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文檔簡介
DB23/TXXXX—XXXX
玉米抗絲黑穗病多標(biāo)記分子輔助育種技術(shù)規(guī)程
1范圍
本文件規(guī)定了玉米抗絲黑穗病多標(biāo)記分子輔助育種的術(shù)語和定義、儀器、育種材料及育種程序。
本文件適用于玉米(ZeamaysL.)抗絲黑穗病分子標(biāo)記輔助育種。
2規(guī)范性引用文件
下列文件中的內(nèi)容通過文中的規(guī)范性引用而構(gòu)成本文件必不可少的條款。其中,注日期的引用文
件,僅該日期對應(yīng)的版本適用于本文件;不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改單)適
用于本文件。
NYT1248.3-2006玉米抗病蟲性鑒定技術(shù)規(guī)范第3部分:玉米抗絲黑穗病鑒定技術(shù)規(guī)范
NY-T1432-2014玉米品種鑒定技術(shù)規(guī)程SSR標(biāo)記法
3術(shù)語和定義
下列術(shù)語和定義適用于本文件。
3.1
玉米絲黑穗病maizeheadsmut
由絲軸黑粉菌(Sphacelothecareiliana(Kühn)Clint.)侵染所引起的玉米真菌性病害,在7葉期之前
穿透玉米胚芽鞘、中胚軸或根部的表皮細(xì)胞完成侵染,初期顯癥不明顯,在開花期破壞雌穗和雄穗的
正常結(jié)構(gòu),形成黑粉孢子堆積造成絕產(chǎn)。
3.2
標(biāo)記輔助選擇
利用與目標(biāo)性狀緊密連鎖的分子標(biāo)記對目標(biāo)性狀進(jìn)行選擇的育種技術(shù)。
3.3
多標(biāo)記組合
利用與育種目標(biāo)性狀緊密連鎖的2個(gè)及以上的分子標(biāo)記組合。
3.4
前景選擇標(biāo)記
用于檢測目標(biāo)性狀的分子標(biāo)記。
3.5
背景選擇標(biāo)記
1
DB23/TXXXX—XXXX
用于檢測試驗(yàn)材料遺傳背景的分子標(biāo)記。
4儀器
4.1DNA提取儀器
研缽、核酸提取磨樣機(jī)、水浴鍋、移液器、低溫高速離心機(jī)和通風(fēng)櫥等。
4.2PCR檢測儀器
PCR儀、移液器、電泳儀、電泳槽和凝膠成像系統(tǒng)。
5育種材料
5.1感病受體親本
選取農(nóng)藝性狀優(yōu)良但感或高感絲黑穗病的玉米自交系,且不具有bin2.09主效抗病位點(diǎn)/基因和
bin8.03次主效抗病位點(diǎn)的玉米自交系,作為感病受體親本(P1)。
5.2抗病供體親本
選取在田間表現(xiàn)為高抗絲黑穗病,且具有bin2.09主效抗病位點(diǎn)/基因和bin8.03次主效抗病位點(diǎn)的玉
米自交系,作為抗病供體親本(P2)。
6育種程序
6.1雜交
以P1為母本,以P2為父本,人工授粉雜交,獲得F1代雜交種子。
6.2回交
以F1為母本,以P1為父本,人工授粉雜交,獲得BC1F1世代雜交種子。
6.3BC1F1基因分型
6.3.1采樣
BC1F1世代雜交種子樣品可以是種子的胚乳、幼苗的葉片等可用于DNA提取的玉米植物組織。樣
品采集后立刻用于DNA提取或冷凍保存。采樣時(shí)應(yīng)記錄每個(gè)體樣品名稱、樣品編號(hào)、采樣地點(diǎn)和時(shí)間
等。
6.3.2DNA提取與純化
將每個(gè)體樣品研磨粉末200mg~300mg轉(zhuǎn)入2mL離心管,加入0.5mL2×CTAB提取緩沖液充分
混勻,在55℃~65℃恒浴30min。加入1mL氯仿:異戊醇(24:1),充分搖動(dòng)5min,8000g,室
溫下離心5min。取上清液加入2.5×體積預(yù)冷無水乙醇,﹣20℃冰箱放置2h以上,15000g離心20
min。用70%的預(yù)冷乙醇洗一次,自然干燥后,用200μL0.1×TE緩沖液溶解,置4℃保存。也可采
用其他能夠達(dá)到PCR擴(kuò)增質(zhì)量要求的DNA提取方法。
2
DB23/TXXXX—XXXX
6.3.3前景選擇
6.3.3.1標(biāo)記信息
使用的分子標(biāo)記為玉米抗絲黑穗病bin2.09主效和bin8.03次主效QTL所在位點(diǎn)的連鎖標(biāo)記或抗病基
因的功能標(biāo)記,詳細(xì)信息見附錄1。
6.3.3.2PCR擴(kuò)增
采用20μL的反應(yīng)體系中進(jìn)行擴(kuò)增。單標(biāo)記反應(yīng)體系包含每種dNTP(2.5mM/mL)2ul,10×Taq
Buffer2ul,25mMMgcl21ul,Primer-F(20u)0.5ul,Primer-R(20u)0.5ul,Taq(5U/uL)1ul,
DNA(20ng/μL~50ng/μL)2ul,ddH2O11ul。擴(kuò)增反應(yīng)條件為:PCR程序?yàn)?5℃預(yù)變性5min,1個(gè)循
環(huán);95℃變性30s,55℃退火30s,72℃延伸10s,共34個(gè)循環(huán);72℃延伸10min,4℃保存。單標(biāo)記PCR
產(chǎn)物分別進(jìn)行酶切,反應(yīng)體系包括10×NEBuffer1ul,限制性內(nèi)切酶0.4ul,PCR產(chǎn)物2.5ul,ddH2O
6.1ul,37℃孵育3h左右。
6.3.3.3酶切產(chǎn)物檢測
對酶切產(chǎn)物采用瓊脂糖凝膠或聚丙烯酰胺凝膠電泳,如個(gè)體攜帶抗病位點(diǎn)或基因,LSdCAP2、
LSdCAP3、LSdCAP8和DNdCAPS8.031標(biāo)記酶切產(chǎn)物大小分別為93bp,136bp,132bp和137bp,可選取
同時(shí)攜帶4個(gè)抗病位點(diǎn)或基因的個(gè)體。
6.3.4背景選擇
對入選個(gè)體進(jìn)行遺傳背景分析,使用的分子標(biāo)記為簡單重復(fù)序列(SampleSequenceRepeat,
SSR)標(biāo)記進(jìn)行遺傳背景,詳細(xì)信息見NY-T1432-2014《玉米品種鑒定技術(shù)規(guī)程SSR標(biāo)記法》中的附
錄C。篩選遺傳背景與P1基因型相似度最高的個(gè)體。
6.4BC1F1回交
以從6.3中獲得的BC1F1為母本,以P1為父本,人工授粉雜交,獲得BC2F1雜交種子。
6.5BC2F1基因分型
按照6.3的基因分型方法執(zhí)行,篩選同時(shí)含有4個(gè)抗病位點(diǎn)或基因、遺傳背景與P1基因型相似度最
高的個(gè)體。
6.6BC2F1回交
以從6.5中獲得的BC2F1為母本,以P1為父本,人工授粉雜交,獲得BC3F1雜交種子。
6.7BC3F1基因分型
按照6.4的基因分型方法執(zhí)行,篩選同時(shí)含有4個(gè)抗病位點(diǎn)或基因、遺傳背景與P1基因型相似度最
高的個(gè)體。
6.8BC3F1回交
從6.7中獲得的BC3F1自交,混收,獲得BC3F2種子。
6.9BC3F2基因分型
3
DB23/TXXXX—XXXX
按照6.3的基因分型方法執(zhí)行,篩選同時(shí)含有4個(gè)純合抗病位點(diǎn)或基因、遺傳背景與P1基因型相似
度最高的個(gè)體。將BC3F2單株種植于田間,選取農(nóng)藝性狀與P1接近的單株。
6.10選系
將6.9中獲得的單株進(jìn)行自交至BC3F4代,從中選擇農(nóng)藝性狀與P1相似的材料進(jìn)行系選,絲黑穗病
抗性鑒定按照NYT1248.3-2006的規(guī)定執(zhí)行,通過小區(qū)品比試驗(yàn),選出優(yōu)良抗病自交系。
4
DB23/TXXXX—XXXX
附錄1dCAPS分子標(biāo)記信息
標(biāo)記信息
序QTL所在的QTL表型貢
標(biāo)記名稱標(biāo)記類型SNP
號(hào)染色體位置獻(xiàn)率(%)引物退火溫度內(nèi)切酶酶切位點(diǎn)預(yù)期產(chǎn)物大小
位置突變位點(diǎn)
上游TACATTGATATTTGCCACACGAAT5’CTGCAG3’
1LSdCAP2連鎖標(biāo)記2.093655PstI93/73,2069T/C
下游CAAATCAACGAGTGATTTACTGCA3’GACGTC5’
上游GGCTGCGCCGTGAGATACT5’ACTGGN3’
2LSdCAP3連鎖標(biāo)記2.093655BsrI136/22,11420T/G
下游GCTCTCGATCTGTCCTTGTCACCA3’TGACCN5’
上游CGACAACGCCCGCCATCGCCG5’CCGC3’
3LSdCAP8功能標(biāo)記2.093660AciI132/19,11322C/G
下游TTGAGGTTGCCGAGGTCAGT3’GGCG5’
上游AGCTCAACGCAATTCATTGTGC5’GWGCWC3’
4DNdCAPS8.03-1功能標(biāo)記8.031065BsiHKAI137/114,2397C/T
下游CGCTCACTGCCAAGTTTTGC3’CWCGWG3’
1
ICS65.020.20
CCSB05
DB23
黑龍江省地方標(biāo)準(zhǔn)
DB23/TXXXX—XXXX
玉米抗絲黑穗病多標(biāo)記分子輔助育種技術(shù)
規(guī)程(征求意見稿)
XXXX-XX-XX發(fā)布XXXX-XX-XX實(shí)施
黑龍江省市場監(jiān)督管理局發(fā)布
DB23/TXXXX—XXXX
玉米抗絲黑穗病多標(biāo)記分子輔助育種技術(shù)規(guī)程
1范圍
本文件規(guī)定了玉米抗絲黑穗病多標(biāo)記分子輔助育種的術(shù)語和定義、儀器、育種材料及育種程序。
本文件適用于玉米(ZeamaysL.)抗絲黑穗病分子標(biāo)記輔助育種。
2規(guī)范性引用文件
下列文件中的內(nèi)容通過文中的規(guī)范性引用而構(gòu)成本文件必不可少的條款。其中,注日期的引用文
件,僅該日期對應(yīng)的版本適用于本文件;不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改單)適
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3術(shù)語和定義
下列術(shù)語和定義適用于本文件。
3.1
玉米絲黑穗病maizeheadsmut
由絲軸黑粉菌(Sphacelothecareiliana(Kühn)Clint.)侵染所引起的玉米真菌性病害,在7葉期之前
穿透玉米胚芽鞘、中胚軸或根部的表皮細(xì)胞完成侵染,初期顯癥不明顯,在開花期破壞雌穗和雄穗的
正常結(jié)構(gòu),形成黑粉孢子堆積造成絕產(chǎn)。
3.2
標(biāo)記輔助選擇
利用與目標(biāo)性狀緊密連鎖的分子標(biāo)記對目標(biāo)性狀進(jìn)行選擇的育種技術(shù)。
3.3
多標(biāo)記組合
利用與育種目標(biāo)性狀緊密連鎖的2個(gè)及以上的分子標(biāo)記組合。
3.4
前景選擇標(biāo)記
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3.5
背景選擇標(biāo)記
1
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用于檢測試
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