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PCR的發(fā)展歷程PCR的發(fā)展歷程1PCR技術(shù)的基本原理
PCR:聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)。
1983年由美國(guó)科學(xué)家KaryMullis提出,1993年因此而獲諾貝爾獎(jiǎng)。PCR技術(shù)是指通過(guò)模擬體內(nèi)DNA復(fù)制的方式,在體外選擇性地將DNA某個(gè)特殊區(qū)域擴(kuò)增出來(lái)的技術(shù),它包括變性、退火、延伸三個(gè)步驟。PCR技術(shù)的基本原理
PCR:聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)。
192①模板DNA的變性:模板DNA經(jīng)加熱至93℃左右一定時(shí)間后,使模板DNA雙鏈或經(jīng)PCR擴(kuò)增形成的雙鏈DNA解離,使之成為單鏈,以便它與引物結(jié)合,為下輪反應(yīng)作準(zhǔn)備;
②模板DNA與引物的退火(復(fù)性):模板DNA經(jīng)加熱變性成單鏈后,溫度降至55℃左右,引物與模板DNA單鏈的互補(bǔ)序列配對(duì)結(jié)合;③引物的延伸:DNA模板--引物結(jié)合物在TaqDNA聚合酶的作用下,以dNTP為反應(yīng)原料,靶序列為模板,按堿基配對(duì)與半保留復(fù)制原理,合成一條新的與模板DNA鏈互補(bǔ)的半保留復(fù)制鏈重復(fù)循環(huán)變性--退火--延伸三過(guò)程,就可獲得更多的“半保留復(fù)制鏈”,而且這種新鏈又可成為下次循環(huán)的模板。每完成一個(gè)循環(huán)需2~4分鐘,2~3小時(shí)就能將待擴(kuò)目的基因擴(kuò)增放大幾百萬(wàn)倍。①模板DNA的變性:模板DNA經(jīng)加熱至93℃左右一定3標(biāo)準(zhǔn)的PCR反應(yīng)體系:
10×擴(kuò)增緩沖液10ul
4種dNTP混合物各200umol/L引物各10~100pmol
模板DNA
0.1~2ug
TaqDNA聚合酶2.5u
Mg2+1.5mmol/L加雙或三蒸水至100ulPCR反應(yīng)五要素:引物、酶、dNTP、模板和Mg2+標(biāo)準(zhǔn)的PCR反應(yīng)體系:4PCR的發(fā)展史
1985年美國(guó)PE-Cetus公司人類遺傳研究室的Mullis等發(fā)明了具有劃時(shí)代意義的聚合酶鏈反應(yīng)。1988年初,Keohanog改用T4DNA聚合酶進(jìn)行PCR,其擴(kuò)增的DNA片段很均一,真實(shí)性也較高,只有所期望的一種DNA片段。但每循環(huán)一次,仍需加入新酶。1988年Saiki等從溫泉中分離的一株水生嗜熱桿菌(thermusaquaticus)中提取到一種耐熱DNA聚合酶,此酶的發(fā)現(xiàn)使PCR廣泛的被應(yīng)用。PCR的發(fā)展史5第一代:手動(dòng)/機(jī)械手式水浴基因擴(kuò)增
用三個(gè)恒溫水浴箱,分別將三個(gè)水浴溫度恒定在三個(gè)溫度:PCR的高溫變性溫度(如94℃)低溫復(fù)性溫度(如58℃),適溫延伸溫度(如72℃)。再用一個(gè)裝有PCR標(biāo)本試管的提籃,用手工在不同溫度的水浴箱中依次水浴。
這種方法的特點(diǎn)是:實(shí)驗(yàn)人員勞動(dòng)強(qiáng)度大,容易因疲勞引起差錯(cuò);而優(yōu)點(diǎn)是:設(shè)備簡(jiǎn)單,投資少,與自動(dòng)化基因擴(kuò)增儀相比,它無(wú)須升降溫過(guò)程,實(shí)驗(yàn)時(shí)間短,試驗(yàn)更接近理想PCR反應(yīng)條件。第一代:手動(dòng)/機(jī)械手式水浴基因擴(kuò)增6第二代:自動(dòng)化控制型PCR特點(diǎn):使用廣泛及具有代表性,采用瓊脂糖電泳的方式對(duì)PCR產(chǎn)物進(jìn)行分析,但存在著操作繁瑣、只適用于定性研究、交叉污染風(fēng)險(xiǎn)大等不足。第二代:自動(dòng)化控制型PCR特點(diǎn):使用廣泛及具有代表性,采用瓊7第三代PCR:實(shí)時(shí)熒光定量PCR為了避免上述傳統(tǒng)PCR的缺陷,并對(duì)基因的表達(dá)水平進(jìn)行定量分析,1992年誕生了所謂“第三代PCR"的熒光定量實(shí)時(shí)PCR。
所謂real-timeQ-PCR技術(shù),是指在PCR反應(yīng)體系中加入熒光基因,利用熒、光信號(hào)累積實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)整個(gè)PCR進(jìn)程,最后通過(guò)標(biāo)準(zhǔn)曲線對(duì)未知模板進(jìn)行定、量分析的方法?!?/p>
第三代PCR:實(shí)時(shí)熒光定量PCR為了避免上述傳統(tǒng)PCR的缺陷8數(shù)字PCR
由于定量PCR的分析最終結(jié)果依賴于Cq值,在這個(gè)意義上所謂的“定量”也只是相對(duì)的。而且在低拷貝靶分子、模板濃度差異細(xì)微的條件下,其檢測(cè)的靈敏度、精確度都受到了限制。在這種背景下,“數(shù)字PCR"應(yīng)運(yùn)而生。數(shù)字PCR是一種核酸分子絕對(duì)定量技術(shù)。相較于實(shí)時(shí)熒光定量PCR,數(shù)字PCR可讓你能夠直接數(shù)出DNA分子的個(gè)數(shù),是對(duì)起始樣品的絕對(duì)定量。因此特別適用于依靠
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