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37CodeofpracticeformonitoringmitochondrialDNAgeneticdiversityofmarine 本文件按照GB/T1.1—2020《標(biāo)準(zhǔn)化工作導(dǎo)則第1部分:標(biāo)準(zhǔn)化文件的結(jié)構(gòu)和起草規(guī)則》的規(guī)定海洋動物資源線粒體DNA遺傳多樣性監(jiān)測技術(shù)規(guī)程本文件確立了海洋動物資源線粒體DNA遺傳多樣性監(jiān)測程序,規(guī)定了監(jiān)測方案設(shè)計、樣品采集、保GB/T12763.6海洋調(diào)查規(guī)范第6部分:海洋生GB/T18654.2養(yǎng)殖魚類種質(zhì)檢驗第2部分:抽種內(nèi)不同群體之間或一個群體內(nèi)不同個體的遺傳變異4監(jiān)測程序海洋動物資源線粒體DNA遺傳多樣性監(jiān)測程序包括監(jiān)測方案設(shè)計、樣品采集、保存與運輸、樣品檢制、數(shù)據(jù)分析、監(jiān)測報告等。其中,對調(diào)查海域某種野生海洋動物資源的遺傳多樣性監(jiān)測,宜每5年~a)現(xiàn)場調(diào)查采樣:按GB/T12763.6規(guī)定執(zhí)行。對海洋底移動迅速的底棲動物可設(shè)地籠誘捕。對游泳能力強(qiáng)的魚類、甲殼類等進(jìn)行拖網(wǎng)采c)對海洋保護(hù)動物、珍稀瀕危生物實行非致死性采樣:●視監(jiān)測生物的具體情況,無菌操作剪取部分魚類鰭條組織約0.1g,或用無菌靜脈處抽取血液約0.5mL;采集的每批樣品分別填寫樣品采集記錄,格式參見附細(xì)胞色素氧化酶I(Cytochromeo錄B。酚-氯仿法提取DNA的步驟參見附錄C;用商品化試劑提取的DNA用洗脫液或滅菌雙蒸水溶解,取5μL經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳,檢查DNA質(zhì)量,電泳方法參見附錄D,或取適量DNA溶液用核酸定量分析儀測定,A260/A280比值為1.8~2.0,DNA濃度不低于50ng/引物宜引用已公開發(fā)表學(xué)術(shù)論文或研究報告,或在基因數(shù)據(jù)庫中搜索目標(biāo)物行設(shè)計2對~3對,引物宜符合Tm值50℃~60℃、長度18bp~24bp、G+C含量在40%~60%、PCR產(chǎn)物長度用合成的引物對樣品進(jìn)行預(yù)實驗。按每對引物的Tm值設(shè)定退火溫度,按7.5.2進(jìn)行PCR。PCR產(chǎn)物經(jīng)1%的瓊脂糖凝膠電泳后,選擇PCR產(chǎn)物條帶單一、清晰、且長度與預(yù)期一致的引物,作為),對所有樣品進(jìn)行擴(kuò)增后,PCR產(chǎn)物經(jīng)1.5%的瓊脂糖凝膠電泳,選擇單一、清晰、且長度與預(yù)期一致9數(shù)據(jù)分析數(shù)與序列長度的比值)等遺傳多樣性數(shù)據(jù)。分析結(jié)果格式參見o現(xiàn)場調(diào)查采樣:□定點;□地籠;□拖網(wǎng)□整體;□肌肉;□血液;□鰭條;□其他:□鮮活;□新鮮;□變質(zhì)□活體;□冷凍;□冰鮮;□常溫;□其他:h)核酸定量分析儀;C.10離心管開口放于潔凈的環(huán)境中,自然干燥15min~30min。50ng~100ngMgCl2檢測記錄海洋動物
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