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文檔簡介
第三章原核生物的基因表達(dá)調(diào)控詳解演示文稿本文檔共108頁;當(dāng)前第1頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分優(yōu)選第三章原核生物的基因表達(dá)調(diào)控本文檔共108頁;當(dāng)前第2頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分(一)基因表達(dá)調(diào)控的意義基因組(genome)是指含有一個生物體生存、發(fā)育、活動和繁殖所需要的全部遺傳信息的整套核酸。
但生物基因組的遺傳信息并不是同時全部都表達(dá)出來的,大腸桿菌基因組含有約4000個基因,一般情況下只有5-10%在高水平轉(zhuǎn)錄狀態(tài),其它基因有的處于較低水平的表達(dá),有的就暫時不表達(dá)。
不同組織細(xì)胞中不僅表達(dá)的基因數(shù)量不相同,而且基因表達(dá)的強(qiáng)度和種類也各不相同,這就是基因表達(dá)的組織特異性(tissuespecificity)。
例如肝細(xì)胞中涉及編碼鳥氨酸循環(huán)酶類的基因表達(dá)水平高于其它組織細(xì)胞,合成的某些酶(如精氨酸酶)為肝臟所特有;胰島β細(xì)胞合成胰島素;甲狀腺濾泡旁細(xì)胞(C細(xì)胞)專一分泌降血鈣素等。本文檔共108頁;當(dāng)前第3頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分細(xì)胞分化發(fā)育的不同時期,基因表達(dá)的情況是不相同的,這就是基因表達(dá)的階段特異性(stagespecificity)。
一個受精卵含有發(fā)育成一個成熟個體的全部遺傳信息,在個體發(fā)育分化的各個階段,各種基因極為有序地表達(dá),一般在胚胎時期基因開放的數(shù)量最多,隨著分化發(fā)展,細(xì)胞中某些基因關(guān)閉(turnoff)、某些基因轉(zhuǎn)向開放(turnon),胚胎發(fā)育不同階段、不同部位的細(xì)胞中開放的基因及其開放的程度不一樣,合成蛋白質(zhì)的種類和數(shù)量都不相同,顯示出基因表達(dá)調(diào)控在空間和時間上極高的有序性,從而逐步生成形態(tài)與功能各不相同、極為協(xié)調(diào)、巧妙有序的組織臟器。從上所述,不難看出:生物的基因表達(dá)不是雜亂無章的,而是受著嚴(yán)密、精確調(diào)控的,不僅生命的遺傳信息是生物生存所必需的,而且遺傳信息的表達(dá)調(diào)控也是生命本質(zhì)所在。
本文檔共108頁;當(dāng)前第4頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分改變基因表達(dá)的情況以適應(yīng)環(huán)境,在原核生物、單細(xì)胞生物中尤其顯得突出和重要,因?yàn)榧?xì)胞的生存環(huán)境經(jīng)常會有劇烈的變化。
例如:周圍有充足的葡萄糖,細(xì)菌就可以利用葡萄糖作能源和碳源,不必更多去合成利用其它糖類的酶類,當(dāng)外界沒有葡萄糖時,細(xì)菌就要適應(yīng)環(huán)境中存在的其它糖類(如乳糖、半乳糖、阿拉伯糖等),開放能利用這些糖的酶類基因,以滿足生長的需要。
即使是內(nèi)環(huán)境保持穩(wěn)定的高等哺乳類,也經(jīng)常要變動基因的表達(dá)來適應(yīng)環(huán)境,例如與適宜溫度下生活相比較,在冷或熱環(huán)境下適應(yīng)生活的動物,其肝臟合成的蛋白質(zhì)圖譜就有明顯的不同。所以,基因表達(dá)調(diào)控是生物適應(yīng)環(huán)境生存的必需。本文檔共108頁;當(dāng)前第5頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分(二)基因表達(dá)的模式生物體內(nèi)的基因調(diào)控各不相同,基因表達(dá)隨環(huán)境變化的情況,可以大致把基因表達(dá)分成兩類:①組成性表達(dá)(constitutiveexpression)指不大受環(huán)境變動而變化的一類基因表達(dá)。其中某些基因表達(dá)產(chǎn)物是細(xì)胞或生物體整個生命過程中都持續(xù)需要而必不可少的,這類基因可稱為看家基因(housekeepinggene),這些基因中不少是在生物個體其它組織細(xì)胞、甚至在同一物種的細(xì)胞中都是持續(xù)表達(dá)的,可以看成是細(xì)胞基本的基因表達(dá)。組成性基因表達(dá)也不是一成不變的,其表達(dá)強(qiáng)弱也是受一定機(jī)制調(diào)控的。本文檔共108頁;當(dāng)前第6頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分②適應(yīng)性表達(dá)(adaptiveexpression)指環(huán)境的變化容易使其表達(dá)水平變動的一類基因表達(dá)。應(yīng)環(huán)境條件變化基因表達(dá)水平增高的現(xiàn)象稱為誘導(dǎo)(induction),這類基因被稱為可誘導(dǎo)的基因(induciblegene);相反,隨環(huán)境條件變化而基因表達(dá)水平降低的現(xiàn)象稱為阻遏(repression),相應(yīng)的基因被稱為可阻遏的基因(repressiblegene)。
本文檔共108頁;當(dāng)前第7頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分(三)
原核基因表達(dá)調(diào)控的特點(diǎn)與方式基因表達(dá)調(diào)控主要表現(xiàn)在以下兩方面:1.轉(zhuǎn)錄水平上的調(diào)控(transcriptionalregulation);2.轉(zhuǎn)錄后水平上的調(diào)控(post-transcriptionalregulation),包括①
mRNA加工成熟水平上的調(diào)控(differentialprocessingofRNAtranscript);②
翻譯水平上的調(diào)控(differentialtranslationofmRNA)。本文檔共108頁;當(dāng)前第8頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分本文檔共108頁;當(dāng)前第9頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分原核生物中,營養(yǎng)狀況(nutritionalstatus)和環(huán)境因素(environmentalfactor)對基因表達(dá)起著舉足輕重的影響。真核生物尤其是高等真核生物中,激素水平(hormonelevel)和發(fā)育階段(developmentalstage)是基因表達(dá)調(diào)控的最主要手段,營養(yǎng)和環(huán)境因素的影響力大為下降。在轉(zhuǎn)錄水平上對基因表達(dá)的調(diào)控決定于DNA的結(jié)構(gòu)、RNA聚合酶的功能、蛋白因子及其他小分子配基的相互作用。本文檔共108頁;當(dāng)前第10頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分
因?yàn)榧?xì)菌mRNA在形成過程中與核糖體混合在一起,所以,細(xì)菌的轉(zhuǎn)錄與翻譯過程幾乎發(fā)生在同一時間間隔內(nèi),轉(zhuǎn)錄與翻譯相耦聯(lián)(coupledtranscriptionandtranslation)。
真核生物中,轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物(primarytranscript)只有從核內(nèi)運(yùn)轉(zhuǎn)到核外,才能被核糖體翻譯成蛋白質(zhì)。本文檔共108頁;當(dāng)前第11頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分二、
操縱子學(xué)說
法國巴斯德研究院的FrancoisJacob與JacquesMonod于1960年在法國科學(xué)院院報(bào)(ProceedingoftheFrenchAcademyofSciences)上發(fā)表了一篇論文,提出乳糖代謝中的兩個基因被一靠近它們的遺傳因子所調(diào)節(jié)。這二個基因?yàn)棣?半乳糖苷酶(β-galactosidase)和半乳糖苷透過酶(galactosidepermease)。
在此文中他們首先提出了操縱子(operon)和操縱基因(operator)的概念,他們的操縱子學(xué)說(theoryofoperon)使我們得以從分子水平認(rèn)識基因表達(dá)的調(diào)控,是一個劃時代的突破,因此他們二人于1965年榮獲諾貝爾生理學(xué)獎。本文檔共108頁;當(dāng)前第12頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分(一)操縱子(operon)
細(xì)菌能隨環(huán)境的變化,迅速改變某些基因表達(dá)的狀態(tài),這就是很好的基因表達(dá)調(diào)控的實(shí)驗(yàn)?zāi)P?。人們就是從研究這種現(xiàn)象開始,打開認(rèn)識基因表達(dá)調(diào)控分子機(jī)理的窗口的。本文檔共108頁;當(dāng)前第13頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分1.操縱子的提出
大腸桿菌可以利用葡萄糖、乳糖、麥芽糖、阿拉伯糖等作為碳源而生長繁殖,當(dāng)培養(yǎng)基中含有葡萄糖和乳糖時,細(xì)菌優(yōu)先利用葡萄糖,當(dāng)葡萄糖耗盡,細(xì)菌停止生長,經(jīng)過短時間的適應(yīng),就能利用乳糖,細(xì)菌繼續(xù)呈指數(shù)式繁殖增長。本文檔共108頁;當(dāng)前第14頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分
大腸桿菌利用乳糖至少需要兩個酶:促使乳糖進(jìn)入細(xì)菌的半乳糖透過酶(lactosepermease)和催化乳糖分解第一步的
-半乳糖苷酶(-galactosidase)。本文檔共108頁;當(dāng)前第15頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分
在環(huán)境中沒有乳糖或其他
-半乳糖苷時,大腸桿菌合成
-半乳糖苷酶量極少,加入乳糖2-3分鐘后,細(xì)菌大量合成
-半乳糖苷酶,其量可提高千倍以上,在以乳糖作為唯一碳源時,菌體內(nèi)的
-半乳糖苷酶量可占到細(xì)菌總蛋白量的3%。
在上述二階段生長細(xì)菌利用乳糖再次繁殖前,也能測出細(xì)菌中
-半乳糖苷酶活性顯著增高的過程。本文檔共108頁;當(dāng)前第16頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分這種典型的誘導(dǎo)現(xiàn)象,是研究基因表達(dá)調(diào)控極好的模型。針對大腸桿菌利用乳糖的適應(yīng)現(xiàn)象,法國的Jocob和Monod等人做了一系列遺傳學(xué)和生化學(xué)研究實(shí)驗(yàn),于1961年提出乳糖操縱子(lacoperon)學(xué)說。本文檔共108頁;當(dāng)前第17頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分2.操縱子的基本組成
乳糖操縱子模型已被許多研究實(shí)驗(yàn)所證實(shí),對其有了更深入的認(rèn)識,并且發(fā)現(xiàn)其他原核生物基因調(diào)控也有類似的操縱子組織,操縱子是原核基因表達(dá)調(diào)控的一種重要的組織形式,大腸桿菌的基因多數(shù)以操縱子的形式組成基因表達(dá)調(diào)控的單元。下面就以乳糖操縱子為例子說明操縱子的最基本的組成元件(elements)。本文檔共108頁;當(dāng)前第18頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分(1)結(jié)構(gòu)基因群
操縱子中被調(diào)控的編碼蛋白質(zhì)的基因可稱為結(jié)構(gòu)基因(structuralgene,SG)。一個操縱子中含有2個以上的結(jié)構(gòu)基因,多的可達(dá)十幾個。每個結(jié)構(gòu)基因是一個連續(xù)的開放閱讀框(openreadingframe),5’端有起始密碼ATG,3’端有終止密碼TAA、TGA或TAG。各結(jié)構(gòu)基因頭尾銜接、串連排列,組成結(jié)構(gòu)基因群。本文檔共108頁;當(dāng)前第19頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分
至少在第一個結(jié)構(gòu)基因5’側(cè)具有核糖體結(jié)合位點(diǎn)(ribosomebindingsite,RBS),因而當(dāng)這段含多個結(jié)構(gòu)基因的DNA被轉(zhuǎn)錄成多順反子mRNA,就能被核糖體所識別結(jié)合、并起始翻譯。核糖體沿mRNA移動,在合成完第一個編碼的多肽后,核糖體可以不脫離mRNA而繼續(xù)翻譯合成下一個基因編碼的多肽,直至合成完這條多順反子mRNA所編碼的全部多肽。本文檔共108頁;當(dāng)前第20頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分
乳糖操縱子含有z、y和a3個結(jié)構(gòu)基因。
z基因長3510bp,編碼含1170個氨基酸、分子量為135,000的多肽,以四聚體形式組成有活性的β-半乳糖苷酶,催化乳糖轉(zhuǎn)變?yōu)榘肴樘?allolactose),再分解為半乳糖和葡萄糖;
本文檔共108頁;當(dāng)前第21頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分
y基因長780bp,編碼有260個氨基酸、分子量為30,000的半乳糖透過酶,促使環(huán)境中的乳糖進(jìn)入細(xì)菌;
a基因長825bp,編碼275氨基酸、分子量為32,000的轉(zhuǎn)乙?;?,以二聚體活性形式催化半乳糖的乙?;?。本文檔共108頁;當(dāng)前第22頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分
z基因5’側(cè)具有大腸桿菌核糖體識別結(jié)合位點(diǎn)(RBS)特征的Shine-Dalgarno(SD)序列,因而當(dāng)乳糖操縱子開放時,核糖體能結(jié)合在轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生的mRNA上。
由于z、y、a三個基因頭尾相接,上一個基因的翻譯終止密碼靠近下一個基因的本文檔共108頁;當(dāng)前第23頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分
翻譯起始密碼,因而同一個核糖體能沿此轉(zhuǎn)錄生成的多順反子(polycistron)mRNA移動,在翻譯合成了上一個基因編碼的蛋白質(zhì)后,不從mRNA上掉下來而繼續(xù)沿mRNA移動合成下一個基因編碼的蛋白質(zhì),一氣依次合成這基因群所編碼所有的蛋白質(zhì)。本文檔共108頁;當(dāng)前第24頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分本文檔共108頁;當(dāng)前第25頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分(2)啟動子
啟動子(promoter,P)是指能被RNA聚合酶識別、結(jié)合并啟動基因轉(zhuǎn)錄的一段DNA序列。操縱子至少有一個啟動子,一般在第一個結(jié)構(gòu)基因5'側(cè)上游,控制整個結(jié)構(gòu)基因群的轉(zhuǎn)錄。用RNA聚合酶與分離的一段DNA雙鏈混合,再加入外切核酸酶去水解DNA,結(jié)果只有被RNA聚合酶識別結(jié)合而被保護(hù)的那段DNA不被水解,由此可以測出啟動子的范圍及其序列。本文檔共108頁;當(dāng)前第26頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分
雖然不同的啟動子序列有所不同,但比較已經(jīng)研究過的上百種原核生物的啟動子的序列,發(fā)現(xiàn)有一些共同的規(guī)律,它們一般長40-60bp,含A-Tbp較多,某些段落很相似的,有保守性,稱為共有性序列(consensussequences)。
啟動子一般可分為識別(R,recognition)、結(jié)合(B,binding)和起始(I,initiation)三個區(qū)段。
本文檔共108頁;當(dāng)前第27頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分
轉(zhuǎn)錄起始第一個堿基(通常標(biāo)記位置為+1)最常見的是A;在-10bp附近有TATAAT一組共有序列,因?yàn)檫@段共有序列是Pribnow首先發(fā)現(xiàn)的,稱為Pribnow盒(Pribnowbox);在-35bp處又有TTGACA一組共有序列。本文檔共108頁;當(dāng)前第28頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分本文檔共108頁;當(dāng)前第29頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分
不同的啟動子序列不同,與RNA聚合酶的親和力不同、啟動轉(zhuǎn)錄的頻率高低不同,即不同的啟動子起動基因轉(zhuǎn)錄的強(qiáng)弱不同,例如:PL、PR、PT7屬強(qiáng)啟動子,而Plac則是較弱的啟動子。本文檔共108頁;當(dāng)前第30頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分色氨酸啟動子(Trp)色氨酸啟動子(Trp)的阻遏蛋白在有色氨酸時,二者結(jié)合,阻遏蛋白變構(gòu)激活而與啟動子結(jié)合,阻止RNA聚合酶的轉(zhuǎn)錄。無色氨酸時,阻遏解除,因β-吲哚丙烯酸是色氨酸的競爭性抑制劑,常用作誘導(dǎo)劑,誘發(fā)色氨酸啟動子轉(zhuǎn)錄。同時,衰減子對Trp轉(zhuǎn)錄也有調(diào)節(jié)作用。本文檔共108頁;當(dāng)前第31頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分乳糖啟動子(Lac)無乳糖時,調(diào)節(jié)基因(I)產(chǎn)生阻遏蛋白與操縱基因結(jié)合,阻止RNA聚合酶結(jié)合進(jìn)而阻止轉(zhuǎn)錄;有乳糖時,乳糖能與阻遏蛋白結(jié)合,使其變構(gòu)解離而行使轉(zhuǎn)錄功能。而LacZ基因可由IPTG(異丙基硫代-β-D-半乳糖)誘導(dǎo)轉(zhuǎn)錄。本文檔共108頁;當(dāng)前第32頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分Tac啟動子是由Trp啟動子和Lac啟動子構(gòu)建而成的雜合啟動子,-35區(qū)為Trp啟動子順序,-10為LacUV5啟動子順序,二者之間距離為16bp者為pTrc,17bp者為pTac。該啟動子只需用IPTG誘導(dǎo)轉(zhuǎn)錄即可。Tac啟動子本文檔共108頁;當(dāng)前第33頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分噬菌體的PL和PR啟動子PL為λ噬菌體左向啟動區(qū),PR為右向轉(zhuǎn)錄啟動區(qū),與阻遏基因CI編碼的阻遏蛋白結(jié)合,可抑制操縱基因OL或OR
轉(zhuǎn)錄,但CI在42℃被滅活,PL或PR啟動下游基因轉(zhuǎn)錄。本文檔共108頁;當(dāng)前第34頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分脂蛋白啟動子(LPP)脂蛋白為細(xì)胞外膜蛋白,細(xì)菌中含量高,該啟動子表達(dá)效率高,由信號肽可將基因表達(dá)產(chǎn)物分泌到胞外,常用來構(gòu)建分泌型表達(dá)載體。本文檔共108頁;當(dāng)前第35頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分(3)操縱區(qū)
操縱區(qū)(operator)是指能被調(diào)控蛋白特異性結(jié)合的一段DNA序列,常與啟動子鄰近或與啟動子序列重疊,當(dāng)調(diào)控蛋白結(jié)合在操縱子序列上,會影響其下游基因轉(zhuǎn)錄的強(qiáng)弱。本文檔共108頁;當(dāng)前第36頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分
以前將操縱區(qū)稱為操縱基因(operatorgene)。但現(xiàn)在基因定義是為蛋白質(zhì)或RNA編碼的核酸序列,而操縱序列并不是編碼蛋白質(zhì)的基因,卻是起著調(diào)控基因表達(dá)強(qiáng)弱的作用,正如啟動序列不叫啟動基因而稱為啟動子一樣,操縱序列就可稱為操縱區(qū)。operon譯為操縱子,即基因表達(dá)操縱的單元之意。本文檔共108頁;當(dāng)前第37頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分
以乳糖操縱子中的操縱區(qū)為例,其操縱區(qū)(o)序列位于啟動子(p)與被調(diào)控的基因之間,部分序列與啟動子序列重疊。
仔細(xì)分析操縱區(qū)序列,可見這段雙鏈DNA具有回文(palindrome)樣的對稱性一級結(jié)構(gòu),能形成十字形的莖環(huán)(stemloop)構(gòu)造。不少操縱區(qū)都具有類似的對稱性序列,可能與特定蛋白質(zhì)的結(jié)合相關(guān)。本文檔共108頁;當(dāng)前第38頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分
阻遏蛋白與操縱區(qū)結(jié)合,就妨礙了RNA聚合酶與啟動子的結(jié)合及其后?-半乳糖苷酶等基因的轉(zhuǎn)錄起始,從而阻遏了這群基因的表達(dá)。
最早只把與阻遏蛋白結(jié)合、起阻遏作用的序列稱為操縱區(qū),但其后發(fā)現(xiàn)有的操縱子中本文檔共108頁;當(dāng)前第39頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分
同一操縱序列與不同構(gòu)像的蛋白質(zhì)結(jié)合,可以分別起阻遏或激活基因表達(dá)的作用,阿拉伯糖操縱子中的操縱序列就是典型的例子。因而凡能與調(diào)控蛋白特異性結(jié)合、從而影響基因轉(zhuǎn)錄強(qiáng)弱的序列,不論其對基因轉(zhuǎn)錄的作用是減弱、阻止或增強(qiáng)、開放,都可稱為操縱區(qū)。本文檔共108頁;當(dāng)前第40頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分(4)調(diào)控基因
調(diào)控基因(regulatorygene)是編碼能與操縱序列結(jié)合的調(diào)控蛋白的基因。調(diào)控蛋白有:阻遏蛋白(repressiveprotein):與操縱區(qū)結(jié)合后能減弱或阻止其調(diào)控的基因轉(zhuǎn)錄,其介導(dǎo)的調(diào)控方式為負(fù)調(diào)控(negativeregulation);
本文檔共108頁;當(dāng)前第41頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分
激活蛋白(activatingprotein):與操縱區(qū)結(jié)合后能增強(qiáng)或起動其調(diào)控的基因轉(zhuǎn)錄,所介導(dǎo)的調(diào)控方式為正調(diào)控(positiveregulation)。本文檔共108頁;當(dāng)前第42頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分
某些特定的物質(zhì)能與調(diào)控蛋白結(jié)合,使調(diào)控蛋白的空間構(gòu)像發(fā)生變化,從而改變其對基因轉(zhuǎn)錄的影響,這些特定物質(zhì)可稱為效應(yīng)物(effector)。有兩種:誘導(dǎo)劑(inducer):能引起誘導(dǎo)發(fā)生的分子;阻遏劑或輔助阻遏劑(corepressor):能導(dǎo)致阻遏發(fā)生的分子。本文檔共108頁;當(dāng)前第43頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分
例如在乳糖操縱子中,調(diào)控基因lacI位于Plac鄰近,有其自身的啟動子和終止子,轉(zhuǎn)錄方向和結(jié)構(gòu)基因群的轉(zhuǎn)錄方向一致,編碼產(chǎn)生由347個氨基酸組成的調(diào)控蛋白R。
在環(huán)境沒有乳糖存在的情況下,R形成分子量為152,000的活性四聚體,能特異性與操縱區(qū)o緊密結(jié)合,從而阻止利用乳糖的酶類基因的轉(zhuǎn)錄,所以R是乳糖操縱子的阻遏蛋白;本文檔共108頁;當(dāng)前第44頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分
當(dāng)環(huán)境中有足夠的乳糖時,乳糖與R結(jié)合,使R的空間構(gòu)像變化,四聚體解聚成單體,失去與操縱區(qū)特異性緊密結(jié)合的能力,從而解除了阻遏蛋白的作用,使其后的基因得以轉(zhuǎn)錄合成利用乳糖的酶類。在這過程中乳糖就是誘導(dǎo)劑,與R結(jié)合起到去阻遏作用(derepression),誘導(dǎo)了利用乳糖的酶類基因轉(zhuǎn)錄開放。本文檔共108頁;當(dāng)前第45頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分
許多調(diào)控蛋白都是變構(gòu)蛋白(allostericprotein),通過與上述類似的方式與效應(yīng)物結(jié)合改變空間構(gòu)像,從而改變活性,起到調(diào)節(jié)基因轉(zhuǎn)錄表達(dá)的作用。本文檔共108頁;當(dāng)前第46頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分(5)結(jié)構(gòu)基因編碼蛋白質(zhì)的基因。本文檔共108頁;當(dāng)前第47頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分(二)乳糖操縱子的表達(dá)調(diào)控
本文檔共108頁;當(dāng)前第48頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分本文檔共108頁;當(dāng)前第49頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分本文檔共108頁;當(dāng)前第50頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分大腸桿菌能以乳糖為唯一碳源生長,這是由于它能產(chǎn)生一套利用乳糖的酶。
這些酶受乳糖操縱子的控制。大腸桿菌乳糖操縱子是大腸桿菌DNA的一個特定區(qū)段,由調(diào)節(jié)基因I,啟動基因P,操縱基因O和結(jié)構(gòu)基因Z、Y、A組成。
P區(qū)是轉(zhuǎn)錄起始時RNA聚合酶的結(jié)合部位。O區(qū)是阻遏蛋白的結(jié)合部位,其功能是控制結(jié)構(gòu)基因的轉(zhuǎn)錄。
平時I基因經(jīng)常進(jìn)行轉(zhuǎn)錄和翻譯,產(chǎn)生有活性的阻遏蛋白。本文檔共108頁;當(dāng)前第51頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分
Z編碼β-半乳糖苷酶;Y編碼β-半乳糖苷透過酶;A編碼β-半乳糖苷乙?;D(zhuǎn)移酶。β-半乳糖苷酶是一種β-半乳糖苷鍵的專一性酶,除能將乳糖水解成葡萄糖和半乳糖。β-半乳糖苷透過酶的作用是使外界的β-半乳糖苷(如乳糖)能透過大腸桿菌細(xì)胞壁和原生質(zhì)膜進(jìn)入細(xì)胞內(nèi)。β-半乳糖苷乙?;D(zhuǎn)移酶的作用是把乙酰輔酶A上的乙酰基轉(zhuǎn)到β-半乳糖苷上,形成乙酰半乳糖。
本文檔共108頁;當(dāng)前第52頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分本文檔共108頁;當(dāng)前第53頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分RNA聚合酶結(jié)合部位阻遏物結(jié)合部位本文檔共108頁;當(dāng)前第54頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分1.阻遏蛋白的負(fù)調(diào)控
當(dāng)大腸桿菌在沒有乳糖的環(huán)境中生存時,lac操縱子處于阻遏狀態(tài)。此i基因在其自身的啟動子Pi控制下,低水平、組成性表達(dá)產(chǎn)生阻遏蛋白R,每個細(xì)胞中僅維持約10個分子的阻遏蛋白。R以四聚體形式與操縱子o結(jié)合,阻礙了RNA聚合酶與啟動子Plac的結(jié)合,阻止了基因的轉(zhuǎn)錄起動。R的阻遏作用不是絕對的,R與o本文檔共108頁;當(dāng)前第55頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分偶爾解離,使細(xì)胞中還有極低水平的-半乳糖苷酶及透過酶的生成。
當(dāng)有乳糖存在時,乳糖受-半乳糖苷酶的催化轉(zhuǎn)變?yōu)閯e乳糖,與R結(jié)合,使R構(gòu)象變化,R四聚體解聚成單體,失去與o的親和力,與o解離,基因轉(zhuǎn)錄開放,使-半乳糖苷酶在細(xì)胞內(nèi)的含量可增加1000倍。這就是乳糖對lac操縱子的誘導(dǎo)作用。本文檔共108頁;當(dāng)前第56頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分本文檔共108頁;當(dāng)前第57頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分乳糖操縱子的控制模型,其主要內(nèi)容如下:
①Z、Y、A基因的產(chǎn)物由同一條多順反子的mRNA分子所編碼。
②這個mRNA分子的啟動子緊接著O區(qū),而位于I與O之間的啟動子區(qū)(P),不能單獨(dú)起動合成β-半乳糖苷酶和透過酶的生理過程。
③操縱基因是DNA上的一小段序列(僅為26bp),是阻遏物的結(jié)合位點(diǎn)。
④當(dāng)阻遏物與操縱基因結(jié)合時,lacmRNA的轉(zhuǎn)錄起始受到抑制。
⑤誘導(dǎo)物通過與阻遏物結(jié)合,改變它的三維構(gòu)象,使之不能與操縱基因結(jié)合,從而激發(fā)lacmRNA的合成。當(dāng)有誘導(dǎo)物存在時,操縱基因區(qū)沒有被阻遏物占據(jù),所以啟動子能夠順利起始mRNA的合成。本文檔共108頁;當(dāng)前第58頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分
本文檔共108頁;當(dāng)前第59頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分
本文檔共108頁;當(dāng)前第60頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分
本文檔共108頁;當(dāng)前第61頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分本文檔共108頁;當(dāng)前第62頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分本文檔共108頁;當(dāng)前第63頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分
本文檔共108頁;當(dāng)前第64頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分
本文檔共108頁;當(dāng)前第65頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分
當(dāng)一個mRNA含有編碼一個以上蛋白質(zhì)的編碼信息,而且這些蛋白質(zhì)都是以獨(dú)立的多肽被翻譯時,這樣的mRNA稱之多順反子mRNA。多順反子mRNA在細(xì)菌中是很普遍的。
多順反子lacmRNA中的lacZ,lacY,lacA經(jīng)翻譯生成的產(chǎn)物分別為LacZ(β-半乳糖苷酶(β-galactosidase))、LacY(β-半乳糖苷通透酶(β-galactosidepermease))和LacA(β-半乳糖苷轉(zhuǎn)乙?;福╰hiogalactosidetransacetylase))。本文檔共108頁;當(dāng)前第66頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分
半乳糖是lac操縱子轉(zhuǎn)錄的活性誘導(dǎo)物,人們發(fā)現(xiàn)一個合成的、結(jié)構(gòu)上類似于別乳糖、不能被β-半乳糖苷酶水解的β-半乳糖苷異丙基硫代半乳糖苷(isopropylthiogalactoside:IPTG)起著lac操縱子的一個誘導(dǎo)物的作用,所以IPTG常用于誘導(dǎo)含有使用了lac啟動子的質(zhì)粒載體的細(xì)菌中的重組蛋白的表達(dá)。
本文檔共108頁;當(dāng)前第67頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分
一些化學(xué)合成的乳糖類似物,不受-半乳糖苷酶的催化分解,卻也能與R特異性結(jié)合使R構(gòu)象變化,誘導(dǎo)lac操縱子的開放。例如異丙基硫代半乳糖苷(isopropylthiog-alactoside,IPTG)就是很強(qiáng)的誘導(dǎo)劑;不被細(xì)菌代謝而十分穩(wěn)定。X-gal(5-溴-4-氯-3-吲哚-β-半乳糖苷)也是一種人工化學(xué)合成的半乳糖苷,可被-半乳糖苷酶水解產(chǎn)生蘭色化合物,因此可以用作-半乳糖苷酶活性的指示劑。IPTG和X-gal都被廣泛應(yīng)用在分子生物學(xué)和基因工程的工作中。本文檔共108頁;當(dāng)前第68頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分本文檔共108頁;當(dāng)前第69頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分本文檔共108頁;當(dāng)前第70頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分lac操縱子受LacI阻遏蛋白調(diào)控。在沒有誘導(dǎo)劑(乳糖或IPTG)存在時,LacI阻遏蛋白與lac操縱子DNA序列結(jié)合得非常緊密,lac基因不能進(jìn)行轉(zhuǎn)錄。當(dāng)IPTG存在時,IPTG與LacI阻遏蛋白相互作用,形成LacI阻遏蛋白-IPTG復(fù)合物,體外研究表明,該復(fù)合物對lac操縱基因的親和性為單獨(dú)LacI阻遏蛋白的親和性的千分之一。所以IPTG作為lac基因表達(dá)的一個誘導(dǎo)劑,起著轉(zhuǎn)錄去阻遏作用。就象(下圖)表示的那樣,RNA聚合酶的結(jié)合部位(lac操縱基因)也是LacI阻遏蛋白的結(jié)合部位,實(shí)驗(yàn)表明RNA聚合酶和LacI阻遏蛋白對操縱基因序列的結(jié)合是相互排斥的。
本文檔共108頁;當(dāng)前第71頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分本文檔共108頁;當(dāng)前第72頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分原核生物基因表達(dá)的調(diào)控乳糖代謝基因表達(dá)調(diào)控圖解:(沒有乳糖時)
R
P
O
lacZlacY
lacA調(diào)節(jié)基因啟動子操縱基因結(jié)構(gòu)基因RNA聚合酶信使RNA轉(zhuǎn)錄翻譯阻抑物與操縱基因結(jié)合,結(jié)構(gòu)基因轉(zhuǎn)錄受阻.阻抑物本文檔共108頁;當(dāng)前第73頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分原核生物基因表達(dá)的調(diào)控乳糖代謝基因表達(dá)調(diào)控圖解:(有乳糖時)
R
P
O
lacZlacYlacA調(diào)節(jié)基因啟動子操縱基因結(jié)構(gòu)基因RNA聚合酶信使RNA轉(zhuǎn)錄翻譯阻抑物與乳糖結(jié)合后構(gòu)象發(fā)生了改變,因而不能與操縱基因結(jié)合,使得結(jié)構(gòu)基因進(jìn)行轉(zhuǎn)錄。阻抑物乳糖轉(zhuǎn)錄半乳糖苷酶酶酶乳糖分解代謝調(diào)控過程是一個自我調(diào)控過程本文檔共108頁;當(dāng)前第74頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分2.CAP的正調(diào)控
細(xì)菌中的cAMP含量與葡萄糖的分解代謝有關(guān),當(dāng)細(xì)菌利用葡萄糖分解產(chǎn)生能量時,cAMP生成少而分解多,cAMP含量低;相反,當(dāng)環(huán)境中無葡萄糖可供利用時,cAMP含量就升高。細(xì)菌中有一種能與cAMP特異結(jié)合的cAMP受體蛋白CRP(cAMPreceptorprotein),當(dāng)CRP未與cAMP結(jié)合時它是沒有活性的,當(dāng)cAMP濃度升高時,CRP與cAMP結(jié)合并發(fā)生空間構(gòu)象的變化而活化,稱為CAP(CRP-cAMPactivatedprotein),能以二聚體的方式與特定的DNA序列結(jié)合。本文檔共108頁;當(dāng)前第75頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分
在lac操縱子的啟動子Plac上游端有一段序列與Plac部分重疊的序列,能與CAP特異結(jié)合,稱為CAP結(jié)合位點(diǎn)(CAPbindingsite)。CAP與這段序列結(jié)合時,可增強(qiáng)RNA聚合酶的轉(zhuǎn)錄活性,使轉(zhuǎn)錄提高50倍。相反,當(dāng)有葡萄糖可供分解利用時,cAMP濃度降低,CRP不能被活化,lac操縱子的結(jié)構(gòu)基因表達(dá)下降。本文檔共108頁;當(dāng)前第76頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分本文檔共108頁;當(dāng)前第77頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分本文檔共108頁;當(dāng)前第78頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分本文檔共108頁;當(dāng)前第79頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分
由于Plac是弱啟動子,單純因乳糖的存在發(fā)生去阻遏使lac操縱子轉(zhuǎn)錄開放,還不能使細(xì)菌很好利用乳糖,必需同時有CAP來加強(qiáng)轉(zhuǎn)錄活性,細(xì)菌才能合成足夠的酶來利用乳糖。lac操縱子的強(qiáng)誘導(dǎo)既需要有乳糖的存在又需要沒有葡萄糖可供利用。通過這一機(jī)制,細(xì)菌是優(yōu)先利用環(huán)境中的葡萄糖,只有無葡萄糖而又有乳糖時,細(xì)菌才去充分利用乳糖。本文檔共108頁;當(dāng)前第80頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分
細(xì)菌對葡萄糖以外的其他糖(如阿拉伯糖、半乳糖、麥芽糖等)的利用上也有類似對乳糖利用的情況,在含有編碼利用阿拉伯糖的酶類基因群的阿拉伯糖操縱子(araoperon)、半乳糖操縱子(galoperon)中也有CAP結(jié)合位點(diǎn),CAP也起類似的正性調(diào)控作用。所以CAP的通用名稱是分解代謝基因激活蛋白(catabolicgeneactivatorprotein)。本文檔共108頁;當(dāng)前第81頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分
不難看出:CAP結(jié)合位點(diǎn)就是一種起正性調(diào)控作用的操縱子,CAP則是對轉(zhuǎn)錄起正性作用的調(diào)控蛋白──激活蛋白,編碼CRP的基因也是一個調(diào)控基因,不過它并不在lac操縱子的附近,CAP可以對幾個操縱子都起作用。從上所述,乳糖操縱子屬于可誘導(dǎo)操縱子(inducibleoperon),這類操縱子通常使是關(guān)閉的,當(dāng)受效應(yīng)物作用后誘導(dǎo)開放轉(zhuǎn)錄。這類操縱子使細(xì)菌能適應(yīng)環(huán)境的變化,最有效地利用環(huán)境能提供的能源底物。本文檔共108頁;當(dāng)前第82頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分乳糖操縱子的誘導(dǎo)
本文檔共108頁;當(dāng)前第83頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分三、
色氨酸操縱子的表達(dá)調(diào)控
本文檔共108頁;當(dāng)前第84頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分
色氨酸是構(gòu)成蛋白質(zhì)的組分,一般的環(huán)境難以給細(xì)菌提供足夠的色氨酸,細(xì)菌要生存繁殖通常需要自己經(jīng)過許多步驟合成色氨酸,但是一旦環(huán)境能夠提供色氨酸時,細(xì)菌就會充分利用外界的色氨酸、減少或停止合成色氨酸,以減輕自己的負(fù)擔(dān)。細(xì)菌所以能做到這點(diǎn)是因?yàn)橛猩彼岵倏v子(trpoperon)的調(diào)控。本文檔共108頁;當(dāng)前第85頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分trp操縱子的結(jié)構(gòu)trp操縱子的結(jié)構(gòu)見下圖:五個結(jié)構(gòu)基因(E、D、C、B、A)分別編碼從分支氨酸起始合成色氨酸途徑的酶或酶亞基。在結(jié)構(gòu)基因之前為調(diào)控區(qū)域,包括啟動子區(qū)(P)、操縱區(qū)(O)、前導(dǎo)肽編碼區(qū)(L)和弱化子區(qū)(a)。弱化子(衰減子):在trpE與操縱基因之間有一段前導(dǎo)序列L(162bp),它能編碼出一個內(nèi)含兩個并連的trp的14肽,由于這兩個trp的合成速度能控制核糖體在mRNA上的移動,使得前導(dǎo)序列的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物mRNA可形成特殊的結(jié)構(gòu),類似轉(zhuǎn)錄終止信號,因此編碼該結(jié)構(gòu)區(qū)域的基因被稱為弱化子(衰減子)。在trpA之后有兩個終止信號t和t′,其中t′為因子所識別,因此因子也參與了調(diào)控。Trp操縱子的調(diào)節(jié)基因(trpR)產(chǎn)生輔阻遏蛋白,遠(yuǎn)離trp操縱子。本文檔共108頁;當(dāng)前第86頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分1.色氨酸操縱子的結(jié)構(gòu)
本文檔共108頁;當(dāng)前第87頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分本文檔共108頁;當(dāng)前第88頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分trp操縱子的調(diào)控:啟動子調(diào)控——阻遏系統(tǒng)弱化子(衰減子)調(diào)控本文檔共108頁;當(dāng)前第89頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分2.
阻遏蛋白的負(fù)調(diào)控
合成色氨酸所需要酶類的基因E、D、C、B、A等頭尾相接串連排列組成結(jié)構(gòu)基因群,受其上游的啟動子Ptrp和操縱子o的調(diào)控,調(diào)控基因trpR的位置遠(yuǎn)離P-o-結(jié)構(gòu)基因群,在其自身的啟動子作用下,以組成性方式低水平表達(dá)其編碼分子量為47000的調(diào)控蛋白R,R并沒有與o結(jié)合的活性,當(dāng)環(huán)境能提供足夠濃度的色氨酸時,R與色氨酸結(jié)合后構(gòu)象變化而活化,就能夠與o特異性親和結(jié)合,阻遏結(jié)構(gòu)基因的轉(zhuǎn)錄。本文檔共108頁;當(dāng)前第90頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分色氨酸操縱子的可阻遏調(diào)控本文檔共108頁;當(dāng)前第91頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分
因此色氨酸操縱子屬于一種負(fù)性調(diào)控的、可阻遏的操縱子(repressibleoperon),即這操縱子通常是開放轉(zhuǎn)錄的,有效應(yīng)物(色氨酸為阻遏劑)作用時則阻遏關(guān)閉轉(zhuǎn)錄。細(xì)菌不少生物合成系統(tǒng)的操縱子都屬于這種類型,其調(diào)控可使細(xì)菌處在生存繁殖最經(jīng)濟(jì)最節(jié)省的狀態(tài)。
本文檔共108頁;當(dāng)前第92頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分3.弱化子及其作用
實(shí)驗(yàn)觀察表明:當(dāng)色氨酸達(dá)到一定濃度、但還沒有高到能夠活化R使其起阻遏作用的程度時,產(chǎn)生色氨酸合成酶類的量已經(jīng)明顯降低,而且產(chǎn)生的酶量與色氨酸濃度呈負(fù)相關(guān)。仔細(xì)研究發(fā)現(xiàn)這種調(diào)控現(xiàn)象與色氨酸操縱子特殊的結(jié)構(gòu)有關(guān)。本文檔共108頁;當(dāng)前第93頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分
在色氨酸操縱子Ptrp-o與第一個結(jié)構(gòu)基因trpE之間有162bp的一段先導(dǎo)序列(leadingsequence,L),實(shí)驗(yàn)證明當(dāng)色氨酸有一定濃度時,RNA聚合酶的轉(zhuǎn)錄會終止在這里。這段序列中含有編碼由14個氨基酸組成的短肽的開放閱讀框,其序列中有2個色氨酸相連,在此開放閱讀框前有核糖體識別結(jié)合位點(diǎn)(RBS)序列,提示這段短開放閱讀框在轉(zhuǎn)錄后是能被翻譯的。本文檔共108頁;當(dāng)前第94頁;編輯于星期三\10點(diǎn)0分
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