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文檔簡介
第一篇生物技術(shù)制藥實(shí)驗(yàn)室規(guī)則及基本要求
一'實(shí)驗(yàn)室規(guī)則
(1)每位同學(xué)應(yīng)自覺遵守課堂紀(jì)律,維護(hù)課堂秩序,不遲到,不早退,不大聲談笑。
(2)實(shí)驗(yàn)前須認(rèn)真預(yù)習(xí),熟悉實(shí)驗(yàn)?zāi)康?、原理、操作步驟,懂得每一操作步驟的意義,
并了解所用儀器的使用方法,否則不能開始實(shí)驗(yàn)。
(3)實(shí)驗(yàn)過程中要聽從教師的指導(dǎo),嚴(yán)肅認(rèn)真地按照操作規(guī)程進(jìn)行實(shí)驗(yàn),并把實(shí)驗(yàn)結(jié)果
和數(shù)據(jù)及時(shí)、如實(shí)記錄在實(shí)驗(yàn)記錄本上,文字要簡練、準(zhǔn)確。完成實(shí)驗(yàn)后經(jīng)教師檢查同
意,方可離開實(shí)驗(yàn)室。
(4)實(shí)驗(yàn)臺面應(yīng)隨時(shí)保持整潔,儀器、藥品擺放整齊。公用試劑用完后,應(yīng)立即蓋嚴(yán)放
回原處。勿使試劑、藥品灑在實(shí)驗(yàn)臺面和地上。實(shí)驗(yàn)完畢,儀器洗凈放好,將實(shí)驗(yàn)臺面
抹拭干凈,才能離開實(shí)驗(yàn)室。
(5)使用儀器、藥品、試劑和各物品必須注意節(jié)約;洗滌和使用儀器時(shí),應(yīng)小心仔細(xì),
防止損壞儀器;使用貴重精密儀器時(shí),應(yīng)嚴(yán)格遵守操作規(guī)程,發(fā)現(xiàn)故障須立即報(bào)告教師,
不得擅自動手檢修。
(6)實(shí)驗(yàn)室內(nèi)嚴(yán)禁吸煙!加熱用的電爐應(yīng)隨用隨關(guān),嚴(yán)格做到:人在爐火在,人走爐火
關(guān)。乙醇、丙酮、乙醛等易燃品不能直接加熱,并要遠(yuǎn)離火源操作和放置。實(shí)驗(yàn)完畢后
應(yīng)立即拔去電爐開關(guān),關(guān)好水籠頭并拉下電閘。離開實(shí)驗(yàn)室以前應(yīng)認(rèn)真、負(fù)責(zé)地進(jìn)行檢
查水電,嚴(yán)防發(fā)生安全事故。
(7)廢液體可倒入水槽內(nèi),同時(shí)放水沖走。強(qiáng)酸、強(qiáng)堿溶液必須先用水稀釋。廢紙屑及
其他固體廢物和帶渣滓的廢物倒入廢品缸內(nèi),不可倒入水槽或到處亂扔。
(8)要精心使用和愛護(hù)儀器,如使用分光光度計(jì)時(shí),不能將比色杯直接置于分光光度計(jì)
上,并注意拿放比色杯時(shí),不要打碎。儀器損壞時(shí),應(yīng)如實(shí)向教師報(bào)告,并填寫損壞儀
器登記表,然后補(bǔ)領(lǐng)。
(9)實(shí)驗(yàn)室內(nèi)一切物品,未經(jīng)本室負(fù)責(zé)教師批準(zhǔn),嚴(yán)禁帶出室外,借物必須辦理登記手
續(xù)。
(10)每次實(shí)驗(yàn)課由班長或課代表負(fù)責(zé)安排值日生。值日生的職責(zé)是負(fù)責(zé)當(dāng)天實(shí)驗(yàn)室的衛(wèi)
生、安全、組織同學(xué)填寫實(shí)驗(yàn)室登記本等一切服務(wù)性的工作。
二'實(shí)驗(yàn)基本要求
1.預(yù)習(xí)報(bào)告要求
做好預(yù)習(xí)報(bào)告,有助于學(xué)生實(shí)驗(yàn)前對實(shí)驗(yàn)的內(nèi)容、目的要求、基本原理、具體操作
方法、數(shù)據(jù)記錄格式及實(shí)驗(yàn)要點(diǎn)等有一定了解,減少盲目性,增強(qiáng)教學(xué)效果。實(shí)驗(yàn)指導(dǎo)
教師應(yīng)檢查學(xué)生的預(yù)習(xí)情況,進(jìn)行必要的提問,解答疑難。預(yù)習(xí)報(bào)告應(yīng)包括實(shí)驗(yàn)原理、
詳細(xì)的實(shí)驗(yàn)操作步驟及做好實(shí)驗(yàn)的注意事項(xiàng),并擬定好實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)表格等。
2.實(shí)驗(yàn)記錄要求
詳細(xì)、準(zhǔn)確、如實(shí)地作好實(shí)驗(yàn)記錄是極為重要的,記錄如果有誤,會使整個(gè)實(shí)驗(yàn)失
敗,這也是培養(yǎng)學(xué)生實(shí)驗(yàn)?zāi)芰蛧?yán)謹(jǐn)?shù)目茖W(xué)作風(fēng)的一個(gè)重要方面。
(1)每位同學(xué)須準(zhǔn)備一個(gè)實(shí)驗(yàn)記錄本,記錄本上要編好頁數(shù),不得撕頁和涂改,寫錯時(shí)
可以劃去重寫。不得用鉛筆記錄,只能用鋼筆或園珠筆記錄。記錄本的左頁作計(jì)算和草
稿用,右頁用作實(shí)驗(yàn)記錄。同組的兩位同學(xué)合做同一實(shí)驗(yàn)時(shí),兩人必須都有相同、完整
的記錄。
(2)實(shí)驗(yàn)中應(yīng)及時(shí)準(zhǔn)確地記錄所觀察到的現(xiàn)象和測量的數(shù)據(jù),條理清楚,字跡端正,切
不可潦草,以致日后無法辨認(rèn)。實(shí)驗(yàn)記錄必須公正客觀,不可夾雜主觀因素。
(3)實(shí)驗(yàn)中要記錄的各種數(shù)據(jù),都應(yīng)事先在記錄本上設(shè)計(jì)好各種記錄格式和表格,以免
實(shí)驗(yàn)中由于忙亂而遺漏測量和記錄,造成不可挽回的損失。
(4)實(shí)驗(yàn)記錄要注意有效數(shù)字,如吸光度值應(yīng)為“0.050”,而不能記成“0.05”。每個(gè)結(jié)果
都要盡可能重復(fù)觀測二次以上,即使觀測的數(shù)據(jù)相同或偏差很大,也都應(yīng)如實(shí)記錄,不
得涂改。
(5)實(shí)驗(yàn)中要詳細(xì)記錄實(shí)驗(yàn)條件,如使用的儀器型號、編號、生產(chǎn)廠等;生物材料的來
源、形態(tài)特征、健康狀況、選用的組織及其重量等;試劑的規(guī)格、化學(xué)式、分子量、試
劑的濃度等都應(yīng)記錄清楚。二人一組的實(shí)驗(yàn),必須每人都作記錄。
3.實(shí)驗(yàn)報(bào)告書寫要求及參考格式
實(shí)驗(yàn)報(bào)告是實(shí)驗(yàn)的總結(jié)和匯報(bào),通過實(shí)驗(yàn)報(bào)告的寫作可以分析總結(jié)實(shí)驗(yàn)的經(jīng)驗(yàn)和問
題,學(xué)會處理各種實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的方法,加深對有關(guān)生物化學(xué)與分子生物學(xué)原理和實(shí)驗(yàn)技術(shù)
的理解和掌握,同時(shí)也是學(xué)習(xí)撰寫科學(xué)研究論文的過程。
3.1實(shí)驗(yàn)報(bào)告的格式
一、實(shí)驗(yàn)?zāi)康?/p>
二、實(shí)驗(yàn)原理
三、儀器、實(shí)驗(yàn)材料和試劑
四、操作步驟
五、結(jié)果處理
一份滿意的實(shí)驗(yàn)報(bào)告必須具備準(zhǔn)確、客觀、簡潔、明了四個(gè)特點(diǎn)。實(shí)驗(yàn)報(bào)告的寫作
水平也是衡量學(xué)生實(shí)驗(yàn)成績的一個(gè)重要方面。實(shí)驗(yàn)報(bào)告必須獨(dú)立完成,嚴(yán)禁抄襲。
3.2實(shí)驗(yàn)報(bào)告的內(nèi)容
實(shí)驗(yàn)報(bào)告使用的語言要簡明清楚,抓住關(guān)鍵,各種實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)都要盡可能整理成表格
并作圖表示,以便比較,一目了然。實(shí)驗(yàn)作圖尤其要嚴(yán)格要求,必須使用坐標(biāo)紙,每個(gè)
圖都要有明顯的標(biāo)題,坐標(biāo)軸的名稱要清楚完整,要注明合適的單位,坐標(biāo)軸的分度數(shù)
字要與有效數(shù)字相符,并盡可能簡明,若數(shù)字太大,可以化簡,并在坐標(biāo)軸的單位上乘
以10的方次。實(shí)驗(yàn)點(diǎn)要使用專門設(shè)計(jì)的符號,如:。、?、口、?、△、▲等,符號的大
小要與實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的誤差相符。不要用“x、+”和“?”小園點(diǎn)。有時(shí)也可用兩端有小橫線的
垂直線段來表示實(shí)驗(yàn)點(diǎn),其線段的長度與實(shí)驗(yàn)誤差相符。通常橫軸是自變量,往往知道
的很準(zhǔn)確,縱軸是應(yīng)變量,是測量的數(shù)據(jù)。曲線要用曲線板或曲線尺畫成光滑連續(xù)的曲
線,各實(shí)驗(yàn)點(diǎn)均勻分布在曲線上和曲線兩邊,且曲線不可超越最后一個(gè)實(shí)驗(yàn)點(diǎn)。兩條以
上的曲線和符號應(yīng)有說明。
3.3實(shí)驗(yàn)結(jié)果
實(shí)驗(yàn)結(jié)果的討論要充分,盡可能多查閱一些有關(guān)的文獻(xiàn)和教科書,充分運(yùn)用已學(xué)過
的知識,進(jìn)行深入的探討,勇于提出自己獨(dú)到的分析和見解,并歡迎對實(shí)驗(yàn)提出改進(jìn)意
見。
三、自動取液器的使用方法
這種取液器在生化實(shí)驗(yàn)中大量地使用,它們主要用于多次重復(fù)的快速定量移液,可
以只用一只手操作,十分方便。移液的準(zhǔn)確度(即容量誤差)為±(0.5%?1.5%),移液的
精密度(即重復(fù)性誤差)更小些,為0.5%。
取液器可分為二種:一種是固定容量的,常用的有100卜iL等多種規(guī)格。每種取液器
都有其專用的聚丙烯塑料吸頭,吸頭通常是一次性使用,當(dāng)然也可以超聲清洗后重復(fù)使
用,而且此種吸頭還可以進(jìn)行120℃高壓滅菌;另一種是可調(diào)容量的取液器,常用的有
20(HiL、500HL和lOOOpL等幾種。
可調(diào)式自動取液器的操作方法是用拇指和食指旋轉(zhuǎn)取液器上部的旋鈕,使數(shù)字窗口
出現(xiàn)所需容量體積的數(shù)字,在取液器下端插上一個(gè)塑料吸頭,并旋緊以保證氣密,然后
四指并攏握住取液器上部,用拇指按住柱塞桿頂端的按鈕,向下按到第一停點(diǎn),將取液
器的吸頭插入待取的溶液中,緩慢松開按鈕,吸上液體,并停留1?2秒鐘(粘性大的溶
液可加長停留時(shí)間),將吸頭沿器壁滑出容器,用吸水紙擦去吸頭表面可能附著的液體,
排液時(shí)吸頭接觸傾斜的器壁,先將按鈕按到第一停點(diǎn),停留一秒鐘(粘性大的液體要加
長停留時(shí)間),再按壓到第二停點(diǎn),吹出吸頭尖部的剩余溶液,如果不便于用手取下吸
頭,可按下除吸頭推桿,將吸頭推入廢物缸,如圖1-1、1-2、1-3和圖1-4。
自動取液器的使用注意事項(xiàng):
①吸取液體時(shí)一定要緩慢平穩(wěn)地松開拇指,絕不允許突然松開,以防將溶液吸入過快
而沖入取液器內(nèi)腐蝕柱塞而造成漏氣。
②為獲得較高的精度,吸頭需預(yù)先吸取一次樣品溶液,然后再正式移液,因?yàn)槲⊙?/p>
清蛋白質(zhì)溶液或有機(jī)溶劑時(shí),吸頭內(nèi)壁會殘留一層“液膜”,造成排液量偏小而產(chǎn)生誤
差。
③濃度和粘度大的液體,會產(chǎn)生誤差,為消除其誤差的補(bǔ)償量,可由試驗(yàn)確定,補(bǔ)償
量可用調(diào)節(jié)旋鈕改變讀數(shù)窗的讀數(shù)來進(jìn)行設(shè)定。
④可用分析天平稱量所取純水的重量并進(jìn)行計(jì)算的方法來校正取液器,1mL蒸儲水
20℃時(shí)重0.9982g。
第二篇實(shí)驗(yàn)部分
實(shí)驗(yàn)一胸腺素的制備
一'實(shí)驗(yàn)?zāi)康?/p>
1.了解胸腺素的來源、性質(zhì)及應(yīng)用;
2.掌握胸腺素的制備工藝原理和注意事項(xiàng);
3.熟悉胸腺素質(zhì)量控制的內(nèi)容及原理。
二'實(shí)驗(yàn)原理
胸腺素是由小牛胸腺或豬胸腺經(jīng)分離純化而得到的一組具有免疫活性的多肽類物
質(zhì),其主要功能是增強(qiáng)機(jī)體的免疫能力,促進(jìn)起免疫作用的T淋巴細(xì)胞的成熟。分子量
在lOKDa以下,胸腺素對熱穩(wěn)定,短時(shí)間加熱至80℃,其生物活性不變;易溶于生理
鹽水及緩沖液。生產(chǎn)工藝采用生理鹽水提取,通過加熱及鹽析的方法去除雜蛋白,并可
通過超濾等方法控制分子量大小,以防大分子蛋白質(zhì)混入產(chǎn)品。
三、實(shí)驗(yàn)儀器、材料和試劑
儀器:500ml量杯,刻度離心管(10ml),試管,試管架,抽濾瓶,真空泵,層析柱,
溫度計(jì),分析天平,勻漿機(jī),離心機(jī),恒溫水浴,冰箱.
試劑:丙酮,硫酸鍍,磷酸二氫鈉,sephadexG-10。
四'實(shí)驗(yàn)步驟
1.提取稱取去脂肪及結(jié)締組織的豬胸腺100g,加3倍體積的生理鹽水,制成勻漿,
1500rpm離心15min,收集上清液,即得提取物。
2.去除雜蛋白將以上提取物加熱至80℃,保持15min,然后1500rpm離心5min,收
集上清液。
3.沉淀將上清液置4℃冰箱,預(yù)冷,加入5倍體積-10℃冷丙酮,攪勻,放置lOmin,
過濾,收集沉淀,干燥得到粗的胸腺素丙酮粉。
4.分級鹽析將丙酮粉溶解于pH7.0的磷酸鹽緩沖液中,加固體硫酸核至25%飽和
度,攪勻,離心;收集上清液并調(diào)pH4.6,加硫酸鍍到50%飽和度,攪勻,靜置,離心,
收集沉淀物。
5.脫鹽將鹽析沉淀物溶于蒸儲水后經(jīng)sephadexG-10脫鹽后冷凍干燥即得到胸腺素。
五、注意事項(xiàng)
1.豬胸腺組織往往帶有許多脂肪及結(jié)締組織,應(yīng)盡可能去凈,否則提取液呈混濁。
2.采用加熱法除掉雜蛋白,注意溫度不可過高,時(shí)間也不宜過長。
3.向溶液中加入固體硫酸錢時(shí)應(yīng)注意攪勻,使硫酸鏤全部溶解,否則易造成局部濃度過
局。
六、思考題
1.胸腺素具有哪些理化性質(zhì)?有何意義?
2.胸腺素組分是否單一多肽類成分?
實(shí)驗(yàn)二細(xì)胞色素c的制備及其測定
一、實(shí)驗(yàn)?zāi)康?/p>
掌握細(xì)胞色素c的制備及其測定方法。
二'實(shí)驗(yàn)原理
細(xì)胞色素是多種能夠傳遞電子的含鐵蛋白質(zhì)的總稱。它廣泛存在于各種動物、植物
組織和微生物中。細(xì)胞色素是呼吸鏈中極重要的電子傳遞體,細(xì)胞色素C只是細(xì)胞色素
中的一種,它主要存在于線粒體中。
細(xì)胞色素C為含鐵吟琳的結(jié)合蛋白質(zhì),相對分子質(zhì)量約為13000,蛋白質(zhì)部分由104
個(gè)左右的氨基酸殘基組成。它溶于水,在酸性溶液中溶解度更大,故可自酸性溶液中提
取。其制品分為氧化型和還原型兩種,前者水溶液呈深紅色,后者水溶液呈桃紅色。細(xì)
胞色素C對熱、酸和堿都比較穩(wěn)定,但三氯乙酸和乙酸可使之變性,引起失活。
吸附劑通常在微酸性(pH5~6)或低鹽溶掖中吸附蛋白質(zhì)。吸附于吸附劑上的蛋白質(zhì)
在微堿性或較高改濃度條件下即可洗脫下來。
本實(shí)驗(yàn)用人造沸石從組織浸提液中吸附細(xì)胞色素C,除去雜蛋白,再以高鹽溶液
從人造沸石上將細(xì)胞色素C洗脫下來。這樣制得的粗制細(xì)胞色素C再經(jīng)透析除去鹽分
子,后用離子交換劑純化,獲得較純細(xì)胞色素C。
細(xì)胞色素C分為氧化型和還原型。在水溶液中,氧化型呈深紅色,最大吸收峰為
408nm,530nm和550nm。550nm波長處的摩爾俏光系數(shù)為0.9xl()4moL/m;還原型的水
溶液呈桃紅色,最大吸收峰為415nm,520nm和550nm。550nm處的磨爾消光系數(shù)為
2.77xl04moL/m?其中還原型最穩(wěn)定,實(shí)驗(yàn)中所獲得的細(xì)胞色素產(chǎn)品是氧化型和還原型
的混合物。經(jīng)氧化劑或還原劑處理,可變?yōu)閱我环N型。測定其中一種的光吸收,根據(jù)磨
爾消光系數(shù),即可計(jì)算出細(xì)胞色素C的含量。
細(xì)胞色素C在動物心肌和酵母中含量豐富,可作為實(shí)驗(yàn)材料。本實(shí)驗(yàn)以新鮮豬心臟
為材料。
三、實(shí)驗(yàn)儀器、材料和試劑
儀器:搗碎機(jī),離心機(jī),電動攪拌機(jī),可見分光光度計(jì),玻璃柱(2.5mx30m),透析袋,
紗布,聯(lián)二亞硫酸鍋。
原料:新鮮豬心。
試劑:
1.0.145mol/L三氯乙酸溶液:稱取三氯乙酸23.69g,溶于蒸儲水,最后定容至
lOOOmLo
2.0.065mol/LNa2HPO4~0.45mol/LNaCl溶液:稱取21.5gNa2HPO#12H2。,
23.4gNaCl,加蒸儲水使之溶解,定容至lOOOmLo
3.15mol/L氫氧化鉉
4.40%(w/v)三氯乙酸
5.25%(W/v)硫酸鉉
6.0.2%(W/V)NaCl
7.O.Olmol/L鐵氟化鉀溶液
8.連二亞硫酸鈉
9.人造沸石(Na20Al2O3:xSiO2-yH2O):為白色顆粒,不溶于水,溶于濃酸。選用
60—80目的顆粒,以水浸沒0.5h,除去15s不沉淀的細(xì)小顆粒,抽干備用。
再生方法:使用過的沸石,先用自來水洗去硫酸鍍,再用0.2moL/LNaOH和1moL
/LNaCl的等體積混合液洗滌沸石,重復(fù)幾次直至沸石變白為止。最后用蒸僧水洗滌至
pH為7~8,即可再次使用。
10.AmberliteIRC-50(H)樹脂處理:AmberliteIRC-50(H)以樹脂為母體,引入竣基形
成的弱酸型陽離子交換劑。使用前應(yīng)先將交換劑轉(zhuǎn)變?yōu)镹H2型。為此,取一定量的Amb
erliteIRC—50(H)(數(shù)量根據(jù)柱體積而定),用蒸鐳水浸泡過夜,傾倒去水,加入2倍體積
的2moi/LHC1溶液,60℃恒溫條件下電磁攪拌約lh,傾倒去鹽酸溶液,用無離子水洗
滌至中性;加入2倍體積的2moi/LNHQH溶液,60℃恒溫條件下攪拌lh,傾倒去氨溶
液,再用無離子水洗至中性。新樹脂需要重復(fù)處理兩次。若顆粒過大,最后一次在2mol/L
NFUOH存在下,用研缽輕輕研磨,傾倒去15s內(nèi)不沉降的顆粒,最終顆粒100-150目為
好。最后用無離子水洗至中性備用。
樹脂再生:用過的AmberliteIRC-50(H)先用無離子水洗,再用2moi/LNH40H洗滌,傾
倒堿水,用無離子水洗至近中性。加2mol/LHC1溶液在60℃條件下攪拌20min,傾去
酸溶液。用無離子水洗至中性。再用2moi/LNH40H溶液浸泡,然后用無離子水洗至中
性后即可使用。如長期不用,可用布氏漏斗抽干備用。
11.透析袋處理:商品透析袋是用人工合成的半透膜制成的管狀袋,規(guī)格很多。一
般以袋的半徑表示其規(guī)格。商品透析袋常常被重金屬鹽、蛋白醐及核酸酶污染。為了防
止被透析的生物大分子物質(zhì)失活,透析袋最好在堿性EDTA溶液(10g/LNa2cO3。
Imol/LEDTA)中煮沸30min。以除去酶和重金屬鹽,然后用蒸儲水煮拂洗滌6~7次,除
去堿和EDTA即可使用。經(jīng)處理的透析袋,只能用清潔的鑲子或戴上橡皮手套取拿,不
宜按用手操作,以防污染。濕的透析袋非常容易長霉,因此保存使用過的透析袋時(shí),最
好經(jīng)水洗滌后,再煮沸后備用或浸泡在含有微量苯甲酸的溶液里。
12.1x20cm層析柱。
13.絞肉機(jī)。
四'實(shí)驗(yàn)步驟
(~)細(xì)胞色素C的制備
1.材料處理
取新鮮或冰凍豬心,除盡脂肪、血管和韌帶,洗盡積血,切成小塊,放入搗碎機(jī)搗
碎。
2.提取
稱取500g絞碎的心肌肉放入大燒杯中,力U500mL0.145mol/L三氯乙酸溶液用玻璃
棒攪勻,室溫下放置,不時(shí)攪拌,浸提約2h。然后,用4層紗布分次壓濾,收集濾液。
用Imol/LNHQH溶液調(diào)節(jié)濾波的pH至6(用pH試紙檢查,pH過高或過低將影響以后
的過濾速度),再用濾紙過濾一次,收集濾液,此濾液應(yīng)清亮。
3.吸附粗分離
將上述所得的清亮濾液,用Imol/LNH40H溶液調(diào)至pH7.2(用酸度計(jì)檢測)。最后量
取濾液體積,按3g/100mL濾液計(jì)算稱取拂石,在不斷攪拌下加于濾液中,并持續(xù)攪拌
lh左右,使之充分吸附。在此過程中可見沸石由白色逐漸變?yōu)榉奂t色。吸附完畢,倒去
上層液體。余下的沸石先用約100mL蒸儲洗滌3~4次,再用100mL0.2%的NaCl溶液分
三次洗滌,最后用蒸儲水洗至上溶液澄清為止,倒去上清液。
4.洗脫
吸附在澇石上的細(xì)胞色素C用25%硫酸鍍液即可洗脫下來。洗脫時(shí)每次加
10mL25%硫酸鍍于沸石中反復(fù)攪拌,倒出洗脫液,再換新的25%硫酸鍍?nèi)芤?,直至?/p>
石變白為止。合并洗脫液,體積約為120mL。硫酸鍍洗脫后的沸石經(jīng)再生后回收備用。
5.鹽析及濃縮
按每100mL洗脫液加25g固體硫酸鏤計(jì)算,稱取固體硫酸鍍,在不斷攪拌下逐步
加于洗脫液中,靜置30~45min。以3000rpm離心lOmin,收集上清夜并量取體積,轉(zhuǎn)入
另一離心管中。沉淀?xiàng)壢?。在攪拌下向上清液中慢慢加?0%三氯乙酸溶液,直至產(chǎn)生
褐色絮狀沉淀為止。以3000rpm離心lOmin。棄上清夜,將離心管到置在濾紙上盡量吸
去上清液,即得細(xì)胞色素C粗提物。
6.透析
所得的細(xì)胞色素C粗提物中含有大量鹽類,在進(jìn)一步純化之前應(yīng)進(jìn)行脫鹽。本實(shí)驗(yàn)
中用透析法脫鹽。為此,在獲得的粗提物中加入2mL蒸儲水,使之溶解。取一段處理
好的、大小合適的透析袋,用夾子或線將一端封閉、并裝水檢查是否漏水。若不漏水,
倒出水后將溶解了的細(xì)胞色素C加入透析袋。加入的溶液體積一般為袋的2/3左右,過
滿在透析時(shí)容易脹破。裝好后應(yīng)擠壓趕出袋中的空氣,然后用夾子或線將口封閉,檢查
封口是否漏溶液,在表明透析袋兩端不漏溶液后,即將透析袋放入蒸儲水中,在電磁攪
拌器攪拌下透析。透析是一個(gè)物理平衡過程,通常要5~6h才能達(dá)到平衡。而且只用蒸
儲水透析一次是不可能完成透析的,因此要更換幾次蒸儲水,每次用奈氏試劑檢查透析
袋外液體,直至無氨離子為止。透析時(shí)間過長,為防止蛋白質(zhì)變性,透析應(yīng)在低溫(4℃)
條件下進(jìn)行。
7.純化
用離子交換層折法純化透析后的粗制品。將處理好的AmberliteIBC_50(NH2),裝入
1x20cm的層析袋中,使柱床高18cm左右。洗脫瓶中裝無離子水,沖洗離子交換柱,至
流出液的pH為7~8。關(guān)閉下口,吸去柱床面上的水,將透析后的粗制品加于柱床表面,
打開下口控制流速,使樣品慢慢進(jìn)入離子交換柱,讓樣品盡可能吸附在柱的上部,越集
中越好,洗脫時(shí)樣品易于集中,減少洗脫液體積。樣品加完后,柱床面上加一層水,用
無離了水繼續(xù)沖洗5~6min,流速為ImL/min,除去不吸附的雜質(zhì)。然后改用0.065mol/L
Na2HPO4~0.45mol/LNaCl溶液洗脫,控制流速為ImoL/min。用試管收集洗脫液,每管
10滴,直至洗脫液無色為止。合并洗脫液,量取總體積,此即為較純的細(xì)胞色素C產(chǎn)
品。洗脫液可進(jìn)一步在4c條件下對無離子水透析除鹽,用硝酸銀溶液檢查透析袋外溶
液,直至無氯離子為止。透析后如發(fā)生沉淀,則離心除去。上清液即為純的細(xì)胞色素C
溶液,可置冰箱保存,也可在低溫干燥成固體。
(-)細(xì)胞色素C的含量測定
制得的細(xì)胞色素C樣品是氧化型分子與還原型分子的混合物。測定其含量時(shí)要先用
氧化劑(鐵氟化鉀)將其全部轉(zhuǎn)變?yōu)檠趸?,或用還原劑(連二亞硫酸鈉)將其全部轉(zhuǎn)變?yōu)?/p>
還原型。然后在550nm波長處測得光密度值(OD),根據(jù)巳知氧化型或還原型細(xì)胞色素C
的摩爾消光系數(shù),即可計(jì)算出樣品中細(xì)胞色素C的含量。具體操作如下:
取1mL標(biāo)準(zhǔn)樣品(81mg/mL)用水稀釋至25mL,從中取0.2,0.4,0.6,0.8和1.0mL分
別放入5支試管中,每管補(bǔ)加蒸溜水至4mL,并加少許聯(lián)二亞硫酸銷作還原劑,然后在
波長550nm處測得各管的消光值(A550)計(jì)算得到的濃度值為橫坐標(biāo)、A值為縱坐標(biāo),作
出標(biāo)準(zhǔn)曲線圖。
取樣品1mL稀釋適當(dāng)倍數(shù),再取此稀釋液1mL,加水3mL,再加少許聯(lián)二硫酸鈉,
然后在波長550nm處測得A550值。
五、實(shí)驗(yàn)結(jié)果
根據(jù)所測得A520m值查標(biāo)準(zhǔn)曲線,得細(xì)胞色素C的濃度,即可計(jì)算出樣品原液
的濃度。在本實(shí)驗(yàn)中,每100g豬心碎肉應(yīng)獲得75mg以上的細(xì)胞色素C的粗制品。
注意事項(xiàng):
(1)盡量除盡豬心的非心肌組織,包括脂肪、血管、韌帶和積血。
(2)提取、中和過程中要注意調(diào)節(jié)pH值。吸附、洗脫步驟應(yīng)嚴(yán)格掌握流速。
(3)鹽析時(shí),加入團(tuán)體硫酸鈉要邊加邊攪拌,不要一次快速加入。
(4)逐滴加入三氯乙酸溶液,攪勻,加完后,盡快離心處理。
(5)注意要求透析袋不漏。
六、思考題
在進(jìn)行生物樣品的分離純化時(shí),為保證樣品的活性,通常需要注意哪些方面?
實(shí)驗(yàn)三蛋白質(zhì)的含量測定(紫外吸收法)
一'實(shí)驗(yàn)?zāi)康?/p>
掌握紫外吸收法測定蛋白質(zhì)濃度的原理及方法。
二'實(shí)驗(yàn)原理
由于蛋白質(zhì)中存在著含有共物雙鍵的酪氨酸和色氨酸,因此蛋白質(zhì)具有吸收紫外光
的性質(zhì),最大吸收峰在280nm波長處。在此波長范圍內(nèi),蛋白質(zhì)溶液的光密度OD280nm
與其濃度呈正比關(guān)系,可作定量測定。紫外吸收法測蛋白質(zhì)含量迅速、簡便、不消耗樣
品,低濃度鹽類不干擾測定。因此,已在蛋白質(zhì)和酶的生化制備中廣泛采用,尤其在柱
層析分離純化中,常用280nm進(jìn)行紫外檢測,來判斷蛋白質(zhì)吸附或洗脫情況。
三、實(shí)驗(yàn)儀器、材料和試劑
儀器:紫外分光光度計(jì),吸管,試管和試管架,容量瓶。
材料和試劑:
1.標(biāo)準(zhǔn)牛血清蛋白溶液:準(zhǔn)確稱取經(jīng)凱氏定氮法校正的結(jié)晶牛血清蛋白,配制成濃度為
1mg/mL的溶液。
2.待測蛋白質(zhì)溶液:實(shí)驗(yàn)一所制備,濃度為Img/mL左右的溶液。
四'實(shí)驗(yàn)步驟
1.標(biāo)準(zhǔn)曲線制作
按表1分別向每支試管內(nèi)加入各種試劑,混勻。以光程為1cm的石英比色杯,在
280nm波長處測定各管溶液的光密度值OD280nm。以蛋白質(zhì)濃度為橫坐標(biāo),光密度值
為縱坐標(biāo),繪出標(biāo)準(zhǔn)曲線。
表1蛋白質(zhì)標(biāo)準(zhǔn)曲線制作
標(biāo)準(zhǔn)蛋白質(zhì)溶液
管號蒸儲水(mL)蛋白質(zhì)濃度(mg/mL)OD280nm
(mL)
1040
20.53.50.125
31.03.00.25
42.02.00.50
53.01.00.75
64.001.0
2.樣品測定
取待測蛋白質(zhì)溶液1mL,加入蒸儲水3mL,混勻,按上述方法測定280nm的光密度,
并從標(biāo)準(zhǔn)工作曲線上查出待測蛋白質(zhì)溶液的濃度。
五'附注
在測定工作中,可以利用280nm及260nm的光密度值求出蛋白質(zhì)的濃度:
蛋白質(zhì)濃度(mg/mL)=1.45OD280nm—0.74OD260nm
式中的OD280nm是蛋白質(zhì)溶液在280nm下測得的光密度,OD260nm是蛋白質(zhì)溶液在
260nm下測得的光密度。
六、思考題
1.你了解幾種測定蛋白質(zhì)含量的方法,它們所根據(jù)的原理是什么?
[附1]蛋白質(zhì)的含量測定(考馬斯亮藍(lán)法)
一'實(shí)驗(yàn)?zāi)康?/p>
掌握考馬斯亮藍(lán)法測定蛋白質(zhì)濃度的原理及方法。
二'實(shí)驗(yàn)原理
此方法是1976年Bradform建立??捡R氏亮藍(lán)G-250在酸性溶液中為棕紅色,當(dāng)它
與蛋白質(zhì)通過疏水作用后,變成藍(lán)色,最大吸收波長從465nm轉(zhuǎn)移到595nm處,在一
定的范圍內(nèi),蛋白質(zhì)含量與595nm的吸光度成正比。
三、實(shí)驗(yàn)儀器、材料和試劑
儀器:紫外分光光度計(jì),吸管,試管和試管架,容量瓶。
材料和試劑:
1.考馬斯亮藍(lán)G-250染料試劑:稱100mg考馬斯亮藍(lán)G-250染料,溶于50mL95%的
乙醇后,再加入120mL85%的磷酸,用水稀釋至1L。
2.標(biāo)準(zhǔn)牛血清蛋白溶液:準(zhǔn)確稱取經(jīng)凱氏定氮法校正的結(jié)晶牛血清蛋白,配制成濃度為
Img/mL的溶液。
3.待測蛋白質(zhì)溶液:實(shí)驗(yàn)一所制備,濃度為Img/mL左右的溶液。
四'實(shí)驗(yàn)步驟
1.標(biāo)準(zhǔn)曲線制作
按下表操作配制系列濃度的蛋白質(zhì)標(biāo)準(zhǔn)品,分別取0.5mL系列濃度的蛋白質(zhì)標(biāo)準(zhǔn)
品,加入4mL的染色液,混勻后室溫放置15分鐘。
管標(biāo)準(zhǔn)蛋白質(zhì)溶蒸儲水蛋白質(zhì)濃考馬斯亮藍(lán)G-250
OD595nm
號液(mL)(mL)度(mg/mL)染色液(mL)
10404
20.53.50.1254
31.03.00.254
42.02.00.504
53.01.00.754
64.001.04
在595nm波長比色,讀出吸光度,以各管的標(biāo)準(zhǔn)蛋白濃度為橫坐標(biāo),以吸光度為縱坐標(biāo)
繪出標(biāo)準(zhǔn)曲線。
2.樣品測定
取待測蛋白質(zhì)溶液0.5mL,加入4mL的染色液,混勻后室溫放置15分鐘,并從標(biāo)
準(zhǔn)工作曲線上查出待測蛋白質(zhì)溶液的濃度。
五'附注
1.高濃度的Tris、EDTA、尿素、甘汕、蔗糖、丙酮等對測定有干擾。
2.顯色結(jié)果受時(shí)間與溫度影響較大,須注意保證樣品與標(biāo)準(zhǔn)的測定控制在同一條件
下進(jìn)行,因此,待測樣品與標(biāo)準(zhǔn)品同時(shí)測定。
3.考馬氏亮藍(lán)G-250染色能力很強(qiáng),特別要注意比色杯的清洗。
六、思考題
1.說明各種蛋白質(zhì)含量測定法中哪幾種可以測出蛋白質(zhì)的絕對含量,哪幾種只能測
定其相對含量,為什么?
實(shí)驗(yàn)四堿變性法提取質(zhì)粒DNA
一'實(shí)驗(yàn)?zāi)康?/p>
1.掌握堿裂解法提取質(zhì)粒的原理方法和各項(xiàng)基本技術(shù);
2.了解堿裂解法質(zhì)粒提取過程中各種純化步驟的設(shè)計(jì)思想。
二、實(shí)驗(yàn)原理
細(xì)菌質(zhì)粒是一類雙鏈、閉環(huán)的DNA,大小范圍從Ikb至200kb以上不等。各種質(zhì)粒
都是存在于細(xì)胞質(zhì)中、獨(dú)立于細(xì)胞染色體之外的自主復(fù)制的遺傳成份,通常情況下可持
續(xù)穩(wěn)定地處于染色體外的游離狀態(tài),但在一定條件下也會可逆地整合到寄主染色體上,
隨著染色體的復(fù)制而復(fù)制,并通過細(xì)胞分裂傳遞到后代。
質(zhì)粒已成為目前最常用的基因克隆的載體分子,重要的條件是可獲得大量純化的質(zhì)
粒DNA分子。目前已有許多方法可用于質(zhì)粒DNA的提取,本實(shí)驗(yàn)采用堿裂解法提取
質(zhì)粒DNA。堿裂解法是一種應(yīng)用最為廣泛的制備質(zhì)粒DNA的方法,其基本原理為:當(dāng)
菌體在NaOH和SDS溶液中裂解時(shí),蛋白質(zhì)與DNA發(fā)生變性,當(dāng)加入中和液后,質(zhì)粒
DNA分子能夠迅速復(fù)性,呈溶解狀態(tài),離心時(shí)留在上清中;蛋白質(zhì)與染色體DNA不
變性而呈絮狀,離心時(shí)可沉淀下來。純化質(zhì)粒DNA的方法通常是利用了質(zhì)粒DNA相
對較小及共價(jià)閉環(huán)兩個(gè)性質(zhì)。例如,氯化葩-澳化乙錠梯度平衡離心、離子交換層析、
凝膠過濾層析、聚乙二醇分級沉淀等方法,但這些方法相對昂貴或費(fèi)時(shí)。對于小量制備
的質(zhì)粒DNA,經(jīng)過苯酚、氯仿抽提,RNA酶消化和乙醇沉淀等簡單步驟去除殘余蛋白
質(zhì)和RNA,所得純化的質(zhì)粒DNA已可滿足細(xì)菌轉(zhuǎn)化、DNA片段的分離和酶切、常規(guī)
亞克隆及探針標(biāo)記等要求,故在分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室中常用。
三、實(shí)驗(yàn)儀器、材料和試劑
儀器:恒溫水浴培養(yǎng)箱,搖床,低溫超速離心機(jī),水浴鍋,冰水浴,電泳儀,穩(wěn)壓電源,
電爐,乳膠手套,紫外投射儀,照相裝置等。
材料和試劑:
1.含pUCl8-EGFP的E.collDH5a菌株。
2.LB液體培養(yǎng)基(Luria-Bertani):稱取蛋白陳(Tryptone)lOg,酵母提取物(Yeastextract)
5g,NaCl5g,溶于800mL去離子水中,用NaOH(lmol/L)調(diào)pH至7.5,加去離子水至
總體積1L,高壓下蒸氣滅菌20分鐘。
3.LB固體培養(yǎng)基:液體培養(yǎng)基中每升加12g瓊脂粉,高壓滅菌。
4.氨茶青霉素(Ampicillin,Amp)母液:配成50mg/mL水溶液,-20℃保存?zhèn)溆谩?/p>
5.溶液I:50mmol/L葡萄糖,25mmol/LTris-Cl(pH8.0),lOmmol/LEDTA(pH8.0)?
溶液I可成批配制,每瓶100mL,高壓滅菌15分鐘,儲存于4℃冰箱。
6.溶液H:0.2mol/LNaOH(臨用前用lOmol/LNaOH母液稀釋),1%SDS?
7.溶液in:5mol/LKAc60mL,冰醋酸11.5mL,H2O28.5mL,定容至100mL,并高
壓滅菌。
四、實(shí)驗(yàn)步驟
1.挑取單菌落接種于3mL含氨苦青霉素(70ng/mL)的LB液體培養(yǎng)基中,37℃搖床培
養(yǎng)過夜。
2.取1mL菌液于1.5mLEppendorf管中,3000r/min離心5分鐘,棄去上清液,濕菌體
在渦流混合器上振蕩均勻。
3.加入100似溶液I,搖勻。冰浴10分鐘。
4.加入200山溶液II,溫和振蕩,溶液變粘稠,而且清亮透明,冰浴10分鐘。
5.加入150Hl溶液ni,溫和振蕩,出現(xiàn)白色沉淀,冰浴10分鐘。
6.4℃10000r/min離心10分鐘,將上清液小心倒入另一個(gè)新Eppendorf管中,加入800pL
預(yù)冷的無水乙醇。-20°C冰箱中放置1小時(shí),沉淀DNA。
7.4℃10,000r/min離心10分鐘,棄去上清液,將Eppendorf管中所有液體揮發(fā)干凈。
8.加入20|aLTE緩沖液溶解DNA。
五、一些試劑的生化作用原理
1.溶液I
①葡萄糖:增加溶液的粘度,維持滲透壓,防止DNA受機(jī)械力作用而降解。
②EDTA:螯合Mg2\Ca2+等金屬離子,抑制DNase對DNA的降解作用。另外,
EDTA的存在,有利于溶菌酶的作用,因?yàn)槿芫傅姆磻?yīng)要求有較低的離子強(qiáng)度的環(huán)境。
2.溶液II
(l)NaOH:DNA在pH大于5、小于9的溶液中是穩(wěn)定的。但當(dāng)pH>12或pH<3時(shí),
就會引起雙鏈之間的氫鍵解離而變性。溶液II中的NaOH濃度為200mmol/L,加到提取
液中時(shí),該系統(tǒng)的pH就高達(dá)12.6,因而促使染色體DNA與質(zhì)粒DNA的變性。
(2)SDS:SDS是離子型表面活性劑。它主要功能是溶解細(xì)胞膜上的脂質(zhì)和蛋白,因而溶
解膜蛋白破壞細(xì)胞膜;解聚細(xì)胞中的核蛋白;SDS能與蛋白質(zhì)結(jié)合成為R-O-SCh—…R+—
蛋白質(zhì)復(fù)合物,使蛋白質(zhì)變性而沉淀下來。
3.溶液in
NaAc的水溶液呈堿性,為了調(diào)節(jié)pH至4.8,必須加入大量的冰醋酸,所以該溶液
實(shí)際上是NaAc-HAc的緩沖液。用pH4.8的NaAc是為了把pH12.6的提取液調(diào)回至pH
中性,使變性的質(zhì)粒DNA能夠復(fù)性,并穩(wěn)定存在。而高鹽的3moi/LNaAc可以中和核
酸上的電荷,減少相斥力,有利于變性的大分子染色體DNA、RNA互相聚合而沉淀下
來,同時(shí)鈉鹽與SDS-蛋白復(fù)合物作用后,能形成較小的鈉鹽形式復(fù)合物,使沉淀更完
全。
4.沉淀DNA
乙醇可以任意比例和水相混溶,乙醉與核酸不會起任何化學(xué)反應(yīng),對DNA很安全,
因此是理想的DNA沉淀劑。DNA溶液中DNA是以水合狀態(tài)穩(wěn)定存在的,當(dāng)加入乙醇
時(shí).,乙醇會奪去DNA周圍的水分子,使DNA失去水而易于聚合。
六'實(shí)驗(yàn)操作中注意的問題
1.該實(shí)驗(yàn)最重要的是去掉染色體DNA,在全部提取過程中,只有一次機(jī)會去除染
色體DNA,其關(guān)鍵步驟是加入溶液II和溶液HI時(shí),控制變性與復(fù)性操作時(shí)機(jī),既要使
試劑與染色體DNA充分作用使之變性,又要使染色體DNA不斷裂成小片段,從而能
與質(zhì)粒DNA相分離。這就要求試劑與溶菌液充分搖勻,搖動時(shí)用力要適當(dāng)。一般加入
溶液I時(shí)可用力振蕩幾次,因?yàn)榇藭r(shí)細(xì)菌還沒有與溶菌的完全作用,染色體DNA尚未
釋放出來,不必?fù)?dān)心其分子斷裂。加入SDS以后,必須注意不能過分用力振蕩,但又
必須保證溶液混合充分,可上下顛倒EP管數(shù)次,直至混勻。
2.加入溶液II5分鐘后,如果溶液不變粘稠時(shí),實(shí)驗(yàn)不能繼續(xù)做下去,要檢查所
用的試劑是否正確,數(shù)量是否符合,待找出原因改正后才可繼續(xù)進(jìn)行下去,否則,提取
到最后,將得不到質(zhì)粒DNA或收率極低。
3.加入乙醇沉淀DNA時(shí),要把離心管蓋上蓋子倒翻搖動幾次,注意觀察水相和乙
醇之間沒有分層現(xiàn)象之后,才可以放到冰箱中去沉淀DNA。
七、思考題
1.質(zhì)粒的基本性質(zhì)有哪些?
2.在堿法提取質(zhì)粒DNA操作過程中應(yīng)注意哪些問題?
實(shí)驗(yàn)五水平式瓊脂糖凝膠電泳法檢測DNA
一'實(shí)驗(yàn)?zāi)康?/p>
學(xué)習(xí)并掌握瓊脂糖凝膠電泳的原理和基本操作,通過DNA瓊脂糖凝膠電泳可知
DNA的純度、含量和相對分子質(zhì)量。
二、實(shí)驗(yàn)原理
瓊脂糖凝膠電泳是分子生物學(xué)中最常用的鑒定DNA的方法,它簡便易行,只需少
量DNA。DNA分子在瓊脂糖凝膠中涌動是由電荷效應(yīng)和分子篩效應(yīng),前者由分子所帶
電荷量的多少而定,后者則主要與分子大小及構(gòu)象有關(guān)。DNA分子在高于其等電點(diǎn)的
pH溶液中帶負(fù)電荷,在點(diǎn)場中向正極移動。由于糖一磷酸骨架在結(jié)構(gòu)上的重復(fù)性質(zhì),
相同數(shù)量的雙鏈DNA幾乎具有等量的凈電荷,因此它們能以同樣的速度向正極移動。
在一定的電場強(qiáng)度下,DNA分子的泳動速度取決于DNA分子大小和構(gòu)象。具有不同
相對分子質(zhì)量的DNA片段泳動速度不同,DNA分子的遷移速度與其相對分子質(zhì)量的
對數(shù)成反比。另外DNA分子的構(gòu)象也可影響其遷移速度,同樣相對分子質(zhì)量的DNA,
超螺旋共價(jià)閉環(huán)質(zhì)粒DNA(covalenllyclosedcircularDNA,cccDNA)遷移速度最快,線狀
DNA(linearDNA)其次,開環(huán)DNA(opencircularDNA,ccDNA)最慢。
觀察瓊脂糖凝膠中DNA的最簡便方法是利用熒光染料澳乙錠(ethidiumbromide,
簡稱EB)染色,EB分子是一種扁平分子,在紫外燈照射下,發(fā)出紅色熒光。當(dāng)DNA在
瓊脂糖凝膠中電泳時(shí),加入的EB就可以嵌入DNA雙鏈的堿基之間,形成一種熒光絡(luò)
合物,使發(fā)射的熒光增強(qiáng)幾十倍.而熒光的強(qiáng)度正比于DNA的含量,如將已知濃度的
標(biāo)準(zhǔn)樣品作電泳對照,就可估計(jì)出待測樣品的濃度。
瓊脂糖凝膠分離DNA的范圍較廣,用各種濃度的瓊脂糖凝膠可以分離長度為
200bp?50kb的DNA,見下表。
瓊脂糖的含量(%)分離線狀DNA分F的有小皰用(Kb)
0.35?6
0.61-20
0.70.8-10
0.90.5-7
1.20.4-6
1.50.2?4
綜上所述,通過DNA瓊脂糖凝膠電泳可知DNA的純度、含量和相對分子質(zhì)量。
三'實(shí)驗(yàn)儀器、材料及試劑
儀器:Eppendorf管,Tip,一次性手套,移液器,錐形瓶,燒杯,量筒,滴管,微波爐
(電熱恒溫水浴鍋),穩(wěn)壓電泳儀,紫外檢測儀,水平式電泳槽,水平儀,攝影設(shè)備。
材料及試劑:
1.pUC18-EGFP質(zhì)粒;入DNA/H比dIH分子量標(biāo)準(zhǔn)。
2.瓊脂糖(Agarose):進(jìn)口或國產(chǎn)的電泳用瓊脂糖均可。
3.5xTBE電泳緩沖液:稱取Tris54g,硼酸27.5g,并加入0.5MEDTA(pH8.0)20mL,
定溶至lOOOmLo
4.6x電泳載樣緩沖液:0.25%浸粉藍(lán),40%(w/v)蔗糖水溶液,貯存于4℃。
四、實(shí)驗(yàn)步驟
1.取5xTBE緩沖液20mL加水至200mL,配制成0.5xTBE稀釋緩沖液,待用。
2.膠液的制備:稱取0.4g瓊脂糖,置于200mL錐形瓶中,加入50mL0.5xTBE稀
釋緩沖液,放入微波爐里(或電爐上)加熱至瓊脂糖全部熔化,取出搖勻,此為0.8%瓊脂
糖凝膠液。加熱過程中要不時(shí)搖動,使附于瓶壁上的瓊脂糖顆粒進(jìn)入溶液。加熱時(shí)應(yīng)蓋
上封口膜,以減少水份蒸發(fā)。
3.膠板的制備:將有機(jī)玻璃膠槽兩端分別用橡皮膏(寬約1cm)緊密封住。將封好的
膠槽置于水平支持物上,插上樣品梳子,注意觀察梳子齒下緣應(yīng)與膠槽底面保持1mm
左右的間隙。
4.加樣:取lO^L酶解液與2pL6x載樣液混勻,用微量移液槍小心加入樣品槽中。
若DNA含量偏低,則可依上述比例增加上樣量,但總體積不可超過樣品槽容量。每加
完一個(gè)樣品要更換tip頭,以防止互相污染,注意上樣時(shí)要小心操作,避免損壞凝膠或
將樣品槽底部凝膠刺穿。
5.電泳:加完樣后,合上電泳槽蓋,立即接通電源??刂齐妷罕3衷?0-80V,電
流在40mA以上。當(dāng)澳酚藍(lán)條帶移動到距凝膠前沿約2cm時(shí),停止電泳。
6.染色:未加EB的膠板在電泳完畢后移入OSpig/mL的EB溶液中,室溫下染色
20-25分鐘。
7.觀察和拍照:在波長為254nm的長波長紫外燈下觀察染色后的或已加有EB的
電泳膠板。DNA存在處顯示出肉眼可辨的桔紅色熒光條帶。紫光燈下觀察時(shí)應(yīng)戴上防
護(hù)眼鏡或有機(jī)玻璃面罩,以免損傷眼睛。經(jīng)照相機(jī)鏡頭加上近攝鏡片和紅色濾光片后
將相機(jī)固定于照相架上,采用全色膠片,光圈5.6,曝光時(shí)間10-120秒(根據(jù)熒光條帶的
深淺選擇)。
8.DNA分子量標(biāo)準(zhǔn)曲線的制作:在放大的電泳照片上,以樣品槽為起點(diǎn),用卡尺
測量WNA的EcoRI和HindIII酶切片段的遷移距離,以厘米為單位。以核甘酸數(shù)的常
用對數(shù)為縱坐標(biāo),以遷移距離為橫坐標(biāo),在坐標(biāo)紙上繪出連結(jié)各點(diǎn)的平滑曲線,即為該
電泳條件下DNA分子量的標(biāo)準(zhǔn)曲線。
五、注意事項(xiàng):
1.EB是強(qiáng)誘變劑并有中等毒性,配制和使用時(shí)都應(yīng)戴手套,并且不要把EB灑到桌面
或地面上。凡是沾污了EB的容器或物品必須經(jīng)專門處理后才能清洗或丟棄。
2.當(dāng)EB太多,膠染色過深,DNA帶看不清時(shí),可將膠放入蒸儲水沖泡,30分鐘后再觀
察。
六、思考題
1.瓊脂糖凝膠電泳中DNA分子遷移率受哪些因素的影響?
實(shí)驗(yàn)六動物組織核糖核酸的制備及測定
一、實(shí)驗(yàn)?zāi)康?/p>
1.學(xué)習(xí)和掌握用苯酚法及鹽溶液法從動物組織提取核酸的原理及操作技術(shù);
2.練習(xí)從動物組織提取RNA,并鑒定純度。
二'實(shí)驗(yàn)原理
利用苯酚法可以直接從動物組織中提取RNA,組織勻漿用苯酚處理并離心后,RNA
即溶于上層被酚飽和的水層中,DNA和蛋白質(zhì)則留在酚層中,向水層加入乙醇后RNA
即呈白色絮狀沉淀析出。
三、實(shí)驗(yàn)步驟
1.稱取3克肝組織,剪成小塊,置于研缽中,加3-4滴90%的苯酚溶液后研磨,勻漿中
加入15mL水,轉(zhuǎn)移至三角燒瓶中,加10mL酚至三角燒瓶中。
2.室溫下劇烈振蕩45分鐘,于3000rpm離心20分鐘。
3.用吸管將上層液吸出,并加入1/2體積的氯仿-異戊醇,于低溫下振蕩20分鐘,以除
去提取液中的蛋白質(zhì),以2000rpm離心10分鐘,吸出上層清液,向上清液中加入醋酸
鉀粉末,使最后濃度大約為2%,裝入小燒杯后,一邊攪拌,一邊緩慢加入兩倍于上清
液體積的95%乙醇以沉淀RNA。
4.于冰浴中放置半小時(shí)后,以lOOOrpm離心5分鐘,沉淀再用少量75%乙醉洗滌1-2
次,收集沉淀,置于干燥器內(nèi)干燥,稱重。
5.測定A260/A280的值,應(yīng)大于1.85,若小于1.85,則說明含雜蛋白和DNA高了。
四'思考題
根據(jù)核酸在細(xì)胞內(nèi)的分布、存在方式及其特性,提取過程中采取了什么相應(yīng)的措施?
[附2]紫外吸收法測定核酸含量
原理
DNA和RNA都有吸收紫外光的性質(zhì),它們的吸收高峰在260nm波長處。吸收紫
外光的性質(zhì)是喋吟環(huán)和嘴咤環(huán)的共聊雙鍵系統(tǒng)所具有的,所以口票吟和喀咤以及一切含有
它們的物質(zhì),不論是核甘、核甘酸或核酸都有吸收紫外光的特性,核酸和核甘酸的摩爾
消光系數(shù)(或稱吸收系數(shù))用K(P)260nm來表示,K(P)260nm為每L溶液中含有1摩爾核酸磷
的光吸收值。RNA的K(P)260nm(pH7為7700~7800)。RNA的含磷量約為9.5%,因此每
mL溶液含IpigRNA的光吸收值相當(dāng)于0.022~0.024。小牛胸腺DNA鈉鹽的K(P)260nm(pH7)
為6600,含磷量為9.2%,因此每mL溶液含IpgDNA的鈉鹽光吸收值為0.020。
蛋白質(zhì)由于含有芳香氨基酸,因此也能吸收紫外光。通常蛋白質(zhì)的吸收高峰在280nm
波長處,在260nm處的吸收值公為核酸的十分之一或更低,故核酸樣品中蛋白質(zhì)含量較
低時(shí)對核酸的紫外測定影響不大。RNA的260nm與280nm吸收的比值在2.0以上;DNA
的260nm與280nm吸收的比值則在1.9左右。當(dāng)樣品中蛋臼質(zhì)含量較高時(shí)比值即下降。
操作方法
將樣品配制成每mL含5~50pg核酸的溶液,于紫外分光光度計(jì)上測定260nm和
280nm吸收值,計(jì)算核酸濃度和兩者吸收比值。
A
RM4濃度(〃g/mL)=—典-x稀釋倍數(shù)
0.024xZ,
DNA溶度/源)=x稀釋倍數(shù)
0.020x£
式中:460??,為260nm波長處光吸收讀數(shù);L為比色池的厚度一般為1或0.5cm;0.024
為每mL溶液內(nèi)含IggRNA的光吸收;0.020為每mL溶液內(nèi)含IggDNA鈉鹽時(shí)的光吸
收值。
[附3]二苯胺顯色法測定DNA含量
原理
脫氧核糖核酸中的2-脫氧核糖在酸性環(huán)境中與二苯胺試劑一起加熱產(chǎn)生藍(lán)色反應(yīng),
在595nm處有最大光吸收。DNA在40-400解范圍內(nèi),光吸收與DNA的濃度成正比。
在反應(yīng)液中加入少量乙醛,可以提高反應(yīng)靈敏度。除DNA外,脫氧木糖、阿拉伯糖也
有同樣反應(yīng)。其他多數(shù)糖類,包括核糖在內(nèi),一般無此反應(yīng)。
操作方法
一、DNA標(biāo)準(zhǔn)曲線的制定
取10支試管,分成2組,依次加入0.4、0.8、1.2、1.6和2.0mLDNA標(biāo)準(zhǔn)溶液。添
加蒸館水,使之都成2mL。另取2支試管,各加2mL蒸儲水作為對照。然后各加入4mL
二苯胺試劑,搖勻。于60℃恒溫水浴中保溫1小時(shí),冷卻后于595nm處進(jìn)行比色測定。
取兩管平均值,以DNA濃度為橫坐標(biāo),光吸收值為縱坐標(biāo),繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線。
二、樣品的測定
取2支試管,各加2mL待測液(內(nèi)含DNA應(yīng)在標(biāo)準(zhǔn)曲線的可測范圍之內(nèi))和4mL
二苯胺試劑,搖勻。其余操作同標(biāo)準(zhǔn)曲線的制作。
三、DNA含量的計(jì)算
根據(jù)測得的光吸收值,從標(biāo)準(zhǔn)曲線上查出相當(dāng)該光吸收值DNA的含量,按下式計(jì)
算出制品中DNA的百分含量:
DNA。/:待測液中測得的DNA/zg數(shù)
待測液中制品的〃g數(shù)
試劑和器材
試劑
1.DNA標(biāo)準(zhǔn)溶液(須經(jīng)定磷確定其純度):取小牛胸腺DNA鈉鹽以0.01mol/L氫氯化鈉溶
液配成200|ig/mL的溶液。
2.樣品待測液:準(zhǔn)確稱取DNA干燥制品以0.01mol/L氫氯化鈉溶液配成lOOpg/mL左右
的溶液。在測定RNA制品中的DNA含量時(shí),要求RNA制品的每mL待測液中至少含
有20圈DNA,才能進(jìn)行測定。
3.二苯胺試劑:使用前稱取1g重結(jié)晶二苯胺,溶于100mL分析純的冰乙酸中,再加入
10mL過氯酸(60%以上),混勻待用。臨用前加入lmL1.6%乙醛溶液。所配得試劑應(yīng)為
無色。
器材
1.分析天平2.恒溫水浴3.試管4.吸量管(2mL和5mL)5.分光光度計(jì)
實(shí)驗(yàn)七表達(dá)蛋白的SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳分析
一'實(shí)驗(yàn)?zāi)康?/p>
1.學(xué)習(xí)和掌握利用SDS-聚丙烯酰胺凝膠電泳法檢測基因工程菌目的蛋白質(zhì)的表達(dá);
2.掌握蛋白質(zhì)純度和分子量的測定。
二、實(shí)驗(yàn)原理
最廣泛使用的不連續(xù)緩沖系統(tǒng)最早是由Ornstein(1964)和Davis(1964)設(shè)計(jì)的,樣品
和濃縮膠中含Tris-HCl(pH6.8),上下槽緩沖液含Tris-甘氨酸(pH8.3),分離膠中含
Tris-HCl(pH8.8)o系統(tǒng)中所有組分都含有0.1%的SDS(LaemmLi,1970)。樣品和濃縮膠
中的氯離子形成移動界面的先導(dǎo)邊界而甘氨酸分子則組成尾隨邊界,在移動界面的兩邊
界之間是一電導(dǎo)較低而電位滴度較陡的區(qū)域,它推動樣品中的蛋白質(zhì)前移并在分離膠前
沿積聚。此處pH值較高,有利于甘氨酸的離子化,所形成的甘氨酸離子穿過堆集的蛋
白質(zhì)并緊隨氯離子之后,沿分離膠泳動。從移動界面中解脫后,SDS-蛋白質(zhì)復(fù)合物成一
電位和pH值均勻的區(qū)帶泳動穿過分離膠,并被篩分而依各自的大小得到分離。
SDS與蛋白質(zhì)結(jié)合后引起蛋白質(zhì)構(gòu)象的改變。SDS-蛋白質(zhì)復(fù)合物的流體力學(xué)和光學(xué)
性質(zhì)表明,它們在水溶液中的形狀,近似于雪茄煙形狀的長桶園棒,不同蛋白質(zhì)的SDS
復(fù)合物的短軸長度都一樣(約為18A,即1.8nm),而長軸則隨蛋白質(zhì)分子量成正比地變
化。這樣的SDS-蛋白質(zhì)復(fù)合物,在凝膠電泳中的遷移率,不再受蛋白質(zhì)原有電荷和形
狀的影響,而只是橢園棒的長度也就是蛋白質(zhì)分子量的函數(shù)。
由于SDS和疏基乙醇的作用,蛋白質(zhì)完全變性和解聚,解離成亞基或單個(gè)肽鏈,
因此測定的結(jié)果只是亞基或單條肽鏈的分子量。SDS聚丙烯酰胺凝膠的有效分離范圍取
決于用于灌膠的聚丙烯酰胺的濃度和交聯(lián)度。在沒有交聯(lián)劑的情況下聚合的丙烯酰胺形
成毫無價(jià)值的粘稠溶液,而經(jīng)雙丙烯酰胺交聯(lián)后凝膠的剛性和抗張強(qiáng)度都有所增加,并
形成SDS蛋白質(zhì)復(fù)合物必須通過的小孔。這些小孔的孔徑隨“雙丙烯酰胺?丙烯酰胺”
比率的增加而變小,比率接近1:20時(shí)孔徑達(dá)到最小值。SDS聚丙烯酰胺凝膠大多按“雙
丙烯酰胺?丙烯酰胺”為1:29配制,試驗(yàn)表明它能分離大小相差只有3%的蛋白質(zhì)。
凝膠的篩分特性取決于它的孔徑,而孔徑又是灌膠時(shí)所用丙烯酰胺和雙丙烯酰胺絕
對濃度的函數(shù)。用5?15%的丙烯酰胺所灌制凝膠的線性分離范圍如下表:
SDS聚丙烯酰胺凝膠的有效分離范圍
*丙烯酰胺濃度(%)線性分離范圍(kD)
1512?43
1016?68
7.536-94
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