基因檢測在腫瘤個性化診療中的應(yīng)用演示文稿

基因檢測在腫瘤個性化診療中的應(yīng)用演示文稿6/13/2023當前第1頁\共有48頁\編于星期二\20點6/13/2023基因檢測在腫瘤個性化診療中的應(yīng)用當前第2頁\共有48頁\編于星期二\20點分子靶向治療與基因檢測液相活檢技術(shù)及其臨床應(yīng)用當前第3頁\共有48頁\編于星期二\20點非小細胞肺癌的靶向治療1.酪氨酸激酶抑制劑（EGFR-TKIs）吉非替尼（易瑞沙?）厄洛替尼（特羅凱?）乳腺癌、胃癌的靶向治療HER-2抑制劑曲妥珠單抗（赫賽汀?）結(jié)、直腸癌的靶向治療EGFR單克隆抗體西妥昔單抗（愛必妥?）2.ALK/ROS1抑制劑克唑替尼（賽可瑞?）色瑞替尼（Zykadia?）當前第4頁\共有48頁\編于星期二\20點非小細胞肺癌的靶向治療1.酪氨酸激酶抑制劑（EGFR-TKIs）吉非替尼（易瑞沙?）厄洛替尼（特羅凱?）?？颂婺幔▌P美納?）2.ALK/ROS1抑制劑克唑替尼（賽可瑞?）色瑞替尼（Zykadia?）當前第5頁\共有48頁\編于星期二\20點肺腺癌和鱗癌的驅(qū)動基因當前第6頁\共有48頁\編于星期二\20點檢測時間段：2014年標本來源：手術(shù)組織、穿刺標本、胸腹水制備的蠟塊標本量：共送檢2322例，退單112例，實際檢測2210例陰性結(jié)果：1260例陽性結(jié)果：950例（19del432例，L858R452例，T790M8例，其他

58例）金域檢驗結(jié)果

陽性率：43%當前第7頁\共有48頁\編于星期二\20點

Gefitiniborcarboplatin-paclitaxelinpulmonaryadenocarcinoma.

NEnglJMed.

2009Sep3;361(10):947-57.doi:10.1056/NEJMoa0810699.Epub2009Aug19.

MokTS,WuYLetalIPASSIPASSTKI藥物是把雙刃劍！當前第8頁\共有48頁\編于星期二\20點NSCLC患者EML4-ALK基因重排EML4EML4–ALK變異體1HELP1496981WDBasic14961059110581620TM激酶ALK間變性淋巴瘤激酶(ALK)基因的異常激活，可促進腫瘤的生長2011年FDA批準克唑替尼用于治療局部晚期或轉(zhuǎn)移的ALK陽性NSCLC患者2013年CFDA批準克唑替尼用于治療局部晚期或轉(zhuǎn)移性ALK陽性的NSCLC患者2014年FDA批準色瑞替尼用于治療局部晚期或轉(zhuǎn)移性ALK陽性的NSCLC患者（包括既往接受克唑替尼治療失敗的患者）當前第9頁\共有48頁\編于星期二\20點

ALK基因與EGFR基因并列非小細胞肺癌靶向治療首選推薦檢測基因！克唑替尼

治療ALK陽性患者Shaw

ATetal.NEnglJMed.2013Jun20;368(25):2385-94.當前第10頁\共有48頁\編于星期二\20點中國ALK陽性NSCLC診斷專家共識（2013）當前第11頁\共有48頁\編于星期二\20點ALK基因重排（FISH)方法：熒光原位雜交試劑盒：ABBOTTALK重排檢測試劑盒優(yōu)點：通過cFDA認證,目前檢測ALK基因重排的金標準缺點：費用高昂，大部分患者很難承受當前第12頁\共有48頁\編于星期二\20點ALK基因重排（全自動免疫組化）方法：全自動免疫組化試劑盒：RocheVENTANA抗ALK單抗優(yōu)點：通過cFDA認證,與FISH方法的一致性為99.23%優(yōu)點二：費用遠低FISH方法，時間快當前第13頁\共有48頁\編于星期二\20點VentanaALK的cFDA注冊臨床實驗三家醫(yī)院（上海腫瘤醫(yī)院，中國科學院腫瘤醫(yī)院，北京大學人民醫(yī)院）超過1100例NSCLC樣本進行VENTANAALK(D5F3)與FISHALK結(jié)果的對比驗證實驗結(jié)果表明VENTANAALK(D5F3)與FISHALK的一致性為99.23%陽性率：12.7%當前第14頁\共有48頁\編于星期二\20點31歲，男性，非吸煙EGFR無突變、ALK無重排一線吉非替尼治療無效口服克唑替尼

8周后高度部分緩解

ROSfusion:FISHROSfusion:IHCBergethonK,etal.JClinOncol2012;30:863-870.克唑替尼治療ROS1基因陽性患者當前第15頁\共有48頁\編于星期二\20點乳腺癌、胃癌的靶向治療HER-2抑制劑曲妥珠單抗（赫賽汀?）當前第16頁\共有48頁\編于星期二\20點HER-2擴增檢測的應(yīng)用輔助診斷

FISH技術(shù)檢測HER-2狀態(tài)結(jié)果客觀準確，為檢測HER-2基因的金標準。制定治療方案HER-2基因擴增患者：應(yīng)用他莫昔芬治療后的死亡風險明顯增高，提示患者可能不適合他莫昔芬作為內(nèi)分泌治療的選擇；HER-2基因擴增患者：對CMF化療方案的反應(yīng)性降低,宜采用高劑量強度的蒽環(huán)類藥物方案。當前第17頁\共有48頁\編于星期二\20點指導靶向用藥

赫賽汀只有針對HER-2基因擴增和蛋白過度表達的病人才有效預(yù)后判斷預(yù)后判斷

研究顯示，HER-2基因擴增患者生存期較短，腫瘤負荷更大，淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移幾率更高，激素受體陰性比例更高，復發(fā)風險更高乳腺癌：HER2擴增陽性率25%左右（熒光原位雜交技術(shù)）NCCNClinicalPracticeGuidelinesinOncologyforbreast

cancer.v1.2014.當前第18頁\共有48頁\編于星期二\20點胃癌：HER2擴增陽性率約15%~27%（熒光原位雜交技術(shù)）；各類型胃腫瘤HER2陽性率：食管胃結(jié)合部腺癌（33%）、胃腺癌（21%）、腸道及彌漫型腫瘤（32%）、混合型腫瘤（6%）乳腺癌：HER2擴增陽性率約20%~25%（熒光原位雜交技術(shù)）

NCCNClinicalPracticeGuidelinesinOncologyforbreast

cancer.v1.2014.NCCNClinicalPracticeGuidelinesinOncologyforgastriccancer.v2.2013.當前第19頁\共有48頁\編于星期二\20點標本來源：組織標本（以乳腺癌為主）方法學：FISH方法標本量：檢測2560例，陽性結(jié)果：1050例金域檢驗結(jié)果

陽性率：41.02%當前第20頁\共有48頁\編于星期二\20點結(jié)直腸癌驅(qū)動基因分布愛必妥和維克替比僅適用于KRAS基因野生型的轉(zhuǎn)移性結(jié)直腸癌患者

KRAS突變是早期NSCLC患者無法從輔助化療中獲益的預(yù)測因子當前第21頁\共有48頁\編于星期二\20點標本來源：組織標本（以結(jié)直腸癌為主）方法學：ARMS-PCR、Sanger測序標本量：檢測1618例陽性結(jié)果：614例金域檢驗結(jié)果薈萃

陽性率：38%當前第22頁\共有48頁\編于星期二\20點部分晚期患者無手術(shù)機會

無足夠的組織標本進行基因分型重復活檢患者依從性差作為金標本的組織靶基因檢測也存在局限性

一、取材困難當前第23頁\共有48頁\編于星期二\20點二、腫瘤異質(zhì)性同一腫瘤組織有異質(zhì)性不同部位腫瘤的異質(zhì)性當前第24頁\共有48頁\編于星期二\20點三、無法對療效進行監(jiān)測組織標本無法用于動態(tài)檢測當前第25頁\共有48頁\編于星期二\20點LiquidBiopsies（液相活檢）Blood&otherbodilyfluids?Cell-freeDNA（血漿游離DNA）?CirculatingtumorDNA（循環(huán)腫瘤DNA）有限的樣本數(shù)量有限的取樣頻率取樣時需要專業(yè)醫(yī)生和專業(yè)機構(gòu)有創(chuàng)傷地取樣檢測速度慢目前實體腫瘤個體化治療面臨的困境當前第26頁\共有48頁\編于星期二\20點ctDNA的生物學屬性

——來源當前第27頁\共有48頁\編于星期二\20點

總游離DNA上皮組織5-10%腫瘤0.01-10%胃腸道5-10%血細胞80-90%largely<1.0%ctDNA的生物學屬性

——含量當前第28頁\共有48頁\編于星期二\20點

血漿?水91%?蛋白

7%?代謝物

(微量)

?

Cell-freeDNA(微量)細胞層

?白細胞2-3%?血小板塊

2-3%?紅細胞90%

?CTC(微量)ctDNA的生物學屬性

——存在部位當前第29頁\共有48頁\編于星期二\20點特殊保存方式

抑制核酸酶介導的ctDNA降解

防腐劑穩(wěn)定有核血細胞

ctDNA分子標記物存在周期短，能實時反應(yīng)患者的基本情況ctDNA的生物學屬性

——半衰期短當前第30頁\共有48頁\編于星期二\20點ctDNA的生物學屬性

——高特異性“相對”準確反應(yīng)腫瘤組織不同克隆的基因特征LearyetalScienceTranslationalMedicine,Nov2012.【ctDNA】所有腫瘤克隆的混合體(能反應(yīng)腫瘤所有克隆的整體特征)。當前第31頁\共有48頁\編于星期二\20點基于血液的靶基因檢測可惠及每一位患者指導用藥勻質(zhì)標本實時監(jiān)測作為無法獲取組織標本的補充，無創(chuàng)檢測結(jié)果指導臨床用藥循環(huán)而勻質(zhì)的ctDNA標本，在一定程度克服了異質(zhì)性實現(xiàn)實時動態(tài)監(jiān)測，提高全程管理水平當前第32頁\共有48頁\編于星期二\20點III、IV期肺腺癌易瑞沙?、特羅凱?、凱美納?等方法：ARMS-PCR基于血液的肺癌EGFR突變檢測當前第33頁\共有48頁\編于星期二\20點EGFR基因突變位點當前第34頁\共有48頁\編于星期二\20點共入組1060位高加索人群非小細胞肺癌患者，來自5個國家652例患者同時具有腫瘤組織和血液樣本，采用Qiagen試劑盒進行檢測這兩者EGFR突變狀態(tài)吻合率為94.3%，特異性為99.8%。當前第35頁\共有48頁\編于星期二\20點當前第36頁\共有48頁\編于星期二\20點IRESSA藥品說明書更新中國Gefitinib說明書更新（2015年2月13日cFDA批準更新）第4頁<注意事項>

當考慮本品用于晚期或轉(zhuǎn)移性NSCLC患者的一線治療時，推薦對所有患者的腫瘤組

織進行EGFR突變檢測，如果腫瘤標本不可評估，則可使用血液（血漿）標本中獲得的循環(huán)腫瘤DNA(ctDNA)用于EGFR突變檢測。

只能使用經(jīng)論證可用于測定腫瘤或ctDNA的EGFR突變的檢測方法，檢測方法須穩(wěn)定、可靠并且靈敏，以避免出現(xiàn)假陰性或假陽性的測定結(jié)果

當前第37頁\共有48頁\編于星期二\20點200例標本對照，腫瘤組織對比外周血進行EGFR基因檢測200例標本，共出現(xiàn)11例不相符標本（組織陽性而外周血檢測陰性、組織陰性而外周血檢測陽性）。√檢測時機的選擇√檢測方法學的選定金域?qū)嶒炇?ctDNA檢測數(shù)據(jù)當前第38頁\共有48頁\編于星期二\20點當前第39頁\共有48頁\編于星期二\20點統(tǒng)計2015年1月1日至3月31日數(shù)據(jù)：檢測目前已使用一代TKI治療的非小細胞肺癌患者（3個月-6個月）72例，出現(xiàn)T790M突變陽性例數(shù)為31例；與新藥臨床試驗部聯(lián)合推動患者加入針對“T790M”位點的第三代TKI新藥臨床試驗。金域?qū)嶒炇?ctDNA檢測數(shù)據(jù)當前第40頁\共有48頁\編于星期二\20點報告時間：ASCO2014背景：服用EGFR-TKI藥物的患者，一般在8～11月內(nèi)出現(xiàn)耐藥耐藥原因：～50%的患者產(chǎn)生T790M突變I期臨床報告：入組199名患者（女性62%，中位年齡60歲，亞裔65%）T790M突變：132位患者進行了檢測，89例檢出T790M療效：T790M(+)(c+uORR)為64%，T790M(－）為23%60例確認緩解的患者中，97%（58/60）的患者在數(shù)據(jù)截止時疾病仍在持續(xù)緩解。最長緩解時間超過8個月AZD9291I期臨床研究當前第41頁\共有48頁\編于星期二\20點外周血中KRAS基因突變檢測III、IV期肺腺癌III、IV期結(jié)直腸癌愛必妥?維克替比?等方法：ARMS-PCR當前第42頁\共有48頁\編于星期二\20點肺／腸癌22基因突變熱點檢測III、IV期肺腺癌III、IV期結(jié)直腸癌指導用藥、預(yù)后評估方法：二代測序當前第43頁\共有48頁\編于星期二\20點22基因列表優(yōu)勢：高通量，覆蓋了大部分非小細胞肺癌和結(jié)直腸癌的驅(qū)動基因當前第44頁\共有48頁\編于星期二\20點ctDNA的臨床應(yīng)用未來潛在臨床用途惡性腫瘤治療反應(yīng)監(jiān)測；惡性腫瘤的預(yù)后分層；惡性腫瘤復發(fā)監(jiān)測。當前第45頁\共有48頁\編于星期二\20點1、治

療反

應(yīng)檢測Diseaseprogression1Dawsonetal.,NEJM2013Online,DOI:10.10562Suetal.,AnnNYAcadSci2008,1137:197-206Cell-freeDNAwastheonlymarkerthatpredictedresponseCELL-FREEDNA/PIK3CACA15-3ANTIGENCIRCULATINGTUMORCELLSPatientrespo