玩轉文獻檢索高效管理文獻（一）醫(yī)學信息檢索基礎知識

研究人員科研過程時間安排8%51%32%9%計劃和構思查閱文獻科學實驗撰寫論文美國科研基金會（NSF）醫(yī)學信息檢索基礎知識面對日益增長的文獻資源，如何通過一種有效的方法，以最少的時間與精力來獲取自己所需要的信息──這就是文獻檢索所要解決的問題。學習目標熟悉信息、知識、情報、文獻、醫(yī)學文獻的基本概念掌握文獻檢索相關知識、文獻檢索原理與檢索語言掌握文獻檢索途徑、步驟理解計算機檢索技術與方法熟悉檢索式的編寫與檢索策略的調整一、相關概念信息（information）自然界、人類社會、人類思維活動中事物存在與運動狀態(tài)的顯示。自然信息 生物信息 社會信息 機電信息湖光山色 鳥語花香 語言文字 光電訊號知識（knowledge）知識是人類對自然界、人類社會中各種現(xiàn)象、規(guī)律的信息反映進行思維分析，加工提煉，經(jīng)過系統(tǒng)化、理論化的結果。因此，系統(tǒng)化、理論化的信息就可以稱之為知識信息是知識的源泉和基礎，知識是信息的升華。情報（information）情報是人們在一定的時間內為一定的目的而傳遞的有使用價值的知識或信息。知識性傳遞性效用性文獻（document）文獻是指記錄有知識的一切載體，也就是說用文字、圖形、符號、視頻音頻等手段記錄下來的人類知識都可以稱之為文獻。三個要素：信息、知識、情報；載體；文字、圖形、視頻、音頻等。醫(yī)學文獻：記錄有醫(yī)學知識的一切載體信息情報文獻記錄認識激活知識獲取文獻類型(1)依文獻載體形式劃分類型印刷型：以紙張為存儲介質，印刷技術為記錄手段如書、刊、報紙等。（紙張型）視聽型：以磁性或感光材料為存儲介質，通過特殊的機械裝置記錄聲音或圖像信息。如：音像帶、幻燈片等。（磁帶型）縮微型：以感光材料為存儲介質，攝影技術為記錄手段。如縮微膠片等。（膠片型）機讀型：以磁性材料或光盤為存儲介質，以數(shù)字代碼或光學字符識別輸入為記錄手段，計算機處理產(chǎn)生。如：磁盤、光盤等。（2）按出版形態(tài)劃分圖書期刊科技報告、專利文獻、會議文獻、政府出版物、學位論文、標準文獻、技術檔案、產(chǎn)品資料等特種文獻(3)

依文獻被加工深度劃分級別一次文獻：即原始文獻，以作者本人的工作實踐或科研成果為依據(jù)創(chuàng)作的原始文獻。如期刊論文、科技報告、專著、技術標檢準索等對。象二次文獻：即檢索工具，是對大量分散無序的一次文獻的收集、

加工、整理而成的有序的、具有可檢索性的文獻。其主要類型有目錄、檢索工具索引和文摘等。三次文獻：是利用二次文獻，對大量一次文獻進行綜合分析與研究，加以濃縮和提煉而形成的文獻。如綜述、年鑒、百科全檢書索等對。象檢索工具零次文獻：是指未經(jīng)正式發(fā)表或記錄在非正規(guī)物質載體上的文獻形式。如書信、論文手稿、筆記、實驗記錄、會議記錄等。二、文獻檢索的相關知識1.文獻檢索原理檢索原理就是用戶的檢索標識與檢索工具中的文獻特征標識的比較匹配，兩者相符即為命中文獻。文獻檢索，狹義上說文獻檢索僅指檢索過程和技術。廣義上說包括文獻存儲和文獻檢索。采集文獻信息分析內容提取主題概念標引特征標識檢索系統(tǒng)輸出結果文獻信息需求分析需求提取主要概念轉換檢索標識匹配比較對比文獻存儲文獻檢索2.計算機檢索原理計算機檢索原理是字符串匹配，所謂字符串匹配即詞語形式的匹配，而非概念匹配。字符串匹配的原理只能檢出與檢索詞詞形相同的部分文獻，不能匹配同一概念不同詞形的全部文獻。如：輸入阿司匹林，只能查找出有關阿司匹林相關的文獻而不能匹配阿斯匹林、乙酰水楊酸、阿司匹靈等。3.檢索語言是用于描述檢索系統(tǒng)中文獻的內容特征及外表特征和表達用戶檢索提問的一種專門的標識系統(tǒng)。檢索語言是檢索者與檢索工具之間進行交流的標準，也是文獻存儲人員與檢索工具之間交流的標準。是溝通文獻存儲和文獻檢索的橋梁。檢索語言兩大范疇按文獻特征劃分：描述文獻外表特征的語言：描述文獻內容特征的語言：檢索語言著者書名引文出處語種序號主題語言分類語言主題詞關鍵詞文本詞（自由詞）分類號類目名稱主題語言是一種描述性語言，從主題概念角度，直接用詞語描述文獻內容特征，直接而專指。

常用的主題語言依據(jù)詞語規(guī)范程度的不同又分關鍵詞、文本詞（自由詞）和為主題詞。文本詞是從文獻題目、文摘或正文中提取出來的具有實質意義，能代表文獻主題內容的自然語言，沒有統(tǒng)一規(guī)范。不同作者按自己的用詞習慣和偏好自由使用，又稱自由詞，具有較大的靈活性和不確定性。概念與文本詞間不是一一對應關系，一個概念可能有多種表達方式，也就是常說的同義詞，所以檢索時必須考慮使用同義詞檢索。如：維生素Ｃ可以由維生素Ｃ、維他命Ｃ、Ｖｃ、抗壞血酸、Vit

C、維C等表示。優(yōu)點：易于掌握、標引簡易、檢索方便、靈活性高、詞匯更新及時，能準確檢索到許多新概念方面的文獻，專指性

強。缺點：自由詞是作者自己選定的，詞的形式不同，拼法不同，容易造成文獻分散在各不同文本詞中，不能集中，容易造成漏檢。自由詞是從文獻的標題、摘要甚至全文提取，并不一定反應文獻的主題內容，也容易造成誤檢。檢索時應提取具有實質意義的詞語作為檢索詞。輔助性、修飾性等沒有實質意義的詞不能做為檢索詞；冠詞、介詞、連詞、副詞、感嘆詞、動詞等均不做為檢索詞；使用頻率過高的詞亦不用作檢索詞。如：檢索高血壓治療方面的文獻可選擇的檢索詞：高血壓治療如：檢索在嚴重燒傷糖尿病患者治療中應用胰島素泵的文獻可選擇檢索詞：燒傷，糖尿病，胰島素泵如：乙肝病毒感染與肝細胞癌的相關研究可選擇檢索詞：乙肝病毒 肝細胞癌主題詞是經(jīng)過規(guī)范化處理的、表達文獻主題的檢索語言。對同一個概念的同義詞、近義詞、單復數(shù)及拼法變異等進行嚴格的規(guī)范。低分子肝素、低分子量肝素、LMWH等基因芯片、DNA芯片、寡核苷酸芯片、微陣列技術、微矩陣、寡核苷酸序列分析等阿司匹林、阿斯匹林、阿司匹靈、乙酰水楊酸等白介素2、白細胞介素2、IL2、IL-2缺點：不易掌握、標引難度大、詞匯更新不及時，無法及時反映新概念、新事物。優(yōu)點：可以檢索到分散在同一概念下各同義詞、近義詞、單復數(shù)及拼寫變異的文獻，提高查全率。檢索到的都是主要探討某一主題的文獻，提高查準率。西紅柿洋柿子番茄番茄作者原文提供自然語言專業(yè)人員標引人工語言文本詞自由詞主題詞將自然語言中的同義詞、多義詞、近義詞等進行規(guī)范化處理主題詞特點：單一性：主題詞與概念的單一對應，即一個概念只能用一個主題詞表達，而一個主題詞在概念上只能代表一種含義，不能存在歧義。（China→中國）規(guī)范性：同義、近義規(guī)范、詞義規(guī)范、詞形規(guī)范。組配性：可以與副主題詞組配表達一個更準確的概念副主題詞(subheadings)又稱限定詞(qualifiers)，是對主題詞作進一步限定的詞，使主題詞具有更高的專指性使用副主題詞增強了主題詞的專指性，縮小檢索范圍，使主題詞表達的文獻的內容更為確切。注：并非每個副主題詞都能與所有主題詞組配，每個副主題詞都有其可組配的主題詞類目范疇。以疾病為主題詞常組配的副主題詞診斷：/診斷/病理學/放射照相術/放射性核素成像/超聲檢查/分析/血液/尿/腦脊髓液治療：/治療/藥物治療/飲食治療/放射治療/外科學/移植/康復/護理病因和發(fā)病學：/病因學/化學誘導/流行病學/先天性/胚胎學/遺傳學/免疫學/微生物學/病毒學/并發(fā)癥/繼發(fā)癥以藥物為主題詞常組配的副主題詞/治療應用/投藥與劑量/副作用/中毒/毒性/禁忌癥/藥代動力學/代謝/血液/尿/腦脊液以化學物質為主題詞常組配的副主題詞/藥理學/激動劑/藥代動力學/拮抗劑和抑制劑/類似物和衍生物/分離和提純/生物合成/化學合成/副作用/中毒/毒性預防醫(yī)學專業(yè)的主題詞常組配的副主題詞/流行病學/預防和控制/經(jīng)濟學/人力/立法和法學/供應和分配/統(tǒng)計學和數(shù)值數(shù)據(jù)/標準/利用分類語言分類語言是一種體系語言，按學科屬性逐級劃分，表現(xiàn)事物的隸屬、平行關系。分類語言即以學科分類為依據(jù)，用學科分級類目標識文獻內容特征。包括：類目名稱、分類號我國文獻分類以《中國圖書資料分類法》（簡稱《中圖

法》）為依據(jù)?！吨袌D法》以各門學科的特點和規(guī)律為基礎，按照知識門類的邏輯次序，將學科劃分為五個基本部類、22個基本大類。每個學科分類分配一個號碼，稱為分類號。馬克思主義、列寧主義、毛澤東思想哲學社會科學總論政治、法律軍事經(jīng)濟文化、科學、教育、體育語言、文字I 文學藝術歷史、地理自然科學總論數(shù)理科學和化學天文學、地球科學生物科學R 醫(yī)藥、衛(wèi)生

農(nóng)業(yè)科學工業(yè)技術交通運輸航空、航天X

環(huán)境科學Z

綜合性圖書R

醫(yī)藥、衛(wèi)生R1 預防醫(yī)學、衛(wèi)生學R2 中國醫(yī)學R3 基礎醫(yī)學R4 臨床醫(yī)學R5 內科學R6 外科學R71 婦產(chǎn)科學R72 兒科學R73 腫瘤學R74 神經(jīng)病學與精神病學R75 皮膚病學與性病學R76 耳鼻咽喉科學R77 眼科學R78 口腔科學R79 外國民族醫(yī)學R8 特種醫(yī)學R9

藥學檢索途徑：又稱檢索項（字段、入口），指在文獻的哪個位置匹配檢索詞。常用的檢索途徑：主題途徑、分類途徑、著者途徑、題名途徑等。三、檢索途徑標題、篇名字段著者字段機構字段文摘字段關鍵詞字段全文任意字段1.主題途徑使用主題語言，以表達主題內容的詞語檢索文獻的途徑，是最常用的檢索途徑，適用于族性檢索要求。依據(jù)詞語的規(guī)范化程度不同，主題途徑包括主題詞途徑、關鍵詞途徑、自由詞途徑（題名途徑、摘要途徑、全文途徑）。主題途徑能將分散在各個學科領域的有關同一主題的文獻集中在一起。主題詞途徑關鍵詞途徑1、關鍵詞多源自于作者原文，其有無、多寡、用詞不一，存在漏檢的風險。2、數(shù)據(jù)庫對關鍵詞檢索功能設置不同，造成誤檢的現(xiàn)象。慎用關鍵詞途徑!!!題名途徑2.分類途徑分類途徑是指使用分類語言（分類號、類目名稱）或分類導航，按照學科分類隸屬關系檢索文獻的途徑。優(yōu)點：可以滿足用戶從學科、專業(yè)等內容出發(fā)獲取文獻的需求。缺點： 難以反映新興學科的內容，不易查全多學科綜合性的文獻3.著者途徑：以文獻作者姓名或團體作者名稱作為檢索入口查找文獻的途徑。–外文數(shù)據(jù)庫中，作者姓名通常采用姓全拼在前，名縮寫在后的形式檢索。–注意中西方著者的書寫方式，西方著者采用名前姓后，檢索時要注意順序。–

如：Wang

Fengshan——Wang

FSGeorge

W.

Bush——Bush

GW題名途徑利用出版物的題名（書名、刊名）作為檢索入口查找文獻的途徑。引文途徑根據(jù)文獻后所附的參考文獻查找文獻的途徑。在計算機系統(tǒng)中，檢索文獻的途徑還有很多，不一一列舉，但需要說明的是，很多檢索系統(tǒng)都有其預設的綜合選項，以便使讀者同時進行多途徑檢索。檢索發(fā)表在《中華內科雜志》上的論文檢索北京大學醫(yī)學部發(fā)表的文章檢索于金明教授發(fā)表的論文檢索某篇文章發(fā)表后是不是被他人引用借鑒檢索CNKI中收錄護理學方面的文獻檢索腹膜透析在慢性腎衰竭中的應用布爾邏輯檢索限定檢索模糊檢索截詞檢索精確檢索

主題詞檢索四、

計算機檢索技術與方法布爾邏輯檢索1.邏輯與：反映概念的并存關系常用符號：AND、and、空格、并且、并且包含、*A

and

B：檢索同時包含A和B的文獻3.邏輯非：反映概念的排除關系ABA

BAB婦女吸煙的危害婦女

AND 吸煙2.邏輯或：反映概念的婦或女存和關兒系童吸煙的危害婦女

OR

兒童

AND 吸煙常用符號：OR、o(r婦、女或者O、R

兒或童者)包含AN、D

或吸、煙+A

OR

B：檢索包含A或包含B及A和B的文獻吸煙與肺外癌癥的相關性常用符號吸：煙NOTA、NDAND癌NOTN、OTnot肺、癌and

not、不包含、-A

not

B：檢索包含A但不包含B的文獻①運算順序：NOT＞AND＞OR②自上而下，從左到右③如需改變運算的優(yōu)先順序，使用小括號將優(yōu)先部分括起。截詞檢索截詞檢索是對檢索詞的片斷進行匹配，對同詞干的詞實現(xiàn)族性檢索的功能，可簡化檢索操作，提高查全率。①

有限截詞

：使用“？”為通配符進行截詞檢索。一個?代表任意一個字符。如：wom?n：women

woman②無限截詞：使用“*”(%)進行截詞檢索。一個“*”可代替任意個字符。如：child*：

child,

children,

childhood等。1、截詞檢索⑴

有限截詞使用“？”為通配符進行截詞檢索。一個?代表任意一個字符。

如： 阿?匹林：阿司匹林，阿斯匹林。⑵

無限截詞：使用“*”(%)進行截詞檢索。 一個“*”可代替任意個字符。如：child*：

child,

children,

childhood等。肝炎%疫苗：肝炎疫苗，肝炎減毒活疫苗，肝炎病毒基因疫苗等。五、其他檢索方法限制檢索限制檢索是指通過限制檢索范圍，達到優(yōu)化檢索結果的方法。如字段限制、范圍限制檢索以及條件限制檢索等。有指令式和菜單式兩種檢索方法指令符有“in”、“=” 、“[ ]”、“：”等。如：于金明

in

AU AU= 于金明菜單式限定精確檢索與模糊檢索精確檢索：①指檢出信息與輸入的詞組完全一致的，如作者、單位、刊名、篇名等字段；②指檢出的信息包含輸入的檢索詞，用“”來標注。模糊檢索：①檢出信息包含輸入的檢索詞；②檢出信息包含輸入的檢索詞中的部分詞素模糊檢索精確檢索主題詞檢索主題詞/副主題詞組配檢索主題詞是描述主題事物和概念的規(guī)范化詞語，副主題詞是涵蓋主題的研究方面的規(guī)范詞語，主題詞組配檢索的表達式為：主題詞/副主題詞（主題事物或概念/ 研究方面

）如：檢索“肝硬化的手術治療” ，主題詞途徑的檢索表達式為：肝硬化/外科學檢索“維生素C的副作用” ，主題詞途徑的檢索表達式為：抗壞血酸/副作用使用主題詞組配副主題詞檢索時，要注意選擇正確的主題詞和副主題詞。題目中涉及多個主題詞時，用副主題詞表達主題概念間的關系因果關系：氟化物引起的痤瘡、痛風引起虹膜炎影響被影響關系：支氣管擴張劑對肺的作用應用關系：阿司匹林治療感冒相關關系：眼弓形體病并發(fā)青光眼連鎖關系：加壓素治療休克引起冠狀動脈疾病因果關系病因學化學誘導影響與被影響關系應用關系相關關系肝硬化的手術治療 肝硬化/外科學眼結核引致失明盲

/病因學

結核，眼/并發(fā)癥壞血病人血液中維生素C

含量的分析 壞血病/血液 抗壞血酸/血液ATP酶在肝中的含量檢測肝/酶學 腺苷三磷酸酶類/分析肺癌的聯(lián)合化療效果肺腫瘤/藥物療法抗腫瘤藥，多劑聯(lián)用/治療應用發(fā)熱病人服用醋氨酚引起肝毒性反應 發(fā)熱/藥物療法、醋氨酚/治療應用 肝疾病/化學誘導、醋氨酚/副作用門腔靜脈分流術后肝昏迷、肝性腦病/病因學門腔分流術，外科/副作用甲醛引致失明盲/化學誘導、甲醛/中毒甲亢導致充血性心衰甲狀腺功能亢進/并發(fā)癥、心力衰竭，充血性/病因學主題詞擴展檢索對有下位詞的主題詞，使用擴展指令則可同時對該主題詞及其全部下位詞進行檢索，擴大檢索范圍，簡化檢索過程