生物信息數(shù)據(jù)庫與生物信息中心教學(xué)課件

計算機應(yīng)用生物信息數(shù)據(jù)庫與生物信息中心王祿山授課大綱生命信息學(xué)—生命科學(xué)與計算機技術(shù)的交叉生物信息學(xué)的研究內(nèi)容:(1)生物信息中心(2)生物信息數(shù)據(jù)庫及格式。生物信息數(shù)據(jù)的檢索工具Entrez文獻的檢索與管理軟件Referencemanager序列同源搜索分析工具—Blast核酸、蛋白質(zhì)序列比對分析軟件—dsgenedNASis生物大分子空間三維結(jié)構(gòu)顯示與分析軟件Rasmol生物圖像對比分析軟件—Scionimage(NIHimage)生物科學(xué)數(shù)據(jù)處理軟件OriginBioinformaticsBiologicalComputerDataCalculations生物傖研究內(nèi)容1.重要生物信息中心2.重要生物信息數(shù)據(jù)庫3.數(shù)據(jù)庫檢索工具4.生物分析相關(guān)軟件GenBankPDBoDts重要生物信息中心BioinformaticscentresNCBINationalCenterforBiotechnologyInformation(US)EBIEuropeanBioinformaticsInstitute(EU)ebi.ac.ukDDBJDNADataBankofJapan(JPddbj.nig.ac.jpExPASyExpertofProteinAnalysisSystem(Switzerlandexpasy.chPDBProteinDataBank(US)/pdb/CBIPKU北京大學(xué)生物信息中心(CN)cbi.pkueducn/chineseBiasing中國生物信息中心(CN)EntrezDatabaseshtp/whng團eNCBIationalCenterforBiotechnologyInformationNationalLibaryofM.xineTEMAPbWhatdoesNCBldo?thebetterunderstandingofmoleculalandsofitLiteratu。·“dsearchresultsEntrezGenNCBIncbi.nlmnihgovOMIMPubMedFull-textElectronicJournalsNucleotideSequencesDGenomes|sequenceMapsProteinaxonomyEuropeanBioinformaticsInstituteebi.ac.uk/邊Keaiencas-eSurhEalwoasitsEuropeanBointormatcsInstitutethepathtoknowledgeainingandEducationathREAIDNADatabaseofjapanddbjnig.acjp/DNADataBankojJapanJanenesePageSiteMapaboutDDBJsWhat'snewmodHied叫ar.11aboutDDBJntegrationotRustaMandDataSubmissioncompleteftptromUniProtssProt>nFebruaryelimnerynoticeorthsentrYRalasaotalargearmountofBLAST&DDBJGenomeetionoftormetonenDBJusenetworkto>CONanttsarayisinndaetolengthlimitetin(oct26,200DDBJ/EMBL/GenBankFeatureTableExample:Protein-codingregoPrototypicaleukaryoticgene3004001100UTRsignalpeptidematuretide3'UTRFEATURESL