過(guò)程層面,前3種分別是磷酸化修飾、胞內(nèi)受體信號(hào)通路和細(xì)胞凋亡過(guò)程的負(fù)調(diào)控;細(xì)胞組分層面,前3種為高分子復(fù)合物、胞質(zhì)組分和細(xì)胞質(zhì)膜結(jié)合的囊泡;分子功能層面,前3種是RNA聚合酶Ⅱ轉(zhuǎn)錄因子活性、酶結(jié)合和蛋白酪氨酸激酶活性。這表明決明子治療NASH是多種生物過(guò)程、細(xì)胞組分及分子功能共同作用的結(jié)果。
KEGG富集分析篩選出123條信號(hào)通路(P0.05),決明子活性成分主要通過(guò)腫瘤相關(guān)通路、內(nèi)分泌反抗、受體激活、EGFR通路、非酒精性脂肪肝病相關(guān)通路、細(xì)胞凋亡和PI3K-Akt等通路發(fā)揮作用。關(guān)鍵靶點(diǎn)中,EGFR落在EGFR相關(guān)通路,BCL2與CASP3落在凋亡相關(guān)通路,PIK3CA、PIK3CB和PIK3CD落在PI3K-Akt信號(hào)通路,說(shuō)明決明子通過(guò)這些信號(hào)通路參加NASH治療。
四、決明子核心成分與關(guān)鍵靶點(diǎn)的分子對(duì)接驗(yàn)證及模擬
從PubChem數(shù)據(jù)庫(kù)下載決明子核心成分sdf文件,經(jīng)OpenBabel軟件轉(zhuǎn)化為mol2格式;從PDB數(shù)據(jù)庫(kù)下載關(guān)鍵靶基因編碼的受體蛋白晶體結(jié)構(gòu),用Pymol3.0.3軟件處理后保存為PDB格式。利用AutoDock4.2.6軟件完成分子對(duì)接,將結(jié)果轉(zhuǎn)化為PDB格式并通過(guò)Pymol3.0.3軟件可視化。將決明子有效成分度值前5的成分與PPI網(wǎng)絡(luò)中度值前5的靶蛋白對(duì)接,結(jié)果顯示,大黃酸、9,10-二羥基-7-甲氧基-3-亞甲基-4H-苯并[g]異色烯-1-酮和1,7-二羥基-2,3,8-三甲氧基-6-甲基蒽-9,10-二酮與靶蛋白EGFR親和力最強(qiáng),膽固醇和豆甾醇與HSP90AA1親和力最強(qiáng),驗(yàn)證了EGFR和HSP90AA1為關(guān)鍵靶蛋白。
針對(duì)大黃酸-EGFR復(fù)合物進(jìn)行分子動(dòng)力學(xué)模擬,采納Gromacs2022軟件、Amber99sb-ildn蛋白力場(chǎng)和GAFF小分子力場(chǎng),添加水和離子平衡體系后分析模擬軌跡。結(jié)果顯示,該復(fù)合物回轉(zhuǎn)半徑穩(wěn)定,均方根偏差在模擬后期趨于穩(wěn)定,表明體系達(dá)到平衡;EFGR部分殘基波動(dòng)顯著,大黃酸和EGFR可形成氫鍵,平均數(shù)量為1.85115±0.96996;結(jié)合自由能分析表明,疏水作用和靜電能利于結(jié)合,極性溶劑不利于結(jié)合,總自由能為(-19.4±6.81)kcal?mol?1,說(shuō)明大黃酸與EGFR能形成穩(wěn)定結(jié)合。
五、討論成果總結(jié)與展望
本討論通過(guò)網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)、分子對(duì)接和動(dòng)力學(xué)模擬等技術(shù),系統(tǒng)探究決明子治療NASH的作用機(jī)制。證明決明子具有多成分、多靶點(diǎn)、多通路治療NASH的特性,膽固醇、豆甾醇和大黃酸是核心成分,EGFR和HSP90AA1是潛在最佳靶點(diǎn)。決明子可通過(guò)腫瘤相關(guān)通路、胰島素反抗、EGFR通路、細(xì)胞凋亡和PI3K-Akt通路等多種途徑干預(yù)改善NASH,且大黃酸與EGFR能形成穩(wěn)定結(jié)合。然而,本討論主要基于生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)猜測(cè)和潛在分子機(jī)制分析,缺乏直接試驗(yàn)數(shù)據(jù)支撐。將來(lái),還需開(kāi)展更多臨床和基礎(chǔ)試驗(yàn),利用高通量測(cè)序及多種分子生物學(xué)手段,在體內(nèi)外水平進(jìn)一步驗(yàn)證決明子治療NASH的作用機(jī)制,為決明子在NASH治療領(lǐng)域的應(yīng)用供應(yīng)更堅(jiān)實(shí)的理論基礎(chǔ)和實(shí)踐依據(jù),推動(dòng)決明子相關(guān)醫(yī)藥討論的進(jìn)展。
更多決明子行業(yè)討論分析,詳見(jiàn)中國(guó)報(bào)告大廳《決明子行業(yè)報(bào)告匯總》。這里匯聚
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