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生化制藥工藝AcompletebusinessplanAcompletebusinessplanAcompletebusinessplanAcompletebusinessplanAcompletebusinessplanAcompletebusinessplanAcompletebusinessplanAcompletebusinessplanAcompletebusinessplanAcompletebusinessplan項(xiàng)目五基因工程制藥1基因工程的概念2基因工程操作工具3基因工程操作流程目錄CONTENTS基因工程常用工具02Part2基因工程操作工具一、基因工程操作工具1、基因工程操作要求基因的大小以納米計(jì)算,要對(duì)它進(jìn)行剪切、拼接等操作,沒(méi)有非常精細(xì)的工具是無(wú)法進(jìn)行的。2、基因工程操作工具“分子手術(shù)刀”----限制性核酸內(nèi)切酶
“分子縫合針”----DNA連接酶“分子運(yùn)輸車”----載體Part2基因工程操作工具二、限制性內(nèi)切酶1、工具酶工具酶功能限制性核酸內(nèi)切酶識(shí)別特異序列,切割DNADNA連接酶催化DNA中相鄰的5′磷酸基和3′羥基末端之間形成磷酸二酯鍵,使DNA切口封合或使兩個(gè)DNA分子或片段連接DNA聚合酶Ⅰ合成雙鏈cDNA分子或片段連接缺口平移制作高比活探針DNA序列分析填補(bǔ)3′末端Klenow片段又名DNA聚合酶I大片段,具有完整DNA聚合酶I的5
3
聚合、35
外切活性,而無(wú)53
外切活性。常用于cDNA第二鏈合成,雙鏈DNA3末端標(biāo)記等反轉(zhuǎn)錄酶合成cDNA替代DNA聚合酶I進(jìn)行填補(bǔ),標(biāo)記或DNA序列分析多聚核苷酸激酶催化多聚核苷酸5′羥基末端磷酸化,或標(biāo)記探針末端轉(zhuǎn)移酶在3′羥基末端進(jìn)行同質(zhì)多聚物加尾堿性磷酸酶切除末端磷酸基Part2基因工程操作工具二、限制性內(nèi)切酶2、限制性內(nèi)切酶限制性核酸內(nèi)切酶(restrictionendonuclease,RE)是識(shí)別DNA的特異序列,并在識(shí)別位點(diǎn)或其周圍切割雙鏈DNA的一類內(nèi)切酶分類Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ基因工程技術(shù)中常用Ⅱ型作用與甲基化酶共同構(gòu)成細(xì)菌的限制修飾系統(tǒng),限制外源DNA,保護(hù)自身DNA命名命名Hin
dⅢ
屬
種
株序Haemophilusinfluenzaed株流感嗜血桿菌d株的第三種酶第一個(gè)字母取自產(chǎn)生該酶的細(xì)菌屬名,用大寫第二、第三個(gè)字母是該細(xì)菌的種名,用小寫第四個(gè)字母代表株羅馬數(shù)字表示發(fā)現(xiàn)的先后次序Part2基因工程操作工具二、限制性內(nèi)切酶2、限制性內(nèi)切酶識(shí)別位點(diǎn)----回文結(jié)構(gòu)(palindrome)雙鏈DNA中含有的二個(gè)結(jié)構(gòu)相同、方向相反的序列切口平端切口粘端切口GGATCCCCTAGGHindⅡGTCGACCAGCTGGTCCAGGACCTG+BamHⅠGGATCCCCTAGGGCCTAGGATCCG+Part2基因工程操作工具二、限制性內(nèi)切酶2、限制性內(nèi)切酶同功異源酶來(lái)源不同的限制酶,但能識(shí)別和切割同一位點(diǎn)GGATCCCCTAGG+BamHⅠGCCTAGGATCCGBstⅠGGATCCCCTAGGGCCTAGGATCCG+Part2基因工程操作工具二、限制性內(nèi)切酶2、限制性內(nèi)切酶同尾酶有些限制性內(nèi)切酶雖然識(shí)別序列不完全相同,但切割DNA后,產(chǎn)生相同的粘性末端,稱為同尾酶。這兩個(gè)相同的粘性末端稱為配伍未端(compatibleend)BglⅡ+BamHⅠ+GGATCCCCTAGGGCCTAGGATCCGAGATCTTCTAGAATCTAGGATCTAPart2基因工程操作工具二、DNA連接酶1、DNA連接酶作用和分類作用催化形成3,5-磷酸二酯鍵分類E·coliDNA連接酶來(lái)源于大腸桿菌,可用于連接粘性末端T4DNA連接酶來(lái)源于T4噬菌體,可用于連接粘性末端和平末端,但連接效率低熱穩(wěn)定的DNA連接酶從嗜熱高溫放線菌(Thermoactinomycesthermophilus)菌株中分離純化的,一種能夠在高溫下催化兩條寡核苷酸探針發(fā)生連接作用的一種核酸酶Part2基因工程操作工具二、DNA連接酶2、不同的DNA連接酶對(duì)比連接酶底物輔助因子和激活因子溫度巰基試劑黏性末端平末端DNA-RNA雜合體RNA-RNA雜合體大腸桿菌DNA連接酶可行可行不行不行NAD+,Mg2+(1~3mmol/L)黏性末端:10~15℃補(bǔ)平缺口:37℃無(wú)T4DNA連接酶可行可行可行可行ATP,Mg2+(10mmol/L)黏性末端:4℃平末端:10~25℃補(bǔ)平缺口:37℃DTT嗜熱菌連接酶可行不行不行不行NAD+,Mg2+(10mmol/L)黏性末端:24~37℃補(bǔ)平缺口:65~72℃無(wú)Part2基因工程操作工具三、基因載體1、載體定義和分類定義能攜帶目的基因,實(shí)現(xiàn)其無(wú)性繁殖或表達(dá)有意義的蛋白質(zhì)所采用的一些DNA分子為什么要利用載體游離的DNA進(jìn)入細(xì)胞體,一般會(huì)直接被分解,就算可以進(jìn)行轉(zhuǎn)錄----翻譯成蛋白,游離DNA也無(wú)法跟著細(xì)胞分裂進(jìn)行復(fù)制,導(dǎo)致子代細(xì)胞中不再含有目的基因分類克隆載體(cloningvector)為使插入的外源DNA序列被擴(kuò)增而特意設(shè)計(jì)的載體表達(dá)載體(expressionvector)為使插入的外源DNA序列可轉(zhuǎn)錄翻譯成多肽鏈而特意設(shè)計(jì)的載體穿梭載體用于真核生物DNA片段在原核生物中克隆和鑒定(容易),然后在真核細(xì)胞宿主表達(dá)Part2基因工程操作工具三、基因載體2、載體選擇標(biāo)準(zhǔn)能自主復(fù)制具有兩個(gè)以上的遺傳標(biāo)記物,便于重組體的篩選和鑒定有克隆位點(diǎn)(外源DNA插入點(diǎn))即多個(gè)單一酶切位點(diǎn)分子量小,以容納較大的外源DNA3、常用載體
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