DNA啟動子、終止子課件

如何分析基因序列中的啟動子、外顯子和內(nèi)含子

DNA啟動子、終止子?啟動子：RNA聚合酶特異性和結(jié)合的DNA序列。啟動子是基因的一個組成部分，控制基因表達(dá)的起始時間和表達(dá)的程度。?外顯子：斷裂基因中的編碼序列。外顯子是真核生物基因的一部分，它在剪接后仍會被保存下來，并可在蛋白質(zhì)生物合成過程中被表達(dá)為蛋白質(zhì)。?內(nèi)含子：斷裂基因的非編碼區(qū)，可被轉(zhuǎn)錄，但在mRNA加工過程中被剪切掉，故成熟mRNA上無內(nèi)含子編碼序列。DNA啟動子、終止子怎樣利用互聯(lián)網(wǎng)中的網(wǎng)站或軟件分析該序列中的外顯子、內(nèi)含子和啟動子呢？現(xiàn)有人基因組中的一段序列GGTATGGGGCCAAGAGATATATCTT………..DNA啟動子、終止子一、根據(jù)一段堿基序列找到其對應(yīng)的基因名或其序列號DNA啟動子、終止子任選瀏覽器——搜索“NCBI”——找到后點擊進(jìn)入，出現(xiàn)如上界面——點擊“BLAST”（BasicLocalAlignmentSearchTool,BLAST）DNA啟動子、終止子當(dāng)出現(xiàn)如上界面時，點擊“nucleotideblast”DNA啟動子、終止子

打開頁面后，在檢索框中輸入需要查找的序列，如圖所示DNA啟動子、終止子根據(jù)索要查詢的基因來源，選定需要查詢的基因（人類基因）——點擊“BLAST”打開DNA啟動子、終止子出現(xiàn)頁面后向下滑動直至出現(xiàn)圖1尋找Ident(一致性）最高的一項點擊進(jìn)入DNA啟動子、終止子點擊進(jìn)入后見所查序列名稱以及序列號據(jù)此進(jìn)行操作DNA啟動子、終止子二、已知基因的基因名或序列號找到其啟動子、外顯子和內(nèi)含子DNA啟動子、終止子1、輸入網(wǎng)址進(jìn)入UCSC網(wǎng)站DNA啟動子、終止子2、點擊GenomeBrowserDNA啟動子、終止子3、點擊進(jìn)入后可看到以下頁面（1）選擇是何種生物的基因（如人類，老鼠等）（2）輸入你所需要查詢的基因名稱輸入完畢，點擊SUBMITDNA啟動子、終止子4、可看到以下頁面（1）將EnsemblGenes設(shè)置為dense（顯示）（2）點擊refreshDNA啟動子、終止子5、可看到以下頁面找到EnsemblGenes點擊所對應(yīng)的序列圖形DNA啟動子、終止子6、可看到以下頁面繼續(xù)點擊所對應(yīng)的序列圖形DNA啟動子、終止子7、可看到以下頁面選擇GenomicSequenceDNA啟動子、終止子8、可看到以下頁面（2）選擇表現(xiàn)形式（如外顯子大寫，其余都小寫）（1）根據(jù)需要選擇所要展現(xiàn)的內(nèi)容（如外顯子、內(nèi)含子）（3）點擊submitDNA啟動子、終止子9、可看到以下頁面此為HBB基因的全部序列第一段大寫部分為第一個外顯子。第一個外顯子前面的所有小寫部分為該序列的啟動子。大寫部分之間夾雜的小寫部分為該序列的內(nèi)含子。DNA啟動子、終止子三、檢驗所得序列是目的序列DNA啟動子、終止子1、驗證利用word輸入我們所得到序列的第一個外顯子的部分序列進(jìn)行驗證，看是否與原題序列匹配DNA啟動子、終止子驗證完成后，確認(rèn)匹配