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文檔簡(jiǎn)介
ICS11.020
C62
DB32
江蘇省地方標(biāo)準(zhǔn)
DB32/T3762.11—2020
新型冠狀病毒檢測(cè)技術(shù)規(guī)范
第11部分:全基因組高通量測(cè)序
TechnicalspecificationsforSARS-CoV-2detection
Part11:Wholegenomehigh-throughputsequencing
2020-07-29發(fā)布2020-07-30實(shí)施
江蘇省市場(chǎng)監(jiān)督管理局發(fā)布
DB32/T3762.11—2020
新型冠狀病毒檢測(cè)技術(shù)規(guī)范第11部分:全基因組高通量測(cè)序
1范圍
本部分規(guī)定了新型冠狀病毒全基因組高通量測(cè)序的環(huán)境與設(shè)施、設(shè)備與耗材、試劑、樣本前處理與
核酸提取、全基因組測(cè)序、結(jié)果分析。
本部分適用于新型冠狀病毒全基因組高通量測(cè)序。
2規(guī)范性引用文件
下列文件對(duì)于本文件的應(yīng)用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,僅注日期的版本適用于本文件。
凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改單)適用于本文件。
GB19489實(shí)驗(yàn)室生物安全通用要求
新型冠狀病毒實(shí)驗(yàn)室生物安全指南中華人民共和國(guó)國(guó)家衛(wèi)生健康委員會(huì)
醫(yī)療機(jī)構(gòu)臨床基因擴(kuò)增管理辦法原衛(wèi)生部辦公廳
醫(yī)療機(jī)構(gòu)臨床基因擴(kuò)增檢驗(yàn)實(shí)驗(yàn)室工作導(dǎo)則原衛(wèi)生部檢驗(yàn)中心
國(guó)家衛(wèi)生計(jì)生委對(duì)高通量測(cè)序試點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室的要求原國(guó)家衛(wèi)生計(jì)生委
3術(shù)語(yǔ)和定義
下列術(shù)語(yǔ)和定義適用于本文件
3.1
全基因組測(cè)序wholegenomesequencing
對(duì)生物體整個(gè)基因組序列進(jìn)行測(cè)定,以獲得完整的基因組信息。
3.2
高通量測(cè)序high-throughputsequencing
能一次并行對(duì)幾十萬(wàn)到幾百萬(wàn)條DNA分子進(jìn)行序列測(cè)定的技術(shù),又稱“下一代”測(cè)序
("next-generation"sequencing)或深度測(cè)序(deepsequencing)技術(shù)。
3.3
Reads
高通量測(cè)序平臺(tái)產(chǎn)生的序列稱為reads,即測(cè)序讀到的堿基序列片段,是測(cè)序的最小單位。
3.4
測(cè)序深度sequencingdepth
測(cè)序得到的總堿基數(shù)與待測(cè)基因組大小的比值。
1
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3.5
測(cè)序覆蓋度sequencingcoverage
測(cè)序得到的序列占整個(gè)基因組的比例。
4環(huán)境與設(shè)施
4.1實(shí)驗(yàn)室資質(zhì)及級(jí)別要求
應(yīng)符合《新型冠狀病毒實(shí)驗(yàn)室生物安全指南》的要求,未經(jīng)培養(yǎng)的感染性材料的操作在采用可靠的
方法滅活前進(jìn)行核酸提取及臨床樣本的滅活等操作,應(yīng)在生物安全二級(jí)實(shí)驗(yàn)室(BSL-2)進(jìn)行,同時(shí)采
用生物安全三級(jí)實(shí)驗(yàn)室(BSL-3)的個(gè)人防護(hù);感染性材料或活病毒在采用可靠方法滅活后進(jìn)行的核酸
檢測(cè)操作應(yīng)在BSL-2進(jìn)行。cDNA制備后的相關(guān)操作可在生物安全一級(jí)實(shí)驗(yàn)室(BSL-1)進(jìn)行。全基因組
測(cè)序?qū)嶒?yàn)室應(yīng)符合GB19489、《國(guó)家衛(wèi)生計(jì)生委對(duì)高通量測(cè)序試點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室的要求》、《醫(yī)療機(jī)構(gòu)臨床
基因擴(kuò)增管理辦法》、《醫(yī)療機(jī)構(gòu)臨床基因擴(kuò)增檢驗(yàn)實(shí)驗(yàn)室工作導(dǎo)則》相關(guān)要求。
4.2操作人員資質(zhì)及防護(hù)要求
實(shí)驗(yàn)操作人員應(yīng)經(jīng)過(guò)生物安全培訓(xùn)并取得實(shí)驗(yàn)活動(dòng)上崗證,在身體健康狀態(tài)良好的情況下準(zhǔn)入。樣
本制備及核酸提取防護(hù)參照DB32/T3762.3的第4章進(jìn)行,測(cè)序相關(guān)操作采用BSL-1的個(gè)人防護(hù)。
5設(shè)備與耗材
5.1設(shè)備
PCR擴(kuò)增儀、核酸提取儀、核酸定量?jī)x、高通量測(cè)序儀。
5.2耗材
微量移液器及各種配套帶濾芯Tip頭、96孔板磁力架、1.5mLEP管、0.2mL8聯(lián)排管、96孔PCR板。
6試劑
核酸提取試劑盒、核酸定量試劑盒、第一鏈cDNA合成試劑盒、隨機(jī)六聚體引物、經(jīng)驗(yàn)證可靠的適
合多重反應(yīng)的PCR擴(kuò)增試劑盒、DNA純化磁珠、文庫(kù)制備試劑盒、高通量測(cè)序試劑盒。
7樣本前處理與核酸提取
參照DB32/T3762.3的第7章進(jìn)行。
8模板制備
8.1cDNA制備
以提取的核酸為模板,采用第一鏈cDNA合成試劑盒和隨機(jī)六聚體引物,根據(jù)試劑盒說(shuō)明書在PCR
擴(kuò)增儀上制備第一鏈cDNA。
2
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8.2混合引物
8.2.1將所有擴(kuò)增引物(附錄A)配置為100μM儲(chǔ)存濃度,將49對(duì)Pool1的引物各取5μL混勻,得
490μLPool1引物池(引物總濃度為100μM),同樣將49對(duì)Pool2的引物各取5μL混勻,得490μLPool
2引物池(引物總濃度為100μM)。
8.2.2以去離子水分別將Pool1和Pool2引物池作10倍稀釋,使其引物總濃度均為10μM,分裝后儲(chǔ)
存以防止污染和降解。
8.3多重PCR擴(kuò)增
8.3.1采用PCR擴(kuò)增試劑盒,根據(jù)試劑盒說(shuō)明書配置多重PCR擴(kuò)增體系,反應(yīng)體系中每一條引物的
終濃度為0.015μM,Pool1和Pool2各配置一套擴(kuò)增體系,每25μL反應(yīng)體系中加入2μLcDNA模板。
8.3.2按以下參數(shù)進(jìn)行PCR擴(kuò)增:98℃30s;98℃15s,65℃5min,擴(kuò)增30循環(huán);4℃hold。
8.4PCR產(chǎn)物的純化
8.4.1將每一份樣本的Pool1擴(kuò)增產(chǎn)物和Pool2擴(kuò)增產(chǎn)物混合于新的8聯(lián)排PCR管或96孔PCR板中。
8.4.2采用DNA純化磁珠法對(duì)混合后的擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行純化,以30μLTEbuffer(10mMtris-HClpH8.0,
0.1mMEDTA)洗脫純化后的產(chǎn)物。
9DNA文庫(kù)構(gòu)建
9.1純化產(chǎn)物的定量與標(biāo)化
使用核酸定量試劑盒對(duì)純化產(chǎn)物進(jìn)行雙鏈DNA定量,根據(jù)所使用建庫(kù)試劑盒說(shuō)明對(duì)其進(jìn)行標(biāo)化。
9.2DNA文庫(kù)制備與混合
根據(jù)所使用的建庫(kù)試劑盒說(shuō)明書進(jìn)行文庫(kù)制備、定量和文庫(kù)混合。
10上機(jī)測(cè)序
根據(jù)高通量測(cè)序試劑盒和高通量測(cè)序儀操作說(shuō)明完成試劑裝載,設(shè)置測(cè)序參數(shù)進(jìn)行測(cè)序。
11結(jié)果分析
可采用不同的生物信息學(xué)軟件進(jìn)行測(cè)序結(jié)果的分析:首先去除測(cè)序數(shù)據(jù)中的PCR引物序列(按照最
大引物長(zhǎng)度30bp進(jìn)行Trim)和低質(zhì)量的Reads,然后以SARS-CoV-2參考基因組(GeneBank號(hào):
MN908947.3)為模板進(jìn)行序列mapping,mapping之后對(duì)測(cè)序覆蓋度和測(cè)序深度進(jìn)行分析,最終生成一
致性(consensus)序列,即為待測(cè)樣本的全基因組序列。
3
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AA
附錄A
(規(guī)范性附錄)
多重PCR擴(kuò)增引物序列
序號(hào)引物名稱所屬引物池引物序列(5′-3′)長(zhǎng)度
1nCoV-2019_1_LEFTPool1ACCAACCAACTTTCGATCTCTTGT24
2nCoV-2019_1_RIGHTPool1AAGTGCCATCTTTAAGATGTTGACG25
3nCoV-2019_2_LEFTPool2CTGTTTTACAGGTTCGCGACGT22
4nCoV-2019_2_RIGHTPool2TAAGGATCAGTGCCAAGCTCGT22
5nCoV-2019_3_LEFTPool1CGGTAATAAAGGAGCTGGTGGC22
6nCoV-2019_3_RIGHTPool1AAGGTGTCTGCAATTCATAGCTCT24
7nCoV-2019_4_LEFTPool2GGTGTATACTGCTGCCGTGAAC22
8nCoV-2019_4_RIGHTPool2CACAAGTAGTGGCACCTTCTTTAGT25
9nCoV-2019_5_LEFTPool1TGGTGAAACTTCATGGCAGACG22
10nCoV-2019_5_RIGHTPool1ATTGATGTTGACTTTCTCTTTTTGGAGT28
11nCoV-2019_6_LEFTPool2GGTGTTGTTGGAGAAGGTTCCG22
12nCoV-2019_6_RIGHTPool2TAGCGGCCTTCTGTAAAACACG22
13nCoV-2019_7_LEFTPool1ATCAGAGGCTGCTCGTGTTGTA22
14nCoV-2019_7_RIGHTPool1TGCACAGGTGACAATTTGTCCA22
15nCoV-2019_8_LEFTPool2AGAGTTTCTTAGAGACGGTTGGGA24
16nCoV-2019_8_RIGHTPool2GCTTCAACAGCTTCACTAGTAGGT24
17nCoV-2019_9_LEFTPool1TCCCACAGAAGTGTTAACAGAGGA24
18nCoV-2019_9_RIGHTPool1TTTATGACAGCATCTGCCACAA22
19nCoV-2019_10_LEFTPool2TGAGAAGTGCTCTGCCTATACAGT24
20nCoV-2019_10_RIGHTPool2TCATCTAACCAATCTTCTTCTTGCTCT27
21nCoV-2019_11_LEFTPool1GGAATTTGGTGCCACTTCTGCT22
22nCoV-2019_11_RIGHTPool1TCATCAGATTCAACTTGCATGGCA24
23nCoV-2019_12_LEFTPool2AAACATGGAGGAGGTGTTGCAG22
24nCoV-2019_12_RIGHTPool2TTCACTCTTCATTTCCAAAAAGCTTGA27
25nCoV-2019_13_LEFTPool1TCGCACAAATGTCTACTTAGCTGT24
26nCoV-2019_13_RIGHTPool1ATAACCACAGCAGTTAAAACAC22
27nCoV-2019_14_LEFTPool2CATCCAGATTCTGCCACTCTTGT23
28nCoV-2019_14_RIGHTPool2AGTTTCCACACAGACAGGCATT22
29nCoV-2019_15_LEFTPool1ACAGTGCTTAAAAAGTGTAAAAGTGCC27
30nCoV-2019_15_RIGHTPool1AGAAACAGAAACTGTAGCTGGC22
31nCoV-2019_16_LEFTPool2AATTTGGAAGAAGCTGCTCGGT22
32nCoV-2019_16_RIGHTPool2CACAACTTGCGTGTGGAGGTTA22
33nCoV-2019_17_LEFTPool1CTTCTTTCTTTGAGAGAAGTGAGGACT27
34nCoV-2019_17_RIGHTPool1TTTGTTGGAGTGTTAACAATGCAGT25
35nCoV-2019_18_LEFTPool2TGGAAATACCCACAAGTTAATGGTTTAAC29
4
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序號(hào)引物名稱所屬引物池引物序列(5′-3′)長(zhǎng)度
36nCoV-2019_18_RIGHTPool2AGCTTGTTTACCACACGTACAAGG24
37nCoV-2019_19_LEFTPool1GCTGTTATGTACATGGGCACACT23
38nCoV-2019_19_RIGHTPool1TGTCCAACTTAGGGTCAATTTCTGT25
39nCoV-2019_20_LEFTPool2ACAAAGAAAACAGTTACACAACAACCA27
40nCoV-2019_20_RIGHTPool2ACGTGGCTTTATTAGTTGCATTGTT25
41nCoV-2019_21_LEFTPool1TGGTGGCTATTGATTATAAACACTACACA29
42nCoV-2019_21_RIGHTPool1TAGATCTGTGTGGCCAACCTCT22
43nCoV-2019_22_LEFTPool2ACTACCGAAGTTGTAGGAGACATTATACT29
44nCoV-2019_22_RIGHTPool2ACAGTATTCTTTGCTATAGTAGTCGGC27
45nCoV-2019_23_LEFTPool1ACAACTACTAACATAGTTACACGGTGT27
46nCoV-2019_23_RIGHTPool1ACCAGTACAGTAGGTTGCAATAGTG25
47nCoV-2019_24_LEFTPool2AGGCATGCCTTCTTACTGTACTG23
48nCoV-2019_24_RIGHTPool2ACATTCTAACCATAGCTGAAATCGGG26
49nCoV-2019_25_LEFTPool1GCAATTGTTTTTCAGCTATTTTGCAGT27
50nCoV-2019_25_RIGHTPool1ACTGTAGTGACAAGTCTCTCGCA23
51nCoV-2019_26_LEFTPool2TTGTGATACATTCTGTGCTGGTAGT25
52nCoV-2019_26_RIGHTPool2TCCGCACTATCACCAACATCAG22
53nCoV-2019_27_LEFTPool1ACTACAGTCAGCTTATGTGTCAACC25
54nCoV-2019_27_RIGHTPool1AATACAAGCACCAAGGTCACGG22
55nCoV-2019_28_LEFTPool2ACATAGAAGTTACTGGCGATAGTTGT26
56nCoV-2019_28_RIGHTPool2TGTTTAGACATGACATGAACAGGTGT26
57nCoV-2019_29_LEFTPool1ACTTGTGTTCCTTTTTGTTGCTGC24
58nCoV-2019_29_RIGHTPool1AGTGTACTCTATAAGTTTTGATGGTGTGT29
59nCoV-2019_30_LEFTPool2GCACAACTAATGGTGACTTTTTGCA25
60nCoV-2019_30_RIGHTPool2ACCACTAGTAGATACACAAACACCAG26
61nCoV-2019_31_LEFTPool1TTCTGAGTACTGTAGGCACGGC22
62nCoV-2019_31_RIGHTPool1ACAGAATAAACACCAGGTAAGAATGAGT28
63nCoV-2019_32_LEFTPool2TGGTGAATACAGTCATGTAGTTGCC25
64nCoV-2019_32_RIGHTPool2GGTAATAGCACATCACTACGCAAC24
65nCoV-2019_33_LEFTPool1ACTTTTGAAGAAGCTGCGCTGT22
66nCoV-2019_33_RIGHTPool1TGGACAGTAAACTACGTCATCAAGC25
67nCoV-2019_34_LEFTPool2TCCCATCTGGTAAAGTTGAGGGT23
68nCoV-2019_34_RIGHTPool2AGTGAAATTGGGCCTCATAGCA22
69nCoV-2019_35_LEFTPool1TGTTCGCATTCAACCAGGACAG22
70nCoV-2019_35_RIGHTPool1ACTTCATAGCCACAAGGTTAAAGTCA26
71nCoV-2019_36_LEFTPool2ATTACAGTTAATGTTTTAGCTTGGTTGTA22
72nCoV-2019_36_RIGHTPool2GAACAAAGACCATTGAGTACTCTGGA26
73nCoV-2019_37_LEFTPool1ACACACCACTGGTTGTTACTCAC23
74nCoV-2019_37_RIGHTPool1GTCCACACTCTCCTAGCACCAT22
75nCoV-2019_38_LEFTPool2ACTGTGTTATGTATGCATCAGCTGT25
76nCoV-2019_38_RIGHTPool2ATCATAAACACCAAGAGTCAGTCTAAA25
5
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序號(hào)引物名稱所屬引物池引物序列(5′-3′)長(zhǎng)度
77nCoV-2019_39_LEFTPool1AGTATTGCCCTATTTTCTTCATAACTGGT29
78nCoV-2019_39_RIGHTPool1TGTAACTGGACACATTGAGCCC22
79nCoV-2019_40_LEFTPool2TGCACATCAGTAGTCTTACTCTCAGT26
80nCoV-2019_40_RIGHTPool2CATGGCTGCATCACGGTCAAAT22
81nCoV-2019_41_LEFTPool1GTTCCCTTCCATCATATGCAGCT23
82nCoV-2019_41_RIGHTPool1TGGTATGACAACCATTAGTTTGGCT25
83nCoV-2019_42_LEFTPool2TGCAAGAGATGGTTGTGTTCCC22
84nCoV-2019_42_RIGHTPool2CCTACCTCCCTTTGTTGTGTTGT23
85nCoV-2019_43_LEFTPool1TACGACAGATGTCTTGTGCTGC22
86nCoV-2019_43_RIGHTPool1AGCAGCATCTACAGCAAAAGCA22
87nCoV-2019_44_LEFTPool2TGCCACAGTACGTCTACAAGCT22
88nCoV-2019_44_RIGHTPool2AACCTTTCCACATACCGCAGAC22
89nCoV-2019_45_LEFTPool1TACCTACAACTTGTGCTAATGACCC25
90nCoV-2019_45_RIGHTPool1AAATTGTTTCTTCATGTTGGTAGTTAGAGA30
91nCoV-2019_46_LEFTPool2TGTCGCTTCCAAGAAAAGGACG22
92nCoV-2019_46_RIGHTPool2CACGTTCACCTAAGTTGGCGTA22
93nCoV-2019_47_LEFTPool1AGGACTGGTATGATTTTGTAGAAAACCC28
94nCoV-2019_47_RIGHTPool1AATAACGGTCAAAGAGTTTTAACCTCTC28
95nCoV-2019_48_LEFTPool2TGTTGACACTGACTTAACAAAGCCT25
96nCoV-2019_48_RIGHTPool2TAGATTACCAGAAGCAGCGTGC22
97nCoV-2019_49_LEFTPool1AGGAATTACTTGTGTATGCTGCTGA25
98nCoV-2019_49_RIGHTPool1TGACGATGACTTGGTTAGCATTAATACA28
99nCoV-2019_50_LEFTPool2GTTGATAAGTACTTTGATTGTTACGATGGT30
100nCoV-2019_50_RIGHTPool2TAACATGTTGTGCCAACCACCA22
101nCoV-2019_51_LEFTPool1TCAATAGCCGCCACTAGAGGAG22
102nCoV-2019_51_RIGHTPool1AGTGCATTAACATTGGCCGTGA22
103nCoV-2019_52_LEFTPool2CATCAGGAGATGCCACAACTGC22
104nCoV-2019_52_RIGHTPool2GTTGAGAGCAAAATTCATGAGGTCC25
105nCoV-2019_53_LEFTPool1AGCAAAATGTTGGACTGAGACTGA24
106nCoV-2019_53_RIGHTPool1AGCCTCATAAAACTCAGGTTCCC23
107nCoV-2019_54_LEFTPool2TGAGTTAACAGGACACATGTTAGACA26
108nCoV-2019_54_RIGHTPool2AACCAAAAACTTGTCCATTAGCACA25
109nCoV-2019_55_LEFTPool1ACTCAACTTTACTTAGGAGGTATGAGCT28
110nCoV-2019_55_RIGHTPool1GGTGTACTCTCCTATTTGTACTTTACTGT29
111nCoV-2019_56_LEFTPool2ACCTAGACCACCACTTAACCGA22
112nCoV-2019_56_RIGHTPool2ACACTATGCGAGCAGAAGGGTA22
113nCoV-2019_57_LEFTPool1ATTCTACACTCCAGGGACCACC22
114nCoV-2019_57_RIGHTPool1GTAATTGAGCAGGGTCGCCAAT22
115nCoV-2019_58_LEFTPool2TGATTTGAGTGTTGTCAATGCCAGA25
116nCoV-2019_58_RIGHTPool2CTTTTCTCCAAGCAGGGTTACGT23
117nCoV-2019_59_LEFTPool1TCACGCATGATGTTTCATCTGCA23
6
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序號(hào)引物名稱所屬引物池引物序列(5′-3′)長(zhǎng)度
118nCoV-2019_59_RIGHTPool1AAGAGTCCTGTTACATTTTCAGCTTG26
119nCoV-2019_60_LEFTPool2TGATAGAGACCTTTATGACAAGTTGCA27
120nCoV-2019_60_RIGHTPool2GGTACCAACAGCTTCTCTAGTAGC24
121nCoV-2019_61_LEFTPool1TGTTTATCACCCGCGAAGAAGC22
122nCoV-2019_61_RIGHTPool1ATCACATAGACAACAGGTGCGC22
123nCoV-2019_62_LEFTPool2GGCACATGGCTTTGAGTTGACA22
124nCoV-2019_62_RIGHTPool2GTTGAACCTTTCTACAAGCCGC22
125nCoV-2019_63_LEFTPool1TGTTAAGCGTGTTGACTGGACT22
126nCoV-2019_63_RIGHTPool1ACAAACTGCCACCATCACAACC22
127nCoV-2019_64_LEFTPool2TCGATAGATATCCTGCTAATTCCATTGT28
128nCoV-2019_64_RIGHTPool2AGTCTTGTAAAAGTGTTCCAGAGGT25
129nCoV-2019_65_LEFTPool1GCTGGCTTTAGCTTGTGGGTTT22
130nCoV-2019_65_RIGHTPool1TGTCAGTCATAGAACAAACACCAATAGT28
131nCoV-2019_66_LEFTPool2GGGTGTGGACATTGCTGCT22
132nCoV-2019_66_RIGHTPool2TCAATTTCCATTTGACTCCTGGGT24
133nCoV-2019_67_LEFTPool1GTTGTCCAACAATTACCTGAAACTTACT28
134nCoV-2019_67_RIGHTPool1CAACCTTAGAAACTACAGATAAATCTTGGG30
135nCoV-2019_68_LEFTPool2ACAGGTTCATCTAAGTGTGTGTGT24
136nCoV-2019_68_RIGHTPool2CTCCTTTATCAGAACCAGCACCA23
137nCoV-2019_69_LEFTPool1TGTCGCAAAATATACTCAACTGTGTCA27
138nCoV-2019_69_RIGHTPool1TCTTTATAGCCACGGAACCTCCA23
139nCoV-2019_70_LEFTPool2ACAAAAGAAAATGACTCTAAAGAGGGTTT29
140nCoV-2019_70_RIGHTPool2TGACCTTCTTTTAAAGACATAACAGCAG28
141nCoV-2019_71_LEFTPool1ACAAATCCAATTCAGTTGTCTTCCTATTC29
142nCoV-2019_71_RIGHTPool1TGGAAAAGAAAGGTAAGAACAAGTCCT27
143nCoV-2019_72_LEFTPool2ACACGTGGTGTTTATTACCCTGAC24
144nCoV-2019_72_RIGHTPool2ACTCTGAACTCACTTTCCATCCAAC25
145nCoV-2019_73_LEFTPool1CAATTTTGTAATGATCCATTTTTGGGTGT29
146nCoV-2019_73_RIGHTPool1CACCAGCTGTCCAACCTGAAGA22
147nCoV-2019_74_LEFTPool2ACATCACTAGGTTTCAAACTTTACTTGC28
148nCoV-2019_74_RIGHTPool2GCAACACAGTTGCTGATTCTCTTC24
149nCoV-2019_75_LEFTPool1AGAGTCCAACCAACAGAATCTATTGT26
150nCoV-2019_75_RIGHTPool1ACCACCAACCTTAGAATCAAGATTGT26
151nCoV-2019_76_LEFTPool2AGGGCAAACTGGAAAGATTGCT22
152nCoV-2019_76_RIGHTPool2TCTCTGCCAAATTGTTGGAAAGGCA22
153nCoV-2019_77_LEFTPool1CCAGCAACTGTTTGTGGACCTA22
154nCoV-2019_77_RIGHTPool1CAGCCCCTATTAAACAGCCTGC22
155nCoV-2019_78_LEFTPool2CAACTTACTCCTACTTGGCGTGT23
156nCoV-2019_78_RIGHTPool2TGTGTACAAAAACTGCCATATTGCA25
157nCoV-2019_79_LEFTPool1GTGGTGATTCAACTGAATGCAGC23
158nCoV-2019_79_RIGHTPool1CATTTCATCTGTGAGCAAAGGTGG24
7
DB32/T3762.11—2020
序號(hào)引物名稱所屬引物池引物序列(5′-3′)長(zhǎng)度
159nCoV-2019_80_LEFTPool2TTGCCTTGGTGATATTGCTGCT22
160nCoV-2019_80_RIGHTPool2TGGAGCTAAGTTGTTTAACAAGCG24
161nCoV-2019_81_LEFTPool1GCACTTGGAAAACTTCAAGATGTGG25
162nCoV-2019_81_RIGHTPool1GTGAAGTTCTTTTCTTGTGCAGGG24
163nCoV-2019_82_LEFTPool2GGGCTATCATCTTATGTCCTTCCCT25
164nCoV-2019_82_RIGHTPool2TGCCAGAGATGTCACCTAAATCAA24
165nCoV-2019_83_LEFTPool1TCCTTTGCAACCTGAATTAGACTCA25
166nCoV-2019_83_RIGHTPool1TTTGACTCCTTTGAGCACTGGC22
167nCoV-2019_84_LEFTPool2TGCTGTAGTTGTCTCAAGGGCT22
168nCoV-2019_84_RIGHTPool2AGGTGTGAGTAAACTGTTACAAACAAC27
169nCoV-2019_85_LEFTPool1ACTAGCACTCTCCAAGGGTGTT22
170nCoV-2019_85_RIGHTPool1ACACAGTCTTTTACTCCAGATTCCC25
171nCoV-2019_86_LEFTPool2TCAGGTGATGGCACAACAAGTC22
172nCoV-2019_86_RIGHTPool2ACGAAAGCAAGAAAAAGAAGTACGC25
173nCoV-2019_87_LEFTPool1CGACTACTAGCGTGCCTTTGTA22
174nCoV-2019_87_RIGHTPool1ACTAGGTTCCATTGTTCAAGGAGC24
175nCoV-2019_88_LEFTPool2CCATGGCAGATTCCAACGGTAC22
176nCoV-2019_88_RIGHTPool2TGGTCAGAATAGTGCCATGGAGT23
177nCoV-2019_89_LEFTPool1CGCGTACGCGTTCCATGTGGTC22
178nCoV-2019_89_RIGHTPool1ATAGTAACCTGAAAGTCAACGAGAT25
179nCoV-2019_90_LEFTPool2ACACAGACCATTCCAGTAGCAGT23
180nCoV-2019_90_RIGHTPool2TGAAATGGTGAATTGCCCTCGT22
181nCoV-2019_91_LEFTPool1TCACTACCAAGAGTGTGTTAGAGGT25
182nCoV-2019_91_RIGHTPool1TTCAAGTGAGAACCAAAAGATAATAAGCA29
183nCoV-2019_92_LEFTPool2TTTGTGCTTTTTAGCCTTTCTGCT24
184nCoV-2019_92_RIGHTPool2AGGTTCCTGGCAATTAATTGTAAAAGG27
185nCoV-2019_93_LEFTPool1TGAGGCTGGTTCTAAATCACCCA23
186nCoV-2019_93_RIGHTPool1AGGTCTTCCTTGCCATGTTGAG22
187nCoV-2019_94_LEFTPool2GGCCCCAAGGTTTACCCAATAA22
188nCoV-2019_94_RIGHTPool2TTTGGCAATGTTGTTCCTTGAGG23
189nCoV-2019_95_LEFTPool1TGAGGGAGCCTTGAATACACCA22
190nCoV-2019_95_RIGHTPool1CAGTACGTTTTTGCCGAGGCTT22
191nCoV-2019_96_LEFTPool2GCCAACAACAACAAGGCCAAAC22
192nCoV-2019_96_RIGHTPool2TAGGCTCTGTTGGTGGGAATGT22
193nCoV-2019_97_LEFTPool1TGGATGACAAAGATCCAAATTTCAAAGA28
194nCoV-2019_97_RIGHTPool1ACACACTGATTAAAGATTGCTATGTGAG28
195nCoV-2019_98_LEFTPool2AACAATTGCAACAATCCATGAGCA24
196nCoV-2019_98_RIGHTPool2TTCTCCTAAGAAGCTATTAAAATCACATGG30
_________________________________
8
DB32/T3762.11—2020
前??言
DB32/T3762《新型冠狀病毒檢測(cè)技術(shù)規(guī)范》目前分為以下部分:
——第1部分:生物樣本采集、運(yùn)輸和保存;
——第2部分:病毒分離與鑒定;
——第3部分:核酸熒光PCR檢測(cè)程序;
——第4部分
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