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DB37DB37/T2038—2012牛尿苷酸合酶缺乏癥(DUMPS)分子檢測(cè)技術(shù)規(guī)程Technicalspecificationofdetectionfordeficiencyofuridinemonophophatesynthaseinbovine2012-02-09發(fā)布2012-03-01實(shí)施山東省質(zhì)量技術(shù)監(jiān)督局發(fā)布I1GB/T6682-2008分析實(shí)驗(yàn)室用NY/T1672-2008綿羊多胎主效基因FecB分子尿苷酸合酶缺乏癥deficiencyofuridinemonoph尿甘酸合酶缺乏癥是由于牛體內(nèi)尿苷酸合酶(UridineMonophophateSynthase,UMPS)基因的C-DNA:脫氧核糖核酸(deoxyribo2尿甘酸合酶缺乏癥是由于奶牛體內(nèi)尿苷酸合酶(UMPS)基因的C-末端405處的密碼子存在一個(gè)點(diǎn)突胚胎早期死亡。基于這個(gè)點(diǎn)突變?cè)O(shè)計(jì)引物對(duì)該區(qū)域進(jìn)行PCR擴(kuò)增以及RFLP分析,由于野生型與突變型個(gè)除另有規(guī)定,所用試劑均為分析純,水為符合GB/T6682-2008的雙蒸水下游引物:5'-GCTTCTAACTGAACTCCT3DB37/T2038—200.5μL,10pmol/μL的上、下游引物各0.5μL,TaqDNA聚合酶1U,DNA模板100ng,加雙蒸水至208.5.2PCR擴(kuò)增循環(huán)參數(shù)8.5.3PCR產(chǎn)物瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)再用1×TAE沖洗一次,水平放置。稱(chēng)取溶液澄清透明,室溫下冷卻至60℃左右時(shí),加入溴化乙錠并混勻,使其終濃度為0.5μg/mL,即得1%8.6RFLP分析8.6.1RFLP酶切體系10μL酶切體系:PCR產(chǎn)物1.0μL,限制性?xún)?nèi)切酶AVaI(10U/μL)0.3μL,10×Buffer1μL,超純水8.7μL,37℃水浴消化過(guò)夜。9.1PCR擴(kuò)增產(chǎn)物檢測(cè)擴(kuò)增產(chǎn)物大小為95bp,條帶清晰(見(jiàn)圖1),可進(jìn)行下一步檢測(cè)。圖1UMPS基因PCR擴(kuò)增結(jié)果(DL2000DNAMaker)4子(-/+),如圖2(另有21bp酶切片段由于片段較小,電泳中沒(méi)有顯示)。M-1--1--/+-1--1--/+-1-M-1--1--/+-1--1--/+-1-圖2酶切產(chǎn)物SDS電泳結(jié)果(50bpDNALander)5主要儀器設(shè)備A.2單道可調(diào)移液器:2μL,10μL,20μL,100μL,200μL,1000A.5恒溫振蕩器:0r/min~200r/min,0℃~60℃6稱(chēng)取SDS2g,加超純水18mL,加熱至68℃助溶,B.60.5mol/LEDTA(10mmol/LTris?Cl(pH8.0)、07﹪(B.1730﹪丙烯酰胺(49:1)丙烯酰胺147g和N,N′-亞甲雙丙烯酰胺3g溶解于400mL水中,將溶液加熱至37℃溶解,完全溶解后89C.7加入1mL75﹪的冰乙醇(-20℃)洗滌DNA沉淀2次,12000rpm、4℃離心3min。D.3加入等體積酚:氯仿:異戊醇(D.5取上清,加入2倍體積的無(wú)水乙醇(-20℃),沉淀DNA,12000rpm、4℃離心2min。D.6加入1ml75%的冰乙醇(-20℃)洗滌DNA2次。立即插入相應(yīng)的點(diǎn)樣梳,將膠板水平放置,室溫靜置20-60min以待
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