基于16srrna和ufa基因的蘚羽藻broupsishynpasel病毒特異性檢測

基于16srrna和ufa基因的蘚羽藻broupsishynpasel病毒特異性檢測

任世英、劉飛、李香謙等：以海洋聚磷酶（halomorna）ysr-3的總dna為模型，采用pcr法擴增d-海因酶基因，將克隆部分轉移到pgm-t載體，并將10種菌株轉移到能夠轉化為腸道的10種菌株。通過過濾藍臉、落葉樹和pcr，確定陽性克隆，并在計算序列后對序列進行blast比分析。得到的基因序列長度為1510bp,與假單胞菌(Pseudomonasentomophila)L48的海因酶基因序列的相似性為77%。翻譯后的序列與熒光假單胞菌(Pseudomonasfluorescens)Pf-5,南極嗜冷菌(Marinomonassp.)MED121,越南伯克氏菌(Burkholderiavietnamiensis)G4的海因酶蛋白序列相似性分別為75%、73%和70%。呂芳,王廣策:利用鳥槍法測序數(shù)據(jù)獲得青島產蘚羽藻(Bryopsishypnoides)葉綠體編碼的16SrRNA和tufA基因全長。序列分析表明16SrRNA含有兩個I型的內含子,其結構和插入位點與蕨藻(Caulerpasertularioides)的相似;tufA基因長1230bp,富含AT區(qū),其序列與羽藻屬相應基因相似?；?6SrRNA,tufA和rbcL基因序列的系統(tǒng)進化分析初步表明:Bryopsidineae,Halimedineae和Ostreobidineae為3個獨立的分支,Bryopsis屬與Derbesia屬互為姊妹群,羽藻種群呈現(xiàn)特殊的生物地理分布格局。Developmentandapplicationofantibodymicroarrayforwhitespotsyndromevirusdetectioninshrimp徐曉麗,繩秀珍,戰(zhàn)文斌:本研究制備了對蝦白斑癥病毒(WSSV)抗體芯片用于養(yǎng)殖中WSSV的特異性、多樣品平行檢測。選擇瓊脂糖修飾玻片作芯片載體,將純化的兔抗WSSV抗體(捕獲抗體)點陣于芯片載體上,芯片與待檢樣品的組織勻漿液孵育,所形成的抗原抗體復合物被Cy3標記的抗WSSV單克隆抗體所識別。結果顯示所制備的WSSV抗體芯片最低檢測限為0.62μg/mL,檢測結果與傳統(tǒng)的間接酶聯(lián)免疫吸附法達到100%的符合。IdentificationofanovelC-typelectinfromtheshrimpLitopenaeusvannameianditsroleindefenseagainstpathogensinfection羅展,張繼泉,李富花,等:作為一種模式識別受體,C-型凝集素參與“非己”識別和對入侵病原的清除過程,在無脊椎動物先天性免疫防御中發(fā)揮重要的作用。本研究采用Real-timePCR、原核重組表達、RNA干擾等分子生物學技術,對凡納濱對蝦(Litopenaeusvannamei)的一種新型C-型凝集素LvLec1的生物學功能進行了研究。GenecloningandprokaryoticexpressionofrecombinantoutermembraneproteinfromVibrioparahaemolyticus袁野,王秀利,郭社平,等:從副溶血弧菌(Vibrioparahaemolyticus)克隆了外膜蛋白基因(ompW),并在大腸桿菌BL21(DE3)細胞中進行了該基因的表達研究。研究結果表明,該基因編碼的蛋白相對分子量是42.78kDa,OmpW蛋白作為候選疫苗來抵御副溶血弧菌的感染奠定了基礎。Thelossofgeneticdiversityduringcaptivebreedingoftheendangeredsculpin,Trachidermusfasciatus,basedonISSRmarkers;implicationsforitsconservation畢瀟瀟,楊巧莉,高天翔,等:利用ISSR技術對松江鱸(Trachidermusfasciatus,國家二級保護動物)的野生群體和養(yǎng)殖群體進行了遺傳多樣性分析和比較。6對引物在85個個體中,共擴增出353個位點,多態(tài)位點324個。養(yǎng)殖群體的多態(tài)性位點比例、Nei遺傳多樣性指數(shù)和Shannon遺傳多樣性指數(shù)均低于野生群體,分別為73.80%,0.1782,0.2769。UPGMA聚類分析和AMOVA分析表明松江鱸養(yǎng)殖群體與野生群體存在一定程度的遺傳隔離,并發(fā)生了顯著的遺傳分化。GeneticidentificationoftwospeciesofPleuronichthysthroughDNAbarcoding張輝,張巖,高天翔,等:長木葉鰈(Pleuronichthyscornutus)和角木葉鰈(Pleuronichthysjaponicus)是木葉鰈屬僅有的兩個形態(tài)相似種,而長木葉鰈在中國海域未見報道。本研究基于在舟山近海采集到的兩種木葉鰈樣品,運用DNA條形碼標準基因(COI),結合線粒體CR和Cytb序列對兩者進行了鑒定,結果發(fā)現(xiàn)COI基因在兩個種的鑒別中最為有效。CharacterizationandapplicationofmonoclonalantibodiesagainstShewanellamarisflavi,anovelpathogenofApostichopusjaponicas李強,景宏麗,李華,等:制備了4株抗仿刺參(Apostichopusjaponicas)病原菌——黃海希瓦氏菌(Shewanellamarisflavi,AP629)的單克隆抗體(3C1,3D9,2F2和2A8),并應用免疫學技術對單抗進行了特性分析,最后應用免疫組織化學技術對不同感染方式下菌株AP629在仿刺參化皮體壁中的定位進行了研究。EnzymeresponsesandlipidperoxidationinthegillsandthehepatopancreasoftheclamMactravereformis,followingcadmiumexposure王曉宇,楊紅生,劉廣斌,等:研究了四角蛤蜊(Mactravereformis)在室內不同濃度鎘不同時間脅迫下,鰓和肝胰腺中抗氧化系統(tǒng)酶、水解酶以及脂質過氧化產物含量的變化。結果表明,SOD、CAT、GPx和ACP的變化能反應鎘脅迫的壓力,可作為重金屬污染評估的生物標志物使用。Estimatedreproductivesuccessofbroodersandheritabilityofgrowthtraitsinlargeyellowcroaker(Larimichthyscrocea)usingmicrosatellites劉賢德,隋班良,王志勇,等:為估算大黃魚(Larimichthyscrocea)親本的繁殖成功率和生長相關性狀的遺傳力,采用因子設計構建了2個混合交配小群體——組1和組3,其親本組合分別為4♀×4♂和3♀×4♂。使用6個微衛(wèi)星引物對親本及子代進行了分析。根據(jù)微衛(wèi)星分析的結果進行系譜重建,得20月齡各生長性狀的遺傳力分別為:體長0.19cm±0.13cm,體高0.09cm±0.06cm,體質量0.13g±0.10g。20月齡大黃魚各生長性狀之間的遺傳相關及表型相關值極大,接近于1,說明對其中一個性狀進行選擇,其他生長性狀也會取得相應的遺傳進展。該研究結果為大黃魚的遺傳育種工作提供了有用的參考資料。Pyrolyticcharacteristicsandkineticsofthemarinegreentidemacroalgae,Enteromorphaprolifera趙輝,閆華曉,劉明,等:通過熱重分析法對滸苔(Enteromorphaprolifera)熱解特性和動力學進行了考察,結果表明:滸苔熱解過程仍可分為3個階段,起始熱解溫度、活化能值和最大失重峰都低于陸生生物質,并計算了活化能和指前因子,并以數(shù)據(jù)為基礎推測了機理函數(shù)。李勇,蔣克勇,孫國祥,等:從生態(tài)營養(yǎng)學方面,本研究總結出試驗結果關鍵指標變化趨勢模擬圖?？梢?達到最高蛋白質效率的飼料蛋白質水平低于獲得最大生長性能的飼料蛋白質水平;飼料蛋白質水平從生態(tài)適宜到生態(tài)過量(生長性能最大),會導致糞氮排除和水中氨氮濃度的顯著增加。PeriodicexposuretoambientsolarirradiancebenefitsthegrowthofjuvenileseedlingsofHizikiafusiformis單體鋒,逄少軍,高素芹:在利用同步受精技術培育羊棲菜(Hizikiafusiformis)幼苗的過程中,“黑苗”和雜藻等問題嚴重威脅幼苗的健康。本研究為了優(yōu)化適合羊棲菜幼苗生長的條件,用直接照射日光、接種滸苔屬海藻和次氯酸鈉清洗等方法處理接種了羊棲菜幼苗的苗簾,結果發(fā)現(xiàn)每天2h的直接日光照射可以有效促進幼苗的生長,同時還能抑制雜藻的生長。Effectsofphotoperiodondailyactivityrhythmofjuvenileseacucumber,Apostichopusjaponicus(Selenka)董貫倉,董雙林,田相利,等:實驗研究了刺參(Apostichopusjaponicus)在不同光照周期下的行為特性:(1)刺參在全黑暗及全光照下存在顯著的晝夜節(jié)律,但是節(jié)律性較弱,且“晝”及“夜”狀態(tài)不同;(2)6～12h光照下,刺參存在一個移入及兩個移出的過程;(3)參礁外刺參數(shù)量隨光照的延長逐漸減少而后增加,平均數(shù)量隨光照的延長逐漸減少。楊靜文,張素萍:此研究一共檢查了22種織紋螺(Nassariidae)的齒舌,它們分別隸屬于2個亞科,2屬,10個亞屬。通過光學顯微鏡和電子掃描顯微鏡作者觀察了織紋螺的齒舌的構造,作為織紋螺齒舌的主要區(qū)別特征,對中央齒、側齒和中間附屬板的形態(tài)進行比較研究。由于在大部分的亞屬中,織紋螺的齒舌形態(tài)變化較大,不能歸納出明顯的亞屬特征,研究的結果不支持只依據(jù)齒舌的形態(tài)而對織紋螺進行亞屬的劃分。同時,實驗結果顯示:織紋螺中央齒的小齒數(shù)量在同一個種類中可能會發(fā)生變動,但是中間附屬板的有或無是不會改變的(即中間附屬板的有無是具有種間差異的),因此,中間附屬板可以作為外形近似種的一個有價值的鑒別特征。紀煒煒,陳雪忠,姜亞洲,等:根據(jù)2009年7月到9月東海北部調查所采集的小黃魚(Larimichthyspolyactis)樣品,采用穩(wěn)定同位素分析的方法研究了小黃魚的營養(yǎng)生態(tài)學。研究結果顯示,δ13C和δ15N的范圍跨度較大且重合度低,不同站位間的δ13C和δ15N具有一定的空間變異性。此外,隨著個體發(fā)育和生長,小黃魚體內δ15N和δ13C值顯著變化。作者闡釋了小黃魚的攝食、洄游等生態(tài)特征,并對穩(wěn)定同位素方法在營養(yǎng)生態(tài)學中的應用進行了探討。Selectivityofescape-holesizeintubetrapsforwhite-spottedcongerCongermyriaster楊炳忠,唐衍力,梁振林:采用比較作業(yè)法,在黃海區(qū)中對出水孔直徑分別為8、15、18、20、22mm的鰻魚籠對星康吉鰻(Congermyriaster)的選擇性進行研究。用SELECT(ShareEachLength’sCatchTotal)選擇性模型估算選擇性參數(shù),由AIC(Akaike’sInformationCriterion)值判斷并選擇較優(yōu)選擇性模型,并用由Logistic模型模擬實驗數(shù)據(jù)獲得選擇性曲線。Photosyntheticefficiency,cellvolume,andelementalstoichiometricratiosinThalassirosiraweissflogiiunderphosphoruslimitation劉勝,郭志靈,李濤,等:磷限制培養(yǎng)下威氏海鏈藻(Thalassirosiraweissflogii)細胞明顯變大,生源要素含量顯著下降,但N/P比卻對磷供應表現(xiàn)不敏感,基本維持在25左右,略高于Redfield比。墨角藻黃素和葉綠素a的比值(Fuco/Chla)與實際光量子產量(ΔF/Fm’)與細胞營養(yǎng)狀態(tài)一致。在評估藻類營養(yǎng)狀態(tài)時需慎用N/P比,而ΔF/Fm’、Fuco/Chla比和細胞大小則可彌補部分不足。SeasonalvariationinfunctionalphytoplanktongroupsinXiangxiBay,ThreeGorgesReservoir楊敏,畢永紅,胡建林:從2007年8月～2008年7月,每月在香溪庫灣定期定點采集浮游植物樣品一次。結果表明,按照Reynolds的浮游植物功能分類法,香溪庫灣共有10個浮游植物優(yōu)勢功能類群,以C-strategists類群以及S-strategists、R-strategists中耐受范圍較廣的類群占優(yōu)勢。以水庫水利調度的10月份、1月份以及5月份為分界線,可分為4個水體相對穩(wěn)定期,CCA分析表明浮游植物優(yōu)勢功能類群的分布同各水體穩(wěn)定期相對應。功能類群C(以美麗星桿藻(Asterionellaformosa)為代表)、P(以顆粒溝鏈藻(Aulacoseriagranulata)為代表)在8～9月份密度較高;Lo(甲藻)在春季2～4月占優(yōu)勢,并在庫灣形成甲藻水華;以漢斯冠盤藻(Stephanodiscushantzschii)為代表的B類群、以尖尾逗隱藻(Kommaacudata)為代表的X2類群和以嚙蝕隱藻(Cryptomonaserosa)為代表的Y類群(單細胞硅隱藻)幾乎在全年都有分布,為全年優(yōu)勢類群,在晚春時的密度尤其高;6～7月份,H1(水華魚腥藻(Anabaenaflos-aquae)、M(微囊藻Microcystisaeruginosa,M.wesenbergii)類群取得競爭優(yōu)勢,庫灣暴發(fā)藍藻水華,在水華后期,以G、J(群體綠藻)類群為代表的綠藻密度較高。浮游植物在周年內的演替類型為Lo(甲藻)→B/X2/Y(單細胞硅隱藻)→H1/M/J/G(群體藍綠藻)→C/P(群體硅藻)。水體穩(wěn)定狀況、光照、水溫以及營養(yǎng)鹽結構可能是影響香溪庫灣浮游植物季節(jié)演替的關鍵因子。楊光,李超倫,孫松:基于1999～2006年6次中國南極考察浮游動物樣品資料,對普里茲灣4種橈足類優(yōu)勢種種群的年際變動進行了分析,結果顯示:4種橈足類種群存在顯著的年際變動,海冰及冰間湖等環(huán)境因子是引起種群變動的主要因素。Classificationofmarinediatomsusingpigmentratiosuites姚鵬,于志剛,鄧春梅,等:作者使用高效液相色譜測定分析了分離自中國海域的14個品系的海洋浮游硅藻的光合色素組成,并計算了色素比值。通過對樣品的聚類分析,發(fā)現(xiàn)3個色素之間的比值,即葉綠素c2:葉綠素c1、巖藻黃素:葉綠素c和硅甲藻黃素:硅藻黃素具有將14個硅藻品系分成和生物學分類相一致的4個類別的能力。Purificationandcharacterizationofcold-activeendo-1,4-β-glucanaseproducedbyPseudoalteromonassp.AN545fromAntarctica沈繼紅,闞光鋒,史翠娟,等:本研究從南極海冰中分離到一株能降解羧甲基纖維素的菌株,經(jīng)16SrDNA分析鑒定為嗜冷菌Pseudoalteromonassp.。純化的纖維素酶分子量約為47.5kDa,能水解羧甲基纖維素、微晶纖維和β-葡聚糖,最佳作用溫度和pH值分別為30°C和pH6.0,30°C溫育1h(pH5.0～6.5)仍有80%的酶活,能被Ca2+和Mg2+激活,被Cu2+抑制,Km和Vmax分別為3.96mg/mL、6.06×10-2mg/(min?mL),為一種新型的酸性低溫內切-1,4-β-葡聚糖酶。那廣水,顧佳,葛林科,等:建立了一種快速檢測近岸海水中36種四環(huán)素類、磺胺類和喹諾酮類抗生素殘留的高效液相色譜-串聯(lián)質譜(HPLC-MS/MS)方法。采用固相萃取法,通過HLB串聯(lián)MCX小柱對樣品進行凈化和濃縮。液相色譜采用C18柱,甲醇和0.1%甲酸作為流動相對樣品進行梯度洗脫,選擇反應監(jiān)測(SRM)正離子模式測定。36種抗生素的回收率范圍在67.4%～109.3%,相對標準偏差均小于14.6%。36種抗生素檢出限范圍為0.45～7.97pg。應用此方法對黃海沿岸的海水樣品進行了檢測,其中31種抗生素被檢出,濃度范圍為在低于檢出限到212.5ng/L之間。張蓬,葛林科,周傳光:本文比較了加速溶劑萃取(ASE)、微波萃取(MAE)和超聲萃取(UAE)在定量萃取沉積物標準參考物質IAEA-417中PCBs,HCHs和DDTs的萃取效率。one-wayANOVA分析的結果顯示ASE和MAE的實際回收率之間無顯著差異,UAE則顯著低于ASE和MAE,綜合考慮儀器的購置費用,耗材,處理時間和溶劑用量,MAE優(yōu)于ASE。Seismicsequenceanddepositionalevolutionofslopebasinsinmid-northernmarginoftheSouthChinaSea黎明碧,金翔龍,李家彪,等:通過多道地震數(shù)據(jù),在研究區(qū)新生代沉積中識別出15個主要反射界面。通過層序標定及其與鄰區(qū)的對比,對各層序界面的年齡進行定年。研究區(qū)新生代沉積經(jīng)歷了河湖相-海陸過渡相-濱淺海相-陸坡深海相,分別對應同裂谷期,早期漂移期和晚期漂移期的構造事件。張毅:本文是對Wang等在ChineseJournalofOceanologyandLimnology(28(3):693-699)所發(fā)表文章“EstimationofpotentialdistributionofgashydrateinthenorthernSouthChinaSea”評論。本文認為Wang等文章中所給出有關珠江口盆地北部及鶯歌海盆地中甲烷水合物的概率分布存在著不妥。在簡要介紹甲烷水合物穩(wěn)定帶計算工作的基礎上,我們指出Wang等文中沒有考慮天然氣水合物存在的基本溫度-壓力條件,建議在其模型中考慮水深、海底溫度及地溫梯度等與水合物分布相關的變量。VariabilityofthesubductionratesofthesubtropicalNorthPacificmodewaters胡海波,劉秦玉,張媛,等:采用IAP-LASG-LICOM1.0海洋模式進行了北太平洋模態(tài)水和潛沉率的數(shù)值試驗。給出了模式中北太平洋潛沉率的氣候態(tài)及年際變化特征。證實了北太平洋副熱帶3個潛沉率極大值海域也是副熱帶模態(tài)水的生成區(qū)。研究了海面風及凈熱通量的改變對3個模態(tài)水形成區(qū)逐年潛沉率的影響,揭示了在這3個海域控制潛沉率年際和年代際變化的機制。Stormsurgedisasterevaluationmodelbasedonanartificialneuralnetwork紀芳,侯一筠:風暴潮預測是一種重要的災害預測方法文章采用反向傳播方法通過風暴潮的各種特征預測風暴潮潮位。信息擴散方法用于處理地質災害預測中的模糊信息問題。首先,單步預測模型和神經(jīng)網(wǎng)絡預測模型被用來收集相關的信息,從而預測極限潮位。然后,采用信息擴散方法進行信息挖掘。信息擴散方法可以在信息不足的時候,提高風險估計的精度。通過實驗發(fā)現(xiàn),文章中提出的方法簡單、有效率,與其他方法相比,可以得到較好的預測結果。在未來的工作中,本研究將著重于提出一種更加精確的預測模型。CloningandnucleotidesequenceofD-hydantoinasegeneofmarinepolyphosphate-accumulatingba