江西省醫(yī)療大數(shù)據(jù)平臺技術規(guī)范 第四部分數(shù)據(jù)存儲規(guī)范_第1頁
江西省醫(yī)療大數(shù)據(jù)平臺技術規(guī)范 第四部分數(shù)據(jù)存儲規(guī)范_第2頁
江西省醫(yī)療大數(shù)據(jù)平臺技術規(guī)范 第四部分數(shù)據(jù)存儲規(guī)范_第3頁
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文檔簡介

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江西省醫(yī)療大數(shù)據(jù)平臺技術規(guī)范第四部分:數(shù)據(jù)存儲規(guī)范

1范圍

本規(guī)范規(guī)定了醫(yī)療大數(shù)據(jù)平臺中數(shù)據(jù)存儲的術語、定義進行約束,包含了醫(yī)療大數(shù)據(jù)主題層模型存

儲規(guī)范、開放表存儲、對象存儲、過程數(shù)據(jù)存儲、結構化數(shù)據(jù)存儲等技術要求。

本規(guī)范適用于醫(yī)療大數(shù)據(jù)平臺的設計、開發(fā)、選型和實施,可作為醫(yī)療大數(shù)據(jù)平臺建設時的評測依

據(jù)。

2規(guī)范性引用文件

下列文件中的內容通過文中的規(guī)范性引用而構成本文件必不可少的條款。其中,注日期的引用文件,

僅該日期對應的版本適用于本文件;不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改單)適用于本

文件。

GB/T18391.1—2009信息技術元數(shù)據(jù)注冊系統(tǒng)(MDR)第1部分:框架

GB/T34960.5—2018信息技術服務治理第5部分:數(shù)據(jù)治理規(guī)范

GB/T35294-2017信息技術科學數(shù)據(jù)引用

GB/T35295-2017信息技術大數(shù)據(jù)術語

WS445.1-2014電子病歷基本數(shù)據(jù)集第1部分:病歷概要

WS445.2-2014電子病歷基本數(shù)據(jù)集第2部分:門(急)診病歷

WS445.3-2014電子病歷基本數(shù)據(jù)集第3部分:門(急)診處方

WS445.4-2014電子病歷基本數(shù)據(jù)集第4部分:檢查檢驗記錄

WS445.5-2014電子病歷基本數(shù)據(jù)集第5部分:一般治療處置記錄

WS445.6-2014電子病歷基本數(shù)據(jù)集第6部分:助產(chǎn)記錄

WS445.7-2014電子病歷基本數(shù)據(jù)集第7部分:護理操作記錄

WS445.8-2014電子病歷基本數(shù)據(jù)集第8部分:護理評估與計劃

WS445.9-2014電子病歷基本數(shù)據(jù)集第9部分:知情告知信息

WS445.10-2014電子病歷基本數(shù)據(jù)集第10部分:住院病案首頁

WS445.11-2014電子病歷基本數(shù)據(jù)集第11部分:中醫(yī)住院病案首頁

WS445.12-2014電子病歷基本數(shù)據(jù)集第12部分:入院記錄

WS445.13-2014電子病歷基本數(shù)據(jù)集第13部分:住院病程記錄

WS445.14-2014電子病歷基本數(shù)據(jù)集第14部分:住院醫(yī)囑

WS445.15-2014電子病歷基本數(shù)據(jù)集第15部分:出院小結

WS445.16-2014電子病歷基本數(shù)據(jù)集第16部分:轉診(院)記錄

WS445.17-2014電子病歷基本數(shù)據(jù)集第17部分:醫(yī)療機構信息

WS446-2014居民健康檔案醫(yī)學檢驗項目常用代碼

WS/T447-2014基于電子病歷的醫(yī)院信息平臺技術規(guī)范

WS/T448-2014基于居民健康檔案的區(qū)域衛(wèi)生信息平臺技術規(guī)范

WS/T303-2009衛(wèi)生信息數(shù)據(jù)元標準化規(guī)則

WS/T304-2009衛(wèi)生信息數(shù)據(jù)模式描述指南

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WS/T305-2009衛(wèi)生信息數(shù)據(jù)集元數(shù)據(jù)規(guī)范

WS/T306-2009衛(wèi)生信息數(shù)據(jù)集分類與編碼規(guī)則

3術語和定義

GB/T18391.1—2009、GB/T34960.5—2018、GB/T35294-2017、GB/T35295-2017、WS445、WS446、

WS447、WS448界定的以及下列術語和定義適用于本文件。

3.1

主題層存儲

為實現(xiàn)數(shù)據(jù)解耦而設計的數(shù)據(jù)存儲方式,根據(jù)數(shù)據(jù)之間的依賴性和業(yè)務關聯(lián),進行數(shù)據(jù)主題域劃分,

降低使用時數(shù)據(jù)跨表查詢復雜度。

3.2

結構化數(shù)據(jù)存儲

面向海量分析型數(shù)據(jù)的存儲方式,支持標準SQL接口,采用基于分布式計算的數(shù)據(jù)倉庫技術,可以

實現(xiàn)數(shù)據(jù)的分布式存儲和處理,以及大數(shù)據(jù)挖掘分析。

3.3

實時數(shù)據(jù)存儲

面向實時性、海量的流式數(shù)據(jù)的存儲方式,采用分布式流式處理技術,可以實現(xiàn)實時流式數(shù)據(jù)存儲

和處理。

3.4

對象數(shù)據(jù)存儲

面向醫(yī)療影像數(shù)據(jù)、文本文件、json對象、XML文件等對象數(shù)據(jù)的存儲方式,采用分布式的、面向

列的、多維的NoSQL數(shù)據(jù)庫系統(tǒng),可以實現(xiàn)對像數(shù)據(jù)的快速檢索和存儲。

4縮略語

下列縮略語適用于本文件:

——TTL:TimeToLive(生存時間價值);

——MPP:MassivelyParallelProcessing(大規(guī)模并行處理技術);

——SDK:SoftwareDevelopmentKit(軟件開發(fā)工具包);

——API:ApplicationProgrammingInterface(應用程序接口);

——ETL:Extract-Transform-Load(抽取、轉換、加載);

——HDFS:HadoopDistributedFileSystem(分布式文件系統(tǒng));

——Redis:RemoteDictionaryServer(遠程字典服務);

——SQL:StructuredQueryLanguage(結構化查詢語言)。

5數(shù)據(jù)存儲規(guī)范

2

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5.1數(shù)據(jù)存儲架構

由于醫(yī)療大數(shù)據(jù)平臺需要存儲的數(shù)據(jù)量大、類別多且復雜,在存儲時應采用分層分域的存儲架構,

降低數(shù)據(jù)之間的耦合性,應建立包含主題層、匯總層、應用層的數(shù)據(jù)存儲架構。

主題層是在接口層采集的原始數(shù)據(jù)基礎上進行主題劃分,形成關聯(lián)性強的主題域表,應包括但不限

于:

——病人信息;

——就診信息;

——醫(yī)囑信息;

——費用;

——診斷;

——過敏;

——檢查;

——檢驗;

——手術;

——護理;

——病案;

——病歷文書;

——腫瘤;

——報告卡;

——體檢;

——其他。

匯總層是在主題層基礎上,根據(jù)不同數(shù)據(jù)使用需求,對不同粒度的數(shù)據(jù)進行一定匯總處理,提高數(shù)

據(jù)使用效率,便于后續(xù)使用。其設計應滿足如下原則:

——應保障匯總數(shù)據(jù)的共用性;

——應能夠提高數(shù)據(jù)使用效率;

——應與原始事實表維度保持一致;

應用層是在匯總層基礎上,通過構建指標集、標簽集、應用寬表等數(shù)據(jù)存儲形式,以滿足各類數(shù)據(jù)

應。其在醫(yī)療機構主要支撐建立科研大數(shù)據(jù)應用平臺、人工智能應用平臺、運營管理系統(tǒng)等基于大數(shù)據(jù)

的智慧應用。

5.2醫(yī)療大數(shù)據(jù)主題層數(shù)據(jù)表存儲目錄

5.2.1數(shù)據(jù)標準化

5.2.1.1原則

醫(yī)療數(shù)據(jù)中心中的醫(yī)療數(shù)據(jù)應遵循統(tǒng)一的數(shù)據(jù)標準并優(yōu)先采用國家、衛(wèi)生行業(yè)已經(jīng)制定的相關數(shù)據(jù)

標準作為基準,對非標準數(shù)據(jù)進行轉換處理。若沒有相應的國家或衛(wèi)生行業(yè)數(shù)據(jù)標準可以引用,應按照

國家衛(wèi)生信息標準制定的有關要求完成數(shù)據(jù)標準制定工作。

5.2.1.2通用電子病歷數(shù)據(jù)標準

對于醫(yī)療機構的主要業(yè)務斷面和相關數(shù)據(jù),應符合WS445-2014(所有部分)《電子病歷基本數(shù)據(jù)

集》里的有關規(guī)定。

5.2.1.3未標準數(shù)據(jù)的標準化

3

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對于國家或者衛(wèi)生行業(yè)尚未制定標準的數(shù)據(jù),醫(yī)療大數(shù)據(jù)平臺數(shù)據(jù)集應按照WS/T303-2009、WS/T

304-2009、WS/T305-2009、WS/T306-2009的要求形成標準化數(shù)據(jù)元,并按照附錄A要求構建數(shù)據(jù)集

及標準化存儲。

5.3結構化數(shù)據(jù)存儲技術要求

結構化數(shù)據(jù)存儲計算面向的是從結構化數(shù)據(jù)庫采集的海量數(shù)據(jù),主要應用于海量結構化數(shù)據(jù)分析,

應用時需滿足以下技術要求:

——結構化數(shù)據(jù)存儲應基于MPP架構實現(xiàn)分布式列式數(shù)據(jù)倉庫;

——應提供標準的SQL接口,減少傳統(tǒng)數(shù)據(jù)應用遷移成本,降低開發(fā)運維人員使用門檻;

——應提供準實時的數(shù)據(jù)插入,以滿足用戶對實時數(shù)據(jù)的實時交互式分析;

——應提供壓縮存儲,以有效節(jié)約存儲成本,并基于分布式文件系統(tǒng)的多副本機制實現(xiàn)數(shù)據(jù)安全

存儲;

——應提供基于多種編程語言(如python、R、Java等)編寫的Map/Reduce程序或自定義函數(shù)的

上傳接口,支持定制化數(shù)據(jù)處理需求;

——應支持多租戶管理,便于將大數(shù)據(jù)平臺計算存儲資源進行合理劃分,提高資源使用效率;

——應支持多種計算引擎(如HiveSQL、Spark算子、SparkSQL、Map/Reduce等計算引擎)。

5.4實時數(shù)據(jù)存儲技術要求

實時數(shù)據(jù)存儲主要應用于接收醫(yī)療生命體征監(jiān)測儀器、物聯(lián)網(wǎng)可穿戴設備采集的海量實時數(shù)據(jù),由

于需要的數(shù)據(jù)吞吐能力、處理能力更高,傳統(tǒng)數(shù)據(jù)庫及處理方式難以滿足需求,實時數(shù)據(jù)存儲應基于當

前流行的開源大數(shù)據(jù)處理技術,實現(xiàn)分布式流數(shù)據(jù)處理服務,使其具有高可靠、高可用、高性能和動態(tài)

擴展的特性,以滿足醫(yī)療大數(shù)據(jù)的存儲要求,應用時需滿足以下技術要求:

——應集成通信網(wǎng)關實現(xiàn)數(shù)據(jù)采集,并通過數(shù)據(jù)采集網(wǎng)關對接多種醫(yī)療/可穿戴監(jiān)測設備,實現(xiàn)設

備海量數(shù)據(jù)的自動存??;

——應提供實時數(shù)據(jù)和歷史數(shù)據(jù)的存儲服務,兩者均應采用分布式架構,以滿足海量數(shù)據(jù)的存儲;

——應通過分布式消息隊列和分布式流式計算框架,以確保數(shù)據(jù)得到快速處理。

5.5對象數(shù)據(jù)存儲技術要求

對象數(shù)據(jù)存儲技術底層是基于分布式的、面向列的、多維的NoSQL數(shù)據(jù)庫系統(tǒng),它具備高容錯性和

高可擴展性。傳統(tǒng)的關系型數(shù)據(jù)庫,如Oracle和MySQL等,如果數(shù)據(jù)記錄在億級別,則查詢和寫入的性

能都會呈指數(shù)級下降,所以更大的數(shù)據(jù)量級并不適用于傳統(tǒng)數(shù)據(jù)庫,而對象數(shù)據(jù)存儲技術對于存儲百億、

千億甚至更多的數(shù)據(jù)都不存在任何問題。應用時需滿足以下技術要求:

——對象數(shù)據(jù)存儲應提供海量、安全和高可靠的云端對象存儲服務,以解決海量圖片文件的存儲

與檢索問題;

——應支持多租戶模式,為每個租戶提供獨立的底層表存儲,租戶之間應相互隔離;

——應提供基本的分類管理功能,每個租戶應可創(chuàng)建若干個不同的Bucket,不同的Bucket存儲不

同類型或用途的對象文件;

——每個Bucket中存儲的Object數(shù)據(jù)對象,應以Object和Bucket的名稱作為單行記錄主鍵,

并以此作為檢索條件;

——每個Bucket中應支持存儲百億級的Object;

——存儲Object在縱向維度上支持的數(shù)據(jù)量級應能彈性擴展;

——用戶應可通過調用API,在任何應用、任何時間及任何地點上傳和下載圖片數(shù)據(jù),也可通過

Web控制臺管理界面對數(shù)據(jù)進行管理;

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——存儲在對象存儲中的圖片文件,應可直接通過圖片鏈接方式進行分享;

——用戶應可直接將圖片鏈接嵌入至HTML頁面,并作為頁面的組成部分進行發(fā)布。

5.6數(shù)據(jù)存儲安全技術要求

為保障大數(shù)據(jù)平臺數(shù)據(jù)存儲安全,應按照數(shù)據(jù)分級分類原則制定不同等級的安全策略,實施時需滿

足以下技術要求:

——數(shù)據(jù)存儲應支持多副本備份,保障數(shù)據(jù)存儲安全;

——涉及數(shù)據(jù)分級分類的,宜按照GB∕T39725-2020信息安全技術健康醫(yī)療數(shù)據(jù)安全指南執(zhí)行;

——涉及網(wǎng)絡和系統(tǒng)安全的,宜按照GB/T22081-2016、GB/T22239-2019執(zhí)行;

——涉及基礎安全和數(shù)據(jù)服務安全的,宜按照GB/T35274-2017執(zhí)行;

——涉及云計算安全的,宜按照GB/T31168執(zhí)行;

——應建立數(shù)據(jù)存儲安全應急處置方案,以應對數(shù)據(jù)存儲突發(fā)情況,快速恢復備份數(shù)據(jù);

——數(shù)據(jù)存儲應按照最小權限原則管理,對各數(shù)據(jù)使用用戶進行權限管理,降低數(shù)據(jù)泄露風險。

5.7數(shù)據(jù)存儲管理要求

5.7.1數(shù)據(jù)存儲管理包括數(shù)據(jù)的分類和標準的命名方法,數(shù)據(jù)的存儲、數(shù)據(jù)的保密規(guī)范和數(shù)據(jù)的備份

要求等。

5.7.2管理要求應包括以下內容:

——應指定專人負責數(shù)據(jù)的管理,明確職責;安排專人負責涉密數(shù)據(jù)資源的傳輸、存儲、共享和

使用;

——應對存儲數(shù)據(jù)的設備及基礎設施重點做好安全防護,包括落實數(shù)據(jù)存儲設備的操作終端安全

管控措施及接入鑒權機制;

——應設置訪問控制策略,定期實施安全風險評估,配置安全基線、部署必要的安全存儲技術手

段等;

——應對不同安全等級的數(shù)據(jù)采用差異化安全存儲;

——應根據(jù)數(shù)據(jù)備份制度和策略,按照操作規(guī)程進行系統(tǒng)和數(shù)據(jù)日常備份,在出現(xiàn)異常時根據(jù)備

份策略進行恢復操作;

——應根據(jù)維護計劃定期進行數(shù)據(jù)資源目錄、數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)維護;

——應加強數(shù)據(jù)備份介質的管理,對各類介質進行控制和保護;

——應根據(jù)所承載的數(shù)據(jù)和軟件的重要程度對介質實行分類和標識,并實行存儲環(huán)境專人管理。

5

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A

A

附錄A

(規(guī)范性)

醫(yī)療大數(shù)據(jù)主題層數(shù)據(jù)表存儲目錄

表A.1HDR(HospitalDataRepository)表集合

業(yè)務域表名描述

organization機構信息

company公司信息

standard_system標準系統(tǒng)信息

system系統(tǒng)信息

patient_id_type病人標識類型表

standard_class基準分類表

code_domain代碼域

code_system代碼系統(tǒng)表

code_set通用代碼集合

code_map通用代碼對照表

department科室信息

dept_category科室分類表

mdm(主數(shù)據(jù))employee員工信息

medical_group醫(yī)療組信息

medical_group_empl醫(yī)療組人員

drug藥品字典

item項目字典表

order_item_class開單項目分類表

order_item_relationship開單項目關系表

diagnose診斷字典表

operation手術字典表

bed床位字典表

lis_item檢驗項目信息

lis_item_map檢驗項目對照表

mdm_map主數(shù)據(jù)對照表

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unit_conversion單位轉換表

mdm_drug_property森億藥品屬性表

mdm_drug_map藥品標準化對照表

patient_master_info病人主信息

patient_identifier病人標識信息

patient(病人信息)

patient_id_relationship病人標識關系表

patient_base_info病人基本信息

visit_record就診總表

outpatient_record門診就診記錄

visit(就診信息)inpat_record住院就診記錄

inpat_baby_info住院嬰兒信息

inpat_shift_dept住院轉科記錄

outpat_recipe門診處方

outpat_recipe_detail門診處方明細

orders(醫(yī)囑信息)

inpat_drug_order住院用藥醫(yī)囑

inpat_undrug_order住院非藥品醫(yī)囑

outpat_fee門診費用匯總表

outpat_fee_detail門診費用明細表

fee(費用)

inpat_balance住院結算表

inpat_fee_detail住院費用明細表

diag(診斷)patient_diagnose病人診斷記錄

allergy(過敏)patient_allergy病人過敏記錄

radiology_report放射學報告

radiology_report_item放射學報告檢查項目

ecg_report心電報告

ecg_result_detail心電報告結果明細

checks(檢查)

ecg_report_item心電報告檢查項目

endoscopy_report內窺鏡報告

endoscopy_report_item內窺鏡報告檢查項目

ultrasound_report超聲報告

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ultrasound_report_item超聲報告檢查項目

ultrasound_result_detail超聲報告檢查結果報告

pathology_report病理報告

pathology_report_item病理報告檢查項目

other_report其他檢查報告

other_report_item其他檢查報告檢查項目

lab_report檢驗報告

lab_report_result檢驗報告結果

microbe_report微生物報告

bacteria_result細菌結果

lab(檢驗)

antibiotic_result藥敏結果

lab_result_show檢驗結果展示表

lis_report_item檢驗報告項目

microbe_report_item微生物報告項目

preoperative_visit_record術前訪視記錄

operation_record手術記錄

operation_employee手術人員

operation_detail手術明細

operation_diagnose手術診斷明細

operation(手術)

operation_document手麻文書

operation_document_detail手術文書數(shù)據(jù)明細

anesthesia_record麻醉記錄

operation_vital_sign手術體征記錄

operation_event手術事件

vital_sign體征記錄

nurse(護理)nurse_record_sheet護理記錄單

nurse_data_record護理數(shù)據(jù)記錄

case_base病案首頁

cases(病案)

case_diagnose病案診斷表

8

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case_operation病案手術表

case_baby病案嬰兒表

inpat_medical_record住院病歷

nurse_record

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