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文檔簡(jiǎn)介
華東理工大學(xué)微生物學(xué)筆記第一章緒論
第一節(jié)微生物學(xué)的研究對(duì)象與任務(wù)
研究對(duì)象--微生物:微生物(Microorganism,,microbe)是一切肉眼看不見或看不清的微小生物的總稱。
微生物在生物界的地位:包括屬于原核生物的細(xì)菌、放線菌、藍(lán)細(xì)菌、;
屬于真核生物的真菌(包括藻狀菌綱、擔(dān)子菌綱、子囊菌綱、半知菌綱);
以及屬于非細(xì)胞結(jié)構(gòu)的病毒。微生物學(xué)的任務(wù):利用有利的一面為人類造福、變有害為有利。
微生物與人類的關(guān)系:疾病、物質(zhì)的霉變、工農(nóng)業(yè)生產(chǎn)、生態(tài)。第二節(jié)微生物學(xué)的發(fā)展第一階段--推測(cè)期;第二階段--觀察期;第三階段--生理期;第四階段--分子生物學(xué)時(shí)期。1944年,Avery證明遺傳的物質(zhì)基礎(chǔ)為DNA;1953年,Watson&CrickDNA雙螺旋結(jié)構(gòu);1961年,Jacob&Monod操縱子學(xué)說;1972年,BergBoyer&CohenDNA克隆技術(shù);1982年,Prusiner發(fā)現(xiàn)朊病毒;1985年SaikiPCR技術(shù)(聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng));1997年,Wilmut克隆羊20世紀(jì)以核酸研究為核心:50年代雙螺旋結(jié)構(gòu);60年代操縱子學(xué)說;70年代DNA重組;80年代PCR技術(shù);90年代DNA測(cè)序。人類基因組測(cè)序計(jì)劃提前5年完成,現(xiàn)由結(jié)構(gòu)向功能轉(zhuǎn)移(后基因組時(shí)代(post-genomics))。從基因組到蛋白質(zhì)組。功能基因組學(xué)(functionalgenomics),蛋白質(zhì)組學(xué)(proteome),生物信息學(xué)(Bioinformatics)。
模式生物:背景清楚、基因組小、便于測(cè)定和分析、可從中獲取經(jīng)驗(yàn)改進(jìn)技術(shù)方法。
第三節(jié)我國(guó)微生物學(xué)的發(fā)展古代對(duì)微生物學(xué)的認(rèn)識(shí)與利用:釀酒,輪作,種痘。微生物學(xué)簡(jiǎn)況:見課本7-8頁(yè)。
第二章微生物形態(tài)與結(jié)構(gòu)
Ⅰ原核微生物第一節(jié)細(xì)菌細(xì)菌的形態(tài)和大?。盒螒B(tài):球狀、桿狀、螺旋狀;大?。阂晕⒚诪槎攘繂挝弧<?xì)菌-原生質(zhì)膜(plasmamembrance)、原生質(zhì)體(protoplast)、原生質(zhì)。細(xì)菌細(xì)胞的一般結(jié)構(gòu)細(xì)胞壁(cellwall)在細(xì)胞最外層、多孔性的、具有一定屏障作用,水和某些化學(xué)物質(zhì)可以通過,但對(duì)大分子物質(zhì)有阻攔作用。功能:韌性、彈性?;瘜W(xué)組成:肽聚糖。1G+菌G-菌核糖體(ribosome)華東理工大學(xué)《微生物學(xué)教程》上課講義G+菌與G-菌的細(xì)胞壁結(jié)構(gòu)內(nèi)壁層(2-3nm肽聚糖層)外壁層(8-10nm脂多糖層)細(xì)胞壁為一層(20~80nm厚的肽聚糖層)脂多糖:O-側(cè)鏈(具有抗原性)———核心———脂質(zhì)(內(nèi)毒素的毒性中心)G+菌與G-菌的細(xì)胞壁組成與結(jié)構(gòu)比較菌性質(zhì)G+菌G-肽聚糖含量少(10%)多(40~90%)直接連接通過五肽連接鏈連接方式氨基酸組成D-Glu-NH2D-GluDAPL-Lys有無脂多糖有無脂蛋白無有垣酸細(xì)胞壁與革蘭氏染色原生質(zhì)體和球形體原生質(zhì)體(protoplast):指在人為條件下,用溶菌酶除盡原有細(xì)胞壁或用青霉素抑制新生細(xì)胞壁的合成后,所留下的僅有一層細(xì)胞膜包裹著的圓球狀滲透敏感細(xì)胞,一般由革蘭氏陽(yáng)性菌形成。脆弱,高滲溶液球形體:指還殘留了部分細(xì)胞壁的原生質(zhì)體,一般由革蘭氏陰性菌所形成。細(xì)胞膜(cellmembrane)緊貼在細(xì)胞壁內(nèi)側(cè)的一層由磷脂和蛋白質(zhì)組成的柔軟、富有彈性的半透性薄膜。功能:主要為控制營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)及代謝產(chǎn)物進(jìn)出細(xì)胞。組成:磷脂蛋白質(zhì)。結(jié)構(gòu):流動(dòng)鑲嵌模型。間體(mesosome)擬線粒體細(xì)胞質(zhì)(cytoplasm)被細(xì)胞膜包圍著的除核質(zhì)體外的一切透明、膠狀、顆粒狀物質(zhì),可總稱為細(xì)胞質(zhì)。主要成分:核糖體、貯藏物、各種酶類、中間代謝物、無饑鹽、載色體和質(zhì)粒等,少數(shù)細(xì)菌還存在羧化體、伴孢晶體或氣泡等構(gòu)造。65%為核糖核酸,35%為蛋白質(zhì)。是蛋白質(zhì)合成的場(chǎng)所。原核生物70S,真核生物80S。2貯藏物(reservematerials)華東理工大學(xué)《微生物學(xué)教程》上課講義一類有不同化學(xué)成分累積而成的不溶性顆粒。在營(yíng)養(yǎng)過剩時(shí),聚合成各種貯藏顆粒,在營(yíng)養(yǎng)缺乏時(shí)又被分解利用。氣泡(gasvacuoles)存在于許多光能營(yíng)養(yǎng)型、無鞭毛運(yùn)動(dòng)水生細(xì)菌中的泡囊狀內(nèi)含物,內(nèi)中充滿氣體。外由僅2nm厚的蛋白質(zhì)膜所包圍,具有調(diào)節(jié)細(xì)胞比重,以使其漂浮在合適水層中的作用,借以獲取光能、氧和營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)。核質(zhì)體(nuclearbody)又稱擬核,指原核生物所持有的無核膜包裹、無固定形態(tài)的原是細(xì)胞核,是遺傳的物質(zhì)基礎(chǔ)。質(zhì)粒(plasemid)核外基因(細(xì)胞質(zhì)基因)。質(zhì)粒的特性:1.環(huán)狀雙鏈小分子片段;2.決定細(xì)菌的某些遺傳特性;3.獨(dú)立自我復(fù)制,可轉(zhuǎn)移,能攜帶一定的遺傳信息;4.可自行消失。細(xì)菌細(xì)胞的特殊結(jié)構(gòu)莢膜(capsule)某些細(xì)菌細(xì)胞壁外存在的一層厚度不定的膠狀物質(zhì)。包括微莢膜(<200nm);莢膜(200nm);粘液層(無明顯界面);菌膠團(tuán)(幾個(gè)菌共有的)。莢膜的主要成分:多糖。莢膜的功能:1.保護(hù)細(xì)菌(致病菌)免受白細(xì)胞的吞噬;2.菌體外的貯存物。有莢膜的菌大多為致病菌;有莢膜菌落為光滑型致?。粺o莢膜菌落為粗糙型不致病。通過負(fù)染色法可觀察到鞭毛(flegellum)和菌毛(pilus,fimbria)鞭毛:長(zhǎng)在細(xì)菌的體表,著生在細(xì)胞膜上的長(zhǎng)絲狀、曲波的附屬物。功能:為細(xì)菌的運(yùn)動(dòng)器官,運(yùn)動(dòng)的支點(diǎn)在細(xì)胞壁上。成分:為蛋白質(zhì)。結(jié)構(gòu):鞭毛絲,鞭毛鉤,基體。觀察:顯微鏡,半固體穿刺。分類:?jiǎn)味吮廾?、端生叢毛菌、兩端鞭毛菌、周毛菌。鞭毛的位置和?shù)目具有細(xì)菌分類鑒定的意義。菌毛:性菌毛,普通菌毛。3芽孢(endosporespore)伴孢晶體(parasporalcrystal;spore-companionedcrystal)華東理工大學(xué)《微生物學(xué)教程》上課講義產(chǎn)芽孢的菌有兩類:好氣:Bacillus(枯草芽孢桿菌屬);厭氣:Clostridium(梭狀芽孢桿菌屬)。定義:某些細(xì)菌在其生長(zhǎng)發(fā)育后期,可在細(xì)胞內(nèi)形成的一個(gè)圓形或橢圓形、厚臂、含水量低、抗逆性強(qiáng)的休眠構(gòu)造。芽孢形成過程①束狀染色質(zhì)形成;②細(xì)胞膜內(nèi)陷,細(xì)胞發(fā)生不對(duì)稱分裂,其中小體積部分即為前芽孢(forespore);③前芽孢的雙層隔壁形成,這時(shí)抗輻射性提高;④在上述兩層隔壁間充填芽孢肽聚糖后,合成DPA,累積鈣離子,開始形成皮層,折光率增高;⑤芽孢衣合成結(jié)束;⑥皮層合成完成,芽孢成熟,抗熱性出現(xiàn);⑦芽孢囊裂解,芽孢游離。特性:含水量低,耐熱,含DPA-Ca。幾種位置和形狀:如何觀察:在形成芽孢的同時(shí),在芽孢旁形成的一顆菱形、方形或不規(guī)則形的堿溶性蛋白質(zhì)晶體。為有毒蛋白質(zhì),一般一個(gè)細(xì)菌產(chǎn)生一個(gè),作為生物農(nóng)藥。例:蘇云金芽孢桿菌(Bacillusthuringiensis)細(xì)菌的群體形態(tài)菌落(colony):將單個(gè)細(xì)菌(或其他微生物)或一小堆同種細(xì)胞接種在固體培養(yǎng)基的表面(有時(shí)為內(nèi)層),當(dāng)它占有一定的發(fā)展空間并給予適宜的培養(yǎng)條件時(shí),該細(xì)胞就會(huì)迅速生長(zhǎng)繁殖并形成細(xì)胞堆,此即菌落。菌落就是在固體培養(yǎng)基上(內(nèi))以母細(xì)胞為中心的一堆肉眼可見的、有一定形態(tài)、構(gòu)造等特征的子細(xì)胞集團(tuán)。菌落特征:一般呈現(xiàn)濕潤(rùn)、較光滑、較透明、較粘稠、易挑取、質(zhì)地均勻、以及菌落正反面或邊緣與中央部位的顏色一致等。單菌落表面特征群體效應(yīng)細(xì)菌的繁殖無性繁殖:不經(jīng)過兩性細(xì)胞的結(jié)合,只是營(yíng)養(yǎng)細(xì)胞的分裂或營(yíng)養(yǎng)菌絲分化而形成同種新個(gè)體的過程。裂殖(橫分裂法):同型,異型。繁殖的過程:細(xì)胞核和細(xì)胞質(zhì)的分裂;橫隔壁的形成;子細(xì)胞的分離。4華東理工大學(xué)《微生物學(xué)教程》上課講義立克次氏體(Rickettsia)處于細(xì)菌和病毒之間,但更接近細(xì)菌。G-菌特點(diǎn):具有細(xì)胞壁,不能通過細(xì)菌濾器;專性細(xì)胞內(nèi)寄生,不能在人工培養(yǎng)基上培養(yǎng)。支原體(Mycoplasma)介于細(xì)菌和立克次氏體之間,是原核生物中最小的,具有致病性。50-60年代稱為PPLO特點(diǎn):無細(xì)胞壁,可通過細(xì)菌濾器;能在人工培養(yǎng)基但條件苛刻(需補(bǔ)充血清);菌落形態(tài)似荷包蛋。衣原體(Chlamydia)介于立克次氏體和病毒之間。以前將衣原體歸于病毒,沙眼衣原體特點(diǎn):具有細(xì)胞壁,但能通過細(xì)菌濾器,專性細(xì)胞內(nèi)寄生(能量寄生)。支原體、立克次氏體、衣原體和病毒的比較比較項(xiàng)目細(xì)胞構(gòu)造含核酸類型DNA和RNADNA和RNADNA和RNADNA和RNA核糖體細(xì)胞壁細(xì)胞膜繁殖時(shí)個(gè)體完整性大分子合成能力產(chǎn)ATP系統(tǒng)氧化谷氨酰胺能力對(duì)抑制細(xì)菌抗生素的反應(yīng)病毒衣原體立克次氏體支原體無有有有無有有有有(含肽聚糖)有(不含肽聚糖)無無有(無甾醇)有(含甾醇)無有(無甾醇)不保持保持保持保持無無有有無無有有無無有有敏感(對(duì)抑制細(xì)胞有抗性敏感壁合成者例外)敏感(青霉素例外)
第三章微生物的形態(tài)與構(gòu)造Ⅱ真核微生物原核生物與真核生物的比較原核生物即廣義的細(xì)菌,指一大類細(xì)胞核無核膜包裹,只存在稱作核區(qū)(nuclearregion)的裸露DNA的原始單細(xì)胞生物,包括真細(xì)菌(eubacteria)和古生菌(archaea)兩大類群。其中除少數(shù)屬古生菌外,多數(shù)的原核生物都是真細(xì)菌。真核生物是一大類細(xì)胞核具有核膜,能進(jìn)行有絲分裂,細(xì)胞質(zhì)中存在線粒體或同時(shí)存在葉綠體等多種細(xì)胞器的生物。真菌、顯微藻類和原生能量代謝華東理工大學(xué)《微生物學(xué)教程》上課講義量和[H]形式的還原力一起,共同合成復(fù)雜的生物大分子的過程。最初的能源(primaryenergysources):有機(jī)物,還原態(tài)無機(jī)物,日光輻射能。通用能源(universalenergysource):ATP。生物氧化:脫氫、遞氫、受氫。發(fā)酵:基質(zhì)為有機(jī)物,最終電子受體為有機(jī)物。葡萄糖→丙酮酸(EMP途徑)產(chǎn)生2個(gè)ATP(底物水平磷酸化)由于基質(zhì)氧化不徹底,發(fā)酵的結(jié)果仍積累有機(jī)物,所以產(chǎn)生的能量較少。例:葡萄糖→丙酮酸→乳酸,產(chǎn)生54kcal的能量不同的微生物發(fā)酵可產(chǎn)生不同的產(chǎn)物,例:葡萄糖→丙酮酸→乳酸or乙醇o(jì)r丙酮丁醇有氧呼吸:徹底的氧化過程。基質(zhì)為有機(jī)物,最終電子受體為分子氧。葡萄糖→CO產(chǎn)生38個(gè)ATP,其中底物水平磷酸化產(chǎn)生2個(gè)ATP,氧化磷酸化產(chǎn)生36個(gè)ATPEMP途逕:葡萄糖→丙酮酸;丙酮酸→乙酰CoA(氧化脫羧體系);TCA循環(huán)。電子傳遞鏈無氧呼吸:基質(zhì)為有機(jī)物,最終電子受體為無機(jī)物。C6H12O6+12KNO3→6CO2+12KNO2+6H2O+429kcal三種生物氧化方式的產(chǎn)能水平比較2+H2O14華東理工大學(xué)《微生物學(xué)教程》上課講義最高:有氧呼吸,第二:無氧呼吸,最低:發(fā)酵?!肮砘稹钡纳飳W(xué)解釋:在無氧條件下,某些微生物在沒有氧、氮或硫作為呼吸作用的最終電子受體時(shí),可以磷酸鹽代替,其結(jié)果是生成磷化氫(PH3),一種易燃?xì)怏w。當(dāng)有機(jī)物腐敗變質(zhì)時(shí),經(jīng)常會(huì)發(fā)生這種情況。若埋葬尸體的墳?zāi)狗饪诓粐?yán)時(shí).這種氣體就很易逸出。農(nóng)村的墓地通常位于山坡上,埋葬著大量尸體。在夜晚,氣體燃燒會(huì)發(fā)出綠幽幽的光,長(zhǎng)期以來人們無法正確地解釋這種現(xiàn)象,將其稱之為“鬼火”。烴類化合物的分解烴類化合物主要是被氧化,是一個(gè)絕對(duì)需氧的過程,在缺氧條件下,烴類完全不受微生物影響。(所以地下沉積的石油會(huì)長(zhǎng)期不變)能分解烴類的微生物:細(xì)菌(假單胞菌,分枝桿菌,棒狀桿菌);放線菌(鏈霉菌,諾卡氏菌);酵母菌。一般在油田及煉油廠附近都能分離到。應(yīng)用:萘被假單胞菌利用生成水楊酸;丙烯氰生成丙烯酰胺;石油脫蠟;石油代替糧食發(fā)酵;石油探測(cè)。絕對(duì)好氧:優(yōu)點(diǎn):石油不被破壞;缺點(diǎn):發(fā)酵過程需通入大量氧氣,消耗動(dòng)力;發(fā)酵培養(yǎng)基中需要加乳化劑(因?yàn)闊N類石油類物質(zhì),與水不相容)。第二節(jié)生物固氮固氮生物:能使氮分子還原成氨的生物。一般均為原核生物,于1888年分離到。能固氮的微生物:自生固氮菌,共生固氮菌,聯(lián)合固氮菌。固氮的生化機(jī)制:固氮反應(yīng)的必要條件:固氮酶(nitrogenase),能量(ATP),還原力,嚴(yán)格的厭氧微環(huán)境。固氮的生化途徑:N2+8[H]+18~24ATP→2NH3+H2+18~24ADP+18~24Pi15華東理工大學(xué)《微生物學(xué)教程》上課講義第七章微生物的生長(zhǎng)及其控制生長(zhǎng)(growth):個(gè)體體積或重量的變化;繁殖(reproduction):個(gè)體數(shù)量的變化。個(gè)體生長(zhǎng)→個(gè)體繁殖→群體生長(zhǎng);群體生長(zhǎng)=個(gè)體生長(zhǎng)+個(gè)體繁殖。生長(zhǎng)和繁殖是交替進(jìn)行的。衡量群體生長(zhǎng)的量:重量、體積、密度、濃度、個(gè)體數(shù)目等。第一節(jié)測(cè)定生長(zhǎng)繁殖的方法純培養(yǎng)的分離法自然界中的微生物都是雜居在一起的,每種微生物的生長(zhǎng)情況是不同的。純種分離:稀釋到平皿法;平板劃線分離法;單細(xì)胞挑取法;利用選擇培養(yǎng)基分離法。微生物生長(zhǎng)的測(cè)定測(cè)定生長(zhǎng)量:測(cè)體積;稱干重;比濁法;生理指標(biāo)法(測(cè)含氮量;測(cè)含碳量;測(cè)磷、DNA、RNA、ATP。)測(cè)細(xì)胞的個(gè)數(shù):比例計(jì)數(shù)法、血球計(jì)數(shù)法、平板活菌計(jì)數(shù)法。
第二節(jié)微生物的生長(zhǎng)規(guī)律細(xì)菌的個(gè)體生長(zhǎng)和同步生長(zhǎng)。研究細(xì)菌個(gè)體的生長(zhǎng)方法:用電子顯微鏡觀察細(xì)胞的超薄切片;同步培養(yǎng)(synchronousculture):使群體中的所有個(gè)體細(xì)胞盡可能的處于同樣細(xì)胞生長(zhǎng)和分裂期中。同步生長(zhǎng)(synchronousgrowth):通過同步培養(yǎng)使細(xì)胞群體處于分裂步調(diào)一致的狀態(tài)。獲得同步生長(zhǎng)的方法:選擇法,誘導(dǎo)法。典型生長(zhǎng)曲線(growthcurve)四個(gè)階段:延滯期、指數(shù)期、穩(wěn)定期、衰亡期。16華東理工大學(xué)《微生物學(xué)教程》上課講義生長(zhǎng)速率常數(shù)(growthrateconstant):每小時(shí)分裂的代數(shù)R。延滯期(lagphase)特點(diǎn):生長(zhǎng)速率常數(shù)為零,代謝活躍,對(duì)外界不良環(huán)境敏感,細(xì)胞變大,RNA(特別是rRNA)含量增高。如何縮短延滯期:種齡,接種量,培養(yǎng)基成分。指數(shù)期(exponentialphase)特點(diǎn):生長(zhǎng)速率常數(shù)最大,代時(shí)(generationtime)最短,細(xì)胞平衡生長(zhǎng),酶系活躍,代謝旺盛。作為發(fā)酵生產(chǎn)的良好種子,可縮短延滯期。穩(wěn)定期(stationaryphase)特點(diǎn):生長(zhǎng)速率常數(shù)為零,菌體產(chǎn)量達(dá)最高點(diǎn),菌體產(chǎn)量與營(yíng)養(yǎng)物消耗有一定的比例關(guān)系。穩(wěn)定期到來的原因:營(yíng)養(yǎng)物耗盡,營(yíng)養(yǎng)物比例失調(diào),積累了有害代謝產(chǎn)物,理化條件不適宜。如何延長(zhǎng)穩(wěn)定期:補(bǔ)料(增加養(yǎng)料,調(diào)節(jié)PH)。細(xì)胞開始貯存糖原、異染顆粒和脂肪等貯藏物,芽孢桿菌開始形成芽孢,積累次級(jí)代謝產(chǎn)物。初生代謝物(primarymetabolites),次生代謝物(secondarymetabolites),穩(wěn)定期產(chǎn)物(idiolites),菌體生長(zhǎng)期(trophophase),代謝產(chǎn)物合成期(idiophase)。衰亡期(declinephase;deathphase)特點(diǎn):負(fù)生長(zhǎng),菌體自溶。如何利用生長(zhǎng)曲線指導(dǎo)生產(chǎn)?種齡:利用對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期的種子;延長(zhǎng)穩(wěn)定期;確定放罐時(shí)間。微生物的連續(xù)培養(yǎng):?jiǎn)危ǚ郑┡囵B(yǎng)(batchculture),密閉培養(yǎng)(closedculture),連續(xù)培養(yǎng)(continuousculture),開放培養(yǎng)(openculture)。恒濁器(turbidostat)改變培養(yǎng)基的流速,以控制菌的濃度恒定。微生物在恒濁器中始終以最高的生長(zhǎng)速率進(jìn)行生長(zhǎng)。用于獲得大量菌體、與菌體生長(zhǎng)相平行的代謝產(chǎn)物的生產(chǎn)。恒化器(chemostat;bactogen)培養(yǎng)基的流速恒定,以某一營(yíng)養(yǎng)物為生長(zhǎng)限制因子。用于與生長(zhǎng)速率相關(guān)的理論研究。單級(jí)連續(xù)培養(yǎng)器(one-stepcontinuousfermentor):代謝產(chǎn)物的生產(chǎn)速率與菌體生長(zhǎng)速率平行。多級(jí)連續(xù)培養(yǎng)器(multi-stepcontinuousfermentor):代謝產(chǎn)物的生產(chǎn)速率與菌體生長(zhǎng)速率不平行。連續(xù)發(fā)酵(continuousfermentation)連續(xù)培養(yǎng)用于生產(chǎn)實(shí)踐時(shí),就稱為連續(xù)發(fā)酵連續(xù)培養(yǎng)的優(yōu)缺點(diǎn)優(yōu)點(diǎn):高效,便于自動(dòng)控制,產(chǎn)品質(zhì)量穩(wěn)定。缺點(diǎn):菌種易退化,易污染雜菌,培養(yǎng)基利用率低。高密度培養(yǎng)(highcell-densityculture)基因工程菌提高產(chǎn)物的比生長(zhǎng)率:?jiǎn)挝粫r(shí)間單位體積內(nèi)的產(chǎn)物量。提高分離提取的效率(下游工程down-streamprocessing)。關(guān)鍵問題:補(bǔ)料,提高溶解氧濃度。
17第三節(jié)影響微生物生長(zhǎng)的主要因素溫度從兩個(gè)方面來看:溫度上升,反應(yīng)速率加快,生長(zhǎng)速率加快;溫度上升,蛋白質(zhì)、核酸被破壞。微生物的生長(zhǎng)有一個(gè)溫度范圍,在這個(gè)范圍內(nèi)有一個(gè)生長(zhǎng)的最適溫度、最低溫度和最高溫度。最適溫度:菌代時(shí)最短,生長(zhǎng)速率最高。氧氣專性好氧菌(strictaerobe),兼性厭氧菌(facultativeaerobe),微好氧菌(microaerophilicbacteria),耐氧菌(aerotolerantanaerobe),厭氧菌(anacerobe)。好氧生物因?yàn)橛蠸OD,因此劇毒的超氧陰離子自由基(O2·-)被歧化成毒性稍低的H2O2,在過氧化氫酶的作用下,H2O2再變成無毒的H2O。PH最適PH,最低PH,最高PH。PH的影響:影響營(yíng)養(yǎng)物的離子化程度,影響環(huán)境中有毒物質(zhì)對(duì)微生物的粗性,影響代謝反應(yīng)中各種酶的活性。華東理工大學(xué)《微生物學(xué)教程》上課講義物理殺菌因素的代表——溫度利用高溫殺菌:干熱滅菌(焚燒滅菌,灼燒滅菌);濕熱滅菌(煮沸消毒法,高壓蒸汽滅菌法,間歇滅菌法,巴斯德消毒法)化學(xué)殺菌劑或抑菌劑表面消毒劑(重金屬鹽類:紅汞;有機(jī)化合物:酚類、醇類、酸類、醛類;氧化劑:鹵素及其化合物;表面活性劑:新潔爾滅,肥皂;染料:龍膽紫;氣體:環(huán)氧乙烷)。抗代謝藥物的代表——磺胺類藥物第四節(jié)有害微生物的控制滅菌(sterilization):采用強(qiáng)烈的理化因素使任何物體內(nèi)外部的一切微生物永遠(yuǎn)喪失其生長(zhǎng)繁殖能力的措施,稱為滅菌。消毒(disinfection):采用較溫和的理化因素,僅殺死物體表面或內(nèi)部一部分對(duì)人體或動(dòng)植物有害的病原菌,而對(duì)被消毒的對(duì)象基本無害的措施。防腐(antisepsis):利用某種理化因素完全抑制霉腐微生物的生長(zhǎng)繁殖,即通過制菌作用(becteriostasis)防止食品、生物制品等對(duì)象發(fā)生霉腐的措施?;?chemotherapy):利用具有高度選擇毒力(selectivetoxicity)即對(duì)病原菌具高度選擇毒力而對(duì)其宿主基本無毒的化學(xué)物質(zhì)來抑制宿主體內(nèi)病原微生物的生長(zhǎng)繁殖,借以達(dá)到治療該宿主傳染病的一種措施。抗代謝藥物一類在化學(xué)結(jié)構(gòu)上與細(xì)胞內(nèi)必要代謝物的結(jié)構(gòu)相似,并可干擾其正常代謝活動(dòng)的化學(xué)物質(zhì)。SMZ:磺胺二甲惡唑(sulfamethoxazole)18華東理工大學(xué)《微生物學(xué)教程》上課講義抗生素抑制細(xì)胞壁的形成-青霉素(青霉素不能口服,它不耐酸,在胃中被降解);影響細(xì)胞膜的功能-多粘菌素;干擾蛋白質(zhì)合成-鏈霉素;阻礙核酸的合成-博萊霉素。微生物的抗藥性。微生物對(duì)環(huán)境的適應(yīng)性產(chǎn)生鈍化酶;改變細(xì)胞膜的透性;細(xì)胞內(nèi)被藥物作用的部位發(fā)生改變。利用抗藥性來指導(dǎo)生產(chǎn)例:如何利用抗磺胺類藥物的菌株生產(chǎn)對(duì)氨基苯甲酸?磺胺對(duì)氨基苯甲酸如果對(duì)氨基苯甲酸增加,磺胺藥療效降低,所以尋找抗磺胺藥的菌株就可增加對(duì)氨基苯甲酸的產(chǎn)量。第八章微生物的遺傳變異和育種遺傳性:親代具有把他所有的形狀給子代的特性。變異性:子代具有改變親代遺傳性狀的特征。遺傳型(genotype),表型(phenotype),變異(varition),飾變(modification)。
第一節(jié)遺傳變異的物質(zhì)基礎(chǔ)三個(gè)經(jīng)典實(shí)驗(yàn):轉(zhuǎn)化試驗(yàn):1928年,F(xiàn).Griffith,肺炎雙球菌,Streptococcuspneumoniae。1944年,O.T.AveryDNARNA蛋白質(zhì)多糖DNA+DNA酶RⅡRⅡRⅡRⅡRⅡ少量SⅢ---___噬菌體感染試驗(yàn):1952年,A.D.Hershey(侯喜)M.Chase(蔡斯)病毒的重建試驗(yàn):1956年,H.Fraenkel-Conrat(弗朗克-康勒脫)噬菌體感染試驗(yàn)和病毒的重建試驗(yàn)的說明圖見下頁(yè)19華東理工大學(xué)《微生物學(xué)教程》上課講義朊病毒的發(fā)現(xiàn)和思考:蛋白質(zhì)是否是遺傳的物質(zhì)基礎(chǔ)?prpsc,蛋白質(zhì)折疊。DNA的結(jié)構(gòu)基本單位是核苷酸:核糖(戊糖)+堿基+磷酸。堿基有四種:腺嘌呤(A),鳥嘌呤(G),胸腺嘧啶(T),胞嘧啶(C)。單鏈上的堿基不受配對(duì)的限制,決定了遺傳的多樣性。半保留的自我復(fù)制保證了生物遺傳的相對(duì)穩(wěn)定。第二節(jié)基因突變和誘變育種20基因突變(genemutation):突變細(xì)胞的遺傳物質(zhì)的分子結(jié)構(gòu)或數(shù)量發(fā)生可遺傳的變化。突變的類型:營(yíng)養(yǎng)缺陷型(auxotroph)菌株:野生型菌株發(fā)生基因突變而喪失合成一種或幾種生長(zhǎng)因子的能力,從而不能在基本培養(yǎng)基上生長(zhǎng)的變異菌株??剐酝蛔冃停╮esistantmutant)菌株:野生型菌株發(fā)生基因突變而對(duì)某化學(xué)藥物或致死物理因子產(chǎn)生抗性的菌株。華東理工大學(xué)《微生物學(xué)教程》上課講義條件致死突變型(conditionallethalmutant)菌株:菌株發(fā)生基因突變后,在某種條件下可正常生長(zhǎng),而在另一種條件下無法生長(zhǎng)。形態(tài)突變型(morphologicalmutant)菌株:菌株發(fā)生基因突變,而在個(gè)體形態(tài)或菌落形態(tài)上發(fā)生突變的菌株。抗原突變型(antigenicmutant)菌株:菌株發(fā)生基因突變,而在細(xì)胞抗原結(jié)構(gòu)上發(fā)生變異的菌株。產(chǎn)量突變型(metabolitequantitativemutant)菌株:菌株發(fā)生基因突變,在代謝產(chǎn)物產(chǎn)量上明顯有別于原始菌株的突變株。正變株(plus-mutant);負(fù)變株(minus-mutant)。突變率(mutationrate):一個(gè)細(xì)胞每一世代某一性狀突變的幾率;群體中每一世代(分裂一次)產(chǎn)生突變的個(gè)數(shù)。突變率:10-8基因突變的特點(diǎn):不對(duì)應(yīng)性:突變的性狀與引起突變的原因之間沒有直接的對(duì)應(yīng)關(guān)系;自發(fā)性(10-6~10-9);稀有性;獨(dú)立性;可誘變性;穩(wěn)定性;可逆性:回復(fù)突變(reverse(back)mutation)。證明基因突變自發(fā)性和不對(duì)應(yīng)性的實(shí)驗(yàn):變量試驗(yàn)(fluctuationtest):波動(dòng)試驗(yàn)、彷徨試驗(yàn);1943年;S.E.Luria&M.Delbruck。涂布試驗(yàn):1949年,H.B.Newcombe影印平板培養(yǎng)法(replicaplating):1952年,J.Lederberg微生物產(chǎn)生抗藥性的途徑:基因突變而產(chǎn)生抗藥性;抗藥性質(zhì)粒的獲得(R因子);生理上的適應(yīng)?;蛲蛔兗捌錂C(jī)制:右圖為突變的類型。21華東理工大學(xué)《微生物學(xué)教程》上課講義誘變(inducedmutation):堿基的置換(substitution),轉(zhuǎn)換(transition),顛換(transversion)。兩個(gè)例子:亞硝酸;5-溴尿嘧啶(堿基類似物baseanalog)。移碼突變(frame-shiftmutationphase-shiftmutation)22華東理工大學(xué)《微生物學(xué)教程》上課講義染色體畸變(chromosomalaberration)轉(zhuǎn)座(transposition):DNA序列通過非同源重組的方式,從染色體某一部位轉(zhuǎn)移到同一染色體的另一部位或其它染色體上的某一部位。轉(zhuǎn)座因子(transposableelement):具有轉(zhuǎn)座作用插入序列(insertionsequence,IS);轉(zhuǎn)座子(transposon,Tn);轉(zhuǎn)座噬菌體(transposablephage)自發(fā)突變(spontaneousmutation):由微生物自身有害代謝產(chǎn)物引起;由DNA復(fù)制過程中堿基配對(duì)錯(cuò)誤引起;由背景輻射和環(huán)境因素引起。遺傳密碼改變的表型效應(yīng):23華東理工大學(xué)《微生物學(xué)教程》上課講義紫外線對(duì)DNA的損傷及其修復(fù)紫外線(ultravioletray)對(duì)DNA的損傷;嘧啶二聚體;光復(fù)活作用(photoreactivation,photorestoration)切除修復(fù)(excisionrepair)突變與育種自發(fā)突變與育種(Breedingbyspontaneousmutation)從生產(chǎn)中育種;定向培育優(yōu)良菌株。自然選育的目的:維持原有的產(chǎn)物的合成水平(穩(wěn)產(chǎn));誘變后的菌株群體中表現(xiàn)出各種生理特性需要純化。誘變育種(breedingbyinducedmutation)誘變育種的幾個(gè)方向:提高產(chǎn)量;改進(jìn)產(chǎn)品質(zhì)量;產(chǎn)生新的生物活性物質(zhì)誘變育種的基本環(huán)節(jié)(左圖所示)出發(fā)菌株→誘變→初篩→復(fù)篩→放大→獲得優(yōu)良變異株。誘變育種兩個(gè)主要的環(huán)節(jié):誘變(inducedmutation);篩選(screening)。誘變育種中的幾個(gè)原則:誘變劑的選擇:簡(jiǎn)便有效;誘變劑的種類:物理誘變劑,化學(xué)誘變劑,擬輻射物質(zhì)(radiomemeticchemical);誘變劑量的選擇:存活率或死亡率曲線,劑量-誘變率曲線;出發(fā)菌株(originalstrain)的選擇:處理細(xì)胞所處的狀態(tài),一般為單孢子懸液;表型延遲(phenotypelag):遺傳型雖已突變,但表型卻要經(jīng)染色體復(fù)制、分離和細(xì)胞的分裂后才表現(xiàn)出來。利用復(fù)合處理的協(xié)同效應(yīng)(synergism);利用和創(chuàng)造形態(tài)、生理和產(chǎn)量之間的相關(guān)指標(biāo);設(shè)計(jì)高效的篩選方法:推理選育。突變株的篩選:產(chǎn)量突變株的篩選,抗藥性突變株的篩選,營(yíng)養(yǎng)缺陷型菌株的篩選24華東理工大學(xué)《微生物學(xué)教程》上課講義營(yíng)養(yǎng)缺陷型突變株:野生型菌株(widetypestrain);原養(yǎng)型(prototroph);回復(fù)突變株(backmutant,reversemutant);基本培養(yǎng)基(minimummedium,MM);補(bǔ)充培養(yǎng)基(supplementedmedium,SM);完全培養(yǎng)基(completemedium,CM)。前體1→A→B→C→D→前體2途徑αβγ酶↑↑↑abc基因一個(gè)基因一條多肽鏈篩選營(yíng)養(yǎng)缺陷型菌株的四個(gè)環(huán)節(jié):誘變;淘汰野生型(抗生素法,菌絲過濾法);檢出缺陷型(夾層培養(yǎng)法,限量補(bǔ)充法,逐個(gè)檢出法,影印平板法);鑒定缺陷型(生長(zhǎng)譜法)。維生素的生長(zhǎng)譜營(yíng)養(yǎng)缺陷型菌株的應(yīng)用:賴氨酸,研究代謝途徑。氨基酸的生長(zhǎng)譜25華東理工大學(xué)《微生物學(xué)教程》上課講義研究代謝途徑:粗糙鏈孢霉(Neurosporacrassa)瓜氨酸-++鳥氨酸--+突變株Ⅰ突變株Ⅱ突變株Ⅲ精氨酸+++前體→鳥氨酸→瓜氨酸→精氨酸→..艾姆氏試驗(yàn)(Amestest):生物的遺傳物質(zhì)是核酸;凡對(duì)微生物有效的誘變劑對(duì)高等動(dòng)物同樣有效;化學(xué)藥劑對(duì)細(xì)菌的誘變率與其對(duì)動(dòng)物的致癌率成正比;凡致癌物質(zhì)都是誘變劑,但并非所有的誘變劑都能致癌;95%的致癌劑有誘變作用,約90%的非致癌劑就沒有誘變劑的作用。材料:鼠傷寒沙門氏菌組氨酸缺陷型菌株,老鼠肝臟抽提液。
第三節(jié)基因重組和基因雜交基因重組(generecombination)遺傳重組(geneticrecombination):兩個(gè)獨(dú)立基因組內(nèi)的遺傳基因,通過一定的途徑轉(zhuǎn)移到一起,形成新的穩(wěn)定基因組的過程。原核生物的基因重組轉(zhuǎn)化(transformation)轉(zhuǎn)導(dǎo)(transduction)接合(conjugation,mating)原生質(zhì)體融合(protoplastfusion)轉(zhuǎn)化:受體菌直接吸收來自供體菌的DNA片段,通過交換把他整合到自己的基因組中,從而獲得供體菌部分遺傳性狀的現(xiàn)象。受體細(xì)胞(recipientcell,receptor)供體細(xì)胞(donorcell)轉(zhuǎn)化子(transformant)26局限轉(zhuǎn)導(dǎo)華東理工大學(xué)《微生物學(xué)教程》上課講義感受態(tài):受體細(xì)胞最易接受外源DNA片段并實(shí)現(xiàn)轉(zhuǎn)化的生理狀態(tài)。轉(zhuǎn)化的過程:感受態(tài)細(xì)胞吸收DNA;DNA摻入細(xì)胞后的整合。轉(zhuǎn)化的要求:受體細(xì)胞處于感受狀態(tài)(competence)轉(zhuǎn)化的特點(diǎn):直接吸收;受體細(xì)胞處于感受態(tài)轉(zhuǎn)染(transfection)轉(zhuǎn)導(dǎo):通過缺陷噬菌體的媒介,將供體細(xì)胞的DNA片段攜帶入受體細(xì)胞中,通過交換和整合,使后者獲得前者的部分遺傳性狀。缺陷噬菌體(defectivephage)轉(zhuǎn)導(dǎo)子(transductant)普遍性轉(zhuǎn)導(dǎo)(generalizedtransduction):完全缺陷噬菌體。特點(diǎn):隨機(jī)包裹;轉(zhuǎn)導(dǎo)子非溶原性。局限性轉(zhuǎn)導(dǎo)(specializedtransduction):部分缺陷噬菌體。特點(diǎn):轉(zhuǎn)導(dǎo)的是特定基因;轉(zhuǎn)導(dǎo)子為缺陷溶原性。普遍性轉(zhuǎn)導(dǎo)和局限性轉(zhuǎn)導(dǎo)的比較普遍性轉(zhuǎn)導(dǎo)和局限性轉(zhuǎn)導(dǎo)的比較普遍轉(zhuǎn)導(dǎo)任何基因能轉(zhuǎn)導(dǎo)的基因不結(jié)合到寄主上噬菌體在寄主中的位置獲得轉(zhuǎn)化噬菌體的方式轉(zhuǎn)導(dǎo)子的區(qū)別通過敏感菌的裂解非溶原性特定基因結(jié)合到寄主上通過溶源菌的誘導(dǎo)部分溶原性27華東理工大學(xué)《微生物學(xué)教程》上課講義溶源轉(zhuǎn)變lysogenicconversion接合:供體菌(F+菌株,雄性菌株)通過性菌毛與受體菌(F-菌株,雌性菌株)直接接觸,把F質(zhì)?;蚱鋽y帶的不同長(zhǎng)度的核基因組片段傳遞給后者,使后者獲得若干新的遺傳性狀。F+菌株;F-菌株;Hfr菌株;F’菌株。特點(diǎn):兩細(xì)胞直接接觸;需要性因子性因子可通過接合獲得。原生質(zhì)體融合:通過人工的方法,使遺傳性狀不同的兩個(gè)細(xì)胞的原生質(zhì)體進(jìn)行融合,從而獲得兼有兩親本遺傳性狀的重組子。原生質(zhì)體技術(shù)的優(yōu)越性:去掉了細(xì)胞壁的障礙,親株基因組可直接融合、交換,并為鏈霉菌實(shí)現(xiàn)基因轉(zhuǎn)化創(chuàng)造了條件;二親株的基因組之間可發(fā)生多次交換,得到多種類型的重組子,且參與融合的親株不限于一個(gè),可以多至3、4個(gè);重組頻率高;可用誘變的方法直接處理原生質(zhì)體,提高突變率;再生成細(xì)胞壁的過程常伴隨治理的消除,使染色體發(fā)生改變;極其簡(jiǎn)單,操作方便,不需要貴重藥品。28華東理工大學(xué)《微生物學(xué)教程》上課講義如何得到原生質(zhì)體:菌體(菌絲)培養(yǎng);細(xì)胞壁的去除;原生質(zhì)體的融合(再生);檢出重組子。再生頻率的計(jì)算:原生質(zhì)體數(shù)H-原生質(zhì)體數(shù)水再生頻率=————————————原生質(zhì)體總數(shù)(血球計(jì)數(shù))原生質(zhì)體技術(shù)的應(yīng)用:利用原生質(zhì)體形成及再生達(dá)到改良親本的目的(大環(huán)內(nèi)酯類抗生素);利用原生質(zhì)體誘變提高突變率(慶大霉素);利用原生質(zhì)體融合獲得性的抗生素(Indolizomycin);利用再生,得到了產(chǎn)量提高的變異菌株,例如生二素鏈霉菌(Streptomyteceambofaciens)通過原生質(zhì)體再生,螺旋霉素的生產(chǎn)能力提高了三倍多。質(zhì)粒消除的結(jié)果常常導(dǎo)致細(xì)胞染色體的改變,或使次級(jí)代謝途徑發(fā)生變化(白霉素和金絲霉素),出現(xiàn)有利于提高抗生素產(chǎn)量的變異菌株。有效的種間融合,使兩個(gè)產(chǎn)生不同抗生素菌株的調(diào)節(jié)基因和結(jié)構(gòu)基因重組在一起,誘發(fā)一些原來為“沉默基因’的表達(dá),從而產(chǎn)生新物質(zhì)。同時(shí)種間融合還可能使兩個(gè)產(chǎn)生不同抗生素菌株的結(jié)構(gòu)基因重組而產(chǎn)生雜種抗生素。真核微生物的基因重組有性雜交(sexualhybridization)準(zhǔn)性雜交(parasexualhybridization)同種而不同菌株的體細(xì)胞間發(fā)生的融合,常見于半知菌類。準(zhǔn)性雜交過程:菌絲聯(lián)結(jié)(anastomosis);形成異核體(heterocaryon);核融合(nuclearfusion);體細(xì)胞交換(somaticcrossing-over)和單倍化。第四節(jié)基因工程基因工程(geneengineering)遺傳工程(geneticengineering):人工的離體的分子水平上的遺傳重組技術(shù)?;静僮鳎韩@取目的基因;優(yōu)良載體的選擇;目的基因與載體DNA的體外重組;重組載體導(dǎo)入受體細(xì)胞(轉(zhuǎn)化);重組受體細(xì)胞的篩選和鑒定;工程菌的表達(dá)。29華東理工大學(xué)《微生物學(xué)教程》上課講義對(duì)質(zhì)粒載體的要求:是一個(gè)獨(dú)立的復(fù)制子;具有較多的單一限制性內(nèi)切酶位點(diǎn);有方便的篩選標(biāo)記;具有外源DNA片段插入失活的附加標(biāo)記;高拷貝數(shù)。應(yīng)用:生產(chǎn)多肽類藥物:干擾素(interferon),白細(xì)胞介素(interleukin);生產(chǎn)疫苗:乙肝疫苗;改造傳統(tǒng)工業(yè)發(fā)酵的菌種;改良動(dòng)植物的特性;用于環(huán)境保護(hù)的“超級(jí)菌”的構(gòu)建。工程菌的不穩(wěn)定性。30華東理工大學(xué)《微生物學(xué)教程》上課講義第五節(jié)菌種的衰退、復(fù)壯和保藏菌種的衰退和復(fù)壯衰退(degeneration):菌種的特性發(fā)生了負(fù)變,如生長(zhǎng)速度減慢、代謝產(chǎn)物合成能力下降。菌種衰退的原因:自發(fā)突變。衰退的防止:控制傳代次數(shù);創(chuàng)造良好的培養(yǎng)條件;利用不易衰退的細(xì)胞傳代;采用有效的菌種保藏方法。復(fù)壯:從已衰退的群體中篩選出少數(shù)沒有退化的個(gè)體。菌種的復(fù)壯:純種分離法(purecultureisolation),包括菌落純(purecultureincolonylever)和菌株純(purecultureinstrainlever);通過寄主體復(fù)壯。菌種的保藏菌種保藏的意義:菌種是一個(gè)國(guó)家極其重要和寶貴的生物資源。菌種保藏的原理:通過保持培養(yǎng)基營(yíng)養(yǎng)成分在最低水平,缺氧狀態(tài),干燥和低溫,使菌種處于“休眠”狀態(tài),抑制其繁殖能力。菌種保藏的方法:斜面冰箱保藏法:斜面保藏是一種短期、過渡的保藏方法,用新鮮斜面接種后,置最適條件下培養(yǎng)到菌體或孢子生長(zhǎng)豐滿后,放在4℃冰箱保存。一般保存期為三個(gè)月到六個(gè)月沙土管保藏法:適合于產(chǎn)孢子或芽孢的微生物。將斜面孢子制成孢子懸浮液接入沙土管中或?qū)⑿泵骀咦庸蜗轮苯优c沙土混合,置干燥器中用真空泵抽干,放在冰箱內(nèi)保存。一般保存期為1年左右。菌絲速凍法:對(duì)于不產(chǎn)孢子或芽孢的微生物,一般不能用沙土管保藏。為了方便可以采用甘油菌絲速凍法。由于該法的保藏溫度為-20℃,為了避免微生物受損傷致死,需要甘油作為保護(hù)劑。甘油的最終濃度為25%。石蠟油封存法:向培養(yǎng)成熟的菌種斜面上,倒入一層滅過菌的石蠟油,用量要高出斜面一厘米,然后保存在冰箱中。此法可適用于不能利用石蠟油作碳源的細(xì)菌、霉菌、酵母等微生物的保存。保存期約一年左右。真空冷凍干燥保藏法:目前常用的較理想的一種方法。在真空中使水分升華。微生物的生長(zhǎng)和代謝都暫時(shí)停止,不易發(fā)生變異。菌種保存時(shí)間一般5年左右。需要一定的設(shè)備。保護(hù)劑一般采用脫脂牛奶或血清等。保護(hù)劑的作用可能是在冷凍干燥的脫水過程中代替結(jié)合水而穩(wěn)定細(xì)胞成分(細(xì)胞膜)的構(gòu)型,防止細(xì)胞膜因?yàn)閮鼋Y(jié)而破壞。保護(hù)劑還可以起支持作用,使微生物疏松地固定在上面。液氮超低溫保藏法:適用范圍最廣的微生物保藏法。尤其是一些不產(chǎn)孢子的菌絲體,用其它保藏方法不理想,可用液氮保藏法,其保存期最長(zhǎng)。原理:用液氮能長(zhǎng)期保存菌種。這是因?yàn)橐旱臏囟瓤蛇_(dá)-196℃,遠(yuǎn)遠(yuǎn)低于其新陳代謝作用停止的溫度(-130℃),所以此時(shí)菌種的代謝活動(dòng)已停止,化學(xué)作用亦隨之消失。需要保護(hù)劑,常用的保護(hù)劑為10%甘油。先將菌液降溫到0℃,再以每分鐘降低1℃的速度,一直降低到-35℃,然后才把裝有菌液的安瓿管放入液氮罐的氣相中。國(guó)內(nèi)菌種保藏機(jī)構(gòu)中國(guó)微生物菌種保藏管理委員會(huì)(ChinaCommitteeforCultureCollectionof31華東理工大學(xué)《微生物學(xué)教程》上課講義Microorganisms.CCCMS)委托中國(guó)科學(xué)院負(fù)責(zé)擔(dān)負(fù)全國(guó)菌種保藏管理業(yè)務(wù),下設(shè)六個(gè)菌種保藏管理中心。l)普通微生物菌種保藏管理中心(CCGMC)中國(guó)科學(xué)院微生物研究所,北京(AS):真菌,細(xì)菌。中國(guó)科學(xué)院武漢病毒研究所,武漢(AS—IV):病毒。2)農(nóng)業(yè)微生物菌種保藏管理中心(ACCC)中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院土壤肥料研究所,北京(ISF)。3)工業(yè)微生物菌種保藏管理中心(CICC)輕工業(yè)部食品發(fā)酵工業(yè)科學(xué)研究所,北京(IFFI)。4)醫(yī)學(xué)微生物菌種保藏管理中心(CMCC)中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院皮膚病研究所,南京(ID):真菌。衛(wèi)生部藥品生物制品檢定所,北京(NICPBP):細(xì)菌。中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院病毒研究所,北京:病毒。5)抗生素菌種保藏管理中心(CACC)中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院抗生素研究所,北京(IA)。四川抗生素工業(yè)研究所,成都(STA):新抗生素菌種。華北藥廠抗生素研究所,石家莊(IANP):生產(chǎn)用抗生素菌種。6)獸醫(yī)微生物菌種保藏管理中心(CVCC)農(nóng)業(yè)部獸醫(yī)藥品監(jiān)察所,北京。國(guó)外菌種保藏機(jī)構(gòu)l)ATCCAmericanTypeCultureCollection.Rockvill.Maryland.U.S.A.美國(guó)標(biāo)準(zhǔn)菌種收藏所,美國(guó),馬里蘭洲,羅克維爾市。2)CSH32華東理工大學(xué)《微生物學(xué)教程》上課講義個(gè)體??;營(yíng)養(yǎng)類型多;存在休眠體。土壤中的微生物:為什么土壤是微生物的天然培養(yǎng)基?營(yíng)養(yǎng)豐富;PH適宜;溫度、通氣。分布情況:細(xì)菌,放線菌,霉菌,酵母菌。水體中的微生物:水中的病原微生物大腸菌群值=1000/大腸菌群數(shù)飲用水的標(biāo)準(zhǔn):總細(xì)菌數(shù):<100個(gè)/ml;大腸菌群數(shù):<3個(gè)/l。空氣中的微生物:主要附著在灰塵上。如何檢查空氣中的微生物:平板檢查法;將空氣通入水中,檢查水中的細(xì)菌;塵埃粒子計(jì)數(shù)器??諝庵形⑸锏奶幚?空氣過濾器;紫外線照射;噴霧消毒。工農(nóng)業(yè)產(chǎn)品中的微生物:工業(yè)產(chǎn)品的霉腐;食品上的微生物;農(nóng)產(chǎn)品上的微生物。極端環(huán)境下的微生物:嗜熱微生物;嗜冷微生物;嗜酸微生物;嗜堿微生物;嗜鹽微生物;嗜壓微生物;抗輻射微生物。第二節(jié)微生物與生物環(huán)境間的關(guān)系互生共生寄生拮抗捕食互生(metabiosis):兩種可單獨(dú)生活的生物,當(dāng)它們?cè)谝黄饡r(shí),通過各自的代謝活動(dòng)而有利于對(duì)方,或偏利于一方的生活方式?!翱煞挚珊希媳确趾谩被ド睦?固氮菌Vs纖維素分解菌人Vs腸道中的正常菌群排阻、抑制外來致病菌;產(chǎn)生有助于消化的淀粉酶、蛋白酶;分解有毒物質(zhì);營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)。共生(symbiosis):兩種生物共居在一起,相互分工合作,合二為一的極其緊密的一種相互關(guān)系。“相依為命,難分難解”共生的例子:地衣(lichen):真菌與藻類;根瘤菌與植物;反芻動(dòng)物(牛)與瘤胃微生物。寄生(parasitism):一種小型生物生活在另一種較大生物體內(nèi)或體表,從中奪取營(yíng)養(yǎng)進(jìn)行生長(zhǎng)繁殖,并使后者蒙受損失甚至被殺死的一種相互關(guān)系。寄生物(parasite);寄主(host)。寄生的例子:噬菌體與宿主菌;煙草與TMV;人與病原微生物。拮抗(antagonism):某種生物產(chǎn)生的特定代謝產(chǎn)物可抑制其他生物的生長(zhǎng)甚至殺死它們的一種相互關(guān)系。特異性拮抗;非特異性拮抗。拮抗的例子:青霉菌產(chǎn)生青霉素;乳酸菌產(chǎn)酸。捕食(predatism,predation):一種大型生物直接捕捉、吞食另一種小型生物以滿足其營(yíng)養(yǎng)需要的相互關(guān)系。捕食的例子:原生動(dòng)物與細(xì)菌。第三節(jié)微生物與環(huán)境保護(hù)水體的污染——富營(yíng)養(yǎng)化水體自凈:天然水體受到污染后,在無人為處理的條件下,借水體自身的能力得到凈化的過程。33華東理工大學(xué)《微生物學(xué)教程》上課講義物理作用:稀釋,沉降,擴(kuò)散;化學(xué)作用:氧化,還原,分解,凝聚;生物作用:細(xì)菌。富營(yíng)養(yǎng)化(eutrophication):水華(waterbloom),赤潮(redtide)。用微生物治理污水。污水分為生活污水和工業(yè)廢水。評(píng)價(jià)水質(zhì)的指標(biāo):化學(xué)需氧量COD(chemicaloxygendemand):用強(qiáng)氧化劑使一升污水中所含的有機(jī)物氧化所消耗的氧的毫克數(shù)。生化需氧量BOD(biochemicaloxygendemand):微生物在有足夠溶解氧存在的條件下,分解一升污水中所含有機(jī)物過程中所消耗的水中溶解氧的毫克數(shù)BOD5:20℃,5天,1升水溶解氧的減少量。生物的污水處理:完全混合曝氣法;活性污泥法;生物膜法。活性污泥(activatedsludge):由或細(xì)菌、原生動(dòng)物和其他微生物群聚集在一起組成的凝絮團(tuán),在污水處理中具有很強(qiáng)的吸附、分解有機(jī)物或有毒物的能力。細(xì)菌是分解有機(jī)物的主力;細(xì)菌聚集成菌膠團(tuán),形成絮狀物。細(xì)菌:吸附有機(jī)物,并分解之;吸附金屬離子與有機(jī)物形成絡(luò)合物;保護(hù)細(xì)菌;利于沉降;原生動(dòng)物:吞噬游離細(xì)菌;吞噬微小污泥;分泌粘性物質(zhì);利于絮凝;霉菌:利于絮凝;酵母菌:分解氰、酚。預(yù)處理:去掉一些大的顆粒、稀釋污水;曝氣:微生物分解有機(jī)物或有毒物;沉淀:出水、回流部分污泥。曝氣的原理:是群體的協(xié)同作用。生物膜法(biofilm):生長(zhǎng)在潮濕、通氣的固體表面上的一層由多種活微生物構(gòu)成的粘滑、暗色菌膜,能氧化、分解污水中的有機(jī)物或某些有毒物。第一節(jié)傳染第十章傳染與免疫傳染與傳染病。傳染(infection):病原微生物侵入機(jī)體后,在一定的部位生長(zhǎng)、繁殖,從而引起一系列病理生理的過程。由于機(jī)體的抵抗力和病原菌兩方面的力量不同以及環(huán)境因素的影響,有時(shí)不表現(xiàn)臨床癥狀,成為隱性傳染或帶菌狀態(tài),有時(shí)表現(xiàn)出臨床癥狀——傳染病。傳染病(infectiousdisease):可從一個(gè)宿主個(gè)體直接或間接傳播到另一宿主個(gè)體的疾病。免疫:抗傳染免疫(免疫防護(hù)):變態(tài)反應(yīng);自身穩(wěn)定功能:自身免疫疾??;免疫監(jiān)視作用:腫瘤病。34華東理工大學(xué)《微生物學(xué)教程》上課講義決定傳染結(jié)局的三大因素:病原體;宿主的免疫力;環(huán)境因素。病原體毒力(virulence),致病力(pathogenicity)。侵襲力(invastiveness):吸附和侵入能力;繁殖與擴(kuò)散能力;抵抗宿主防御功能的能力。毒素(toxin)外毒素(exotoxin):病原菌生長(zhǎng)過程中不斷向外界環(huán)境分泌的一類毒性蛋白。毒性強(qiáng),抗原性強(qiáng),毒性不穩(wěn)定(對(duì)熱和化學(xué)物質(zhì)敏感);0.3-0.4%甲醛脫毒。內(nèi)毒素(endotoxin):是G-菌細(xì)胞壁外層的組分之一,化學(xué)成分為脂多糖(LPS),一般不分泌到環(huán)境中。毒性低,抗原性弱,化學(xué)穩(wěn)定性強(qiáng)。熱源物質(zhì)(pyrogen)。入侵病原體的數(shù)量;侵入門徑(entrypoint)。宿主的免疫力免疫力(immunity):免疫防御(immunologicdefence);免疫穩(wěn)定(immunologichomeostasis);免疫監(jiān)視(immunologicserveillance)。環(huán)境因素:宿主環(huán)境(先天,后天);外界環(huán)境;自然環(huán)境;社會(huì)環(huán)境。傳染的三種可能結(jié)局:隱性傳染(inapparentinfection);帶菌狀態(tài)(carrierstate);顯性傳染(apparentinfection)。
第二節(jié)非特異性免疫非特異性免疫(nonspecificimmunity);先天免疫(innateimmunity);自然免疫(naturalimmunity)。自然免疫:在生物長(zhǎng)期進(jìn)化過程中形成,屬于先天即有、相對(duì)穩(wěn)定、無特殊針對(duì)性的對(duì)付病原體的天然抵抗力。表皮和屏障結(jié)構(gòu)(barrierstructure):機(jī)械作用;化學(xué)保護(hù)作用;正常菌群的拮抗作用;粘膜表面的免疫球蛋白。皮膚與粘膜;血腦屏障(blood-brainbarrier):內(nèi)皮細(xì)胞層,細(xì)胞間連接緊密,阻擋病原菌進(jìn)入腦組織,保護(hù)中樞神經(jīng)系統(tǒng);血胎屏障(blood-embryobarrier):母體子宮內(nèi)膜和胎兒的絨毛膜,防止母體內(nèi)的病原體進(jìn)入胎兒。吞噬細(xì)胞的吞噬作用吞噬細(xì)胞:存在于血液、體液和組織中,能吞噬、殺死和消化病原菌的白細(xì)胞。多形核白細(xì)胞(polymorphonuclearleukocyte,PMN);粒細(xì)胞(granulocyte):產(chǎn)生于骨髓,完全成熟后進(jìn)入血流,是一類活動(dòng)非常積極的重要細(xì)胞。急性炎癥反應(yīng)中的重要吞噬細(xì)胞。包括嗜中性粒細(xì)胞(neutrophil);嗜堿性粒細(xì)胞(basophil);嗜酸性粒細(xì)胞(eosinophil)。35華東理工大學(xué)《微生物學(xué)教程》上課講義巨噬細(xì)胞(macrophage,M.):由骨髓干細(xì)胞分化而來,在組織中分布廣;肝臟、肺、網(wǎng)狀結(jié)締組織。吞噬和殺菌作用抗原遞呈作用:通過吞噬、處理和傳遞,對(duì)外來抗原物質(zhì)進(jìn)行加工,以適應(yīng)激活淋巴細(xì)胞的需要;免疫調(diào)節(jié)作用:在外來抗原刺激下,產(chǎn)生多種可溶性生物活性物質(zhì),進(jìn)行免疫調(diào)節(jié);抗癌作用。炎癥反應(yīng):炎癥(inflammation):機(jī)體對(duì)病原體的侵入或其他損傷的一種保護(hù)反應(yīng),在相應(yīng)部位出現(xiàn)紅、腫、熱、痛和功能障礙。是病理過程,也是免疫反應(yīng)。正常體液或組織中的抗菌物質(zhì):補(bǔ)體(complement);干擾素(interferons,IFNs)補(bǔ)體:是血清中的正常成分,有補(bǔ)充抗體作用的能力。有九種不同的成分C1,C2,C3,C4,C5,C6,C7,C8,C9;C1包括C1q,C1r,C1s。被抗原抗體復(fù)合物激活后,可溶解和殺傷細(xì)胞,增強(qiáng)吞噬作用。動(dòng)員大量吞噬細(xì)胞聚集在炎癥部位;血流的加速使血液中抗菌因子和抗體發(fā)生局部濃縮;死亡的宿主細(xì)胞堆積可釋放一部分抗菌物質(zhì);炎癥中心部位氧濃度下降和乳酸濃度提高,可抑制多種病原體的生長(zhǎng);炎癥部位體溫的升高可降低某些病原體的繁殖速度。36華東理工大學(xué)《微生物學(xué)教程》上課講義第三節(jié)特異性免疫特異性免疫(specificimmunity)獲得性免疫(acquiredimmunity)適應(yīng)性免疫(adaptiveimmunity):機(jī)體針對(duì)某一種或一類微生物或其產(chǎn)物所產(chǎn)生的特異性抵抗力,是后天獲得的。免疫應(yīng)答(immuneresponse):發(fā)生在活生物體內(nèi)的特異性免疫的系列反應(yīng)過程。是抗原、抗體的特異性反應(yīng)。抗原(antigen,Ag);免疫原(immunogen):能刺激誘導(dǎo)機(jī)體發(fā)生免疫應(yīng)答并能與相應(yīng)抗體或T淋巴細(xì)胞受體發(fā)生特異性免疫反應(yīng)的大分子物質(zhì)。免疫原性(immunogenicity);抗原性(antigenicity)。免疫反應(yīng)性(immunoreactivity);反應(yīng)原性(reactinogenicity)。半抗原(hapten);不完全抗原(incompleteantigen):只有反應(yīng)原性,沒有免疫性。完全抗原由兩部分組成:載體(carrier):化學(xué)本質(zhì)為蛋白質(zhì);半抗原??乖幕咎匦裕壕哂幸欢ɑ瘜W(xué)組成和結(jié)構(gòu)的大分子物質(zhì)。異物性(foreignness):抗原的理化性質(zhì)與其所刺激的機(jī)體的自身物質(zhì)理化性質(zhì)之間的差異程度特異性:由分子表面上特定化學(xué)基團(tuán)所決定(抗原決定簇,antigenicdeterminant)??贵w(antibody):高等動(dòng)物體在抗原物質(zhì)的刺激下,由漿細(xì)胞產(chǎn)生的一類能與相應(yīng)抗原在體內(nèi)外發(fā)生特異性結(jié)合的免疫球蛋白。抗抗體(antiantibody):具有抗體功能的抗原刺激機(jī)體產(chǎn)生的相應(yīng)的抗體。37華東理工大學(xué)《微生物學(xué)教程》上課講義抗體的結(jié)構(gòu)五類抗體:IgG,IgA,IgM,IgD,IgE。
38華東理工大學(xué)《微生物學(xué)教程》上課講義抗體形成的規(guī)律:兩次應(yīng)答規(guī)律:初次免疫應(yīng)答(primaryimmuneresponse);再次免疫應(yīng)答(secondaryimmuneresponse)?;貞浄磻?yīng)抗體出現(xiàn)的順序:IgM最早出現(xiàn),IgA最晚出現(xiàn)。影響抗體形成的因素:抗原:是否按抗體形成的規(guī)律(親緣關(guān)系,注射次數(shù));機(jī)體:本身機(jī)體的差異。第四節(jié)免疫學(xué)方法及其應(yīng)用抗原抗體反應(yīng)的一般規(guī)律:特異性:鑰匙和鎖;可逆性:Ag+Ab←→Ag·Ab;定比性;階段性:特異性結(jié)合階段,可見反應(yīng)階段;條件依賴性影響抗原抗體間反應(yīng)的因素:電解質(zhì)溫度:溫度上升,促進(jìn)分子運(yùn)動(dòng),增加抗原抗體的碰撞機(jī)會(huì);但溫度過高,抗原抗體解離、變性、破壞。一般最適溫度為37℃PH:蛋白質(zhì)為兩性電離性質(zhì),Ig的等電點(diǎn)為PH=5~5.5。一般抗原抗體反應(yīng)的PH為6~8??乖贵w
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