Pubmed數(shù)據(jù)庫(kù)檢索與利用

PubMed數(shù)據(jù)庫(kù)檢索與利用江西中醫(yī)藥大學(xué)圖書館查青林2015.11.27主要內(nèi)容PubMed概述PubMed檢索途徑與使用方法檢索結(jié)果導(dǎo)入NoteExpressPubMed元數(shù)據(jù)利用2主要內(nèi)容PubMed概述PubMed檢索途徑與使用方法檢索結(jié)果導(dǎo)入NoteExpressPubMed元數(shù)據(jù)利用3PubMed簡(jiǎn)介PubMed是由美國(guó)國(guó)立醫(yī)學(xué)圖書館(NationalLibraryofMedicine,NLM)下屬美國(guó)生物技術(shù)信息中心(NationalCenterforBiotechnologyInformation,NCBI)研制的基于Web的文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù)收錄全世界包括美國(guó)在內(nèi)80多個(gè)國(guó)家的5000余種生物醫(yī)學(xué)期刊的文摘及題錄數(shù)據(jù)，內(nèi)容涉及護(hù)理學(xué)、牙科學(xué)、獸醫(yī)學(xué)、藥理學(xué)、保健系統(tǒng)等醫(yī)學(xué)各個(gè)領(lǐng)域現(xiàn)有文獻(xiàn)2200萬(wàn)余條，收錄文獻(xiàn)時(shí)間起自20世紀(jì)50年代PubMed提供部分免費(fèi)全文，包括①NLM開(kāi)發(fā)的免費(fèi)生物醫(yī)學(xué)數(shù)字化期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù)PubMedCentral(PMC)；

②開(kāi)放獲取(OpenAccess,OA)期刊的文獻(xiàn)；③部分出版商提供的免費(fèi)期刊文獻(xiàn)。PubMed每條記錄均有惟一的識(shí)別號(hào)PMID(PubMedUniqueIdentifier)

。MEDLINE:PubMed主體部分，記錄均標(biāo)有[PubMed-indexedforMEDLINE]

InProcessCitation:又稱PreMEDLINE,記錄均標(biāo)有[PubMed-inprocess]Publisher-SuppliedCitation:記錄均標(biāo)有[PubMed-assuppliedbypublisher][PubMed-indexedforMEDLINE][PubMed-assuppliedbypublisher][PubMed-inprocess]NLM早在1879年即開(kāi)始編譯醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)的檢索刊物《醫(yī)學(xué)索引》(IndexMedicus,IM)從1964年起，采用計(jì)算機(jī)進(jìn)行電子編輯和排版，在此基礎(chǔ)上開(kāi)發(fā)了“醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)分析與檢索系統(tǒng)”(MedicalLiteratureAnalysis&RetrievalSystem)，即著名的MEDLARS系統(tǒng)1971年正式建立了該系統(tǒng)的聯(lián)機(jī)系統(tǒng)，稱為“MEDLARS聯(lián)機(jī)檢索系統(tǒng)”(MEDLARSonline)，即MEDLINE系統(tǒng)隨著網(wǎng)絡(luò)技術(shù)的發(fā)展，開(kāi)發(fā)人員致力于將MEDLINE數(shù)據(jù)庫(kù)的信息放到網(wǎng)上，供廣大醫(yī)務(wù)人員免費(fèi)使用。從1997年6月起，PubMed開(kāi)始在網(wǎng)上免費(fèi)向讀者提供服務(wù)發(fā)展歷程收錄范圍廣、內(nèi)容齊全、回溯時(shí)間長(zhǎng)免費(fèi)提供題錄、文摘檢索功能完善、使用方便提供檢索詞自動(dòng)轉(zhuǎn)換匹配功能、MeSH主題詞檢索可直接下載全部元數(shù)據(jù)，便于利用各種工具進(jìn)行分析提供相關(guān)文獻(xiàn)鏈接:Relatedcitations,Linkout更新速度快:數(shù)據(jù)實(shí)時(shí)更新個(gè)性化服務(wù)(MyNCBI)PubMed特點(diǎn)

PubMed提供檢索詞自動(dòng)轉(zhuǎn)換匹配功能(AutomaticTermMapping,ATM)。

PubMed對(duì)鍵入的檢索詞自動(dòng)進(jìn)行分析、匹配、轉(zhuǎn)換并檢索，是一種智能化的檢索過(guò)程。MeSH轉(zhuǎn)換表

Vitaminh→

"biotin"[MeSHTerms]OR"biotin"[AllFields]OR"vitaminh"[AllFields]期刊轉(zhuǎn)換表

newenglandjournalofmedicine→

"NEnglJMed"[Journal]OR"newenglandjournalofmedicine"[AllFields]作者索引

SmithJA→SmithJA[Author]主要內(nèi)容PubMed概述PubMed檢索途徑與使用方法檢索結(jié)果導(dǎo)入NoteExpressPubMed元數(shù)據(jù)利用10二、PubMed檢索途徑與使用方法基本檢索高級(jí)檢索主題詞檢索題錄檢索期刊檢索基本檢索框高級(jí)檢索題錄檢索主題詞檢索期刊檢索臨床查詢臨床試驗(yàn)網(wǎng)址13輸入檢索式例：類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎（rheumatoidarthritis）應(yīng)用雷公藤（triperygiumwilfordii）方面的文獻(xiàn)。點(diǎn)擊“Search”顯示設(shè)置檢索結(jié)果標(biāo)題含有檢索詞文獻(xiàn)標(biāo)題含有檢索詞文獻(xiàn)點(diǎn)擊“Seemore”在PubMed注冊(cè)自己的賬戶點(diǎn)擊篇名點(diǎn)擊出版物類型相關(guān)文獻(xiàn)點(diǎn)擊“LinkOut”點(diǎn)擊數(shù)據(jù)庫(kù)名稱時(shí)間限定文獻(xiàn)類型限定語(yǔ)種限定限定結(jié)果點(diǎn)擊高級(jí)檢索檢索式顯示框構(gòu)建檢索式檢索歷史輸入檢索詞顯示索引例：檢索2009年以來(lái)發(fā)表的有關(guān)腫瘤護(hù)理方面的英文綜述性文獻(xiàn)輸入檢索詞選擇檢索字段點(diǎn)擊“Search”完整檢索式檢索結(jié)果點(diǎn)擊主題詞檢索輸入檢索詞點(diǎn)擊“Search”例：通過(guò)主題詞途徑，檢索有關(guān)心肌梗塞（myocardialinfarction）方面的文獻(xiàn)添加到檢索框檢索勾選主題詞檢索結(jié)果輸入檢索詞點(diǎn)擊“Search”例：通過(guò)主題詞途徑，檢索有關(guān)心肌梗塞（myocardialinfarction）預(yù)防（preventionandcontrol)方面的文獻(xiàn)確定主題詞選擇副主題詞添加到檢索框檢索主題詞加權(quán)檢索選項(xiàng)檢索結(jié)果例：通過(guò)主題詞途徑，檢索有關(guān)心肌梗塞（myocardialinfarction）預(yù)防（preventionandcontrol)方面的文獻(xiàn)。要求主題詞加權(quán)、不擴(kuò)展檢索勾選加權(quán)檢索、不擴(kuò)展檢索選項(xiàng)添加到檢索框檢索檢索結(jié)果題錄檢索例：檢索《病毒雜志》（archivesofvirology）2009年發(fā)表的《基因穩(wěn)定性與連續(xù)性分析》（geneticstabilityandlinkageanalysis）這篇文獻(xiàn)輸入檢索信息點(diǎn)擊“Search”點(diǎn)擊期刊檢索檢索框輸入刊名點(diǎn)擊“Search”例：查找《新英格蘭醫(yī)學(xué)雜志》（nejm）

PubMed基本檢索規(guī)則布爾運(yùn)算符AND，OR，NOT必須大寫例如：vitaminORzincPubMed從左至右進(jìn)行布爾運(yùn)算，可以通過(guò)加圓括符改變運(yùn)算順序例如：commoncoldAND(vitaminORzinc)指定文獻(xiàn)記錄字段名稱檢索

例如：DNA［mh］ANDcrick［au］AND1993［dp］

常用字段名稱縮寫：

DP——出版日期如1998［dp］；輸入日期范圍則用冒號(hào)連接，如1996：1998［dp］

AD——第一作者機(jī)構(gòu)名稱、地址、資助號(hào)如tianjin［ad］

AU——作者姓名如woods［au］

TA——期刊名稱包括期刊名全稱、簡(jiǎn)稱、ISSN如science［ta］或0021-9258［ta］

LA——文獻(xiàn)出版語(yǔ)言如Chinese［la］

MH——Mesh主題詞如neoplasm［mh］

PT——出版類型如review［pt］

TW——自由詞

TI——文獻(xiàn)標(biāo)題內(nèi)自由詞如leiomyosarcoma［ti］

作者姓名[字段標(biāo)識(shí)]Woods[au]輸入檢索詞詳細(xì)檢索過(guò)程輸入檢索詞詳細(xì)檢索過(guò)程刊名[字段標(biāo)識(shí)]Science[ta]輸入檢索詞詳細(xì)檢索過(guò)程輸入檢索詞詳細(xì)檢索過(guò)程詞組檢索例如：“singlecell”截詞檢索：*例如：輸入infect*，可檢出infection，infectious，infective，infectivity，infector等截詞檢索只限于單詞，對(duì)詞組無(wú)效

雙引號(hào)，系統(tǒng)進(jìn)行強(qiáng)制檢索注意：檢索詞自動(dòng)轉(zhuǎn)換匹配功能關(guān)閉輸入檢索詞檢索結(jié)果詳細(xì)檢索過(guò)程詞組檢索輸入檢索詞檢索結(jié)果詳細(xì)檢索過(guò)程*通配符，可同時(shí)檢索含有infection，infected，infections等詞的文獻(xiàn)注意：檢索詞自動(dòng)轉(zhuǎn)換匹配功能關(guān)閉輸入檢索詞詳細(xì)檢索過(guò)程主要內(nèi)容PubMed概述PubMed檢索途徑與使用方法檢索結(jié)果導(dǎo)入NoteExpressPubMed元數(shù)據(jù)利用65從圖書館網(wǎng)站下載NoteExpress66檢索結(jié)果保存為Medline格式文件67從