晶體解析步驟

2選擇用銅靶還是鋰靶張，用以判定晶體可否解析。-1S文件中包含有最大的和最小的H角，有效地靖修衍射點教長。好像不同的機器或者還原程序得到的文件不同，有的是hid,abs0這個過程基本上是一直按回車鍵的過程（除了在要輸入化學成份的時候改動一下和在是不是成立指令文件的時候輸入Y即可一樣可不能犯蠟。若是犯錯，那就要從頭對空間群迸行指認（犯錯可能是出此刻下面的精修迸程中）。其中ins文件：包含分子式，空間群等信息;hkl文件：包含的是衍射點的強度敵據(jù)；peF文件：記錄丁晶體物理特征，分于式，空間群，衍射數(shù)據(jù)收集的條件以應(yīng)使用的相關(guān)5.3選擇要解析的方法：宜接法（TREF）還是帕特深法（PATT）?如果晶體中含有重匝于如金屬原于，那就要用PATT法；若是晶體中沒有原于長不同專門大的原于，就用TREF法。默許的方式是宜接法。5.5用xp程序與xl程序完成原于的指認，付利葉忙氫或理論加氫，畫圖等。達到比較好的結(jié)W標準:A化學上臺理(鍵長、鍵角、價態(tài))輸入fmol=出現(xiàn)一系列的Q峰信息。每次打開xp后都要先輸入此命令。進入Q峰之間連接的結(jié)構(gòu)體系中。根據(jù)化學肚會(犍長，鍵角和連接方式)和自己晶體的預(yù)測的結(jié)構(gòu)，對Q峰迸行取舍。取舍完畢后，進行原于的命君。當閃點在某個原于上時，從鍵盤上輸入要命君的原于的符號,然后回車；閃點就會跳到下一個要命名的Q峰上。當閃點在某個Q峰上時，如果直接回車,會可以看棍球圖，如果有錯誤的原于命名，可以繼續(xù)用pick命令迸行修改?？梢钥吹浇Y(jié)構(gòu)圖，并可以旋轉(zhuǎn)觀看可以長出對稱的單元。如果沒有對稱的單元，則此命令無效。刪除grow出來的原于和其他操作長出的原于，這些原于不能帶入精修的過程中。對原于進行排序，按照原于若稱的序號；如果輸入sortX3N則按照原于種類迸行排序。保存所作的命君信息。會有提示詢問是否從name.點擊xl出現(xiàn)精修過程，看是否符臺5.5中的標準（可以關(guān)閉刃后，通過增加ins中的Is的次數(shù)或者如果其他的條件不符臺，則要修改ins文件：加入Oi>5afix（將指定的原于坐標強制性的固定在指定的位直上，或者在指定的位貫上產(chǎn)生原于）afix13表示固定垂直于某個平面的H原于的坐標afix23表示固定亞甲基上的H原于的坐標afix43表示固定類似于苯環(huán)上的H原于的坐標在原于的數(shù)宇信息部分査找是否有H原于的產(chǎn)生（即付利葉計算出來的H原于）,如果有則要防在精修時其隨處飄動，引起漂移值不穩(wěn)定等。繼續(xù)用0精修，看是否符臺標準（也可以省菇此步，因為H原于還沒有加完）輸入fmol輸入kill購去掉所有的M峰査看H原于加的是否正確，如果不正確則要用“01原于若”干掉。幾輪精修之后，看標準是否達到，如果沒有達到，還要繼續(xù)査找原因，修改ins文件。產(chǎn)生數(shù)據(jù)信息的ins文件中的命令，可以將這些命令加在Eqiv（和亦b—起使用，指定形成氫犍的兩個原于的名稱，將產(chǎn)生分于間和分于內(nèi)有鍵臺作用的原于的對稱性代碼，并將信息寫在cif中）輸入這些命令后，精修一輪就可產(chǎn)生相應(yīng)的信息。一直精修到達到標準，才能算是完成精修任A畫橢球圖輸入fmol輸入info顯示所有原子和M峰的坐標和位移參教信息等。輸入kill調(diào)整奸視角，以保證所有的原于都能看清晰且美觀。a=l,表示不標注H原于，原于序號不用括號;a=2,表示不標注H原于，原于序號用括號a=3,表不標注H原于，原序號不用括號teipcell表示畫出帶晶胞框的棍球圖其中()表示：立體角度回車后，將出現(xiàn)橢球圖，對原于進行標記（敲回車可以跳過原于，用backspace可以倒退,如果原于標記的宇體大小不臺適，吏從labl命令從新開始）。標記完畢后，自動退出，此時會讓輸入要保存的*pt的文件名。選巾后回車輸入要輸出的圖像文件的合稱選回車保存成黑白圖，選c保存成彩色圖等一分鐘左右B畫晶胞堆積圖輸入fmol輸入kill調(diào)整好視角，以保證所有的.原于都能看清晰且美觀。也可以用mor命令來調(diào)整視角。輸入pboxa表示在當前圖形的位置下要堆積的晶胞格于的寬度b表示在當前圖形的位賣下要堆積的晶胞格于的深度當前圖形的位貫下要堆積的晶胞格于的高度是寬度的0.75倍M表示堆積。此時會出現(xiàn)堆積的圖形，可以對堆積出的分于進行刪減。選擇倒數(shù)第二頊退出,表示保存丁此pack圖形。輸入proj#0}調(diào)整方向如果要命名部分原于，就要一直按回車鍵直至退出。如果沒有命君原于，可以按esc40出。輸入要保存的Lpk的文件君除原于后可以進行橢球圖的處理。顯示出距商Cl原于為3埃的所有原于，用此法可以尋找是否有氫健的存在？輸入Sgtn長